基因组数据库检索的几个问题
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GGCCTAAGTCGCCGCAGAACTGCCACGTGGGGATGAGATTTGCTGGG CTGGTAGCGGCGGCTGCTGCGGG GTCCCGCCCACGTGAAGCCAGCCTAACTGAGCTCTGGACTT………….
获得序列 NCBI
确定位置 UCSC
问题四
如何找出两个遗传标记（比如序列标签位点 STS）之间的所有基因？
第一外显子
SNP
Ensembl EMBL – EBI（European Molecular Biology Labor atory和European Bioinformatics Institute）以及the Sanger Institute共同支持。包含各种真核生物基 因组信息。
http://www.ensembl.org/
UCSC(University of California,Santa Cruz)基因组浏览器 UCSC主页网址为http://genome.ucsc.edu/
利用NCBI的Entrez Gene
输入基因名称
染色体
STS
数据库编号
蛋白、疾病、基因
问题二
如何找到一个基因的序列？此序列除了含 有所有已注释的外显子和内含子外，还有 用于引物设计的一些碱基？
美国国立生物技术信息中心 (NCBI)
UCSC(University of California,Santa Cruz)基因组浏览器
EMBL – EBI
问题一
如何找到一个感兴趣的基因及相关信息？ 一旦基因在图谱上被定位，又如何方便地找 到同一区域的其它基因？
美国国立生物技术信息中心 (NCBI) 的Entrez Gene NCBI主页网址为http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
基因组数据库检索的几个问题
分子生物学实ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ中常见的问题
我要研究的基因（或序列）在哪？ 有人研究过吗？研究到什么程度?有哪些经典文献？ 这个基因有什么功能？ 有几个外显子？产物有多大？ 设计PCR引物？文献上的引物准不准？ cDNA序列到哪里找？有无可变剪接？ 小鼠等其他生物的基因组中有无同源基因？
公共生物信息数据库
两个STS之间用；号隔开
以此类推，通过选择页面显示选项，可以找到某 两个标记之间的其他信息：表达序列标签 （EST）、单核苷酸多态（SNP）、简单重复序 列等等。
输入两侧STS
STS和Gene
谢
谢 !
外显子信息
NCBI、UCSC及Ensembl有时对同一基因使 用不同的符号，但是数据基本一致。这3个 站点之间可以自由地穿梭。
问题三
已知一段mRNA序列，怎样在人类基因组 图谱中找到对应的DNA片段？ 一旦它的位置确定，如何找到选择性剪接 位点位置？
mRNA登录号
BG334944
一段序列
获得序列 NCBI
确定位置 UCSC
问题四
如何找出两个遗传标记（比如序列标签位点 STS）之间的所有基因？
第一外显子
SNP
Ensembl EMBL – EBI（European Molecular Biology Labor atory和European Bioinformatics Institute）以及the Sanger Institute共同支持。包含各种真核生物基 因组信息。
http://www.ensembl.org/
UCSC(University of California,Santa Cruz)基因组浏览器 UCSC主页网址为http://genome.ucsc.edu/
利用NCBI的Entrez Gene
输入基因名称
染色体
STS
数据库编号
蛋白、疾病、基因
问题二
如何找到一个基因的序列？此序列除了含 有所有已注释的外显子和内含子外，还有 用于引物设计的一些碱基？
美国国立生物技术信息中心 (NCBI)
UCSC(University of California,Santa Cruz)基因组浏览器
EMBL – EBI
问题一
如何找到一个感兴趣的基因及相关信息？ 一旦基因在图谱上被定位，又如何方便地找 到同一区域的其它基因？
美国国立生物技术信息中心 (NCBI) 的Entrez Gene NCBI主页网址为http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
基因组数据库检索的几个问题
分子生物学实ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ中常见的问题
我要研究的基因（或序列）在哪？ 有人研究过吗？研究到什么程度?有哪些经典文献？ 这个基因有什么功能？ 有几个外显子？产物有多大？ 设计PCR引物？文献上的引物准不准？ cDNA序列到哪里找？有无可变剪接？ 小鼠等其他生物的基因组中有无同源基因？
公共生物信息数据库
两个STS之间用；号隔开
以此类推，通过选择页面显示选项，可以找到某 两个标记之间的其他信息：表达序列标签 （EST）、单核苷酸多态（SNP）、简单重复序 列等等。
输入两侧STS
STS和Gene
谢
谢 !
外显子信息
NCBI、UCSC及Ensembl有时对同一基因使 用不同的符号，但是数据基本一致。这3个 站点之间可以自由地穿梭。
问题三
已知一段mRNA序列，怎样在人类基因组 图谱中找到对应的DNA片段？ 一旦它的位置确定，如何找到选择性剪接 位点位置？
mRNA登录号
BG334944
一段序列