非小细胞肺癌基因检测

案例分析
姓名：王女士
年龄：46
诊断：非小细胞肺癌 样品种类：穿刺组织 检测项目：EGFR突变检测；EML4-ALK基因融合检测；ERCC1表达量；TYMS表达量； RRM1表达量；TUBB3表达量
检测项目
EGFR突变 EML4-ALK ERCC1表达量
检测结果
19外显子突变 无转位 高
临床意义
吉非替尼、厄洛替尼疗效佳 克里唑替尼无效风险高 铂类药物疗效较差
TYMS表达量
RRM1表达量 TUBB3表达量
低
高 高
氟类/培美曲塞/卡培他滨疗效佳
吉西他滨疗效差 抗微管类药物疗效差
谢谢！
程，DNA修复是铂类化疗耐药性产生的主要机制之一。
Lord RVN et al, Clin Cancer Res, 2002, 8:2286-91
吉西他滨与RRM1 mRNA 表达
背景 吉西他滨是脱氧胞嘧啶核苷同系物，属细胞周期特异性抗代谢类化疗药，主
要作用于DNA合成期（S期）的肿瘤细胞，同时也阻断细胞增殖由G1向S期过渡的进程。 临床研究显示低RRM1 mRNA水平的肺癌患者对吉西他滨敏感性相对较高，药物疗效较
肿瘤个体化用药基因检测的临床应用
——非小细胞肺癌
江苏省肿瘤分子诊断工程技术研究中心 江苏省恶性肿瘤多学科联合诊治技术服务中心
人类基因组计划和国际癌症基因组计划
——个体化医疗的奠基石
于1990年在美国正式启动的人类基因组计划，要把人体内约10万个基因的密码全部解 开，同时绘制出人类基因的谱图。 2006年多国联合启动的国际癌症基因组计划，是人类基因组计划后的又一重大科学研 究。 揭示更多地与癌症相关的突变类型，获得50种肿瘤的特定分子异常谱型，探寻DNA变 异与肿瘤发生发展的机理。
EML4-ALK融合基因
ALK 最早是在间变性大细胞淋巴瘤（ ALCL)的一个亚型中被发现的，因此定名为 间变性淋巴瘤激酶（anaplastic lymphoma kinase，ALK）。 靶向药：XALKORI ®胶囊（克唑替尼），辉瑞公司。 NCCN与ESMO推荐ALK阳性NSCLC的一线治疗首选克唑替尼。 总体突变率：11.4% 腺癌突变率：16.1% 鳞癌突变率：0.7% 优势人群：
事件, n (%)
克唑替尼 (n=173) 100 (58) 7.7
化疗 (n=174) 127 (73) 3.0
60 40 20 0 0 5 10 时间(月)
• • Shaw et al., ESMO 2012; Abstract LBA1_PR N Engl J Med 2013;368:2385-94
好，中位生存期延长。而且，专家建议RRM1高表达的患者应避免使用吉西他滨。
Rafael Rosell1. Oncogene (2003) 22, 3548–3553
抗微管类药物与TUBB3 mRNA 表达
背景 抗微管类化疗药是作用于细胞微管，通过影响纺锤体形成，从而抑制细胞有
丝分裂的一类广谱化疗药。在多种临床研究中，TUBB3 mRNA表达水平与抗微管类化疗 的疗效密切相关。低TUBB3表达水平的肿瘤患者接受紫杉醇类或长春碱类化疗的效果 较好，中位生存期较长。反之，TUBB3高表达的患者的抗微管类化疗疗效较差。
腺癌
肺癌的传统分类
肺腺癌的分子分类
EGFR基因突变检测在临床应用的意义
IPASS: 根据突变状态的疗效分 析
1.0 Gefitinib EGFR M+ (n=132) Gefitinib EGFR M- (n=91) Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129) Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85)
By Yoshinori Shirota, Journal of Clinical Oncology, 2001,19: 4298-4304
化疗药物检测项目（ mRNA 表达）
类型
药物
卡铂、顺铂 奥沙利铂 抗微管药物
基因
ERCC1
样本
Hale Waihona Puke Baidu评价
低表达敏感
TUBB3 RRM1
mRNA 表达 吉西他滨 氟尿嘧啶 培美曲赛
中位数, 个月 HR (95% CI) P
0.49 (0.37 - 0.64) <0.0001
15
20
25
NCCN指南推荐
靶向药物检测项目汇总
药物
基因
EGFR
癌种
样本
组织标本、 血浆、体液 标本
判断标准
突变敏感 突变耐药 融合敏感 融合敏感
重要程度
必检 推荐 必检 推荐
吉非替尼/厄洛 替尼/埃克替尼
0.8 无进展生存率
0.6
对象 不加选择的中国患者 有效率 30％
0.4 0.4
根据临床特征选择优势人群 50％
0.2
根据EGFR敏感基因选择 +耐药基因选择 70-80% 80-95%
0.0 0 4 8 12 16 Time from randomisation (months) 20
Mok, Wu,Thomprast et al. NEJM, 2009
轻微/从未吸烟； 与EGFR突变人群相比，ALK融合人群年龄更轻； 腺癌； EGFR/KRAS野生型； 病理学特（含印戒细胞的黏液型或实性腺癌中， ALK融合基因的发生率高于其他类型的肺腺癌 (46．2％VS. 8.0％）
EML4-ALK融合检测的意义
100 无进展生存期的概率 (%)
80
检测EGFR突变的重要性
医学指南
全球三大肿瘤突变会指南均强调检测EGFR突变的重要性
EGFR突变检测的应用
很好预测TKI药物对NSCLC患者的疗效
HRM血浆突变检测
外显子19缺失； 外显子21点突变； 外显子18点突变； 非小细胞肺癌 没有发现外显子18、 19、21突变
外显子20未发生突变， 继续使用TKI治疗 肿瘤对TKI敏感，患者 使用TKI治疗 外显子20突变，提示 TKI治疗产生耐药，转 为非TKI治疗 肿瘤对TKI不敏感，患 者使用非TKI治疗
Rafael Rosell1. Oncogene (2003) 22, 3548–3553
氟类药物与TYMS mRNA 表达
背景 TYMS基因编码的胸苷酸合成酶（TS）是嘧啶核苷酸合成的限速酶，是肿瘤生 长的重要因子。5-FU的代谢物5-FdUMP与TS结合，阻碍TS的正常功能，从而抑制DNA合 成。临床研究表明，低TYMS mRNA水平的肿瘤患者接受氟类化疗的效果较好，中位生 存期较长。反之，TYMS高表达的患者对氟类疗效较差。研究也发现培美曲赛的疗效与 TYMS mRNA表达水平呈负相关。
KRAS 非小细胞肺 癌 EML4-ALK
克唑替尼
组织标本 组织标本
ROS1
铂类药物与ERCC1 mRNA 表达
背景 ERCC1（Excision Repair Cross Complement Group 1）是核酸外切修复家族中重 要成员，参与DNA链的切割和损伤识别。ERCC1的表达量直接影响DNA修复的生理过
肿瘤治疗存在的核心问题
盲目治疗 过度治疗
个体化治疗
肺癌的传统分类观点
小细胞肺癌 (SCLC)
鳞癌 大细胞 小细胞 腺癌
非小细胞肺癌 (NSCLC) 腺癌 鳞癌 大细胞癌
肺腺癌的分子亚型
鳞癌 大细胞 小细胞
ALK fusion ROS fusion PIK3CA BRAF PDGFR amp MEK1 KRAS HER2 EGFR
石蜡切片 新鲜组织
低表达敏感 低表达敏感 低表达敏感
TYMS
样本要求
石蜡包埋肿瘤组织块 一般组织块不小于5×5×5（mm），组织包于蜡块正中央，处理完可归还蜡块（推荐）。 送检保存：常温保存、运输。
新鲜肿瘤组织块
要求提供50mg左右的样本，取癌组织的中心位置组织块，5×5mm（绿豆大）以上，以 PBS或生理盐水清洗干净，15分钟内放入RNAlater保存液或液氮中保存。 送检保存：常温保存、运输，取样后24小时内送检。 全血标本 使用枸橼酸钠（1：9）或EDTA-Na2抗凝的采血管，血液样本2ml以上。 禁忌：切勿使用肝素抗凝剂；切勿反复冻融。 送检保存：4℃冰箱保存，切不可置于-20℃中（血细胞在融解的时候易发生溶血）；当天送检， 冰上运输。