分子标记技术在黄瓜遗传育种中的研究应用

合集下载

分子标记在黄瓜遗传育种中的研究进展

分子标记在黄瓜遗传育种中的研究进展作者：张新俊梁改荣来源：《河南农业·综合版》 2013年第10期河南农业职业学院张新俊开封县农业局梁改荣摘要：分子标记技术在黄瓜遗传育种中应用广泛，一是黄瓜遗传图谱的构建；二是种质资源的遗传多样性和亲缘关系；三是分子标记辅助育种；四是品种纯度鉴定。

并对分子技术在黄瓜育种上的应用进行了展望。

关键词：分子标记；黄瓜；遗传育种；应用；展望生物技术的发展给黄瓜遗传育种研究提供了新的手段，分子标记作为一种基本的分析手段，是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记形式。

分子标记技术作为一项新技术，已开始广泛应用于黄瓜遗传育种的研究。

以下就目前分子标记在黄瓜遗传育种中的应用及展望综述如下。

一、黄瓜遗传图谱的构建遗传图谱是黄瓜遗传育种及分子克隆应用研究的理论依据和基础，由于形态标记和生化标记数目较少，且特殊遗传材料培养困难及细胞学研究工作量大等原因，应用这些标记得到较为完整的黄瓜遗传图谱很少。

分子标记可提供大量的遗传标记，而且可显著提高构建遗传图谱的效率。

（一）遗传图谱构建的步骤第一，根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合，建立作图群体。

第二，群体中不同植株或品系的标记基因型的分析。

第三，标记间连锁群的确定。

（二）遗传图谱构建的研究进展黄瓜具有7条染色体（2n=2x=14），黄瓜连锁图应具有7个连锁群，总长度为750～1 000 cm。

黄瓜遗传基础狭窄，更接近于自花授粉作物，因此，黄瓜遗传图谱的构建进展缓慢。

黄瓜遗传图谱的构建为黄瓜品种资源的研究、育种中亲本材料的选择选配、育种方案的制定提供了依据，以及为基因定位、物理图谱的构建、基因克隆等奠定了基础。

由众多研究结果可以看出：黄瓜的遗传图谱构建仅仅是连锁图谱的构建，基因组图谱的构建却没有报道；黄瓜是蔬菜中研究较深入的一种，但却没有对基因组进行研究。

水稻基因组图谱已于2001完成，国际茄科基因组计划也已开始，所以，分子标记为黄瓜基因组的研究奠定了基础。

dna分子标记技术及其在蔬菜遗传育种研究中的应用

dna分子标记技术及其在蔬菜遗传育种研究中的应用
DNA分子标记技术是一种通过分析DNA序列上的特定标记位点来研究物种的遗传变异和亲缘关系的技术。

在蔬菜遗传育种研究中，DNA分子标记技术被广泛应用于以下方面：
1. 遗传多样性研究：DNA分子标记技术可以通过分析不同蔬菜品种或不同个体之间的DNA序列差异来评估物种的遗传多样性。

通过比较不同品种或个体之间的DNA分子标记，可以确定它们之间的亲缘关系和遗传距离。

2. 基因定位和图谱构建：DNA分子标记技术可以用来帮助研究人员定位蔬菜的重要遗传特征或性状的基因。

通过分析与目标性状相关联的DNA分子标记的位置，可以确定这些标记位点与目标基因的连锁关系，并构建相应的遗传图谱。

3. 品种鉴定和纯度鉴定：DNA分子标记技术可以用来对蔬菜品种进行鉴定和纯度测试。

通过与已知标准品种的DNA序列进行比对，可以确定蔬菜品种的基因组组成，并判断其纯度和真实性。

4. 分子辅助选择育种：DNA分子标记技术可以与传统育种方法相结合，进行分子辅助选择育种。

通过对目标性状相关的DNA分子标记进行筛选、分析和评价，可以在早期育种阶段就有效地选择与目标性状相关的优良个体，提高育种效率。

总之，DNA分子标记技术在蔬菜遗传育种研究中发挥重要作
用，可以帮助研究人员分析遗传多样性、定位遗传特征、鉴定品种和辅助选择育种，为蔬菜遗传改良提供科学依据。

有关黄瓜分子标记的标准_概述说明以及解释

有关黄瓜分子标记的标准概述说明以及解释1. 引言1.1 概述黄瓜（Cucumis sativus）是一种重要的蔬菜作物，具有广泛的经济和营养价值。

随着对黄瓜基因组的深入研究，分子标记技术逐渐成为黄瓜遗传育种、种质鉴定和基因功能解析的重要工具。

本文旨在综述有关黄瓜分子标记的标准，并对其进行概述、解释和说明。

1.2 文章结构本文共分为五个部分：引言、黄瓜分子标记的标准概述、黄瓜分子标记的具体要点解释、黄瓜分子标记的实验技术指南以及结论。

通过依次展开这些内容，我们将全面介绍黄瓜分子标记领域的最新进展和关键问题。

1.3 目的本文旨在提供一个全面而清晰的理解黄瓜分子标记方法和技术的框架，探讨其在黄瓜遗传育种中的应用前景，并提出相关建议，以进一步推动该领域的发展。

通过对现有知识和实践经验进行归纳总结，我们希望为黄瓜分子标记领域的科研人员和从业者提供参考和指导。

以上是关于“1. 引言”部分的内容，将介绍黄瓜分子标记的概述、文章结构以及本文的目的。

2. 黄瓜分子标记的标准概述2.1 什么是黄瓜分子标记:黄瓜分子标记是指在黄瓜（Cucumis sativus）植物中使用一种特定的方法或技术，在其基因组中标记和检测目标序列或特定位点的过程。

这些分子标记可以是DNA片段、蛋白质、RNA、酶等，通过与黄瓜基因组中的特定区域结合，并以不同的方式进行可视化或检测。

2.2 分子标记的重要性:黄瓜分子标记在现代遗传学和生物学研究中起着至关重要的作用。

通过使用分子标记，可以更精确地确定黄瓜基因组上感兴趣的特定位点，比如某个基因、一个DNA序列或一个调控区域。

此外，分子标记还可以帮助区分不同类型的黄瓜品种、进行亲缘关系分析以及遗传地图构建等。

2.3 研究现状和问题:目前，已经有多种黄瓜分子标记技术被开发出来并广泛应用于黄瓜相关领域的研究。

然而，在黄瓜分子标记的标准化方面仍存在一些问题。

例如，不同实验室使用不同的分子标记方法和技术，导致数据结果难以互相比较和验证。

分子标记技术在蔬菜遗传育种及种质资源中的应用

ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＣＨＡＮＧＪＩＡＮＧＶＥＧＥＴＡＢＬＥＳ
Hale Waihona Puke ２００８．１专题综述
分子标记技术在蔬菜遗传育种及种质资源中的应用
刘艳芝张敬敏徐宝连徐祥文
摘要着重介绍分子标记在蔬菜育种和种质资源方面的应用进展概况，包括用于蔬菜育种及种质资源的主要分子标记及分子标记遗传图谱、在蔬菜种质资源研究和蔬菜育种上的应用，对分子标记在蔬菜应用中存在的问题及前景进行了综述。
这是一项利用放射性同位素（通常用Ｐ３２）或非放射性物质（如地高辛等）标记探针，与转移于支持膜上的总基因组ＤＮＡ杂交，通过显示限制性酶切片段的大小，来检测不同遗传位点等变异（多态性）的一种技术。ＲＦＬＰ标记主要应用于各种植物遗传连锁图的绘制和目标基因的标记，迄今为止，各种蔬菜如番茄、辣椒、甘蓝等的连锁图主要是由ＲＦＬＰ标记绘制，其中包括一些重要农艺性状基因。１．２ＲＡＰＤ技术
鉴定蔬菜品种纯度的常规方法是根据田间表型性状，后又发展为利用同工酶的方法，但二者都有一定的缺陷。近年来应用分子标记建立品种的指
－３５－
ＪＯＵＲＮＡＬＯＦＣＨＡＮＧＪＩＡＮＧＶＥＧＥＴＡＢＬＥＳ
纹图谱已用于品种纯度的鉴定，该方法快速、准确、方便、成本也不太高，在幼苗或种子阶段就可鉴定出品种的纯度。Ｍａｔｓｕｕｒａ［１１］发现利用ＲＦＬＰ分析可快速检测黄瓜杂交一代Ｆ１品种的纯度。黄三文等［１２］对辣椒筛选出１２个较稳定的ＲＡＰＤ标记，可用于“中椒”系列辣椒的９个杂交种的纯度鉴定。田雷等［１３］利用ＡＦＬＰ方法对在农业生产上大面积推广使用的５个甘蓝杂交组合及其１０个亲本进行了分析研究，证明了ＡＦＬＰ技术在甘蓝种子真实性及品种纯度鉴定中的可行性。

生物技术用于黄瓜遗传育种

生物技术用于黄瓜遗传育种张圣平1　顾兴芳1　许文连2　王烨1(1中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京　100081;2山东省成武县蔬菜局,成武　274200)摘　要:　“十五”期间,生物技术在黄瓜遗传育种上的应用更加广泛,分子标记辅助育种、单倍体育种以及黄瓜基因工程改良取得了重要进展。

本文综述了黄瓜基因分子标记、遗传图谱构建、基因定位、基因克隆与表达、品种DNA 指纹图谱分析、分子技术鉴定病害、单倍体和三倍体培养、遗传转化体系建立及基因工程改良方面的最新进展,并讨论了存在的问题和前景。

关键词:　生物技术　黄瓜　遗传育种Application of Biotechnology on G enetics and B reeding of CucumberZhang Shengping Gu Xingfang Xu Wenlian Wang Ye(1I nstit ute of V egetables and Flowers ,Chinese A cadem y of A g ricult ural S ciences Bei j i ng 100081;2V egetable B ureau of Chengw u Count y in S handong Province ,Chengw u 274200)Abstract :　The application of biotechnology on genetics and breeding research of Cucumber during "The Tenth Five 2years Plan"went deeper into.Molecular marker 2assisted breeding ,haploid breeding and genetic engineering improvement in cucumber were gained significant development.The recent progress of gene molecular markers ,mo 2lecular genetic map construction ,gene locating ,gene clone and expression ,DNA fingerprinting analysis ,identifying diseases using molecular technology ,haploid and triploid culture ,genetic transformation system and genetic engi 2neering improvement in cucumber were summed up.And the problems to be solved and prospects of were discussed.K ey words :　Biotechnology Cucumber Genetics and breedieg “十五”期间,黄瓜育种研究首次被列入国家“863”项目,育种方法和技术得到了快速发展。

黄瓜重要性状相关分子标记研究进展_胡丽芳

黄瓜白粉病(powdery mildew，PM)是一种广泛发生的世界性病害，是由专性活体寄生的白粉菌引起，主要包括瓜单囊壳菌[Sphaerotheca fuliginea (Schlecht.) Poll.] 和二孢白粉菌 (Erysiphe cichoracearum DC.)2 种。春保护地和夏秋露地黄瓜最易发生此病，病菌孢子主要通过雨水和气流进行传播，主要侵害叶片。通过 MAS 方法进行黄瓜抗白粉病品种的选育研究可一定程度上加速育种进程。
目前，分子标记辅助选择的快速发展，大大提高了遗传分析的准确性和选育的有效性。综合国内外文献
基金项目：国家自然科学基金“黄瓜脂氧合酶基因 CsLOX1 参与性别分化的研究”(31060262)；江西省自然科学基金“黄瓜 AG subfamily 基因 CsMADS24 在花器官发育中的功能分析”(20122 BAB214017)；江西省自然科学基金“黄瓜脂氧化酶基因参与性别分化的研究”(2009GQN0034)；江西省教育厅项目“黄瓜 EST-SSR 新标记的开发及染色体定位”(GJJ10111)；江西农业大学自由项目“茉莉酸参与黄瓜性别分化的研究”(2009)。第一作者简介：胡丽芳，女，1979 年出生, 湖南常德人，助理研究员，博士，研究方向：植物分子生物学。E-mail：LFHu_Hn337@。通讯作者：刘世强，男，1978 年出生，广西玉林人，讲师，博士，研究方向：植物分子生物学。通信地址：330045 江西省南昌市昌北经济技术开发区志敏大道 1101 号，Tel：0791-83813574，E-mail：LSQ_hn306@。收稿日期：2013-10-17，修回日期：2013-12-26。
摘要：综述了不同分子标记技术在黄瓜重要病害（白粉病、霜霉病、枯萎病、黑星病、炭疽病、病毒病）、果

分子标记技术在蔬菜遗传育种中的应用

遗传图谱既是遗传研究的重要内容，又是作物资源、育种及分子克隆等应用研究的理论依据和基础。遗传图谱可以为育种工作者提供关于某一物种完整详细的基本资料，可以很容易将所需要的基因定位，使育种目的性更强，效率更高。传统的形态和生化方法很难使遗传图精密，很难反映基因组的全部情况。但随着各种分子标记技术的发展和完善，为构建高饱和度的连锁图提供了有力的工具。目前已有 20 种蔬菜作物构建了遗传图谱。
异显著的栽培番茄和野生醋栗番茄杂交产生的 142 个 F2 单株为作图群体，应用 SSR 标记构建了番茄的遗传连锁图谱，图谱共包含 112 个标记，总长度 808cm，标记平均间距 7．22cm。Wang 等（1997）利用 AFLP 技术构建了甜瓜（Cucumis melo L．）的遗传连锁图，含有 197 个 AFLP 位点、6 个 RAPD 位点与 1 个微卫星位点，覆盖了 1942cm 遗传距离，并发现 AFLP 标记在甜瓜图谱构建中比 RAPD 及 SSR 标记更有效。在我国，张宝玺等（2003）以辣椒胞质雄性不育的保持系 Yolowonder、恢复系 Perennial 及其 F1 构建的 DH 群体与不育系 77013A 测交的群体为供试材料，用 AFLP 分子标记技术构建了包括 43 个标记 8 个连锁群的辣椒分子遗传图谱。
植物育种中分子标记辅助选择是通过分析与目标基因紧密连锁的分子标记来判断目标基因是否存在的。通过不同分子标记技术的分析可筛选出与目标基因性状紧密连锁的 DNA 片段，这样可以作为辅助育种的分子标记。应用这些分子标记进行间接选择，将得到事半功倍的作用，因为 MAS 不受植物生长发育的时期及环
境的影响，如抗病育种不需要创造选择环境进行筛选鉴定等，从而显著提高育种效率。

应用SSR_分子标记分析烟台地区黄瓜种质资源遗传多样性

中国瓜菜收稿日期：2023-04-23；修回日期：2023-08-15基金项目：国家重点研发计划项目子课题（2018YFD1000805-03）；中国农业大学烟台研究院政策引导性项目（Z202206）；中国农业大学本科生URP 项目（U2022067）作者简介：满孝源，男，在读本科生，研究方向为设施农业科学与工程。

E-mail ：*****************通信作者：陈晓峰，男，副教授，研究方向为作物遗传育种。

E-mail ：*****************黄瓜（Cucumis sativus L.，2n =14）是葫芦科黄瓜属一年生蔓生植物，是一种世界性蔬菜，又名王瓜、胡瓜、青瓜，在果菜类蔬菜中具有很高的地位[1]。

我国是黄瓜生产大国，其栽培面积占世界黄瓜栽培总面积的一半以上，产量和规模均居世界第一位。

山东黄瓜地方品种由于栽培历史较久和引入途径不同，加之山东省不同地区气候差异较大，在长期自然和人工定向选择下，形成类型多、品种资源丰富的特点[2-3]。

以白黄瓜和地黄瓜为代表的烟台地方黄瓜，因其具有品质优良、营养丰富、口感鲜脆等特点，市场地位不断提高[4-5]。

随着市场需求扩大，黄瓜栽培及其选育品种逐渐增多，原优良品种在选育过程中纯度逐渐降低，在生产中重名现象普遍，烟台地区种质资源研究相对落后，导致优质种质流失严重[6]。

21世纪以来，分子生物学得到了突飞猛进的发展，越来越多的分子标记技术相继出现，并逐渐广泛应用于作物遗传育种、植物亲缘关系鉴别、基因库构建等各个领域，例如RFLP 、ISSR 、RAPD 、AFLP 、SSR 等[7-10]。

SSR （Simple Sequence Repeat ）称应用SSR 分子标记分析烟台地区黄瓜种质资源遗传多样性满孝源，王湘懿，张凯歌，胡凌，陈晓峰（中国农业大学烟台研究院山东烟台264670）摘要：以22份黄瓜为材料，利用SSR 分子标记技术进行遗传分析，构建22份黄瓜种质的指纹图谱和分子身份证。

DNA分子标记在瓜类遗传育种中的应用

分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的遗传标记形式。自１８９０年ＢｓｉＷｈｅ首次提出用ＲＬｏｅｔｎ和ｉｔＦＰ作为遗传标记构建遗传连锁图谱以来，分子标记技术及其应用研究ｋ新月异，相继出现了２ｔ０多种ＤＡＮ分子标记方法。随着分子生物学的发展，这些技术不断完善和改进，并有新的标记方法问世。
多态性ＤＡ，该技术用一个（时用两个）机引Ｎ有随
２分子标记技术在瓜类作物育种上的
应用
分子标记技术在蔬菜中的应用，以十字花科和
物（一般８ｌ一０个碱基）非定点扩增ＤＡ片段，然Ｎ后用凝胶电泳分开扩增片段。ＳＳｆｑｅｃａｇｄＴｅｕｎｅｇｅＳＴ
Ｓｅｉ）ｔ特定序列位点是对由其特定引物序列所界定的
一
茄科作物的研究最为广泛和深入，而葫芦科作物研究较少。分子标记技术已用于研究西瓜、甜瓜和黄
类标记的统称。利用特异ＰＲ技术的最大优点Ｃ
是产生的信息可靠，而ＲＰ，ＡＬ和利用随机ＡＤＦＰ
收稿日期：２０ — ２００４１— ８
ＲＰ（ａｄｍＡｐｉｅｏｙｒｈｃＤＡ随机扩增 ห้องสมุดไป่ตู้ＡＤＲｎｏｍｌｄＰｌｐｉＮ）ｉｆｍｏ
一
核苷酸的改变，目前已有２００多个标记定位于人０
类染色体上。检测ＳＰ的最佳方法是ＤＡ芯片技ＮＮ术。ＳＰ可称为第三代ＤＡ分子标记。ＮＮ

分子标记技术在黄瓜育种上的应用

Ｄｊｈｉｎ等利用ＲＩｉｕｅｋｚＦＰ标记评价两组黄瓜种质的遗传多样
性。在第一组１品系中，ＦＰ标记反映了与同工酶分析６个ＲＬ
一
连锁图谱。Ｓｒｕｎ等利用重组近交系构建了由７ｅｑｅ７个ＲＰＡＤ
标记和三个基因组成的８Ｏ个位点的黄瓜遗传罔谱，分属９个
的多态性确定亲本组合，建立作图群体；群体中不同植株或品
系的标记基因型的分析；标记问连锁群的确定。其中构建永久性分离群体是作成功和高效的关键。近年来，分子标记已用于黄瓜的遗传作图。Ｋｎａｄ等ｅｎｒ
育种中应用的几个主要方面。
１亲缘关系和遗传多样性的研究
分子标记是进行种质亲缘关系分析和检测种质资源多样性的有效工具。对玉米、大麦、小麦等作物的研究表明，利用分
利用ＲＩ、ＡＤ、ＦＲＰ同工酶、态和抗病性所产生的标记，Ｐ形进
行了黄瓜遗传图谱的构建，到５得８个位点的遗传图谱，属分１０个连锁群，图谱覆盖的基因组总长度约为７６ｃ标记该６Ｍ，问平均距离约为２Ｍ。Ｉｅ利用ＲＰ１ｃ，等ｅＡＤ在黄瓜的杂交Ｆ２
从２０个１基的随机引物中筛选出２００碱Ｏ个用于ＰＲ反应，Ｃ
３利用分子标记可以对基因进行定位
标记目标性状基因的方法目前丰要有两种：一是利用近
等基因系或Ｍｉｅｏｅ（９１提出的分离群体分组分析ｃｌｒ等１９）ｈｍ

黄瓜主要农艺性状分子标记研究进展

中国瓜菜2023，36（10）：1-9，15收稿日期：2023-06-17；修回日期：2023-09-03基金项目：河北省高等学校科学技术研究项目青年基金项目（QN2022068）；河北省自然科学基金青年项目（C2022407038）作者简介：李亚航，男，在读硕士研究生，研究方向为黄瓜抗病分子标记辅助选择体系的建立。

E-mail ：*******************通信作者：崔浩楠，男，讲师，研究方向为葫芦科作物分子遗传改良。

E-mail ：******************.cn黄瓜（Cucumis sativus L.）是葫芦科甜瓜属一年生植物，普遍种植于世界上各个国家和地区，是很常见的蔬菜作物。

另外，黄瓜具有较高的营养价值，含有蛋白质、钙、磷、铁、钾、胡萝卜素、维生素B2、维生素C 、维生素E 及烟酸等营养素。

常食黄瓜对人体有许多益处，能够起到抗衰老、降血糖等功效[1]。

研究发现，黄瓜起源于印度，而中国是次级起源中心之一，可分为华北型、华南型、欧洲温室型、欧美加工型等类型[2]。

分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA 水平遗传多态性的直接反映[3]。

其主要可分为四大类，第一大类是基于分子杂交的方法，主要指RFLP 。

第二大类是基于PCR 的DNA 扩增方法，又可分为两类，一类是使用随机引物，以RAPD 为代表；而另一类是利用特定引物或引物对扩增的标记，主要有SCAR 、STS 、SSR 、TRAP 、SRAP 、EST-SSR 等分子标记。

第三大类是通过PCR 与酶切相结合的方法，主要有AFLP 以及CAPS 。

第四大类是基于单个核苷酸多态性的DNA 标记，目前是指SNP [4]。

分子标记技术黄瓜主要农艺性状分子标记研究进展李亚航，施艳娥，丁卓，崔浩楠（河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室·河北科技师范学院园艺科技学院河北秦皇岛066000）摘要：黄瓜（Cucumis sativus L.）是一种重要的蔬菜作物，在世界各地广泛种植。

dna分子标记技术在瓜类蔬菜遗传育种中的应用

dna分子标记技术在瓜类蔬菜遗传育种中的应用DNA分子标记技术是通过检测和分析DNA分子的遗传多态性来实现基因定位、分离、克隆和转化的一种先进的遗传分析技术。

在瓜类蔬菜遗传育种中，DNA分子标记技术已广泛应用，为育种工作提供了重要的辅助手段。

DNA分子标记技术的应用可以帮助育种者快速、准确地鉴定目标基因或遗传性状。

通过利用已知的DNA分子标记进行筛选，可以直接筛选出目标基因或遗传性状的携带者，避免了传统育种方法中的大量回交和后代分析，节省了时间和资源。

例如，对于瓜类蔬菜中的苦味基因，利用DNA分子标记技术可以通过筛选比对标记位点来判断植株是否携带苦味基因，从而避免了食用苦味果实的风险。

通过DNA分子标记技术的应用，可以实现育种材料的品质鉴定和分类。

对于瓜类蔬菜来说，育种者通常通过品质性状、抗病性等指标来对种质资源进行评价和分类。

而DNA分子标记技术可以根据已知的标记位点来鉴定和分类材料，为后续的杂交配组提供有力的依据。

例如，在甘薯中，利用已知的DNA分子标记可以鉴定甘薯的花色、抗病性和主要品质性状，从而为育种者提供了更准确的育种方向。

DNA分子标记技术还可以用于建立遗传图谱和构建遗传连锁图。

通过对不同品种间的杂交后代进行分子标记分析，可以获得遗传图谱，用于确定分子标记之间的遗传连锁关系。

这些遗传连锁图可以为育种者提供分子标记选择的依据，促进目标基因的定位和选择。

在瓜类蔬菜中，通过构建遗传连锁图，可以确定各种性状和抗性基因之间的遗传关系，为相关基因的选择和转化提供了重要的依据。

DNA分子标记技术还可以辅助进行分子辅助选择和分子设计育种。

通过分析和筛选DNA分子标记，可以实现对目标基因的快速选择和背景基因的消除，以加速育种速度和提高育种效果。

分子设计育种利用已知的分子标记和遗传信息，结合功能基因组学等技术，可以实现对目标性状的精确改良和设计。

在瓜类蔬菜中，利用DNA分子标记技术和分子辅助选择，可以改良和设计果实大小、抗病性、耐寒性等重要性状，提高瓜类蔬菜的品质和产量。

基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱

基于SNP分子标记构建黄瓜指纹图谱目录一、内容概要 (3)1. 研究背景与意义 (4)2. 国内外研究进展概述 (4)3. 研究内容与方法 (5)二、材料与方法 (6)1. 材料收集与处理 (8)黄瓜品种选择 (9)样本采集与保存 (10)DNA提取与纯化 (10)2. SNP分子标记开发 (12)遗传学原理与技术路线 (13)SNPs筛选与验证 (14)分子标记数据整合 (16)3. 花纹图谱构建 (17)条形码技术与数据编码 (17)图谱构建与优化 (19)图谱验证与比较 (19)三、结果与分析 (20)1. SNP位点分布与多样性 (21)SNPs数量与分布规律 (22)遗传多样性分析 (23)物种鉴定与分类 (24)2. 花纹图谱特征提取 (25)图谱特征参数选取 (26)图谱相似性计算 (27)花纹模式识别 (28)3. 综合分析与评价 (28)不同品种间差异分析 (29)花纹图谱的稳定性与重复性评估 (30)分子标记在黄瓜指纹图谱中的应用价值 (31)四、讨论与展望 (32)1. 研究成果总结 (33)SNP分子标记在黄瓜指纹图谱构建中的优势 (34)花纹图谱在黄瓜品种鉴定中的应用前景 (35)2. 研究局限与不足 (35)技术方法的局限性 (36)数据来源的局限性 (37)3. 未来研究方向与展望 (38)深入挖掘SNP标记信息 (40)开发新型分子标记技术 (41)推广黄瓜指纹图谱在农业生产中的应用 (42)一、内容概要本文档旨在介绍基于单核苷酸多态性(SNP)分子标记构建黄瓜指纹图谱的方法和技术流程。

黄瓜指纹图谱是一种利用基因组中特定SNP位点的多态性，为黄瓜个体提供独特遗传标识的技术。

通过构建黄瓜指纹图谱，可以更有效地进行黄瓜种质资源的鉴定、评价和利用，推动黄瓜遗传育种和种业发展。

SNPID与引物的设计与筛选：根据黄瓜基因组中的SNP位点信息，设计并筛选出适用于指纹图谱构建的特异性引物。

分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展_苏长跃

山东农业科学2014，46（4）：136 139Shandong Agricultural Sciences收稿日期：2013－07－30基金项目：山东省农业良种工程重大课题：山东设施名产蔬菜及食用菌新品种选育（2011LZ06）；以生物技术为主要手段的蔬菜种质资源创新利用研究作者简介：苏长跃（1986－），男，硕士研究生，研究方向为蔬菜育种。

E －mail ：changyaona@163．com *通讯作者，E －mail ：zigaojiao5@163．com分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展苏长跃1，焦自高2*，史庆华1，董玉梅2，王崇启2，肖守华2（1．山东农业大学园艺科学与工程学院，山东泰安271018；2．山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心，山东济南250100）摘要：本文综述了分子标记技术及其应用于瓜类蔬菜种质资源亲缘关系和遗传多样性分析、分子标记辅助选择、品种纯度鉴定、遗传图谱构建及基因定位等方面的研究进展，对目前分子标记技术应用于瓜类蔬菜育种中存在的问题进行了探讨，并对其应用前景做了展望，以期为今后瓜类蔬菜高效分子育种技术的建立提供参考。

关键词：瓜类蔬菜；分子标记技术；辅助育种；研究进展中图分类号：S642．036文献标识号：A文章编号：1001－4942（2014）04－0136－04瓜类蔬菜在我国蔬菜生产中占有重要地位。

分子标记是以个体间遗传物质核苷酸序列变异为基础的遗传标记，是DNA 水平上遗传多态性的直接反映［1］。

分子标记技术的出现，使植物育种的“间接选择”成为可能，大大提高了遗传分析的准确性和选育品种的有效性［2］。

近年来，随着分子生物学的迅猛发展，分子标记技术在蔬菜育种中的作用越来越受到重视［3］。

本文综述了几种常见的分子标记技术在瓜类蔬菜育种中的研究进展，以期为瓜类蔬菜高效分子育种体系的建立提供参考。

1分子标记技术种类Bostein 等（1980）最早利用限制性长度片段多态性（Ｒestriction fragment length polymorphism ，ＲFLP ）作为遗传标记构建了遗传连锁图谱，开创了直接利用DNA 多态性发展遗传标记的新阶段［4］。

上海交通大学科技成果——黄瓜分子育种与推广应用

上海交通大学科技成果——黄瓜分子育种与推广应用
技术背景
在国家和上海市科技项目的资助下，蔡润教授团队历时近20年的努力，收集鉴定了800多份黄瓜种质，开展了分子标记遗传图谱构建、主要农艺性状QTL分析、基因定位与克隆，并将研发出的黄瓜分子标记成功应用于育种，培育出10余个黄瓜新品种。

技术水平
构建了6张黄瓜分子标记遗传图谱，并不断更新，一直是国内外黄瓜最有代表性的分子标记遗传图谱。

共检测了18个性状，包括花、果实、侧枝、抗病性等相关性状的130QTL。

对黄瓜的性型、果瘤、抗白粉病、表皮毛等4个性状进行了精细定位，并首次图位克隆了这些基因的功能。

围绕着相关技术的研发和应用，获得教育部科技发明一等奖1项，上海市科技进步二、三等奖各1项。

产业化基础
相关研究获得授权发明专利15项。

培育出自主知识产权的欧洲
温室型“申绿”黄瓜新品种6个，华南型“申杂”新品种4个，在全国16个省市大面积种植推广，年亩产量1.5万公斤以上，亩均产值3万元左右。

由于蔡教授培育的黄瓜品种具有以下优势，受到生产者和消费者一致好评。

技术特点
1、全雌花且每花必果，产量高；
2、可定制长度和性状（如是否带刺）；
3、口感好，无籽。

黄瓜果实长度遗传分析及分子标记的开题报告

黄瓜果实长度遗传分析及分子标记的开题报告【题目】黄瓜果实长度遗传分析及分子标记【背景】黄瓜（Cucumis sativus L.）是葫芦科（Cucurbitaceae）的一种蔬菜作物，经济价值较高。

黄瓜果实长度是农民种植黄瓜时非常重要的性状之一，在黄瓜产业中具有重要的经济意义。

黄瓜果实长度的遗传基础已经引起人们的广泛关注，研究表明，果实长度是由多个基因控制的复杂性状。

基因型对果实长度的影响是相对稳定的，而环境因素（如温度、光照、水分等）则会对果实长度产生一定的影响。

研究黄瓜果实长度遗传基础和分子机制，有助于提高黄瓜的产量和质量，促进黄瓜产业的发展。

【研究目的】本研究旨在探究黄瓜果实长度的遗传基础和分子机制，构建黄瓜果实长度的遗传图谱，并开发相关的分子标记，为黄瓜产业的发展提供科学依据。

【研究内容】1. 黄瓜果实长度的遗传分析：选择不同长度的黄瓜品种或变异品系作为亲本，进行交叉试验，得到第一代、第二代等后代，统计各代黄瓜果实长度的数据，进行遗传分析，推断果实长度的遗传模式。

2. 构建黄瓜果实长度的遗传图谱：根据遗传分析结果，筛选出相关基因，开展基因定位和连锁分析，构建黄瓜果实长度的遗传图谱，为后续分子标记的研发提供理论基础。

3. 分子标记的开发和应用：根据遗传图谱开发与黄瓜果实长度相关的分子标记，如SSR、SNP等，对黄瓜品种进行鉴定和评价，为黄瓜杂交育种和品种筛选提供有效工具。

【研究方法】1. 遗传分析：选择不同长度的黄瓜品种或变异品系作为亲本，进行交叉试验，得到第一代、第二代等后代，统计各代黄瓜果实长度的数据，采用遗传学分析方法进行遗传分析。

2. 基因定位和连锁分析：采用分子标记技术进行基因定位和连锁分析，通过PCR扩增和电泳检测等手段，分析不同基因间的连锁关系和分离频率，构建黄瓜果实长度的遗传图谱。

3. 分子标记的开发和应用：根据遗传图谱开发与黄瓜果实长度相关的分子标记，设计引物，采用PCR技术进行扩增和分离纯化，通过PCR-SSCP、PCR-RFLP等分析技术进行检测和鉴定。