生物技术与食品产业
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不同酶切产生的相同粘性末端称配伍末端(
compatible end),可用连接酶连接。
中新口腔
A
B
C
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Restriction Nucleases
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Restriction Nucleases
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• 不同有限制性核酸内切酶识别的DNA序列可以不相同。有 的识别四核苷酸序列,有的识别六或八核苷酸序列。
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• 重叠基因(overlapping gene):是指一个 基因的序列中,含有另一个基因的部分或 全部序列,即其核苷酸序列是重叠的。基 因重叠现象仅发现于一些噬菌和病毒基因 组中。
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中心法则
转录
DNA 质
反转录
RNA
翻译 蛋白
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基因重组
• 目的基因与载体基因,标记基因等的连接 叫基因重组
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• 假基因(pseudo gene)在真核生物中普遍 存在。这是一类在基因中稳定存在,核苷 酸序列同其相应的正常功能基因基本相同 、但却不能合成出有功能的蛋白质的失活 基因,它是相应的正常基因空谈而丧失活 性的结果。人类基因中与蛋白质合成有关 的基因只占整个人类基因组的2%。
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• 重复序列(repeated sequence):是指在 一个DNA分子中出现不止一次的序列。 几 乎所有的真核生物的基因组DNA中都有重 复序列。在人类基因组计划中发现,35.3% 的基因组包含重复序列。
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• 基因工程的分子生物学基础
– 脱氧核糖核酸 – DNA变性、复性和杂交 – DNA的复制 – DNA的修复 – 生物的基因重组 – 基因 – 遗传信息的传递方向
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• 脱氧核糖核酸
– 生物的遗传物质是DNA。DNA是由大量的脱氧 核糖核苷酸组成的线状或环状生物大分子。由 碱基、磷酸、戊糖组成。碱基由腺嘌噙(A) 、鸟嘌噙(G)、胞嘧啶(C)与胸腺嘧啶(T )组成。
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EcoR 1 from E.coli
G AAT T C C T TAA G
PALINDROME
palindrome
AAG CTT T TC GAA
Hind III from Haemophilus influenza
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限制性核酸内切酶作用后产生两种末端: 钝性末端(blunt end/flush end)
Restriction map is a linear array of sites on DNA cleaved by various restriction enzymes. DNA限制酶切片段沿染色体或染色体片段的依次排列 称作限制图谱.
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限制性核酸内切酶的命名
• 按酶的来源的属、种名而定,取属名的第一个字母大写与 种名的头两个字母小写组成的三个斜体字母作略语表示;
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人类染色体组示意图
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细胞核示意图
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Байду номын сангаас
动物细胞示意图
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植物细胞示意图
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DNA(脱氧核糖核酸)
1. 由两条极性相反并互补的多聚核苷酸链围绕 中心轴的双螺旋结构。
2. 两条链中的碱基之间按照A配T,G配C的互补 原则,以氢键连接。
其中A为:腺嘌呤 T为:胸腺嘧啶 G为:鸟嘌呤 C为:胞嘧啶 U为:尿嘧啶 (RNA)
• 断裂基因(split gene; interrupted gene):基因 编码序列中有与氨基酸编码无关的DNA间隔序列 ,使一个基因分隔成不连续的若干区段。这种编 码序列不连续的间断基因称为~。
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• 断裂基因的表达程序是:先转录成初级转录物 ,又叫前体mRNA,然后经过删除和连接,除 去无关的DNA间隔序列的转录物,便形成了成 熟的mRNA分子;它从细胞核中输送到细胞质 ,再译成相应有多肽链。其中被剪除的DNA部 分叫间隔序列或内含子(intron),被保留下 来的DNA部分叫编码序列或外显子(exon) 。这种内含子的除和外显子的连接,形成成熟 的mRNA的过程,称为RNA剪接。
– 杂交(hybridization):当复性DNA分子由不同的两 条链分子形成时,这种复性称为~。
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• DNA的复制 • 复制是一个复杂的过程,可参看有关书籍。
– DNA复制特点:从特定的开始并按特定的方向进行 (5’→3’);DNA分子的复性是半保留复制;DNA 分子的复制是半不连续复制;DNA分子的复制是通 过DNA聚合酶及各种相关的酶蛋白、蛋白因子的协 同有序的工作完成的;DNA分子复制具有高度的精 确性和准确性
粘性末端(sticky end/cohesive end )
Hind III
GTCGAC CAGCTG
BamH I
GGATCC CCTAGG
GTC + GAC CAG CTG
G
+GATCC
CCTAG
G
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粘性末端
5´-端突出
5' AATTC 3' G
3´-端突出
5' G
3' ACGTC
限制性核酸内切酶识别序列长度为4~8个bp。
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基因工程研究的对象
研究生物大分子,如:蛋白质、核酸 、多糖等调节生命过程的物质,包括它们 的结构、性状、代谢。
分子生物学是基因工程的基础。
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工具酶
• 三大类:
– 限制性内切酶 – 连接酶 – 修饰酶
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Restriction enzymes( recognize specific short sequences of DNA and cleave the duplex (sometimes at target site, sometimes elsewhere, depending on type). 识别序列常是一组含4-6个核苷酸的回文序列. 是一类能识别和切割双链DNA分子中的某特定核苷核 酸序列的酶
• 如果DNA中的核苷酸序列是随机排列的,则一个识别四核 苷酸序列的内切酶平均每隔256bp(44)出现一次该酶的 识别切割位点,同样的对识别六或八核苷酸序列的内切酶 则大致上分别是每隔4096bp(46)或65,536bp(48)出现一次 识别切割位点。按此可大致估计一个未知的DNA分子限制 性内切酶可能具有切点频率,以便选用合适的内切酶。
• 如有株名,再加上一个字母; • 其后用大写罗马数码Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ……区分同菌株种内具有
的不同限制性修饰系统 。 例如:从流感嗜血杆菌d株(Haemophilus
influenzae d)中先后分离到3种限制酶,则分别命名为 HindⅠ、HindⅡ和HindIII。
BamHⅠ Cla I EcoR Ⅰ Hind III
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• DNA变性、复性与杂交
– DNA变性(DNA denaturation):在高温及强碱长 期保持下,双链DNA分子氢键断裂,两条链完全分 离,形成单DNA分子。
– 复性(renaturation)或退火(annealing):变性 DNA分子经处理又可重新形成天然DNA分子,这 个过程称~。降低温度、pH及增加盐浓度均可促 进DNA的复性。
• DNA修复主要包括三个步骤:
– DNA修复核酸酶对DNA双链上不正常的碱 基的识别与切割;DNA聚合酶对已切割区 域的重新合成;DNA连接酶对剩下切口的 修补
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• 基因
– 基因是具有遗传疚的DNA片段,也是编码 蛋白质或RNA分子遗传信息的基本遗传单 位。
– 2001.2.12由美、中、日、英、法等国宣布 人类基因组草图完成,人类基因组由31.67 亿个碱基组成,共有3万个左右基因
是分子生物学中应用最广的限制性内切酶。通常在重组DNA技术提到的限制性 核酸内切酶主要指Ⅱ类酶而言。
II类酶识别序列特点为回文结构。 ······GGATCC ······ ······CCTAGG ······
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三、限制性内切酶的切割位点
大部分限制性核酸内切酶识别DNA序 列具有回文结构特征,切断的双链DNA都 产生5’磷酸基和3’羟基末端。不同限制性核 酸内切酶识别和切割的特异性不同
3. DNA 直线排列于染色体上,存在于细胞核中 。
4. DNA有自我复制的能力。
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DNA自我复制示意图
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DNA双螺旋碱基配对图
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RNA(核糖核酸)
• 存在于细胞质中 • 分别有三种功能不同的RNA
rRNA tRNA rRNA • mRNA为遗传密码,由DNA转录而来
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限制性核酸内切酶的分类
限制性核酸内切酶
(restriction endonuclease)
识别DNA的特异序列,并在识别位 点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。
是细菌内存在的保护性酶。分为I、II 、III三类。
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I
II
III
DNA底物
双链DNA
双链DNA
双链DNA
辅因子
识别序列 识别点对称
– DNA分子复制的速度:细菌:104~105核苷酸/min ,而在真核细胞中为500~5000核苷酸/min
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• DNA的修复
– DNA复制时可能由于DNA聚合酶引发的偶 然的错误,或者由于环境因素致使DNA产 生序列上的错误,此时生物体内存在着的修 复系统就会对DNA的变异起保护修复的作 用。
• 重组质粒基因包括:
标记片段 启动子 目的基因 终止子
载体基因片段
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基因工程的一般操作步骤
目的基因的获得
载体的选择
重组质粒的构建 导入目标生物体细胞内
转基因重组体的获得 转基因生物的鉴定
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基因工程的特点
• 生物的基因可以在人类、动物、植物和微 生物四大系统间进行交流
• 可以大大缩短育种年限。 • 变异可以定向
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• 基因工程的内容和方法 • 主要内容:
– 分离制取带有目的基因的DNA片段;在体 外,将目的基因连接到行当的载体上;将重 组的DNA分子导入受体细胞并扩增繁殖; 从大量的细胞繁殖群体中,筛选出获得了重 组DNA分子的重组体;外源基因的表达和 产物的分离和纯化。
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• 主要方法
– 密度梯度离心;DNA分子的切割与连接、核酸 分子杂交、凝胶电泳、细胞转化、DNA序列结 构分析以及人工合成、基因定点突变和PCR扩 增等多种新技术、新方法。
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基因工程的基本原理和内容
1. 染色体
一、基本概念
2. DNA(脱氧核糖核酸)
3. RNA(核糖核酸)
4. 基因
5. 中心法则
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• 1、DNA分子是由两条互 相平行的脱氧核苷酸长链 盘绕而成的。 2、DNA分子中的脱氧核 糖和磷酸交替连接,排在 外侧,构成基本骨架,碱 基排列在内侧。 3、两条链上的碱基通过 氢键相结合,形成碱基对 ,它的组成有一定的规律 。
第二章 基因工程与食品科学
• 概述 • 基因工程定义
– 是指按人们的需要,用类似工程设计的方法将不同 来源的基因(DNA分子),在体外构建杂种DNA 分子,然后导入受体细胞,并在受体细胞内复制、 转录和表达的操作。又称为DNA重组技术。
• 基因工程的实施包括四个必要的条件:工具酶 、基因、载体和受体
Mg++
Mg++
ATP
SAM
特异(识别和结合于特定 特异 的DNA序列位点)
否
回文序列
Mg++ ATP
特异 否
切割位点 甲基化功能
随机切断在识别位点以 外的DNA序列,通常在识 别位点周围400-1000bp
有
识别位点范围内或 它近端处固定位点
无
在识别序列周围 25-30bp范围内固 定位点
有
(ATP:腺嘌呤核苷三磷酸;SAM:S—腺苷酰甲硫氨酸)
• 限制性核酸内切酶的种类很多,至今已发现近800多种, 可以根据它们对DNA有不同的识别序列和切割特征选用, 从而为基因工程提供了有力的工具。表列出了几种最常用 的限制性核酸内切酶的识别序列和切割点。
– 现代研究表明:基因是一个功能单位,但不 是一个不可分割的的最小的重组单位和突变 单位,它包含若干个空谈子和重组子。
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• 移动基因(movable gene):是指一个或以从染 色体基因组上的一个位置转移到另一个位置,甚 至在不同的染色体之间跃迁,故也称为跳跃基因 。但这种移动只是移动一个拷贝,在原来的位置 还保留一份拷贝。
有关基因的概念
• 基因是含有一定功能的DNA片段,是遗传的基本单位 。
• 获取某段有一定生理功能的DNA片段叫基因克隆。
• 找出某段有一定生理功能的DNA片段在染色体上的位 置叫基因定位。
• 测定出某段有一定生理功能的DNA片段的碱基序列叫 基因测序。
• 按照一定的碱基序列,以核苷酸为原料,合成某段有 一定生理功能的DNA片段叫基因合成。