RNA转录与转录后加工

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第7章 RNA转录与转录后加工

1 本章主要内容

1)转录的基本概念

2)大肠杆菌RNA聚合酶及其转录

3)真核生物的RNA聚合酶及其转录

4)RNA的转录后加工和反转录

2 教学目的和要求

通过本章学习,掌握转录的基本概念,原核转录的主要参与者(RNA聚合酶和启动子)以及原核转录的过程(起始、延伸和终止)。

1)掌握真核转录的三种主要RNA聚合酶、所转录的基因类型和参与转录过程各种因

子等。

2)了解不同前体RNA的加工机制。

3)了解反转录的特点

3 重点难点

1) 转录

2) 大肠杆菌RNA聚合酶、原核转录的过程

3) 真核生物的RNA聚合酶、真核转录过程、转录因子

4) RNA的转录后加工、反转录

4 教学方法与手段

讲授与交流互动相结合,采用多媒体教学。

5 授课内容

1)RNA转录概述

2)细菌基因的转录

3)真核生物的转录

4)RNA的转录后加工

5) RNA的反转录

第一节 RNA转录概述

一、信使的发现

•1955年Brachet用洋葱根尖和变形虫进行实验:

–若加入RNA酶,则蛋白质合成就停止;

–若再加入来自酵母的RNA,又可合成蛋白质。

这表明什么?

•同年Goldstein和Plaut用同位素标记变形虫RNA前体——

•发现标记的RNA在核内。

•标记追踪实验:经过一段时间又发现被标记的RNA在细胞质中,

•这表明什么?

•1956年E. Volkin和L.Astrachan:

•用同位素脉冲一追踪标记

•表明T2噬菌体新合成的RNA的碱基比和自身的DNA碱基比相似,而和细菌的碱基比不同。T2感染细菌时注入的是DNA,而在细胞里合成的是RNA。

•这表明什么?

•最令人信服的证据是Hall.B.D和Spiegeman,S的DNA-RNA的杂交实验:

•将T2噬菌体感染E.coli后产生的RNA分离出来,分别与T2和E.coli的DNA进行分子杂交。

•结果这种RNA只能和T2的DNA形“杂种”链,而不能和E.coli的DNA进行杂交。

Jacob和Monod预言:

(1)这种“ 信使”应是一个多核苷酸;

(2)其分子平均不小于5 105bp,足以携带一个基因的遗传信息;

(3)它们至少是暂时连在核糖体上;

(4)其碱基组成反映了DNA的序列;

(5)它们能高速更新。

Jacob和Monod将它定名为: 信使RNA (Messenger RNA) 或mRNA。

二、几个基本概念

•转录(transcription):是指以DNA为模板,在依赖于DNA的RNA聚和酶催化下,以4

种rNTP(ATP、CTP、GTP和UTP)为原料,合成RNA的过程。

•在有些病毒中,RNA也可以指导合成RNA。

•转录是基因表达的第一步,也是最关键的一步。

三、RNA合成的基本特点

•1960年Weiss,S,B等发现RNA聚合酶(RNA Pol)。其特点是:

(1)以核糖核苷三磷酸(rNTR)为底物;

(2)以DNA为模板;

(3)按5′-3′方向合成;

(4)无需引物的存在能单独起始链的合成;

(5)第一个引入的rNTP是以三磷酸形式存在;

(6)在体内DNA双链中仅一条链作为模板;

(7)RNA的序列和模板是互补的。

确定有义链

•1963 J.Marmur和Doty Spiegelnan区分有义链。采用枯草杆菌的SP8噬菌体为材料,SP8 DNA 双链有“ 轻”、“ 重”差异明显。

•现在将作为转录模板的DNA单链称为模板链或反义链(antisen strand),

•非模板链称为有义链(sense strand)或编码链。

•在体外DNA的两条链都可作为RNA合成的模板。

•怎样用实验证实mRNA的合成总是延着5’- 3′方向进行的?

•E.coli在0︒C时需13秒钟才能加上一个核苷酸,但在37︒C每秒就可加上40个核苷酸; •利用这个差别以14C来标记U, 在0︒C培养E.coli,。

•提取这种正在伸长的mRNA分子,发现——

•14C标记首先出现在伸长的3′端,因此可以证明合成是延着5′-3′方向进行的。

四、RNA合成和DNA复制的区别

(1) 转录时只有一条DNA链为模板,而复制时两条链都可作为模板;

(2) DNA-RNA杂合双链不稳定,RNA合成后释放,而DNA复制叉形成后一直打开,

新链和母成子链;

(3) RNA合成不需引物,而DNA复制需引物;

(4) 转录的底物是rNTP,复制的底物是dNTP;

(5) 聚合酶系不同。

第二节细菌基因的转录

一、细菌的RNA聚合酶

1. 全酶(Holo Enzyme)和核心酶(Core Enzyme)

(1) 全酶(Holo Enzyme)

•用于转录的

•依靠空间结构与DNA模板结合(σ与核心酶结合后引起的构象变化)

•专一性地与DNA序列(启动子)结合

•结合常数:1014/mol

•半衰期:数小时(107/mol 1秒以下)

•转录效率低,速度缓慢(σ的结合)

(2)核心酶(Core Enzyme)

•作用于转录的延伸过程(终止)

•依靠静电引力与DNA模板结合(蛋白质中碱性基团与DNA的磷酸根之间)•非专一性的结合(与DNA的序列无关)

•结合常数:1011/mol

•半衰期:60秒

E.Coli RNApol 的亚基组成

core enzyme

(3)全酶的组装过程

•此外,新发现的一种ω亚基的功能尚不清楚。

2. 各亚基的特点和功能

(1)σ因子

• σ因子可重复使用

• 修饰RNApol构型

• 使Holo Enzyme 识别启动子的Sextama Box(-35区),并通过σ与模板链结合

E.coli中不同的 因子可识别不同的启动子

(2)α因子

•核心酶的组建因子

•促使RNApol 与DNA模板链结合

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