转座子插入敲除

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特点:
• 1、所有生物的染色体都有转座子 • 2、转座相关序列可以占据物种基因的很大 一部分,如人和玉米基因组的50%以上是由 转座相关序列组成 • 3、转座子的含量在不同基因组中变化很大 • 4、当转座子移位时,转座因子通常对插入 位点几乎没有序列选择性
转座子类型:
• 1、DNA转座子
• 2、类病毒反转录转座子
变体反转。采用这种方法可进一步确证突变体表型是否由转座子 插入突变引起。 • (2)大多数转座的位点偏好于连锁位点,所以如果有一个可转座 的元件靠近目的基因,那么可转座的元件即会高效地移动并插入 目的基因。因此,即使在突变体库中没有发现期望的插入位点, 仍可以采用转座子在连锁位点上的转座获得目的基因被插入失活 的品系。
• (3 )当一个基因家族的多个成员沿染色体串连排列Fra Baidu bibliotek,可采用复
制型的转座系统创建该基因家族全部成员均被敲除的突变体。
• 随着基因敲除技术的发展,早期技术中的许多 不足和缺陷都已经解决,但基因敲除技术始终 存在着一个难以克服的缺点,即敲掉一个基因 并不一定就能获知该基因的功能,其原因包括: • 一方面,许多基因在功能上是冗余的,敲掉一 个在功能上冗余的基因,并不能造成容易识别 的表型,因为基因家族的其他成员可以提供同 样的功能; • 另一方面,对于某些必需基因,敲除后会造成 细胞的致死性,也就无法对这些必需基因进行 相应的研究了
•转座子(transposon)是存在于DNA上可自 主复制和移位的基本单位。 •由Barbara McClintock 在20世纪40年代首 次从玉米中发现,从此改变了人们对基因 组序列稳定性的认识,打破了遗传物质在 染色体上呈线性固定排的传统理论。 •1983年McClintock因发现转座子被授予诺 贝尔奖
务。目前已经应用于微生物、昆虫、植物、动物及人类基因组功
能的研究。例如蛙类基因组含有Tcl水手转座子超家族,呈自然失 激活转座子,使睡美人转座子苏醒。
活状态,转座酶与转座增强子序列末端结合,在HMGBI蛋白协助下,
使用转座子进行插入突变的优点有:
• (1 )转座子能够在转座酶的存在下从插入位点剪切下来,造成突
• 3、聚腺苷酸(poly-A)反转录转座子
转座机制:
• 1、剪切-粘贴机制
• 2、复制-粘贴机制
插入突变
• 转座子插入突变是利用转座子在染色体上可移 动的特点,当其跳跃插入到某个功能基因内部 或邻近位点时时,就会引起该基因的失活,并 诱导产生突变型。
• 因此我们可以利用某些能随机插入基因序列的 转座子,在目标细胞基因组中进行随机插入突 变,建立一个携带随机插入突变的细胞库,然 后通过相应的标记(如Tn5转座子含kan抗性基 因)进行筛选获得相应的基因敲除细胞。
• 睡美人转座子(sleeping bueaty,转座子SB)已证明在小鼠和人细胞中
可以激活,转座子插入新的位点后,该位点附近的基因即受到抑制
呈现隐性的“睡美人”表型。 • 一旦转座子在转座酶的作用下从这一位点上转走,该位点的基因 隐性表型又恢复为显性表型,即“睡美人苏醒”。调控转座酶和 转座子活性的系统称为青蛙王子(Frog Prince)。 • 用特异的开放阅读框捕获技术,可以使自然散在的转座酶编码基 因高表达,人为催化激活转座子使其苏醒,执行插入、切除等任
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