化学软件应用---ChemOffice

• 3.1.3.3 图形的旋转或缩放
如果不改变图形模板的话，在绘图区每单击一次鼠标， 就会出现一个选定模板的图形。单击鼠标左键后不松 手，则可以通过移动鼠标使图形旋转，待转动到希望的 位置时松手即可。 画好的图形也可以旋转和缩放。用选取框或套索选中 图形，此时图形被一灰色框笼罩，上方中央一点为旋转 控制点，鼠标移至此会变成双箭头，单击鼠标可以旋转 图形。右下角为缩放控制点，拖动这个角可以按比例改 变图形大小。
O
O N HO HO
OH OH N O
O
并非所有的化合物名称都能得到结构式，如果无法由 名字产生结构式，ChemDraw会弹出显示提示信息。
• 1.3.6 根据结构得出化合物命名
如果确定了化合物的结构，想知道其系统命名，可 以借助ChemDraw。 绘制化合物结构式 选中此结构，【Structure】/【Convert Structure to
Map】菜单命令即可打开符号窗
口。 单击 按钮，可以选择各种 Windows字体和符号，包括汉 字。
（2）改变字体 【Text】/【Font】 菜单命令可以改变字
体。 Windows的所有字
体都可以在ChemDraw
中使用，也包括汉字字
体。
（3）改变颜色
默认状态下，ChemDraw的文字和绘制的图形是黑色 的，根据实际需要可以变换文字及图形的颜色。 • 选中画好的结构式或图形 • 单击【Color】，出现下拉菜单，除了黑色之外，还包 含6中可以选择的颜色 • 单击所选中的颜色，完成改变颜色的操作。 • 若不喜欢给出的颜色，单击【Others】选项，弹出 【颜色】调色板，其中由更多的颜色可供选择，还可以 自定义颜色。
Name】，即可在结构式下面出现系统命名。 并非所有的结构式都能给出化合物名称，如果无法由 结构产生系统命名，ChemDraw会弹出窗口给出提示 信息。
HO OH HO NH
肾上腺素结构式
肾上腺素的系统命名
• 1.3.7 预测核磁共振化学位移
ChemDraw可以根据结构式预测分子的1H和13C核磁
共振化学位移。 例：心安得（propranolol）是一种心血管药物，能抑制
心脏的收缩率，避免过度兴奋和阻止神经冲动，保证心
壁平滑肌的收缩。
• 绘制化合物结构式
• 选中此结构，【Structure】/【Predict 1H-NMRShifts】，出现该化合物的1H核磁共振化学位移值及图
谱
• 缩小当前窗口，返回绘制结构式的窗口
• 1.3.10 绘制化学反应式
以氨基苯酚合成对氨基水杨酸为例：
使用苯环模板绘制苯环 使用单键模板，在苯环间位上分别绘制出羟基和氨 基，得到氨基苯酚 用选取框选中氨基苯酚，鼠标变成 “手”形状，按住 Ctrl键，“手”形鼠标上出现“+”号，向右拖动鼠标，将 氨基苯酚结构式复制出一份到新位置，并在氨基对位上 绘制单键，其终点的连接点上键入COONa，得到对氨 基水杨酸钠 再复制一份对氨基水杨酸钠至新位置，并将COONa改 为COOH
能是自动执行的，如果结构式中有红色方框罩住的原子
或官能团，在绘制时应引起注意。
• 1.3.5 根据化合物名称得到结构式
如果知道了化合物的英文名称，可能就不需要逐键绘
制结构式了，因为ChemDraw提供了一种功能，可以 根据化合物的名称自动给出结构式。化合物名称必须时
英文名，最好时系统命名的。
☆ 【Structure】/【Convert
Name to Structure】，弹
出对话框 ☆ 在输入框中输入化合物的英文名，点击OK即可出现结
构式
ChemDraw也能根据一些化合物的缩写给出结构 式，如EDTA。在输入框中输入EDTA，即可出现 EDTA的结构式。 有时输入化合物的商品名或俗名也能得到结构 式，如输入“aspirin”，即可得到阿司匹林的结构 式。 如输入“morphine”即可得到吗啡的结构式。
使用箭头模板，绘制两条水平箭头
使用文字模板在第一个箭头上下方分别输入“NaHCO3, CO2”， “120℃，4kg/cm2”，在第二个箭头上下方分
别输入“H2SO4”，“30℃以下，pH=3.5”，最终得到 对氨基水杨酸合成反应式。
OH
3 o 2 2
NH2
• 1.3.11 符号、字体和颜色
（1）输入特殊符号 有时需要在结构式或反应方程 式中输入特殊符号。 【View】/【Show Character
OH O
O
3.在绘图区单击鼠标，出现一个苯环；
4.单击 （单键）按钮，将鼠标移至苯环的一个角上，出 现深色的正方形连接点，如图所示。 5.自连接点横向拉出一根实线单键，松开鼠标，自单键终 点向右下方再次拉出一根单键，与前一根单键夹角约为 109°，余类推。 6.多重键的方法同5。
7. 选中垂直工具栏 中的文本工具，分 别将鼠标移2 图形存盘
画好的分子结构图形可以保存为文件，以备将来使用 或修改。ChemDraw文件的扩展名为“cdx”。 【File】/【Save As】，弹出【另存为】对话框，
即可保存。【保存类型】有多种选项，可另存为Chem
Draw 3.x版的格式（“chm”），或“gif”、“bmp”图形 格式，或另存为ISIS格式。
环戊二烯（Cp Rings）
环烷（Cycloalkans）
DNA
官能团（Functional Groups）
己醣（Hexoses）
苯环（Ph Rings）
纳米管 （Nanotubes）
多面体（Polyhedra）
RNA
立体中心 （Stereocenters）
超分子 （Supramolecules）
3.1 ChemDraw
• ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组 件，是国际上绝大多数杂志指定的论文排版软 件，为不同的杂志备有不同的模板，应用最为广 泛。 • 其理念是“化学家能懂的，ChemDraw也应该
懂”。
主要功能
• AutoNom：依照IUPAC命名化学结构； • ChemNMR：预测13C和1H的NMR近似谱图； • ChemProp：预测BP、MP、临界温度、临界气 压、吉布斯自由能、logP、折射率、热结构等性质； • Chemspec：可输入JCAMP及SPC频谱资料，用以比 较ChemNMR预测的结果； • ClipArt：高品质的实验室玻璃仪器图库，可搭配 ChemDraw使用； • Name=Struct：输入IUPAC化学名称后就可自动产生 ChemDraw结构。
以心安得化合物为例：
【Analysis】窗口
【Chemical Properties】】窗口
• 1.3.9 元素周期表
ChemDraw提供了一张使用起来十分方便的元素周
期表。 【View】/【Show Periodic Table Window】即可打
开元素周期表窗口。 单击周期表上的元素符号，就可以得到该元素的物理 性质。单击表中的 按钮，可以打开或关闭周期表下 方的物理性质详细列表。
ChemOffice 构成
• 版本为ChemOffice Ultra 2010版。主要包含如 下软件和组成： • ChemDraw Ultra 11.0：化学结构绘图。 • Chem3D Ultra 11.0：分子模型及仿真。 • ChemFinder Ultra 11.0：化学信息搜寻整合系 统 • E-Notebook 11.0：整理化学信息、文件和数 据，并从中取得所要的结果。
化学办公软件 ChemOffice
ChemOffice简介
• 分子式和结构式是化学家的语言，这类特殊的数 据需要专门软件来处理。目前已经有了许多化学 软件问世，其中ChemOffice是世界上最优秀的 化学软件，集强大的应用功能于一身，其结构绘 图是国内外重要论文期刊制定的格式。化学工作 者可以用ChemOffice去完成自己的想法，与同 行交流化学结构、模型和相关信息。是化学工作 者的必备软件。
的位置，待出现连
接点后，点击键盘 上的O键。
在绘制过程中，化学键键角难以精确掌握，且 拖拉化学键或键点的过程中难免会造成键长的变 化和图形的扭曲，因此需要对图形进行整理。除 了手动调整外，还可以通过ChemDraw的相关菜 单命令进行整理。
8.单击
选取框按钮，选中画好的
阿司匹林结构式。 9.执行【Structure】/【Clean Up Structure】命令，整理图形，即可 将结构式整理到最佳状态。该命令 可多执行几次，直到结构式的形状 不再变化。
•1.1 主界面
椅式环己烷
环戊二烯
• ChemDraw主界面自上而下分为菜单栏、工具 栏和绘图窗口。绘图窗口左侧是垂直工具栏，其 中的工具和模板是化学专用的。有些模板按钮下 面带有 箭头，单击该按钮不松开，会在其右侧 弹出子工具栏。
【询问工具】 【箭头】 【轨道】 【绘图元素】 【括弧】【化学符号】
• 1.2 模板
垂直工具栏上的【模板】包含了多种较复杂的分子种
类和玻璃仪器模板。分别如下：
氨基酸（Amino Acids Side Chains）
氨基酸（Amino Acids）
芳香族（Aromatics）
双环（Bicyclics）
玻璃仪器（Clipware）
构象异构体 （Conformers）
式、摩尔质量、同位素分布图，元素分析组成比例等数
据。 【View】/【Show Chemical Properties
Window】，弹出化学性质窗口，包含该化合物的沸
点、熔点、临界温度、临界压力、临街体积、Gibbs自 由能、LogP、MR、Herry’s Law、生成热、ClogP、 CMR等。
• 【Structure】/【Predict 13C-NMR-Shifts】,出现该
化合物的13C核磁共振化学位移值及图谱 • 有了这两张谱图，在实测样品的核磁共振，就会心中 有数。
• 1.3.8 分析结构估计性质 ChemDraw可以对化合物结构进行分析计算。 选中化合物结构式，【View】/【Show Analysis Window】，弹出分析窗口，包含该化合物的分子简
• 编辑快捷键与其他软件如word相同，常用的与图形编
辑有关的快捷键： Ctrl+A：全选 ，Ctrl+C：复制，Ctrl+V：粘贴，
Ctrl+X：剪切， F9：下标 ， F10：上标 ， Ctrl+R：旋转图形，可以设定旋转角度，
Ctrl+K：改变图形大小，可以设定键长， Ctrl+Shift+H：水平翻转图形， Ctrl+Shift+V：垂直翻转图形。
ChemDraw包括了众多的模板，我们想画的
东西多数已经包括在其中了，熟悉这些模板， 我们可以根据这些模板迅速组合成希望的分子 形状。
1.3 绘图实例
我们主要利用ChemDraw绘制一些结构式，预测反
应方程式，搭建化学反应仪器等。
O
1.3.1 绘制结构式
以阿司匹林结构式的绘制为例： 1. 启动ChemDraw； 2. 选中垂直工具栏最下端的 按钮，鼠标变成苯环的样子；
撤销操作，单击 【Undo】
旋转控制点
缩放控制点
• 1.3.4 检查结构错误和整理结构式
ChemDraw可以检查绘制的结构是是否有问题，选 中结构式后，进行【Structure】/【Check structure】菜单命令，ChemDraw就会将一个红色方 框罩在有问题的源自或官能团上，便于用户检查。该功
菜单栏 常用工具栏 套索 结构透视 实线单键 多重箭 虚线键 碎线键 碎线楔键 粗键 楔形键 空楔形键 波浪键 序列工具 脂肪族链 环丙烷 环戊烷 环庚烷 椅式环己烷 苯环 状态栏 选取框 质谱碎片 橡皮 文本工具 笔
格式工具栏
绘图窗口
箭头
轨道 绘图元素 括号 化学符号
询问工具 高级工具
模板 环己烷 环丁烷 环辛烷
• 1.3.12 快捷菜单和快 捷键
（1）快捷菜单
ChemDraw快捷菜单包
含了多种选项，使用快捷菜 单能完成常用编辑、属性设 置、模板选择等功能。 在选中的结构上单击鼠标 右键，会弹出快捷菜单。
（2）快捷键
• 常用的与结构有关的快捷键：
Ctrl+Shift+K：整理结构式 Ctrl+Shift+N：将化合物名称转换为结构式 Alt+Ctrl+Shift+N：将结构式转换为化合物名称