细菌的分类及命名ppt课件
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Bacillus subtilis ( Ehrrnbeg) Cohn 1872
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11
三名法
属名+种名加词+(subsp.或var.)+亚种(变种)加词
实例
苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
酿酒酵母椭圆变种
Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus
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12
有关学名的其他知识
属名：表示该微生物主要特征的名词或用 作名词的形容词，单数
常代表微生物的主要特征，如形态（芽孢 杆菌属、葡萄球菌属）、生理（乳杆菌属）
更多学名连在一起，若属名相同，属名可 缩写
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13
有关学名的其他知识
种名加词：代表一个种的次要特征，补充 说明微生物的颜色、形状、用途等次要特 征。也可以从人名（巴斯德酵母）、地名 （华根霉）衍生而来
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9
双名法
学名
属名：首字母大写，斜体字 种名加词：小写，斜体字 （首次定名人）：正体字，用括号 现在定名人：正体字 定名年份
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10
双名法的实例
大肠埃希氏菌
Escherichia coli ( Migula) Castellani et Chalmers 1919
枯草芽孢杆菌
第十二章 微生物的进化、系统发育和 分类鉴定
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1
序：进化的概念：
两种分类原则：
第一节 进化的测量指征
一，进化指征的选择
二，rRNA作为进化指征
16SrRNA 特点
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2
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3
16S rRNA特点：
1、16SrRNA存在于所有生物中并执行相同的功能—合 成蛋白质。 2、 进化相对保守，分子序列变化缓慢； 3、相对分子质量适中； 4、16S rRNA普遍存在（真核生物为18SrRNA)； 5、微生物的16S rRNA可从样品中直接提取，分析、 比较其序列，进而确定其家族树中位置
五、核酸的碱基组成和分子杂交
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%)
某一特定种的DNA碱基组成是恒定的。GC含量以 碱基全部克分子中G和C的摩尔百分数表示：
G+C G +C +A +T
×100%
=（G +C）mol%
所得数值范围从23~75
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21
每个生物种都有特定的GC%范围，因 此 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC% 范围为25--75%，变化范围最大，因此更适 合于细菌的分类鉴定。
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24
2. 核酸的分子杂交
原理：根据DNA解链的可逆性和碱基配对的专 一性。
若同源性70%以上为种的水平，20%以上可能 是属的水平。
核酸分子杂交(hybridization)间接比较 不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性
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25
DNA杂交法：
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26
1）DNA-DNA杂交；
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6
第二节 细 菌 分 类
一，分类单元及等级
界 Kingdom
门 phylum
纲 class
目 order
科 family
属 genus
种 species
原核生物界 细菌门 真细菌纲 放线菌目 分支杆菌科 分支杆菌属 结核分支杆菌
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7
种的概念
种：最基本的分类单位
是一群表型特征高度相似、亲缘关系极其接 近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的 总称
二、生理生化反应
营养要求：碳源、氮源、营养类型 代谢产物：种类、产量、显色反应 酶：产酶种类、反应特性
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19
三、其他
血清学反应
血清学试验与噬菌体分型
近年又发展了红外光谱，gc含量，dna杂交等。
生态学特征
相互关系、宿主种类、与氧关系等。
四、氨基酸和蛋白质分析
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20
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22
GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，
G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定
但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们 之间具有近的亲缘关系。
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23
同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5% 以下；同属不同种的差别应低于10～15%；
若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的 菌株，如果其G+C含量的差别大于5%，则肯定不是 同一个种，大于15%则肯定不是同一个属。
31.03.2021
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44
全生命系统树－－ (Olsen & Woese 1993) 三，三界生物的主要特征
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5
微生物分类学
微生物分类学
一门按微生物的亲缘关系把他们分门别类的 排成各种分类单元或分类群的学科
分类学任务
分类、鉴定、命名
微生物分类学的发展
经典分类学
微生物系统学
大肠杆菌K12菌株 E.coli K12
E.coli O157:H7：致病性，抗原特征
模式菌株：菌落、菌株、菌苔、斜面、菌 种、培养物、
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18
第三节 微生物分类鉴定 的特征和技术
分类依据:
一、形态特征（个体和群体）
细胞形态：形状、大小、排列、染色反应等。 培养：固体— 菌落，半固体— 穿刺，液体。
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14
有关学名的其他知识
未完成鉴定的菌种：种名加词可用sp.或 spp.表示 学名的发音：拉丁字母规则发音，欧美学 者按自己语种发音
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15
亚种以下的几个分类名词
不受国际命名法规限制 亚种：进一步细分种时所用的单元，一般 指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定 特征都与模式种相同的种。 命名方法按照三名法处理 变种：与亚种是同义词，现在很少使用
菌株
某条件、地区分离得到的具体菌株。它是由 一独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群 体及其一切后代，典型菌株、模式株
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8
微生物的学名
俗名
结核杆菌：结核分歧杆菌
学名
菌种的科学名称，是按照“国际命名法则” 进行命名并受国际学术界公认的通用正式名 称，由拉丁词或拉丁化的词构成 林奈的“双名法” 三名法
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16
菌型：曾用作菌株的同义词，现已废除， 仅作若干变异ห้องสมุดไป่ตู้的后缀
菌群：两种微生物介于他们之间的一些过 渡类型的菌种，具有某些共同性状。
如：大肠菌群包括大肠杆菌、产气肠细菌 及他们之间的过渡类型
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17
菌株（品系）
菌株名称＝属名+种的加词+菌株代号，菌 株代号可随意用字母、符号、编号或字母 加编号等自行决定
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11
三名法
属名+种名加词+(subsp.或var.)+亚种(变种)加词
实例
苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
酿酒酵母椭圆变种
Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus
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12
有关学名的其他知识
属名：表示该微生物主要特征的名词或用 作名词的形容词，单数
常代表微生物的主要特征，如形态（芽孢 杆菌属、葡萄球菌属）、生理（乳杆菌属）
更多学名连在一起，若属名相同，属名可 缩写
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13
有关学名的其他知识
种名加词：代表一个种的次要特征，补充 说明微生物的颜色、形状、用途等次要特 征。也可以从人名（巴斯德酵母）、地名 （华根霉）衍生而来
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双名法
学名
属名：首字母大写，斜体字 种名加词：小写，斜体字 （首次定名人）：正体字，用括号 现在定名人：正体字 定名年份
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10
双名法的实例
大肠埃希氏菌
Escherichia coli ( Migula) Castellani et Chalmers 1919
枯草芽孢杆菌
第十二章 微生物的进化、系统发育和 分类鉴定
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1
序：进化的概念：
两种分类原则：
第一节 进化的测量指征
一，进化指征的选择
二，rRNA作为进化指征
16SrRNA 特点
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3
16S rRNA特点：
1、16SrRNA存在于所有生物中并执行相同的功能—合 成蛋白质。 2、 进化相对保守，分子序列变化缓慢； 3、相对分子质量适中； 4、16S rRNA普遍存在（真核生物为18SrRNA)； 5、微生物的16S rRNA可从样品中直接提取，分析、 比较其序列，进而确定其家族树中位置
五、核酸的碱基组成和分子杂交
1. DNA的碱基组成(G+Cmol%)
某一特定种的DNA碱基组成是恒定的。GC含量以 碱基全部克分子中G和C的摩尔百分数表示：
G+C G +C +A +T
×100%
=（G +C）mol%
所得数值范围从23~75
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每个生物种都有特定的GC%范围，因 此 可以作为分类鉴定的指标。细菌的GC% 范围为25--75%，变化范围最大，因此更适 合于细菌的分类鉴定。
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2. 核酸的分子杂交
原理：根据DNA解链的可逆性和碱基配对的专 一性。
若同源性70%以上为种的水平，20%以上可能 是属的水平。
核酸分子杂交(hybridization)间接比较 不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性
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25
DNA杂交法：
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1）DNA-DNA杂交；
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第二节 细 菌 分 类
一，分类单元及等级
界 Kingdom
门 phylum
纲 class
目 order
科 family
属 genus
种 species
原核生物界 细菌门 真细菌纲 放线菌目 分支杆菌科 分支杆菌属 结核分支杆菌
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7
种的概念
种：最基本的分类单位
是一群表型特征高度相似、亲缘关系极其接 近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的 总称
二、生理生化反应
营养要求：碳源、氮源、营养类型 代谢产物：种类、产量、显色反应 酶：产酶种类、反应特性
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三、其他
血清学反应
血清学试验与噬菌体分型
近年又发展了红外光谱，gc含量，dna杂交等。
生态学特征
相互关系、宿主种类、与氧关系等。
四、氨基酸和蛋白质分析
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22
GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，
G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定
但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们 之间具有近的亲缘关系。
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同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5% 以下；同属不同种的差别应低于10～15%；
若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的 菌株，如果其G+C含量的差别大于5%，则肯定不是 同一个种，大于15%则肯定不是同一个属。
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全生命系统树－－ (Olsen & Woese 1993) 三，三界生物的主要特征
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微生物分类学
微生物分类学
一门按微生物的亲缘关系把他们分门别类的 排成各种分类单元或分类群的学科
分类学任务
分类、鉴定、命名
微生物分类学的发展
经典分类学
微生物系统学
大肠杆菌K12菌株 E.coli K12
E.coli O157:H7：致病性，抗原特征
模式菌株：菌落、菌株、菌苔、斜面、菌 种、培养物、
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第三节 微生物分类鉴定 的特征和技术
分类依据:
一、形态特征（个体和群体）
细胞形态：形状、大小、排列、染色反应等。 培养：固体— 菌落，半固体— 穿刺，液体。
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有关学名的其他知识
未完成鉴定的菌种：种名加词可用sp.或 spp.表示 学名的发音：拉丁字母规则发音，欧美学 者按自己语种发音
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亚种以下的几个分类名词
不受国际命名法规限制 亚种：进一步细分种时所用的单元，一般 指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定 特征都与模式种相同的种。 命名方法按照三名法处理 变种：与亚种是同义词，现在很少使用
菌株
某条件、地区分离得到的具体菌株。它是由 一独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群 体及其一切后代，典型菌株、模式株
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微生物的学名
俗名
结核杆菌：结核分歧杆菌
学名
菌种的科学名称，是按照“国际命名法则” 进行命名并受国际学术界公认的通用正式名 称，由拉丁词或拉丁化的词构成 林奈的“双名法” 三名法
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菌型：曾用作菌株的同义词，现已废除， 仅作若干变异ห้องสมุดไป่ตู้的后缀
菌群：两种微生物介于他们之间的一些过 渡类型的菌种，具有某些共同性状。
如：大肠菌群包括大肠杆菌、产气肠细菌 及他们之间的过渡类型
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菌株（品系）
菌株名称＝属名+种的加词+菌株代号，菌 株代号可随意用字母、符号、编号或字母 加编号等自行决定