贵州地方山羊CPT-1A基因在不同品种和组织中的表达差异
贵州4个山羊群体mtDNACytb基因多态性研究
贵州 山羊 是 我 国优 良地 方 品 种 ，具有 肉质 好 ，
板 皮 张 幅 大 ， 应 性 、 病 性 强 ， 殖 性 能 好 等 特 适 抗 繁
Ｇｅ ｔｃ Ｄｉ ｅ ｓｔ ｎｅｉ ｖ ｒ ｉｙ Ａｎａ ｙ ｉ － ｌ ｓｓｏｆ Ａ
Ｇｅ ｎｄ Ｉｓ Ｃｏ ｒ ｌ ｔｏ ｎｅ ａ ｔ ｒ ｅ ａ ｉ ｎ ｔ ｉｋ Ｐｅ ｆ ｒ ａ ｅ ｉ ｏ ｈ ｒ ｈ Ｍ ｌ ｒ ｏ ｍ ｎｃ ｎ Ｓ ｕｔ ｅ ｎ Ｃｈｉ ｅ ｅ Ｈｏ ｓｅ ｎ ｎ ｓ ｌｔ ｉ
ｇ ｎ ｘ ｎ ２ ｘ ｎ ４，ｅ ｏ ６ ｘ ｎ ３ ｎ Ｃｈ ｎ ｓ ｌｔｉ ｏ ｕ ａｉｎ ｗａ ｅｅ ｔｄ ｕ ｉｇ Ｐ ｅ ｅ ｅ ｏ ，ｅ ｏ ｘ ｎ ２ ，ｅ ｏ ４ ｉ ｉｅ ｅ Ｈｏｓｅｎ ｐ ｐ ｌｔ ｓ ｄ ｔｃ ｅ ｓｎ ＣＲ —Ｓ ＣＰ ｉ ｈ ｓ ｓｕ ｙ ｏ Ｓ ｎ ｔｉ ｔｄ ．
２Ｓ ａ ｇ ａ Ｂ ｇ ｔ ｌ ｅｎＣ ．ｔ， ｈ ｎ ｈ ｉ２ ０ ７ ， ｈｎ ） ．ｈ ｎ ｈ ｉ ｒ ｈ ｓ ｉ ｏＬｄ Ｓ ａ ｇ ａ ０ ０ ２Ｃ ｉａ ｉ Ｈｏ ｔ
Ａ ｓｒ ｃ： ａ ｙ ｃ ｎ ａｅ（Ａ Ｎ ｐ ｙ ｅ ｐｒ ｎ ｌ ｉ ｍ ｍ ａａ ｔｙ ｔ ｓ ． ｈ ｏ ｍ ｒｈｓ ｆ Ａ Ｎ ｂｔａ ｔ Ｆｔ ｉ ｓ ｔ ｓ Ｆ Ｓ ） ｌ ｓ ｒ ｉ ｏ ａｔｏ ａ ｍ ｌ ｎｆ ｎ ｅｉ Ｔ ｅ ｌ ｏ ｉ ｏ Ｆ Ｓ ｔａ ｄ ｙ ｈ ａ ｖ ｙ ｍ ｔ ｒｅｎ ｉ ａｓ ｈ ｓ ｐｙ ｐ ｍ
片段进行 测序分析和 比较 。结果表 明：５条 山羊的 Ｃ ｔ 基 因序列均为 １１０ ｐ的 同源基 因序列 ； ５ ｙｂ ４ ｂ 总共发现 １ 个 １
变异住 点， 观察到 １ ０种单倍型 ； ４个山羊群体 中单倍型 多样性 为 ０４ ２，８９ 核 苷酸 多样度 为 ００ １５＇０２ 。 ． ，． ， ４＇ ８ － ０ ． ４ － ． ５ 贵 ０ － ０ ０ 州山羊的遗传 多样性处 于中等水 平 ； 州山羊可分为两大类群 ， 贵 即贵州黑 山羊和贵 州麻 羊 ２个群体 为一类 ； 州 贵
贵州本地山羊TFB1M基因启动子区多态性生物信息学分析
Bioinformatics Analysis on the SNP of Promoter Ｒegion of TFB1 M Gene in Local Goat in Guizhou Province
贵州本地山羊 TFB1 M 基因启动子区多态性生物信息学分析
孙岩岩， 罗卫星， 谢海强， 宋桃伟， 刘彬， 蔡惠芬
*
（ 贵州大学动物科学学院 / 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室 ， 贵州 贵阳 550025 ） 摘要： 目的： 采用 DNA 池结合 PCＲ 技术， 筛选 TFB1 M 基因启动子区 SNP 位点， 并分析其对启动子区的影响 。 方法： 利用多 CpG 岛。结果： TFB1 M 基因启动子区发现 1 个 SNP 位 转录因子结合位点、 种生物信息学软件预测 TFB1 M 基因核心启动子范围、 点 G － 234A。TFSEAＲCH 软件预测结果显示 TFB1M 基因启动子区转录因子 ADＲ1 与 Sp1 位置调换， 且 ADＲ1 位置的提前导致 TFB1 M 基因转录效率增高。结论： G － 234A 位点可能影响 TFB1 M 基因转录， 试验结果为进一步分析 TFB1 M 基因启动子区功能 奠定基础。 关键词： TFB1 M； SNP； 启动子
J］ . Nucleic Acids Ｒesearch， rapid annotation of ribosomal ＲNA genes ［ 2007 ， 35 （ 9 ） ： 3100 － 3108. ［ 11］Ｒttig M， Medema MH， Blin K， et al. NＲPSpredictor2 － a web server J］ . Nucleic Acids Ｒefor predicting NＲPS adenylation domain specificity ［ search， 2011 ， 39 （ suppl 2 ） ： W362 － W367. ［ 12］Tamura K， Stecher G， Peterson D， et al. MEGA6 ： Molecular EvolutionJ］ . Molecular Biology and Evoluary Genetics Analysis Version 6. 0 ［ tion， 2013 ， 30 （ 12 ） ： 2725 － 2729. ［ 13］Han D， Hu Z. Mutations stabilize small subunit ribosomal ＲNA in des. Current Microbiology， 2007 ， iccation － tolerant cyanobacteria Nostoc ［J］ 54 （ 4 ） ： 254 － 259. ［ 14］Cai F， Axen SD， Kerfeld CA. Evidence for the widespread distribution of CＲISPＲ － Cas system in the Phylum Cyanobacteria ［J］ . ＲNA Biology， 2013 ， 10 （ 5 ） ： 687 － 693. ［ 15］Delaye L， Moya A. Abundance and distribution of the highly iterated palindrome 1 （ HIP1 ） among prokaryotes ［ J］ . Mobile Genetic Elements， 2011 ， 1 （ 3 ） ： 159 － 168. ［ 16］Griffiths － Jones S， Moxon S， Marshall M， et al. Ｒfam： annotating non J］ . Nucleic Acids Ｒesearch， 2005 ， － coding ＲNAs in complete genomes ［ 33 （ suppl 1 ） ： D121 － D124. ［ 17］Shih PM， Wu D， Latifi A， et al. Improving the coverage of the cya. Pronobacterial phylum using diversity － driven genome sequencing ［J］ 2013 ， 110 （ 3 ） ： 1053 ceedings of the National Academy of Sciences， － 1058. ［ 18］Cao H， Shimura Y， Masanobu K， et al. Draft genome sequence of the toxic bloom － forming cyanobacterium Aphanizomenon flos － aquae NIES － 81 ［ J］ . Genome Announcements， 2014 ， 2 （ 1 ） ： e00044 － 00014. ［ 19］Stolyar S， Liu Z， Thiel V， et al. Genome sequence of the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus sp. strain NK55a ［ J］ . Genome An2014 ， 2 （ 1 ） ： e01060 － 01013. nouncements， ［ 20］Morris J， Crawford T， Jeffs A， et al. Whole genome re － sequencing of two ‘wild － type’ strains of the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC J］ . New Zealand Journal of Botany， 2014 ， 52 （ 1 ） ： 36 － 47. 6803 ［ ［ 21］Fujisawa T， Okamoto S， Katayama T， et al. CyanoBase and ＲhizoBase： databases of manually curated annotations for cyanobacterial and rhizobial . Nucleic Acids Ｒesearch， 2014 ， 42 （ D1 ） ： D666 － D670. genomes ［J］
贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异
贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异杨家大【摘要】[目的]揭示贵州地方山羊瘦素基因(Leptin)表达水平的组织分布规律及品种差异,为研究Leptin基因与山羊肉质的关系提供参考依据.[方法]以黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊为研究对象,南江黄羊为对照,采用TaqMan实时荧光定量PCR对其肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中的Leptin基因表达水平进行测定.[结果]Lptin基因在不同山羊品种的肝脏、肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中呈高表达,均以皮下脂肪的Leptin基因表达水平最高,且在黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊4个贵州地方山羊品种中,皮下脂肪中的表达水平显著高于心脏、肺脏、背最长肌和半膜肌(P＜0.05).除肝脏内Leptin基因表达水平在各品种间无显著差异(P＞0.05)外,在肾脏、心脏、肺脏、背最长肌、半膜肌、皮下脂肪中的表达水平均存在品种差异,且以贵州白山羊最高.[结论]贵州地方山羊品种Leptin基因表达的组织分布规律相似,均以皮下脂肪最高,在品种方面则以贵州白山羊的整体表达水平较高.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2015(046)005【总页数】6页(P876-881)【关键词】贵州地方山羊;Leptin基因;组织分布;品种差异【作者】杨家大【作者单位】凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里556011【正文语种】中文【中图分类】S827.890 引言【研究意义】贵州地方山羊品种资源丰富，如贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、黔东南小香羊等。
这些山羊品种适宜山地放牧、抗逆性强、繁殖力高、育肥性能好、肉质优良，在我国山羊品种资源中占据重要位置，尤其是黔东南小香羊膻味轻、肉质细嫩多汁，是山羊肉产品之上品（陈祥等，2004）。
因此，研究贵州地方山羊品种的肉质形成机制对大力发展贵州生态养羊业具有重要意义。
贵州地方山羊Leptin基因表达的组织分布规律及品种差异
Ｌ ｅ ｐ ｉ ｆ ｎ 基 因表达水平进行测定 。【 结果 】 Ｌ ｅ ｐ ｔ ｉ ｎ ￣ 因在不 同山羊品种的肝脏 、 肾脏 、 心脏 、 肺脏 、 背最长肌 、 半膜肌 和皮下
Ｄ Ｏ Ｉ ： １ ０ ． ３ ９ ６ ９ ￣： ｉ ｓ ｓ ｎ ． ２ ０ ９ ５ － １ １ ９ １ ． ２ ０ １ ５ ． ５ ． ８ ７ ６
贵州地方山羊Ｌ ｅ ｐ ｔ ｉ ｎ 基 因表达的组织 分布规律及品种差异
杨 家 大
（ 凯里 学院 环境与生命 科学学院，贵 州 凯里 ５ ５ ６ ０ １ １ ）
南方农 业学报
Ｊ ｏ ｕ ｒ ｎ ａ ｌ ｏ ｆ Ｓ ｏ ｕ ｔ ｈ ｅ ｒ ｎ Ａ ｃ ｕ ｌ ｔ ｕ ｒ ｅ ２ ０ １ ５ ， ４ ６ （ ５ ） ： ８ ７ ６ — ８ ８ １
ｈ ｔ ｔ ｐ： ／ ／ ｗ ｗｗ． ｎ ｆ ｎ ｙ ｘ ｂ． ｅ ｎ
Ｉ Ｓ Ｓ Ｎ ２ ０９ ５ —１ １ ９１ ；ＣＯＤＥＮ ＮＮＸＡＡＢ
摘要 ： 【 目的】 揭示 贵州地方 山羊瘦素基 因（ Ｌ ｅ ｐ ｔ ｉ ｎ ） 表达水平 的组织分布规律及 品种 差异 ， 为研究 Ｌ ｅ ｐ ｔ ｉ ｎ 基 因与 山 羊 肉质 的关系提供参考依据 。 【 方法 】 以黔东南小香羊 、 贵州 白山羊 、 贵州黑 山羊 、 黔北麻羊４ 个贵州地方山羊 为研究对
高， 在品种方面则以贵州 白山羊的整体表达水平较高。 关键词 ：贵州地方 山羊 ；Ｌ ｅ ｐ ｔ ｉ ｎ 基因 ；组织分布 ；品种差异
中 图分 类 号 ： ￥ ８ ２ ７ ． ８ ９ 文 献标 志码 ： Ａ 文章 编 号 ： ２ ０ ９ ５ — １ １ ９ １ （ ２ ０ １ ５ ） ０ ５ — ０ ８ ７ ６ — ０ ６
贵州地方山羊品种肌肉生长抑制素基因的表达差异
贵州地方山羊品种肌肉生长抑制素基因的表达差异杨家大;彭舒【摘要】为了解贵州地方山羊肌肉生长抑制素基因(Myostatin)的表达部位及组织分布模式,比较各组织中Myostatin基因表达的品种间差异,以β-actin作为内参基因,应用TaqMan实时荧光定量方法检测了黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊等贵州地方山羊品种以及南江黄羊的肝、肾、心、肺、背最长肌、半膜肌、皮下脂肪组织中Myostatin基因mRNA的表达水平.结果显示:肝和皮下脂肪中Myostatin基因的表达水平较高,肾和肺次之,半膜肌、背最长肌和心等肌肉组织中的表达水平相对较低;而半膜肌和背最长肌中Myostatin基因的表达水平高于心肌.肝和皮下脂肪Myostatin基因的表达在各品种间差异不显著;心、肺、肾、背最长肌和半膜肌中Myostatin基因的表达,贵州白山羊显著高于黔东南小香羊和黔北麻羊;肺、背最长肌和半膜肌中,Myostatin基因的表达贵州白山羊显著高于贵州黑山羊和南江黄羊.可见,贵州地方山羊心、肝、肺、肾、背最长肌、半膜肌和皮下脂肪中均有Myostatin基因表达,其组织表达水平总体为肝和皮下脂肪＞肾和肺＞半膜肌、背最长肌和心(肌),且多数组织中Myostatin基因的表达存在品种差异.【期刊名称】《江苏农业学报》【年(卷),期】2015(031)002【总页数】7页(P369-375)【关键词】肌肉生长抑制素;实时荧光定量;贵州地方山羊;基因表达【作者】杨家大;彭舒【作者单位】凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里556011;凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里556011【正文语种】中文【中图分类】S827肌肉生长抑制素(MSTN),又称转化生长因子8 (Growth differentiation factor 8,GDF-8),是一类分子量为2.5×104的糖蛋白[1],对肌肉生长发育具有负调控作用,与肌肉量的增长[2-4]和脂肪沉积[5-6]有关。
KAP6.1基因在两个山羊品种间的表达差异
KAP6.1基因在两个山羊品种间的表达差异
赵俊星;任有蛇;岳文斌
【期刊名称】《家畜生态学报》
【年(卷),期】2008(29)2
【摘要】KAP6.1基因是编码羊绒的结构蛋白基因之一,以辽宁绒山羊和岢岚本地山羊作为研究对象,利用FQRT-PCR技术对KAP6.1基因在2个品种皮肤中的表达差异进行了研究.结果显示:KAP6.1基因在两个山羊品种皮肤中均有表达.辽宁绒山羊的表达量是岢岚当地山羊表达量的1.3倍.品种内部,公山羊的表达量都高于母山羊,其中,辽宁绒山羊公羊的表达量是母羊的2.5倍,岢岚当地山羊公羊的表达量是母羊的1.8倍.
【总页数】3页(P14-16)
【作者】赵俊星;任有蛇;岳文斌
【作者单位】山西农业大学动物科技学院,山西,太谷,030801;山西农业大学动物科技学院,山西,太谷,030801;山西农业大学动物科技学院,山西,太谷,030801
【正文语种】中文
【中图分类】S811.5
【相关文献】
1.贵州地方山羊品种肌肉生长抑制素基因的表达差异 [J], 杨家大;彭舒
2.PGC-1α基因在两种类型鸡骨骼肌间的表达差异 [J], 束婧婷;宋卫涛;朱文奇;单艳菊;章明;陶志云;胡艳;徐文娟;李慧芳
3.KAP6.1基因在两个山羊品种间的表达差异 [J], 赵俊星;任有蛇;岳文斌
4.以5-(6-羧酸-2-萘基)-间苯二羧酸为配体构筑的两个镉的金属-有机骨架化合物的合成、晶体结构及荧光性质 [J], 陈飞燕;蓝尤钊;何亚兵;冯云龙
5.PRKAA2基因在肿瘤细胞与血细胞中表达差异研究 [J], 孙春霞;陈书坤;郑磊因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
山羊肉质相关主效基因研究进展
动物营养学报２０２０，３２（６）：２５０７⁃２５１２ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＮｕｔｒｉｔｉｏｎ㊀ｄｏｉ：１０．３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１００６⁃２６７ｘ．２０２０．０６．００９山羊肉质相关主效基因研究进展陈滇黔１㊀张华琦２㊀韩㊀勇３∗（１．贵州大学动物科学学院，贵州大学贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室，贵阳５５００２５；２．铜仁职业技术学院，贵州省畜禽健康养殖协同创新中心，铜仁５５４３００；３．贵州省农业科学院畜牧兽医研究所，贵阳５５０００５）摘㊀要：影响山羊肉质的指标很多，其中肌内脂肪（ＩＭＦ）㊁肌肉嫩度㊁肌苷酸（ＩＭＰ）是业界公认的部分主要指标㊂本文对ＩＭＦ㊁肌肉嫩度㊁ＩＭＰ的相关主效基因脂肪型脂肪酸结合蛋白（Ａ⁃ＦＡＢＰ）㊁心脏型脂肪酸结合蛋白（Ｈ⁃ＦＡＢＰ）㊁腺苷酸琥珀酸裂解酶（ＡＤＳＬ）㊁钙蛋白酶１（ＣＡＰＮ１）及钙蛋白酶抑制蛋白（ＣＡＳＴ）基因近年来的研究进展情况进行综述，以期为开展山羊肉质相关主效基因的研究及肉用性状选育提供一定的理论参考㊂关键词：山羊；肌内脂肪；肌肉嫩度；肌苷酸；主效基因中图分类号：Ｓ８２７㊀㊀㊀㊀文献标识码：Ａ㊀㊀㊀㊀文章编号：１００６⁃２６７Ｘ（２０２０）０６⁃２５０７⁃０６收稿日期：２０１９－１２－０２基金项目：国家重点研发计划子课题 幼龄山羊培育与高效养殖技术集成应用（２０１８ＹＦＤ０５０１９０２⁃０１）；肉羊培育与产业化学科团队建设（黔牧医所团队培育［２０１８］０３号）作者简介：陈滇黔（１９９４ ），女，贵州遵义人，硕士研究生，研究方向为动物营养㊂Ｅ⁃ｍａｉｌ：１６０３４７９８６４＠ｑｑ．ｃｏｍ∗通信作者：韩㊀勇，副研究员，硕士生导师，Ｅ⁃ｍａｉｌ：２６４２９００２２５＠ｑｑ．ｃｏｍ㊀㊀随着社会经济的刚性发展，人们生活水平逐渐提高，膳食结构向营养健康方向转变㊂山羊肉作为肉质细嫩㊁味道鲜美㊁蛋白质高㊁胆固醇低㊁热量低㊁富含人体必需氨基酸和微量元素的营养健康肉品，倍受消费者青睐，其市场需求量越来越大㊂影响山羊肉质的因素主要有饲养方式㊁营养水平㊁屠宰加工及基因调控等㊂山羊肉质评定的指标主要有肌肉嫩度㊁ｐＨ㊁肉色㊁系水力㊁肌内脂肪（ｉｎｔｒａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｔ，ＩＭＦ）含量㊁脂肪酸含量以及肌苷酸（ｉｎｏｓｉｎｅｍｏｎｏｐｈｏｓｐｈａｔｅ，ＩＭＰ）含量等㊂近年来，分子生物学及基因工程等新技术在畜禽育种工作中应用越来越广泛，目标基因功能解析越来越快捷准确㊂随着数量性状的主效基因序列中大量的单核苷酸多态性（ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒ⁃ｐｈｉｓｍ，ＳＮＰ）位点的发现，使畜禽的标记辅助选择育种突破了传统的常规育种方法，加快了畜禽遗传改良的速度㊂本文对山羊肉质主要指标ＩＭＦ㊁ＩＭＰ㊁肌肉嫩度的相关主效基因脂肪型脂肪酸结合蛋白（ａｄｉｐｏｃｙｔｅｆａｔｔｙ⁃ａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ，Ａ⁃ＦＡＢＰ）㊁心脏型脂肪酸结合蛋白（ｈｅａｒｔｆａｔａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｏｒｏｔｅｉｎ，Ｈ⁃ＦＡＢＰ）㊁腺苷酸琥珀酸裂解酶（ａｄｅｎｙｌｏｓｕｃｃｉｎａｔｅｌｙａｓｅ，ＡＤＳＬ）㊁钙蛋白酶１（ｃａｌ⁃ｐａｉｎ１，ＣＡＰＮ１）及钙蛋白酶抑制蛋白（ｃａｌｐａｓｔａｔｉｎ，ＣＡＳＴ）基因的研究进行综述，旨在为探索山羊强度育肥下上述基因的表达调控构建技术思路和研究方法㊂１㊀调控山羊ＩＭＦ含量的主效基因㊀㊀ＩＭＦ主要沉积在肌束膜及肌束周围，形成可见的大理石花纹，其含量是评价肉质的重要指标之一，对肌肉的风味㊁嫩度㊁大理石纹等具有重要的影响［１］㊂研究表明，ＩＭＦ直接参与肌肉嫩度㊁多汁性和风味的形成［２］㊂脂肪合成是从脂肪酸的合成和摄取开始，山羊ＩＭＦ的沉积受到脂肪代谢关键基因等复杂的基因网调控，同时受动物生长㊁脂肪酸组成等因素综合影响［３－４］㊂有研究表明，Ａ⁃ＦＡＢＰ㊁Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因是影响ＩＭＦ沉积的主效基因［５－８］㊂１．１㊀Ａ⁃ＦＡＢＰ㊀㊀Ａ⁃ＦＡＢＰ又称为脂肪酸结合蛋白４（ＦＡＢＰ４），㊀动㊀物㊀营㊀养㊀学㊀报３２卷是一种膜周边蛋白，该蛋白在脂肪细胞中能与脂肪酸结合，能将脂肪酸从脂解部位运输到质膜，有利于脂肪酸的释放，从而促进脂肪酸的代谢和运转［９］㊂有研究表明，Ａ⁃ＦＡＢＰ基因是影响肉质性状的候选基因［８］㊂山羊Ａ⁃ＦＡＢＰ基因序列长３９９ｂｐ，编码１３２个氨基酸［１０］㊂Ａ⁃ＦＡＢＰ基因在黔东南小香羊㊁贵州白山羊㊁贵州黑山羊㊁黔北麻羊和南江黄羊５个山羊品种的皮下脂肪㊁心脏㊁肝脏㊁肺脏㊁肾脏㊁背最长肌及半膜肌等组织中均有表达，且皮下脂肪的表达量高于其他组织［１１］㊂天府肉羊Ａ⁃ＦＡＢＰ基因表达量变化受年龄的影响最大，并随着年龄的增长表达量也随之增长；且Ａ⁃ＦＡＢＰ基因表达量与ＩＭＦ含量表现为显著负相关［１０］㊂张伟［１２］在西农萨能奶山羊ＦＡＢＰ４基因外显子２㊁内含子２发现ＳＮＰ：Ｇ⁃３６３２⁃Ａ㊁Ａ⁃３７１６⁃Ｇ㊂研究发现，在饲粮中添加１．５ｍｇ／ｄ铬饲喂伊朗本地品种Ｍａｈａｂａｄｉ山羊羔羊可显著降低ＦＡＢＰ４基因的表达量［１３］㊂１．２㊀Ｈ⁃ＦＡＢＰ㊀㊀Ｈ⁃ＦＡＢＰ也称为脂肪酸结合蛋白３（ＦＡＢＰ３），是一类低分子质量（约１５ｋｕ）的胞浆蛋白，该蛋白可以将脂肪酸从细胞膜运送到β－氧化以及三酰甘油和磷脂的合成位置，它与脂肪酸特异性结合，使细胞内外保持一定的浓度差，从而促进脂肪酸摄取［１４］㊂Ｈ⁃ＦＡＢＰ具有促进细胞内脂肪酸转运的功能，同时被称为转运蛋白，在脂肪酸转运㊁基因转录等方面发挥着重要作用［１５］㊂研究证明，ＦＡＢＰ３基因是影响山羊ＩＭＦ含量的候选基因［１６］㊂山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因完整编码区（ＣＤＳ）大小为４０２ｂｐ，编码１３３个氨基酸，由４个外显子和３个内含子组成［１７－１８］㊂ＦＡＢＰ３基因在藏山羊和南江黄羊中的背最长肌㊁大肠㊁小肠㊁子宫㊁大脑㊁肾脏㊁脾脏和心脏组织中高表达㊂研究发现，饲粮中添加鱼油可下调ＦＡＢＰ３基因表达［１９－２０］㊂近几年，多个山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因ＳＮＰ位点被发现，但多数ＳＮＰ需要研究者验证㊂钱成等［２１］在黔北麻羊外显子３筛选到ＳＮＰ位点Ｔ１２０Ａ，该位点对黔北麻羊ＲＮＡ二级和蛋白二级结构稳定性的影响较大，继而影响其生长发育㊂王兰萍等在［２２］江苏地方山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因第２外显子１３２ｂｐ位点处发现ＳＮＰ位点的ＧＣ基因型能提高ＩＭＦ含量的遗传效应㊂谢一妮［５］在崇明白山羊㊁崇明杂山羊㊁徐淮山羊和关中奶山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因中检测到ＳＮＰ位点突变（Ａ１０１７Ｇ）和缺失（Ｇ９９９－），且２个ＳＮＰ位点均对ＩＭＦ含量有影响，为确定Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因是山羊ＩＭＦ含量的候选基因奠定了理论基础㊂２㊀调控山羊ＩＭＰ含量的主效基因㊀㊀ＩＭＰ属于芳香杂环化合物，其组成为６－羟基嘌呤核的杂环结构㊁１个核糖基团和１分子磷酸基，分子式为Ｃ１０Ｈ１３Ｎ４Ｏ８Ｐ［２３］㊂ＩＭＰ是畜禽肉质鲜味的主要影响因子，是最强的鲜味物质，能提高畜禽的肉质鲜味，是评定肉质鲜味的重要指标［２４－２５］㊂在畜禽死亡后，肌肉中的ＡＴＰ逐渐降解生成ＩＭＰ［２６］㊂腺苷琥珀酸裂解酶是ＩＭＰ在畜禽机体内沉积的关键酶之一，由ＡＤＳＬ基因编码，有研究表明，ＡＤＳＬ基因是影响肌肉中ＩＭＰ含量的主效基因［２７］㊂㊀㊀ＡＤＳＬ是ＩＭＰ合成酶系中催化合成嘌呤核苷酸起始合成与循环的唯一双功能酶［２８］㊂研究表明，ＡＤＳＬ基因是风味性状的主效基因［２７］㊂在ＧｅｎＢａｎｋ上发现，山羊ＡＤＳＬ基因ｃＤＮＡ长１６６６ｂｐ㊂有研究发现，中国美利奴羊（新疆军垦型）ＡＤＳＬ基因表达与ＩＭＰ含量呈正相关，基础饲粮添加１％方剂中草药，ＡＤＳＬ基因表达量增高［７］㊂不同饲养方式会影响ＡＤＳＬ基因在苏尼特羊肌肉中的表达量，放牧可以增加ＡＤＳＬ基因在苏尼特羊肌肉中的表达量［２９］㊂目前，ＡＤＳＬ基因在猪㊁鸡㊁鸭等畜禽上研究报道较多，但在山羊上的研究报道极少，需加强ＡＤＳＬ基因对山羊肉质的调控机理㊁分子标记等方面的研究㊂３㊀调控山羊肌肉嫩度的主效基因㊀㊀肌肉嫩度是指肉在食用时对肌纤维碎裂的抵抗力，反映了肉的质地，是评定山羊肉质的重要指标之一［３０］㊂研究表明，ＣＡＰＮ１和ＣＡＳＴ基因是调控畜禽肉质嫩度的主效基因［３１］㊂钙蛋白酶㊁ＣＡＳＴ及钙蛋白酶激活蛋白共同构成了细胞蛋白水解系统，存在于哺乳动物组织中，主要依赖Ｃａ２＋激活，其组分的相对含量决定了动物死后贮藏过程中肉质软化的程度［３２］㊂ＣＡＳＴ和ＣＡＰＮ１共同作用影响肌肉的嫩度［３３］㊂３．１㊀ＣＡＰＮ１㊀㊀ＣＡＰＮ１也称为μ钙蛋白酶（μ⁃ｃａｌｐａｉｎ），是钙蛋白酶家族的一员，它参与肌肉蛋白的降解过程，在肌肉嫩化过程中起重要作用，分布于细胞和亚细胞器中，由ＣＡＰＮ１基因编码［３４－３５］㊂赵伯阳［３６］８０５２６期陈滇黔等：山羊肉质相关主效基因研究进展克隆到山羊ＣＡＰＮ１基因ｃＤＮＡ序列长为２２６７ｂｐ，ＣＡＰＮ１基因包括完整的开放阅读框２１５１ｂｐ，编码７１６个氨基酸㊂研究发现，ＣＡＰＮ１基因在天府肉羊心脏㊁肝脏㊁脾脏㊁肺脏㊁肾脏㊁眼肌㊁腿肌组织中发现均有表达，其在肌肉组织中表达量最高，且１岁羊的各组织中ＣＡＰＮ１基因表达量均显著高于其他年龄段［３６］㊂王华［３７］在高山细毛羊㊁小尾寒羊㊁藏羊㊁蒙古羊和滩羊ＣＡＰＮ１基因中发现ＳＮＰ位点Ａ６３０Ｇ，位于外显子６，此位点与胴体重和肉色有显著相关性㊂ＣＡＳＴｍＲＮＡ表达量和ＣＡＳＴ与ＣＡＰＮ１ｍＲＮＡ表达量的比值对绵羊的肉嫩度﹑多汁性及大理石纹起负调控作用㊂ＣＡＳＴ与ＣＡＰＮ１ｍＲＮＡ表达量的比值对绵羊肉嫩度的调控作用最明显［３８］㊂３．２㊀ＣＡＳＴ㊀㊀ＣＡＳＴ是钙蛋白酶的内源性抑制蛋白，由ＣＡＳＴ基因编码，可抑制肌肉内蛋白质的降解，对肌肉生长和嫩度有重要影响，可通过Ｃａ２＋激活钙蛋白酶来提高肌肉嫩度，从而改善肉质［３９－４０］㊂目前，ＣＡＳＴ基因已被确定为影响肉质的重要候选基因［４１］㊂山羊ＣＡＳＴ基因全长为２４３５ｂｐ，包含１个２１８７ｂｐ的开放读码框，编码１个含有７２８个氨基酸残基的蛋白［４２］㊂山羊ＣＡＳＴ基因序列与绵羊和牛ＣＡＳＴ基因序列就有较高的同源性，序列分析显示，在第６外显子中存在非同义氨基酸变异，在内含子区域内检测到同时存在序列变异和长度变异，推测此变异对山羊ＣＡＳＴ基因功能和表达有影响［４３］㊂研究发现，ＣＡＳＴⅡ基因在天府肉羊心脏㊁肝脏㊁脾脏㊁肺脏㊁肾脏㊁眼肌㊁腿肌组织中均有表达［３６］㊂Ｇｒｅｇｕｌａ⁃Ｋａｎｉａ等［４４］在生长羔羊ＣＡＳＴ基因１２内含子内进行基因型分析，发现 ａｃ 基因型公羊的腰部肌肉内脂肪含量最高，在提高羔羊肉质的育种工作可优先选择 ａｃ 基因型㊂王华［３７］在高山细毛羊㊁小尾寒羊㊁藏羊㊁蒙古羊和滩羊的ＣＡＳＴ基因发现ＳＮＰ位点Ｇ６２Ｔ和Ｃ１１０Ｔ，这２个位点对失水率和剪切力有显著影响㊂任霆［４５］在巴美肉羊的ＣＡＳＴ（第６外显子和３非翻译区）基因发现多肽位点ＣＡＳＴ⁃Ｐ４，ＣＡＳＴ⁃Ｐ４多肽位点基因型在宰前活重㊁胴体重和背最长肌处的亮度值存在显著差异，该位点与巴美肉羊肉质性状存在一定的关联性，可作为影响羊肉质性状候选基因进一步研究㊂Ｊａｗａｓｒｅｈ等［４６］在Ａｗａｓｓｉ羊ＣＡＳＴ基因发现ＳＮＰ位点Ｈｈａ１，基于ＣＡＳＴＨｈａ１基因多态性，对３组羔羊（３个基因型）进行为期７０ｄ的育肥试验，发现３种基因型间体重和长臂肌宽有显著差异㊂４㊀小结与展望㊀㊀目前研究显示，ＩＭＦ含量是肌肉风味和嫩度的重要指标，受Ａ⁃ＦＡＢＰ㊁Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因调控㊂对山羊Ａ⁃ＦＡＢＰ㊁Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因的研究主要集中于基因表达㊁基因多态性及饲粮对基因表达的调控方面，笔者尚未查阅到强度育肥对山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因表达影响的相关研究㊂当前，山羊肥羔越来越受到消费者的青睐，系统化地研究强度育肥对山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因表达的影响有助于为优质肥羔生产奠定生物学理论基础，助推山羊养殖业的提质增效㊂㊀㊀ＩＭＰ是山羊肉质鲜味的重要影响因子，其主效基因为ＡＤＳＬ基因，但该基因的相关研究主要集中在家禽上，在山羊上研究极少，山羊ＡＤＳＬ基因多态性㊁ｍＲＮＡ差异性表达㊁基因调控机理等方面的研究需要业内专家的积极努力，同时营养水平对ＩＭＰ含量的主效基因ＡＤＳＬ基因表达调控的研究尚未见到报道㊂㊀㊀大量研究证明，ＣＡＰＮ１与ＣＡＳＴ基因是畜禽肉质嫩度的主效基因，目前该基因在山羊上的研究主要集中在基因克隆测序㊁基因表达㊁基因多态性及与肉质关联性分析上，强度育肥对肉质嫩度的主效基因表达的影响研究尚未见报道，开展此方向的研究具有重要的理论和生产指导意义㊂参考文献：［１］㊀李海峰，耿爽，金鑫，等．延边黄牛ＳＲＥＢＰ１基因多态性与肌内脂肪酸组成的相关性研究［Ｊ］．延边大学农学学报，２０１７，３９（４）：６８－７２．［２］㊀ＳＵＺＵＫＩＫ，ＩＲＩＥＭ，ＫＡＤＯＷＡＫＩＨ，ｅｔａｌ．ＧｅｎｅｔｉｃｐａｒａｍｅｔｅｒｅｓｔｉｍａｔｅｓｏｆｍｅａｔｑｕａｌｉｔｙｔｒａｉｔｓｉｎＤｕｒｏｃｐｉｇｓｓｅｌｅｃｔｅｄｆｏｒａｖｅｒａｇｅｄａｉｌｙｇａｉｎ，ｌｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓｍｕｓ⁃ｃｌｅａｒｅａ，ｂａｃｋｆａｔｔｈｉｃｋｎｅｓｓ，ａｎｄｉｎｔｒａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｔｃｏｎ⁃ｔｅｎｔ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，２００５，８３（９）：２０５８－２０６５．［３］㊀朱武政，林亚秋，江明锋，等．肉用山羊脂代谢相关基因与肌内脂肪含量的相关性分析［Ｊ］．畜牧兽医学报，２０１６，４７（７）：１３３３－４１．［４］㊀李华伟．过瘤胃胆碱对肉羊脂肪代谢和肌内脂肪形成的调控作用及分子机制［Ｄ］．博士学位论文．扬９０５２㊀动㊀物㊀营㊀养㊀学㊀报３２卷州：扬州大学，２０１７．［５］㊀谢一妮．山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因多态性及其与肌内脂肪含量的相关性研究［Ｄ］．硕士学位论文．雅安：四川农业大学，２０１１．［６］㊀ＧＥＲＢＥＮＳＦ，ＶＥＲＢＵＲＧＦＪ，ＶＡＮＭＯＥＲＫＥＲＫＨＴ，ｅｔａｌ．Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓｏｆｈｅａｒｔａｎｄａｄｉｐｏｃｙｔｅｆａｔｔｙａｃｉｄ⁃ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｗｉｔｈｉｎｔｒａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｔｃｏｎｔｅｎｔｉｎｐｉｇｓ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，２００１，７９（２）：３４７－３５４．［７］㊀罗燕．中草药添加剂对中国美利奴羊（新疆军垦型）肉品质和风味的影响研究［Ｄ］．博士学位论文．石河子：石河子大学，２０１６．［８］㊀ＡＶＩＬＥＳＣ，ＰＯＬＶＩＬＬＯＯ，ＰＥＮＡＦ，ｅｔａｌ．Ａｓｓｏｃｉａ⁃ｔｉｏｎｓｂｅｔｗｅｅｎＤＧＡＴ１，ＦＡＢＰ４，ＬＥＰ，ＲＯＲＣａｎｄＳＣＤ１ｇｅｎｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓａｎｄｆａｔｄｅｐｏｓｉｔｉｏｎｉｎＳｐａｎｉｓｈｃｏｍｍｅｒｃｉａｌｂｅｅｆ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，２０１３，９１（１０）：４５７１－７．［９］㊀ＨＥＲＴＺＥＬＡＶ，ＢＥＮＮＡＡＲＳ⁃ＥＩＤＥＮＡ，ＢＥＲＮＬＯ⁃ＨＲＤＡ．Ｉｎｃｒｅａｓｅｄｌｉｐｏｌｙｓｉｓｉｎｔｒａｎｓｇｅｎｉｃａｎｉｍａｌｓｏｖｅｒｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇｔｈｅｅｐｉｔｈｅｌｉａｌｆａｔｔｙａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎｉｎａｄｉｐｏｓｅｃｅｌｌｓ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＬｉｐｉｄＲｅｓｅａｒｃｈ，２００２，４３（１２）：２１０５－２１１１．［１０］㊀余俊旭．天府肉羊ＦＡＭ１３４Ｂ和Ａ⁃ＦＡＢＰ基因克隆㊁序列分析及其肌内脂肪含量的相关性研究［Ｄ］．硕士学位论文．雅安：四川农业大学，２０１７．［１１］㊀杨家大．５种山羊脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白基因的表达谱研究［Ｊ］．中国畜牧兽医，２０１５，４２（６）：１５３８－４６．［１２］㊀张伟．奶山羊ＦＡＢＰ３和ＦＡＢＰ４基因的多态性与乳脂肪酸成分的关联分析［Ｄ］．硕士学位论文．杨凌：西北农林科技大学，２０１５．［１３］㊀ＳＡＤＥＧＨＩＭ，ＮＡＪＡＦＰＡＮＡＨＭＪ，ＢＡ⁃ＫＨＴＩＡＲＩＺＡＤＥＨＭＲ，ｅｔａｌ．Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｅｎｅｓｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎｌｉｐｉｄｍｅｔａｂｏｌｉｓｍｒｅｖｅａｌｓｔｈｅｒｏｌｅｏｆｃｈｒｏｍｉｕｍｉｎｒｅｄｕｃｉｎｇｂｏｄｙｆａｔｉｎａｎｉｍａｌｍｏｄｅｌｓ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＴｒａｃｅＥｌｅｍｅｎｔｓｉｎＭｅｄｉｃｉｎｅａｎｄＢｉｏｌｏｇｙ，２０１５，３２：４５－５１．［１４］㊀ＦＵＲＵＨＡＳＨＩＭ，ＨＯＴＡＭＩＳＬＩＧＩＬＧＳ．Ｆａｔｔｙａｃｉｄ⁃ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎｓ：ｒｏｌｅｉｎｍｅｔａｂｏｌｉｃｄｉｓｅａｓｅｓａｎｄｐｏｔｅｎ⁃ｔｉａｌａｓｄｒｕｇｔａｒｇｅｔｓ［Ｊ］．ＮａｔｕｒｅＲｅｖｉｅｗｓＤｒｕｇＤｉｓｃｏｖ⁃ｅｒｙ，２００８，７（６）：４８９－５０３．［１５］㊀ＧＬＡＴＺＪＦ，ＳＣＨＡＡＰＦＧ，ＢＩＮＡＳＢ，ｅｔａｌ．Ｃｙｔｏ⁃ｐｌａｓｍｉｃｆａｔｔｙａｃｉｄ⁃ｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎｆａｃｉｌｉｔａｔｅｓｆａｔｔｙａｃｉｄｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎｂｙｓｋｅｌｅｔａｌｍｕｓｃｌｅ［Ｊ］．ＡｃｔａＰｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａＳｃａｎｄｉｎａｖｉｃａＳｕｐｐｌｅｍｅｎｔｕｍ，２００３，１７８（４）：３６７－３７１．［１６］㊀ＷＡＮＧＬ，ＬＩＬ，ＪＩＡＮＧＪ，ｅｔａｌ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒｃｈａｒａｃｔｅｒ⁃ｉｚａｔｉｏｎａｎｄｄｉｆｆｅｒｅｎｔｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐａｔｔｅｒｎｓｏｆｔｈｅＦＡＢＰｇｅｎｅｆａｍｉｌｙｄｕｒｉｎｇｇｏａｔｓｋｅｌｅｔａｌｍｕｓｃｌｅｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ［Ｊ］．ＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙＲｅｐｏｒｔｓ，２０１５，４２（１）：２０１－２０７．［１７］㊀阴彦辉，韦光辉，李伟，等．徐淮山羊Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因克隆㊁表达产物亚细胞定位的研究及转基因小鼠的制备［Ｊ］．畜牧兽医学报，２０１２，４３（５）：６８４－６９２．［１８］㊀ＣＡＯＨＨ，ＺＨＡＮＧＧＸ，ＷＡＮＧＬＸ，ｅｔａｌ．ＳｅｑｕｅｎｃｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｆｒａｇｍｅｎｔｓｏｆｐｏｒｃｉｎｅＨ⁃ＦＡＢＰｇｅｎｅ［Ｊ］．Ｈｅｒｅｄｉｔａｓ，２００２，２４（２）：１４６－１４８．［１９］㊀ＦＡＵＬＣＯＮＮＩＥＲＹ，ＢＥＲＮＡＲＤＬ，ＢＯＢＹＣ，ｅｔａｌ．Ｅｘｔｒｕｄｅｄｌｉｎｓｅｅｄａｌｏｎｅｏｒｉｎｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎｗｉｔｈｆｉｓｈｏｉｌｍｏｄｉｆｉｅｓｍａｍｍａｒｙｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｐｒｏｆｉｌｅｓｉｎｌａｃｔａ⁃ｔｉｎｇｇｏａｔｓ［Ｊ］．Ａｎｉｍａｌ，２０１８，１２（８）：１５６４－７５．［２０］㊀蒋婧．山羊ＰＰＡＲγ和ＦＡＢＰ家族基因的分离鉴定㊁组织表达及其多态性检测［Ｄ］．硕士学位论文．雅安：四川农业大学，２０１２．［２１］㊀钱成，罗卫星，孙岩岩，等．贵州地方山羊品种Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因第３外显子ＳＮＰ研究［Ｊ］．生物技术，２０１５，２５（４）：３４９－３５４．［２２］㊀王兰萍，耿荣庆，冀德君，等．Ｈ⁃ＦＡＢＰ基因多态性与江苏地方山羊品种ＩＭＦ含量的关系［Ｊ］．生物技术，２０１２，２２（２）：４６－４９．［２３］㊀何宗亮，魏杨，杨硕，等．家禽肌肉肌苷酸含量影响因素的研究进展［Ｊ］．家禽科学，２０１８（９）：５５－５８．［２４］㊀ＮＡＲＵＫＡＷＡＭ，ＭＯＲＩＴＡＫ，ＨＡＹＡＳＨＩＹ．Ｌ⁃ｔｈｅａ⁃ｎｉｎｅｅｌｉｃｉｔｓａｎｕｍａｍｉｔａｓｔｅｗｉｔｈｉｎｏｓｉｎｅ５ᶄ⁃ｍｏｎｏｐｈｏｓ⁃ｐｈａｔｅ［Ｊ］．Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，ＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙａｎｄＢｉｏｃｈｅｍｉｓ⁃ｔｒｙ，２００８，７２（１１）：３０１５－３０１７．［２５］㊀ＭＡＳＩＣＵ，ＹＥＯＭＡＮＳＭＲ．Ｕｍａｍｉｆｌａｖｏｒｅｎｈａｎｃｅｓａｐｐｅｔｉｔｅｂｕｔａｌｓｏｉｎｃｒｅａｓｅｓｓａｔｉｅｔｙ［Ｊ］．ＡｍｅｒｉｃａｎＪｏｕｒ⁃ｎａｌｏｆＣｌｉｎｉｃａｌＮｕｔｒｉｔｉｏｎ，２０１４，１００（２）：５３２－５３８．［２６］㊀李仲玉，刘培峰，李佳凝，等．影响畜禽肌肉肌苷酸含量的因素及其相关基因的研究进展［Ｊ］．中国饲料，２０１７（３）：８－１１＋９．［２７］㊀ＹＥＭＨ，ＣＨＥＮＪＬ，ＺＨＡＯＧＰ，ｅｔａｌ．Ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎｂｅ⁃ｔｗｅｅｎｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓｉｎＡＤＳＬａｎｄＧＡＲＳ⁃ＡＩＲＳ⁃ＧＡＲＴｇｅｎｅｓｗｉｔｈｉｎｏｓｉｎｅ５ᶄ⁃ｍｏｎｏｐｈｏｓｐｈａｔｅ（ＩＭＰ）ｃｏｎｔｅｎｔｓｉｎＢｅｉｊｉｎｇ⁃ｙｏｕｃｈｉｃｋｅｎｓ［Ｊ］．ＢｒｉｔｉｓｈＰｏｕｌｔｒｙＳｃｉｅｎｃｅ，２０１０，５１（５）：６０９－６１３．［２８］㊀刘长青．山东省地方鸡种风味特性候选基因ＡＤＳＬ与ＡＴＩＣ的研究［Ｄ］．硕士学位论文．曲阜：曲阜师范大学，２００５．［２９］㊀罗玉龙，刘畅，李文博，等．两种饲养方式下苏尼特羊肉中鲜味物质含量及相关调控基因表达量［Ｊ］．食品科学，２０１９，４０（１３）：８－１３．［３０］㊀帕提姑㊃阿布都克热．新疆羊肉食用品质特性及相０１５２６期陈滇黔等：山羊肉质相关主效基因研究进展关影响因素的研究［Ｄ］．硕士学位论文．乌鲁木齐：新疆农业大学，２０１２．［３１］㊀王金浩，文生萍，饶华，等．影响牛肉品质的主效基因［Ｊ］．云南农业大学学报，２００８（５）：６９３－７．［３２］㊀ＳＨＡＲＭＡＲ，ＭＡＩＴＲＡＡ，ＰＡＮＤＥＹＡＫ，ｅｔａｌ．Ｓｉｎ⁃ｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓｉｎｃａｐｒｉｎｅｃａｌｐａｓｔａｔｉｎｇｅｎｅ［Ｊ］．Ｇｅｎｅｔｉｋａ，２０１３，４９（４）：５０５－５１２．［３３］㊀陆克龙．肉鸡ＣＡＰＮ１和ＣＡＳＴ基因遗传多态性及其与肌肉嫩度相关性［Ｄ］．硕士学位论文．南京：南京农业大学，２０１２．［３４］㊀ＫＥＭＰＣＭ，ＳＥＮＳＫＹＰＬ，ＢＡＲＤＳＬＥＹＲＧ，ｅｔａｌ．Ｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓ ａｎｅｎｚｙｍａｔｉｃｖｉｅｗ［Ｊ］．ＭｅａｔＳｃｉｅｎｃｅ，２０１０，８４（２）：２４８－５６．［３５］㊀ＯＮＯＹ，ＳＯＲＩＭＡＣＨＩＨ．Ｃａｌｐａｉｎｓ：ａｎｅｌａｂｏｒａｔｅｐｒｏｔｅ⁃ｏｌｙｔｉｃｓｙｓｔｅｍ［Ｊ］．ＢｉｏｃｈｉｍｉｃａｅｔＢｉｏｐｈｙｓｉｃａＡｃｔａ，２０１２，１８２４（１）：２２４－２３６．［３６］㊀赵伯阳．山羊ＣＡＰＮ１基因和ＣＡＳＴ基因Ⅱ型转录本克隆及在不同组织中的表达［Ｄ］．硕士学位论文．雅安：四川农业大学，２０１１．［３７］㊀王华．甘肃主要绵羊品种的ＰＲＫＡＧ３㊁ＣＡＳＴ和ＣＡＰＮ１基因多态性与肉品质相关性分析［Ｄ］．硕士学位论文．兰州：甘肃农业大学，２０１６．［３８］㊀燕凤．绵羊ＣＡＰＮ１㊁ＣＡＳＴ基因ｍＲＮＡ的发育性表达规律及其对肉品质的影响［Ｄ］．硕士学位论文．杨凌：西北农林科技大学，２００８．［３９］㊀陈冬金，陈岩锋，桑雷，等．钙蛋白酶抑制蛋白基因作为肉质候选基因的研究进展［Ｊ］．中国畜禽种业，２０１９，１５（１）：８－１０．［４０］㊀ＭＡＬＨＥＩＲＯＳＪＭ，ＥＮＲＩＱＵＥＺ⁃ＶＡＬＥＮＣＩＡＣＥ，ＤＡＳＩＬＶＡＤＵＲＡＮＢＯ，ｅｔａｌ．ＡｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｏｆＣＡＳＴ２，ＨＳＰ９０ＡＡ１，ＤＮＡＪＡ１ａｎｄＨＳＰＢ１ｇｅｎｅｓｗｉｔｈｍｅａｔｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓｉｎＮｅｌｌｏｒｅｃａｔｔｌｅ［Ｊ］．ＭｅａｔＳｃｉｅｎｃｅ，２０１８，１３８：４９－５２．［４１］㊀ＴＡＩＴＲＧＪｒ，ＳＨＡＣＫＥＬＦＯＲＤＳＤ，ＷＨＥＥＬＥＲＴＬ，ｅｔａｌ．ＣＡＰＮ１，ＣＡＳＴａｎｄＤＧＡＴ１ｇｅｎｅｔｉｃｅｆｆｅｃｔｓｏｎｐｒｅｗｅａｎｉｎｇｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ，ｃａｒｃａｓｓｑｕａｌｉｔｙｔｒａｉｔｓ，ａｎｄｒｅ⁃ｓｉｄｕａｌｖａｒｉａｎｃｅｏｆｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓｉｎａｂｅｅｆｃａｔｔｌｅｐｏｐｕｌａ⁃ｔｉｏｎｓｅｌｅｃｔｅｄｆｏｒｈａｐｌｏｔｙｐｅａｎｄａｌｌｅｌｅｅｑｕａｌｉｚａｔｉｏｎ［Ｊ］．ＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，２０１４，９２（１２）：５３８２－５３９３．［４２］㊀ＷＡＮＧＤＨ，ＸＵＧＹ，ＷＵＤＪ，ｅｔａｌ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒｃｌｏ⁃ｎｉｎｇａｎｄｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎｏｆｃａｐｒｉｎｅｃａｌｐａｓｔａｔｉｎｇｅｎｅ［Ｊ］．ＭｏｌｅｃｕｌａｒＢｉｏｌｏｇｙＲｅｐｏｒｔｓ，２０１１，３８（６）：３６６５－３６７０．［４３］㊀ＺＨＯＵＨ，ＨＩＣＫＦＯＲＤＪＧ．Ａｌｌｅｌｉｃｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｏｆｔｈｅｃａｐｒｉｎｅｃａｌｐａｓｔａｔｉｎ（ＣＡＳＴ）ｇｅｎｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄｂｙＰＣＲ⁃ＳＳＣＰ［Ｊ］．ＭｅａｔＳｃｉｅｎｃｅ，２００８，７９（２）：４０３－４０５．［４４］㊀ＧＲＥＧＵＬＡ⁃ＫＡＮＩＡＭ，ＧＲＵＳＺＥＣＫＩＴＭ，ＪＵＮＫＵＳＺＥＷＡ，ｅｔａｌ．ＡｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｏｆＣＡＳＴｇｅｎｅｐｏｌ⁃ｙｍｏｒｐｈｉｓｍｗｉｔｈｃａｒｃａｓｓｖａｌｕｅａｎｄｍｅａｔｑｕａｌｉｔｙｉｎｔｗｏｓｙｎｔｈｅｔｉｃｌｉｎｅｓｏｆｓｈｅｅｐ［Ｊ］．ＭｅａｔＳｃｉｅｎｃｅ，２０１９，１５４：６９－７４．［４５］㊀任霆．巴美肉羊ＣＡＳＴ和ＭｙｏＤ基因ＳＮＰ检测及其与肉品质相关性研究［Ｄ］．硕士学位论文．呼和浩特：内蒙古农业大学，２０１５．［４６］㊀ＪＡＷＡＳＲＥＨＫＩ，ＡＬ⁃ＡＭＡＲＥＥＮＡＨ，ＡＡＤＰＹ．ＲｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓｂｅｔｗｅｅｎＨｈａ１ｃａｌｐａｓｔａｔｉｎｇｅｎｅｐｏｌｙ⁃ｍｏｒｐｈｉｓｍ，ｇｒｏｗｔｈｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ，ａｎｄｍｅａｔｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓ⁃ｔｉｃｓｏｆＡｗａｓｓｉｓｈｅｅｐ［Ｊ］．Ａｎｉｍａｌｓ，２０１９，９（９）：６６７．１１５２㊀动㊀物㊀营㊀养㊀学㊀报３２卷∗Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ，ａｓｓｏｃｉａｔｅｐｒｏｆｅｓｓｏｒ，Ｅ⁃ｍａｉｌ：２６４２９００２２５＠ｑｑ．ｃｏｍ（责任编辑㊀武海龙）ＲｅｓｅａｒｃｈＰｒｏｇｒｅｓｓｏｎＭｅａｔＱｕａｌｉｔｙＲｅｌａｔｅｄＭａｊｏｒＧｅｎｅｓｏｆＧｏａｔｓＣＨＥＮＤｉａｎｑｉａｎ１㊀ＺＨＡＮＧＨｕａｑｉ２㊀ＨＡＮＹｏｎｇ３∗（１．ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＧｅｎｅｔｉｃｓ，ＢｒｅｅｄｉｎｇａｎｄＲｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎｏｆＰｌａｔｅａｕＭｏｕｎｔａｉｎＡｎｉｍａｌｓ，ＭｉｎｉｓｔｒｙｏｆＥｄｕｃａｔｉｏｎ，ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅ，ＧｕｉｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕｉｙａｎｇ５５００２５，Ｃｈｉｎａ；２．ＧｕｉｚｈｏｕＣｏｏｐｅｒａｔｉｖｅＩｎｎｏｖａｔｉｏｎＣｅｎｔｅｒｏｆＬｉｖｅｓｔｏｃｋａｎｄＰｏｕｌｔｒｙＨｅａｌｔｈＢｒｅｅｄｉｎｇ，ＴｏｎｇｒｅｎＶｏｃａｔｉｏｎａｌａｎｄＴｅｃｈｎｉｃａｌＣｏｌｌｅｇｅ，Ｔｏｎｇｒｅｎ５５４３００，Ｃｈｉｎａ；３．ＡｎｉｍａｌＨｕｓｂａｎｄｒｙａｎｄＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＲｅｓｅａｒｃｈＩｎｓｔｉｔｕｔｅ，ＧｕｉｚｈｏｕＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｇｕｉｙａｎｇ５５０００５，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｈｅｒｅａｒｅｍａｎｙｆａｃｔｏｒｓｔｈａｔａｆｆｅｃｔｇｏａｔｍｅａｔｑｕａｌｉｔｙ，ａｍｏｎｇｏｆｔｈｅｍ，ｉｎｔｒａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｔ（ＩＭＦ），ｍｕｓｃｌｅｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓ，ｉｎｏｓｉｎｅｍｏｎｐｈｏｓｐｈａｔｅ（ＩＭＰ）ａｒｅｓｏｍｅｋｅｙｉｎｄｉｃａｔｏｒｓｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄｂｙｔｈｅｉｎｄｕｓｔｒｙ．Ｔｈｉｓａｒｔｉ⁃ｃｌｅｆｏｃｕｓｅｄｏｎｒｅｖｉｅｗｔｈｅｒｅｓｅａｒｃｈｐｒｏｇｒｅｓｓｉｎｒｅｃｅｎｔｙｅａｒｓｏｆｒｅｌａｔｅｄｍａｊｏｒｇｅｎｅｓｏｆｈｅａｒｔｆａｔａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏ⁃ｔｅｉｎ（Ｈ⁃ＦＡＢＰ），ｈｅａｒｔｆａｔａｃｉｄｂｉｎｄｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎ（Ｈ⁃ＦＡＢＰ），ａｄｅｎｙｌｏｓｕｃｃｉｎａｔｅｌｙａｓｅ（ＡＤＳＬ），ｃａｌｐａｉｎ１（ＣＡＰＮ１）ａｎｄｃａｌｐａｓｔａｔｉｎ（ＣＡＳＴ）ｇｅｎｅｓｆｏｒＩＭＦ，ｍｕｓｃｌｅｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓａｎｄＩＭＰ．Ｉｔａｉｍｅｄｔｏｐｒｏｖｉｄｅｓｏｍｅｒｅｆｅｒ⁃ｅｎｃｅｔｏｓｔｕｄｙｔｈｅｒｅｌａｔｅｄｍａｊｏｒｇｅｎｅｓｏｎｍｅａｔｑｕａｌｉｔｙｏｆｇｏａｔｓ，ａｎｄａｌｓｏｔｏｒｅｓｅａｒｃｈｏｆｂｒｅｅｄｉｎｇｏｆｍｅａｔｔｒａｉｔｓｏｆｇｏａｔｓ．［ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＡｎｉｍａｌＮｕｔｒｉｔｉｏｎ，２０２０，３２（６）：２５０７⁃２５１２］Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｇｏａｔｓ；ｉｎｔｒａｍｕｓｃｕｌａｒｆａｔ；ｍｕｓｃｌｅｔｅｎｄｅｒｎｅｓｓ；ｉｎｏｓｉｎｅｍｏｎｐｈｏｓｐｈａｔｅ；ｍａｊｏｒｇｅｎｅ２１５２。
CPT1基因在肿瘤中的研究进展
CPT1基因在肿瘤中的研究进展沈天允;史志周【摘要】肉碱棕榈酰转移酶1(CPT1)是肝脏组织细胞中长链脂肪酸β-氧化的关键调节酶和限速酶.其亚型CPT1A和CPT1 C能够促进肿瘤的生长.CPT1A在胶质母细胞瘤、淋巴瘤、食管癌和乳腺癌等多种恶性肿瘤中扩增且高表达,抑制CPT1A活性和表达的药物具有明显的抗肿瘤作用.因此CPT1在肿瘤癌变中具有重要促进作用,可能成为肿瘤诊断的分子标志物和抗肿瘤治疗的新靶点.【期刊名称】《基础医学与临床》【年(卷),期】2016(036)002【总页数】5页(P262-266)【关键词】CPT1;β-氧化;恶性肿瘤;肿瘤癌变【作者】沈天允;史志周【作者单位】昆明理工大学医学院,云南昆明650500;昆明理工大学医学院,云南昆明650500【正文语种】中文【中图分类】R34恶性增殖是肿瘤的基本特征之一，该过程需要消耗大量的原料和能量，为了适应这种需要，肿瘤细胞将发生代谢重编程(tumor metabolic reprogramming)，而脂质合成与分解代谢的异常是肿瘤细胞代谢重编程的重要特征。
在肿瘤细胞中，一方面脂肪酸的从头合成明显增加，以满足细胞增殖对脂质的需要；另一方面当肿瘤细胞缺乏葡萄糖时，将通过增强脂肪β-氧化来满足细胞对能量的需求。
在脂肪β-氧化过程中，长链脂肪酸需转变为酰基肉毒碱才能进入线粒体基质进行氧化，而该过程的关键调节酶是肉碱棕榈酰转移酶(carnitine palmitoyltransferase，CPT)。
CPT包括CPT1和CPT2两个亚型，其中CPT1位于线粒体外膜的外表面，负责催化酰基和肉碱形成酰基肉毒碱，CPT2位于线粒体内膜的内表面，负责催化线粒体基质中酰基肉毒碱的酰基和游离的辅酶A形成酰基辅酶A。
大量研究发现，由于CPT1功能异常导致的β-氧化异常在肿瘤的发生发展中过程发挥重要作用，因此本文将综述CPT1在肿瘤中的研究进展。
肉碱棕榈酰转移酶1(CPT1)通过跨膜结构域定位于线粒体外膜，并且其N末端和C末端均位于线粒体外膜的胞质侧。
山羊褪黑激素受体1A基因HinfⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析本科毕业论文 推荐
本科毕业论文题目：山羊褪黑激素受体1A基因Hin fⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析姓名：贾征学号040801030 专业：动物科学指导教师：杨利国职称教授中国·武汉二○○八年六月分类号密级华中农业大学本科毕业论文山羊褪黑激素受体1A基因Hin fⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析Hin fⅠ-RFLP of Melatonin receptor 1 A(MTNR1A) gene and the association with the litter size traits in goat学生姓名：贾征学生学号：040801030学生专业：动物科学指导教师：杨利国教授华中农业大学动物科学学院二○○八年六月目录摘要 (4)ABSTRACT (5)前言 (6)1.材料与方法 (7)1.1材料 (7)1.1.1 试验动物 (7)1.1.2 实验材料 (7)1.1.3主要试剂的来源 (7)1.1.4主要仪器设备 (8)1.1.5主要试剂的配置 (8)1.1.6主要分子生物学软件................................ 错误！未定义书签。
1.2方法 (9)1.2.1.山羊基因组DNA的提取 (9)1.2.2.引物设计及其序列 (10)1.2.3.PCR扩增及其电泳检测 (10)1.2.4. 限制性内切酶消化扩增产物以及电泳检测 (12)1.2.5.统计分析 (13)2 结果与分析 (13)2.1PCR扩增结果 (13)2.2酶切结果 (14)2.3褪黑激素基因频率和基因型频率分析结果 (15)2.4MTNR1A基因型与波尔山羊头胎产羔数性状的关联分析 (15)2.5MTNR1A基因型与经产产羔数性状的关联分析 (16)3 讨论 (16)3．1不同山羊品种基因型频率及基因频率差异 (16)3．2MTNR1A不同基因型对波尔山羊头胎和经产羔数的影响 (17)参考文献 (17)致谢 (18)山羊褪黑激素受体1A基因Hin fⅠ酶切多态性及其与产羔数性状的关联分析摘要本研究以褪黑激素受体1A 基因为候选基因，分析该基因多态性对山羊产羔数性状的影响。
贵州山羊遗传多样性及其起源研究
ｄ ｔｒ ｎ ｄ Ｔ ｅ ｈ ｐ ｏ ｙ ｅ ｄ ｖ ｒ ｉ ｎ ｕ ｌｏ ｉ ｅ ｄ ｖ ｒ ｉ ｒ ９ １ ５ —０． ９ ｎ ５ ８ ３％ 一１ ９ ０ ４ ｅ ｅｍｉｅ ． ｈ ａ ｌ ｔ ｐ ｉ ｅ ｓｔ ａ ｄ ｎ ｃ ｅ ｔ ｉ ｅ ｓｔ ｗｅ ｅ ０． ６ ｙ ｄ ｙ ９ ０ ５ ａ ｄ １． ８ ． ０ ％
Ａｂ ｔ ａ ｔ ｈ ｏ ｌ ｔ ｅ ｕ ｎ ｅ ｆｍｉ ｃ ｏ ｄ ｉ ｓｒ ｃ ：Ｔ ｅ ｃ ｍｐ ｅｅ ｓ ｑ ｅ ｃ ｓ ｏ ｔ ｈ ｎ ｒａ ＤＮＡ Ｄ—ｏ ｐ ｏ ２ ｉｄ ｖ ｄ ａｓ ｉ ｈ ｅ ｉ ｏ ｏ ｔｂ ｅ ｄ ｅ ｅ ｏ ｌ ｌ ｏ ｆ ｎ ｉ ｉｕ ｌ ｎ ｔ ｒｅ Ｇｕ ｚ ｕ ｇ ａ ｒ ｅ ｓ ｗ ｒ ４ ｈ ａ ａｙ ｅ ｙ ＤＮＡ ｓ ｑ ｅ ｃｎ ｅ ｈ ｏｏ ｙ Ｔ ｅ ｒ ｓ ｔ ｓ ｏ ｄ ｔ ａ ｅｌ ｎ ｔ ｆｍｔ ｎ ｚｄｂ ｌ ｅ ｕ ｎ ｉｇ ｔ ｃ ｎ ｌ ｇ ． ｈ ｅ ｕ ｓ ｈ ｗｅ ｔ ｈ ｅ ｇ ｈ ｏ ＤＮＡ Ｄ— ｐ ｉ ｉｈ ｕ ｇ ａ ａ １ ｌ ｈ ｔ ｌ ｎ Ｇｕ ｚ ｏ ｏ ｔｗ ｓ １２ ２ ｏ
ｍ Ｄ Ａ Ｄ １ ｐ全序 列分子长为 １２ ２～１２ ３ ｐ 检测 到 ６ ｔＮ ．ｏ ｏ １ １ｂ ， ７个变异位 点， 占分析位 点总数 的 ５ ５ ％ ， 定 了 ３ 约 ．３ 界 ３ 种单倍型 。贵 州山羊品种单倍型 多样度 为 ０ ９ １５～ ． ９ 核苷 酸多样 度为 １ ５ ８３ ～１ ９０４ ， 明贵 州 ．６ ０ ９ ０５， ． ８ ％ ．０ ％ 表 山羊品种遗传 多样性丰富。根据 ｍｔＮ Ｄ Ａ单倍 型构建 了贵 州山羊 的 Ｎ 分子 系统 树 ， Ｊ 聚类表 明 ， 州山 羊存 在 支 贵
系 Ａ和 支 系 Ｂ 两 大母 系起 源 。
山羊低氧适应性相关基因的表达量研究
山羊低氧适应性相关基因的表达量研究作者：肖骁字向东等来源：《湖北农业科学》2013年第09期摘要：为了探讨藏山羊低氧生态适应性的分子调节机理，采用实时荧光定量PCR技术对藏山羊和乐至黑山羊低氧诱导因子（HIF-1α）、血管内皮生长因子（VEGF165）及其受体FLT-1和FLK-1基因的表达量进行测定。
结果表明，在垂体组织中，乐至黑山羊hif-1α、vegf165和flk-1的mRNA相对表达量分别是藏山羊的1.43倍、1.93倍和4.25倍，差异显著（P0.05）；在肝脏组织中，乐至黑山羊hif-1α、vegf165和flt-1的mRNA相对表达量分别是藏山羊的2.08倍、1.52倍和3.21倍，差异显著（P0.05）。
说明经过长期生物进化和环境选择，藏山羊对于高原低氧环境已经表现出明显的适应性，目的基因的表达量均低于乐至黑山羊。
关键词：藏山羊；实时荧光定量PCR；mRNA表达量；低氧适应性中图分类号：S827 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2013）09-2181-04低氧诱导因子-1（Hypoxia inducible factor-1， HIF-1）是一种能特异性结合于促红细胞生成素基因的低氧反应原件（HRE）的DNA结合蛋白，它广泛参与动物细胞中缺氧诱导产生的适应性反应，是细胞适应低氧的重要蛋白转录调节因子[1]。
HIF-1是由对氧敏感的α亚基和稳定表达的β亚基组成的异源二聚体[2]。
作为HIF-1的调节亚基和活性亚基，HIF-1α决定HIF-1的活性，实现HIF-1的生物效应。
低氧环境下HIF-1α在组织细胞中广泛表达，在某些基因的启动子、增强子或其他调控区也都含有HIF-1α的特异结合序列，这说明在低氧诱导的各种相关基因的表达中HIF-1α起着关键作用[2]。
血管内皮生长因子（Vascular endothelial growth factor，VEGF）是对血管形成具有重要作用的生长因子。
不同海拔高度来源山羊心肌、肺和背最长肌的转录组比较分析
不同海拔高度来源山羊心肌、肺和背最长肌的转录组比较分析我国本地山羊分布在各种各样的栖息地,并且经过长期人工的驯养已经对当地的气候环境条件形成了适应性。
为了探讨由于长期高海拔气候适应所导致的山羊基因组的变化,本文以生活在我国600米、2,000米和3,000米三个不同海拔高度的本地山羊为研究对象,采集对高海拔气候极为敏感的心肌、肺和背最长肌三种组织作为研究样本,每个种群取三个生物学重复,通过构建27个组织样本文库进行转录组测序(RNA-seq),平均每个文库获得了约4Gb、共129Gb的高质量测序数据,89.14%-96.48%的clean reads可以比对到山羊参考基因组。
通过全基因组表达谱分析发现,全基因组范围内至少在一个组织中表达的基因有12,421个,占已被注释的山羊参考基因组基因总数(22,131个)的56.12%；基因表达谱和序列特征主要受海拔高度影响,海拔高度越接近的样本全基因组表达谱和序列越相似。
通过差异基因筛选、鉴定和功能富集分析发现,差异基因数目和表达模式在不同种群和组织之间差异显著(P<0.05),心肌、背最长肌、肺三个组织中,与高海拔适应性相关的差异表达基因数目依次减少,表明心脏组织对高海拔低氧环境更敏感；差异表达基因主要富集在线粒体及其组成相关的通路、蛋白质折叠绑定和置建立、腺苷三磷酸酶(ATPase)活性、细胞氧化还原内稳态等与低氧应答机制相关的通路中,在低氧刺激的应答机制中发挥着不可或缺的作用。
单核苷酸非同义突变(nsSNV)鉴定结果显示,高海拔和低海拔种群之间发生突变的基因数目和突变位点数都存在显著的差异性(P<0.05),表明高海拔和低海拔地区的山羊经过长期的自然选择,在外界环境的诱导下基因组水平上存在很大差异。
本文研究结果为揭示山羊高海拔适应性的分子机制提供了科学依据,为今后山羊高海拔适应性的相关研究提供了宝贵的参考。
贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析
中国畜牧兽医 2024,51(3):926-935C h i n aA n i m a lH u sb a n d r y &V e t e r i n a r y Me d i c i n e 贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析宋兴超,孟金柱,赵园园,吴震洋,安清明(铜仁学院农林工程与规划学院,贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,铜仁554300)摘 要:ʌ目的ɔ克隆贵州白山羊肌细胞生成素(m y o g e n i n )基因并对其结构特性进行生物信息学分析,为进一步探索该基因调控山羊肌肉发育的分子机制提供重要参考依据㊂ʌ方法ɔ以贵州白山羊血液基因组D N A 为模板,设计4对特异性引物,运用P C R 扩增㊁S a n g e r 直接测序及序列拼接方法获得贵州白山羊m y o g e n i n 基因完整编码区核苷酸序列,应用B i o E d i t 7.0㊁N e t P h o s 3.1㊁C o n s e r v e dD o m a i n sS e a r c h ㊁S MA R T ㊁M o t i f S c a n 等生物信息学软件分别分析该基因核苷酸与氨基酸序列的组成㊁编码蛋白磷酸化位点㊁关键结构域和功能模体等结构特性,通过D N A S t a r L a s e r g e n e ㊁D N AMA N8.0和M e g a 5.0软件分别进行15个偶蹄目物种m y o g e n i n 基因编码氨基酸序列相似性比对及系统进化树构建㊂ʌ结果ɔ贵州白山羊m y o g e n i n 基因序列全长2424b p (获得G e n B a n k 登录号:H Z 53289),由3个外显子㊁2个内含子㊁部分5'-U T R 和3'-U T R 构成,长度分别为471㊁82㊁122㊁765㊁589㊁135和260b p,编码区长度为675b p ,共编码224个氨基酸㊂贵州白山羊m y o g e n i n 蛋白第1 86位氨基酸为生肌决定因子(m y o g e n i c d e t e r m i n i n g f a c t o r s ,M y o D )家族特有碱性结构域(B a s i cd o m a i n ),第81 139位氨基酸为螺旋-环-螺旋(h e l i x -l o o p -h e l i x ,H -L -H )结构域,第160 170位氨基酸为低复杂度结构域,存在21个磷酸化位点和核定位信号蛋白等功能模体结构㊂氨基酸序列比对表明,6个半胱氨酸残基㊁1个核定位信号和1个低复杂度结构域在15个偶蹄目物种完全保守㊂m y o g e n i n 基因编码氨基酸序列相似性与系统进化分析均显示,贵州白山羊与波尔山羊㊁湖羊和马可波罗盘羊的亲缘关系最近㊂ʌ结论ɔ本研究成功克隆得到贵州白山羊m y o ge n i n 基因全长序列,大小为2424b p ,编码224个氨基酸,my o g e n i n 蛋白包含B a s i c d o m a i n 和H -L -H 结构域㊂该结果可为m y o g e n i n 基因调控山羊肌肉发育的分子机制研究提供理论参考㊂关键词:贵州白山羊;m y o ge n i n 基因;克隆;分子系统进化;生物信息学中图分类号:S 827;S 813.3文献标识码:AD o i :10.16431/j.c n k i .1671-7236.2024.03.004 开放科学(资源服务)标识码(O S I D ):收稿日期:2023-08-18基金项目:贵州省科技计划项目(黔科合基础-Z K [2022]一般559);铜仁学院博士科研启动基金项目(t r x y D H 2001);铜仁市科学技术局博士人才项目(铜市科研[2020]126号㊁铜市科研[2023]4号);贵州省重点实验室项目(黔科合平台人才[2020]2003号)联系方式:宋兴超,E -m a i l :s o n g x i n g c h a o _888@126.c o m ㊂通信作者安清明,E -m a i l :a n q i n g m i n g2009@163.c o m C l o n i n g a n dB i o i n f o r m a t i c sA n a l ys i s o f m y o g e n i n G e n e i nG u i z h o u W h i t eG o a tS O N G X i n g c h a o ,M E N GJ i n z h u ,Z H A O Y u a n y u a n ,WUZ h e n y a n g ,A N Q i n g m i n g(G u i z h o uP r o v i n c i a lK e y L a b o r a t o r yf o rB i o d i v e r s i t y Co n s e r v a t i o na n dU t i l i z a t i o n i n t h e F a n j i n g M o u n t a i nR e g i o n ,C o l l e g e o f A g r o f o r e s r y E n g i n e e r i n g a n dP l a n n i n g ,T o n gr e n U n i v e r s i t y ,T o n g r e n 554300,C h i n a )A b s t r a c t :ʌO b j e c t i v e ɔT h i s s t u d y w a s a i m e d t oc l o n e m y o ge n i n g e n e i nG u i z h o u W h i t e g o a t a n d a n a l y z e t h es t r u c t u r ec h a r a c t e r i s t i c sb y b i o i nf o r m a t i c s ,s oa st o p r o v i d ea ni m p o r t a n tr e f e r e n c e b a s i sf o rf u r t h e re x p l o r i ng m o l e c u l a rr e g u l a t i o n m e ch a ni s m o f m u s c l e d e v e l o pm e n to f g o a t .ʌM e t h o d ɔT h eb l o o d g e n o m i cD N A o fG u i z h o u W h i t e g o a tw a su s e da s t e m pl a t e ,f o u r p a i r so f s p e c i f i c p r i m e r sw e r ed e s i g n e d ,a n dt h ec o m p l e t ec o d i n g s e q u e n c eo f m y o ge n i n g e n e i n G u i z h o u3期宋兴超等:贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析W h i t e g o a t w a s o b t a i n e d b y P C R a m p l i f i c a t i o n,S a n g e r s e q u e n c i n g a n d s e q u e n c e a s s e m b l y m e t h o d.T h e m o l e c u l a r s t r u c t u r e c h a r a c t e r i s t i c s o f m y o g e n i n g e n e,s u c h a s c o m p o s i t i o n o f n u c l e o t i d e a n d a m i n o a c i d s e q u e n c e,p h o s p h o r y l a t i o n s i t e s,k e y d o m a i n s a n d f u n c t i o n a lm o t i f sw e r e a n a l y z e db y B i o E d i t7.0,N e t P h o s3.1,C o n s e r v e d D o m a i n sS e a r c h,S MA R T a n d M o t i fS c a n s o f t w a r e s,r e s p e c t i v e l y.T h e s e q u e n c e s i m i l a r i t y c o m p a r i s o n o f m y o g e n i n g e n e a m o n g15 A r t i o d a c t y l a s p e c i e s a n d p h y l o g e n e t i c t r e e c o n s t r u c t i o nw e r e c a r r i e do u t b y D N A S t a rL a s e r g e n e, D N AMA N8.0a n d M e g a5.0s o f t w a r e s.ʌR e s u l tɔT h el e n g t ho f m y o g e n i n g e n es e q u e n c ei n G u i z h o u W h i t e g o a tw a s2424b p(o b t a i nG e n B a n k a c c e s s i o nN o.:H Z53289),w h i c hw a s c o n s i s t e d o f3e x o n s,2i n t r o n s a n d p a r t i a l o f5'-U T Ra n d3'-U T R,a n dw a s471,82,122,765,589,135a n d 260b p i nl e n g t h,r e s p e c t i v e l y.T h e l e n g t ho f c o d i n g r e g i o n w a s675b p,w h i c h w a se n c o d e d224 a m i n o a c i d s.T h ed e d u c e da m i n oa c i ds e q u e n c ea n a l y s i ss h o w e dt h a t1-86a m i n oa c i d sw e r et h e u n i q u eb a s i c d o m a i no fm y o g e n i cd e t e r m i n i n g f a c t o r s f a m i l y,81-139a m i n oa c i d sw e r e t h eh e l i x-l o o p-h e l i xD N Ab i n d i n g d o m a i n,a n d160-170a m i n o a c i d sw e r e t h e l o wc o m p l e x i t y r e g i o n s.T h e r e w e r e21p h o s p h o r y l a t i o ns i t e sa n df u n c t i o n a lm o t i f s t r u c t u r es u c ha sn u c l e a r l o c a l i z a t i o ns i g n a l p r o t e i n.A m i n o a c i d s e q u e n c e a l i g n m e n t s h o w e d t h a t s i x c y s t e i n e r e s i d u e s,o n e n u c l e a r l o c a l i z a t i o n s i g n a l p r o t e i na n do n e l o wc o m p l e x i t y r e g i o nw e r ec o m p l e t e l y c o n s e r v e da m o n g15A r t i o d a c t y l a s p e c i e s.S e q u e n c e s i m i l a r i t y a n d m o l e c u l a r p h y l o g e n e t i ca n a l y s i sa l l s h o w e dt h a tG u i z h o u W h i t e g o a t m y o g e n i n g e n e h a d t h e c l o s e s t g e n e t i c r e l a t i o n s h i p w i t hB o e r g o a t,H u s h e e p a n dM a r c oP o l o s h e e p.ʌC o n c l u s i o nɔT h e m y o g e n i n g e n eo fG u i z h o u W h i t e g o a tw a ss u c c e s s f u l l y c l o n e d,w i t ha s i z e o f2424b p i nl e n g t ha n de n c o d i n g224a m i n oa c i d s,w h i c hc o n t a i n e dt h eB a s i ca n d H-L-H d o m a i n s.T h e s er e s u l t sc o u l d p r o v i d et h e o r e t i c a lr e f e r e n c ef o rf u r t h e re x p l o r i n g t h e m o l e c u l a r r e g u l a t i o nm e c h a n i s mo fm u s c l e g r o w t ha n dd e v e l o p m e n t o f g o a t.K e y w o r d s:G u i z h o u W h i t e g o a t;m y o g e n i n g e n e;c l o n i n g;m o l e c u l a r p h y l o g e n e t i ce v o l u t i o n;b i o i n f o r m a t ic s肌细胞生成素(m y o g e n i n)是生肌调节因子(m y o g e n i cr e g u l a t o r y f a c t o r s,MR F s)家族中可在畜禽骨骼肌表达的重要基因,能够将肌肉基因转录激活,促进肌细胞分化,作为骨骼肌发育的一种关键调控因子,该基因在牛成肌细胞和肌管细胞生成与分化过程中与肌源调节蛋白2基因(m y o z e n i n2, M y o z2)和生肌决定因子(m y o g e n i cd e t e r m i n i n g f a c t o r s,M y o D)基因共同发挥中心调节作用[1],该基因在整个肌肉形成过程中功能极其重要,其表达可终止成肌细胞增殖及调控单核成肌细胞融合为多核成肌细胞[2]㊂另外,m y o g e n i n基因与M R F s家族中M y o D㊁生肌因子5和生肌调节因子4等相关转录调节因子相互作用,协同调控畜禽肉质性状的形成[3],并且m y o g e n i n基因的编码区与非翻译区存在大量与山羊和绵羊生长性状显著关联的单核苷酸多态性(s i n g l en u c l e o t i d e p o l y m o r p h i s m s,S N P s)位点[4-6],表明该基因是调控羊肌肉发育的关键基因㊂克隆m y o g e n i n基因,探究其序列结构特性与功能,可为进一步利用基因敲除或转基因技术改良畜禽生长性状提供理论参考,对提高畜禽生产性能具有重要理论意义与实践价值㊂贵州白山羊作为贵州喀斯特地区特色地方山羊品种,具有适应性强㊁遗传性能稳定及肉质鲜嫩等优点[7-8],但该品种存在个体较小㊁生长速度缓慢及产肉量低等不足[9],基于分子水平筛选山羊生长性状的关键基因并探究其序列结构特性及功能,可为后续进行分子标记筛选㊁辅助选择育种及加快肉用山羊品种改良的遗传进展提供有效策略㊂目前,在山羊m y o g e n i n基因方面,仅见刘铮铸等[10]和赵子贵等[11]分别对波尔山羊与隆林山羊该基因克隆测序的相关报道,而对贵州白山羊m y o g e n i n基因序列结构特性及其调控肌肉发育的分子机制研究相对较少[12]㊂因此,本研究通过克隆贵州白山羊m y o g e n i n基因全长序列,并对其结构特性开展生物信息学分析,旨在为深入解析该基因生物学功能及其调控贵州白山羊肌肉发育性状的分子遗传机理提供理论依据㊂729中国畜牧兽医51卷1材料与方法1.1材料1.1.1试验动物和样品采集在贵州省铜仁市沿河土家族自治县华珍牧业有限责任公司随机选取健康成年雄性贵州白山羊10只,颈静脉采血5.0m L, -20ħ保存㊂1.1.2主要试剂血液基因组D N A提取试剂盒购自天根生化科技(北京)有限公司;琼脂糖㊁核酸染料G r e e n P l u s㊁D L2000D N A M a r k e r和2ˑS a n T a q F a s t P C R M i x预混液均购自生工生物工程(上海)股份有限公司㊂1.2方法1.2.1 D N A提取贵州白山羊血液基因组D N A采用相应试剂盒提取,其浓度及纯度利用紫外分光光度计和0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,稀释为70n g/μL,-20ħ保存备用㊂1.2.2引物设计与合成以G e n B a n k数据库中山羊(登录号:F J607135)㊁家牛(登录号: HM452338)和家猪(登录号:U14331)m y o g e n i n基因序列信息作为参考,采用P r i m e rP r e m i e r5.0软件分段设计扩增该基因的4对特异性引物(表1),引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成㊂1.2.3 P C R扩增与克隆测序 P C R反应体系40μL:模板D N A2μL,上㊁下游引物(10p m o l/μL)各1μL,2ˑS a n T a q F a s tP C R M i x预混液20μL,灭菌蒸馏水16μL㊂P C R反应程序:94ħ预变性5m i n;94ħ变性30s,退火(各温度见表1)30s, 72ħ延伸(延伸时间见表1),共40个循环;72ħ延伸10m i n;4ħ保存㊂4段P C R产物通过1.2%琼脂糖凝胶电泳检测㊁切胶㊁回收纯化后送生工生物工程(上海)股份有限公司克隆测序㊂表1引物信息T a b l e1P r i m e r i n f o r m a t i o n引物P r i m e r s序列S e q u e n c e s(5'ң3')产物长度P r o d u c tl e n g t h/b p退火温度A n n e a l i n gt e m p e r a t u r e/ħ延伸时间E x t e n d e dt i m e/s扩增区域A m p l i f i e dr e g i o nGM-1F:A G G T T T C T G T G G C G T T G G C G T T G75559.2555'-U T R㊁内含子1 R:T T G C C T T T G T C T T A T C T G G A A A G GGM-2F:C G C C A T C C A G T A C A T A G A G C G94160.460外显子1㊁2 R:T G G G G C C A A A C T C C A G T G C G C T GGM-3F:A G C A C T C T T T A G G G G C A G A A T C T G96159.460内含子1㊁外显子3 R:G A T T G T G G G C G T C T G T A G G G T CGM-4F:C T T C C C T C T T C C C T T A T T C C G G90956.658内含子2㊁3'-U T R R:T C C C T T G C T T T A T C T C C C T G G A A1.2.4序列拼接与结构分析采用C h r o m a s2.0软件校对测序峰图;通过C a p3在线软件(h t t p:ʊd o u a.p r a b i.f r/s o f t w a r e/c a p3)拼接序列,运用B L A S T比对获得序列㊂序列结构通过G E N S C A N 软件(h t t p:ʊg e n e s.m i t.e d u/G E N S C A N.h t m l)预测并参考K o z a k法则[13]进行确定㊂m y o g e n i n基因C D S碱基构成由B i o E d i t7.0软件统计,编码氨基酸序列组成采用D N AMA N8.0软件预测㊂蛋白保守结构功能域预测运用N C B I在线软件C o n s e r v e d D o m a i n sS e a r c h(h t t p s:ʊw w w.n c b i.n l m.n i h.g o v/S t r u c t u r e/c d d/w r p s b.c g i)和简单模块构架搜索工具(S i m p l e M o d u l a r A r c h i t e c t u r e R e s e a r c h T o o l,S MA R T)(h t t p:ʊs m a r t.e m b l.d e/)完成;蛋白磷酸化位点利用软件N e t P h o s3.1(h t t p:ʊw w w.c b s.d t u.d k/s e r v i c e s/)预测;应用M o t i f S c a n 在线软件(h t t p:ʊm y h i t s.i s b-s i b.c h/c g i-b i n/m o t i f_ s c a n)预测m y o g e n i n蛋白功能模体㊂1.2.5相似性分析与系统进化树构建从N C B I 数据库下载波尔山羊(登录号:A C M46112.1)㊁湖羊(登录号:A D D17008.1)㊁马可波罗盘羊(登录号: K A I4537165.1)㊁家牛(登录号:B A C76803.1)㊁牦牛(登录号:A G F90518.1)㊁瘤牛(登录号: A B Y50567.1)㊁水牛(登录号:A G G09131.1)㊁家猪(登录号:C A A61410.1)㊁野猪(登录号:A C O53814.1)㊁羊驼(登录号:X P_006218555.2)㊁野生双峰驼(登录号:X P_032322621.1)㊁单峰驼(登录号:X P_ 031294695.1)㊁甘肃马鹿(登录号:A C N58566.2)和塔里木马鹿(登录号:K A F4018206.1)m y o g e n i n基8293期宋兴超等:贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析因编码氨基酸序列,应用D N AMA N8.0和D N A S t a rL a s e r g e n e软件进行15个偶蹄目物种该基因编码氨基酸序列相似性比对分析,利用M e g a 5.0软件中非加权组平均法(u n w e i g h t e d p a i r-g r o u p m e t h o dw i t ha r i t h m e t i cm e a n s,U P GMA),基于泊松模型(P o i s s o n m o d e l)构建了15个偶蹄目物种m y o g e n i n基因编码氨基酸序列的系统进化树㊂2结果2.1P C R扩增以贵州白山羊血液基因组D N A为模板,以G M-1㊁G M-2㊁G M-3和G M-4为引物,P C R扩增出4段特异性产物(图1),每段均与预期扩增长度相符,条带清晰,表明引物特异性较强,适宜后续克隆测序㊂①A~D,引物GM-1㊁GM-2㊁GM-3和GM-4的P C R扩增结果㊂②M,D L2000D N A M a r k e r;1~3,P C R产物①A-D,P C Ra m p l i f i c a t i o nr e s u l t so f p r i m e r sGM1,GM2,GM3a n dGM4,r e s p e c t i v e l y.②M,D L2000D N A M a r k e r;1-3,P C R p r o d u c t s图1贵州白山羊m y o g e n i n基因P C R扩增结果F i g.1P C Ra m p l i f i c a t i o n r e s u l t s o f m y o g e n i n g e n e i nG u i z h o u W h i t e g o a t2.2克隆测序与序列分析4对扩增产物经纯化后由生工生物工程(上海)股份有限公司克隆测序,拼接后获得长度为2424b p的贵州白山羊m y o g e n i n基因核苷酸序列,经N C B I数据库B L A S T比对,与波尔山羊㊁绵羊㊁印度水牛和猪m y o g e n i n基因序列相似性分别为99.92%㊁97.61%㊁94.68%和83.62%,显示克隆的核苷酸序列为贵州白山羊m y o g e n i n基因序列㊂序列结构分析表明贵州白山羊m y o g e n i n基因由3个外显子(471㊁82㊁122b p)㊁2个内含子(765㊁589b p)和部分5'-U T R(135b p)㊁3'-U T R(260b p)构成,编码区长度为675b p(图2),该序列已上传至N C B I数据库,获得G e n B a n k登录号为H Z53289㊂贵州白山羊m y o g e n i n基因A T G起始密码子位于136b p处,T G A为终止密码子,编码序列中碱基A㊁T㊁G㊁C的平均含量分别为20.61%㊁16.81%㊁30.12%和32.46%,G C含量(62.58%)高于A T含量(37.42%)㊂贵州白山羊m y o g e n i n基因共编码224个氨基酸,929中 国 畜 牧 兽 医51卷m y o g e n i n 蛋白由20种常见氨基酸组成(表2)㊂其中,亮氨酸(11.2%)含量最高,甲硫氨酸(0.4%)含量最低;带正电荷的氨基酸残基(A r g +L ys )25个,占比11.1%,带负电荷的氨基酸残基(A s p +Gl u )31个,占比13.9%㊂A T G ,起始密码子;*,终止密码子T G A ;Ѳ,磷酸化位点(Y ,酪氨酸;T ,苏氨酸;S,丝氨酸);,核定位信号(82 96); ,N -豆蔻酰基化位点(54 59); ,酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(87 90㊁175 178㊁203 206㊁209 212);ʻ,蛋白激酶C 磷酸化位点(87 89); ,依赖于c AM P 和c GM P 的蛋白激酶磷酸化位点(74 77㊁105 108)A T G ,T h e s t a r t c o d o n ;*,T h es t o p c o d o nT G A ;Ѳ,T h e g e n e r i c p h o s p h o r y l a t i o ns i t e (Y ,T y r o s i n e ;T ,T h r e o n i n e ;S ,S e r i n e );,N L S (82-96); ,N -m y r i s t o y l a t i o ns i t e (54-59); ,C a s e i nk i n a s e Ⅱp h o s p h o r yl a t i o ns i t e (87-90,175-178,203-206a n d209-212);ʻ,P r o t e i n k i n a s e C p h o s p h o r y l a t i o n s i t e (87-89); ,c AM P a n d c GM P -d e p e n d e n t p r o t e i n k i n a s e p h o s p h o r yl a t i o n s i t e (74-77a n d105-108)图2 贵州山羊m y o ge n i n 基因核苷酸及其编码氨基酸序列结构特征F i g .2 S t r u c t u r e c h a r a c t e r i s t i c s of n u c l e o t i d e a c i da n da m i n o a c i d s e q u e n c e o f m y og e n i n g e n e i nG u i zh o u W hi t e g o a t 表2 贵州白山羊m y o ge n i n 蛋白氨基酸组成T a b l e 2 A m i n o a c i d c o m p o s i t i o no fm y o g e n i n p r o t e i n i nG u i z h o u W h i t e g o a t 氨基酸A m i n o a c i d s 数量N u m b e r/个频率F r e q u e n c y/%氨基酸A m i n o a c i d s 数量N u m b e r/个频率F r e q u e n c y/%丙氨酸A l a (R )167.1亮氨酸L e u (L )2511.2精氨酸A r g(R )167.1赖氨酸L ys (K )94.0天冬酰胺A s n (A )83.6甲硫氨酸M e t (M )10.4天冬氨酸A s p (D )104.5苯丙氨酸P h e (F )62.7半胱氨酸C y s (C )62.7脯氨酸P r o (P )2310.3谷氨酰胺G l n (Q )94.0丝氨酸S e r (S)177.6谷氨酸G l u (E )219.4苏氨酸T h r (T )83.6甘氨酸G l y(G )156.7色氨酸T r p(W )20.9组氨酸H i s (H )73.1酪氨酸T y r (Y )83.6异亮氨酸I l e (I)62.7缬氨酸V a l (V )114.90393期宋兴超等:贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析2.3 编码蛋白结构域和功能模体分析由图2可知,贵州白山羊m y o g e n i n 基因编码氨基酸序列存在21个可被u n s p ㊁P K A ㊁P K B ㊁P K C ㊁C K I ㊁c d c 2㊁c d k 5和E G F R 等蛋白激酶磷酸化的位点,包括3个酪氨酸(T yr o s i n e ,Y )位点㊁3个苏氨酸(T h r e o n i n e ,T )位点和15个丝氨酸(S e r i n e ,S )位点㊂M o t i fS c a n 在线软件预测显示,贵州白山羊m y o ge n i n 蛋白序列第82 96位氨基酸可能存在1个核定位信号(n u c l e a r l o c a l i z a t i o ns i g n a l ,N L S :R R R A A T L R E K R R L K K ),第54 59位氨基酸含有1个N -豆蔻酰基化位点(N -m y r i s t o yl a t i o ns i t e ,G L G P A E ),4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点(C a s e i nk i n a s e Ⅱp h o s p h o r y l a t i o n s i t e ,87 90:T L R E ,175 178:S A L E ,203 206:S I V D ,209 212:T V E D )㊁1个蛋白激酶C 磷酸化位点(pr o t e i n k i n a s e C p h o s p h o r yl a t i o n s i t e ,87 89:T L R )与2个依赖于c AM P 和c GM P 的蛋白激酶磷酸化位点(c AM P a n d c GM P -d e pe n d e n t p r o t e i n k i n a s e p h o s p h o r y l a t i o n s i t e ,74 77:K R K S ,105 108:K R S T )(图2)㊂由图3可知,贵州白山羊m y o ge n i n 蛋白第1 86位氨基酸为M y o D 家族碱性结构域(b a s i cd o m a i n ),第81 139位氨基酸为保守螺旋-环-螺旋结构域(h e l i x -l o o p -h e l i x ,H -L -H ),H -L -H 结构域存在D N A 结合区(D N Ab i n d i n g d o m a i n )和二聚化多肽结合位点(d i m e r p o l y p e p t i d eb i n d i n gs i t e )2个核心功能区域㊂另外,基于S MA R T 软件分析结果表明,贵州白山羊m y o ge n i n 蛋白第160 170位氨基酸为低复杂度区域(l o w c o m p l e x i t yr e gi o n )㊂图3 贵州白山羊m y o ge n i n 蛋白保守结构功能域F i g .3 C o n s e r v e dd o m a i no fm y o ge n i n p r o t e i n i nG u i z h o u W h i t e g o a t 2.4 15个偶蹄目物种m y o ge n i n 基因编码氨基酸序列比对与系统进化树构建氨基酸序列比对分析结果显示,贵州白山羊与波尔山羊㊁湖羊㊁马可波罗盘羊㊁水牛㊁甘肃马鹿㊁塔里木马鹿㊁牦牛㊁瘤牛㊁家牛㊁家猪㊁野猪㊁双峰驼㊁羊驼和单峰驼m y o ge n i n 基因编码氨基酸序列相似性分别为99.6%㊁99.6%㊁99.1%㊁98.2%㊁98.2%㊁98.2%㊁97.8%㊁97.8%㊁96.4%㊁95.5%㊁95.5%㊁95.1%㊁94.6%和94.6%(图4)㊂图4 不同物种间m y o ge n i n 基因氨基酸序列相似性比对F i g .4 S i m i l a r i t y a l i g n m e n t of a m i n o a c i d s e q u e n c e s o f m y og e n i n g e n e a m o n g d i f f e r e n t s pe c i e s 15个物种m y o ge n i n 蛋白重要功能结构域比对分析显示(图5),6个半胱氨酸残基(C ys ,C )㊁核定位信号蛋白(n )和低复杂度区域(l )在所分析物种中完全保守㊂基于15个偶蹄目物种m y o ge n i n 基因139中 国 畜 牧 兽 医51卷编码氨基酸序列关键功能位点的比对结果表明,贵州白山羊和家牛在第200位氨基酸处分别为脯氨酸(P r o ,P )和天冬酰胺(A s n ,N ),其他物种均为丝氨酸(S e r ,S ),甘肃马鹿与塔里木马鹿等鹿科动物在第19 21位氨基酸处存在 S ㊁V ㊁T插入突变,初步表明偶蹄目物种间m y o g e n i n 基因编码氨基酸序列保守性较强,但是也存在物种特异性位点㊂阿拉伯数字表示氨基酸位点;小圆点表示与贵州白山羊m y o g e n i n 基因氨基酸序列一致;序列上方的c 表示半胱氨酸残基,n 表示核定位信号蛋白,l 表示低复杂度区域, 表示贵州白山羊特定变异位点A r a b i cn u m e r a l s r e p r e s e n t a m i n o a c i d s i t e s ,s m a l l d o t i s s a m e s i t e a s a m i n o a c i d s e q u e n c e o fG u i z h o uW h i t e g o a t m y o g e n i n g e n e ,c s h o w s c y s t e i n e r e s i d u e ,n s h o w sn u c l e a r l o c a l i z a t i o n s i g n a l ,l s h o w s l o wc o m p l e x i t y r e g i o n , s h o w s s p e c i a lm u t a t i o n s i t e 图5 15个偶蹄目物种m y o ge n i n 基因编码氨基酸序列比对F i g .5 A m i n o a c i d s e q u e n c e a l i g n m e n t of m y og e n i n g e n e a m o n g 15A r t i o d a c t y l a s pe c i e s 15个偶蹄目物种m y o ge n i n 基因编码氨基酸序列的系统进化树显示,该进化树明显分为五大类群,分别为牛亚科㊁鹿科㊁羊亚科㊁猪科和骆驼科(图6)㊂贵州白山羊与同属于羊亚科的马可波罗盘羊㊁湖羊和波尔山羊聚在一个分支;瘤牛㊁水牛㊁牦牛和家牛同属牛亚科聚为一个分支;甘肃马鹿和塔里木马鹿聚在鹿科分支;家猪和野猪同为猪科聚为一个分支;单峰驼㊁羊驼和双峰驼同属骆驼科聚在同一分支㊂图6 15个偶蹄目物种m y o ge n i n 基因编码氨基酸序列系统进化树F i g .6 P h y l o g e n e t i c t r e e b a s e do n t h e a m i n o a c i d s e q u e n c e of m y og e n i n g e n e a m o n g 15A r t i o d a c t y l a s pe c i e s 2393期宋兴超等:贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析3讨论3.1m y o g e n i n基因核苷酸与编码氨基酸序列结构特征分析基因是控制生物性状发生的遗传基础,本研究参照N C B I已报道的脊椎动物基因核苷酸序列相关信息,根据与贵州白山羊亲缘关系较近的波尔山羊㊁牛等物种m y o g e n i n基因序列设计特异性引物,应用分段P C R扩增㊁克隆与S a n g e r直接测序技术成功获得了贵州白山羊m y o g e n i n基因完整编码区核苷酸序列,利用相关软件对m y o g e n i n基因编码蛋白的结构功能域特征开展了生物信息学预测及比较基因组学分析,为后续探究m y o g e n i n基因调控贵州白山羊生长性状分子机理提供借鉴与参考㊂m y o g e n i n基因序列分析显示,在核苷酸组成方面,贵州白山羊m y o g e n i n基因C D S区G C含量明显高于A T㊂王宁等[14]研究表明,当基因G C含量高时,其核苷酸替代速率则会下降,鉴于m y o g e n i n基因在调控肌肉发育方面的关键作用,推测该功能基因的核苷酸替代速率低可能是由于该基因G C含量较高所致,其具体机制尚需深入研究,这与马鹿[15]和梅花鹿[16]该基因G C含量高于A T含量的结果基本一致㊂贵州白山羊m y o g e n i n基因编码氨基酸数量与其他物种基本一致,均为224个氨基酸,甘肃马鹿和塔里木马鹿等鹿科动物该基因则在19 21位插入丝氨酸(S)㊁缬氨酸(V)和苏氨酸(T),表明不同物种m y o g e n i n基因编码氨基酸序列数量上的不同,可能会影响其编码蛋白的生物学功能,尚需深入验证㊂除此之外,贵州白山羊m y o g e n i n蛋白第1 86位氨基酸为M y o D家族特有的碱性结构域,第81 139位氨基酸为H-L-H D N A结合结构域,属于成肌调节因子M R F s家族基因典型的保守b H L H结构功能域㊂S o u m i l l i o n等[17]研究表明, b H L H结构功能域由猪m y o g e n i n基因外显子1编码,同时猪㊁小鼠和人该基因b H L H结构功能域氨基酸序列基本一致㊂刘铮铸等[10]研究表明,波尔山羊m y o g e n i n基因编码的第1 138位氨基酸序列含有M R F s基因家族典型的b H L H结构域㊂赵子贵等[11]研究发现,隆林山羊m y o g e n i n基因编码第1 133个氨基酸为其肽链的b H L H结构域㊂本研究结果与前人研究均一致㊂因此,由编码氨基酸序列保守结构功能域角度也证明了本研究克隆的贵州白山羊核苷酸序列为m y o g e n i n基因㊂由15个偶蹄目物种m y o g e n i n基因氨基酸序列相似性比对及系统进化树结果推测,贵州白山羊与波尔山羊㊁湖羊和马可波罗盘羊等羊亚科物种的亲缘关系最近,与猪科㊁骆驼科相对较远,该结果与郭金虎等[18]㊁侯佩兴等[19]及何学谦等[20]分别利用性别决定因子(S R Y)基因㊁胰岛素样生长因子-1(I G F-1)基因和肌细胞生成素基因构建鹿科㊁牛科和猪科等偶蹄目物种分子系统进化树获得的结果相符,这不仅符合动物形态学分类,同时也证明了通过核内基因分析偶蹄目物种系统进化关系的可行性㊂3.2m y o g e n i n基因编码蛋白关键结构功能域与生长性状的关系生长性状作为一种重要的经济性状,是家养动物新品种选育工作的一项关键育种目标㊂贵州白山羊作为一种肉用动物,如能挖掘调控生长性状关键基因或筛查到与肌肉发育连锁的分子标记,从分子水平探究其蛋白关键功能位点的变异与性状间的关系,可为后续利用基因敲除和过表达解析基因功能以及运用基因编辑技术开展生长性状的遗传改良提供分子育种策略㊂近年来,大量研究已对畜㊁禽m y o g e n i n基因S N P位点进行挖掘分析,从该基因不同区段明确了S N P位点与体尺及生长性状的关联性㊂研究显示,猪m y o g e n i n基因3'-侧翼区353b p片段M s pⅠ酶切形成的B B基因型与初生重和瘦肉率显著相关[21]㊂京海黄鸡m y o g e n i n基因外显子3中T36C突变形成的B B基因型2周龄和12周龄体重极显著高于A A基因型[22]㊂本研究m y o g e n i n基因编码氨基酸序列比对分析显示,15个偶蹄目物种m y o g e n i n蛋白的6个半胱氨酸残基(c)㊁核定位信号蛋白(N L S)㊁低复杂度区域(l)未存在变异位点,推测m y o g e n i n基因这些保守结构功能域可能在肌肉发育过程中具有重要调控功能,尚需深入研究㊂Z h a n g等[23]预测湖羊m y o g e n i n基因N L S结构域位于第74 96位氨基酸残基,与本研究结果一致㊂另外,贵州白山羊m y o g e n i n基因编码氨基酸序列中存在2个显著的结构功能域:延伸结构域B a s i c 区和H-L-H结构域,在H-L-H结构域中包括D N A 结合区和二聚化多肽结合位点㊂M e a d o w s等[24]研究表明,m y o g e n i n基因是M R F s基因家族成员之一,该基因家族典型特征是基因表达产物均包括一段碱性氨基酸富含区和H-L-H结构域,其中碱性氨基酸区富含精氨酸和赖氨酸,提供靶D N A识别结合位点,H-L-H结构域存在与骨骼肌特异性启动子或增强子等结合的位点,调节肌肉肌酸激酶(M C K)㊁肌钙蛋白等的表达,可进一步促进肌肉分化㊂本研究预测分析的贵州白山羊m y o g e n i n蛋白339中国畜牧兽医51卷的关键结构功能域等结果也反映了不同物种m y o g e n i n编码蛋白特定结构的一致性对其生物学功能的重要意义㊂4结论本研究成功克隆获得2424b p贵州白山羊m y o g e n i n基因全长序列,由3个外显子和2个内含子组成,C D S长度为675b p,共编码224个氨基酸;贵州白山羊m y o g e n i n蛋白存在典型的碱性结构域㊁H-L-H结构域㊁多个磷酸化位点和功能模体㊂参考文献(R e f e r e n c e s):[1] W E ID,Z HA N GJ,R A Z ASH A,e t a l.I n t e r a c t i o no fM y o D a n d M y o G w i t h M y o z2g e n e i n b o v i n em y o b l a s td i f f e r e n t i a t i o n[J].R e s e a r c hi n V e t e r i n a r yS c i e n c e,2022,152(20):569-578.[2] H E R NÁN D E Z-H E R NÁN D E Z J M,G A R CÍA-G O N ZÁL E ZE G,B R U N C E,e t a l.T h e m y o g e n i cr e g u l a t o r y f a c t o r s,d e t e r m i n a n t s o f m u s c l ed e v e l o p m e n t,c e l l i d e n t i t y a n d r e g e n e r a t i o n[J].S e m i n a r s i n C e l l&D e v e l o p m e n t a lB i o l o g y,2017,72(12):10-18.[3] O L I A N I L C,L I D A N I K,G A B R I E L J E.D i f f e r e n t i a t e d e v o l u t i o n a r y r e l a t i o n s h i p s a m o n gc h o rd a te sf r o m c o m p a r a t i v ea l ig n m e n t s o f m u l t i p l es e q u e n c e so f M y o D a n d M y o G m y o g e n i cr e g u l a t o r yf a c t o r s[J].G e n e t i c sa n d M o l e c u l a r R e s e a r c h,2015,14(4):12561-12566.[4] S O U S A-J U N I O RLPB,M E I R A A N,A Z E V E D O H C,e t a l.V a r i a n t si n m y o s t a t i na n d M y o Df a m i l yg e n e sa r ea s s o c i a t e d w i t h m e a t q u a l i t y t r a i t si n S a n t aI nêss h e e p[J].A n i m a l B i o t e c h n o l o g y,2022,33(2):201-213.[5]李静云,王新乐,张云飞,等.绵羊M y o G基因内含子Ⅱ多态性及其与生长性状的关联分析[J].中国畜牧兽医,2022,49(4):1364-1373.L I J Y,WA N G X L,Z HA N G Y F,e t a l.P o l y m o r p h i s m o f M y o G g e n e i n t r o nⅡa n d i t sa s s o c i a t i o n w i t h g r o w t h t r a i t si n s h e e p[J].C h i n aA n i m a l H u s b a n d r y&V e t e r i n a r y M e d i c i n e,2022,49(4):1364-1373.(i nC h i n e s e)[6]刘铮铸,巩元芳,付志新,等.山羊M y o G基因内含子Ⅱ变异及其在体质量上的遗传效应分析[J].畜牧兽医学报,2011,42(7):1015-1021.L I UZZ,G O N G YF,F UZX,e t a l.G e n e t i c v a r i a t i o no f g o a t M y o G g e n e i n t r o nⅡa n d i t s g e n e t i c e f f e c t s o nb o d y w e i g h t[J].Ac t a V e t e r i n a r i a e t Z o o t e c h n i c aS i n i c a,2011,42(7):1015-1021.(i nC h i n e s e)[7]许厚强.贵州地方畜禽遗传资源志[M].北京:中国农业出版社,2019.X U H Q.A n i m a lG e n e t i cR e s o u r c e s i nG u i z h o u[M].B e i j i n g:C h i n aA g r i c u l t u r eP r e s s,2019.(i nC h i n e s e)[8]国家畜禽遗传资源委员会.中国畜禽遗传资源志羊志[M].北京:中国农业出版社,2012.C H I N A N A T I O N A L C OMM I S S I O N O F A N I MA LG E N E T I C R E S O U R C E S.A n i m a lG e n e t i cR e s o u r c e si n C h i n a S h e e p a n d G o a t s[M].B e i j i n g:C h i n aA g r i c u l t u r eP r e s s,2012.(i nC h i n e s e)[9] L IL,Y A N G P,S H IS,e t a l.A s s o c i a t i o na n a l y s i st oc o p y n u m b e rv a r i a t i o n(C N V)o f O p n4g e n e w i t hg r o w t ht r a i t so f g o a t s[J].A n i m a l s(B a s e l),2020,10(3):441-448.[10]刘铮铸,巩元芳,张传生,等.波尔山羊M y o G基因的鉴定和序列分析[J].畜牧兽医学报,2010,41(10):1337-1341.L I U Z Z,G O N G Y F,Z HA N G C S,e t a l.I d e n t i f i c a t i o na n ds e q u e n c ea n a l y s io f M y o G g e n ei nB o e r g o a t(C a p r ah i r c u s)[J].A c t a V e t e r i n a r i ae tZ o o t e c h n i c a S i n i c a,2010,41(10):1337-1341.(i nC h i n e s e)[11]赵子贵,黄晨,宋少锐,等.隆林山羊肌细胞生成素基因的序列分析与结构预测[J].中国畜牧兽医,2012,39(11):17-21.Z HA OZ G,HU A N G C,S O N G S R,e t a l.S e q u e n c ea n a l y s i sa n d s t r u c t u r e p r e d i c t i o n o f M y o G g e n ei nL o n g l i n g o a t[J].C h i n a A n i m a l H u s b a n d r y&V e t e r i n a r y M e d i c i n e,2012,39(11):17-21.(i nC h i n e s e)[12]宋兴超,孟金柱,赵园园,等.贵州白山羊M y o G基因启动子区序列克隆及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2023,50(3):893-903.S O N G X C,M E N GJZ,Z HA O Y Y,e t a l.C l o n i n ga n db i o i n f o r m a t ic sa n a l y s i so f M y o G g e n e p r o m o t e rr e g i o n s e q u e n c ei n G u i z h o u W h i t e g o a t[J].C h i n aA n i m a l H u s b a n d r y&V e t e r i n a r y M e d i c i n e,2023,50(3):893-903.(i nC h i n e s e)[13] K O Z A K M.S t r u c t u r a l f e a t u r e s i ne u k a r y o t i cm R N A st h a tm o d u l a t e t h e i n i t i a t i o no f t r a n s l a t i o n[J].J o u r n a lo f B i o l o g i c a l C h e m i s t r y,1991,266(30):19867-19870.[14]王宁,陈润生.基于内含子和外显子的系统发育分析的比较[J].科学通报,1999,44(19):2095-2102.WA N G N,C H E N R S.C o m p a r i s o no f p h y l o g e n e t i ca n a l y s i sb a s e do n i n t r o na n de x o n[J].C h i n e s e Sc i e n c eB u l l e t i n,1999,44(19):2095-2102.(i nC h i n e s e)[15]宋兴超,刘汇涛,岳志刚,等.甘肃马鹿m y o g e n i n基因4393期宋兴超等:贵州白山羊肌细胞生成素基因克隆与生物信息学分析克隆㊁序列结构特征预测及其分子系统进化分析[J].四川动物,2013,32(1):51-59.S O N G X C,L I U H T,Y U E Z G,e t a l.C l o n i n g,b i o i n f o r m a t ic s p r ed i c t i o no ns t r u c t u r a l c h a r a c te r i s t i c sa n d p h y l o g e n e t i c e v o l u t i o na n a l y s i so f m y o g e n i n g e n ei n C e r v u s e l a p h u s k a n s u e n s i s[J].S i c h u a nJ o u r n a l o fZ o o l o g y,2013,32(1):51-59.(i nC h i n e s e) [16]宋兴超,徐超,刘琳玲,等.吉林梅花鹿肌肉发育关联基因M y o G的鉴定及生物信息学分析[J].特产研究,2019,41(4):11-16.S O N G X C,X U C,L I U L L,e t a l.I d e n t i f i c a t i o na n db i o i n f o r m a t ic s a n a l y s i s o f M y o G g e n e r e l a t ed t om u s c l e d e v e l o p m e n t i n J i l i n s i k a d e e r(C e r v u sn i p p o n)[J].S p e c i a l W i l d E c o n o m i c A n i m a la n dP l a n tR e s e a r c h,2019,41(4):11-16.(i nC h i n e s e)[17] S O UM I L L I O N A,E R K E N SJH F,L E N S T R AJA,e t a l.G e n e t i cv a r i a t i o n i nt h e p o r c i n e m y o g e n i n g e n el o c u s[J].M a m m a l i a nG e n o m e,1997,8(8):564-568.[18]郭金虎,单祥年,常青,等.赤麂S R Y基因的测序及其与部分偶蹄目动物S R Y基因序列的比较[J].动物学报,2001,47(2):145-149.G U OJH,S HA N X N,C HA N G Q,e t a l.S e q u e n c i n gS R Y g e n e o f M u n t i a c u s m u n t i a k v a g i n a l i s a n d ap h y l o g e n e t i c c o m p a r i s o n w i t h s o m e o fA r t i o d a c t y l a[J].A c t aZ o o l o g i c aS i n i c a,2001,47(2):145-149.(i nC h i n e s e)[19]侯佩兴,孙立彬,赵洪波.偶蹄目牛科和鹿科S R Y基因编码区进化研究[J].上海交通大学学报(农业科学版),2009,27(4):350-352.H O U PX,S U N LB,Z HA O H B.E v o l u t i o no f S R Yg e n ee n c o d i n g r e g i o n i nt h eB o v i d a ea n dG e r v i d a eo ft h eA r t i o d a c t y l a[J].J o u r n a l o f S h a n g h a iJ i a o t o n gU n i v e r s i t y(A g r i c u l t u r a l S c i e n c e),2009,27(4):350-352.(i nC h i n e s e)[20]何学谦,陈昌维.会理黑山羊M y o G基因的鉴定及序列分析[J].畜牧与兽医,2014,46(4):46-49.H E X Q,C H E N C W.I d e n t i f i c a t i o na n ds e q u e n c ea n a l y s i s o f M y o G g e n e i nH u i l i B l a c k g o a t[J].A n i m a lH u s b a n d r y&V e t e r i n a r y M e d i c i n e,2014,46(4):46-49.(i nC h i n e s e)[21] T EP A S M F,S O UM I L L I O N A,HA R D E R S F L,e t a l.I nf l u e n c e s o f m y og e n i n g e n o t y p e s o n b i r t hw e i g h t,g r o w t h r a t e,c a r c a s s w e i g h t,b a c k f a tt h i c k n e s s,a n dl e a n w e i g h to f p i g s[J].J o u r n a lo fA n i m a lS c i e n c e,1999,77(9):2352-2356.[22] G E N X I Z,Y I N G T,T A OZ,e t a l.E x p r e s s i o n p r o f i l e sa n da s s o c i a t i o n a n a l y s i s w i t h g r o w t h t r a i t s o ft h eM y o G a n d M y f5g e n e s i n t h e J i n g h a i Y e l l o wc h i c k e n[J].M o l e c u l a r B i o l o g y R e p o r t s,2014,41(11):7331-7338.[23] Z HA N G Z,X U F,Z HA N G Y,e t a l.C l o n i n g a n de x p r e s s i o n of M y o Gg e n e f r o m H u sh e e p a n di d e n t i f i c a t i o no f i t sm y o g e n i c s p e c i f i c i t y[J].M o l e c u l a rB i o l o g y R e p o r t s,2014,41(2):1003-1013.[24] M E A D OW S E,C H O J H,F L Y N N J M,e t a l.M y o g e n i n r e g u l a t e s a d i s t i n c t g e n e t i c p r o g r a m i na d u l tm u s c l e s t e mc e l l s[J].D e v e l o p m e n a t a l B i o l o g y,2008,322(2):406-414.(责任编辑戴晔)539。
雷公山山区放牧山羊 ACC1 mRNA 的组织分布
雷公山山区放牧山羊 ACC1 mRNA 的组织分布杨家大;陈祥;龙威海;冯文武;丁玫【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2015(000)005【摘要】为了揭示雷公山山区放牧山羊乙酰辅酶A羧化酶1（ACC1）mRNA表达的组织分布规律，使用TaqMan实时荧光定量技术对黔东南小香羊、贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊和南江黄羊的肝、肾、心、肺、背最长肌、半膜肌以及皮下脂肪组织中ACC1基因的mRNA表达水平进行测定。
结果表明，黔东南小香羊、黔北麻羊、南江黄羊ACC1 mRNA均主要在皮下脂肪中表达，其水平分别为3919．5456、900．5568、1550．5592；贵州黑山羊ACC1 mRNA主要在肝脏内表达，其水平为2367．4258；贵州白山羊 ACC1 mRNA 主要在肌肉组织和肝脏中表达，其水平分别为背最长肌420.1109，心351．4361，半膜肌268．0311，肝200．4141。
在皮下脂肪和肝脏，贵州白山羊ACC1 mRNA的表达水平都明显低于其他品种。
由此可见，雷公山山区放牧山羊ACC1 mRNA主要在皮下脂肪和肝脏中表达。
【总页数】4页(P25-28)【作者】杨家大;陈祥;龙威海;冯文武;丁玫【作者单位】凯里学院环境与生命科学学院，贵州凯里556011;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳550025;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】S827.2【相关文献】1.放牧山羊 CPT1B 基因 mRNA 的组织分布研究 [J], 杨家大;陈祥;龙威海;冯文武;丁玫2.雷公山区山羊生产模式浅述 [J], 梁庭敏;周尚增3.雷公山山区放牧山羊黑素皮质素受体-4 mRNA表达的研究 [J], 杨家大;吴声榕;潘盛榕4.雷公山区降水分布特征 [J], 金鹤桃5.山区黑山羊"放牧"的饲养管理技术分析 [J], 王亚提因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
LEPR基因在贵州白山羊组织中的表达
LEPR基因在贵州白山羊组织中的表达肖旭东;杜典策;王峰;康建兵;黄兰;徐伟;罗卫星【摘要】为探究瘦素受体基因(LEPR)在贵州白山羊组织中的表达规律,利用实时荧光定量PCR技术检测LEPR基因在贵州自山羊心、肝、脾、肺、肾、肠、背肌、腿肌和皮下脂肪9个组织的表达量.结果表明:目的基因LEPR和内参基因GAPDH 的熔解曲线均呈单一峰形,说明所选条件可准确定量LEPR基因在贵州白山羊各组织中的相对表达量.具体表达量为脂肪＞脾＞肺＞背肌＞肠＞肝＞肾＞心＞腿肌.%The expression quantity of LEPR gene in theheart,liver,spleen,lung,kidney,intestine,back muscle,leg muscle and subcutaneous fat of Guizhou white goat was detected by real-time fluorescence quantitative PCR to explore the expression patterns of LEPR gene in different tissues of Guizhou white goat.The results showed that the melting curves of both LEPR gene and GAPDH gene have a single peak.This indicates that the expression of LEPR gene in different tissues can be accurately quantified with the selected conditions in Guizhou white goat.The expression quantity of the LEPR gene was fat ＞ spleen ＞ lung ＞back muscles ＞ intestine ＞ liver ＞ kidney ＞ heart ＞ leg muscles.【期刊名称】《山地农业生物学报》【年(卷),期】2017(036)001【总页数】4页(P36-39)【关键词】LEPR基因;贵州白山羊;实时荧光定量PCR【作者】肖旭东;杜典策;王峰;康建兵;黄兰;徐伟;罗卫星【作者单位】贵州省沿河土家族自治县草地生态畜牧业发展中心,贵州沿河565300;贵州省沿河土家族自治县草地生态畜牧业发展中心,贵州沿河565300;沿河土家族自治县科学技术局,贵州沿河565300;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025【正文语种】中文【中图分类】Q311LEPR基因最早由Tartaglia等[1]在小鼠上发现，并报道了该基因序列，随后也发现人类的LEPR基因序列，并将其定位于人类1号染色体上。
山羊激活素A型受体定量表达研究
山羊激活素A型受体定量表达研究赵中权;孙晓卫;张超;张家骅【期刊名称】《中国草食动物科学》【年(卷),期】2014(000)0z1【摘要】采用定量PCR技术研究了山羊激活素A型受体在不同山羊品种的心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、卵巢和垂体7个组织中的表达情况.研究发现:ACTRA在不同品种山羊的心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、卵巢和垂体中都有表达.ACTR Ⅰ A和ACTRⅡA在肾脏中含量最高,心、肺中含量最低;各组织中ACTR Ⅰ A与ACTRⅡA呈极显著正相关(P＜0.01).萨能奶山羊ACTR Ⅰ A含量极显著高于南江黄羊及大足黑山羊(P＜0.01),南江黄羊、大足黑山羊与萨能奶山羊各组织中ACTRⅡA含量差异均不显著(P＞0.05).繁殖力较低的萨能奶山羊卵巢ACTRⅡA与ACTR Ⅰ A比值显著低于高繁殖力山羊.【总页数】4页(P156-159)【作者】赵中权;孙晓卫;张超;张家骅【作者单位】西南大学,重庆市草食动物资源保护与利用工程技术研究中心,北碚400715;西南大学,重庆市草食动物资源保护与利用工程技术研究中心,北碚400715;西南大学,重庆市草食动物资源保护与利用工程技术研究中心,北碚400715;西南大学,重庆市草食动物资源保护与利用工程技术研究中心,北碚400715【正文语种】中文【相关文献】1.激活素A及其受体在肝切除小鼠肝组织表达研究 [J], 闫枫2.激活素受体相互作用蛋白2在ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化斑块中表达的研究 [J], 宁亚媛;宁静;张敏;张晶;丁旭;金春杰;陈丽娟3.激活素A及其ⅡA型受体在小鼠肝损伤模型肝组织中的表达 [J], 张红军;柳忠辉;马迪;陈芳芳;台桂香4.荧光定量PCR检测山羊褪黑素受体表达体系的优化研究 [J], 汪运舟;陈维云;王慧;李俊娴;于婷;王树迎5.激活素ⅡA型受体在免疫细胞上的表达 [J], 劳凤学;张学军;徐桂月;崔雪玲;杨煜;柳忠辉因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
不同精粗比日粮对山羊组织脂肪酸合成和代谢相关基因表达的影响
不同精粗比日粮对山羊组织脂肪酸合成和代谢相关基因表达的影响占今舜;詹康;钟小军;霍俊宏【期刊名称】《江西农业学报》【年(卷),期】2022(34)2【摘要】研究了不同精粗比(40∶60,L组;50∶50,M组;60∶40,H组)的全混合日粮对努比亚山羊不同组织中脂肪酸合成和代谢相关基因表达的影响。
结果表明:L组山羊瘤胃和空肠中的ACOX1 mRNA表达量分别显著高于M组和H组的(P<0.05);L组山羊瘤胃中的CPT1A mRNA表达量显著高于M组的(P<0.05),而在十二指肠中则相反;PPAR-γmRNA在L组山羊瘤胃中的表达量显著高于其他两组的(P<0.05),而在H组山羊十二指肠中的表达量显著高于其他两组的(P<0.05);L组山羊肝脏中的ACACA和FASN mRNA表达量均显著低于M组的(P<0.05),而在瘤胃中则相反。
总之,不同精粗比日粮能够通过调控脂肪酸合成和代谢相关基因的表达来影响山羊体内脂肪的沉积。
【总页数】6页(P166-170)【作者】占今舜;詹康;钟小军;霍俊宏【作者单位】江西省农业科学院畜牧兽医研究所;扬州大学动物科学与技术学院【正文语种】中文【中图分类】S827.5【相关文献】1.不同精粗比日粮对黄淮白山羊瘤胃挥发性脂肪酸影响2.2种日粮对不同生长阶段乌金猪脂肪组织脂类合成代谢相关基因表达的影响3.不同精粗比日粮对泌乳山羊肝脏蛋白表达谱及乳脂肪合成的影响4.不同的日粮豆油水平对团头鲂幼鱼生长、脂质沉积、组织脂肪酸组成和肝脂质代谢相关基因的表达的影响5.不同精粗比日粮对舍饲育肥牦牛组织中脂肪代谢相关酶活性及基因表达的影响因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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杨 家大．贵州地方 山羊 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ基 因在不 同品种 和组织 中的表达差异 ［ Ｊ ］ ． 浙江农业学报 ， ２ ０ １ ５ ， ２ ７ （ ６ ） ： ９ ２ １ — ９ ２ ６ ．
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存 在品种间差异 ， 此 结果 为 研 究 该 基 因与 贵 州 地 方 山羊 脂 肪 沉 积 及 肉 质 性 状 的 关 系 提 供 了理 论 基 础 。
关键 词 ： 贵州地方 山羊 ； 南江黄羊 ； Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ； 基 因表 达
中图分类号 ： Ｓ ８ ２ ７ 文献标志码 ： Ａ 文章编 号 ： １ ０ ４． ０ １ ５ ２ ４ （ ２ ０ １ ５ ） ０ ６ － ０ ９ ２ １ － ０ ６
摘
要： 为揭示贵州地方 山羊及南 江黄羊 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ ｍ Ｒ Ｎ Ａ水 平的品种 和组织差异 ， 以黔东 南小香羊 、 贵州 白山
羊、 贵州黑 山羊 、 黔北 麻羊以及南江黄羊为研究对象 ， 采用实时荧光定量方 法对肝 、 肾、 心、 肺、 背最 长肌 、 半膜
肌、 皮下脂肪 中 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ基 因的 ｍＲ Ｎ Ａ 表达 水平 进 行 检 测 。结 果 表 明 ， 从器官组织分布模式来看 ， 黔 北麻 羊 和
南 江黄羊 Ｃ Ｐ Ｔ － Ｉ Ａ ｍ Ｒ Ｎ Ａ水平都 以肾中最高（ ０ ． ０ ０ １ ９和 ０ ． ０ ０ １ ９ ） ， 贵州黑 山羊 以肝 中最高（ ０ ． ０ ０ ７ ４ ） ， 贵州 白山 羊 以背最长肌中最高 （ ０ ． ０ ０ １ １ ） ， 黔 东南小 香羊各组织 中无差异 ； 从品种差异来看 ， 心和肾中 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ ｍ Ｒ Ｎ Ａ水 平 以南 江黄羊最高（ ０ ． ０ ０ １ ８和 ０ ． ０ ０ １ ９ ） ， 肝和肺 中以贵 州黑 山羊 最高 （ ０ ． ０ ０ ７ ４和 ０ ． Ｏ ０ ２ ７ ） ， 皮下 脂肪 中以黔东 南小香羊 （ ０ ． ０ ０ ０ ７ ） 最高 ， 背最长肌 和半膜 肌中各品种无差异 。结果提示 ， 贵州 白山羊 、 贵州黑 山羊 、 黔北 麻羊 以及南 江黄羊 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ基因的器官组织分布模式存在差异 ， 肝、 肾、 心、 肺 和皮下脂肪 中 Ｃ Ｐ Ｔ － １ Ａ ｍＲ Ｎ Ａ的表达
Ｄ Ｏ Ｉ ： １ ０ ． ３ ９ ６ ９ ／ ｊ ． ｉ ｓ ｓ ｎ ． １ ０ ０ ４—１ ５ ２ ４ ． ２ ０ １ ５ ． ０ ６ ． ０ ４
贵州地 方 的 表 达
差 异
杨 家 大
（ 凯里学院 环境 与生命科学学 院， 贵州 凯里 ５ ５ ６ ０ １ １ ）
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