第三章-蛋白质的修饰和表达
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
• 水溶性的碳化二亚胺类特定修饰羧基基团, 最广泛,可在较温和的条件进行
2021/2/11
6
(四)二硫键的化学修饰
• 修饰方法:还原 • 修饰试剂:2-巯基乙醇、巯基乙酸和二硫苏糖醇等。 • 判断蛋白质分子中有无二硫键,是链内二硫键还是链
间二硫键的方法可用非还原/还原双向SDS-PAGE电 泳技术。处理后的蛋白很容易自动氧化,重新形成 二硫键,因而需要经过羧甲基处理,防止重新形成 二硫键。
2021/2/11
16
质粒
外源DNA
限制性内切酶
限制性内切酶 一、目的基因的获得
退火
目的基因
受体细胞二、重组
转化
五、外源基因在受体细胞内表重组达质粒
四带202重1筛、/2/1组1选筛体的选细三和胞、鉴重定组接体受转了表达入重受组体目体的细的产胞细物胞17
(一)定点突变
• 定义:改变一个或两个碱基 • 特点:突变率高、简单易行、重复性好 • 方法:重叠延伸PCR技术、快速定点突变 • 应用:纤维蛋白酶原活化剂,降低血浆清除
修饰部位:蛋白质的侧链基团 修饰机制:选择性的试剂或者亲和标记试剂与
侧链上的特定功能团发生化学反应
修饰类型:巯基、氨基、羧基、二硫键
2021/2/11
3
(一)巯基的修饰
特点:亲wk.baidu.com 最容易发生反应的侧链基团
修饰试剂 烷基化试剂 (碘乙酸、碘乙酰胺) N-乙基马来酰亚胺
DTNB
反应类型 羧甲基化
光吸收 二硫键、 有颜色的TNB
筛选
表达
2021/2/11
22
盒
同时获得酶多切个割 突变体
式
蛋白基因
突
变
新突变质粒
核苷酸片段
2021/2/11
23
(二)定向进化(directed evolution)
• 范围:特定的蛋白质 • 条件:大量突变体、合适的筛选系统
2021/2/11
24
1、制造突变体
方法:易错PCR、DNA改组技术
• 修饰方式:活化-OH(剧烈条件)
• 偶连基团:氨基、巯基、羧基
• 优点:延长半衰期、较小毒性、血药浓度波动小、
酶降解作用降低……
?
• 应用: 天门冬酰胺酶、腺苷脱氨酶
PEG 修饰脂质体包被的阿霉素
2021/2/11
10
四、蛋白质的化学交联和化学偶联
• 交联:含有双功能基团的化学试剂与蛋白 质分子间形成网状交联。
2、筛选
方法:表型观察选择、高通量筛选 (1)噬菌体表面展示技术 概念:外源蛋白与噬菌体衣壳蛋白融合存于噬菌体表面的技术 特点:基因型和表型统一在同一病毒颗粒内
2021/2/11
26
噬 菌 体 展 示 技 术 的 基 本 原 理
2021/2/11
27
(2)核糖体展示技术 原理:
该技术是基于一种稳定的抗体-核糖体-mRNA复合物的构象基
率,延长血浆半衰期
2021/2/11
18
1、重叠延伸PCR技术
2021/2/11
19
2021/2/11
重 叠 延 伸
PCR 介 导 的 定 点 突 变20
2、快速定点突变
2021/2/11
21
质粒
外源DNA
酶切割
限制性内切酶
限制性内切酶
受体细胞
新突变质粒
转化
蛋白基因
退火
目的基因
核苷酸片段
重组质粒
29
基因融合的策略
1、方法
➢将融合基因通过合适的酶切位点直接剪切到适当
特点:试剂对被修饰基团、修饰部位具有专一性
类型
特点
应用
亲和标记 专一性标记酶活性部位 分离细胞表面受体
不可逆
光亲和标记 专一性标记酶活性部位 发现疾病相关的靶位点
不可逆
鉴别蛋白质
光反应基团
2021/2/11
9
三、蛋白质的聚乙二醇修饰
• PEG特点:亲水、不带电荷
• 结合机制:共价结合,形成屏障保护抗原,阻止免 疫反应和酶的水解
• 偶联:蛋白质分子偶联到一个化学惰性的 水不溶性的载体上。
2021/2/11
11
2021/2/11
蛋白质的化学交联
12
2021/2/11
蛋白质的化学交联
13
2021/2/11
蛋白质分子固定示意图
14
2021/2/11
15
第二节 蛋白质的分子生物学改造
• 基因突变 定点突变 定向进化
• 基因融合
础。抗体蛋白与它的编码序列物理连接。抗体基因转录,产生
许多mRNA分子,每一个代表着不同抗体基因。mRNA分子与
细菌的核糖体孵育,然后mRNA翻译成蛋白质。每个复合体展
示一种不同的抗体,当经过一个含有靶标抗原的亲和柱子后,
一些能结合上去的复合体不会被洗去,该展示技术完全在体外
完成,并且不需要克隆就能完成大规模抗体库的构建。
2021/2/11
7
化学修饰影响条件
1、温和的反应条件是防止蛋白质分子变性的一个 必要条件;
2、pH值变化:决定了具有潜在反应能力的基团所 处的可反应和不可反应的离子状态;
3、温度:影响活性巯基的微环境 4、有机溶剂:试剂需要有机溶剂来助溶,但有机溶
剂可使蛋白质变性。
2021/2/11
8
二、蛋白质的位点专一性修饰
第三章 蛋白质的修饰和表达
第一节 第二节 第三节
蛋白质修饰的化学途径 蛋白质改造的分子生物学途径 重组蛋白质的表达
2021/2/11
1
第一节 蛋白质的化学修饰
一、蛋白质侧链基团的化学修饰 二、蛋白质位点的专一性修饰 三、蛋白质的聚乙二醇修饰 四、蛋白质的化学交联和化学偶联
2021/2/11
2
一、蛋白质侧链基团的化学修饰
2021/2/11
28
二、基因的融合
• 概念:不同的基因或者基因片段序列构成一 个新的杂合基因,经合适的表达系统表达后, 获得由不同功能蛋白拼合在一起的新型多功 能蛋白。
• 原则:将第一个蛋白基因的终止密码子删 除,接上带有终止密码子的第二个蛋白或者多 肽基因,实现两个基因的融合表达
2021/2/11
2021/2/11
4
(二、氨基的化学修饰)
特点:亲和反应活性高 赖氨酸的ε –氨基
修饰试剂
反应类型
TNBS
黄色复合物(420nm)
烷基化试剂
(卤代乙酸、芳基卤、芳族磺酸)
磷酸吡哆醛
光吸收
2021/2/11
5
(三)羧基的化学修饰
• 由于羧基在水溶液中的化学性质使蛋白质 分子中的谷氨酸和天冬氨酸的修饰方法很 有限,产物一般是酯类或酰胺类。
易错PCR原理: 改变正常PCR反应体系 中某些组分的数量或者 质量,随即引入错误碱 基创造序列多样性的 DNA文库。 难点:适当的突变频率
DNA改组技术原理: 靶基因酶切产生随机DNA 片段,以3’-末端的片端为 引物和模板,随机互补结 合并延伸。 优点:突变率高、
适用不同物种
2021/2/11
25
2021/2/11
6
(四)二硫键的化学修饰
• 修饰方法:还原 • 修饰试剂:2-巯基乙醇、巯基乙酸和二硫苏糖醇等。 • 判断蛋白质分子中有无二硫键,是链内二硫键还是链
间二硫键的方法可用非还原/还原双向SDS-PAGE电 泳技术。处理后的蛋白很容易自动氧化,重新形成 二硫键,因而需要经过羧甲基处理,防止重新形成 二硫键。
2021/2/11
16
质粒
外源DNA
限制性内切酶
限制性内切酶 一、目的基因的获得
退火
目的基因
受体细胞二、重组
转化
五、外源基因在受体细胞内表重组达质粒
四带202重1筛、/2/1组1选筛体的选细三和胞、鉴重定组接体受转了表达入重受组体目体的细的产胞细物胞17
(一)定点突变
• 定义:改变一个或两个碱基 • 特点:突变率高、简单易行、重复性好 • 方法:重叠延伸PCR技术、快速定点突变 • 应用:纤维蛋白酶原活化剂,降低血浆清除
修饰部位:蛋白质的侧链基团 修饰机制:选择性的试剂或者亲和标记试剂与
侧链上的特定功能团发生化学反应
修饰类型:巯基、氨基、羧基、二硫键
2021/2/11
3
(一)巯基的修饰
特点:亲wk.baidu.com 最容易发生反应的侧链基团
修饰试剂 烷基化试剂 (碘乙酸、碘乙酰胺) N-乙基马来酰亚胺
DTNB
反应类型 羧甲基化
光吸收 二硫键、 有颜色的TNB
筛选
表达
2021/2/11
22
盒
同时获得酶多切个割 突变体
式
蛋白基因
突
变
新突变质粒
核苷酸片段
2021/2/11
23
(二)定向进化(directed evolution)
• 范围:特定的蛋白质 • 条件:大量突变体、合适的筛选系统
2021/2/11
24
1、制造突变体
方法:易错PCR、DNA改组技术
• 修饰方式:活化-OH(剧烈条件)
• 偶连基团:氨基、巯基、羧基
• 优点:延长半衰期、较小毒性、血药浓度波动小、
酶降解作用降低……
?
• 应用: 天门冬酰胺酶、腺苷脱氨酶
PEG 修饰脂质体包被的阿霉素
2021/2/11
10
四、蛋白质的化学交联和化学偶联
• 交联:含有双功能基团的化学试剂与蛋白 质分子间形成网状交联。
2、筛选
方法:表型观察选择、高通量筛选 (1)噬菌体表面展示技术 概念:外源蛋白与噬菌体衣壳蛋白融合存于噬菌体表面的技术 特点:基因型和表型统一在同一病毒颗粒内
2021/2/11
26
噬 菌 体 展 示 技 术 的 基 本 原 理
2021/2/11
27
(2)核糖体展示技术 原理:
该技术是基于一种稳定的抗体-核糖体-mRNA复合物的构象基
率,延长血浆半衰期
2021/2/11
18
1、重叠延伸PCR技术
2021/2/11
19
2021/2/11
重 叠 延 伸
PCR 介 导 的 定 点 突 变20
2、快速定点突变
2021/2/11
21
质粒
外源DNA
酶切割
限制性内切酶
限制性内切酶
受体细胞
新突变质粒
转化
蛋白基因
退火
目的基因
核苷酸片段
重组质粒
29
基因融合的策略
1、方法
➢将融合基因通过合适的酶切位点直接剪切到适当
特点:试剂对被修饰基团、修饰部位具有专一性
类型
特点
应用
亲和标记 专一性标记酶活性部位 分离细胞表面受体
不可逆
光亲和标记 专一性标记酶活性部位 发现疾病相关的靶位点
不可逆
鉴别蛋白质
光反应基团
2021/2/11
9
三、蛋白质的聚乙二醇修饰
• PEG特点:亲水、不带电荷
• 结合机制:共价结合,形成屏障保护抗原,阻止免 疫反应和酶的水解
• 偶联:蛋白质分子偶联到一个化学惰性的 水不溶性的载体上。
2021/2/11
11
2021/2/11
蛋白质的化学交联
12
2021/2/11
蛋白质的化学交联
13
2021/2/11
蛋白质分子固定示意图
14
2021/2/11
15
第二节 蛋白质的分子生物学改造
• 基因突变 定点突变 定向进化
• 基因融合
础。抗体蛋白与它的编码序列物理连接。抗体基因转录,产生
许多mRNA分子,每一个代表着不同抗体基因。mRNA分子与
细菌的核糖体孵育,然后mRNA翻译成蛋白质。每个复合体展
示一种不同的抗体,当经过一个含有靶标抗原的亲和柱子后,
一些能结合上去的复合体不会被洗去,该展示技术完全在体外
完成,并且不需要克隆就能完成大规模抗体库的构建。
2021/2/11
7
化学修饰影响条件
1、温和的反应条件是防止蛋白质分子变性的一个 必要条件;
2、pH值变化:决定了具有潜在反应能力的基团所 处的可反应和不可反应的离子状态;
3、温度:影响活性巯基的微环境 4、有机溶剂:试剂需要有机溶剂来助溶,但有机溶
剂可使蛋白质变性。
2021/2/11
8
二、蛋白质的位点专一性修饰
第三章 蛋白质的修饰和表达
第一节 第二节 第三节
蛋白质修饰的化学途径 蛋白质改造的分子生物学途径 重组蛋白质的表达
2021/2/11
1
第一节 蛋白质的化学修饰
一、蛋白质侧链基团的化学修饰 二、蛋白质位点的专一性修饰 三、蛋白质的聚乙二醇修饰 四、蛋白质的化学交联和化学偶联
2021/2/11
2
一、蛋白质侧链基团的化学修饰
2021/2/11
28
二、基因的融合
• 概念:不同的基因或者基因片段序列构成一 个新的杂合基因,经合适的表达系统表达后, 获得由不同功能蛋白拼合在一起的新型多功 能蛋白。
• 原则:将第一个蛋白基因的终止密码子删 除,接上带有终止密码子的第二个蛋白或者多 肽基因,实现两个基因的融合表达
2021/2/11
2021/2/11
4
(二、氨基的化学修饰)
特点:亲和反应活性高 赖氨酸的ε –氨基
修饰试剂
反应类型
TNBS
黄色复合物(420nm)
烷基化试剂
(卤代乙酸、芳基卤、芳族磺酸)
磷酸吡哆醛
光吸收
2021/2/11
5
(三)羧基的化学修饰
• 由于羧基在水溶液中的化学性质使蛋白质 分子中的谷氨酸和天冬氨酸的修饰方法很 有限,产物一般是酯类或酰胺类。
易错PCR原理: 改变正常PCR反应体系 中某些组分的数量或者 质量,随即引入错误碱 基创造序列多样性的 DNA文库。 难点:适当的突变频率
DNA改组技术原理: 靶基因酶切产生随机DNA 片段,以3’-末端的片端为 引物和模板,随机互补结 合并延伸。 优点:突变率高、
适用不同物种
2021/2/11
25