pFB-ERV逆病毒载体使用说明

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慢病毒使用操作手册

慢病毒使用操作手册

慢病毒使用操作手册:1 慢病毒使用操作2 慢病毒安全使用规范3 悬浮细胞感染方法概要4 相关专业术语(详情可参考公司网站FAQ)5 细胞培养器皿的相关参数1、慢病毒使用操作手册1.1 慢病毒的储存与稀释:1.1.1 病毒的储存:用户收到病毒液后在很短时间内即使用慢病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4 ℃保存;如需长期保存请放置于-80℃(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口)A.病毒可以存放于-80℃ 6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,我们建议在使用前需要重新滴定病毒滴度B.反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中应仅尽量避免反复冻融,为避免反复冻融我们强烈建议客户收到病毒后按照每次的使用量进行分装。

1.1.2 病毒的稀释:用户需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用培养目的细胞用PBS或无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完) 分装后使用。

1.2 慢病毒用于体外(In Vitro)实验:感染培养原代细胞和建系细胞1.2.1 慢病毒对各种细胞和组织的亲嗜性不同,用户使用Invabio提供的慢病毒之前可以通过查阅相关文献,了解慢病毒对您的目的细胞的亲嗜性,感染复数(MOI 值)以及在体(In Vivo)注射所需要的病毒量。

如果没有相关文献支持,可以通过感染预实验得到合适的感染复数(MOI 值)(使用24孔板检测病毒对目的细胞的亲嗜性)1.2.2 慢病毒感染目的细胞预实验1.2.2.1 慢病毒感染目的细胞预实验注意事项A.测定慢病毒对目的细胞的亲嗜性时,需要同时设置对慢病毒亲嗜性较高的细胞(HEK293T,Hela)作为平行实验的对照细胞。

B.在进行慢病毒感染实验时,可以用完全培养基(培养目的细胞用)稀释;理论上,含有血清,双抗或者其他营养因子的完全培养基不影响慢病毒的感染效率。

C. Invabio提供的病毒单位为TU/ml, 即每毫升中含有具有生物活性的病毒颗粒数。

逆转录病毒试用装操作手册

逆转录病毒试用装操作手册

汉恒逆转录病毒操作手册一、逆转录病毒的试用装分装与储存1.收到汉恒生物逆转录病毒产品后,请先对逆转录病毒产品进行分装处理,建议20-50μl/管。

如1-2天内使用,则留足够量病毒4℃保存,余下逆转录病毒置于-80℃长期保存。

2.病毒可以存放于-80℃ 6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,建议在使用前重新测定病毒滴度。

3.反复冻融会降低逆转录病毒滴度:逆转录病毒滴度越低,冻融对滴度的影响越大,108IU/ml的逆转录病毒冻融2次滴度没有显著性差异,第3次冻融开始,每冻融一次滴度降低约10%;滴度107IU/ml滴度逆转录病毒,从第2次冻融开始,每次冻融病毒滴度下降10%-15%。

二、逆转录病毒试用装实验策略与关键知识点1.逆转录病毒感染策略:逆转录病毒本身的病毒滴度不高,感染细胞时病毒消耗量较大,试用装体积较小,建议使用96孔板进行MOI梯度感染测试。

逆转录病毒感染细胞后会反转录并插入基因组形成稳转,因此逆转录病毒感染一般采用感染少量细胞,然后将细胞放大化培养。

而不是直接大量感染。

注意:对于一些传代能力较差的原代细胞,比如BMSC等,建议采用腺病毒感染。

2.逆转录病毒感染关键知识点1)细胞准备:由于试用装体积有限,请使用96孔板准备细胞,逆转录病毒感染细胞前,请确保目的细胞状态良好、无支原体污染。

逆转录病毒感染的时候细胞汇合率为40%~60%间为宜。

2)感染细胞最佳MOI的测定:MOI(感染复数)是指每个细胞感染的病毒数。

逆转录病毒对于不同种类不同来源的细胞,其最适MOI各有差别,原则上最适MOI是感染效率较好的最低MOI。

MOI一般以3:10:30:100的比例递增进行梯度摸索,一般的细胞基础逆转录病毒感染MOI 可从3为开始,即设立4个常规的MOI摸索,即3,10,30,100。

3)助转剂polybrene的选择:实验证明,polybrene可提高逆转录病毒对大部分细胞的感染效率,但polybrene 有一定的细胞毒性,不同细胞对polybrene的敏感度不同,polybrene最常用的工作浓度为5~8μg/ml。

逆转录病毒包装

逆转录病毒包装

逆转录病毒包装
逆转录病毒(Retrovirus)是一类RNA病毒。

在逆转录酶的作用下,以病毒RNA为模板合成cDNA,再通过DNA复制、转录、翻译等过程形成病毒颗粒。

逆转录病毒表达系统是一种新的重组蛋白高效表达系统,由逆转录病毒载体、辅助载体(表达病毒包装需要的蛋白质)和包装细胞系组成。

逆转录病毒载体在外源基因表达、基因沉默、基因治疗、生物制药等得到广泛的应用。

逆转录病毒载体主要优点:转染范围广,可以感染各种细胞类型,如淋巴细胞或肝细胞、肌细胞等;转入的外源基因可完全整合;对细胞感染率高;感染细胞不产生病变,可建立细胞系长期持续表达外源基因。

逆转录病毒载体系统共由两部分组成:包装细胞系和缺陷病毒本身。

在逆转录病毒载体中,去除了正常的蛋白编码序列而保留了复制和包装信号,通过分子克隆技术将目的基因插入此载体上,而包装细胞系能提供病毒载体包装成病毒粒子所需的结构蛋白。

当重组病毒载体导入包装细胞后,缺陷病毒载体和包装细胞的互补作用共同完成病毒装配,该病毒颗粒可感染其他宿主细胞,此时目的基因进入该细胞并整合到细胞基因组中,导致插入序列在宿主细胞中表达,产生目的蛋白。

宿主细胞不能像包装细胞那样为缺失结构基因的逆转录病毒提供结构蛋白,因而在宿主细胞内不会产生新的感染性病毒颗粒,保证了该载体在生物制品领域的生物安全性问题。

服务内容
将目的基因片段克隆到逆转录病毒载体上;逆转录病毒的包装、扩增、滴度的测定。

客户提供
样品;目的基因信息或者序列。

我们提供
含有目的基因片段的逆转录病毒;所用的引物序列、测序结果;详尽完整的实验报告。

pFB-hrGFP逆病毒载体使用说明

pFB-hrGFP逆病毒载体使用说明

pFB-hrGFPpFB-hrGFP 逆病毒载体基本信息:载体名称:pFB-hrGFP 质粒类型: 逆病毒载体 高拷贝/低拷贝: 低拷贝 克隆方法: 限制性内切酶,多克隆位点启动子:-- 载体大小:5838 bp 5'测序引物及序列:-- 3' 测序引物及序列:-- 载体标签:-- 载体抗性: 氨苄青霉素 筛选标记: 无 克隆菌株: DH5α 等 宿主细胞(系): 常规细胞系(293、CV-1、CHO 等)备注:逆病毒载体pFB-hrGFP 组成型表达hrGFP 绿色荧光蛋白;hrGFP 细胞毒性低稳定性: 稳表达 组成型/诱导型: 组成型 病毒/非病毒: 逆转录病毒pFB-hrGFP 载体质粒图谱和多克隆位点信息:pFB-hrGFP载体简介:pFB-hrGFP载体限制性酶切位点pFB-hrGFP, 5838 bp version 013001Enzymes with 1-10 cleavage sites:#sites -- Bp position of recognition site --AatII 2 978, 5764Acc65I 3 647, 1846, 3364AccI 3 1967, 2057, 3724AflII 3 202, 1265, 2919AflIII 3 164, 2157, 3953AgeI 1 1840AhdI 6 687, 733, 1274, 3404, 3450 4841Alw44I 4 1054, 3769, 4267, 5513AlwNI 6 323, 398, 2084, 3040, 3115 4364ApaI 1 1238ApoI 3 87, 1128, 2063BanII 8 580, 593, 764, 1238, 2266 3297, 3310, 3481BbeI 4 615, 1656, 2234, 3332BbsI 3 2494, 2686, 5831BbvCI 2 453, 3170BciVI 5 656, 1986, 3373, 4162, 5689 BglI 1 4960BglII 1 1678BpmI 5 1799, 2135, 2681, 2867, 4931 Bpu10I 8 337, 412, 453, 1548, 2263 3054, 3129, 3170BsaAI 5 1816, 2000, 2156, 2693, 3705 BsaHI 7 615, 978, 1656, 2234, 3332 5382, 5764BsaI 10 694, 715, 782, 1414, 1802 2726, 3411, 3432, 3499, 4913 BsaWI 5 138, 1840, 4159, 4306, 5137 BseRI 6 718, 1068, 1561, 1600, 2426 3435BsgI 2 2213, 2774BsiEI 8 961, 1034, 1838, 2801, 3866 4290, 5213, 5362BsiHKAI 7 580, 1054, 3297, 3769, 4267 5428, 5513BsmBI 6 976, 1093, 1337, 1396, 1582Bsp120I 1 1238BspHI 4 2115, 4673, 5681, 5786BspLU11I 2 164, 3953BsrBI 5 1299, 2798, 2823, 3884, 5685 BsrDI 2 4900, 5082BsrGI 2 1541, 2532BssHII 2 563, 3280BssSI 5 2723, 2777, 4126, 5510, 5817 Bst1107I 1 3724BstAPI 5 322, 397, 3039, 3114, 3771 BstEII 1 1346Bsu36I 1 1276Cfr10I 5 1840, 2099, 2348, 2504, 4926 DraI 3 4710, 4729, 5421DraIII 1 1873DrdI 2 3642, 4055DsaI 4 151, 931, 2070, 2166EaeI 7 827, 961, 1368, 1389, 1668 2801, 5234EarI 5 1334, 1564, 2626, 3831, 5635 Ecl136II 2 580, 3297Eco52I 2 961, 2801Eco57I 3 2090, 4480, 5528Eco72I 2 2000, 2156EcoNI 2 1647, 2419EcoO109I 5 499, 1477, 1924, 3216, 5821 EcoRI 1 2063EcoRV 4 308, 383, 3025, 3100EheI 4 615, 1656, 2234, 3332FspI 2 2613, 5066HaeII 6 615, 1656, 2234, 3332, 3827 4197HgaI 6 889, 1166, 3659, 4055, 4633 5383HincII 2 2057, 5385HinfI 10 637, 1020, 1045, 1863, 2829 3354, 3853, 3928, 4324, 4841 KasI 4 615, 1656, 2234, 3332KpnI 3 647, 1846, 3364MscI 3 827, 1368, 1668MslI 6 159, 2068, 2617, 5094, 5253 5612MunI 2 11, 21NarI 4 615, 1656, 2234, 3332NcoI 2 2070, 2166NdeI 3 1664, 1672, 3775NgoMIV 1 2348NheI 5 6, 16, 26, 197, 2914 NotI 1 2800NspI 4 164, 2610, 3588, 3953PleI 9 637, 1020, 1045, 1863, 2829 3354, 3853, 4324, 4841PpuMI 4 499, 1477, 1924, 3216PshAI 1 1015Psp1406I 2 5071, 5444PstI 5 1178, 1360, 2105, 2510, 5087 PvuI 2 1034, 5213PvuII 7 286, 361, 2207, 2602, 2741 3003, 3078SacI 2 580, 3297SacII 1 151SalI 1 2057SapI 2 2626, 3830SbfI 1 2104ScaI 1 5324SchI 9 637, 1020, 1045, 1863, 2829 3354, 3853, 4324, 4841SexAI 1 1474SfcI 10 182, 1178, 1360, 2105, 2510 2599, 2899, 4218, 4409, 5087 SmaI 4 643, 1241, 2018, 3360SmlI 8 202, 1265, 2795, 2919, 4059 4321, 4598, 5466SpeI 1 897SrfI 1 1240SspI 1 5648StyI 8 496, 706, 1504, 2070, 2166 2229, 3213, 3423TatI 5 1541, 2451, 2532, 3759, 5324 TfiI 1 3928Tsp45I 7 1282, 1491, 2225, 3608, 3703 5103, 5314TspRI 10 1284, 1875, 3849, 4355, 4368 4639, 4788, 4893, 5240, 5267 Tth111I 4 633, 1473, 3350, 3697VspI 1 5017XbaI 3 464, 2036, 3181XcmI 1 2517XhoI 1 2795XhoII 10 1678, 2085, 2217, 2400, 4594 4605, 4691, 4703, 5471, 5488 XmaI 4 643, 1241, 2018, 3360XmnI 2 2644, 5441Enzymes that do NOT cut molecule:AccIII AscI BamHI BclI BlnI Bpu1102I BsaBI BsiWI BsmI BspMI BstBI BstXI ClaI Eco47III FseI HindIII HpaI MluI NruI NsiI PacI PmeI Ppu10I RsrII SanDI SfiI SgfI SgrAI SnaBI SphI StuI SwaI Van91IpFB-hrGFP载体序列。

汉恒生物-病毒载体操作安全手册

汉恒生物-病毒载体操作安全手册

病毒载体操作安全手册引言根据W HO生物安全手册对感染性微生物的相对危害程度制订的危险度等级的划分标准。

病毒的危险度为 4 级,它对个体和群体的危险均高,通常能引起人或动物的严重疾病,并且很容易发生个体之间的直接或间接传播,对感染一般没有有效的预防和治疗措施。

所以我们需要制定一定的安全注意事项,包括设备的要求、操作人员的防护、操作的规范性以及废弃物的处理等,以避免潜在的危险。

一、病毒房设备要求我们知道细胞培养技术与其他一般实验室工作的主要区别在于要求保持无菌操作,避免微生物及其他有害因素的影响。

目前超净工作台的广泛使用,很大程度上方便了组织细胞培养工作,并使一些常规实验室有可能用于进行细胞培养。

细胞培养实验室应能进行六方面的工作:无菌操作、孵育、制备、清洗、消毒灭菌处理、储藏。

病毒房的设备在普通细胞房的基础上要求更高,尤其是其无菌操作设备。

(一)无菌操作区1、无菌操作室:无菌操作区只限于细胞培养及其他无菌操作的区域,最好能与外界隔离,不能穿行或受其他干扰。

理想的无菌操作室应划为三部分:1(1)更衣室—―供更换衣服、鞋子及穿戴帽子和口罩。

(2)缓冲间—―位于更衣间与操作间之间,目的是为了保证操作间的无菌环境,同时可放置恒温培养箱及某些必需的小型仪器。

(3) 无菌操作间—―专用于无菌操作、细胞培养。

无菌操作间的空气消毒:紫外线灯。

2、二级生物安全柜:生物安全柜是为操作原代培养物、菌毒株以及诊断性标本等具有感染性的实验材料时,用来保护操作者本人、实验室环境以及实验材料,使其避免暴露于上述操作过程中可能产生的感染性气溶胶和溅出物而设计的。

(二)孵育区本区对无菌的要求虽不比无菌区严格,但仍需清洁无尘,因此也应设置在干扰少而非来往穿行的区域。

孵育一般可在恒温培养箱内进行。

(三)制备区在该区主要进行培养液及有关培养用的液体等的制备,如条件有限,可以在操作区进行。

(四)储藏区主要存放各类冰箱、干燥箱、液氮罐、无菌培养液、培养瓶等,此环境也需要清洁无尘。

逆转录病毒载体

逆转录病毒载体

逆转录病毒载体逆转录病毒的许多特点使其成为基因转移载体的最佳选择。

它可有效的整合入靶细胞基因组并稳定持久地表达所带的外源基因。

病毒基因组以转座的方式整合,其基因组不会发生重排,因此所携带的外源基因也不会改变。

逆转录病毒属RNA病毒,通过其本身逆转录酶的作用,形成双链DNA原病毒,然后整合于宿主细胞染色体中。

逆转录病毒是一类正链RNA病毒,其分为顺式功能基因和反式功能基因。

由于逆转录病毒包膜上有env 编码的糖蛋白能被许多哺乳动物细胞膜上特异性受体所识别,并能介导逆转录病毒的遗传物质高效地进入宿主细胞内;同时逆转录病毒结构基因gag、env 和pol的缺乏不影响其他部分的活性,因此可用外源性基因代替这部分病毒基因,外源性基因最大容量为8.0kb左右,可适用于大部分目的基因;并且病毒在自身表达的整合酶催化作用下可高效地整合入宿主细胞染色体中,这有利于外源基因在宿主细胞的永久表达。

构建载体时以DNA原病毒为基础,将野生型病毒的3类结构基因gag,pol和env删除,以供外源基因的插入,但是要保存病毒的包装序列(ψ)和双侧的长末端重复(LTR),LTR含有启动子、增强子、整合信号及poly A信号等多种元件。

插入的基因一般为两种或两种以上,如目的基因和标记基因。

因此和逆转录病毒结合的是DNA。

将目的基因重组到逆转录病毒载体上,制成高浓度的病毒颗粒,人为感染着床前或着床后的胚胎,也可以直接将胚胎与能释放逆转录病毒的单层培养细胞共孵育以达到感染的目的,通过病毒将外源目的基因插入整合到宿主基因组DNA中去。

通过此方法,得到了转基因鸡和转基因牛。

这种逆转录病毒被用重组DNA技术修饰后作为基因载体在应用中优于微注射法之处为:无需要重排,可在整合点整合转移基因的单个拷贝;将胚胎置于高浓度病毒容器中,或者与被感染的细胞体外共同培养,或微注射鸡胚盘里,整合有逆转录病毒的DNA的胚胎率高。

缺点是:需要生产带有转基因的逆转录病毒;插入逆转录病毒的基因有一定的大小限度;所得转基因家畜的嵌合性很高,而需要广泛的杂交,以建立转基因系;转基因的表达问题尚未解决。

转思路迪博客:慢病毒载体发展

转思路迪博客:慢病毒载体发展

转思路迪博客:慢病毒载体发展和“简单型”逆转录病毒载体的设计类似,对慢病毒载体的改造也是基于将其病毒基因组分成三个载体分别表达包膜蛋白,病毒包装蛋白和外源表达载体。

当使用慢病毒载体用于临床基因治疗时,有些系统甚至使用4 或者5 质粒系统以降低产生复制性病毒(RCR, replicative-competent retrovirus) 的可能性从而增加体内使用的安全性。

与“简单型” 逆转录病毒不同的是,慢病毒由于存在辅助蛋白和调控蛋白,其载体改造涉及更多的对这些反式作用因子的去除以及相应的顺式作用元件的改造。

第一代慢病毒载体使用三质粒系统,将包膜蛋白单独置于一个质粒中表达,包装载体含有除包膜蛋白编码基因的全病毒基因组,使用CMV 启动基因表达,并用人胰岛素基因的polyA 替代3' LTR 作为加尾信号,同时将外源插入片段以及所有相关顺式作用元件(包装信号y,LTRs,RRE 和引发结合位点(PBS, primer binding site)) 置于外源表达载体中。

第二代慢病毒载体去除了辅助蛋白编码基因Vif, Vpr, Vpu和Nef,以减少产生RCR的风险。

第三代慢病毒载体则去除了对Tat和Rev蛋白因子的依赖作用。

通过将5' LTR中的U3区替换成CMV,可以消除对Tat的依赖;通过对gag-pol 编码基因的密码子进行优化,可以解除对Rev 的依赖。

许多顺式作用元件(DNA 序列)对病毒的包装效率影响也很大,比如cPPT 和来源于Igk 的MAR (matrix attachment region),以及WPRE(土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件),其可以有效帮助mRNA 的polyA 加尾效率。

同时通过失活3'LTR 区的U3 区,可以减少病毒载体整合后对宿主整合位点附近基因的表达干扰,而且还可以有助于引入诱导表达或者组织特异性表达系统。

包膜蛋白表达载体:慢病毒载体改造中一个重大突破是将慢病毒自身的包膜蛋白替换成其它病毒的包膜蛋白,尤其是VSV-G 。

2024年医学微生物学课件第30章逆转录病毒(特殊条款版)

2024年医学微生物学课件第30章逆转录病毒(特殊条款版)

医学微生物学课件第30章逆转录病毒(特殊条款版)医学微生物学课件第30章:逆转录病毒一、引言逆转录病毒(Retroviruses)是一种RNA病毒,具有逆转录酶(reversetranscriptase,RT)活性,能够将病毒RNA转录成DNA,并插入宿主细胞的基因组中。

这种独特的复制方式使得逆转录病毒在生物医学领域具有广泛的应用价值,如基因治疗、基因工程等。

本章将详细介绍逆转录病毒的生物学特性、分类、生命周期、致病机制以及防治策略。

二、逆转录病毒的生物学特性1.结构特征逆转录病毒颗粒呈球形,直径约为100-120纳米。

病毒颗粒由核心、衣壳和包膜三部分组成。

核心含有病毒RNA、逆转录酶、病毒蛋白等;衣壳呈二十面体对称,由病毒蛋白组成;包膜来源于宿主细胞,含有病毒糖蛋白。

2.基因组结构逆转录病毒的基因组为单链正链RNA,长度约为9-11千碱基对(kb)。

基因组包含5'和3'非翻译区(UTR)、Gag、Pol、Env和辅助蛋白基因。

其中,Gag编码衣壳蛋白,Pol编码逆转录酶和整合酶,Env编码病毒包膜糖蛋白,辅助蛋白基因参与病毒复制、装配和释放等过程。

3.逆转录酶活性逆转录酶是逆转录病毒复制的关键酶,具有DNA聚合酶、RNA 聚合酶和DNA内切酶活性。

在病毒复制过程中,逆转录酶将病毒RNA转录成单链DNA,然后合成双链DNA,将双链DNA整合入宿主细胞基因组。

三、逆转录病毒的分类逆转录病毒可分为两大类:简单逆转录病毒和复杂逆转录病毒。

1.简单逆转录病毒简单逆转录病毒包括HIV、SIV、FIV等,它们的基因组结构较为简单,仅含有Gag、Pol、Env和辅助蛋白基因。

这类病毒主要感染哺乳动物,如人类免疫缺陷病毒(HIV)感染人类,导致艾滋病。

2.复杂逆转录病毒复杂逆转录病毒的基因组结构较为复杂,含有多个基因家族,如长末端重复序列(LTR)、整合酶、病毒蛋白等。

这类病毒主要感染鸟类、哺乳动物和昆虫,如劳斯肉瘤病毒(RSV)感染鸟类,诱发肉瘤。

汉恒腺病毒载体操作手册

汉恒腺病毒载体操作手册
4、细胞离心,1000rpm,5min。去掉上清。 5、根据细胞计数结果加入细胞冻存液(70%完全培养基 +20%FBS+10%DMSO),重悬细胞,密度为 3 x 106 个/ml。 6、分装进细胞冻存管,放入冻存盒中,放入-80℃超低温冰箱。 7、第二天将细胞放于液氮罐中长久保存,并作记录。保存过程 中,要不时复苏细胞检测细胞存活率,观察细胞状态等。
6
汉恒生物公司地址:上海市徐汇区斜土路
E-mail:service@
1175 号 15 楼

T实e验l:室02地1-址51:29上62海58市张江高科技园区蔡伦路 781 弄张江药谷 503
腺病毒载体操作手册
四、腺病毒包装、扩增和纯化
(一)腺病毒包装
5118bp
GFP
(NotI ) (NcoI ) (NcoI )
pUC ori
SV40 PolyA LoxP
HindIII
[ SacI SalI
Amp r pUC ori
SacII
XbaI(456)
ITR
ITR
1
(NdeI )
(NdeI )
NheI(1384)
pHB Ad-U6-RFP 4993bp
1
汉恒生物公司地址:上海市徐汇区斜土路
E-mail:service@
1175 号 15 楼

T实e验l:室02地1-址51:29上62海58市张江高科技园区蔡伦路 781 弄张江药谷 503
腺病毒载体操作手册
蛋白(GFP)。pHBAd-CMV-IRES-RFP 和 pHBAd-U6-RFP 能表达 红色荧光蛋白(RFP)。
3、将细胞溶液转移到 15ml 离心管中,并在其中加上 1ml 新鲜 的完全培养基,混匀后离心,1000rpm,5min。

腺病毒包装操作手册

腺病毒包装操作手册

汉恒重组腺病毒操作手册目录腺病毒安全使用和注意事项腺病毒储存与稀释的注意事项一、整体实验流程二、实验材料三、腺病毒包装和浓缩四、重组腺病毒滴度(PFU)的测定五、重组腺病毒感染目的细胞六、重组腺病毒用于动物实验附1:汉恒生物腺病毒载体附2:腺病毒感染细胞最佳MOI的摸索(表达荧光的病毒) 附3:汉恒生物常见三种病毒感染目的细胞比较腺病毒安全使用和注意事项➢腺病毒安全使用注意事项(*非常重要*)1) 腺病毒相关实验请在生物安全柜(BL-2级别)内操作。

2) 操作病毒时请穿实验服,佩戴口罩和手套,尽量不要裸露双手及手臂的皮肤。

3) 操作病毒时需要特别小心病毒溅出。

如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用70%乙醇加 1%的SDS溶液擦拭干净。

4) 接触过病毒的枪头、离心管、培养板及培养瓶请用84消毒液浸泡后统一处理。

5) 如实验过程中需要离心,应使用密封性好的离心管,必要时请用封口膜封口后离心。

6) 病毒相关的废弃物需要特殊收集,统一经高温灭菌后处理。

7) 实验完毕后请用香皂清洗双手。

➢腺病毒储存与稀释的注意事项1)腺病毒的储存收到病毒液后若在短期内使用,可将病毒放置于 4℃保存(一周内使用完最佳);如需长期保存请分装后放置于 -80 ℃ 。

注:a.反复冻融会降低病毒滴度(每次冻融会使病毒滴度降低10%~50%),因此在病毒使用过程中尽量避免反复冻融。

汉恒生物对病毒已进行分装(200 μl/tube),收到后请直接放置-80℃冰箱保存即可。

b.若病毒储存时间超过6个月,汉恒生物建议在使用前重新测定病毒滴度(参见附表2-慢病毒滴度测定方法)。

2)腺病毒的稀释需要稀释病毒时,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用PBS或培养目的细胞用的无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)混匀分装后置于 4℃保存(一周内使用完最佳)。

重组腺病毒是一种复制缺陷的腺病毒载体系统,在基因治疗、基础生命科学研究等领域被广泛应用。

汉恒生物-慢病毒生产及使用操作手册第二版

汉恒生物-慢病毒生产及使用操作手册第二版

2. 感染细胞最佳 MOI 的测定 MOI(Multiplicity of Infection,感染复数)是指每个细胞感染的病毒
数,通常 MOI 越高,病毒整合到染色体的数量以及目的蛋白的表达量越高。 对于分裂活跃的细胞,比如 Hela、293 细胞,MOI=1~3 时,80%以上的细胞均表 达目的基因。而对于非分裂细胞,比如原代细胞,感染效率较低。需要进行 MOI 梯度摸索实验,选择适合的 MOI 进行实验。
四、慢病毒包装和浓缩 (一)质粒扩增
构建好的慢病毒载体和辅助质粒需经过大量抽提,浓度大于 1ug/ul,A260/280 在 1.7-1.8 间方可用以包毒。推荐使用 Qiagen 大抽试剂盒进 行质粒的大量去内毒素抽提。 (二)传 293T 细胞
将培养 293T 细胞 T75 瓶中的培养基吸净,加入 2mL 4 度冰箱取出的 0.25% 胰酶,使其均匀覆盖瓶底,置于 37 度培养箱中 3-5min,取出,摇晃可发现细胞 于底部脱离,将其全部晃下,加入 3mL 37 度水浴中预热的 10% DMEM,移液枪 用 10mL 移液管进行吹打,较大力吹打 6-8 次即可,不留死角,瓶口处较难吹打 可将移液管对准培口,小力将培养基打出即可覆盖到接近瓶口的细胞。之后,将 所有细胞吸出,置于 15mL 离心管中,取 50ul 混匀后的细胞于 1.5mL eppendorf
当细胞传代次数过多,细胞状态变差时,或者细胞出现污染事故时,需要丢 弃并对最初冻存的细胞进行复苏。
1、设置温度为 37~42℃的水浴。 2、查看细胞库记录,根据记录从液氮罐中取出冻存的细胞(需戴上棉手套, 防止被冻伤),迅速丢入水浴锅中并快速晃动,尽量在 1~2min 内使细胞溶液完全 溶解。 3、将细胞溶液转移到 15ml 离心管中,并在其中加上 1ml 新鲜的完全培养 基,混匀后离心,1000rpm,5min。 4、去掉上清,加入 5ml 新鲜的完全培养基,混匀沉淀后,转入 6cm 培养皿。 5、将培养皿平稳放入 37℃、5%CO2 和 95%相对湿度的培养箱中培养。 6、第二天观察细胞存活率。给细胞换一下培养基。以后每天观察细胞生长 情况。

非洲猪瘟病毒荧光PCR检测试剂盒(一步法)说明书和内包装标签(2022版)

非洲猪瘟病毒荧光PCR检测试剂盒(一步法)说明书和内包装标签(2022版)

非洲猪瘟病毒荧光PCR检测试剂盒(一步法)说明书和内包装标签(一)非洲猪瘟病毒荧光PCR检测试剂盒(一步法)说明书【兽药名称】通用名非洲猪瘟病毒荧光PCR检测试剂盒(一步法)商品名无英文名African Swine Fever Virus Real - time PCR Test Kit (One - step)汉语拼音Feizhouzhuwenbingdu Yingguang PCR Jiance Shijihe (Yibufa)【主要成分与含量】编号试剂盒组分装量用法ASFV01 -qf50缓冲液Bl5ml/瓶直接使用ASFV 02 - qf50缓冲液B25ml/瓶直接使用ASFV 03 - qf50PCR反应液900叱管直接使用ASFV 04 - qf50阳性对照1ml /管直接使用ASFV 05 - qf50阴性对照1ml /管直接使用【作用与用途】用于全血、血清、血浆、淋巴结、脾脏、肾脏、扁桃体和肌肉等样品中的非洲猪瘟病毒核酸的检测。

【用法与判定】1用法1.1样品处理1.1.1全血、血清、血浆直接进行下一步试验。

淋巴结、脾脏、肾脏、扁桃体、肌肉等组织样品取0.1〜0.2g,置研钵充分研磨,加入10倍体积约1〜2ml生理盐水,混匀;或置研磨管中,加入10倍体积约1〜2ml生理盐水及研磨珠,用组织研磨仪匀浆。

以5000转/分钟离心5分钟,留上清,即为组织匀浆液。

1.1.2取1.5ml离心管加入100川缓冲液B1,每管分别加入10可全血(EDTA抗凝剂)或20m组织匀浆液、血清、血浆样品、阳性对照和阴性对照混匀。

室温3分钟内涡旋混匀3〜5次。

1.1.3每管加入100W缓冲液B2,涡旋混匀,12000转/分钟离心1分钟,上清为待检核酸。

1.2扩增试剂准备取18WPCR反应液至PCR反应管;依次分别加入2囚阴性对照、样品和阳性对照待检核酸,盖紧管盖,每个反应管内反应体积为20N。

1.3将PCR反应管瞬时离心,置荧光PCR仪内,进行如下反应:1) 95℃预变性20秒;2)95c变性10秒,58c延伸20秒,共40个循环;设置58c收集FAM 荧光信号。

慢病毒包装步骤及注意事项

慢病毒包装步骤及注意事项

慢病毒包装步骤及注意事项现今常用的制备慢病毒载体的方法为使用3或者4质粒系统转染293T细胞。

此外,也有使用其它几类慢病毒包装细胞系制备慢病毒载体。

瞬时转染制备慢病毒:细胞:慢病毒包装常用人胚肾细胞(HEK, human embryonic kidney)293T,其含有SV40病毒的大T抗原蛋白编码基因,转染效率极高。

但其贴壁性不好,所以需要使用多聚赖氨酸包被的培养皿增加其吸附性。

多聚赖氨酸培养皿可购买,也可自行制备。

转染前,细胞密度控制在40-70%比较好。

DNA:每10 cm培养皿约含5x106 293T细胞,需用30-40 ug 不含内毒素的质粒进行转染。

质粒的纯度对慢病毒载体的包装效率非常关键。

不同的包膜蛋白表达载体,其使用量也不同。

转染:最经济的转染方法是磷酸钙转染法,虽然其溶液配置影响因素多,不易稳定重复得到最佳的转染结果。

其它方法有脂质体法和PEI法。

转染48-60后可以收集上清,通过低速离心,然后滤膜过滤可以去除上清中的细胞碎片。

如果使用VSV-G包膜蛋白的话,可以通过两次超速离心进行浓缩,从而最高可以获得滴度高达1011-1012IU/ml的慢病毒载体。

之后可以将病毒载体溶解在PBS,HBSS或者DMEM中,并置于-800C储存。

储存溶液添加血清会帮助提高病毒冻融时的存活率,然而有些病毒在侵染细胞时,血清会有干扰,所以需要依据具体病毒种类考虑是否添加血清。

病毒滴度:含VSV-G的慢病毒载体,其滴度在浓缩前一般为107IU/ml,浓缩之后可以达到109-107IU/ml 。

含有荧光标记或者其它报告基因的病毒载体,可以通过梯度稀释侵染HeLa或者293,NIH3T3细胞来确定其滴度;不含报告基因的可通过测定病毒颗粒中相关病毒蛋白的活性或者含量来确定其滴度,比如使用p24gag的elisa 试剂盒。

一般来说,每4-60 x 103个病毒载体含1ng p24gag。

然而这种方法测出来的滴度并不准确,不同的病毒载体类型,不同的储存方式,都会导致p24gag和病毒载体颗粒的比值变化较大。

金拓思慢病毒产品说明书

金拓思慢病毒产品说明书

金拓思慢病毒产品说明书一、产品简介慢病毒载体是一类重组逆转录病毒载体,由于其结构和功能的特点,慢病毒载体作为一种重要的基因转移工具应用于基因治疗和细胞分子生物学研究领域。

区别于一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。

该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。

在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型细胞,达到良好的基因治疗效果。

我公司生产的重组慢病毒均以国际通用的第三代载体四质粒体系生产,通过重组改造后将含有目的基因的慢病毒骨架及其相应的作用元件组合为新质粒,并通过辅助质粒将病毒包装的元件组成重组病毒。

通过自我灭活的方式,阻止病毒自我复制。

保证了慢病毒使用过程中的良好生物安全性。

二、重要说明2.1安全操作说明1.应在Ⅱ级及以上级别生物安全柜中使用慢病毒产品。

2.虽经过改造后病毒安全性极大提高,操作中仍需佩戴口罩、手套等安全防护措施以免产生潜在危害。

3.操作中所有接触慢病毒试剂的样品、耗材、器皿等均需通过84消毒液(1:20)浸泡后,高温121℃灭活15min以上。

4.实验过程中有病毒液洒落的情况时,应用纸巾将病毒液吸干后喷洒70乙醇,并将擦干的纸巾一并高温处理以免造成其它伤害、污染环境。

2.2使用注意事项所有慢病毒产品均通过干冰低温运输,请收到产品后立即转入-80℃冰箱保存。

每次使用时提前取出病毒液放置在4℃冰箱待融化,并保存于4℃冰箱。

每次融化后请尽快使用,病毒液应尽量避免反复冻融降低病毒滴度。

三、慢病毒制备与使用3.1实验材料细胞:人贴壁细胞293T培养基:高糖DMEM培养基血清:胎牛血清抗生素:青链霉素转染试剂:Transfection-mate增强剂:Polybrene3.2病毒制备方法3.2.1细胞准备细胞复苏:1.将液氮保存细胞取出后,迅速放入37℃水浴锅内,应及时轻柔摇动加快解冻速度。

2.将完全溶解的细胞离心,1500rpm,3min。

逆转录病毒载体介导DNA转染

逆转录病毒载体介导DNA转染

逆转录病毒载体介导DNA转染关键词:逆转录病毒载体DNA转染2012-10-09 00:00 来源:丁香园点击次数:164逆转录病毒载体属RNA病毒,但可在受染细胞内反转录产生DNA互补链,此DNA单链可作为模板合成第二条DNA链,第二条DNA链可掺入细胞基因组DNA中。

此病毒可利用宿主细胞的酶自行转录与复制,RNA可合成蛋白,再包装病毒,RNA从胞内释放,成为感染性病毒,该载体可经不同方式改变。

介导过程可使病毒单拷贝基因组稳定地进入细胞。

首先,逆转录病毒的繁殖必须要有适当的包装细胞系,以利于产生高滴度的病毒,同时还具有适当的结构。

如:ψ2(第一代包装细胞),PA317(第二代包装细胞),ψ1-CRIP、PG13、DA、CFA(第三代包装细胞),包装细胞可提供逆转录病毒gag、pol和env蛋白才能使带有包装信号及目的基因的病毒载体RNA进行包装,包装细胞只提供gag、pol和env蛋白而不产生具有复制能力的野生型病毒(RCR),而第一代包装细胞可产生RCR,安全性较差;第二代包装细胞,临床上已广泛应用,也未发现产生RCR,安全性好;第三代包装细胞更加安全,第三代包装细胞中主要区别是病毒结构基因中env不同。

反转录病毒作为基因转移的载体有如下特点:①反转录病毒感染细胞的效率高,基因转移率在10%-100%;②病毒基因转移能将外源基因整合到宿主细胞基因组中外源基因能稳定存在而不丢失;③外源基因整合的拷贝数一般只有一个;④反转录病毒只选择感染分裂细胞;⑤病毒可容纳外源基因的DNA长度为<8Kb。

反转录病毒载体的结构:已切除了病毒的结构基因gag,大部分pol和env,包括两侧的LTR,被选择(标记)基因和目的基因插入的多聚位点所取代,同时还带有包装信号ψ。

(一)可产生特异性逆转录病毒细胞系的建立1、逆转录病毒载体进入包装细胞系从细胞质粒中产生感染性病毒包括将质粒导入包装细胞系,可从稳定感染细胞中选择病毒产生细胞或用一个包装细胞系暂时产生的病毒感染另一种有不同包装的细胞系,从中选择病毒的产生细胞。

逆病毒感染

逆病毒感染

逆转录病毒载体简介逆转录病毒载体介导DNA转染技术逆转录病毒载体属RNA病毒,但可在受染细胞内逆转录产生DNA互补链,此DNA单链可作为模板合成第二条DNA链,第二条DNA链可掺入细胞基因组DNA中。

此病毒可利用宿主细胞的酶自行转录与复制,RNA可合成蛋白,再包装病毒,RNA 从胞内释放,成为感染性病毒,该载体可经不同方式改变。

介导过程可使病毒单拷贝基因组稳定地进入细胞。

首先,逆转录病毒的繁殖必须要有适当的包装细胞系,以利于产生高滴度的病毒,同时还具有适当的结构。

如:ψ2(第一代包装细胞),PA317(第二代包装细胞),ψ1-CRIP、PG13、DA、CFA(第三代包装细胞),包装细胞可提供逆转录病毒gag、pol和env蛋白才能使带有包装信号及目的基因的病毒载体RNA进行包装,包装细胞只提供gag、pol和env蛋白而不产生具有复制能力的野生型病毒(RCR),而第一代包装细胞可产生RCR,安全性较差;第二代包装细胞,临床上已广泛应用,也未发现产生RCR,安全性好;第三代包装细胞更加安全,第三代包装细胞中主要区别是病毒结构基因中env不同。

逆转录病毒作为基因转移的载体有如下特点:(1) 逆转录病毒感染细胞的效率高,基因转移率在10%-100%;(2) 病毒基因转移能将外源基因整合到宿主细胞基因组中外源基因能稳定存在而不丢失;(3) 外源基因整合的拷贝数一般只有一个;(4) 逆转录病毒只选择感染分裂细胞;(5) 病毒可容纳外源基因的DNA长度为<8Kb。

逆转录病毒载体的结构:已切除了病毒的结构基因gag,大部分pol和env,包括两侧的LTR,被选择(标记)基因和目的基因插入的多聚位点所取代,同时还带有包装信号ψ。

可产生特异性逆转录病毒细胞系的建立逆转录病毒载体介导DNA转染技术(一) 逆转录病毒载体进入包装细胞系从细胞质粒中产生感染性病毒包括将质粒导入包装细胞系,可从稳定感染细胞中选择病毒产生细胞或用一个包装细胞系暂时产生的病毒感染另一种有不同包装的细胞系,从中选择病毒的产生细胞。

慢病毒载体构建步骤

慢病毒载体构建步骤

一、简介慢病毒(Lentivirus)载体是以HIV-1(人类免疫缺陷I 型病毒)为基础发展起来的基因治疗载体。

区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。

慢病毒载体的研究发展得很快,研究的也非常深入。

该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。

目前慢病毒也被广泛地应用于表达RNAi 的研究中。

由于有些类型细胞脂质体转染效果差,转移到细胞内的siRNA 半衰期短,体外合成siRNA 对基因表达的抑制作用通常是短暂的,因而使其应用受到较大的限制。

采用事先在体外构建能够表达siRNA 的载体, 然后转移到细胞内转录siRNA 的策略,不但使脂质体有效转染的细胞种类增加,而且对基因表达抑制效果也不逊色于体外合成siRNA,在长期稳定表达载体的细胞中,甚至可以发挥长期阻断基因表达的作用。

慢病毒载体能够产生表达shRNA 的高滴度的慢病毒,在周期性和非周期性细胞、干细胞、受精卵以及分化的后代细胞中表达shRNA,实现在多种类型的细胞和转基因小鼠中特异而稳定的基因表达的功能性沉默,为在原代的人和动物细胞组织中快速而高效地研究基因功能,以及产生特定基因表达降低的动物提供了可能性。

慢病毒作为siRNA 的携带者,不但具备特异性地使基因表达沉默的能力,而且充分发挥了慢病毒载体自身所具备的优势,为基因功能的研究提供了更强有力的工具。

在所构建的siRNA 表达载体中,是由RNA 聚合酶Ⅲ启动子来指导RNA 合成的,这是因为RNA聚合酶Ⅲ有明确的起始和终止序列,而且合成的RNA不会带poly A 尾。

当RNA 聚合酶Ⅲ遇到连续4 个或5 个T 时,它指导的转录就会停止,在转录产物3’端形成1~4 个U。

U6 和H1 RNA 启动子是两种RNA 聚合酶Ⅲ依赖的启动子,其特点是启动子自身元素均位于转录区的上游,适合于表达~21ntRNA 和~50ntRNA 茎环结构(stem loop)。

逆转录病毒载体

逆转录病毒载体


将收集的病毒颗粒感染靶细胞就可以将目的基 因整合到靶细胞染色体上, 基因活性得到表 达。而目的基因可以通过细胞分裂传给下一代 子细胞。永久稳定地表达目的蛋白。
应用

用于基因治疗 外源基因表达
基因治疗
逆转录病毒载体无疑是在基因治疗中传递目的 基因最有效的运载工具, 广泛应用于人类基 因治疗的研究中。应用逆转录病毒载体, 携 带所要表达的目的基因, 可以用于基因相关 疾病的检测及治疗。


RN A 干扰 简单地说, RNA干扰是指一种分子生物学上 由双链 RNA 诱发的基因沉默现象。 逆转录病毒载体介导的 R N A i 技术可以长期 稳定表达siRNA ,从而实现基因的稳定沉默。
问题

对环境条件要求高 在不适条件下,重组逆转 录病毒会失去其感染能力,因此 ,保持逆转 录病毒的存在最适条件是非常关键的。
应用机理

这种病毒表达载体是将 g a g 、 p o l 、 e n v 等三个基因的大部分或全部除去, 由于没有 g a g 、 p o l 、 e n v三个基因的存在而不能够 产生有感染性的病毒颗粒, 因此, 人们又设 计出了一种特殊的包装细胞株。

这种包装细胞株能够表达 逆转录病毒的全部 蛋白,逆转录病毒载体在整合入宿主基因组后, 可以与包装细胞形成的病毒缺失蛋白重组成具 有感染能力的病毒颗粒。

另外,国外已有学者将逆转录病毒载体应用于 生殖细胞研究,其意义更加深远,也为逆转录 病毒载体的研究打开了新思路,让机体从最初 就形成某些疾病的抗体。

插入诱变 逆转录病毒载体经过包装后产生的 病毒插入到基因组中可引起基因突变。

癌基因激活 由于逆转录病毒载体的插入, 使 原来存在于宿主染色体上的癌基因被激活 , 而引起癌症.

乙型流感病毒IBV核酸检测试剂盒说明书

乙型流感病毒IBV核酸检测试剂盒说明书

乙型流感病毒(IBV)核酸检测试剂盒说明书技术原理:DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。

双链DNA在多种酶的作用下可以变性解链成单链,在DNA聚合酶与启动子的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子挎贝。

在聚合酶链式反应实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。

因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,并设计引物做启动子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。

(DNA高温变性低温复性)发现耐热DNA聚合同酶--Taq酶对于PCR的应用有里程碑的意义,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活,不需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临床。

特点优势:1.特异性:所有产品使用的引物均经过详尽的生物信息学分析,经过GenBank及自建庞大数据库的比对,确保所用的每一条引物均为种属或血清型特异的基因序列区段,可实现对细菌种属及血清型的特异检测,特异性均达到100%。

2. 重现性:该系列所有产品均经过大量实验菌株的验证,重现性为100%。

3. 灵敏性:该系列产品可实现对检测菌的高灵敏检测,当样品中细菌的浓度达到103cfu/ml时,可实现对其的直接检测,无需繁琐的增菌过程。

4. 实用性:检测范围广,涵盖了对人体危害较为严重的17种呼吸道及肠道致病菌,可实现对临床样品及其他环境取样的快速检测,整个检测过程为3-4个小时。

5. 优势1:序列资源丰富,除GenBank公布的序列外,公司还进行了大量菌株的序列破译,从理论上保证所选引物具有良好的保守性和特异性。

6. 优势2:该系列试剂盒均经过大量的保守性及特异性实验验证,凭借公司拥有的丰富的菌种资源,每一种检测试剂盒均经过了20余种标准菌株和临床菌株的保守性验证及40余种近缘标准菌株和临床菌株的特异性验证,确保在使用过程中不会出现任何的假阳性及假阴性报告结果。

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pFB-ERVpFB-ERV 逆病毒载体基本信息:载体名称:pFB-ERV 质粒类型: 逆病毒载体;双顺反子载体高拷贝/低拷贝: 低拷贝克隆方法: 限制性内切酶,多克隆位点启动子:CMV 载体大小:11067 bp 5'测序引物及序列:-- 3' 测序引物及序列:-- 载体标签:-- 载体抗性: 卡那霉素筛选标记: Neomycin1.html' target='_blank'>新霉素(Neomycin ) 克隆菌株: DH5α 等宿主细胞(系): 常规细胞系(293、CV-1、CHO 等)备注:-- 稳定性: 稳表达组成型/诱导型: 组成型病毒/非病毒: 逆转录病毒pFB-ERV 载体质粒图谱和多克隆位点信息:pFB-ERV载体简介:pFB-ERV载体描述DNA vector-based systems that allow precise control of gene expression in vivo have become invaluable for the study of gene function in a variety of organisms, particularly when applied to the study of developmental and other biological processes for which the timing or dosage of gene expression is critical to gene function. Such systems have also been successfully used to overexpress toxic or disease-causing genes, to induce gene targeting, and to express antisense RNA. Inducible systems are currently being used by pharmaceutical companies to facilitate screening for inhibitors of clinically relevant biological pathways, and potential applications for gene therapy are being explored.The Agilent Complete Control ecdysone-inducible plasmid vectors are based on the insect molting hormone ecdysone, which can stimulate transcriptional activation in mammalian cells harboring the ecdysone receptor protein from Drosophila melanogaster.2 The system has a numberof advantages over alternative systems. Firstly, the lipophilic nature and short in vivo half-life of the ecdysone analog ponasterone A (ponA) allows efficient penetrance into all tissues including brain, resulting in rapid and potent inductions and rapid clearance.Secondly, ecdysteroids are not known, nor are they expected, to affect mammalian physiology in any measurable way. Thirdly, the heterodimeric ponA responsive receptor and receptor DNA recognition element have been genetically altered such that trans-activation of endogenous genes by the ecdysone receptor, or of theponA-responsive expression cassette by endogenous transcription factors, is extremely unlikely. In addition, it has been found that in the absence of inducer the heterodimer remains bound at the promoter in a complex with corepressors and histone deacetylase, and is thus tightly repressed until ligand binding, at which time high-level transcriptional activation occurs (i.e., the heterodimer is converted from a tight repressor to a transactivator). In transient assays and stable cell lines harboring receptor expression plasmids in combination with a plasmid bearing an inducible luciferase expression cassette, induction ratios of 1,000-fold have been achieved.3A limitation to the use of plasmid-based vectors for controlled gene expression is the fact that many cell types of academic, industrial or clinical interest are difficult or virtually impossible to transfect using current transfection methods. In particular, primary human cell lines, lymphocytes, neurons and other nondividing cells are best transduced using viral delivery systems. The most popular and user-friendly of these are the retroviral vectors. Infection with retroviruses often yields transduction efficiencies close to 100%, and the proviral copy number can be easily controlled by varying the multiplicity of infection (MOI). This latter feature is particularly important for inducible systems, for which low basal expression and high induction ratios are affected by copy number. Thus infection of the target cell with virus at an optimal MOI should yield a high frequency of clones capable of mediating desirable expression profiles without exhaustive colony screening.With the vectors pFB-ERV and pCFB-EGSH, we have adapted the ecdysone inducible components of the Complete Control System for retroviral delivery. Used together, we have attained induction ratios of >1,000-fold with these vectors in tissue culture cells.OVERVIEW OF ECDYSONE-REGULATABLE GENE EXPRESSIONThe ecdysone receptor (EcR) is a member of the retinoid-X-receptor (RXR) family of nuclear receptors and is composed of three domains: an N-terminal activation domain (AD), a central DNA-binding domain (DBD), and a C-terminal ligand-binding and dimerization domain (LBD). In insect cells, EcR and the nuclear receptor ultraspiracle (USP) form a promoterbound heterodimer, which regulates transcription (see Figure 1). In the absence of ecdysone, the receptor heterodimer binds to corepressors and tightly represses transcription.4When ecdysone binds to the EcR LBD, the corepressors are released, coactivators are recruited to the complex, and transcriptional activation is enabled.In mammalian cells harboring the EcR gene, EcR heterodimerizes with RXR, the mammalian homologue of USP. The EcR–RXR heterodimer binds to multiple copies of the ecdysone-responsive element (EcRE), and in the absence of ponA, repressestranscription of an expression cassette. When ponA binds to the receptor, the receptor complex activates transcription of a reporter gene or a gene of interest. To avoid pleiotropic interactions with endogenous pathways in mammalian host cells, both the EcRE recognition sequence and the EcR protein were modified.The EcRE sequence was modified to create a synthetic recognition site that does not bind any endogenous transcription factors. The wild-type EcRE sequence consists of two inverted repeat sequences separated by a single nucleotide: AGTGCA N TGCACT. The EcRE sequence was changed to AGTGCA N1 TGTTCT (and renamed E/GRE). Recognition of the synthetic E/GRE recognition sequence by either a steroid receptor or a wild-type RXR heterodimer receptor is extremely unlikely, as these receptors recognized only the wild-type perfect inverted repeat. The E/GRE recognition sequence has imperfect inverted half sites separated by one nucleotide. A wild-type RXR heterodimer requires single nucleotide separation of the inverted repeats, and the majority bind to direct repeats rather than inverted repeats (EcRE is an exception).The EcR protein was modified to create a synthetic ecdysone-binding receptor that does not transactivate any host genes. Three amino acids in the EcR DBD were mutated to change its DNA-binding specificity to that of the glucocorticoid receptor (GR), which recognizes the half-site AGAACA.2 Like all steroid receptors and unlike RXR receptors, the GR protein homodimerizes and recognizes two inverted repeat sequences separated by three nucleotides. The GR–EcR fusion protein (GEcR) retains the ability to dimerize with RXR and activate, with ponA-dependence, reporter genes that contain the synthetic E/GRE recognition sequence.The GEcR receptor was further modified by replacing the EcR AD with the more potent VP16 AD. The result of all the modifications is the synthetic ecdysone-binding receptor VgEcR. VgEcR is a fusion of the ligand-binding and dimerization domain of the D. melanogaster ecdysone receptor, the DNA-binding domain of the glucocorticoid receptor, and the transcription activation domain of herpes simplex virus (HSV) VP16OVERVIEW OF REPLICATION-DEFECTIVE RETROVIRAL GENE TRANSFER SYSTEMSNon-replicating retroviral vectors contain all of the cis elements required for transcription of mRNA molecules encoding a gene of interest, and packaging of these transcripts into infectious virus particles (Figure 2). The vectors are typically comprised of an E. coli plasmid backbone containing a pair of 600 base pair viral long terminal repeats (LTRs) between which the gene of interest is inserted. The LTR is divided into 3 regions. The U3 region contains the retroviral promoter/enhancer. The U3 region is flanked in the 3′ direction by the R region, which contains the viral polyadenylation signal (pA), followed by the U5 region which, along with R, contains sequences that are critical for reverse transcription. Expression of the viral RNA is initiated within the U3 region of the 5′ LTR and is terminated in the R region of the 3′ LTR. Between the 5′ LTR and the coding sequence for the gene of interest resides an extended version of the viral packaging signal (ψ+), which is required in cis for the viral RNA to be packagedinto virion particles.In order to generate infectious virus particles that carry the gene of interest, specialized packaging cell lines have been generated that contain chromosomally integrated expression cassettes for viral Gag, Pol and Env proteins, all of which are required in trans to make virus. The gag gene encodes internal structural proteins, pol encodes reverse transcriptase (RT) and integrase, and the env gene encodes the viral envelope protein, which resides on the viral surface and facilitates infection of the target cell by direct interaction with cell type-specific receptors; thus the host range of the virus is dictated not by the DNA vector but by the choice of the env gene used to construct the packaging cell. The packaging cell line is transfected with the vector DNA, and at this point either stable viral producer cell lines may be selected (providing the vector has an appropriate selectable marker), or mRNAs that are transiently transcribed from the vector are encapsidated and bud off into the cell supernatant. These supernatants are collected, and used to infect target cells. Upon infection of the target cell, the viral RNA molecule is reverse transcribed by RT (which is present in the virion particle), and the cDNA of the gene of interest, flanked by the LTRs, is integrated into the host DNA. Because the vector itself carries none of the viral proteins, once a target cell is infected the LTR expression cassette is incapable of proceeding through another round of virus production. Recent advances in transfection technology have allowed the production of high titer viral supernatants following transient cotransfection of the viral vector together with expression vectors encoding the gag, pol and env genes (Figure 2),5, 6 obviating the need for the production and maintenance of stable packaging cell lines. For example, Agilent pVPack gag-pol and env-expressing packaging vectors consistently give rise to titers of >107 infectious units (IU)/ml when cotransfected with the pFB-hrGFP control vector (Agilent Catalog #240027), using a 293-derived cell line for virus production.Description of the VectorsThe pFB-ERV vector was derived from the high-titer MoMLV vector pFBNeo5 for efficient delivery of the ecdysone receptor proteins VgEcR and RXR (Figure 3). In the vector pFB-ERV the ecdysone receptor and the neomycin-resistance open reading frame (ORF) are expressed from a tricistronic message with the neomycin resistance ORF expressed at the end of the message. Thus, maintenance of infected cell lines in G418 ensures expression of the transcript encoding the receptor genes. The tricistronic transcript is expressed from the CMV promoter, which is flanked by unique EcoR I and Fse I sites so that a cell type-specific promoter of interest may be substituted. The viral promoter within the 3′ LTR has been deleted to make this aself-inactivating (SIN) vector. Upon infection and chromosomal integration into the target cell genome, the SIN deletion is transferred to the 5′ LTR, resulting in an integrated expression cassette in which only the CMV promoter is active. Cells containing an estimated single integrated viral expression cassette can be selected in as high as 1 mg/ml G418, although 600 μg/ml is routinely used.The vector pCFB-EGSH contains an ecdysone-inducible expression cassette inserted between the viral LTRs in the antisense orientation relative to that for the viral promoter (see Figure 4). The U3 promoter within the 5′ LTR of the vector has been replaced with the CMV promoter to increase production of viral RNA in packaging cells, thereby increasing the titer of the viral supernatants. Potential interference from the proviral 5′ LTR is obviated due to the SIN deletion. The inducible expression cassette contains a multiple cloning site that contains three contiguous copies of the HA epitope(3× HA) positioned for fusion at the C-terminus of the protein of interest. A second expression cassette in which the hygromycin-resistance gene is expressed from the TK promoter is located downstream (relative to transcription from the LTRs) of the inducible cassette. A pBR322 origin and ampicillin-resistance gene allow pCFB-EGSH to be propagated in prokaryotes.The pCFB-EGSH-Luc vector contains the luciferase reporter gene and is intended for use as a positive control vector to test the expression of the VgEcR and RXR receptors in pFB-ERV-containing cell lines. The pCFB-EGSH-Luc vector is derived from the pCFB-EGSH vector and has the luciferase gene inserted in the MCS. ThepCFB-EGSH-Luc vector does not contain the HA epitope sequence.pFB-ERV载体限制性酶切位点pFB-ERV, 11067 bp version 011006Enzymes with 1-10 cleavage sites:#sites -- Bp position of recognition site --AarI 3 5297, 6078, 7229AatII 7 978, 2200, 2253, 2336, 25223692, 10993Acc65I 8 647, 1847, 2966, 3609, 47925409, 7341, 8593AccI 6 1968, 2058, 3212, 3762, 62348953AccIII 1 8514AclI 3 4990, 10300, 10673AflII 3 202, 1265, 8466AflIII 9 164, 2820, 3249, 5283, 54587215, 7390, 8545, 9182AgeI 2 1841, 6125AhdI 6 687, 733, 1274, 8633, 867910070AleI 2 5607, 6402Alw44I 6 1054, 5445, 7377, 8998, 949610742AlwNI 3 323, 398, 9593ApaI 5 1238, 5081, 5754, 5787, 7013ApoI 4 87, 1128, 2064, 2986AscI 2 3231, 8537AseI 2 2085, 10246AvaI 10 577, 610, 643, 1241, 20194259, 4340, 5700, 8556, 8589 BamHI 4 3167, 6272, 6425, 6539BbeI 7 615, 1656, 4376, 6598, 69397704, 8561BbsI 10 2714, 3947, 4148, 5101, 52015567, 7033, 7133, 7499, 11060 BbvCI 6 453, 4448, 4454, 4526, 45386744BciVI 7 656, 1987, 3038, 7913, 86029391, 10918BclI 1 8508BfrBI 1 8519BglI 10 2163, 2285, 2356, 3926, 41224859, 5264, 5906, 7196, 10189 BglII 2 1678, 4266BlnI 3 5119, 7051, 7542BlpI 4 4349, 5850, 6283, 6817BmgBI 4 2774, 5508, 6562, 7440BmrI 6 2373, 5318, 7250, 7644, 892810120BmtI 6 6, 16, 26, 197, 47728461BpmI 7 1799, 4049, 4592, 6277, 69348414, 10160Bpu10I 10 337, 412, 453, 1548, 44484454, 4526, 4538, 5730, 6744 BpuEI 8 5370, 5920, 7302, 8096, 92889550, 9827, 10695BsaAI 8 2001, 2417, 5282, 6316, 72148007, 8524, 8934BsaBI 1 2807BsaI 10 694, 715, 782, 1414, 18026310, 8640, 8661, 8728, 10142 BsgI 3 5668, 6184, 6559BsiWI 1 4187BsmBI 8 976, 1093, 1337, 1396, 15824337, 4630, 8831BsmI 7 3317, 4894, 5114, 5147, 57127046, 7079BspHI 3 9902, 10910, 11015BspMI 7 3085, 3951, 5298, 6079, 72307601, 7964BsrDI 6 3420, 5072, 7004, 7931, 1012910311BsrGI 3 1541, 3252, 6017BssHII 6 563, 3232, 3551, 6681, 81028538BssSI 4 8297, 9355, 10739, 11046Bst1107I 1 8953BstAPI 4 322, 397, 4392, 9000BstEII 2 1346, 4961Bsu36I 3 1276, 5939, 5996BtsI 4 4015, 4124, 10468, 10496ClaI 2 5534, 7466DraI 3 9939, 9958, 10650DraIII 3 1874, 5326, 7258DrdI 4 6454, 7726, 8871, 9284EagI 7 961, 2679, 3311, 4040, 67286962, 7611EcoICRI 3 580, 3403, 5733EcoNI 2 1647, 4048EcoRI 1 2064EcoRV 2 308, 383FseI 1 2676FspI 3 6059, 7805, 10295HincII 5 2058, 3663, 4551, 6234, 10614 HindIII 3 2957, 5192, 7124KasI 7 615, 1656, 4376, 6598, 69397704, 8561KpnI 8 647, 1847, 2966, 3609, 47925409, 7341, 8593MluI 1 8545MmeI 10 684, 1383, 3823, 4811, 49365336, 7268, 8630, 9372, 9556 MscI 7 827, 1368, 1668, 3537, 61586548, 7785MunI 2 11, 21NaeI 5 2677, 4388, 4735, 6837, 8205 NarI 7 615, 1656, 4376, 6598, 69397704, 8561NcoI 7 2439, 2688, 5651, 5783, 61617560, 8137NdeI 4 1664, 1672, 2312, 9004 NgoMIV 5 2677, 4388, 4735, 6837, 8205NheI 6 6, 16, 26, 197, 47728461NotI 1 6961NruI 2 3004, 3885NsiI 1 8519PciI 6 164, 2820, 3249, 5458, 73909182PfoI 6 771, 2848, 3327, 6275, 87178826PmlI 3 2001, 5282, 7214PpuMI 8 499, 1477, 1925, 3082, 47235924, 6065, 8530PshAI 2 1015, 2731PspOMI 5 1238, 5081, 5754, 5787, 7013 PstI 4 1178, 1360, 7754, 10316PvuI 4 1034, 5532, 7464, 10442PvuII 6 286, 361, 4541, 5707, 60217809RsrII 2 4035, 8220SacI 3 580, 3403, 5733SacII 3 151, 4431, 4677SalI 2 2058, 6234SanDI 1 8530SapI 5 3070, 3202, 8054, 8264, 9059 ScaI 2 6134, 10553SexAI 3 1474, 4663, 6458SfcI 10 182, 1178, 1360, 5216, 71487754, 8446, 9447, 9638, 10316 SfoI 7 615, 1656, 4376, 6598, 69397704, 8561SmaI 5 643, 1241, 2019, 5700, 8589 SnaBI 2 2417, 8524SpeI 1 897SphI 3 2788, 3502, 8106SrfI 1 1240SspI 3 3532, 3877, 10877StuI 2 3813, 6773TatI 10 1541, 2296, 2376, 2409, 24603252, 6017, 6134, 8988, 10553 TfiI 8 2837, 3469, 3911, 4493, 46038190, 8324, 9157Tsp45I 9 1282, 1491, 6364, 7826, 81328837, 8932, 10332, 10543Tth111I 8 633, 1473, 3992, 6358, 64577820, 8579, 8926Van91I 2 5415, 7347XbaI 3 464, 2037, 2972XcmI 2 5741, 5813XhoI 2 4259, 4340XmaI 5 643, 1241, 2019, 5700, 8589 XmnI 3 5176, 7108, 10670ZraI 7 978, 2200, 2253, 2336, 25223692, 10993Enzymes that do NOT cut molecule:AsiSI BstBI BstXI Eco47III FspAIHpaI PacI PmeI PsiI SbfISfiI SgrAI SwaIpFB-ERV载体序列:pFB-ERV, 11067 bp version 011006 NOTE: The following sequence has been verified for accuracyat the junctions. The remainder of the sequence has beenobtained from existing data.1 GAATTGCTAG CAATTGCTAG CAATTGCTAG CAATTCATAC CAGATCACCG51 AAAACTGTCC TCCAAATGTG TCCCCCTCAC ACTCCCAAAT TCGCGGGCTT101 CTGCCTCTTA GACCACTCTA CCCTATTCCC CACACTCACC GGAGCCAAAG151 CCGCGGGACA TATACATGTG AAAGACCCCA CCTGTAGGTT TGGCAAGCTA201 GCTTAAGTAA CGCCATTTTG CAAGGCATGG AAAAATACAT AACTGAGAAT251 AGAAAAGTTC AGATCAAGGT CAGGAACAGA TGGAACAGCT GAATATGGGC301 CAAAGCGGAT ATCTGTGGTA AGCAGTTCCT GCCCCGGCTC AGGGCCAAGA351 ACAGATGGAA CAGCTGAATA TGGGCCAAAC AGGATATCTG TGGTAAGCAG401 TTCCTGCCCC GGCTCAGGGC CAAGAACAGA TGGTCCCCAG ATGCGGTCCA451 GCCCTCAGCA GTTTCTAGAG AACCATCAGA TGTTTCCAGG GTGCCCCAAG501 GACCTGAAAT GACCCTGTGC CTTATTTGAA CTAACCAATC AGTTCGCTTC551 TCGCTTCTGT TCGCGCGCTT CTGCTCCCCG AGCTCAATAA AAGAGCCCAC601 AACCCCTCAC TCGGGGCGCC AGTCCTCCGA TTGACTGAGT CGCCCGGGTA651 CCCGTGTATC CAATAAACCC TCTTGCAGTT GCATCCGACT TGTGGTCTCG701 CTGTTCCTTG GGAGGGTCTC CTCTGAGTGA TTGACTACCC GTCAGCGGGG751 GTCTTTCATT TGGGGGCTCG TCCGGGATCG GGAGACCCCT GCCCAGGGAC801 CACCGACCCA CCACCGGGAG GTAAGCTGGC CAGCAACTTA TCTGTGTCTG851 TCCGATTGTC TAGTGTCTAT GACTGATTTT ATGCGCCTGC GTCGGTACTA901 GTTAGCTAAC TAGCTCTGTA TCTGGCGGAC CCGTGGTGGA ACTGACGAGT951 TCGGAACACC CGGCCGCAAC CCTGGGAGAC GTCCCAGGGA CTTCGGGGGC 1001 CGTTTTTGTG GCCCGACCTG AGTCCAAAAA TCCCGATCGT TTTGGACTCT1051 TTGGTGCACC CCCCTTAGAG GAGGGATATG TGGTTCTGGT AGGAGACGAG1101 AACCTAAAAC AGTTCCCGCC TCCGTCTGAA TTTTTGCTTT CGGTTTGGGA1151 CCGAAGCCGC GCCGCGCGTC TTGTCTGCTG CAGCATCGTT CTGTGTTGTC 1201 TCTGTCTGAC TGTGTTTCTG TATTTGTCTG AAAATATGGG CCCGGGCCAG 1251 ACTGTTACCA CTCCCTTAAG TTTGACCTTA GGTCACTGGA AAGATGTCGA 1301 GCAGATCGCT CACAACCAGT CGGTAGATGT CAAGAAGAGA CGTTGGGTTA 1351 CCTTCTGCTC TGCAGAATGG CCAACCTTTA ACGTCGGATG GCCGCGAGAC 1401 GGCACCTTTA ACCGAGACCT CATCACCCAG GTTAAGATCA AGGTCTTTTC 1451 ACCTGGCCCG CATGGACACC CAGACCAGGT CCCCTACATC GTGACCTGGG 1501 AAGCCTTGGC TTTTGACCCC CCTCCCTGGG TCAAGCCCTT TGTACACCCT 1551 AAGCCTCCGC CTCCTCTTCC TCCATCCGCC CCGTCTCTCC CCCTTGAACC 1601 TCCTCGTTCG ACCCCGCCTC GATCCTCCCT TTATCCAGCC CTCACTCCTT 1651 CTCTAGGCGC CCCCATATGG CCATATGAGA TCTTATATGG GGCACCCCCG 1701 CCCCTTGTAA ACTTCCCTGA CCCTGACATG ACAAGAGTTA CTAACAGCCC 1751 CTCTCTCCAA GCTCACTTAC AGGCTCTCTA CTTAGTCCAG CACGAAGTCT 1801 GGAGACCTCT GGCGGCAGCC TACCAAGAAC AACTGGACCG ACCGGTGGTA 1851 CCTCACCCTT ACCGAGTCGG CGACACAGTG TGGGTCCGCC GACACCAGAC 1901 TAAGAACCTA GAACCTCGCT GGAAAGGACC TTACACAGTC CTGCTGACCA 1951 CCCCCACCGC CCTCAAAGTA GACGGCATCG CAGCTTGGAT ACACGCCGCC 2001 CACGTGAAGG CTGCCGACCC CGGGGGTGGA CCATCCTCTA GACTGCCGGA 2051 TCGAATTGTC GACGAATTCG CCGTTGCATT AGTTATTAAT AGTAATCAAT 2101 TACGGGGTCA TTAGTTCATA GCCCATATAT GGAGTTCCGC GTTACATAAC 2151 TTACGGTAAA TGGCCCGCCT GGCTGACCGC CCAACGACCC CCGCCCATTG 2201 ACGTCAATAA TGACGTATGT TCCCATAGTA ACGCCAATAG GGACTTTCCA 2251 TTGACGTCAA TGGGTGGAGT ATTTACGGTA AACTGCCCAC TTGGCAGTAC 2301 ATCAAGTGTA TCATATGCCA AGTACGCCCC CTATTGACGT CAATGACGGT 2351 AAATGGCCCG CCTGGCATTA TGCCCAGTAC ATGACCTTAT GGGACTTTCC 2401 TACTTGGCAG TACATCTACG TATTAGTCAT CGCTATTACC ATGGTGATGC 2451 GGTTTTGGCA GTACATCAAT GGGCGTGGAT AGCGGTTTGA CTCACGGGGA 2501 TTTCCAAGTC TCCACCCCAT TGACGTCAAT GGGAGTTTGT TTTGGCACCA 2551 AAATCAACGG GACTTTCCAA AATGTCGTAA CAACTCCGCC CCATTGACGC 2601 AAATGGGCGG TAGGCGTGTA CGGTGGGAGG TCTATATAAG CAGAGCTGGT 2651 TTAGTGAACC GTCAGATCCG CTAGTGGCCG GCCGCCACCA TGGAACAAAA 2701 ACTTATTTCT GAAGAAGACT TGGCCCCCCC GACCGATGTC AGCCTGGGGG 2751 ACGAACTCCA CTTAGACGGC GAGGACGTGG CGATGGCGCA TGCCGACGCG 2801 CTAGACGATT TCGATCTGGA CATGTTGGGG GACGGGGATT CCCCAGGTCC 2851 GGGATTTACC CCCCACGACT CCGCCCCCTA CGGCGCTCTG GATATGGCCG 2901 ACTTCGAGTT TGAGCAGATG TTTACCGATG CCCTTGGAAT TGACGAGTAC 2951 GGTGGGAAGC TTCTAGGTAC CTCTAGAAGA ATATCAAATT CTATATCTTC 3001 AGGTCGCGAT GATCTCTCGC CTTCGAGCAG CTTGAACGGA TACTCGGCGA 3051 ACGAAAGCTG CGATGTGAAG AAGAGCAAGA AGGGACCTGC GCCACGGGTG 3101 CAAGAGGAGC TGTGCCTGGT TTGCGGCGAC AGGGCCTCCG GCTACCACTA 3151 CAACGCCCTC ACCTGTGGAT CCTGCAAGGT GTTCTTTCGA CGCAGCGTTA 3201 CGAAGAGCGC CGTCTACTGC TGCAAGTTCG GGCGCGCCTG CGAAATGGAC 3251 ATGTACATGA GGCGAAAGTG TCAGGAGTGC CGCCTGAAAA AGTGCCTGGC 3301 CGTGGGTATG CGGCCGGAAT GCGTCGTCCC GGAGAACCAA TGTGCGATGA3351 AGCGGCGCGA AGAGAAGGCC CAGAAGGAGA AGGACAAAAT GACCACTTCG 3401 CCGAGCTCTC AGCATGGCGG CAATGGCAGC TTGGCCTCTG GTGGCGGCCA 3451 AGACTTTGTT AAGAAGGAGA TTCTTGACCT TATGACATGC GAGCCGCCCC 3501 AGCATGCCAC TATTCCGCTA CTACCTGATG AAATATTGGC CAAGTGTCAA 3551 GCGCGCAATA TACCTTCCTT AACGTACAAT CAGTTGGCCG TTATATACAA 3601 GTTAATTTGG TACCAGGATG GCTATGAGCA GCCATCTGAA GAGGATCTCA 3651 GGCGTATAAT GAGTCAACCC GATGAGAACG AGAGCCAAAC GGACGTCAGC 3701 TTTCGGCATA TAACCGAGAT AACCATACTC ACGGTCCAGT TGATTGTTGA 3751 GTTTGCTAAA GGTCTACCAG CGTTTACAAA GATACCCCAG GAGGACCAGA 3801 TCACGTTACT AAAGGCCTGC TCGTCGGAGG TGATGATGCT GCGTATGGCA 3851 CGACGCTATG ACCACAGCTC GGACTCAATA TTCTTCGCGA ATAATAGATC 3901 ATATACGCGG GATTCTTACA AAATGGCCGG AATGGCTGAT AACATTGAAG 3951 ACCTGCTGCA TTTCTGCCGC CAAATGTTCT CGATGAAGGT GGACAACGTC 4001 GAATACGCGC TTCTCACTGC CATTGTGATC TTCTCGGACC GGCCGGGCCT 4051 GGAGAAGGCC CAGCTAGTCG AAGCGATCCA GAGCTACTAC ATCGACACGC 4101 TACGCATTTA TATACTCAAC CGCCACTGCG GCGACTCAAT GAGCCTCGTC 4151 TTCTACGCAA AGCTGCTCTC GATCCTCACC GAGCTGCGTA CGCTGGGCAA 4201 CCAGAACGCC GAGATGTGTT TCTCACTAAA GCTCAAAAAC CGCAAACTGC 4251 CCAAGTTCCT CGAGGAGATC TGGGACGTTC ATGCCATCCC GCCATCGGTC 4301 CAGTCGCACC TTCAGATTAC CCAGGAGGAG AACGAGCGTC TCGAGCGGGC 4351 TGAGCGTATG CGGGCATCGG TTGGGGGCGC CATTACCGCC GGCATTGATT 4401 GCGACTCTGC CTCCACTTCG GCGGCGGCAG CCGCGGCCCA GCATCAGCCT 4451 CAGCCTCAGC CCCAGCCCCA ACCCTCCTCC CTGACCCAGA ACGATTCCCA 4501 GCACCAGACA CAGCCGCAGC TACAACCTCA GCTACCACCT CAGCTGCAAG 4551 GTCAACTGCA ACCCCAGCTC CACCCACAGC TTCAGACGCA ACTCCAGCCA 4601 CAGATTCAAC CACAGCCACA GCTCCTTCCC GTCTCCGCTC CCGTGCCCGC 4651 CTCCGTAACC GCACCTGGTT CCTTGTCCGC GGTCAGTACG AGCAGCGAAT 4701 ACATGGGCGG AAGTGCGGCC ATAGGACCCA TCACGCCGGC AACCACCAGC 4751 AGTATCACGG CTGCCGTTAC CGCTAGCTCC ACCACATCAG CGGTACCGAT 4801 GGGCAACGGA GTTGGAGTCG GTGTTGGGGT GGGCGGCAAC GTCAGCATGT 4851 ATGCGAACGC CCAGACGGCG ATGGCCTTGA TGGGTGTAGC CCTGCATTCG 4901 CACCAAGAGC AGCTTATCGG GGGAGTGGCG GTTAAGTCGG AGCACTCGAC 4951 GACTGCATAG 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GACGGAGCTT GTGTCCAAGA TGCGGGACAT 6651 GCAGATGGAC AAGACGGAGC TGGGCTGCCT GCGCGCCATC GTCCTCTTTA 6701 ACCCTGACTC CAAGGGGCTC TCGAACCCGG CCGAGGTGGA GGCGCTGAGG 6751 GAGAAGGTCT ATGCGTCCTT GGAGGCCTAC TGCAAGCACA AGTACCCAGA 6801 GCAGCCGGGA AGGTTCGCTA AGCTCTTGCT CCGCCTGCCG GCTCTGCGCT 6851 CCATCGGGCT CAAATGCCTG GAACATCTCT TCTTCTTCAA GCTCATCGGG 6901 GACACACCCA TTGACACCTT CCTTATGGAG ATGCTGGAGG CGCCGCACCA 6951 AATGACTTAG GCGGCCGCGA TCCGGTTATT TTCCACCATA TTGCCGTCTT 7001 TTGGCAATGT GAGGGCCCGG AAACCTGGCC CTGTCTTCTT GACGAGCATT 7051 CCTAGGGGTC TTTCCCCTCT CGCCAAAGGA ATGCAAGGTC TGTTGAATGT 7101 CGTGAAGGAA GCAGTTCCTC TGGAAGCTTC TTGAAGACAA ACAACGTCTG 7151 TAGCGACCCT TTGCAGGCAG CGGAACCCCC CACCTGGCGA CAGGTGCCTC 7201 TGCGGCCAAA AGCCACGTGT ATAAGATACA CCTGCAAAGG CGGCACAACC 7251 CCAGTGCCAC GTTGTGAGTT GGATAGTTGT GGAAAGAGTC AAATGGCTCT 7301 CCTCAAGCGT ATTCAACAAG GGGCTGAAGG ATGCCCAGAA GGTACCCCAT 7351 TGTATGGGAT CTGATCTGGG GCCTCGGTGC ACATGCTTTA CATGTGTTTA 7401 GTCGAGGTTA AAAAACGTCT AGGCCCCCCG AACCACGGGG ACGTGGTTTT 7451 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