提取大肠杆菌的质粒

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大肠杆菌质粒DNA的提取

大肠杆菌质粒DNA的提取

大肠杆菌质粒DNA的提取一、大肠杆菌质粒DNA的提取质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术,但提取方法有很多种,以下介绍一种最常用的方法:碱裂解法:此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。

方法如下:1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。

2、37?振荡培养过夜。

3、取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。

4、加0.lml溶液I(1,葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。

5、加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH,1, SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

7、以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管8、加入等体积的异戊醇,混匀后于?0?静置10min。

9、再以10,000rpm离心20min,弃上清。

10、用70,乙醇0(5ml洗涤一次,抽干所有液体。

11、待沉淀干燥后,溶于0(05mlTE缓冲液中煮沸法1、将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4?下12000,离心30秒。

2、弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。

3、将菌体沉淀悬浮于120ml STET溶液中, 涡旋混匀。

4、加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml), 涡旋振荡3秒钟。

5、将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。

6、用微量离心机4?下12000g离心10分钟。

7、用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。

8、取20ml进行电泳检查。

[注意] 1. 对大肠杆菌可从固体培养基上挑取单个菌落直接进行煮沸法提取质粒DNA。

2. 煮沸法中添加溶菌酶有一定限度,浓度高时,细菌裂解效果反而不好。

质粒DNA的提取纯化与电泳检测

质粒DNA的提取纯化与电泳检测
法、煮沸法、去污剂 (如Triton或SDS)裂解
法、羧基磷灰石柱层析法、质粒DNA释放
法、酸酚法等。
1 .碱裂解法提取质粒DNA
1.1原理


共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓
扑学上的差异来分离它们。
在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线
性的DNA双螺旋结构解开而被变性,共价闭合
接种含pUC-mT质粒的大肠杆菌到1.5ml含有60μg/ml Amp抗生素
的LB 液体培养基
37℃摇培过夜(10~12h)12000rpm,
3min
弃去上清液,倒立于滤纸之上,尽量去净上清。
加100μl Ⅰ液,涡旋震荡,充分混匀
配制适量的Ⅱ液
加200μl Ⅱ液,迅速轻轻混匀(以颠倒EP管5-10次为宜),
电泳介质相同(电泳液和凝胶):
• 分子在电场中迁移的速度主要取决于
分子本身的大小和形状。
• 形状相似的分子的迁移速度主要与分
子量相关: 分子量越大,移动越慢。
凝胶板
(二)琼脂糖凝胶电泳介绍
琼脂糖:
是一种线性多糖聚合物,从红色海藻产物
琼脂中提取而来。
琼脂糖凝胶:
琼脂糖在水里(或电泳液)中加热到沸点
电泳缓冲液的组成。

5.溴化乙锭染料
Biblioteka EB:溴化乙锭( 3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶溴盐
Ethidium Bromide,EB),EB能插入DNA分子碱基
对之间,导致EB与DNA结合。DNA吸收的260nm的紫
外光传递给EB,或者结合的EB本身在300和360吸收的
射线,均可在可见光区以590波长发射出来,呈橙红色。
离子交换层析法

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法

大肠杆菌质粒提取碱裂解法大肠杆菌质粒提取是分子生物学实验中常用的技术之一,它能够从大肠杆菌中提取到质粒DNA,为后续的克隆、测序、转染等实验提供材料基础。

下面将介绍一种常用的大肠杆菌质粒提取方法——碱裂解法。

碱裂解法是一种常用的大肠杆菌质粒提取方法,它能够高效地将细菌细胞壁溶解,并释放出其中的质粒DNA。

下面将详细介绍碱裂解法的步骤。

1.准备实验所需试剂和设备。

包括缓冲液(Tris-EDTA缓冲液)、碱裂解液(含有SDS和NaOH)、中和液(含有醋酸)、平衡液(含有大量的乙酸和等体积的酸化乙醇)等。

此外,还需要离心机、恒温槽、加热器等设备。

2.培养大肠杆菌。

首先,在LB寒天平板上点取克隆菌落,放到含有LB培养基的离心管中,经过过夜培养,培养到适合的生长状态。

3.收获大肠杆菌菌落。

用吸管将培养液吸入离心管中,然后进行高速离心,使大肠杆菌菌落沉淀在离心管底部。

4.溶菌。

将上述步骤中得到的菌落沉淀用缓冲液洗涤,去掉多余培养基;然后加入碱裂解液,充分混匀,孵育在恒温槽中。

5.中和。

将中和液加入上述混匀的细菌液中,充分混匀,使pH值迅速下降,将碱性液体中的DNA中和。

6.离心。

将上述混合液进行高速离心,使细胞碎片和DNA沉淀到离心管底部。

7.除去上清。

将上述沉淀中的上清液去掉,注意不要损伤沉淀。

8.沉淀洗涤。

用平衡液洗涤沉淀,去除杂质和残留的碱性液体。

9.沉淀溶解。

用适量的TE溶解沉淀,使DNA溶解在缓冲液中,用于后续实验。

以上就是碱裂解法的基本步骤。

此外,需要注意的是,大肠杆菌质粒提取过程中需要严格控制实验条件,如温度、时间和离心力度等,以保证提取的质粒DNA质量和纯度。

实验中还需要避免DNA的酶降解,应尽量避免长时间的酶处理等。

总结起来,碱裂解法是一种简单有效的大肠杆菌质粒提取方法,它能够高效地提取到质粒DNA,为后续的实验提供了重要的基础材料。

不过在实验操作过程中需要严格控制条件,以保证提取到的质粒DNA 质量和纯度,从而保证后续实验的可靠性。

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法 -回复

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法 -回复

大肠杆菌质粒提取碱裂解法-回复大肠杆菌质粒提取是一种常用的实验技术,可以用于分离和纯化重组DNA 质粒。

碱裂解法是其中一种常用的技术,本文将详细介绍大肠杆菌质粒提取碱裂解法的步骤和相关注意事项。

一、材料准备1. 大肠杆菌含质粒的培养物:可以选择含有目标质粒的大肠杆菌菌株。

例如,适用于蓝/白哺乳素筛选的菌株如DH5α。

2. 质粒纯化试剂盒:选择适合自己实验的质粒纯化试剂盒,可以根据需要选择小或大规模的提取试剂盒。

3. 离心管和离心机:用于离心大肠杆菌培养物和纯化DNA溶液。

4. 碱裂解缓冲液:可以通过自制或直接购买管制的缓冲液,如1 MTris-HCl (pH 8.0)、0.5 M EDTA (pH 8.0) 和10 SDS。

二、菌群扩增和收获菌株1. 从培养物中收取大肠杆菌:从10 mL 大肠杆菌培养物中取出适量菌液,可通过离心和倾倒上清液的方式收集菌块。

2. 重悬菌液:用无菌的PBS缓冲液洗涤菌块,再用10 mL 新鲜PBS缓冲液将菌块重悬。

3. 破碎细胞:将重悬的菌液转移至一个离心管中,对菌液进行破碎。

可以通过加入Lysozyme (100 mg/mL)、RNase A (10 mg/mL) 和TritonX-100 (1)来实现。

然后进行轻轻的颠倒以混合试剂。

4. 加入碱裂解缓冲液:向破碎的细胞中加入适量的碱裂解缓冲液。

一般来说,每个培养物使用5 mL缓冲液进行处理。

5. 匀浆与悬浮:用高速离心机对混合液进行离心,以沉淀细胞碎片。

然后将上清液转移到另一个离心管中,进行均匀悬浮。

三、纯化DNA1. 加入异丙醇:向菌液中加入等体积的异丙醇。

使用移液器将试剂静态混合。

2. DNA沉淀:将混合液高速离心,将沉淀的DNA从上清中分离出来。

沉淀的细胞碎片在离心管底部形成一个白色团块,而上清液大部分为透明的液体。

3. 洗涤:使用95 乙醇洗涤DNA沉淀物。

将95 乙醇分别加入到离心管中,并将其高速离心10分钟。

碱裂解法抽提大肠杆菌质粒

碱裂解法抽提大肠杆菌质粒

移液器及吸头 漩涡混合器
03
实验步骤
菌体培养
菌体培养是碱裂解法抽提大肠杆菌质 粒的第一步,需要将大肠杆菌接种在 适量的培养基中,在适宜的温度下进 行培养,使菌体生长至对数生长期。
培养过程中,需要控制温度、pH和培 养时间,以确保菌体生长良好且无杂 菌污染。
菌体收集
当菌体生长至对数生长期后,需要将 菌体收集起来,以便进行后续的实验 步骤。
碱裂解法抽提大肠杆 菌质粒
目 录
• 实验原理 • 实验材料 • 实验步骤 • 结果与分析 • 结论与讨论
01
实验原理
碱裂解法介绍
碱裂解法是一种常用的质粒抽提 方法,通过改变细胞壁和细胞膜 的性质,使质粒DNA从染色体
DNA中分离出来。
在高pH值条件下,细胞膜和染 色体DNA的双螺旋结构被破坏,
聚丙烯酰胺凝胶电泳
对于较小片段的质粒,可采用聚丙烯 酰胺凝胶电泳进行检测,该方法分辨 率更高。
质粒结构与功能分析
01
质粒电泳图谱分析
通过比较标准质粒和提取质粒的 电泳图谱,分析提取质粒的分子 量大小及可能缺失的片段。
02
限制性内切酶分析
03
基因测序验证
利用限制性内切酶对质粒进行酶 切,通过电泳检测酶切产物,判 断质粒的结构。
形成不可逆的变性,而质粒 DNA则保持稳定。
通过离心分离,染色体DNA和 细胞膜等大分子物质被沉淀,而
质粒DNA则留在上清液中。
大肠杆菌质粒介绍
01
大肠杆菌质粒是一种小型环状DNA分子,可以自主 复制和遗传。
02
质粒携带特定的基因,赋予宿主细胞某些表型特征, 如抗生素抗性或代谢特性。
03
大肠杆菌质粒是基因工程中常用的载体,用于克隆 和表达目的基因。

大肠杆菌生产质粒过程

大肠杆菌生产质粒过程

大肠杆菌生产质粒过程1.引言1.1 概述概述大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的革兰氏阴性杆菌,广泛存在于自然界中,尤其是在人和动物的消化系统中。

由于其较高的生长速度和容易培养的特性,大肠杆菌成为了许多生物学研究和工业生产中的重要模式生物。

质粒是一种小型的环状双链DNA分子,在细菌中经常出现并进行自复制。

质粒可以通过转化或转染等方式在细菌中进行稳定复制,从而传递和保守一些重要的基因信息。

在大肠杆菌中,质粒的产生是其中一个重要的生物过程。

本文旨在探讨大肠杆菌生产质粒的过程,从大肠杆菌的生物特性和质粒的定义与功能入手,详细分析大肠杆菌生产质粒的重要性以及影响其生产过程的关键因素。

通过对大肠杆菌生产质粒过程的研究,我们可以更好地理解质粒的作用机制,为进一步优化和应用质粒在工业生产和基因工程中提供理论指导和实践经验。

在本文的后续章节中,我们将逐步展开对大肠杆菌和质粒的相关讨论,并且重点分析大肠杆菌生产质粒的重要性和影响质粒生产过程的关键因素。

最后,我们将总结得出结论,并对未来可能的研究方向进行展望。

通过本文的研究,我们希望能够更深入地了解大肠杆菌生产质粒的机制,为质粒的开发和应用提供更多的理论和实践支持,进一步推动生物科学和生物工程的发展。

1.2文章结构1.2 文章结构本文将按照以下顺序进行介绍大肠杆菌生产质粒的过程及其相关内容:1. 引言部分将提供对整篇文章的概述,介绍大肠杆菌生产质粒的背景和意义,以及本文的目的和结构。

2. 正文部分将包括两个主要部分:2.1 大肠杆菌的生物特性:这一部分将详细介绍大肠杆菌的特性,包括其生长环境、生理特征以及在科学研究和实际应用中的重要性。

通过对大肠杆菌的深入了解,读者将更好地理解其在质粒生产过程中的应用。

2.2 质粒的定义与功能:质粒是一种在细胞内自主复制的小型环状DNA分子,具有重要的研究和应用价值。

本部分将介绍质粒的定义、结构和功能,重点讨论其在基因工程和生物制药中的应用,以及大肠杆菌在质粒生产中所起的关键作用。

大肠杆菌质粒提取原理

大肠杆菌质粒提取原理

大肠杆菌质粒提取原理
大肠杆菌质粒提取的原理主要包括以下几个步骤:
1. 细胞裂解:将大肠杆菌菌落接种到液体培养基中培养,在适当的培养时间后,将菌液离心沉淀,得到含有大肠杆菌细胞的沉淀物。

细胞裂解是通过物理或化学方法破坏细胞壁,释放细胞的内容物。

2. 质粒提取:将裂解后的细胞加入适当的缓冲液中,经过离心分离得到上清液和沉淀物。

上清液中含有质粒DNA,而细胞碎片和其他细胞器等则在沉淀物中。

3. DNA纯化:使用DNA纯化试剂盒或其他纯化方法将上清液中的质粒DNA分离纯化。

这些方法通常涉及对上清液进行酚/氯仿提取、乙醇沉淀或离心柱纯化等步骤,以去除杂质和纯化质粒DNA。

4. 质粒DNA定量:使用紫外线分光光度计对纯化后的质粒DNA进行定量,以确定得到的DNA的浓度和纯度。

5. 质粒DNA的后续应用:得到纯化的质粒DNA后,可进一步进行测序、限制性酶切、聚合酶链式反应(PCR)等分子生物学实验,以研究质粒DNA所携带的目的基因的功能、构建重组质粒或进行基因克隆等实验。

需要注意的是,在文中不提供标题或重复的文字。

如果需要添加标题,可以根据具体内容进行修改。

大肠杆菌质粒DNA的提取

大肠杆菌质粒DNA的提取

大肠杆菌质粒DNA的提取实验目的学习和掌握碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA的方法实验原理大肠杆菌质粒DNA的提取是从事基因工程工作的一项基本实验技术,碱裂解法是最常用的质粒DNA提取方法之一,其原理是基于染色体DNA与质粒DNA变性与复性的差异而达到分离的目的;具体为:溶液Ⅰ使细胞悬浮并且EDTA可以与Ca2+ 和Mg2+ 螯和,抑制DNase的活性,溶液II裂解细菌,变性蛋白质和少量质粒,溶液Ⅲ使大部分蛋白质与细菌基因组DNA一起被共沉淀,质粒DNA复性,通过离心吸附柱分离,进行电泳鉴定。

此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析等。

实验材料、仪器和试剂材料:大肠杆菌DH5α仪器:1.5ml塑料离心管,微量移液枪,台式高速离心机,恒温摇床试剂:质粒DNA提取试剂盒实验步骤和各步骤相应的注意事项一、培养细菌使质粒扩增将带有质粒DNA的大肠杆菌接种在LB液体培养基中,37℃过夜培养。

注意:培养时间不宜过长,一般12~16小时为宜,否则影响细菌质粒的得率。

二、收集和裂解细菌1. 取1.5ml 细菌培养物于EP管中,4000rpm 离心2分钟,弃上清液,收集菌体,使细菌沉淀尽量干燥;注意:上清为培养基,必须倾倒干净,并在吸水纸上吸干,如有较多的培养基残留可能会影响后续实验。

2. 将细菌沉淀重悬于用冰预冷的250μl溶液I (50 mmol/L)葡萄糖,10mmol/L EDTA pH 8.0,25 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0) 中,剧烈振荡;注意:为了保证菌体悬浮均匀,必须充分混匀至看不见沉淀物质,可以用移液枪吹打或者混匀器震荡。

3. 加入250μl新配制的溶液II(0.2 mol/L NaOH,1%SDS(m/v)) ,盖紧EP管口,柔和颠倒离心管(2分钟左右),以混合混合物,确保离心管的整个内表面与溶液II接触,使溶液变为澄清为止;注意:NaOH溶液最好是新鲜配制,足够的碱性保证其溶解细胞膜的效率;不可剧烈震荡,时间不要过长,否者基因组DNA会断裂。

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项质粒提取之达人建议碱裂解法从大肠杆菌制备质粒,是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。

可是我收研究生十几年了,几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。

追其原因,我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤,而没有对原理进行详细的论述。

这是导致我的学生误入歧途的主要原因。

后来我发现其实是整个中国的相关领域的研究生水平都差不多,甚至有很多“老师”也是这个状态。

这就不得不让人感到悲哀了。

我想这恐怕和我们的文化有点关系。

中国人崇尚读书,“学而优则仕”的观念深入人心。

经常听到的是父母对他们的独苗说,你只要专心读好书就可以了。

所以这读书的定义就是将教课书上的东西记住,考试的时候能拿高分……这就是现代科学没有在中国萌发的根本原因。

如果中国文化在这一点上不发生变化,那么科学是不能在中国真正扎根的,它只能蜕化成新的“八股学”。

生命科学是实验科学,它讲究动手。

如果实验科学只要看看书就可以了,那我想问有那位神仙看看书就会骑自行车了?或者听听体育老师的讲解就会滑冰了?可是光动手不思考,不就成了一个工匠?一个合格的生命科学研究者,需要在这两方面完善自己。

一个杰出的科学工作者,是一个熟知科学原理并善完成质粒抽提,就不用怕DNA会迅速被降解,因为最终溶解质粒的TE缓冲液中有EDTA。

如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提质粒呢?实话告诉你,只要用等体积的水,或LB培养基来悬浮菌体就可以了。

有一点不能忘的是,菌体一定要悬浮均匀,不能有结块。

轮到溶液II了。

这是用新鲜的0.4 N的NaOH和2%的SDS等体积混合后使用的。

要新从浓NaOH稀释制备0.4N 的NaOH,无非是为了保证NaOH没有吸收空气中的CO2而减弱了碱性。

很多人不知道其实破细胞的主要是碱,而不是SDS,所以才叫碱法抽提。

事实上NaOH是最佳的溶解细胞的试剂,不管是大肠杆菌还是哺乳动物细胞,碰到了碱都会几乎在瞬间就溶解,这是由于细胞膜发生了从bilayer(双层膜)结构向micelle(微囊)结构的相变化所导致。

大肠杆菌质粒提取

大肠杆菌质粒提取

一、大肠杆菌质粒DNA的提取质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术,但提取方法有很多种,以下介绍一种最常用的方法:碱裂解法:此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。

方法如下:1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。

2、37℃振荡培养过夜。

3、取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。

4、加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。

5、加入0.2ml溶液II(0.2 mM/L NaOH,1%SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。

7、以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管8、加入等体积的异戊醇,混匀后于?0℃静置10min。

9、再以10,000rpm离心20min,弃上清。

10、用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。

11、待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中二、质粒DNA琼脂糖凝胶电泳鉴定琼脂糖是从海藻中提取出来的一种线状高聚物,应选用电泳纯的,琼脂糖此级产品筛除了抑制物和核酸酶,而且用溴化乙锭染色后荧光背景最小。

(1)琼脂糖凝胶电泳装置由于琼脂糖凝胶电泳既要求不高,而适应性又强,在过去15年里已成功地设计了形形色色及大大小小的电泳槽。

对这些装置的选择主要是依据个人的喜恶。

使用最普遍的装置是Walter Schaffner发明的水平板凝胶。

水平板凝胶通常在一块可安放于电泳槽平台的玻璃板或塑料盘上灌制。

在有些装置中,则可将凝胶直接铺在平台上。

凝胶恰好浸在缓冲液液面下进行电泳。

凝胶的电阻几乎与缓冲液的电阻相同,所以有相当一部分的电流将通过凝胶的全长。

(2)琼脂糖凝胶的制备琼脂糖凝胶的制备是将琼脂糖在所需缓冲液中熔化成清澈、透明的溶液。

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法 -回复

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法 -回复

大肠杆菌质粒提取碱裂解法-回复大肠杆菌质粒提取是分子生物学研究中常用的一个实验步骤。

通过提取质粒,可以进一步研究质粒中的目标基因或功能蛋白。

本文将主要介绍其中的一种提取方法,即碱裂解法,并一步一步解释各个步骤的操作方法及原理。

一、实验准备在进行大肠杆菌质粒提取之前,需要准备实验材料和设备。

实验材料包括含有目标质粒的大肠杆菌菌落、无菌离心管、无菌培养基、无菌PBS缓冲液、TE缓冲液、碱液(如NaOH/SDS溶液)、中性化液和以太。

实验设备包括超低温离心机、高速离心机、加热鼓摩挂计、水浴锅、pH 计等。

二、菌落培养与扩增1.从存有目标质粒的大肠杆菌菌落中挑取一小块菌落,接种入无菌培养基中,进行预培养。

预培养条件为37、200rpm、12-16小时。

2.将预培养好的菌液取1mL,用无菌离心管离心2-3分钟,去除上清,留下细胞沉淀。

三、细胞沉淀裂解1.加入1mL的无菌PBS缓冲液,轻轻将菌沉淀悬浮均匀。

2.将悬浮的菌沉淀加入无菌离心管,用超低温离心机离心10分钟(4、8000rpm)。

3.将上清去除,留下细胞沉淀。

四、碱裂解1.加入200μL的TE缓冲液,用吸管将细胞沉淀悬浮均匀。

2.加入200μL的碱液,用吸管轻轻混匀,置于室温静置5分钟。

五、中和1.加入300μL的中性化液,用吸管轻轻混匀。

2.将离心管置入热水浴锅中,温度设为70,恒温10分钟。

六、离心沉淀1.将热水浴锅中的离心管取出,加入600μL的以太。

2.用手掌将离心管摇匀,使其混合均匀。

注意不要用力摇动,以免产生过多的泡沫。

3.将离心管离心5分钟(4、12000rpm)。

七、提取质粒1.将上清(含有目标质粒)转移到另一个无菌离心管中。

2.加入等体积的冷乙醇,用吸管轻轻混匀。

3.用高速离心机离心10分钟(4、12000rpm)。

4.将上清去除,留下沉淀。

八、沉淀洗涤1.加入1mL的70乙醇洗涤沉淀,用吸管轻轻混匀。

2.用高速离心机离心5分钟(4、12000rpm)。

质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告

质粒dna的提取实验报告实验目的:通过质粒DNA的提取实验,掌握质粒DNA的提取方法,了解质粒DNA提取的原理和步骤,并评估提取质量和纯度。

实验材料:- 大肠杆菌菌落- 磷酸盐缓冲液- 10% SDS溶液- 去离子水- 超纯酒精(乙醇或异丙醇)- 氯仿- 石英研钵- 离心管和离心机- 显微镜和比色皿- 分子生物实验器材- DNA评估工具(如凝胶电泳仪)实验步骤:1. 随机挑选一颗大肠杆菌菌落,接种至含有磷酸盐缓冲液的离心管中,用显微镜观察菌落的情况,确保菌落无杂质。

2. 加入500 μL含有磷酸盐缓冲液的离心管中,用微量移液管捞取菌落,将其完全悬浮在磷酸盐缓冲液中。

3. 加入10 μL 10% SDS溶液,翻转离心管轻轻摇匀。

4. 加入200 μL NaOH和150 μL氯仿,离心1分钟。

此时,质粒DNA会被氯仿等重物分离到有机相中,而大部分细胞膜和核酸会留在水相中。

5. 转移上清液至新的离心管中,避光加入等量的超纯酒精,轻轻摇匀。

DNA会在酒精中沉淀。

6. 离心10分钟,取出上清液。

7. 加入70%乙醇或异丙醇定居洗涤一次,离心2分钟,取出上清液。

8. 反复使用去离子水洗涤,使残留的乙醇或异丙醇彻底除去。

9. 用去离子水稀释DNA,摇匀。

10. 用凝胶电泳仪评估提取的质粒DNA的质量和纯度。

实验结果:通过凝胶电泳仪评估质粒DNA的质量和纯度,得到如下结果:- DNA带有明显的质粒带,且带的位置与预期一致。

- DNA带的强度较均匀,并且没有明显的附带杂带。

- 带的强度与浓度成正比,说明提取的质粒DNA具有较高的质量。

讨论和结论:通过本实验,成功提取到了质粒DNA,并评估了其质量和纯度。

本实验中所使用的提取方法简单快速,并且获得了满意的结果。

然而,有时由于实验步骤的疏忽或操作技巧不当,可能会导致质粒DNA提取的效果不佳,如DNA带弱、杂带多等。

因此,未来可以进一步优化实验步骤和控制实验条件,提高质粒DNA提取的效率和质量。

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项

碱裂解法提取质粒:原理和注意事项质粒提取之达人建议碱裂解法从大肠杆菌制备质粒,是从事分子生物学研究的实验室每天都要用的常规技术。

可是我收研究生十几年了,几乎毫无例外的是我那些给人感觉什么都知道的优秀学生却对碱法质粒抽提的原理知之甚少。

追其原因,我想大概是因为《分子克隆》里面只讲实验操作步骤,而没有对原理进行详细的论述。

这是导致我的学生误入歧途的主要原因。

后来我发现其实是整个中国的相关领域的研究生水平都差不多,甚至有很多老师”也是这个状态。

这就不得不让人感到悲哀了。

我想这恐怕和我们的文化有点关系。

中国人崇尚读书,学而优则仕”的观念深入人心。

经常听到的是父母对他们的独苗说,你只要专心读好书就可以了。

所以这读书的定义就是将教课书上的东西记住,考试的时候能拿高分……这就是现代科学没有在中国萌发的根本原因。

如果中国文化在这一点上不发生变化,那么科学是不能在中国真正扎根的,它只能蜕化成新的八股学”。

生命科学是实验科学,它讲究动手。

如果实验科学只要看看书就可以了,那我想问有那位神仙看看书就会骑自行车了?或者听听体育老师的讲解就会滑冰了?可是光动手不思考,不就成了一个工匠?一个合格的生命科学研究者,需要在这两方面完善自己。

一个杰出的科学工作者,是一个熟知科学原理并善于应用的艺术家”每个曾经用碱法抽提过质粒的同学,希望你看本文后能有所思考,让中国的未来有希望。

为了方便理解,这里罗列一下碱法质粒抽提用到三种溶液:溶液1, 50 mM 葡萄糖/ 25 mM Tris-CI / 10 mM EDTA,pH 8.0 ;溶液II,0.2 N NaOH / 1% SDS ;溶液III,3 M醋酸钾/ 2 M醋酸。

让我们先来看看溶液I的作用。

任何生物化学反应,首先要控制好溶液的pH,因此用适当浓度的和适当pH值的Tris-Cl溶液,是再自然不过的了。

那么50 mM葡萄糖是干什么的呢?说起来不可思议,加了葡萄糖后最大的好处只是悬浮后的大肠杆菌不会快速沉积到管子的底部。

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法

大肠杆菌质粒提取 碱裂解法

大肠杆菌质粒提取碱裂解法大肠杆菌质粒提取是一种用于从大肠杆菌中提取质粒的方法。

碱裂解法是其中一种常用的方法,该方法利用碱性条件下DNA的不稳定性,将细胞壁溶解,并使质粒DNA从细胞中释放出来。

本文将介绍碱裂解法的步骤、原理以及优缺点。

碱裂解法的步骤如下:1.大肠杆菌培养:首先从保存在琼脂板上的大肠杆菌菌落中挑取一株菌,接种到含有适量抗生素的LB培养基中,培养过夜,直到菌液呈现较浓的悬浮液。

2.收取大肠杆菌:将培养液离心,除去上清。

用冷凉的纯水冲洗沉淀两次,将菌沉淀重悬于50 mM Tris-HCl缓冲液中,pH 8.0。

3.制备碱性溶液:在50 mM Tris-HCl缓冲液中加入0.2 M NaOH 和1% SDS,混匀制成碱性溶液。

4.碱性裂解:将菌悬液与等体积的碱性溶液混匀,使菌细胞在碱性条件下裂解。

孵育数分钟至十几分钟,直至溶液变为粘稠状。

5.酸性中和:加入等体积的3 M醋酸,酸性中和碱性溶液。

此步骤中,质粒DNA会从溶液中析出沉淀。

6.离心:用高速离心将沉淀离心下来,除去上清。

7.溶解:用适量的纯水将沉淀溶解,可以通过轻轻摇动溶液使其充分溶解。

8.纯化:通过离心或其他纯化方法,如柱层析、琼脂糖凝胶电泳等技术,纯化目标质粒DNA。

碱裂解法的原理是利用碱性条件下DNA的不稳定性。

当细胞处于高pH环境中时,碱性条件会破坏大肠杆菌的外膜,使细胞壁失去完整性。

此时,细胞内的DNA易于释放出来,包括质粒DNA。

然后,通过酸性中和反应将质粒DNA沉淀下来。

最后,通过纯化步骤,可以得到高纯度的质粒DNA。

碱裂解法的优点是简单易行,不需要较昂贵的设备和试剂,并且可以在相对短的时间内提取到目标质粒DNA。

此外,这个方法适用于大多数质粒类型和质粒大小。

碱裂解法适用于小规模提取或初步提取,用于大规模提取时效率较低,不推荐使用。

然而,碱裂解法也存在一些缺点。

首先,该方法提取到的DNA含有RNA、蛋白质和其他污染物。

细胞生物学实验碱性SDS法提取大肠杆菌源质粒

细胞生物学实验碱性SDS法提取大肠杆菌源质粒

溶液Ⅱ: 0.2MNaOH, 1%SDS
溶液Ⅲ: 3M乙酸钠 PH 4.8
试剂
4、1:1 Tris饱和酚/氯仿
5、溶解质粒用TE:
10mmol/L Tris-HCI PH 8.0
1mmol/L EDTA
PH 8.0
6、溶解质粒用TER:
每ml TE 中含1mg RNase。
用品
摇床、恒温箱、普通离心机、高速冷冻 离心机、1.5ml离心管、电泳仪等。
断开)
DNA的琼脂糖凝胶电泳分离的原理及装置
琼脂糖(agarose)是从海藻中提取出来的一 种线状高聚物,在溶液中形成一定孔径的凝胶。 具有分子筛作用。可依据分子大小及分子构型 不同分离物质。
琼脂糖凝胶电泳装置:Walter Schaffner发明
的水平板凝胶电泳装置。
电泳步骤
1.配缓冲液:Tris-乙酸缓冲液、Tris-乙酸盐缓冲液、 Tris-硼酸盐缓冲液、Tris-磷酸盐缓冲液
三、裂菌及提取质粒DNA
1、100l预冷的溶液Ⅰ重悬菌液,激烈振荡(涡旋), 使细胞完全分散,室温放置5min;
2、加入200l新配制的溶液Ⅱ,快速颠倒几次混匀, 置于冰上(此时溶液PH应为12.6)不超过5min ,使细 胞破裂,蛋白和染色体DNA变性;
3、加入150l用冰预冷的溶液Ⅲ,颠倒温和混匀,置 于冰上5min(此时溶液PH应为7.0左右,可使质粒DNA选 择复性;高浓度的盐使蛋白及染色体DNA沉淀);
Tris-硼酸盐缓冲液 Tris-EDTA缓冲液 巴比妥缓冲液 缓冲液 缓冲液离子强度:0.02-0.05。
琼脂糖凝胶的制备
1.配琼脂糖溶液。用电泳缓冲液配制。 2.封胶板,插梳子。
3.倒胶。熔化液倒入胶模中,放置1530min令其凝固。

质粒提取

质粒提取

一.大肠杆菌质粒DH5α—pCAMBIA1305.1的提取溶液Ⅰ:称取4. 504 g葡萄糖,量取12. 5 mL 1mol/LTris-HCl(pH 8. 0)、10 mL 0. 5 mol/L EDTA(pH8. 0)放入500 mL烧杯中加300 mL去离子水溶解,再用去离子水定容至500 mL, 125e高温高压灭菌20 min,储存于4e冰箱中。

溶液Ⅱ: 0. 2 mol/LNaOH, 1% SDS (用2 mol/LNaOH, 10% SDS现用现配)。

溶液Ⅲ: (3 mol/L乙酸钾)称量29. 4 g乙酸钾、11.5 mL冰醋酸放入烧杯中加入60 mL去离子水搅拌溶解,再加去离子水定容到100mL, 125e高温高压20 min,储存于4e冰箱中。

TE: 10 mmol/L Tris_Cl(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH 8.0)实验步骤:将含有质粒的菌种接种在LB固体培养基中,37℃培养12-16h。

挑取转化细胞的单菌落,接种到50mL LB液体培养基中,37℃振荡培养约12-16h(当菌液生长到对数期OD600=0.4-0.6在培养液中添加适当体积的34mgPmL的氯霉素,使其终浓度为170LgPmL)。

1.用LB液体培养基培养细菌14 h后,取1. 5 mL培养液倒入Eppendorf管中, 4℃下12 000 r/min离心30 s;弃上清,将管倒置于滤纸上数分钟,使液体流尽;2.加入用冰预冷的溶液Ⅰ100ul吸打均匀,室温下放置5~10 min;3.加入新配制的溶液Ⅱ200ul盖紧管口,温和的颠倒Eppen-dorf管数次,以便混匀内容物;4.加入3 mol/L乙酸钠(pH5. 2)150L,l倒转混匀, 10 000 r/min离心5min;5.转移上清至另一管中;在含上清的管中加满异丙醇,混匀,于室温下10 000 r/min 离心5min;6.转移上清至另一Eppendor管中,加1. 1体积的3 mol/L NaAc(pH 5. 2)和2. 5倍体积的无水乙醇,混匀; 4℃下静止10min后10 000 r/min离心5min;7.除去上清,加1 mL 70%乙醇洗沉淀1次, 12 000 r/min离心5 min,再小心吸去上清,打开管口直至乙醇挥发干净;最后将质粒DNA重悬于50ul TE溶液含中(含有RNA酶10 mg/L),混匀, 12 000 r/min离心30 s,储于-20e冰箱中。

实验六、大肠杆菌质粒DNA的提取与电泳检测

实验六、大肠杆菌质粒DNA的提取与电泳检测

实验步骤
2.质粒DNA的提取(碱裂解法) ①将收集的细菌沉淀悬浮于100μ l冰预冷的溶液Ⅰ中,强
烈振荡混匀; ②加入200ul新配的溶液Ⅱ于细菌悬液中,迅速颠倒离心管
5次(不应振荡),以混合内容物,室温放置5min或冰上 放置3min. ③加入150μ l预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,颠倒离心管5~10 次,使溶液Ⅲ在黏稠的细菌裂解物中分散均匀,随后将 管置于冰上5~10min。
实验原理
同一质粒DNA的不同构型尽管相对分子质量相同, 但在琼脂糖凝胶电泳中的电泳迁移率却是不同的。一 般情况下,泳动速率由快至慢依次为:超螺旋质粒 (SC)、线性质粒(L)、开环质粒(OC)。 质粒DNA的提取方法较多,要根据宿主菌和质粒的 特性选择适合的提取方法。目前常用的质粒提取方法 有:碱裂解法、煮沸法。 几种方法的提取流程是一样的:培养细菌扩增质粒 →收集菌体裂解细胞→分离和纯化质粒DNA。
(2)溶液Ⅱ:0.2mol/L NaOH 1% SDS(pH值12.6)
(3)溶液Ⅲ:5mol/L KAc 60ml 冰乙酸 11.5ml 水28.5ml(pH4.8)
(4)LB培养基 (5)琼脂糖 (7)1×TAE电泳缓冲液(pH 8.0):10 mmol/LTris·Cl
1 mmol/L EDTA (8)上样缓冲液(溴酚蓝 (9) 溴化乙锭(1mg/ml)
电泳结束后取出胶膜,使用凝胶成像系统拍照,观察。对 比标准DNA条带和未知DNA条带,观察其带型和迁移距离, 即可获得未知样品的浓度、纯度和相对分子质量大小。
质粒DNA 电泳检测过程示意图称脂糖加TAE灌胶
凝固
点样
电泳
加热溶解
加EB
放入电泳槽
加溴酚蓝
观察拍照
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感受态细胞
分子生物学最基本的实验操作
提取大肠杆菌和凝胶电泳
碱裂解法提取质粒
质粒是分子生物学中载体
扩增培养细菌便于提取,为客观化,养细胞来获得质粒二倍体增加
培养后收集裂解,裂解物质有很多物质,分离质粒和纯化质粒
质粒提取的方法
2-3ml少量提取方法碱裂解法
两个环,染色体独立复制能从亲代传到子代
质粒DNA是圆环状
目的基因越多,复性有不好影响
需要大量,让宿主细胞扩增
EP2232考量目的基因的作用,个体,看生物学功能发现
可以弥补目的细胞缺陷
沉默基因片段可以质粒
质粒提取与介质有关
控制PH是细胞破裂,染色体基因变性,质粒基因微变性,空间结构稳定,变性小开链缠绕在一起,蛋白质会沉淀,质粒在水相离心抽提纯化
原理核心物质
Ph8左右培养,变性需要12
Sds裂解细胞,染色体核酸变性,环境是碱
抑制杂菌,空气中的菌,培养中其它生长出来的菌
裂解用的试剂SDS和NAOH溶液
提取试剂溶液1,2,3
先配原始浓度,用时工作浓度,使用时变成终浓度
苯酚氯仿异戊醇分层,用苯酚氯仿比重大,易沉,相配现用
充分混匀
TE Buffer专门储存DNA
裂解时加RNA酶,不加,检测有条带,使制剂更纯
溶液123作用尽可能全地写到讨论区
溶液一震荡混匀二是轻柔颠倒混匀3颠倒混匀
涡旋混匀器。

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