引物合成常见问题

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Q10.如何保存引物?

引物合成后,经过一系列处理和纯化步骤,旋转干燥而成无色或白色絮状干粉。

干粉:运输时常温运输,-20℃可以保存一年。

储存液:配好后分装成几管,避免反复冻融,-20℃可以保存半年。

工作液:常规使用,4℃保存,也可-20℃保存,但应避免反复冻融。

修饰荧光引物:需要避光保存,尽快使用为宜。

Q11.引物定量不准是怎么回事儿?

我们偶尔收到用户投诉定量不准的报告,出现这种情况的可能性有:

(1)定量错误、分装错误、引物抽干或收样过程中意外丢失。这种可能性有,但是很少,因为作为专业

的引物合成公司,我们的生产人员都是经过严格的专业培训,这种错误是要求谨慎避免甚至杜绝的。一般情况下,引物都有留样备份,接到用户投诉后,我们都会找出留样重新定量,一般都没有问题,如确实存在问题,则可安排重新准备一份。

(2)系统误差,我们认为10%左右为允许误差。使用过程中,引物工作浓度范围很宽,定量上的少许偏差不影响实验。

(3)用户收到引物干粉时,打开引物管盖前没有离心或其他误操作导致引物干粉部分丢失。

(4)用户没有能够正确理解引物OD数的含义,没有能够正确使用分光光度计,特别是使用微量测定;用户没有将OD读数,正确地转换成母液中OD数。这种情况比较常见。

例如,验证标2OD引物量是否准确,简单的做法是:加入1ml水,彻底溶解混匀后,取100ul,加入

900ul水,用光径为1cm的石英比色杯,波长260nm,此时光吸收的读数为0.2。

Q12.最长可以合成多长的引物?

我们合成过100base的引物,但是产率很低。除非需要,建议合成片段长度不要超过80base。引物越长,

出现问题的概率就越大,按照目前的引物合成效率,大于80base的粗产品,全长引物的百分比不高,后

续处理还有丢失很多,最后的产量很低。

Q13.为什么修饰引物的产量要比一般引物低,价格要高?

主要因为是修饰单体稳定性较差,偶连时间长,效率低,最后得到的产量自然低于一般的引物。修饰引物通常需要PAGE或HPLC纯化,纯化过程损失大。修饰引物使用的原料是一般引物原料的几百倍,所以产品的价格也高。

Q14.引物片段退火后不能连接到载体上是什么问题?

连接反应需要引物的5’磷酸基团。如果需要将合成的引物退火直接连接相应的载体上,引物需要磷酸化。磷酸化的产物如果还不能连接载体上,需要检查载体的酶切效果,需要改善引物退火的条件。SiRNA分子

具有特殊的对称结构,退火的难度较大,退火时需要提高退火温度。

Q15.如果测序发现引物突变,是否有补偿?该如何处理?

如果出现测序发现引物位置碱基错误的情况,我们可以免费重合一次,没有其他任何补偿或赔偿,不承担其他连带责任,这是国际行规。原因我们在前面已提到,化学合成效率不可能达到100%。

如果遇到这种情况,首先和我们联系,我们会检查合成序列是否和原始订单一致,如果确认引物合成序列没有输错,我们建议重新挑取克隆测序,您可能会找到正确克隆的。根据我们经验,40个碱基以下的引物,测1-2个克隆就可以了;40个以上的特别是用于全片段拼接合成的,就需要多测一些了。一般情况下,每

个克隆突变的位点都不一样,正确的总是有的,就是如何找到它。您也可以要求我们将引物免费重合一次,

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