外文摘要信息获取之PubMed
6.数据库检索外文 Pubmed医学专业研究生必看
3、关键词与主题词检索
Pubmed的关键词检 索有何特别? 有了Pubmed的特色 功能还要主题词检索 作什么?
为什么还要强调主 题词检索?
2
3 4
只要用主题词 检索就足够了 吗?
1
(1)为什么还要强调主题词检索?
• 主题词是在关键词的基础上经过规范化处理的,就是在文 献存储时,对文献中的同义词、近义词、多义词等进行严 格的控制与规范,使得同一主题概论的文献相对集中在一 个主题词之下。
• Publisher-Supplied
出版商提供的电子文献题录,每条记录标有:
[PubMed-as supplied by publisher],分为两类: – MEDLINE 收录,逐步转为In Process, Indexed状态。 – Not MEDLINE:PubMed 收录,MEDLINE不收录, 一直标注[PubMed-as supplied by publisher]或 [PubMed]
检索键
只查重点论述的文献
系统自动扩展检索下位词, 勾选后不检索下位词
(4)只要用主题词检索就足够了吗
• 不是每个词都有对应的主题词 • 没有主题标引的文献不可以用主题词检索 ----如何识别主题标引的文献 策略:根据实际需求选择,最好的是使用主 题词与关键词相结合
4、值得推荐的功能与资源
1. 2.
特点
• • • • • • • • 资源免费 收录广泛 更新迅速 数据权威 检索方便 检索结果精准 个性化定制功能丰富 外部分析工具功能强大
是目前使用最广泛、影响力最大的生物医学信息资源检索系统。
• MEDLINE Indexed
1966 to prensent的MEDLINE已标引数据, 有MeSH字段和摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
PubMed(获取全文)
一、通过PubMed的LinkOut链接
二、利用本馆订购的全文数据库
三、利用网上免费的全文数据库
四、百链云图书馆
五、珠江三角洲数字图书馆联盟 全国图书馆参考咨询联盟 六、申请原文传递服务 七、通过E-mail向作者索取
通过PubMed的LinkOut链接
全文链接
全文链接
LinkOut
检索输入框
点击篇名链接
获取途径
本馆资源
PubMed 申请文献传递
Scirus Web of Science
珠江三角洲数字图书馆联盟 珠江三角洲数字图书馆联盟是广东省公共图书 馆、高校图书馆和科研图书馆联合建立的公益性资
源共享服务平台。该服务平台与超星数字图书馆合
作,利用无缝链接技术,将广东省内公共、教育、 科技三大系统的图书馆数字资源进行整合,提供文 献资源共享。
上参考咨询和文献远程传递服务。 /admin/union/index.do
申请原文传递服务
申请原文传递
下载原文传递申请表
Hale Waihona Puke /检索输入框获取途径
全国图书馆参考咨询联盟
全国图书馆参考咨询联盟是在全国文化信息资源
共享工程国家中心指导下,由我国公共、教育、科技
系统图书馆合作建立的公益性服务机构,其宗旨是以
数字图书馆馆藏资源为基础,以因特网的丰富信息资 源和各种信息搜寻技术为依托,为社会提供免费的网
有PMC标志的,直接免费获取 本馆有馆藏的可直接获取全文 有全文链接,但是需要帐号密码的,可向丁香园求助
利用本馆订购的全文数据库
利用网上免费的全文数据库
百链云图书馆
可一站式检索200多个中外文数据库,能够实
现本馆与其他馆互联互通、共建共享。
/
PubMed简介及使用说明
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure:分子构造资料库。
5.Genome:基因组合序列资料库。
6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM:遗传学资料库。
8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
文献检索 第四课 Pubmed
温州医科大学图书馆
林薇
Contents
初识PubMed PubMed基本检索 PubMed高级检索 PubMed主题词检索 PubMed期刊检索 PubMed检索结果处理
初识 PubMed
标引质量高
更新速度快 使用方便
信息量大
选择PubMed的n个理由
/pubmed
Pubmed基本检索
一、Pubmed检索系统
(三)Pubmed基本检索 基本检索
Pubmed基本检索
一、 Pubmed的检索规则
1.
逻辑运算符: AND OR NOT
AND diabetes therapy NOT nifedipine
将检索出同时包含阿司匹林和糖尿病两个检索词的文献。
/美国国立卫生研究院
/美国国立医学图书馆
/国家生物技术信息中心
Entrez资源整合系统
NCBI资源整合系统,基于Web界面的综合生物信 息数据库,可实现跨库检索,包括
GenBank和Nucletide (2) Genoma (3) OMIM (4) Protein (5) Structure (6) Pubmed (7) PMC
(1)
初识Pubmed
一、Pubmed检索系统
(一)Pubmed收藏范围:
(1)
(P46)
Medline:标注为[Pubmed-indexed for Medline] (2) OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline] (3) In Progress Citations:标注为[Pubmed-in Process] (4) Publisher Supplied Citation:标注为[Pubmed-as supplied by Publisher]
PubMed简介与使用
”
2.1-基本检索
✓ “sleep walking” seach result
“
”
检索词智能转换匹配
➢PubMed将输入的检索词依次与各类术语表进行匹配,进行智能转换。
Author Index
作者索引表
4
5 Sleep + Walking
Common Phrase List 3
常用词组表
Sleep Walking
因此,查上述类型的文献需结合自由词 检索
PubMed的数据来源
1949-1965Medline回溯数据, 无MeSH字段,无摘要
MedLine 1966年至今的Medline数据,
有MeSH字段,有摘要
Old-
Medline
PubMed
出版商提供的数据,其中符 合Medline收录标准的内容会 逐步转入Pre-Medline
1 MeSH Translation Table
主题词转换表
2
Journals Translation Table
刊名转换表
检索结果数量太庞大,怎么办?
1
更加准确地描述检索要求:尽量选择与检索 主题密切相关的专业术语,避免使用过于宽
泛的词汇。
2 适当地为检索的关
键词添加限定词。
3 使用检索结果左侧的过
学科范围:生命科学,医药卫生 检索入口:/pubmed
1
1.2-如何进入PubMed
1.2-如何进入PubMed
2
3
1.2-如何进入PubMed
1.3-PubMed简介
由美国国立医学图书馆 (National Library of Medicine, NLM)下属的国家 生物技术信息中心 (National Centre for Biotechnology Information, NCBI)开发。
pubmed检索综述
pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具,被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。
本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索,以帮助研究人员更有效地获取相关文献,了解领域的最新动态。
1. PubMed简介在讨论综述检索之前,我们首先要了解PubMed的基本情况。
1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)提供的免费文献数据库,涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。
1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围,包括医学、生物学、生物化学、药学等,是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。
2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时,选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。
2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词(MeSH词)和自由词进行关键词选择,以确保检索结果的广泛性和准确性。
2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词,以涵盖不同表达方式的文献,提高检索的全面性。
2.3 关键词的组合合理组合关键词,使用AND、OR、NOT等逻辑运算符,构建复杂而精确的检索式,以确保检索结果符合研究目的。
3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能,帮助研究者更精准地定位所需文献。
3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围,可以获取最新的研究成果,同时限制检索结果的数量。
3.2 文献类型的筛选在高级检索中,可以选择特定的文献类型,如综述、临床研究、病例报告等,以便更有针对性地获取信息。
3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构,可以进一步缩小检索结果的范围,确保文献的质量和相关性。
4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能,帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。
4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户,用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等,提高检索的效率和个性化。
pubmed检索英文文献的步骤
pubmed检索英文文献的步骤要进行PubMed检索英文文献,可以按照以下步骤进行:1. 访问PubMed网站,打开浏览器,输入"/pubmed",进入PubMed网站的首页。
2. 定义研究主题,明确你感兴趣的研究主题,可以是某个特定的疾病、医学领域或者其他相关主题。
3. 使用关键词进行检索,在PubMed首页的搜索框中输入与你的研究主题相关的关键词。
关键词应该是具体而明确的,以便缩小搜索范围。
4. 高级搜索选项,如果你想进一步精确搜索结果,可以使用高级搜索选项。
点击搜索框旁边的"Advanced"按钮,可以在更多的搜索字段中输入关键词,如作者、期刊、出版日期等。
5. 筛选搜索结果,当你点击搜索按钮后,PubMed将会显示与你关键词相关的文献列表。
可以根据自己的需要使用筛选选项来缩小搜索结果的范围,如出版日期、文章类型、文献来源等。
6. 阅读摘要和全文,在搜索结果中,你可以点击文章标题或摘要以获取更多信息。
摘要通常提供了文章的简要概述,帮助你判断是否与你的研究主题相关。
有些文章可能提供免费全文,可以直接阅读,而有些文章可能需要付费或订阅才能获取全文。
7. 下载文献,如果你找到了感兴趣的文献,可以选择下载或保存文献的选项。
这样你就可以在离线状态下阅读或打印文献。
8. 引用和相关文献,在每篇文献的页面上,你可以找到该文献的引用和相关文献。
这些引用和相关文献可能对你的研究有帮助,可以进一步扩展你的文献检索范围。
9. 检索历史和搜索提醒,PubMed还提供了检索历史和搜索提醒的功能。
检索历史可以帮助你回顾之前的搜索记录,搜索提醒可以让你及时获取最新的相关文献。
总结起来,PubMed检索英文文献的步骤包括访问PubMed网站、定义研究主题、使用关键词进行检索、使用高级搜索选项、筛选搜索结果、阅读摘要和全文、下载文献、查找引用和相关文献,以及利用检索历史和搜索提醒功能。
外文医学文献检索工具Pubmed、SCI
作为文献主题的人名
Publication Type
文献类型,包括期刊论文、综述、临床试验 、随机对照试验、病例报告、来信等
MeSH Subheadings MeSH副主题词
Source
文献出处
Journal Title Abbreviation
刊名缩写
Title
篇名
Title/Abstract
不用于显示。用于对篇名和摘要字段进行检 索
字段名称 Abstract Affiliation Author Name
Comment in
Corporate Author Comment on
Publication Date Grant Number Issue ISSN Language
MeSH Major Topic MeSH Terms
Text Words
不用于显示。用于以下字段的检索:TI、AB 、MH、SH、NM、PS、OT等字段
Volume
期刊卷号
1.6 PubMed的检索特点
• 系统特点: 主题加工规范 检索方式灵活多样 免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取) 提供检索词自动转换匹配
1.7 PubMed界面
年以来的MEDLINE已标引数据, 有MeSH字段和摘要, 标记:[PubMed-indexed for MEDLINE]
1.4 PubMed的记录来源
❖ OLDMEDLINE
1948-1965年间发表的200万篇生物医学文献 未标引,无MeSH字段, 标记:[PubMed-OLDMEDLINE]
检索词输入框
使用帮助
常用工具
更多服务
PubMed题录
题名 TI
外文数据库PUBMED检索
一、PubMed简介
PubMed简介
• 收录70余个国家5400多种生物医学
期刊的题录与文摘,其中收录中文
刊100余种,是世界上最权威的医
学数据库。
• 现有1950年以来的2200多万篇文献
的记录(其中MEDLINE记录1700多 万条)
PubMed收录数据
• MEDLINE Indexed
• 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据, 有MeSH字段和摘要,每条记录标有: [PubMed-indexed for MEDLINE]
• OldMEDLINE
• 1949-1965年间的MEDLINE数据,无MeSH 字段和摘要,每条记录标有:[PubMedOLDMEDLINE for Pre1966]
PubMed收录数据
• MEDLINE Inprocess
• 最新的MEDLINE处理中数据,未标引,无 MeSH字段。每条记录标有:[PubMed-in process]。
文献类型
文献可获取性
文献年限 研究对象类 型 清除
我不记得字段
我想看看之索(advanced search)
字段选择
检索历史
(三)主题检索( Mesh Database)
1、点击主页右下角的MeSH Database进入主题词检索界面; 2、输入检索词后,点击go按钮,系统将显示与该词有关主 题词; 3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、 组配的副主题词; 4、选择合适的主题词与副主题词后,点击send to按钮, 进入检索表达式浏览窗口; 5、点击Search PubMed将显示检索结果。
mol biol cell
期刊的一般检 索,是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号
外文文献检索pubmed
限定字段检索
三种方式:
1.通过“Limits”页面的“Tag Terms”下拉列表选择相 应字段,详见“Limits”。
2.通过“Advanced Search”页面的“Search Builder” 选择字段并构建检索式,详见“Advanced Search”。 3.检索式:检索词[字段标识] 例:Smith J[au] Chi[la] hypertension[mh] 2000:2007[dp] 2007/01/01:2007/01/31[edat] 注:时间格式:YYYY/MM/DD
1. 加双引号,如:“single cell”
2.加标段标识[tw]:single cell[tw]
3.使用短横线“-”将两词连接起来:single-cell
4.使用截词符*:single cell*
词组检索
截词检索和禁用词
截词检索: 可通过在词干后加“*”检 索以该词干开头的所有词的文献。需要 注意的是:截词检索将关闭PubMed的 自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩 展检索功能 。如:输入heart attack*, 不会启动自动匹配功能检索与之匹配的 Mesh主题词“Myocardial Infarction” 及其下位更专指的主题词的相关文献。 截词功能最多可使用600个词形变化。 超过600个会显示如下图的提示信息。
PubMed检索
2010年3月
概 况
PubMed() 是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM) 的国家生 物技术信息中心(National Center for Biotech-nology Information, NCBI)开 发的一个以网络为基础的医学文献检 索系统,是NCBI庞大的检索体系Entrez 的一部分。
PubMed-外文文摘型医学文献数据库
天津医科大学图书馆 2019.9
一、引言
PubMed主页
一、引言
本章内容提要
PubMed概述 登录方式 检索方法与技巧 检索结果处理 个性化服务(My NCBI)
1.简介
二、PubMed概述
PubMed是生物医学领域最重要、最权威、完全免 费的文摘数据库,是检索全世界生物医学期刊论文 的重要工具。
其他检索 : 主题词检索、期刊检索、本检索(Basic Search)
在基本检索输入框中,可以输入任何具有实质性意义的词语, 比如:自由词、主题词、人名或者刊名,系统都会智能化地同 系统中词表的进行匹配后完成检索。
二、PubMed概述
2.特点——收录范围广
PubMed收录全世界包括美国在内80多个国家的 5,200余种生物医学期刊的文摘及题录数据,内容 涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、药理 学、环境和公共卫生,保健系统等医学各个领域, 自1946年以来的文献记录,文献量超过2600万条。
二、PubMed概述
2.特点——收录范围广
Pubmed的文献记录主要来源于以下几类: (1)Medline (2)In‐process citations(PreMEDLINE) (3)Publisher‐supplied citation (4)OLDMEDLINE
二、PubMed概述
(1)MEDLINE
是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 。
[PubMed-indexed for MEDLINE] [PubMed-in process] [PubMed-as supplied by publisher]
外文医学文献检索工具pubmed
1. PubMed检索机制
1. PubMed检索机制
(一)Automatic Term Mapping:词汇自 动转换
1. PubMed检索机制
(一)Automatic Term Mapping:词汇自动 转换
1. PubMed检索机制
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping)
基本检索举例2:北京大学医学部马大龙 教授发表的文献
我们分别得到了两个检索结果: 作者为:马大龙(ma dl)的检索结果; 作者单位为:北京大学(peking university[ad])的检索结果。 现在我们要利用检索史把这两个检索结果用 AND组合起来。 注意:检索历史在高级检索里。
1. PubMed检索机制
(一)Automatic Term Mapping:词汇自动 转换
1、MeSH Translation table Vitamin c 转换为: “ascorbic acid”[MeSH Terms] OR “ascorbic”[All Fields] AND “acid”[All Fields]) OR "ascorbic acid"[All Fields] OR "vitamin c"[All Fields] 想要查验检索词的转换情况,并进行调整和保存检 索策略,可看右下角的“search details”按钮
Hale Waihona Puke 一、PubMed概况 PubMed comprises approximately 23million citations for biomedical literature from MEDLINE, life science journals, and online books. PubMed citations and abstracts include the fields of medicine, nursing, dentistry, veterinary medicine, the health care system, and preclinical sciences. PubMed also provides access to additional relevant Web sites and links to the other NCBI molecular biology resources.
pubmed使用介绍
2000年
02
01
03
04
05
PubMed的起源和发展
A
B
C
D
PubMed的特点和优势
权威性
收录内容主要来源于权威的医学学术期刊和会议论文集,具有很高的学术价值和可信度。
更新及时
收录的文献内容实时更新,能够反映全球生物医学领域的最新研究成果。
检索功能强大
提供多种检索方式,方便用户快速找到所需内容。
关键词筛选
文章类型筛选
发表时间筛选
根据文章类型,如期刊论文、综述、病例报告等进行筛选。
选择特定时间范围内的文章,如近五年、近十年等。
03
02
01
检索结果筛选
检索结果数量
显示符合条件的文章总数。
学科分布
统计各学科领域符合条件的文章数量,便于了解相关领域的研究热点和发展趋势。
高频关键词
分析检索关键词中出现频率较高的词汇,有助于了解相关领域的研究重点和热点话题。
跨学科研究的支持
THANKS FOR
感谢您的观看
WATCHING
个性化服务的进一步发展
跨学科研究热点分析
利用人工智能技术对多学科领域的文献数据进行热点分析和趋势预测,帮助用户了解跨学科研究的前沿和动态。
跨学科合作平台
构建跨学科的合作平台,促进不同学科领域的研究者之间的交流与合作,推动跨学科研究的创新和发展。
跨学科主题词系统
建立和完善跨学科的主题词系统,方便用户检索和获取不同学科领域的文献资源。
与Scopus的整合
用户可以在PubMed搜索框中输入关键词,然后点击"在Scopus中搜索"选项,直接跳转到Scopus数据库进行相关文献的搜索。
外文数据库pubmed检索
PubMed与Web of Science的比较
学科领域
PubMed主要针对生物医学领域,而Web of Science涵盖 多个学科领域,包括自然科学、社会科学等。
引文分析
Web of Science提供强大的引文分析功能,可以分析论文的引用 网络和影响因子;PubMed则主要关注医学领域的引文分析。
检索范围
PubMed主要专注于生物医学领域,提供大量医学文献和临床试验结果;而Google Scholar则覆盖更 广泛的主题,包括社会科学、人文科学等。
学术质量
PubMed收录的文献经过严格筛选,质量较高;Google Scholar则包含大量学术和非学术文献,质量 参差不齐。
检索深度
PubMed提供高级检索功能,支持复杂的布尔逻辑运算和精确匹配;Google Scholar的检索功能相对 简单,但可以通过关键词匹配获取更多相关结果。
数据整合
Web of Science整合了多个数据库和专利信息,方便用户 进行跨库检索;PubMed则主要专注于医学文献的检索。
PubMed与Scopus的比较
学科覆盖范围
Scopus覆盖的学科范围比 PubMed更广泛,包括医学、生 命科学、物理、化学、工程等众 多领域。
国际性
Scopus收录的文献来自全球各地, 更加国际化;PubMed则以英文 医学文献为主。
数据分析工具
Scopus提供了丰富的数据分析工 具,如引用分析、学科领域分析 等;PubMed也提供了一定的数 据分析功能,但相对较少。
05
PubMed的未来发展
PubMed的创新和发展方向
人工智能和机器学习技术 应用
利用人工智能和机器学习技术,提高 PubMed的检索效率和准确性,提供更加智 能化的检索服务。
外文文献检索方法
外文数据库PUBMED检索
1.某一主题的检索
在检索框中键入一个或多个英文单 词(大写或小写均可),点击GO按 钮。PubMed系统会自动在主题词表, 期刊刊名表,著者全称表及著者索 引中查询与输入的词相匹配的形式, 这就是它特有的“自动词汇匹配功 能”。
检索有关肿瘤(cancer)的文献
cancer
"neoplasms"[MeSH Terms] OR "neoplasms"[All Fields] OR "cancer"[All Fields]
2.检索某一作者发表的文献
书写规则:姓前名后,姓用全称,名缩写。
考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自 动转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将 检索成smith ja,smith jb,smith jr 等。
精确检索:可以用双引号将作者名引起来, 再加作者字段限定[AU],如:"smith j"[au], 实现精确查找。
检索式:
DNA[] AND crick[au] AND 1993[dp]
字段限制检索 其规则是:检 索词+[字段 标识]
DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
常用字段(检索时大小写都可以)
缩写 全称
缩 写
全称
AB Abstract
LA Language
AD
Affiliation (机构)
例:
“single cell’’,系统会将
其作为一个不可分割的词组在数据
库的全部字段中进行检索。
词组强制和截词检索时,系统的智 能词语匹配功能将不再被执行。例
强制检索 "single cell"
pubmed外文摘要信息获取
检索练习
▪ 检索珠江医院医护人员发表的论文 (zhujiang hospital; zhu jiang hospital )
▪ 检索珠江医院肝胆外科方驰华教授发表的论文 ▪ 检索珠江医院医护人员2005年以来发表的英文
南方医科大学医学情报学教研室
PubMed概况
▪ 收录80多个国家5000多种生物医学期刊的题录与 文摘,是世界上最权威的医学数据库。
▪ 现有1865年以来的2000多万篇文献的记录(其中 MEDLINE记录1830多万条)
▪ 最近3年平均每年增加80余万条文献记录 ▪ 在全部记录中有78%的文献为英文;在2000年以
站全文链接、NCBI资源。
南方医科大学医学情报学教研室
外部链接
南方医科大学医学情报学教研室
外部链接
南方医科大学医学情报学教研室
二、认识PubMed文献
南方医科大学医学情报学教研室
检索练习与演示
▪ 问题:砒霜是什么?有什么特点与作用? ▪ 砒霜(三氧化二砷,白砷):arsenic trioxide,
white arsenic,As2O3 ▪ 利用PubMed数据库检索有关砒霜的文献
南方医科大学医学情报学教研室
PubMed题录
题名TI
来源SO PubMed记录 类型(状态)
作者AU
南方医科大学医学情报学教研室
PubMed记录类型(状态)
▪ PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献 记录按处理过程分4种类型(或状态)
PubMed - as supplied by publisher
PubMed
属于Medline收录范围,建立 ti、au、ab等基本书目信息。
外文摘要信息获取之PubMed
南方医科大学医学情报学教研室
南方医科大学医学情报学教研室
刊名检索
输入期刊全名,如:molecular biology of the cell→mol biol cell” [Journal Name]),系统自动转换;
如果杂志全名中包括括弧或方括号,键入 时应该予以取消,例如杂志名为:J Hand Surg [Am],检索时应转成:J Hand Surg Am.
语种为中文的期刊直接用汉语拼音 南方医科大学学报:Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao(继承 Di 1 jun yi da xue xue bao)
支持截词检索(*),但对词组无效。 如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词 bacteria、bacterium等最多600个单词。 截词检索时,系统的自动词语匹配功能和 MeSH自动扩展功能将不再被执行,如: heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction。
南方医科大学医学情报学教研室
题名TI
作者AU
来源SO
南方医科大学医学情报学教研室
出版商提供 电子文献
MEDLINE 收录文献
正在处理的文献
南方医科大学医学情报学教研室
OLDMEDLINE
南方医科大学医学情报学教研室
举例 甲型病毒(H1N1)性流感
(flu,influenza)/猪流感swine flu 检索词:H1N1;flu;influenza;swine
献 检索词:subhealth,sub-health 构建检索表达式: Subhealth[ti] OR sub-health[ti]
PubMed简介及使用说明
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure:分子构造资料库。
5.Genome:基因组合序列资料库。
6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM:遗传学资料库。
8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
四、PubMed基本检索功能
南方医科大学医学情报学教研室
1.
关键词检索
在检索框中键入一个或多个单词,如键入:
vitamin c AND common cold
hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)
检索词可出现于PubMed记录的标题、摘 要等全部可检索字段。
PubMed - indexed for MEDLINE
南方医科大学医学情报学教研室
三、PubMed检索特点
南方医科大学医学情报学教研室
PubMed检索特点
检索运算符AND、NOT、OR必须大写。 (vitamin c OR zinc) AND common cold 支持截词检索(*),但对词组无效。 如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词 bacteria、bacterium等最多600个单词。 截词检索时,系统的自动词语匹配功能和 MeSH自动扩展功能将不再被执行,如: heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction。
Choose a field to search:选定检索字段 Enter search term(s):输入检索词 Click the Show Index link to display a list of terms, if desired:点 击索引链接查看索引表 Change the default AND operator, if necessary. 改变字段/算符 Click the Add to Search Box button. 单击添加到检索框按钮 Repeat steps as necessary 视情况重复上述步骤 Click Search to run your query, or click Preview to see the result count of your query in the Search History section. 单击搜索运 行查询;或点击预览在检索史区显示查询结果数量。
篇名检索
在文章的标题中进行检索 字段标识[TI] 检索举例:篇名中检索亚健康的相关文 献 检索词:subhealth,sub-health 构建检索表达式: Subhealth[ti] OR sub-health[ti]
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作者检索
PubMed概况
(com; org; net) 美国国立医学图书馆(National Library of Medicine - NLM)国家生物技术信息中心 (National Center for Biotechnology Information - NCBI)向因特网用户提供免费 MEDLINE检索服务(自1997-6-26起)
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中国人姓名格式:first name、last name Shi-zhen Zhong( Shi zhen Zhong ) →
zhong sz
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
Shizhen Zhong →zhong s 当作者三个字以上的中国人时,注意这两种 格式都要检索。即:
Zhong sz[au] OR zhong s[au]
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如果杂志全名中包括括弧或方括号,键入 时应该予以取消,例如杂志名为:J Hand Surg [Am],检索时应转成:J Hand Surg Am. 语种为中文的期刊直接用汉语拼音 南方医科大学学报:Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao(继承 Di 1 jun yi da xue xue bao)
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检索问题
检索《南方医科大学学报》(原第一军医大 学学报》有多少篇文献被收录,最早收录时 间是哪一年?
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2013年1月1日星期二
38
五、 PubMed高级检索
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检索框
检索策略细节
搜索器
预览
检索历史
索引
高级检索界面
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题名TI
出版商提供 电子文献 作者AU 来源SO MEDLINE 收录文献
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正在处理的文献
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OLDMEDLINE
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举例
甲型病毒(H1N1)性流感 (flu,influenza)/猪流感swine flu 检索词:H1N1;flu;influenza;swine flu 造血干细胞移植(hsct)治疗地中海贫血 检索词:hematopoietic stem cell transplantation;thalassemia
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举例
小剂量阿斯匹林治疗高血压 Small dose; aspirin;hypertension 方法:通过搜索器和索引表将检索词逐一导入 1、输入Small dose ,点击SHOW INDEX 2、在新界面选择索引表中的一个或多个索引词, 加入到检索框。 3、 aspirin、hypertension同理。最后搜索。 4、可以改变默认字段和逻辑算符。 5、检索史直接显示于高级检索界面的检索史区
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PubMed概况
收录80多个国家5400多种生物医学期刊的题录与 文摘,是世界上最权威的生物医学数据库。 现有1865年以来的2000万篇文献记录。 每年增加60余万条文献记录。
90%的文献为英文;70%以上的文献有摘要;
截至2010年6月,收录中国期刊111种(我校学报 被收录) 。大陆93种、台13、港4、澳1。
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“姓”+空格+“名首字母缩写”
例如键入phillips c,系统会自动在作 者字段内进行检索。 如果想进行更精确的检索,可以用双引 号将作者名引起来,再加[au](作者字 段标识符),如:"phillips c"[au]。
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Phillips CB
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刊名检索
输入期刊全名,如:molecular biology of the cell→mol biol cell” [Journal Name]),系统自动转换;
键入期刊标准缩写形式如:mol biol cell,或 期刊的ISSN(国际标准出版物代码)如:10591524进行检索; 如果期刊名恰好是MeSH词表中的词或一个单词, 如:《Gene Therapy》,《Science》,《Cell》 等,加[ta](杂志名称) 。
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2. 字段限定检索
篇名字段检索 作者字段检索 机构字段检索 刊名字段检索
[ti] [au] [ad] [ta]
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常用字段(检索时大小写都可以)
缩写 全称 缩写 全称
AB AD AU DP CP TIAB IS
Abstract Affiliation(机构) Author(作者) Publication Date
Phillips C
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检索举例
查找钟世镇院士发表的显微外科学 (microsurgery)论文 检索姚开泰院士发表的鼻咽癌 (nasopharyngeal carcinoma,NPC)论文
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机构检索
查某一机构发表论文被收录情况 机构字段 [AD] 检索南方医院发表的SARS论文 南方医院:nanfang hospital; south hosipital;southern hospital 表达式:SARS AND nanfang hospital[ad]
外文摘要信息获取
夏 旭 南方医科大学医学情报学教研室 电话:61648544 Email:xiaxu99@
常用外文摘要数据库
PubMed(核心内容) EMBase Engineering Village 2 Web of Science Scopus BIOSIS Preview SciFinder Scholar
查作者文章被收录。 西方人姓名书写格式:first name、 Middle Name、last name。
美国肯尼迪总统: John Frank Kenedy, Kenedy為 last name(姓) Frank為 middle name,比较少见,多看到 John F. Kenedy,中间名用缩写。 如果姓名中间有逗号,逗号前肯定是姓。 Kenedy, John F. →Kenedy jf
高级检索
检索策略细节(Details——特征栏) 检索框(Search Box) 预览(Preview ——特征栏) 索引(Index ——特征栏) 搜索器(Search Builder) 检索史(Search History ——特征栏)
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搜索器(Search Builder)
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PubMed检索特点
强制检索:双引号" "或限定字段 "endocrine disruption" endocrine disruption 注意:所有的 " " 、*、 ( )、- 都必须是英 文状态下输入。