细菌古细菌病毒

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微生物学复习思考题

微生物学复习思考题

绪论1.什么是微生物?它包括那些类群?概念:微生物是一切肉眼看不见或看不清的微小生物的总称。

包括:原核类:细菌〔真细菌,古细菌〕,放线菌,蓝细菌,支原体,立克次氏体,衣原体等。

真核类:真菌〔酵母菌,霉菌,蕈菌〕,原生动物和显微藻类非细胞类:病毒,亚病毒〔类病毒,拟病毒,朊病毒〕2.人类迟至19世纪才真正认识微生物,其中主要客服了哪些重大障碍?显微镜的创造〔列文虎克〕灭菌技术的运用纯种别离培养技术的建立3.微生物有哪五大共性?其中最根本的是哪一个?为什么?五大共性:〔1〕体积小、面积大〔2〕吸收多、转化快〔3〕生长旺、繁殖快〔4〕适应强、易变异〔5〕分布广、种类多最根本的:〔1〕体积小、面积大原因:由于微生物是一个如此突出的小体积大面积系统,从而赋予它们具有不同于一切大生物的五大共性,因为一个小体积大面积系统,必然有一个巨大的营养物质吸收面、代谢废物的排泄面和环境信息的交换面,并由此而产生其余4个共性。

4.试述微生物的多样性(1)物种的多样性〔2〕生物代谢类型的多样性〔3〕代谢产物的多样性〔4〕遗传基因的多样性〔5〕生态类型的多样性5.微生物名人巴斯德(1)否认“自生说〞(2)预防接种(3)证明发酵是由微生物引起的(4)创造巴斯德消毒法第一章原核生物的形态、构造和功能1.细菌的根本形态分为几种?测量微生物大小常用单位是什么?细菌的形态极其简单,根本上只有球状、杆状和螺旋状三大类,仅少数为其他形状,如丝状,三角形,方形和圆盘形。

量度细菌大小的单位是um,而度量其亚细胞构造那么要用nm作单位。

2.试述G+和G-细菌细胞壁构G+:厚度大〔20~80nm〕,化学组成简单,一般含90%肽聚糖和10%磷壁酸N-乙酰氨基葡萄糖〔G〕肽聚糖形成坚硬的多层三维网状结构N-乙酰胞壁酸〔N〕G+ 四肽链-肽桥交联甘油型磷壁酸核糖醇型G-:厚度较G+细菌薄,层次较多,成分较复杂,肽聚糖层很薄〔仅2~3cm〕故机械强度较G+细菌弱,主要包括外膜,肽聚糖层,壁膜间隙三个局部。

古菌、细菌和真核生物

古菌、细菌和真核生物

古菌、细菌和真核生物古菌、细菌和真核生物00三域系统三域系统是由Carl Woese在1990年提出的生物分类﹐将原核生物分成了两大类﹐起初称为真细菌(Eubacteria)和古细菌(Archaebacteria).Woese 依据16S rRNA序列上的差别﹐认为这两组生物和真核生物从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来﹐因此将三者各划为一类﹐作为比界高的分类系统,称作"域"(Domain)或者"总界"(Superkingdom).目前这三域分别命名为细菌域(Bacteria)﹑古菌域(Archaea)和真核域(Eukarya).然而﹐rRNA树有可能将进化太快的类群放错位置(比如微孢子虫).有人认为生物的根应该在真细菌之内﹐很多真细菌的类群在古细菌之前分支出来﹐很晚古细菌和真核生物才彼此分开.三域特征比较特征细菌(Bacteria) 古菌(Archaea) 真核生物(Eukarya)形态和遗传原核细胞结构是是否共价闭合环状DNA 是是否组蛋白无有有被膜包围的核无无有细胞壁含胞壁酸不含胞壁酸不含胞壁酸膜脂质酯键连接醚键连接酯键连接核糖体大小 70S 70S 80S起始tRNA 甲酰蛋氨酸蛋氨酸蛋氨酸多数基因中有内含子否否是操纵子有有无mRNA加帽和聚A尾无无有质粒有有稀少核糖体对白喉毒素敏感否是是RNA聚合酶 1个(4亚基) 几个(各8~12亚基) 3个(各12~14亚基)需要转录因子否是是启动子结构 -10和-35序列 TATA框TATA框生理产甲烷作用无有无硝化有无无脱氮有有无固氮有有无基于叶绿素的光合作用有无有(在叶绿体中)基于视紫红质的能量代谢有有无化能无机营养(Fe, S, H2) 有有无气泡有有无聚-b-羟基脂肪酸作为碳储存颗粒有有无在80℃以上生长有有无原核生物Procaryotic organism原核生物(Procaryotic organism) 是由原核细胞组成的生物,包括蓝细菌、细菌、古细菌、放线菌、立克次氏体、螺旋体、支原体和衣原体等.原核生物具有以下的特点:①核质与细胞质之间无核膜因而无成形的细胞核;②遗传物质是一条不与组蛋白结合的环状双螺旋脱氧核糖核酸(DNA)丝,不构成染色体(有的原核生物在其主基因组外还有更小的能进出细胞的质粒DNA);③以简单二分裂方式繁殖,无有丝分裂或减数分裂;④没有性行为,有的种类有时有通过接合、转化或转导,将部分基因组从一个细胞传递到另一个细胞的准性行为(见细菌接合);⑤没有由肌球、肌动蛋白构成的微纤维系统,故细胞质不能流动,也没有形成伪足、吞噬作用等现象;⑥鞭毛并非由微管构成,更无"9+2"的结构,仅由几条螺旋或平行的蛋白质丝构成;⑦细胞质内仅有核糖体而没有线粒体、高尔基器、内质网、溶酶体、液泡和质体(植物)、中心粒(低等植物和动物)等细胞器;⑧细胞内的单位膜系统除蓝细菌另有类囊体外一般都由细胞膜内褶而成,其中有氧化磷酸化的电子传递链(蓝细菌在类囊体内进行光合作用,其他光合细菌在细胞膜内褶的膜系统上进行光合作用;化能营养细菌则在细胞膜系统上进行能量代谢);⑨在蛋白质合成过程中起重要作用的核糖体散在于细胞质内,核糖体的沉降系数为 70S;⑩大部分原核生物有成分和结构独特的细胞壁等等.总之原核生物的细胞结构要比真核生物的细胞结构简单得多.70年代分子生物学的资料表明:产甲烷细菌、极端嗜盐细菌、极端耐酸耐热的硫化叶菌和嗜热菌质体等的16S rRNA核苷酸序列,既不同于一般细菌,也不同于真核生物.此外,这些生物的细胞膜结构、细胞壁结构、辅酶、代谢途径、tRNA和rRNA的翻译机制均与一般细菌不同.因而有人主张将上述的生物划归原核生物和真核生物之外的"第三生物界"或古细菌界.与真核生物的种类相比,已发现的原核生物种类虽不甚多,但其生态分布却极其广泛,生理性能也极其庞杂.有的种类能在饱和的盐溶液中生活;有的却能在蒸馏水中生存;有的能在0℃下繁殖;有的却以70℃最适温度;有的是完全的无机化能营养菌,以二氧化碳为唯一碳源;有的却只能在活细胞内生存.在行光合作用的原核生物中,有的放氧,有的不放氧;有的能在PH为10以上的环境中生存,有的只能在PH为1 左右的环境中生活;有的只能在充足供应氧气的环境中生存,而另外一些细菌却对氧的毒害作用极其敏感.有的可利用无机态氮,有的却需要有机氮才能生长;还有的能利用分子态氮作为唯一的氮源等.古细菌archaeobacteria古细菌(archaeobacteria) (又可叫做古生菌或者古菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中.具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组蛋白;此外还具有既不同于原核细胞也不同于真核细胞的特征,如:细胞膜中的脂类是不可皂化的;细胞壁不含肽聚糖,有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于肽聚糖,但都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸.历史古细菌这个概念是1977年由Carl Woese和George Fox提出的,原因是它们在16SrRNA的系统发生树上和其它原核生物的区别.这两组原核生物起初被定为古细菌(Archaebacteria)和真细菌(Eubacteria)两个界或亚界.Woese认为它们是两支根本不同的生物,於是重新命名其为古菌(Archaea)和细菌(Bacteria),这两支和真核生物(Eukarya)一起构成了生物的三域系统.古菌、细菌和真核生物在细胞结构和代谢上,古菌在很多方面接近其它原核生物.然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上,它们并不明显表现出细菌的特徵,反而非常接近真核生物.比如,古菌的转译使用真核的启动和延伸因子,且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB.古菌还具有一些其它特徵.与大多数细菌不同,它们只有一层细胞膜而缺少肽聚糖细胞壁.而且,绝大多数细菌和真核生物的细胞膜中的脂类主要由甘油酯组成,而古菌的膜脂由甘油醚构成.这些区别也许是对超高温环境的适应.古菌鞭毛的成分和形成过程也与细菌不同.基於rRNA序列的系统发生树,显示了可明显区别的三支:细菌(Bacteria)、古菌(Archaea)和真核生物(Eukarya)生存环境很多古菌是生存在极端环境中的.一些生存在极高的温度(经常100℃以上)下,比如间歇泉或者海底黑烟囱中.还有的生存在很冷的环境或者高盐、强酸或强碱性的水中.然而也有些古菌是嗜中性的,能够在沼泽、废水和土壤中被发现.很多产甲烷的古菌生存在动物的消化道中,只有在熟识国际游戏规则的情况下,如反刍动物、白蚁或者人类.古菌通常对其它生物无害,且未知有致病古菌.形态单个古菌细胞直径在0.1到15微米之间,有一些种类形成细胞团簇或者纤维,长度可达200微米.它们可有各种形状,如球形、杆形、螺旋形、叶状或方形.它们具有多种代谢类型.值得注意的是,盐杆菌可以利用光能制造ATP,尽管古菌不能像其他利用光能的生物一样利用电子链传导实现光合作用.进化和分类从rRNA进化树上,古菌分为两类,泉古菌(Crenarchaeota)和广古菌(Euryarchaeota).另外未确定的两类分别由某些环境样品和2002年由Karl Stetter发现的奇特的物种纳古菌(Nanoarchaeum equitans)构成.Woese认为细菌、古菌和真核生物各代表了一支具有简单遗传机制的远祖生物的后代.这个假说反映在了"古菌"的名称中(希腊语archae为"古代的").随后他正式称这三支为三个域,各由几个界组成.这种分类后来非常流行,但远组生物这种思想本身并未被普遍接受.一些生物学家认为古菌和真核生物产生於特化的细菌.古菌和真核生物的关系仍然是个重要问题.除掉上面所提到的相似性,很多其他遗传树也将二者并在一起.在一些树中真核生物离广古菌比离泉古菌更近,监听器,但生物膜化学的结论相反.然而,在一些细菌,(如栖热袍菌)中发现了和古菌类似的基因,使这些关系变得复杂起来.一些人认为真核生物起源於一个古菌和细菌的融合,二者分别成为细胞核和细胞质.这解释了很多基因上的相似性,但在解释细胞结构上存在困难.目前有22个古菌基因组已经完全结束了测序,另外15个的测序工作正在进行中.代表性古细菌极端嗜热菌(themophiles):能生长在90℃以上的高温环境.如斯坦福大学科学家发现的古细菌,最适生长温度为100℃,80℃以下即失活,德国的斯梯特(K. Stetter)研究组在意大利海底发现的一族古细菌,能生活在110℃以上高温中,最适生长温度为98℃,降至84℃即停止生长;美国的J. A. Baross发现一些从火山口中分离出的细菌可以生活在250℃的环境中.嗜热菌的营养范围很广,多为异养菌,其中许多能将硫氧化以取得能量.极端嗜盐菌(extremehalophiles):生活在高盐度环境中,盐度可达25%,如死海和盐湖中.极端嗜酸菌(acidophiles):能生活在pH值1以下的环境中,往往也是嗜高温菌,窃听卡,生活在火山地区的酸性热水中,能氧化硫,硫酸作为代谢产物排出体外.极端嗜碱菌(alkaliphiles):多数生活在盐碱湖或碱湖、碱池中,生活环境pH值可达11.5以上,最适pH值8~10.产甲烷菌(metnanogens):是严格厌氧的生物,能利用CO2使H2氧化,生成甲烷,同时释放能量.CO2+4H2rCH4+2H2O+能量补充资料二分法和三域学说地球上究竟有几种生命形式?当亚里士多德建立生物学时,他用二分法则将生物分为动物和植物.显微镜的诞生使人们发现了肉眼看不见的细菌.细菌在细胞结构上与动植物的最根本差别是,动植物细胞内有细胞核,遗传物质DNA 主要储存于此,而细菌则没有细胞核,DNA游离于细胞质中.由于动物与植物的差别小于它们与细菌的差别,沙东(E. Chatton)于1937年提出了生物界新的二分法则,即生物分为含细胞核的真核生物和不含细胞核的原核生物.动植物属于真核生物,而细菌属于原核生物.1859年达尔文发表《物种起源》以后,生物学家便开始建立基于进化关系而非表型相似性的分类系统,即所谓系统发育分类系统.可是,由于缺乏化石记录,这种分类方法长期未能有效运用于原核生物的分类.1970年代,随着分子生物学的发展,伍斯终于在这方面获得了意义重大的突破.在漫长的进化过程中,每种生物细胞中的信息分子(核酸和蛋白质)的序列均不断发生着突变.许多信息分子序列变化的产生在时间上是随机的,进化速率相对恒定,即具有时钟特性.因此,物种间的亲缘关系可以用它们共有的某个具有时钟特性的基因或其产物(如蛋白质)在序列上的差别来定量描述.这些基因或其产物便成了记录生物进化历程的分子记时器(chronometer).显然,这种记录生物系统发育历程的分子记时器应该广泛分布于所有生物之中.基于这一考虑,伍斯选择了一种名为小亚基核糖体核酸(SSU rRNA)的分子,作为分子记时器.这种分子是细胞内蛋白质合成机器mm核糖体的一个组成部分,而蛋白质合成又是几乎所有生物生命活动的一个重要方面.因此,把SSU rRNA分子作为分子记时器是合适的.在比较了来自不同原核及真核生物的SSU rRNA序列的相似性后,伍斯发现原先被认为是细菌的甲烷球菌代表着一种既不同于真核生物,也不同于细菌的生命形式.考虑到甲烷球菌的生活环境可能与生命诞生时地球上的自然环境相似,伍斯将这类生物称为古细菌.据此,伍斯于1977年提出,生物可分为三大类群,即真核生物、真细菌和古细菌.基于SSU rRNA分析结果的泛系统发育(进化)树随后诞生了.进一步的研究表明,进化树上的第一次分叉产生了真细菌的一支和古细菌/真核生物的一支,古细菌和真核生物的分叉发生在后.换句话说,古细菌比真细菌更接近真核生物.据此,1990年伍斯提出了三域分类学说:生物分为真核生物、真细菌和古细菌三域,域被定义为高于界的分类单位.为突出古细菌与真细菌的区别,伍斯将古细菌更名为古菌.真细菌改称细菌.三域学说使古菌获得了与真核生物和细菌等同的分类学地位.自诞生之日起,伍斯的三域学说便遭到部分人,特别是微生物学领域外的人反对.反对者坚持认为:原核与真核的区分是生物界最根本的、具有进化意义的分类法则;与具有丰富多样性表型的真核生物相比,古菌与细菌的差异远没有大到需要改变二分法则的程度.但在詹氏甲烷球菌基因组序列测定完成前的近20年中,采用多种分子记时器进行的系统发育学研究一再证明,古菌是一种独特的生命形式.三域学说的第一个基因组学证据尽管对古菌已有了上述认识,当人们第一次面对詹氏甲烷球菌的全基因组序列时,监听卡又萌发出了旺盛的生命力.,还是大吃了一惊.詹氏甲烷球菌共有1738个基因,其中人们从未见过的基因竟占了56%!相比之下,在这之前完成测序的流感嗜血菌(Haemophilus influenzae)和生殖道枝原体(Mycoplasma genitalium)基因组中未知基因仅占20%左右.于是人们终于在基因组水平上认识到,古菌是一种崭新的生命形式.更有趣的是,詹氏甲烷球菌基因组中占总数44%的那些功能或多或少已经知道的基因似乎勾勒出了古菌与另两类生物之间的进化关系:古菌在产能、细胞分裂、代谢等方面与细菌相近,而在转录、翻译和复制方面则与真核生物类似.换言之,一个生活在大洋底部热溢口处的、习性古怪的微生物,在遗传信息传递方面竟有着与人(而不是与人的消化道中细菌)相似的基因!在赞叹生命奇妙的同时,许多人开始欢呼三域学说的最终确立.美国《科学》周刊在把詹氏甲烷球菌基因组序列测定工作列为1996年度重大科学突破之一时宣称,这一成果使围绕三域学说的争论差不多可以结束了.对伍斯进化树的新挑战就在古菌的悬念似乎行将消失时,接踵而来的新发现却使人们重新陷入困惑之中.各类完整的微生物基因组序列一个接一个出现在人们轻点鼠标便可查阅的数据库中,在已发表的18种生物基因组序列中,古菌的占了4个.采用更灵敏的方法对这些基因组(包括詹氏甲烷球菌基因组)进行分析,得到了令人吃惊的结果:詹氏甲烷球菌基因组中只有30%(不是先前估计的半数以上)的基因编码目前未知的功能,这与细菌基因组相近.古菌的神秘性和独特性因此减少了许多.对三域学说更为不利的是,多国语言翻译机,在詹氏甲烷球菌的那些可以推测功能的基因产物(蛋白质)中,44%具有细菌蛋白特征,只有13%的像真核生物的蛋白质.在另一个古菌,嗜热碱甲烷杆菌(Methanobacterium thermoaotutrophicum)的基因组中也有类似情况.因此,从基因组比较的数字上看,古菌与细菌间的差异远小于古菌与真核生物间的差异,不足以说服三域学说的反对者.更令人难以理解的是,利用同一生物中不同基因对该物种进行系统发育学定位常常会得到不同的结果.最近,一种能在接近沸点温度下生长的细菌(Aquifex aeolicus)的基因组序列测定完成.对该菌的几个基因进行的系统发育学研究表明:如果用参与细胞分裂调控的蛋白质FtsY作为分子记时器,该菌与伍斯进化树上位于细菌分枝的一个土壤细菌mm枯草芽孢杆菌相近;如果以一种参与色氨酸合成的酶为准,该菌应属于古菌;而当比较该菌和其他生物的合成胞苷三磷酸(DNA的基本结构单位之一)的酶时,竟发现古菌不再形成独立的一群.看来不同的基因似乎在诉说不同的进化故事.那么,古菌还能是独特的、统一的生命形式吗?属于真核生物的啤酒酵母基因组序列测定完成后,三域学说遇到了更大危机.酵母细胞核基因中,与细菌基因有亲缘关系的比与古菌有亲缘关系的多一倍.有人还对在三种生命形式中都存在的34个蛋白质家族进行了分析,发现其中17个家族来源于细菌,只有8个显示出古菌与真核生物的亲缘关系.如果伍斯进化树正确、古菌与真核生物在进化历程中的分歧晚于两者与细菌的分歧的话,那么怎样才能解释上面这些结果呢?根据细胞进化研究中流行的内共生假说,真核细胞细胞器(线粒体、叶绿体)的产生源于细菌与原真核生物在进化早期建立的内共生关系.在这种关系中,真核细胞提供稳定的微环境,内共生体(细菌)则提供能量,久而久之,内共生体演变为细胞器.真核生物细胞核中一部分源于细菌的基因可能来自线粒体,这些为数不多的基因通常编码重新运回线粒体的蛋白质分子.可是,现在发现许多源于细菌的核基因编码那些在细胞质、而不是线粒体中起作用的蛋白质.那么,这些基因从何而来呢?显然,内共生假说已不足以挽救伍斯进化树.不过,伍斯进化树也不会轻易倒下,支撑它的假说依然很多.最近,有人提出了新版的"基因水平转移"假说.根据这个假说,基因组的杂合组成是进化过程中不同谱系间发生基因转移造成的.一种生物可以采用包括吞食等方式获得另一种、亲缘关系也许很远的生物的基因.伍斯推测,始祖生物在演化形成细菌、古菌和真核生物三大谱系前,生活于可以相互交换基因的"公社"中,来自这个"史前公社"的生物可能获得了不同的基因遗产.这一切使得进化树难以枝杈分明.不过,伍斯相信,基于SSU rRNA的进化树在总体上是正确的,三种生命形式是存在的.争论在继续三年前詹氏甲烷球菌基因组序列的发表,似乎预示着一场延续了20多年的、关于地球上到底有几种生命形式的争论的终结.古菌似乎被认定为生命的第三种形式.如今,仅仅过了三年,即使最乐观的人都无法预料伍斯进化树的命运.这场仍在继续的争论中,尽管古菌的分类地位遭到质疑,但古菌这一生命形式的独特性依然得到不同程度的肯定.目前,古菌研究正在世界范围内升温,这不仅因为古菌中蕴藏着远多于另两类生物的、未知的生物学过程和功能,以及有助于阐明生物进化规律的线索,而且因为古菌有着不可估量的生物技术开发前景.古菌已经一次又一次让人们吃惊,可以肯定,在未来的岁月中,这群独特的生物将继续向人们展示生命的无穷奥秘.真细菌Bacteria, eubacteria真细菌(Bacteria, eubacteria)除古细菌以外的所有细菌均称为真细菌.最初用于表示"真"细菌的名词主要是为了与其他细菌相区别.古菌域Archaea古细菌(古菌)是原核生物中的一大类.它们既与细菌(真细菌)有很多相似之处,同时另一些特征相似于真核生物.历史古细菌这个概念是1977年由Carl Woese和George Fox提出的,原因是它们在16SrRNA的系统发生树上和其它原核生物的区别.这两组原核生物起初被定为古细菌(Archaebacteria)和真细菌(Eubacteria)两个界或亚界.Woese认为它们是两支根本不同的生物,于是重新命名其为古菌(Archaea)和细菌(Bacteria),这两支和真核生物(Eukarya)一起构成了生物的三域系统.古菌、细菌和真核生物在细胞结构和代谢上,古菌在很多方面接近其它原核生物.然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上,它们并不明显表现出细菌的特征,反而非常接近真核生物.比如,古菌的转译使用真核的启动和延伸因子,且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB.古菌还具有一些其它特征.与大多数细菌不同,它们只有一层细胞膜而缺少肽聚糖细胞壁.而且,绝大多数细菌和真核生物的细胞膜中的脂类主要由甘油酯组成,而古菌的膜脂由甘油醚构成.这些区别也许是对超高温环境的适应.古菌鞭毛的成分和形成过程也与细菌不同.生境很多古菌是生存在极端环境中的.一些生存在极高的温度(经常100℃以上)下,比如间歇泉或者海底黑烟囱中.还有的生存在很冷的环境或者高盐、强酸或强碱性的水中.然而也有些古菌是嗜中性的,能够在沼泽、废水和土壤中被发现.很多产甲烷的古菌生存在动物的消化道中,如反刍动物、白蚁或者人类.古菌通常对其它生物无害,且未知有致病古菌.形态单个古菌细胞直径在0.1到15微米之间,有一些种类形成细胞团簇或者纤维,长度可达200微米.它们可有各种形状,如球形、杆形、螺旋形、叶状或方形.它们具有多种代谢类型.值得注意的是,盐杆菌可以利用光能制造ATP,尽管古菌不能像其他利用光能的生物一样利用电子链传导实现光合作用.进化和分类从rRNA进化树上,古菌分为两类,泉古菌(Crenarchaeota)和广古菌(Euryarchaeota).另外未确定的两类分别由某些环境样品和2002年由Karl Stetter发现的奇特的物种纳古菌(Nanoarchaeum equitans)构成.Woese认为细菌、古菌和真核生物各代表了一支具有简单遗传机制的远祖生物的后代.这个假说反映在了"古菌"的名称中(希腊语archae为"古代的").随后他正式称这三支为三个域,各由几个界组成.这种分类后来非常流行,英语翻译机,但远祖生物这种思想本身并未被普遍接受.一些生物学家认为古菌和真核生物产生于特化的细菌.古菌和真核生物的关系仍然是个重要问题.除掉上面所提到的相似性,很多其他遗传树也将二者并在一起.在一些树中真核生物离广古菌比离泉古菌更近,但生物膜化学的结论相反.然而,在一些细菌,(如栖热袍菌)中发现了和古菌类似的基因,使这些关系变得复杂起来.一些人认为真核生物起源于一个古菌和细菌的融合,二者分别成为细胞核和细胞质.这解释了很多基因上的相似性,但在解释细胞结构上存在困难.目前有22个古菌基因组已经完全结束了测序,另外15个的测序工作正在进行中.。

古细菌

古细菌

古细菌姓名:唐选盼学号:20092113310050 班级:09海科2班定义古细菌(archaeobacteria)(又可叫做古生菌、古菌、古核生物的结构核细胞或原细菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中。

具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组蛋白;此外还具有既不同于原核细胞也不同于真核细胞的特征,如:细胞膜中的脂类是不可皂化的;细胞壁不含肽聚糖,有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于肽聚糖,但都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸。

常生活于热泉水、缺氧湖底、盐水湖等极端环境中的原核生物。

具有一些独特的生化性质,如膜脂由醚键而不是酯键连接。

在能量产生与新陈代谢方面与真细菌有许多相同之处,而复制、转录和翻译则更接近真核生物。

古核生物与真核生物可能共有一个由真细菌的祖先歧化而来的共同祖先。

生存环境及形态很多古菌是生存在极端环境中的。

一些生存在极高的温度(经常100℃以上)下,比如间歇泉或者海底黑烟囱中。

还有的生存在很冷的环境或者高盐、强酸或强碱性的水中。

然而也有些古菌是嗜中性的,能够在沼泽、废水和土壤中被发现。

很多产甲烷的古菌生存在动物的消化道中,如反刍动物、白蚁或者人类。

古菌通常对其它生物无害,且未知有致病古菌演化和分类从rRNA演化树上,古菌分为两类,泉古菌门(Crenarchaeota)和广古菌门(Euryarchaeota)。

另外未确定的两类分别由某些环境样品和2002年由Karl Stetter发现的奇特的物种纳古菌门(Nanoarchaeum equitans)构成。

Woese认为细菌、古菌和真核生物各代表了一支具有简单遗传机制的远祖生物的后代。

这个假说反映在了“古菌”的名称中(希腊语archae为“古代的”)。

随后他正式称这三支为三个域,各由几个界组成。

细菌和病毒之间的区别

细菌和病毒之间的区别
消毒时请使用漂白剂,因为它可以有效杀死细菌。
洗手
使用酒精和洗手液
保持良好的卫生习惯
避免触摸脸部,因为有机物可以通过脸部的粘膜进入。
咳嗽或打喷嚏时要掩住口鼻。
消毒时请使用漂白剂,因为它可以有效杀死病毒。
相似点
没有核
两者都引起疾病
两者都在微观上
两者都有毒力
没有核
两者都引起疾病
两者都在微观上
两者都有毒力
他们拥有蜂窝机械。
他们没有手机。
好处
它们可以归类为有害或有益。一些细菌被认为是有益或健康的,尤其是在肠道中发现的细菌。
它们是有害的,但有些用于基因工程目的。
感染能力/感染性质
它们引起局部感染。
它们引起全身感染。
感染持续多长时间?
他们持续超过10天。
疾病的持续时间在2到10天之间。
它会引起发烧吗?
他们引起发烧。
他们感染了什么?
他们感染所有生命形式。
它们可以感染各种生命,包括细菌和古细菌。
在哪里可以找到它们?
它们存在于生态系统中。
它们存在于地球的生态系统中。
它们如何可视化?
在光学显微镜下可以看到它们。
它们通过负染可视化。
繁殖要求
细菌可以在没有宿主的情况下生长和繁殖。
病毒需要宿主才能在宿主内部复制时进行繁殖。
常用名称和菌株
芽孢杆菌
球菌
霍乱弧菌
立克次体
金黄色葡萄球菌
幽门螺杆菌
肺炎链球菌
甲型肝炎病毒
乳头瘤病毒
伊波拉病毒
汉坦病毒
轮状病毒
SARS冠状病毒
SARS-CoV-2
寨卡病毒
奈罗病毒
如何预防感染的传播?

【地球生物全系列——从单细胞到人类】古细菌界(上)

【地球生物全系列——从单细胞到人类】古细菌界(上)

【地球生物全系列——从单细胞到人类】古细菌界(上)古细菌界(上)所谓古细菌就是远古时代特殊生态环境下生活的细菌,其生活习性和化学组成都很特殊。

它适合生活于高温、高盐和缺氧的环境。

细胞壁不含肽聚糖;细胞膜的脂类与其他任何生物都不一样;RNA聚合酶和核糖体中的一种蛋白质都和真核细胞相似而和原核细胞不同。

它们可能是地球形成初期古老细菌的代表,保持了古老的形态,很早就和其他细菌分道扬镳。

所以,有人主张把古细菌从原核生物中划出来另立一个古细菌界,与原核生物、真核生物并列为界。

人类在发现和研究微生物之前,把一切生物分成截然不同的两大界——动物界和植物界。

随着人们对微生物认识的逐步深化,从两界系统经历过三界系统、四界系统、五界系统甚至六界系统,直到70年代后期,发现了地球上的第三生命形式-古菌,才导致了生命三域学说的诞生。

该学说认为生命是由古菌域(Archaea)、细菌域(Bacteria)和真核生物域(Eucarya)所构成。

“古细菌”这个概念第一次出现是在1977年,由卡尔·乌斯和乔治·福克斯提出的,原因是它们在16S核糖体RNA的系统发生树上和其它原核生物的区别。

这两组原核生物起初被定为古细菌和真细菌两个界或亚界(当时乌斯与福克斯更倾向于用“总界”一词)。

后来乌斯认为它们是两支根本不同的生物,于是在1990年重新命名其为古菌和细菌,并将这两支和真核生物划为域这一新建立的分类阶元,一起构成了生物的三域系统。

起初只有一些产甲烷菌(英语:methanogen)属于这个新域,这些古菌以一些极端环境为栖息地,比如温泉和盐湖。

到20世纪末,微生物学家意识到古菌是一个庞大而多元化的群体,不只局限于极端环境,而是广泛存在于自然界中,如土壤和海洋里。

由于聚合酶链式反应(PCR)被大量用于探测采样土壤或水中的原核生物的核酸,古菌的重要性和独特性得到新的重视。

PCR方法可以不经细菌培养(英语:microbiological culture)而直接探测和鉴别微生物。

界(生物学分类)

界(生物学分类)

四界系统
在三界分类系统,由于真菌与植物和动物在结构、营养方式上和消化方式上的明显差异,所以在 1959年美 国生物学家魏泰克(R·H·Whittaker)提出了另立真菌界的四界(原生生物界、真菌界、植物界和动物界)分 类系统。
五界系统
魏泰克(aker)在 1969年又提出将生物分成五个界.。生物分类学上使用较广的是五界分类系统。魏泰克在 已区分了植物与动物、原核生物与真核生物的基础上,又根据真菌与植物在营养方式和结构上的差异,把生物界 分成了原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界和动物界五界。其中的原生生物界包括一切真核的单细胞生物 和没典型细胞分化的多细胞生物。魏泰克认为,这些生物处于进化的低级阶段,它们之间是没有清楚界限的,因 此,可以放在一个界中。但是,有些分类学家则主张将它们分别放到动物界或植物界中,对于那些同时具有动物 和植物两方面特征的生物,可以既收入植物界,也收入动物界,承认它们的“双重身份”。五界系统按复杂性增 加的三个层次排列生命:原核的单细胞(原核生物界);真核的单细胞(原生生物界);真核的多细胞(植物界、 真菌界和动物界)。随着生物层次的上升,生物变得愈加多样化,因为生物结构和功能复杂性的增加,变异的机 会增多。多细胞生命的三个界代表了一种生态的和形态的分类。植物(生产)、真菌(还原)和动物(消费)代 表了我们这个世界上三种主要生存方式。五界系统:原核生物界、原生生物界、植物界、菌物界、动物界。
界(生物学分类)
生物学分类
01 简述
03பைடு நூலகம்三界系统
目录
02 两界系统 04 四界系统
05 五界系统
07 六界
目录
06 两总界五界 08 十界
在很长一段时间里,界(Kingdom)是生物科学分类法中最高的类别。一开始人只将生物分为动物和植物两 界,微生物被发现后,也长时期被分入动物或植物界:好动的微生物被分入动物界,有色素的细菌(藻类)被分 为植物,有些甚至被同时放入两界。

微生物的分类

微生物的分类

微生物的分类.txt∞-一人行,必会发情二人行,必会激情三人行,必有奸情就不会被珍惜。

真实的女孩不完美,完美的女孩不真实。

得之坦然,失之淡然,顺其自然,争其必然。

三域学说的建立(1)古细菌原界(Archaebacteria) ,包括产甲烷细菌,极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌;(2)真细菌原界(Eubacteria) ,包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物;(3)真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物,真菌,动物和植物.2,微生物分类学经典分类学:按微生物表型分类微生物系统学:按亲缘关系和进化规律分类发展表型特征:形态学,生理生化学,生态学等,推断微生物的系统发育.表型特征结合分子水平上比较微生物的基因型特征(如16S rRNA)探讨微生物进化,系统发育和分类鉴定.★微生物分类学的三个任务:分类,鉴定及命名☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的分类类群.☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程.☆命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称.种是最基本的分类单位每一分类单位之后可有亚门,亚纲,亚目,亚科...种(species):是一个基本分类单位;是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其接近,与同属内其他种有明显差别的菌株的总称.菌株(strain): 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代(起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群).因此,一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株.菌株强调的是遗传型纯的谱系.例如:大肠埃希氏杆菌的两个菌株:Escherichia coli B 和Escherichia coli K12★菌株的表示法:★种是分类学上的基本单位,菌株是实际上应用的基本单位,因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别!亚种(subspecies)或变种(variety):为种内的再分类.当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传形状,而又不足以区分成新种时,可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元——亚种.变种是亚种的同义词,因"变种"一词易引起词义上的混淆,从1976年后,不在使用变种一词.通常把实验室中所获得的变异型菌株,称之为亚种.如:E.coli k12(野生型)是不需要特殊aa的,而实验室变异后,可从k12获得某aa的缺陷型,此即称为E.coli k12的亚种.型(form):常指亚种以下的细分.当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时,可以细分为不同的型.例如:按抗原特征的差异分为不同的血清型;学名—是微生物的科学名称,它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的.学名由拉丁词,或拉丁化的外来词组成.学名的命名有双名法和三名法两种.①双名法:学名=属名+种名+(首次定名人)+现定名人+定名年份属名:拉丁文的名词或用作名词的形容词,单数,首字母大写,表示微生物的主要特征,由微生物构造,形状或由科学家命名.种名:拉丁文形容词,字首小写,为微生物次要特征,如微生物色素,形状,来源或科学家姓名等.4,微生物的命名必要,用斜体表示可省略,用正体字微生物的名字有俗名和学名两种.如: 红色面包霉———粗糙脉孢霉绿脓杆菌———铜绿假单胞菌例:大肠埃希氏杆菌Escherichia coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus Rosenbach 1884◆当泛指某一属微生物,而不特指该属中某一种(或未定种名)时,可在属名后加sp.或ssp.(分别代表species 缩写的单数和复数形式)例如:Saccharomyces sp.表示酵母菌属中的一个种.◆菌株名称——在种名后面自行加上数字,地名或符号等,如: Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia SinicaBacillus subtilis BF7658 BF=北纺Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌ATCC=American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心◆当文章中前面已出现过某学名时,后面的可将其属名缩写成1~3个字母.如:Escherichia coli 可缩写成 E.coliStaphylococcus aureus可缩写成 S. aureus②三名法:用于对亚种的命名,这时在属和种名后加写一个subsp.,然后再附上亚种名称(斜排体). 如:Bacillus thuringiensis subsp. galleria苏云金芽孢杆菌腊螟亚种形态结构,生理生化,少量的化石资料,行为习性,等等表型特征:5, 进化指征的选择:b)形态特征在不同类群中进化速度差异很大,仅根据形态推断进化关系往往不准确;缺点:a)由于微生物可利用的形态特征少,很难把所有生物放在同一水平上进行比较;蛋白质,RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化速率相对恒定,也就是说,分子序列进化的改变量(氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化的时间成正比.生物大分子作为进化标尺依据a)在两群生物中,如果同一种分子的序列差异很大时,------------进化距离远,进化过程中很早就分支了.b)如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同,------------处在同一进化水平上.大量的资料表明:功能重要的大分子,或者大分子中功能重要的区域,比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低.RNA作为进化的指征16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的"分子尺":1)rRNA具有重要且恒定的生理功能;2)在16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究;3)16SrRNA分子量大小适中,便于序列分析;4)rRNA在细胞中含量大(约占细胞中RNA的90%),也易于提取;5)16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源分子是18SrRNA).因此它可以作为测量各类生物进化的工具.Eubacteria(真细菌界)Archaebacteria(古细菌界)Eukarya(真核生物界)Carl Woese利用16SrRNA建立分子进化树微生物(病毒)古生菌(Archaea)细菌(Bacteria)真菌(酵母,霉菌,蕈菌等),单细胞藻类,原生动物等非细胞型细胞型原核微生物真核微生物(Eukarya)古生菌在进化谱系上与真细菌及真核生物相互并列,且与后者关系更近,而其细胞构造却与真细菌较为接近,同属于原核生物.6,微生物分类鉴定的特征和技术形态学特征,生理学特征,生态学特征6.1 生物分类的传统指标:☆形态学特征培养特征,运动性,特殊的细胞结构,细胞形态及其染色特性,等等微生物分类和鉴定的重要依据之一:a)易于观察和比较,尤其是真核微生物和具有特殊形态结构的细菌;b)许多形态学特征依赖于多基因的表达,具有相对的稳定性;与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关;代谢产物等营养类型;与氧的关系;对温度的适应性;对pH的适应性;对渗透压的适应性;酶及蛋白质都是基因产物;对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较;测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多;常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种,亚种或菌株.★生态特性包括在自然界的分布情况,与其他生物有否寄生或共生关系, 宿主种类及与宿主关系, 有性生殖情况, 生活史等.★血清学反应6.2 核酸的碱基组成和分子杂交特点:与形态及生理生化特性的比较不同,对DNA的碱基组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微生物之间基因组的差异,因此结果更加可信.(1) DNA的碱基组成(G+Cmol%)DNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征,即使个别基因突变,碱基组成也不会发生明显变化.分类学上,用G+C占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol%)来表示各类生物的DNA碱基因组成特征.◆每个生物种都有特定的GC%范围,因此后者可以作为分类鉴定的指标.细菌的GC%范围为25--75%,变化范围最大,因此更适合于细菌的分类鉴定.◆GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定,并可检验表型特征分类的合理性,从分子水平上判断物种的亲缘关系.使用原则:G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定每一种生物都有一定的碱基组成,亲缘关系近的生物,它们应该具有相似的G+C含量,若不同生物之间G+C含量差别大表明它们关系远.但具有相似G+C含量的生物并不一定表明它们之间具有近的亲缘关系.同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4~5%以下;同属不同种的差别应低于10~15%;G+C 含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基本特征,它对于种,属甚至科的分类鉴定有重要意义.若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的菌株,如果其G+C含量的差别大于5%,则肯定不是同一个种,大于15%则肯定不是同一个属.在疑难菌株鉴定,新种命名,建立一个新的分类单位时,G+C含量是一项重要的,必不可少的鉴定指标.其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特征和把那些G+C含量差别大的种类排除出某一分类单元.G+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定(2) 核酸的分子杂交不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近,碱基排列顺序差异越小,它们之间的亲缘关系就越近,反之亦然.核酸分子杂交(hybridization)间接比较不同微生物DNA碱基排列顺序的相似性a)DNA-DNA杂交;(亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较)b)DNA-rRNA杂交;(亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较)c)核酸探针;(利用特异性的探针,用于细菌等的快速鉴定)(3) 16SrRNA或18SrRNA的核酸序列分析16SrRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的"分子尺":16SrRNA的序列高度保守,可精确指示细菌之间的亲缘关系16SrRNA的大小为1500bp左右,所含信息能反映生物界进化关系,易操作,适用于各级分类单元目前常用的是建立在PCR技术基础上的16SrRNA基因的直接测序法,方便快捷.《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D.Bergey)(1860-1937)1957年第七版后,由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如1974年第八版,撰稿人多达130多位,涉及15个国家;现行版本撰稿人多达300多人,涉及近20个国家),所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果,因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位.7.1 细菌分类系统7,微生物分类系统《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology)伯杰氏手册是目前进行细菌分类,鉴定的最重要依据,其特点是描述非常详细,包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法.(20世纪80年代末期)7.2 真菌分类系统真菌界分类系统很多,各国采用不同的系统,比较混乱.近年来为较多人接受的是Ainsworth 的纲要.俗名—common name简洁易懂,方便记忆,但涵义往往不够准确,还有适用范围和地区性的限制.命名—scientific name菌种的科学名称.菌种的学名是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认,并通用的名称.命名原则:学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份规定与常识:属名应大写首字母,单数,可以组合外而成.种的加词代表一个种的次要特征,首字小写第一节微生物的分类单元与其他生物的分类一样,微生物分类的基本单元也是种(species)。

海桐的界门纲目科属种

海桐的界门纲目科属种

海桐的界门纲目科属种域,生物分类法中最高的类别。

所有细胞生物分为两个结构域:没有核膜的生物(细菌和古细菌)分为原核结构域,其他为真核结构域。

现存的生物分为三个领域:细菌、古细菌和真核生物。

因生物病毒没有细胞结构,所以应归于非细胞生物,根据其结构的不同,大体将其分为:真病毒(euvirus,简称病毒virus)、亚病毒(subvirus,包括类病毒viroid、朊病毒prion、拟病毒virusoid)。

三域系统▪细菌域▪古菌域▪真核域十界未专属域:1.病毒界、2.亚病毒因子古菌域:3.古细菌界细菌域:4.细菌界真核生物域:5.囊泡藻界、6.古虫界、7.有孔虫界、8.真菌界、9.植物界、10.动物界四界法▪菌界▪原生生物界▪植物界▪动物界1.原生动物门全都是单细胞动物,是最原始的动物,其中熟悉的有眼虫、草履虫2.菱形虫门结构简单的内寄生动物,有记录的种类不多3.直泳虫门与菱形虫类似的动物4.多孔动物门也被称为海绵宝宝。

海绵是原始的多细胞动物5.扁盘动物门到目前为止,此门被丝盘虫一种动物独占6.腔肠动物门这里有水螅、水母、海葵和珊瑚7.古杯动物门“古”意思是此类动物已灭绝了,“杯”就是说它们长得像杯子8.栉水母动物门也有人把这个门归入腔肠动物门,作为栉水母纲9.扁形动物门有涡虫、吸虫、绦虫等常听说的寄生虫10.螠虫动物门海洋底栖动物,身体呈柱形或长囊形11.舌形动物门全都是“吸血不眨眼”的寄生虫,分类地位尚难确定在1994年新发现的一类动物,人类对它们所知甚少13.纽形动物门比扁形动物略高等的类似动物14.颚胃动物门体形很小,生活在浅海的细沙中,人们了解得不多15.线虫动物门一个庞大的家族,包含有很多人肚子里长过的——蛔虫16.腹毛动物门身体腹面长有纤毛的一类动物17.轮虫动物门很小,与原生动物类似18.线形动物门与线虫动物类似的一类动物19.鳃曳动物门生活在靠近两极的冷水中的海洋底栖动物,有记载的种类极少20.动吻动物门和鳃曳动物类似21.棘头虫动物门身体前端有吻的一类动物1983年才发现的一个新门,目前没有准确分类23.内肛动物门苔藓状的小动物24.环节动物门蚯蚓、蚂蟥、沙蚕……都是身体呈环节状25.环口动物门最近新发现的一类动物26.星虫动物门与前面说的螠虫动物相似27.软体动物门包含有大量常见动物28.软舌螺动物门已灭绝29.叶足动物门寒武纪的奇虾等30.缓步动物门很强的一类动物,能忍受高温、绝对零度、高辐射真空和高压31有爪动物门身体呈蠕虫状,足呈圆柱形,末端有爪,近乎灭绝动物界中种类占三分之二以上的动物33.腕足动物门像贝壳的化石就是这类动物留下的34.外肛动物门曾经与内肛动物为同一门合称苔藓动物,现已分开35.帚虫动物门又一个很小的门,又是只有10几种动物,又都是海洋底栖动物36.古虫动物门在5.3亿年前的生命大爆发中就灭绝了,在近几年才发现37.棘皮动物门熟悉的有海星、海胆、海参和海百合38.须腕动物门没有嘴和消化管的非寄生动物,生活在深海中,分类地位有争议39.异涡动物门仅2种,在波罗的海附近分布曾先后被认为扁形动物和软体动物40.毛颚动物门只有50种左右,还是海洋动物它们的身体呈蠕虫状,有人将其归为脊索动物门、肠鳃类,俗称气门。

生物分类——三域六界

生物分类——三域六界

生物分类——三域六界生物分类——三域六界三域称为细菌域(Bacteria)﹑古生菌域(Archaea)和真核生物域(Eukarya).六界分类系统即原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界、动物界,再加病毒界即六界系统三大主干:植物、动物、微生物.植物界(Plantae)生物的一界,能够通过光合作用制造其所需要的食物的多细胞生物的总称。

在不同的生物分界系统中,植物的概念及其所包括的类群也不一样,如将生物分为植物和动物两界时,植物界包括藻类、菌类、地衣、苔藓、蕨类和种子植物;在五界(六界即是在五界的基础上把病毒单立为一界的学术理论)的系统中,植物界仅包括多细胞的光合自养的类群,而菌类、地衣和单细胞藻类以及原核的蓝藻则不包括在内。

植物界和其他生物类群的主要区别是含有叶绿素,能进行光合作用,自己可以制造有机物。

此外,它们绝大多数是固定生活在某一环境,不能自由运动(少部分低等藻类例外),细胞具细胞壁;细胞具全能性,即由1个植物细胞可培养成1个植物体等。

植物覆盖着地球陆地表面的大多部分,并且在海洋、湖泊、河流和池塘中也是如此。

它们的大小、寿命差异很大,从微小的肉眼看不见的藻类到海洋中的巨藻和陆地上庞大的、寿过几千年的"世界爷"(北美红杉)都是植物。

植物在自然界生物圈中的各种大大小小的生态系统中几乎都是唯一的初级生产者。

植物和人类的关系极为密切,它是人类和其他生物赖以生存的基础。

动物界(Animalia)生物的一界,该界成员均属真核生物,包括一般能自由运动、以(复杂有机物质合成的)碳水化合物和蛋白质为食的所有生物。

动物界作为动物分类中最高级的阶元,已发现的共35门70余纲约350目,150多万种。

分布于地球上所有海洋、陆地,包括山地、草原、沙漠、森林、农田、水域以及两极在内的各种生境,成为自然环境不可分割的组成部分。

分类动物学根据自然界动物的形态、身体内部构造、胚胎发育的特点、生理习性、生活的地理环境等特点,将特点相同或相似的动物归为同一类,有脊索动物和无脊索动物两大类。

微生物学 原核生物--V12

微生物学 原核生物--V12

Protein A Protein G
The upper images show space-filled models and the lower images are ribbon representations. The antibody heavy and light chains are shown in blue and green respectively, glycosylation in orange, a Protein A fragment in purple and a Protein G fragment in yellow.
Chemical structure of lipid A as found in E. coli
脂多糖的功能 类脂A是G-菌致病物质——内毒素物质基础; LPS结构决定了表面抗原决定簇多样性;
根据LPS抗原性的测定,沙门氏菌属(Salmonella)的 抗原型多达2107种,一般都源自O-特异侧链种类 的变化。这种多变性是革兰氏阴性细菌躲避宿主 免疫系统攻击,保持感染成功的重要手段。也可 依此用灵敏的血清学方法对病原菌进行鉴定,在 传染病的诊断中有其重要意义。
含量很高(50~90) 含量很低(~10)
磷壁酸
类脂质 蛋白质
含量较高(<50) 无
一般无(<2) 无 含量较高(~20) 含量较高
革兰氏阳性和阴性细菌细胞壁成分的比:厚度大,组分简,一般只含90% 肽聚糖和10%磷壁酸
磷壁酸(teichoic acid)
链球菌: 细胞沿一个平面进行分裂,新个体不但可保 持成对的样子,并可连成链状. 如: 乳链球菌 (Streptococcus lactis) 无乳链球菌(Streptococcus agalactiae) 溶血链球菌 ( Streptococcus hemolyticus)

微生物定义、分类

微生物定义、分类

少数微生物也是人类的敌人!
•鼠疫; •天花; •艾滋病; •疯牛病;
微生物与人类关系: 微生物是一把十分锋利的双刃剑,
它在给人类带来巨大利益的同时也带 来“残忇”的破坏。它给人类带来的 利益不仅是享受,实际上也会威协到 人类的生存。
微生物分类
二、微生物分类
原核生物
真细菌、古细菌
细胞生物 生
真核生物
微生物既是人类的敌人,更是人类的朋友。
微生物是人类的朋友!
微生物是自然界物质循环的关键环节;
体内的正常菌群是人及动物健康的基本保证; 帮助消化、提供必需的营养物质、组成生理屏障
微生物可以为我们提供很多有用的物质;
微生物参与物质、能量循环
有机酸、酶、药物、疫苗、面包、奶酪、啤酒、酱油等
基因工程为代表的现代生物技术;
真菌、单细胞藻类、原生动物
物 非细胞生物
病毒、亚病毒
为了方便学生记忆Βιβλιοθήκη 微生物种类可用一句话概括“三菌、 四体、一病毒”即:细菌、真菌、放线菌,立克次氏体、 支原体、衣原体、螺旋体,病毒。
微生物定义、分类
情境:微生物知识认知 任务一:微生物定义、分类
课程:食品微生物技术
微生物定义
一、微生物定义
1.微生物及其生物分类地位
1 什么叫微生物 微生物:是一类个体微小、结构简单,肉眼不可见戒看不清
楚的微小生物的统称。
2 主要类群 包括:病毒、细菌、古菌、真菌、原生动物和藻类
(3)微生物无处不在,它和人类的关 系如何呢?

古细菌介绍

古细菌介绍

古细菌界古细菌界一类称为古细菌的有机体,与其他细菌(真细菌)一样不具有明确的细胞核,过去被一起归之于原核生物,以与有核的真核生物相区分。

古细菌界分为两种:嗜热细菌、嗜盐细菌。

1977年,美国伊斯诺斯大学进化学家卡尔·伍斯发现,古细菌与真细菌和真核生物都颇有差别,在分类学上似可单...【分类号】:Q913.84【DOI】:cnki:ISSN:10003185.0.1995-01-0131.嗜热细菌嗜热细菌只有在高温下才能良好地生长。

迄今为止已分离出50多种嗜热细菌。

在这些细菌中有一种最抗热的菌株(Phyolobous fumarii),在105℃繁殖率最高,甚至在高达113℃也能增殖。

深海极端嗜热和产甲烷细菌,备受人们关注,因为它位于生命进化系统树的根部附近,对它进行深入研究,可能有助于我们弄清世界上最早的细胞是如何生存的问题。

有人认为嗜热细菌生存的极限温度可能是150℃,若超过这一温度,无论哪种生命形式都不可避免地使维持DNA和其他重要的生命大分子完整性的化学键遭到破坏。

PCR(多聚酶链反应)中所使用的Taq酶就是从T.aquaticus嗜热细菌中分离到。

最近又从Pyrococcus furiosus分离一种Pfu聚合酶取代了Taq酶,Pfu酶在100℃时能最好地发挥作用。

2.嗜盐细菌它能在极端地盐环境下生长和繁殖,特别是在天然地盐湖和太阳蒸发盐池中生存。

由渗透势原理可知,高盐溶液中的细胞将失去更多的水分,成为脱水细胞。

而嗜盐细菌可产生大量的内溶质或保留从外部取得溶质的方式来维持自身的生存,如嗜盐杆菌(Halobacterium salinarum)在其细胞质内浓缩了高浓度氯化钾,其中有一种酶只有在高浓度的氯化钾中,才有活性,才能发挥其功能。

而与环境中盐类接触的盐杆菌,其细胞质中的蛋白质需要有高浓度的氯化钠才能发挥作用。

所谓古细菌就是远古时代特殊生态环境下生活的细菌,其生活习性和化学组成都很特殊。

古细菌、细菌染色法

古细菌、细菌染色法

16sRNA核小体内含子古细菌古细菌(archaeobacteria) (又可叫做古生菌或者古菌)是一类很特殊的细菌,多生活在极端的生态环境中。

具有原核生物的某些特征,如无核膜及内膜系统;也有真核生物的特征,如以甲硫氨酸起始蛋白质的合成、核糖体对氯霉素不敏感、RNA聚合酶和真核细胞的相似、DNA具有内含子并结合组蛋白;此外还具有既不同于原核细胞也不同于真核细胞的特征,如:细胞膜中的脂类是不可皂化的;细胞壁不含肽聚糖,有的以蛋白质为主,有的含杂多糖,有的类似于肽聚糖,但都不含胞壁酸、D型氨基酸和二氨基庚二酸。

历史古细菌这个概念是1977年由Carl Woese和George Fox提出的,原因是它们在16SrRNA的系统发生树上和其它原核生物的区别。

这两组原核生物起初被定为古细菌(Archaebacteria)和真细菌(Eubacteria)两个界或亚界。

Woese认为它们是两支根本不同的生物,於是重新命名其为古菌(Archaea)和细菌(Bacteria),这两支和真核生物(Eukarya)一起构成了生物的三域系统。

古菌、细菌和真核生物在细胞结构和代谢上,古菌在很多方面接近其它原核生物。

然而在基因转录这两个分子生物学的中心过程上,它们并不明显表现出细菌的特徵,反而非常接近真核生物。

比如,古菌的转译使用真核的启动和延伸因子,且转译过程需要真核生物中的TATA框结合蛋白和TFIIB。

古菌还具有一些其它特徵。

与大多数细菌不同,它们只有一层细胞膜而缺少肽聚糖细胞壁。

而且,绝大多数细菌和真核生物的细胞膜中的脂类主要由甘油酯组成,而古菌的膜脂由甘油醚构成。

这些区别也许是对超高温环境的适应。

古菌鞭毛的成分和形成过程也与细菌不同。

基於rRNA序列的系统发生树,显示了可明显区别的三支:细菌(Bacteria)、古菌(Archaea)和真核生物(Eukarya)生存环境很多古菌是生存在极端环境中的。

一些生存在极高的温度(经常100℃以上)下,比如间歇泉或者海底黑烟囱中。

环境工程(细菌、古菌)2.1

环境工程(细菌、古菌)2.1

w 或称性丝,每一个有性细菌有1根~4根,参与细 菌有性生殖时细菌间传递遗传物质。
8. 芽孢
某些细菌当环境恶劣时,细胞质浓缩凝集,逐步形成 一个圆形、椭圆形或圆柱形的休眠体,称为芽孢。
w类似(于1)“芽蚕结孢茧的变多蛹层”结构 w 由外至内,依次为 w ①芽孢外壁
由蛋白质、脂类和糖组成
w ②一层或几层芽孢衣
w 细菌:单细胞不分枝的原核微生物。 w 细菌细胞微小而透明,通常用适当染料染色后显微镜观察
(一)细菌的外形与大小
球菌
w 球菌就是球形的细菌,
它是这类细菌的总称, 细胞呈球形或椭圆形。
w l .单球菌
w 2 .双球菌
w 3.链球菌
图1-2
w 4 .四联球菌
w 5.八叠球菌
w 6 .葡萄球菌
杆菌
膜 菌w 膜或者在液体培养基表面形成 (轻)
w 使培养液混浊(中)
沉淀 w 或产生絮状
(粘重,如菌胶团、活性污泥)。对照
菌沉淀
均匀浑浊
细菌的物理化学性质 小结
(一)细菌表面电荷和等电点(P52-53) 细菌表面带负电荷 ;由细菌表面的蛋白质(两性电解质) 的等电点和外界的pH值所决定。
(二)细菌染色原理及染色方法 1.染色原理 通过染色,可增加菌体与背景的反差,在显 微
w 多层作用—使芽孢对高温、干燥、辐射、酸、碱和 有机溶剂等杀菌因子具有极强抵抗能力
w 芽孢“复苏”—合适的环境中,恢复普通的细胞结构, 失去各类抵抗功能。
能否形成芽孢,芽孢的形状、大小及其在细胞内的位置(如图 ),是细菌种的特征,在分类鉴定上有一定意义。
芽孢结构致密,染料不能渗入,不易着色。
芽胞的特点(P48-49):

微生物

微生物
藻类中的原核生物 蓝藻(如色球藻、念珠藻、颤藻、螺旋藻) 蓝藻(如色球藻、念珠藻、颤藻、螺旋藻) 属于原核生物 含叶绿素和藻蓝素(但不形成叶绿体)、有的含 叶绿体)、 含叶绿素和藻蓝素(但不形成叶绿体)、有的含 有蓝藻叶黄素,有的含有胡萝卜素 胡萝卜素, 有蓝藻叶黄素,有的含有胡萝卜素,有的含有蓝 藻蓝素,也有的含有蓝藻藻红素 红海就是由 藻红素。 藻藻蓝素,也有的含有蓝藻藻红素。红海就是由 于水中含有大量藻红素的蓝藻,使海水呈现出红 于水中含有大量藻红素的蓝藻, 色。
放线菌
霉菌
菌落的形态较大,质地疏 由菌丝构成,直径3-10µm, 松,外观干燥,不透明, 与酵母菌细胞类似,细胞壁 呈现或松或紧的蛛网状、 主要有几丁质构成,少数含 绒毛状、棉絮状,与培养 有维生素 基结合紧密,不易挑起 细胞直径为细菌10倍,是典 型的真核微生物细胞主要由 细胞壁,细胞膜,细胞核构 成。细胞壁分为三层,成分 为酵母维生素 较湿润,较透明,表面较 光滑,容易挑起,菌落知 底均匀,正反面以及边缘 与中央部位的颜色一致。
5、其他类:立克次氏体、衣原体、支原体 、其他类:立克次氏体、衣原体、
立克次氏体
衣原体
支原体
衣原体立克次氏体 立克次氏体
• 是介于细菌与病毒之间,而接近于细菌的 是介于细菌 病毒之间 细菌与 之间, 一类原核生物。一般呈球状或杆状,是专性 一类原核生物。一般呈球状或杆状 是专性 细胞内寄生物,主要寄生于节肢动物, 细胞内寄生物,主要寄生于节肢动物,有 的会通过蚤、 螨传入人体、 的会通过蚤、虱、蜱、螨传入人体、如斑 疹伤寒 • 细胞大小为 ~0.6µm×0.8~2.0µm,有 细胞大小为0.3~ × ~ , 细胞形态,一般不能通过细菌滤器 细菌滤器, 细胞形态,一般不能通过细菌滤器,

原核生物包括古菌和细菌的区别

原核生物包括古菌和细菌的区别

原核生物包‎括古菌和细‎菌,与真核生物‎的区别综合‎列于表1-1 。

主要差异有‎(1 )、原核生物的‎遗传物质主‎要是以双螺‎旋DNA 构成的一条‎染色体 (chrom‎o some‎),仅形成一个‎核区,没有核膜包‎围,无核仁,称为原核 (nucle‎o id) 或拟核,无组蛋白与‎之相结合。

真核生物的‎遗传物质以‎双螺旋DNA 构成一条或‎一条以上的‎多条染色体‎群,形成一个真‎核(nucle‎o lus) ,有一核膜包‎围,膜上有孔,有核仁,明显有别于‎周围的细胞‎质,并有组蛋白‎与之相结合‎。

而且各种细‎胞器如线粒‎体、叶绿体携带‎有自己的DNA ,可自主复制‎。

(2 )、原核生物细‎胞的细胞质‎由细胞膜 (cell membr‎a ne) 包围,并有细胞膜‎大量褶皱内‎陷入细胞质‎中形成中间‎体或称为间‎体 (mesos‎o me) 。

不含其他分‎化明显的细‎胞器 (organ‎e lles‎)。

真核生物细‎胞同样由细‎胞膜包围,但不内陷,内含多种细‎胞器,如主要进行‎呼吸能量代‎谢的线粒体‎(mitoc‎h ondr‎i a )和光合作用‎的叶绿体(chlor‎o plas‎t) 等。

各种细胞器‎有各自的膜‎包围,细胞器膜与‎细胞膜之间‎无直接关系‎。

(3 )、原核生物和‎真核生物细‎胞的蛋白质‎合成都是在‎核蛋白体上进行,但大小不同‎,原核生物的‎核蛋白体为70S ,而真核生物‎的核蛋白体‎为80S ,其细胞器的‎核蛋白体也‎为70S 。

而且它们各‎自的亚单位‎构成也不一‎样,原核生物的‎核蛋白体是‎由50S 和30S 的两个亚单‎位构成,真核生物的‎核蛋白体是‎由60S 和40S 两个亚单位‎构成,各亚单位的‎构成上也有‎区别。

古菌、细菌和真核‎生物三域原核生物中‎,古菌和细菌‎在细胞形态‎结构、生长繁殖、生理代谢、遗传物质存‎在方式等方‎面相类似,因而同属原‎核生物。

但在分子生‎物学水平上‎,古菌和细菌‎之间有明显‎差别,主要表现见‎表1-1 。

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mingcheng qian_a Acinetobacter sp. ADP10.297099 Acinetobacter sp. ADP10.297099 Aeropyrum pernix K10.213786 Agrobacterium tumefaciens str. C58 chromosome circular, 0.199061 Agrobacterium tumefaciens str. C58 chromosome linear, 0.208169 Anaplasma marginale str. St. Maries0.241185 Aquifex aeolicus VF50.283444 Aquifex aeolicus VF50.283444 Archaeoglobus fulgidus DSM 43040.259615 Azoarcus sp. EbN10.175667 Azoarcus sp. EbN10.175667 Bacillus cereus ATCC 109870.339426 Bacillus halodurans C-1250.289017 Bacillus licheniformis ATCC 145800.280976 Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 1680.292021 Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27, 0.338755 Bacteroides fragilis YCH460.27116 Bacteroides thetaiotaomicron VPI-54820.287389 Bartonella henselae str. Houston-10.300199 Bartonella quintana str. Toulouse0.295733 Bifidobacterium longum NCC27050.197722 Borrelia burgdorferi B310.386338 Borrelia garinii PBi chromosome linear, sequence0.387193 Bradyrhizobium japonicum USDA 1100.178692 Brucella melitensis 16M chromosome I, sequence0.209658 Brucella suis 1330 chromosome I, sequence0.209681 Buchnera aphidicola (Baizongia pistaciae)0.343245 Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum), 0.357761 Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)0.357921 Burkholderia pseudomallei K96243 chromosome 2, sequence.0.157284 Campylobacter jejuni RM12210.348385 Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 111680.345846 Candida glabrata strain CBS138 chromosome A sequence0.306334 Candidatus Blochmannia floridanus0.332303 Caulobacter crescentus CB150.162775 Chlamydia muridarum Nigg0.292683 Chlamydophila caviae GPIC0.294674 Chlamydophila caviae GPIC0.294674 Chlamydophila pneumoniae AR390.288604 Chlamydophila pneumoniae J1380.300368 Chlamydophila pneumoniae TW-1830.304591 Chlorobium tepidum TLS0.208689 Chromobacterium violaceum ATCC 124720.171196 Clostridium acetobutylicum ATCC 8240.371847 Clostridium perfringens str. 130.380888 Clostridium tetani E880.394385Corynebacterium diphtheriae NCTC 131290.226612 Corynebacterium efficiens YS-3140.185147 Corynebacterium glutamicum ATCC 130320.228226 Coxiella burnetii RSA 4930.287917 Dehalococcoides ethenogenes乙烯脱卤拟球菌(0.244193 Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1, sequence0.163258 Desulfotalea psychrophila LSv540.262385 Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris str. Hildenborough, 0.176405 Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden0.339816 Enterococcus faecalis V5830.329748 Enterococcus faecalis V5830.329748 Erwinia carotovora subsp. atroseptica SCRI10430.241033 Escherichia coli CFT0730.268643 Escherichia coli K120.246808 Escherichia coli O157 H70.247343 Francisella tularensis subsp. tularensis Schu 40.337835 Fusobacterium nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586, 0.351272 Geobacillus kaustophilus HTA4260.247498 Geobacter sulfurreducens PCA0.1903 Gloeobacter violaceus PCC 74210.190694 Haemophilus ducreyi 35000HP0.300905 Haemophilus influenzae Rd KW200.310291 Helicobacter hepaticus ATCC 514490.323694 Helicobacter pylori 266950.306189 Helicobacter pylori, strain J99 genome0.304707 Idiomarina loihiensis L2TR0.264204 l Agrobacterium tumefaciens str. C58 chromosome linear, 0.208169 l Borrelia burgdorferi B310.386338 Lactobacillus johnsonii NCC 5330.338209 Lactobacillus plantarum WCFS10.276266 Lactococcus lactis subsp. lactis Il14030.335543 Legionella pneumophila str. Lens0.302911 Legionella pneumophila str. Lens0.302911 Legionella pneumophila str. Paris0.303021 Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1,0.302454 Leifsonia xyli subsp. xyli str. CTCB070.159459 Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-1300.319467 Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I,0.320587 Leptospirillum sp. Group II environmental sequence.0.237639 Leptospirillum sp. Group III environmental sequence0.216996 Listeria innocua Clip112620.333804 Listeria monocytogenes EGD-e0.330362 Listeria monocytogenes str. 4b F23650.330743 Mannheimia succiniciproducens MBEL55E0.28625 Mesoplasma florum L10.399416 Mesorhizobium loti MAFF3030990.185163 Methanobacterium thermoautotrophicum str. Delta H genome0.252398Methanobrevibacter ruminantium反刍甲烷短杆菌,0.339816 Methylococcus capsulatus str. Bath0.176448 Methylococcus capsulatus str. Bath0.176448 Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis str. k10, 0.155051 Mycobacterium bovis AF2122970.168446 Mycobacterium leprae TN0.195367 Mycobacterium tuberculosis CDC15510.168624 Mycobacterium tuberculosis H37Rv0.168653 Mycoplasma gallisepticum R0.363109 Mycoplasma genitalium G-370.350035 Mycoplasma hyopneumoniae 2320.362058 Mycoplasma mobile 163K0.380585 Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. PG10.387419 Mycoplasma penetrans HF-20.389206 Mycoplasma pneumoniae M1290.312692 Mycoplasma pulmonis UAB CTIP0.378347 Nitrosomonas europaea ATCC 197180.244485 Nocardia farcinica IFM 101520.145017 Nostoc sp. PCC 71200.29313 Onion yellows phytoplasma OY-M0.368075 Parachlamydia sp. UWE250.323886 Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm700.300541 Photobacterium profundum SS9 chromosome 10.282674 Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO10.277224 Pirellula sp. 10.224978 Porphyromonas gingivalis W830.255078 Prochlorococcus marinus str. MIT 93130.250965 Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375, 0.29991 Propionibacterium acnes KPA1712020.189808 Pseudomonas putida KT24400.187953 Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC30000.202396 Ralstonia solanacearum GMI10000.16136 Rhodopseudomonas palustris CGA0090.17117 Rickettsia conorii str. Malish 70.338627 Rickettsia prowazekii str. Madrid E0.350215 Rickettsia typhi str. Wilmington0.352044 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratypi A str. ATCC0.238891 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Ty2, 0.239679 Salmonella typhimurium LT20.240146 Shewanella oneidensis MR-10.26063 Shigella flexneri 2a str. 2457T0.246774 Silicibacter pomeroyi DSS-30.176907 Sinorhizobium meliloti苜蓿根瘤菌()0.199281 Staphylococcus aureus subsp. aureus COL0.354327 Staphylococcus aureus subsp. aureus MRSA2520.352237 Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA4760.354116 Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu500.352721Staphylococcus aureus subsp. aureus MW20.353782 Staphylococcus aureus subsp. aureus N3150.352581 Staphylococcus epidermidis ATCC 122280.347352 Streptococcus agalactiae 2603VR0.325853 Streptococcus agalactiae NEM3160.32523 Streptococcus mutans UA1590.312639 Streptococcus pneumoniae R6 genome0.305613 Streptococcus pneumoniae TIGR40.306926 Streptococcus pyogenes M1 GAS0.314787 Streptococcus pyogenes MGAS103940.311957 Streptococcus pyogenes MGAS3150.312661 Streptococcus pyogenes SSI-10.314101 Streptococcus pyogenes strain MGAS82320.31371 Streptococcus thermophilus CNRZ10660.303146 Streptococcus thermophilus LMG 183110.302832 Streptomyces avermitilis MA-46800.147205 Streptomyces coelicolor A3(2), genome蓝色链霉菌0.136051 Sulfolobus acidocaldarius DSM 6390.315159 Sulfolobus solfataricus P20.322791 Sulfolobus sp. NOB8H2 plasmid pNOB8, sequence.0.31857 Symbiobacterium thermophilum IAM 148630.157769 Synechococcus elongatus PCC 63010.223348 Synechococcus sp. WH 81020.191886 Thermoanaerobacter tengcongensis strain MB4, genome 0.336693 Thermosynechococcus elongatus BP-10.232179 Thermus thermophilus HB270.152103 Thermus thermophilus HB8, genome嗜热水生菌0.151056 Treponema denticola ATCC 354050.306949 Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols0.222139 Tropheryma whipplei str. Twist0.260526 Tropheryma whipplei TW08270.250822 Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 7009700.379238 Vibrio cholerae O1 biovar eltor str. N16961 chromosome I, 0.257727 Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome I, 0.269676 Vibrio vulnificus CMCP6 chromosome I, sequence0.265901 Wigglesworthia glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis0.389211 Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster0.319168 Wolinella succinogenes DSM 17400.25369 Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 3060.172798 Xanthomonas campestris pv. campestris str. ATCC 33913, 0.173522 Xylella fastidiosa Temecula10.21723 Yersinia pestis biovar Medievalis str. 910010.25955 Yersinia pestis CO920.258559 Yersinia pestis KIM0.256812 Yersinia pseudotuberculosis IP 329530.255877 Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM40.256232qian_t qian_g qian_c hou_a hou_t hou_g hou_c zong_a zong_t 0.2973720.2153340.1901950.2990060.2979310.1909160.2121470.2980530.297652 0.2973720.2153340.1901950.2990060.2979310.1909160.2121470.2980530.297652 0.2214290.2809590.2838260.2174560.2211030.2782430.2831980.2156210.221266 0.2063450.3017890.2928060.2100170.1970730.2862230.3066860.2045390.201709 0.199750.2892080.3028720.1986380.207920.3020320.291410.2034040.203835 0.2613710.2578660.2395790.2619930.2401980.2351630.2626460.2515890.250784 0.2839660.2167330.2158570.2848140.2782530.2191490.2177840.2841290.281109 0.2839660.2167330.2158570.2848140.2782530.2191490.2177840.2841290.281109 0.2560570.2441570.2401710.2564480.2562470.2433590.2439460.2580320.256152 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