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motivation of the paragraph.
LLDDGG 疾病基因研究室 重庆医科大学药学院 秧茂盛
★ One paper, one point! One idea, one article. It would be
short and readable to a broad readership.
LLDDGG 疾病基因研究室 重庆医科大学药学院 秧茂盛
四、 学术不端行为是比较常见的
1. 自己捏造、篡改数据：1.97%(0.86-4.45) 2. 自己的其它不端行为：33.7% 3. 同事捏造、篡改数据：14.12%(9.91-19.72) 4. 同事的其它不端行为：72% 5. 08年投浙江医科大学学报论文中31%存在抄袭 6. 1/3国内学者承认存在学术不端行为 7. 医学和药学领域比其它领域不端行为更泛滥 8. 学术不端行为现状可能要比想象中的更严重
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论文信息学
建议和意见请发送到：yangms88@yahoo.com.cn
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Research Process
LLDDGG 疾病基因研究室 重庆医科大学药学院 秧茂盛
讲课内容
一、必须批判性地阅读文献 二、漂亮研究论文的写作 三、在同行评议中胜出 四、常见的中国人英语用词错误
2. Work out what the figures and tables would look like. 3. Give your paper a narrative structure that links from one
finding to another.
This can be the logical order of why one experiment was done in response to another, or you can describe from the beginning to the end of a pathway.
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6. 阅读讨论
对论文质量给出你的评价 理解研究结果的重要性和对学科发展的影响 你认为论文的不足是什么？
7. 提出下一步研究设想
就如何加强进一步的研究，提出你的建议 研究结果是否填补了相关领域的空白 引申或开拓出新的研究方向
8. 收尾
从头到尾快速阅读全文，重点理解格式和叙述过程 词汇的使用、图表标示及其说明和文章的结构布局完美吗？ 有无值得你效仿和借鉴的地方？
2. What was the mystery that you wanted to answered? 3. Have you answered it? 4. What is new? 5. Does the reader need help understanding the significance? 6. Include different levels at which your results are significant.
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三、 阳性预测值大于50%是难于获得的
LLDDGG 疾病基因研究室 重庆医科大学药学院 秧茂盛
1、 声称的发现可能仅是偏差而已 2、 改进措施
(1). 提高统计学效力 (2). 制订和使用统一的、标准的研究规范 (3). 加深对事件前概率的认识
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方法学质量的评估
1. 是原创性研究吗？ 2. 研究的对象和目标是什么？ 3. 研究设计切实可行吗？ 4. 采取了哪些措施来避免和最小化系统性偏差？ 5. 数据获取和结果评价是“盲性的”吗？ 6. 统计学问题是如何处理的？科学吗？
以确保方法学的有效性和结论的可靠性！
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2. 理解摘要
寻找为何、怎样开展本课题实验研究的线索
3. 阅读结果
3.1 仔细阅读文本，重点放在你能够理解的内容上 考虑两个问题--(1) 作者做了哪些工作？获得了哪些结果？ (2) 有无遗漏你想看到的内容？
3.2 分析图表及其文字说明
这是认识论文事实真相的要点 判定数据是否支持结论 关注细节是非常好的行为 针对你的疑问来阅读材料和方法学内容
U：偏差
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3. 随机性的"阴性"/"阳性"发现，无处不在 4. 多个独立研究的影响
n: 独立研究的重复次数越多，其发现的真实性越大
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二、 可以借鉴的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ个推论
1. 研究越小，其发现的真实性越小 2. 效应越小，其发现的真实性越小 3. 样本数愈多加上选择性愈小，其发现的真实性越小 4. 设计、分析等的灵活性愈大，其发现的真实性越小 5. 偏见、经济利益冲突愈大，其发现的真实性越小 6. 越热门，其发现的真实性越小
2. Tell the reader where you’re going with the argument that follows.
3. Make all transitions so there are no gaps in logic. 4. The main route to clarity is to cut, cut, cut. 5. Only using words with precise meanings.
PLoS ONE,2009[4(5)]e5738; Nature,2010[467(7312)]153；Nature,2010[463(7278)]142-143
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逐步阅读法
1. 读懂标题
1.1 理解每一个词汇的含义 获得最丰富、最重要的信息
1.2 写出你期望看到的实验内容列表 在开始阅读论文之前 尽可能快和完整性的完成它 回答两个问题--(1) 是你还是作者遗漏了关键点？ (2) 论文的标题误导了你吗？ 牢记: 你的实验列表与作者的不同是一件好事情 从文章中寻找产生不同实验列表的原因 建立修正后的你的实验列表
4. 阅读时间要充足
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一、 大多数的研究发现是假的
1.仅依据p值小于0.05作为评判标准是有缺陷的 会误解“阴性”结果 阳性结果的决定因素有: (1)事件的前概率 (2)统计学效率 (3)统计学显著性水平
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Advice from Prolific authors and journal editors
★Thinking early about the right journal and finding an
appropriate editor, the best reviewers and, of course, an appropriate audience of readers.
R : 真相关/假相关; β: Type II error rate; α: Type I error rate; C : 相关总概率
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2. 无法完全避免偏差
(1)结果的选择性或歪曲报道 (2)无法确认哪一种相关是真实的 (3)偏差越大，得到真实结果的可能性就越小
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4. 阅读前言
为什么作者选择开展本课题的实验研究工作？ 作者拟回答的主要问题是什么？
5. 对比主要问题、数据和结论
对主要问题的回答合理吗？科学吗？ 选择的实验内容及其方法正确吗？ 你的实验列表与作者的相比，哪一个更好？ 针对同样的课题你会怎样研究？ 作者报道的研究工作，哪些可被借鉴？ 值得重复研究或开展更加深入的研究吗？
4. Don’t claim more than you have shown.
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Writing your paper clearly
1. Sentences should have an active construction, address one thought at a time, and generally be kept short and to the point.
★ New authors should be careful to polish their work and
respond meticulously and politely to reviewers’ comments.
★ The first sentence in a paragraph always describes the
★ Put yourself in the position of the potential reader of your
paper and ask yourself two questions: is it worth my time to read this paper, and what will I get out of it?
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必须批判性地阅读文献
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前言
1. 正式发表的科学研究是有缺陷的 你可以质疑任何科学研究！
2. 阅读文献不同于阅读小说或新闻报刊 理解文献的结构，分次阅读，从不同的组分中获取特定 的信息
3. 理解背景知识和有关定义或概念 使用经典的教科书
PLoS Med 2(8): e124. 4. Moonesinghe R, Khoury MJ, Janssens ACJW (2007) Most published
research findings are false—But a little replication goes a long way. PLoS Med 4(2): e28. 5. Fanelli D (2009) How Many Scientists Fabricate and Falsify Research? A Systematic Review and Meta-Analysis of Survey Data. PLoS ONE 4(5): e5738. 6. Nature 2010, 467(7312):153 7. Nature 2010, 463(7278):142-143 8. AMWA Journal 1999, 14(1):32-42
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参考文献
1. www.rpi.edu/~ploppg/biol.../Dr_Ploppers_How_to_Read_a_Paper.doc 2. BMJ 1997;315:305-308 3. Ioannidis JPA (2005) Why most published research findings are false.
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Set up a roadmap for writing the paper
1. Remember that everyone, even a scientist, thinks in narrative. Science is a story. Tell it.
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漂亮研究论文的写作
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Define your bottom line--your point !
1. Repeat it over and over again—at the end of the Abstract, in the Introduction, in the Results, and in the Discussion.
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short and readable to a broad readership.
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四、 学术不端行为是比较常见的
1. 自己捏造、篡改数据：1.97%(0.86-4.45) 2. 自己的其它不端行为：33.7% 3. 同事捏造、篡改数据：14.12%(9.91-19.72) 4. 同事的其它不端行为：72% 5. 08年投浙江医科大学学报论文中31%存在抄袭 6. 1/3国内学者承认存在学术不端行为 7. 医学和药学领域比其它领域不端行为更泛滥 8. 学术不端行为现状可能要比想象中的更严重
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Research Process
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讲课内容
一、必须批判性地阅读文献 二、漂亮研究论文的写作 三、在同行评议中胜出 四、常见的中国人英语用词错误
2. Work out what the figures and tables would look like. 3. Give your paper a narrative structure that links from one
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6. 阅读讨论
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就如何加强进一步的研究，提出你的建议 研究结果是否填补了相关领域的空白 引申或开拓出新的研究方向
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从头到尾快速阅读全文，重点理解格式和叙述过程 词汇的使用、图表标示及其说明和文章的结构布局完美吗？ 有无值得你效仿和借鉴的地方？
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三、 阳性预测值大于50%是难于获得的
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(1). 提高统计学效力 (2). 制订和使用统一的、标准的研究规范 (3). 加深对事件前概率的认识
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方法学质量的评估
1. 是原创性研究吗？ 2. 研究的对象和目标是什么？ 3. 研究设计切实可行吗？ 4. 采取了哪些措施来避免和最小化系统性偏差？ 5. 数据获取和结果评价是“盲性的”吗？ 6. 统计学问题是如何处理的？科学吗？
以确保方法学的有效性和结论的可靠性！
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2. 理解摘要
寻找为何、怎样开展本课题实验研究的线索
3. 阅读结果
3.1 仔细阅读文本，重点放在你能够理解的内容上 考虑两个问题--(1) 作者做了哪些工作？获得了哪些结果？ (2) 有无遗漏你想看到的内容？
3.2 分析图表及其文字说明
这是认识论文事实真相的要点 判定数据是否支持结论 关注细节是非常好的行为 针对你的疑问来阅读材料和方法学内容
U：偏差
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3. 随机性的"阴性"/"阳性"发现，无处不在 4. 多个独立研究的影响
n: 独立研究的重复次数越多，其发现的真实性越大
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二、 可以借鉴的ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ个推论
1. 研究越小，其发现的真实性越小 2. 效应越小，其发现的真实性越小 3. 样本数愈多加上选择性愈小，其发现的真实性越小 4. 设计、分析等的灵活性愈大，其发现的真实性越小 5. 偏见、经济利益冲突愈大，其发现的真实性越小 6. 越热门，其发现的真实性越小
2. Tell the reader where you’re going with the argument that follows.
3. Make all transitions so there are no gaps in logic. 4. The main route to clarity is to cut, cut, cut. 5. Only using words with precise meanings.
PLoS ONE,2009[4(5)]e5738; Nature,2010[467(7312)]153；Nature,2010[463(7278)]142-143
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1.1 理解每一个词汇的含义 获得最丰富、最重要的信息
1.2 写出你期望看到的实验内容列表 在开始阅读论文之前 尽可能快和完整性的完成它 回答两个问题--(1) 是你还是作者遗漏了关键点？ (2) 论文的标题误导了你吗？ 牢记: 你的实验列表与作者的不同是一件好事情 从文章中寻找产生不同实验列表的原因 建立修正后的你的实验列表
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1.仅依据p值小于0.05作为评判标准是有缺陷的 会误解“阴性”结果 阳性结果的决定因素有: (1)事件的前概率 (2)统计学效率 (3)统计学显著性水平
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(1)结果的选择性或歪曲报道 (2)无法确认哪一种相关是真实的 (3)偏差越大，得到真实结果的可能性就越小
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★ Put yourself in the position of the potential reader of your
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2. 阅读文献不同于阅读小说或新闻报刊 理解文献的结构，分次阅读，从不同的组分中获取特定 的信息
3. 理解背景知识和有关定义或概念 使用经典的教科书
PLoS Med 2(8): e124. 4. Moonesinghe R, Khoury MJ, Janssens ACJW (2007) Most published
research findings are false—But a little replication goes a long way. PLoS Med 4(2): e28. 5. Fanelli D (2009) How Many Scientists Fabricate and Falsify Research? A Systematic Review and Meta-Analysis of Survey Data. PLoS ONE 4(5): e5738. 6. Nature 2010, 467(7312):153 7. Nature 2010, 463(7278):142-143 8. AMWA Journal 1999, 14(1):32-42
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参考文献
1. www.rpi.edu/~ploppg/biol.../Dr_Ploppers_How_to_Read_a_Paper.doc 2. BMJ 1997;315:305-308 3. Ioannidis JPA (2005) Why most published research findings are false.
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1. Remember that everyone, even a scientist, thinks in narrative. Science is a story. Tell it.
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1. Repeat it over and over again—at the end of the Abstract, in the Introduction, in the Results, and in the Discussion.