一步一步教你使用NCBI数据库资源

一步一步教你使用-NCBI-查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计方案、BLAST-序列比对等

一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST 序列比对等最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST 进行序列比对……，这些问题在NCBI 上都可以方便的找到答案。

现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI 的使用。

希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI 的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS 查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST 进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。

关于NCBI 其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。

第一部分利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer 页面，网址为：/mapview/index.html 在search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的基因。

操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。

2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。

ncbi使用指导

ncbi使用指导导言：NCBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心，是全球最大的生物信息学数据库。

NCBI提供了丰富的生物学资源，包括基因序列、蛋白质序列、科学文献等。

本文将为您介绍如何使用NCBI来获取和利用生物学信息。

一、注册NCBI账号在使用NCBI之前，首先需要注册一个账号。

在NCBI官方网站（）的主页上，点击右上角的“Sign In”按钮，并选择“Register for an NCBI account”。

根据提示提供相关信息，完成注册流程。

二、搜索和获取基因序列1. 打开NCBI网站后，点击主页上的“Search”按钮，进入搜索页面。

2. 在搜索框中输入您感兴趣的基因名称或者序列标识符，如“BRCA1”。

3. 点击“Search”按钮进行搜索。

4. 在搜索结果中，选择您需要的基因序列，点击链接进入该基因的详细信息页面。

5. 在详细信息页面中，您可以获取该基因的序列信息，可以下载或拷贝该序列以供后续分析使用。

三、检索科学文献1. 在NCBI主页上方的搜索框中，选择“PubMed”为搜索目标。

2. 输入您感兴趣的科学文献关键词，如“cancer treatment”。

3. 点击搜索按钮进行检索。

4. 在搜索结果中，选择您需要的文献，点击链接进入该文献的详细页面。

5. 在详细页面中，您可以阅读文章摘要，并根据需要下载全文或进行其他操作。

四、利用NCBI工具进行序列分析1. 在NCBI主页上方的菜单栏中，选择“Tools”进行工具选择。

2. 根据您的需求选择相应的工具，如“BLAST”进行序列比对分析。

3. 进入选择的工具页面后，按照提示上传或输入您的序列数据。

4. 设定参数并运行分析。

5. 分析完成后，您可以查看比对结果、序列保守性等信息，并进行进一步的分析和解释。

五、订阅NCBI数据库更新信息1. 在NCBI主页上方菜单栏中选择“NCBI Account”。

怎样使用NCBI

怎样使用NCBINCBI（National Center for Biotechnology Information，国家生物技术信息中心）是一个提供生物医学和基因组学相关信息和工具的资源中心，为全球研究人员提供了公共数据库和计算工具。

NCBI不仅提供了各种数据库（如PubMed、GenBank和BLAST等），还提供了多种工具和程序包，可以帮助用户在完整的基因组中、分析和解释生物信息。

1. PubMedPubMed是NCBI最受欢迎的数据库之一，它提供了全球各领域生物医学和生物科学研究的相关文献。

用户可以在框中输入关键词来相关的医学文献，也可以使用高级功能来筛选文献。

在结果中，用户可以找到文献的摘要、全文和相关信息。

2. GenBankGenBank是NCBI的核心数据库之一，它收集和存储了全球各领域基因组学研究的DNA序列数据。

用户可以通过框中输入基因名、序列ID或其他相关信息来特定的DNA序列数据。

结果会提供序列的相关信息、注释、变异等。

3.BLASTBLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于在NCBI数据库中相似序列的工具。

BLAST可以用来比对一段DNA或者蛋白质序列与数据库中的其他序列进行比对，用户可以通过输入序列或者上传文件的方式使用BLAST。

BLAST结果会给出匹配的序列、相似度和其他相关信息。

4. Primer-BLASTPrimer-BLAST是一个用于设计引物（primers）的工具，该工具可以帮助用户设计用于PCR扩增特定DNA区域的引物。

用户可以在框中输入目标基因的序列，Primer-BLAST会自动生成一对合适的引物，并提供引物的相关信息和参数。

除了上述常用的NCBI工具和数据库外，NCBI还提供了其他许多强大且有用的工具和资源，如ClinVar（帮助研究人员了解基因变异与遗传疾病的关系）、Entrez（提供了多个数据库的交叉功能）和PubChem（提供化合物信息和化学数据库）等。

ncbi使用指导

ncbi使用指导摘要：一、NCBI简介1.NCBI的定义与作用2.NCBI的主要数据库二、NCBI数据库的使用1.基因数据库1.1 基因序列数据库1.2 基因表达数据库1.3 基因调控数据库2.蛋白质数据库2.1 蛋白质序列数据库2.2 蛋白质结构数据库3.核酸序列数据库3.1 核酸序列数据库概述3.2 核酸序列数据库的使用方法4.文献数据库4.1 PubMed简介4.2 如何利用PubMed进行文献检索三、NCBI工具的使用1.基因芯片数据分析工具2.基因序列比对工具3.蛋白质结构预测工具四、NCBI的进阶使用技巧1.如何利用NCBI进行基因注释2.如何利用NCBI进行基因家族分析3.如何利用NCBI进行共表达网络分析正文：一、NCBI简介CBI（National Center for Biotechnology Information，美国国家生物技术信息中心）是一个提供生物信息学资源的网站，它为全球科研工作者提供了大量的生物学数据和工具。

NCBI的主要数据库包括基因数据库、蛋白质数据库、核酸序列数据库和文献数据库等。

二、NCBI数据库的使用1.基因数据库基因数据库包括基因序列数据库、基因表达数据库和基因调控数据库。

基因序列数据库提供了大量的基因序列信息，用户可以通过关键词搜索、序列相似性搜索等方式找到需要的基因序列。

基因表达数据库则提供了基因在不同生物体、不同组织、不同发育阶段的表达信息。

基因调控数据库则包含了基因调控相关的信息，如启动子、转录因子结合位点等。

2.蛋白质数据库蛋白质数据库包括蛋白质序列数据库和蛋白质结构数据库。

蛋白质序列数据库提供了蛋白质的氨基酸序列信息，用户可以通过序列相似性搜索找到相似的蛋白质序列。

蛋白质结构数据库则提供了蛋白质的三维结构信息，用户可以通过结构域、功能域等关键词搜索需要的蛋白质结构。

3.核酸序列数据库核酸序列数据库包括DNA序列数据库和RNA序列数据库。

ncbi使用方法

ncbi使用方法（原创版4篇）《ncbi使用方法》篇1CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，它提供了许多生物学和生命科学相关的数据库和工具。

以下是使用NCBI 的一些基本方法：1. 核酸序列数据库（Nucleotide Sequence Database）：在NCBI 主页上，可以选择核酸序列数据库，输入序列名称或序列号，然后点击“Search”按钮即可查询序列信息。

2. 蛋白质序列数据库（Protein Sequence Database）：在NCBI 主页上，可以选择蛋白质序列数据库，输入蛋白质名称或蛋白质号，然后点击“Search”按钮即可查询蛋白质信息。

3. 基因组数据库（Genome Database）：在NCBI 主页上，可以选择基因组数据库，输入基因组名称或基因组号，然后点击“Search”按钮即可查询基因组信息。

4. 代谢通路数据库（Metabolic Pathway Database）：在NCBI 主页上，可以选择代谢通路数据库，输入代谢通路名称或代谢通路号，然后点击“Search”按钮即可查询代谢通路信息。

5. 生物投影数据库（BioProject Database）：在NCBI 主页上，可以选择生物投影数据库，输入生物投影名称或生物投影号，然后点击“Search”按钮即可查询生物投影信息。

6. 序列比对工具（Sequence Alignment Tool）：NCBI 提供了一款名为“Clustal Omega”的序列比对工具，可以在NCBI 主页上使用该工具进行序列比对。

7. 基因表达数据库（Gene Expression Database）：NCBI 提供了一款名为“GEO”的基因表达数据库，可以在NCBI 主页上查询基因表达数据。

8. 蛋白质结构数据库（Protein Structure Database）：NCBI 提供了一款名为“RCSB PDB”的蛋白质结构数据库，可以在NCBI 主页上查询蛋白质结构信息。

NCBI良心教程寻找基因转录本序列及相关编码蛋白

NCBI良心教程寻找基因转录本序列及相关编码蛋白NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是一个全球顶级的生物医学数据库，提供了大量的基因序列和相关的生物信息。

在这个教程里，我们将介绍如何在NCBI中基因转录本序列以及相关编码蛋白。

第一步：访问NCBI网站首先，打开你的浏览器，并输入 "NCBI"，然后点击按钮。

在结果中，选择并点击进入 "NCBI - National Center for Biotechnology Information" 的官方网站。

第二步：选择数据库在NCBI的官方网站中，你可以看到很多不同的数据库。

对于本教程，我们将使用 "GenBank" 数据库来基因转录本序列以及相关编码蛋白。

点击页面左上角的 "Databases" 菜单，然后选择 "Nucleotide" 数据库，它是用于基因序列的数据库。

第三步：基因转录本序列在 "Nucleotide" 页面中，你会看到一个框，可以输入你感兴趣的基因的名称或相关关键词。

在框中输入基因的名称或相关关键词，然后点击按钮。

此时，你将看到与该基因相关的转录本序列的结果列表。

除了查找基因转录本序列，你还可以使用NCBI相关的编码蛋白质序列。

在 "Nucleotide" 页面中，选择 "Protein" 或 "Protein database" 选项卡。

在框中输入与你感兴趣的蛋白质相关的关键词，并点击按钮。

此时，你将看到与该蛋白质相关的转录本或基因的结果列表。

点击结果列表中感兴趣的蛋白质，你将进入蛋白质的详细页面。

在这个页面上，你可以找到该蛋白质的序列以及其他相关信息。

总结：在NCBI中基因转录本序列及相关编码蛋白可以通过以下步骤完成：1.访问NCBI官方网站；2.选择 "GenBank" 数据库；3.你感兴趣的基因的名称或相关关键词；4.点击结果中的转录本，查看序列和其他详细信息；5.如果你想相关编码蛋白质，选择 "Protein" 选项卡，并输入相关关键词；6.点击结果中的蛋白质，查看蛋白质序列和其他相关信息。

NCBI使用教程

NCBI使用教程NCBI(National Center for Biotechnology Information)是一个提供生物信息学相关资源和服务的综合性数据库，为研究者和学生们提供了大量的生物学数据、文献和工具，对于研究生物学和相关领域的人来说是非常有价值的资源。

本文将向您介绍如何使用NCBI进行生物信息学的研究和学习。

在DNA/RNA seq页面，可以和浏览生物序列数据。

可以输入序列数据，通过BLAST程序进行序列比对和比对分析。

可以利用高级功能，如限定序列长度、物种、数据库等。

此外，在这个页面上，还可以进行FASTA格式序列的格式化处理，并获得一些特定的DNA/RNA序列数据。

在Gene页面，可以和浏览基因信息。

可以通过基因名、ID等关键字进行。

每个基因都有自己的页面，显示了其基本信息、结构、功能以及相关文献。

在页面底部还可以找到该基因的序列信息、同源基因和调控因子等信息。

在Protein页面，可以和浏览蛋白质信息。

可以输入蛋白质名、ID等关键字进行。

每个蛋白质也有自己的页面，显示了其基本信息、结构、功能等。

在页面底部还可以找到该蛋白质的序列信息、同源蛋白和结构域等信息。

在Nucleotide页面，可以和浏览核苷酸信息。

可以输入核苷酸序列、基因名等关键字进行。

每个核苷酸也有自己的页面，显示了其基本信息、序列、功能等。

在页面底部还可以找到该核苷酸的同源序列和CDS （Coding Sequence）等信息。

在NCBI的Tools页面，提供了许多有用的工具和资源。

如BLAST、序列比对工具、基因注释工具等。

可以根据自己的需要选择相应的工具来进行生物信息学分析和研究。

此外，NCBI还提供了一些教育和培训资源，如教程、视频和在线培训课程，可以帮助用户更好地使用NCBI的数据库和工具。

综上所述，NCBI是一个非常重要和有价值的生物信息学资源和工具，可以帮助生物学和相关领域的研究者和学生进行科研和学习。

NCBI数据库使用方法快速入门!

NCBI数据库使用方法快速入门！
Taxonomy界面，会显示该物种的Nucleotide和Protein，选择“Protein
Protein界面，点击“RefSeq”（该数据库包括具有生物意义上的非冗余基因、转录本和蛋白序列，使用人类基因命名委员会定义的术语，并且包括了官方的基因符号和可选的符号）：
二、蛋白信息查询
、将该文件导入搜库软件，可对蛋白进行定性分析，继而得到差异蛋白。

在NCBI Protein”，并输入差异蛋白的Accession Number，点击“Search”：
Protein界面，就会显示该蛋白的信息（如氨基酸个数、蛋白名称、蛋白序列和序列等）：
一般情况下，如果蛋白质组所研究的物种已经被测序，推荐使用Uniprot数据库作为搜库的数据库，如果所研究的物种在Uniprot数据库中蛋白数据较少，推荐使用NCBI数据库进行搜库。

好了，今天的介绍就到这里，感兴趣的小伙伴们收藏起来吧~希望对大家有所帮助！。

ncbi使用指导

ncbi使用指导【原创版】目录1.NCBI 的概述2.NCBI 的使用方法3.NCBI 的数据库资源4.NCBI 的实用工具5.NCBI 的注意事项正文CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，是一个提供生物学和医学信息的数据库和工具的官方网站。

该网站由美国国家卫生研究院（NIH）建立，旨在为科学家、医生、研究人员和学生提供免费的生物学和医学信息。

以下是 NCBI 的使用指导：一、NCBI 的概述CBI 提供了多种数据库资源和实用工具，包括基因序列、蛋白质序列、基因组信息、生物学文献等。

这些资源对于生物学和医学研究非常重要。

二、NCBI 的使用方法1.访问 NCBI 的官方网站：https:///2.在主页上，你可以看到 NCBI 提供的各种数据库和工具的链接。

你可以点击链接进入相应的数据库或工具页面。

3.在数据库或工具页面，你可以使用各种搜索框和过滤器来查找你需要的信息。

例如，在基因序列数据库中，你可以输入基因名称或序列号来查找相关的基因序列信息。

三、NCBI 的数据库资源1.基因序列数据库（GenBank）：提供了全球各种生物的基因序列信息。

2.蛋白质序列数据库（Protein Database）：提供了全球各种生物的蛋白质序列信息。

3.基因组数据库（Genome Database）：提供了全球各种生物的基因组信息。

4.生物学文献数据库（PubMed）：提供了全球生物学和医学领域的文献信息。

四、NCBI 的实用工具1.BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）：用于比较基因序列或蛋白质序列的相似性。

2.Entrez：用于在 NCBI 的数据库中搜索和获取相关的生物学信息。

3.Coffee Break：用于查看和下载基因序列或蛋白质序列的图片。

五、NCBI 的注意事项1.在使用 NCBI 的数据库和工具时，请遵守相关的知识产权和版权规定。

一步一步教你使用NCBI2.

5.1 从SNP的序列号入手找到其对应的基因序列和该SNP在基因组中的具体位置。

跟Bonnie03 PM之后，得到rs号为rs6677188，其实这不是一个基因的编号，而是一个SNP的编号。

要得到它的详细信息可以参考以下途径，有兴趣的战友可以自己照着做一下，为了节约版面，不做详细抓图：1，打开NCBI的SNP页面，网址为 /sites/entrez?db=Snp 在搜索的for后面填写rs编号，点击go2，这时会出现搜索结果页面，如图所示：由于编号是唯一的，所以搜索结果也是唯一的，如果要得到它的详细信息，点击该编号对应的超链接即可。

3，点击该编号对应的超链接，得到详细信息页面，如图所示（抓取部分页面）：4.1 如果要得到该SNP所在基因的序列，可通过点击NCBI Resource Links对应的序列代码实现，建议选择GenBank(即NT 032977)，这里不做演示，有兴趣的朋友可以自己操作。

4.2 如果要得到该SNP在基因组里的位置图，可以通过点击Integrated Maps对应的超链接（即chromosome1）来实现，点击后出现下图：5，要得到这个SNP在基因组中详细的位置，点击Map element下面对应的超链接就可以了，这里就不抓图演示了，建议选择第一个，即reference所对应的。

以上内容都是建立在查找文献后，知道了一个既定的位点后而进行的。

snp选择原则：1. 选择位点当然以启动子（转录起始上游2KB）SNP，外显子SNP，内含子与外显子交界区SNP 为优先选择对象。

2. 频率要求：大于5%为佳，因为如果你样本小的话根本在人群中得不到分型。

3. 强烈建议选择SNP前检索NCBI，尤其是HAPMAP数据库，里面包含中国人群SNP的频率信息及重要的位点连锁信息。

4. 内含子最后选择吧，如果处于交界区当然可以优先考虑。

ncbi使用指导

ncbi使用指导【最新版】目录1.NCBI 的简介2.NCBI 的使用方法3.NCBI 的数据库资源4.NCBI 的优缺点及应用领域正文CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，是由美国国立卫生研究院（NIH）资助的一个公共生物技术信息中心。

NCBI 的主要任务是收集、保存和传播生物学和医学研究所需的各种信息资源。

使用 NCBI 非常简单，只需访问其官网（https:///）即可。

在首页，你可以根据你的需求选择不同的数据库进行搜索。

NCBI 提供了多个数据库，包括基因序列数据库（GenBank）、蛋白质序列数据库（Protein Database）、基因组数据库（Genome Database）、生物学文献数据库（PubMed）等。

其中，GenBank 是全球最大的基因序列数据库，包含了全球各地的生物基因序列信息。

Protein Database 则包含了全球已知蛋白质的序列信息。

Genome Database 则收集了全球多个物种的基因组信息。

而 PubMed 则是一个包含全球生物医学文献的数据库，是科研人员进行文献检索的重要工具。

CBI 的使用有着许多优点，例如其数据库庞大，信息全面，而且全部免费开放。

同时，NCBI 还提供了强大的检索和分析工具，如 BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）序列比对工具，以及各种生物信息学分析工具。

然而，NCBI 也存在一些缺点，例如由于其数据库庞大，对于初学者可能会感到有些复杂和难以理解。

此外，由于 NCBI 主要服务于科研人员，对于一般公众来说，可能不易使用。

一步一步教你使用NCBI数据库资源

一步一步教你使用NCBI数据库资源NCBI（National Center for Biotechnology Information）是一个提供生物医学和基因组学信息的在线数据库资源平台。

它提供了众多的数据库和工具，包括基因序列，蛋白质序列，文献数据库等。

下面将一步一步地介绍如何使用NCBI的数据库资源。

第一步：打开NCBI网站第二步：选择想要访问的数据库或工具NCBI提供了多个数据库和工具，根据自己的需要选择相应的链接。

一些常用的数据库和工具包括：- PubMed：PubMed是由NCBI提供的一个生物医学文献数据库，包含众多的科学论文和文章。

- GenBank：GenBank是一个存储DNA序列的数据库，包含了全球范围内的基因序列数据。

-BLAST：BLAST是一个用于序列比对和相似性序列的工具。

- Gene：Gene是一个存储基因信息的数据库，提供了基因功能、表达和序列等信息。

- Protein：Protein是一个存储蛋白质序列和功能信息的数据库。

- Structure：Structure是一个存储蛋白质三维结构信息的数据库。

-GEO：GEO是一个存储基因表达和调控数据的数据库。

第三步：使用数据库或工具进行查询根据选择的数据库或工具，进入相应的页面后，你可以使用框输入关键词进行查询。

例如，在PubMed中可以输入关键词来相关的科学论文。

在GenBank中，你可以输入基因名或序列来查找相应的DNA序列信息。

第四步：浏览结果并获取需要的信息第五步：导出或保存数据如果你想保存查询结果或将其用于后续分析，NCBI提供了导出和保存的选项。

可以将结果导出为文本文件或保存为特定的格式（如FASTA格式的基因序列）。

第六步：使用其他工具进行进一步分析NCBI还提供了各种分析工具，可以对查询结果进行进一步分析和处理。

例如，可以使用BLAST工具进行序列比对，找到与查询序列相似的序列。

总结：NCBI的数据库资源为生物医学和基因组学研究者提供了丰富的数据和工具。

ncbi使用指导

ncbi使用指导（原创版）目录1.NCBI 的概述2.NCBI 的使用方法3.NCBI 的资源与工具4.NCBI 的优缺点及适用场景正文CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心的缩写，是一个提供生物学和医学信息的大型数据库。

NCBI 由美国国家卫生研究院（NIH）资助，是美国国家生物技术信息中心的一个组成部分。

CBI 的使用非常简单。

首先，用户需要在网站上注册一个账户，然后可以通过搜索引擎查找所需的信息。

搜索结果会以列表的形式显示，用户可以选择查看摘要或全文。

此外，NCBI 还提供了许多高级搜索选项，如限制搜索结果的时间、作者、期刊等。

CBI 的资源与工具非常丰富。

其中包括了 PubMed、基因序列数据库、蛋白质序列数据库、基因组数据库等。

PubMed 是 NCBI 最著名的资源之一，它是一个包含了全球医学和生命科学领域的文献摘要和全文的数据库。

基因序列数据库和蛋白质序列数据库则包含了全球已知的所有基因和蛋白质序列。

基因组数据库则包含了全球所有已知的基因组序列。

CBI 的优点在于其提供的信息全面、准确，且更新及时。

同时，NCBI 的搜索工具也非常强大，可以满足用户的各种搜索需求。

然而，NCBI 也存在一些缺点，如搜索结果可能过于繁多，需要用户具备一定的筛选能力。

此外，NCBI 的注册和搜索过程可能对于一些非专业人士来说过于复杂。

总的来说，NCBI 是一个非常重要的生物学和医学信息数据库，适用于所有从事相关领域研究的人员。

NCBI数据库的使用与功能介绍

NCBI数据库的使用与功能介绍NCBI (National Center for Biotechnology Information)数据库是世界上最大的生物信息学数据库之一，旨在为全球科学家提供生物学、生物化学、生物物理学和生物医学研究的数据和工具。

该数据库包含了来自各种生物学研究领域的大量数据，包括基因组序列、蛋白质序列、文献引用、医学图像和结构信息等。

NCBI数据库的使用和功能非常多样化，本文将介绍其中的一些主要功能。

一、检索和浏览数据NCBI数据库提供了强大的功能，可以帮助用户检索和浏览各种生物学数据。

用户可以使用关键词、序列、ID或其他查询方式来感兴趣的信息。

例如，用户可以通过基因组序列、蛋白质序列或特定生物物种来查找相关的数据。

二、基因组和基因信息NCBI数据库中包含大量的基因组序列和基因信息，包括人类和其他生物物种的基因组数据。

用户可以使用NCBI数据库来特定基因的相关信息，如基因序列，基因表达数据，蛋白质序列，基因功能和遗传变异等。

此外，NCBI数据库还提供了对基因组浏览器的访问，可以帮助用户在特定基因组上查看和分析基因注释和结构信息。

三、蛋白质信息NCBI数据库也包含了大量的蛋白质序列和相关信息。

用户可以使用NCBI数据库来特定蛋白质的相关信息，如蛋白质序列，结构信息，功能注释，亚细胞定位和表达水平等。

此外，用户还可以使用NCBI数据库中提供的BLAST工具来进行蛋白质序列比对和相似性，以帮助识别新的蛋白质序列。

四、文献和引用NCBI数据库中包含了大量的科学文献引用和摘要信息。

用户可以使用PubMed工具来特定主题的科学文献，并查看摘要和全文。

此外，用户还可以使用PubMed工具来查找相关文献的引用信息，以帮助了解和分析科学研究领域的发展趋势。

五、医学图像和结构信息NCBI数据库还提供了医学图像和结构信息的访问，帮助用户了解各种疾病和病理过程的图像和结构特征。

用户可以使用NCBI数据库来和浏览医学图像数据库，如CT扫描、MRI图像和遗传学图像等。

一步一步教你使用NCBI数据库资源

一步一步教你使用NCBI数据库资源随着ncbi数据库各种资源的涌现，NCBI已经成为科研工作者必不可少的资料查找，数据分析的工具。

那么NCBI数据如何使用，新手入门一步一步教你认识和使用NCBI数据库。

一综合数据库NCBI数据库集美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)，即我们所熟知的NCBI是由美国国立卫生研究院(NIH)于1988年创办。

创办NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。

除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。

目前，NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页上找到相应链接，其中多半是由BLAST功能发展而来的。

1 NCBI最新进展1.1 PubMed搜索功能的增强去年，NCBI对PubMed进行了几项改进工作，改动最大的是搜索界面和摘要浏览界面。

其中，搜索界面中新增了“Advanced Search”选项(这实际上是对以往“Limits”和“Preview/Index”功能的整合)，并且增加了一个新的窗口，用户可以在此窗口下通过“论文作者名”、“论文所属杂志名称”、“论文出版日期”等限定条件进行搜索。

而且，“论文作者名”和“论文所属杂志名称”还设有文本框自动填充功能。

现在，在PubMed数据库中进行文本搜索的同时还可以立即通过两个“内容传感器(content sensors)”进行分析。

一步一步教你使用NCBI

一步一步教你使用NCBI 查找DNA、mRNA、cDNA、Protein、promoter、引物设计、BLAST序列比对等作者：urbest2007-8-1苏州大学生命科学学院最近看到很多战友在论坛上询问如何查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST进行序列比对……，这些问题在NCBI上都可以方便的找到答案。

现在我就结合我自己使用NCBI的一些经历（经验）跟大家交流一下BCBI的使用。

希望大家都能发表自己的使用心得，让我们共同进步！我分以下几个部分说一下NCBI的使用：Part one 如何查找基因序列、mRNA、PromoterPart two 如何查找连续的mRNA、cDNA、蛋白序列Part three 运用STS查找已经公布的引物序列Part four 如何运用BLAST进行序列比对、检验引物特异性特别感谢本版版主，将这个帖子置顶！从发帖到现在，很多战友对该帖给与了积极的关注，在此向给我投票的（以及想给我投票却暂时不能投票的）各位战友表示真诚的感谢，谢谢各位战友！请大家对以下我发表的内容提出自己的意见。

关于NCBI其他方面的使用也请水平较高的战友给予补充First of all，还是让我们从查找基因序列开始。

第一部分利用Map viewer查找基因序列、mRNA序列、启动子（Promoter）下面以人的IL6（白细胞介素6）为例讲述一下具体的操作步骤1．打开Map viewer页面，网址为：/mapview/index.html 在search的下拉菜单里选择物种，for后面填写你的目的基因。

操作完毕如图所示：2．点击“GO”出现如下页面：3．在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene 前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：说明一下：1、染色体的红色区域即为你的目的基因所处位置。

2、下面参考序列给出了三个，是不同的部门做出来的，经我验证，序列有微小的差异，但总体来说基本相同。

NCBI使用简明教程，一步一步教会你使用

NCBI使用简明教程，一步一步教会你使用
NCBI (National Center for Biotechnology Information )是指美国国立生物技术信息中心，是一个内容丰富、功能强大的数据库工具。

几乎每个生命科学研究者都需要使用NCBI，很多刚接触生命科学研究的小伙伴经常会问：如何使用NCBI 查询基因序列、如何进行引物设计、如何使用BLAST 进行序列比对等等？
针对这些问题，我们收集、整理此教程，为科研工作者提供一份相对专业和简明的资料，以作基础参考之用！
主要内容分4部分，包括：
1、如何查找基因序列、mRNA、Promoter
2、如何查找连续的 mRNA、cDNA、蛋白序列
3、运用 STS 查找已经公布的引物序列
4、如何运用 BLAST 进行序列比对、检验引物特异性。

NCBI使用方法

NCBI使用方法NCBI（National Center for Biotechnology Information）是一个提供生物学数据库和工具的公共资源。

它提供了许多与生物学相关的数据库，如基因、蛋白质、序列、文献等。

这些数据库对于生物学研究者和生物信息学家来说是非常有用的。

本文将介绍如何使用NCBI进行常见的生物学研究。

另一个常用的NCBI数据库是GenBank，它是一个包含DNA序列、RNA序列和蛋白质序列的数据库。

要在GenBank中查找特定序列，可以在NCBI主页中的框中输入序列信息，如基因名称、序列碱基或蛋白质序列；还可以输入序列的GenBank号、Accession号或序列的FASTA格式。

点击后，系统会返回与查询相关的序列记录。

每个记录都包含序列信息、注释和相关文献等。

当找到感兴趣的序列后，可以查看其详细信息。

如果序列是基因，可以了解它的基因组位置、启动子区域、外显子和内含子等信息。

如果序列是蛋白质，可以了解其氨基酸序列、结构、功能等信息。

此外，在GenBank中还可以找到与特定序列关联的其他序列记录，如同一基因的多个转录本、同源基因等。

除了PubMed和GenBank外，NCBI还提供了许多其他有用的数据库和工具。

例如，BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一个用于比较序列相似性的工具，可以帮助找到特定序列的同源序列。

通过输入查询序列，BLAST可以在NCBI的数据库中相似的序列，并对它们进行比对。

这对于鉴定未知序列的功能以及研究序列进化关系非常有用。

此外，NCBI还提供了一些用于序列分析和生物信息学研究的工具。

例如，COBALT（Constraint-Based Multiple Alignment Tool）可以用于多序列比对，Open Reading Frame Finder可以用于预测DNA序列中的开放阅读框，而RefSeq database则提供了高质量的基因组和蛋白质序列等。

ncbi使用指导

ncbi使用指导摘要：1.NCBI 的概述2.NCBI 的使用方法3.NCBI 的数据库资源4.NCBI 的实用工具5.NCBI 的优点与局限性正文：CBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心，由美国国立卫生研究院（NIH）资助，是一个提供生物学和医学信息的重要机构。

NCBI 的使命是提高生物学和医学的研究效率，通过提供公共资源来促进科学进步。

CBI 的使用方法非常简单。

用户只需访问NCBI 的官方网站（https:///）即可开始使用。

网站提供了各种工具和数据库，以满足用户的各种需求。

对于初学者，NCBI 提供了详细的使用指南和教程，以帮助用户快速上手。

CBI 的数据库资源非常丰富，包括基因序列数据库、蛋白质序列数据库、基因组数据库、生物学文献数据库等。

其中，基因序列数据库（GenBank）是全球最大的基因序列数据库，包含了来自各种生物的基因序列信息。

蛋白质序列数据库（Protein Database）包含了全球已知蛋白质的序列信息，是研究蛋白质结构和功能的重要资源。

基因组数据库（Genome Database）则提供了各种生物的基因组信息，为基因组学研究提供了重要支持。

CBI 还提供了许多实用工具，如基因序列比对工具（BLAST）、蛋白质序列比对工具（BLASTP）、基因组组装工具（组装预测程序）等。

这些工具可以帮助用户进行基因序列比对、蛋白质序列比对、基因组组装等研究。

尽管NCBI 提供了许多有价值的资源和工具，但它也存在一些优点和局限性。

首先，NCBI 的数据库资源虽然丰富，但并不全面，有些特定领域的信息可能无法在NCBI 中找到。

其次，NCBI 的工具虽然强大，但对于非专业人士来说，可能存在一定的学习成本。

此外，NCBI 的部分服务需要付费，这也限制了一部分用户的使用。

总的来说，NCBI 是一个提供生物学和医学信息的重要机构，它提供了丰富的数据库资源和实用工具，为生物学和医学研究提供了重要支持。

ncbi使用方法

ncbi使用方法NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是一个提供生物信息学工具和数据库的资源。

它为生物学家和研究人员提供了许多用于分析和研究生物信息的工具和数据库。

以下是一些使用 NCBI 的基本方法。

1.注册和登录：2. PubMed ：3.基因组检索和比对：NCBI 提供了多个基因组数据库，如 GenBank 和 RefSeq。

这些数据库包含了大量的基因组序列和注释信息。

您可以使用 BLAST 工具来进行基因组比对。

在 NCBI 的主页上点击 BLAST 链接，选择您要比对的数据库和序列类型，然后输入您的查询序列。

点击按钮后，您将获得与查询序列匹配的相关结果。

4.基因和蛋白质序列：如果您有一个具体的基因或蛋白质序列，您可以使用 NCBI 提供的工具进行。

在 NCBI 的主页上找到“nucleotide”或“protein”链接，然后在框中输入您的序列。

点击按钮后，您将获得与查询序列相关的数据库记录和注释信息。

6.文献管理：7.数据库交叉：NCBI 提供多个数据库，它们彼此之间可能存在关联。

您可以利用NCBI 的链接和工具来进行数据库间的交叉。

例如，在 PubMed 的结果中，您可以找到与其他数据库相关的链接和注释信息。

8.其他工具和资源：总结起来，NCBI提供了丰富的生物信息学工具和数据库，可以帮助生物学家和研究人员在基因组学、生物医学和其他生物领域进行各种类型的研究和分析。

熟练掌握NCBI的使用方法将能够提高您在生物信息学研究中的效率和准确性。