RNA恒温扩增法在肺炎支原体检测中的应用_周杰
RNA实时荧光恒温扩增技术在检测儿童肺炎支原体肺炎中的应用
RNA实时荧光恒温扩增技术在检测儿童肺炎支原体肺炎中的应用白莉;高煜;姜伟艳;张井兰【期刊名称】《齐齐哈尔医学院学报》【年(卷),期】2018(039)010【摘要】目的探索RNA实时荧光恒温扩增技术在儿童肺炎支原体肺炎中的应用意义,建立早期诊断儿童肺炎支原体肺炎的有效方法提供基础资料.方法收集284例诊断为儿童肺炎的患者,均给予相同的治疗方法,使用RNA实时荧光恒温扩增技术(SAT)检测治疗前后肺炎支原体抗体(MP-IgG),并比较治疗前后发热时间、白细胞构成比差异.结果 MP肺炎患儿的SAT阳性率明显升高(P<0.01);随着治疗时间的延长,MP-IgG阳性率呈增高趋势(P<0.01).随着SAT转阴时间延长,MP肺炎患儿发热持续时间越长、中性粒细胞百分比升高,淋巴细胞百分比降低(P<0.01).结论 SAT 法是评价MP肺炎发展和愈合的有效指标.【总页数】2页(P1124-1125)【作者】白莉;高煜;姜伟艳;张井兰【作者单位】163000 黑龙江省大庆市,大庆油田总医院;大庆市人民医院;163000 黑龙江省大庆市,大庆油田总医院;163000 黑龙江省大庆市,大庆油田总医院【正文语种】中文【中图分类】R375【相关文献】1.RNA恒温扩增实时荧光检测技术在检测脑脊液中结核分枝杆菌的应用 [J], 张海晴;黄海滨;王春颖;刘成永;胡永领;侯远沛;成松;周冬青2.实时荧光核酸恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎治疗中的应用研究 [J], 牛春密;梁航;刘丽;赵靖;徐淑凤3.评价RNA恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断价值 [J], 白莉;高煜;张井兰4.评价RNA恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断价值 [J], 白莉;高煜;张井兰5.RNA实时荧光恒温扩增技术在儿童支原体肺炎抗生素治疗中的指导价值 [J], 王紫荆;马云驰;庄琴;汪蓉;胡小林;方剑;赵云;尹清金;侯晓华;谢屹峰;朱静因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
RNA恒温扩增技术快速检测(TB-SAT)痰结核杆菌在鉴别肺部感染性疾病的临床观察
RNA恒温扩增技术快速检测(TB-SAT)痰结核杆菌在鉴别肺部感染性疾病的临床观察结核病是由结核分枝杆菌引起的肺部疾病。
由于肺结核病的症状,体征和X线表现同许多胸部疾病相似肺,因此在诊断时常需鉴别。
肺结核病确诊目前我们在临床主要靠痰涂片和痰结核菌培养阳性来定诊。
但是依据常规痰涂片阳性率低,痰培养时间长需45天,这些原因给快速诊断病情带来困难。
2014年我院引进RNA恒温扩增技术快速检测痰结核分枝杆菌给临床带来希望。
一种利用RNA恒温扩增的结核分枝杆菌核酸检测试剂盒。
目的用RNA恒温扩增实时检测(SAT—TB)快速检测临床痰标本中的MTB,并对检测效果进行评估。
方法痰标本取自哈尔滨市肺科医院的肺部感染性疾病与肺结核鉴别的患者资料和方法1.研究对象;2014年7月至2015年1月就诊于哈尔滨市胸科医院的患者76例,男43例,女76例。
年龄最高89岁,最少7岁。
平均年龄48岁。
咳嗽46例,胸闷23,咳痰31,低热19.,高热3例。
咳血6例,体检发现肺阴影3例。
盗汗8例。
消瘦10例。
76例病人肺CT显示肺部阴影不能除外肺结核2.方法,以上病例全部留取痰结核菌涂片,痰结核菌培养,及TB-SAT结核菌。
TB-SAT原理;同一温度下,首先通过M-MLV反转录酶产生靶标核酸(RNA)的一个双链DNA 拷贝,然后利用T7 RNA多聚酶从该DNA拷贝上产生多个(100~1000个)RNA拷贝;每一个RNA拷贝再从反转录开始进入下一个扩增循环;同时,带有荧光标记的探针和这些RNA拷贝特异结合,产生荧光。
该荧光信号可由荧光检测仪器实时捕获,实时反映扩增循环情况。
3.结果;痰结核培养阳性4例,痰涂片阳性6例,TB-SAT阳性5例。
诊断明确肺结核6例,临床诊断30例。
肺癌7例。
肺炎18,声带结核2例,间质肺2例支气管扩张2例,肺化脓2例,淋巴瘤1例讨论;结核病是由结核分枝杆菌引起的肺部疾病。
由于肺结核病的症状,体征和X线表现同许多胸部疾病相似肺,因此在诊断时常需鉴别。
RNA实时荧光恒温扩增技术在检测儿童肺炎支原体肺炎中的应用
齐齐哈尔医学院学报 2018年第 39卷第 lO期 Journal of Oiqihar Medical University,2018,Vo1.39.No.10
RNA实 时 荧 光 恒 温 扩 增 技 术 在 检 测 儿 童肺 炎 支 原 体 肺 炎 中 的应 用
. 经 验 交 流 .
pneumonia in children BA,Li. General Hospital of Daqing Oil Field,Daqing,Heilong,jiang,163001,China. 【Abstract】 objective To explore the application significance of RNA real—time simultaneous
【关键词 】 肺炎支原体 ; RNA实时荧光恒温扩增技 术 ; 中性粒 细胞 ; 淋 巴细胞 [中 图 分 类 号 ]R375 [文献 标 识 码 ]A DOI:10.3969/j.issn.1002—1256.2018.10.003
Application of RNA real—tim e sim ultaneous am plif ication and testing for the detection of m ycoplasm a
白莉 高煜 姜伟 艳 张井 兰
【摘要 】 目的 探 索 RNA实时荧 光恒温扩 增技术 在儿童肺 炎支原体 肺炎 中的应用 意义 ,建立早 期 诊 断儿童肺炎支原体肺炎 的有效方法提供基础 资料 。方法 收集 284例诊 断 为儿童 肺炎 的患者 ,均给 予 相同的治疗方法 ,使用 RNA实 时荧 光恒温扩增技术 (SAT)检测 治疗前后肺炎支原 体抗 体 (MP—IgG),并 比 较治疗前后发热 时间 、白细胞构成 比差异 。结果 MP肺炎患儿 的 SAT阳性率 明显升高 (P<0.01);随着治 疗时间 的延长 ,MP—IgG阳性率呈增 高趋 势(P<0.01)。随着 SAT转 阴时 间延长 ,MP肺炎患 儿发热 持续时 间越长 、中性粒细胞百分 比升 高 ,淋 巴细胞百 分 比降低 (P<0.01)。结论 SAT法是评价 MP肺 炎发展和愈 合 的有 效 指 标 。
基于RNA恒温扩增技术分析天津地区呼吸道感染住院儿童肺炎支原体感染的流行病学特点
㊀2019,35(3)中国人兽共患病学报C h i n e s e J o u r n a l o f Z o o n o s e sD O I :10.3969/j.i s s n .1002-2694.2019.00.005 实验研究基于R N A 恒温扩增技术分析天津地区呼吸道感染住院儿童肺炎支原体感染的流行病学特点王㊀朝1,王㊀维1,郭㊀伟2,吕㊀玲3,李维超4,李会强5,林书祥1国家自然科学基金项目(N o .81772259);天津市卫生局科技基金(N o .2011K Z 33);天津市卫生局科技基金(N o .2015K Z 038)联合资助通讯作者:林书祥,E m a i l :l j u n ju n d @s i n a .c o m ;O R C I D :0000G0001G9365G7201作者单位:1.天津市儿童医院/天津市儿科研究所,天津㊀300134;2.天津市儿童医院呼吸科,天津㊀300134;3.天津市儿童医院内分泌科,天津㊀300134;4.天津市儿童医院风湿免疫科,天津㊀300134;5.天津医科大学医学检验学院,天津㊀300203摘㊀要:目的㊀分析天津地区呼吸道感染住院儿童肺炎支原体(M P )感染的流行病学特点,探讨R N A 恒温扩增技术(S A T )在M P 检测中的应用.方法㊀收集2016年5月-2018年5月在天津市儿童医院住院的1782例呼吸道感染患儿的M P GR N A 检测结果和其他临床资料,进行回顾性分析.结果㊀2016年5月-2018年5月天津市儿童医院呼吸道感染住院儿童M P 总检出率为39.79%,男性患儿M P 检出率为36.62%,女性为43.63%,女性患儿平均年龄及M P 检出率均高于男性(χ2=9.04,P <0 05).M P 感染见于各年龄组住院儿童,新生儿与婴儿组㊁幼儿组㊁学龄前期组和学龄期组患儿的M P 检出率分别为9 76%㊁26.28%㊁48.08%和63.51%.M P 感染全年可见,春夏秋冬四季检出率分别为23.15%㊁31.65%㊁59.50%和44 73%,秋冬季M P 检出率高于春夏季(χ2=114.70,P <0 05).肺泡灌洗液㊁痰液㊁咽拭子和胸腹水的M P GR N A 阳性率分别为77.89%㊁20.38%㊁32 15%和27.27%.M P GR N A 与M P GD N A 检测结果存在差异(P <0 05).结论㊀天津地区呼吸道感染住院儿童中,女性患儿M P 检出率高于男性,总的M P 检出率随着患儿年龄的增大而增高,M P 检出率秋季最高,肺泡灌洗液M P GR N A 阳性率明显高于其他标本类型.R N A 恒温扩增技术适用于M P 感染早期诊断和病情监测.关键词:肺炎支原体检测;R N A 恒温扩增技术;流行病学分析;儿童中图分类号:R 375㊀㊀㊀文献标识码:A ㊀㊀㊀文章编号:1002-2694(2019)03-0223-06E p i d e m i o l o g i c a l a n a l y s i s o f M y c o p l a s m a p n e u m o n i a e f r o mr e s p i r a t o r yt r a c t i n f e c t i o n i nh o s p i t a l i z e d c h i l d r e n i nT i a n j i n r e gi o nb a s e d o nR N Ac o n s t a n t Gt e m p e r a t u r e a m pl i f i c a t i o n WA N GC h a o 1,WA N G W e i 1,G U O W e i 2,L Y U L i n g 3,L IW e i GC h a o 4,L IH u i GQ i a n g 5,L I NS h u GX i a n g1(1.T i a n j i nP e d i a t r i cR e s e a r c hI n s t i t u t e ,T i a n j i nC h i l d r e n sH o s p i t a l ,T i a n j i n 300134,C h i n a ;2.D e p a r t m e n t o f R e s p i r a t i o n ,T i a n j i nC h i l d r e n sH o s p i t a l ,T i a n ji n 300134,C h i n a ;3.D e p a r t m e n t o f E n d o c r i n o l o g y ,T i a n j i nC h i l d r e n sH o s p i t a l ,T i a n j i n 300134,C h i n a ;4.D e p a r t m e n t o f R h e u m a t i s ma n dI mm u n o l o g y ,T i a n j i nC h i l d r e n sH o s p i t a l ,T i a n ji n 300134,C h i n a ;5.S c h o o l o f M e d i c a lL a b o r a t o r y ,T i a n j i n M e d i c a lU n i v e r s i t y ,T i a n j i n 300203,C h i n a )A b s t r a c t :T o a n a l y z e t h ee p i d e m i o l o g i c a l c h a r a c t e r i s t i c so f M y c o pl a s m a p n e u m o n i a e (M P )i n f e c t i o n i nh o s p i t a l i z e dc h i l Gd r e nw i t h r e s p i r a t o r y t r a c t i n f e c t i o n i nT i a n j i na n d t o e x p l o r e t h e a p p l i c a t i o no fR N Ac o n s t a n t t e m p e r a t u r e a m p l i f i c a t i o n t e c h Gn o l o g y i n t h e d e t e c t i o n o fM P ,t h eM P GR N At e s t r e s u l t s a n d o t h e r c l i n i c a l d a t a o f 1782c h i l d r e nw i t h r e s p i r a t o r yt r a c t i n f e c t i o n w h ow e r eh o s p i t a l i z e d i nT i a n j i nC h i l d r e n sH o s p i t a l f r o m M a y 2016t o M a y 2018w e r e r e t r o s p e c t i v e l y a n a l yz e d .T h e r e s u l t s s h o w e dt h a tt h et o t a l M Pi n f e c t i o nr a t eo ft h eh o s pi t a l i z e d c h i l d r e nw i t h r e s p i r a t o r y i n f e c t i o n i nT i a n j i nC h i l d r e n sH o s Gp i t a lw a s 39.79%f r o m M a y 2016t oM a y 2018,t h eM P i n f e c Gt i o n r a t e i n m a l e p a t i e n t sw a s36.62%,a n dt h a to f f e m a l e s w a s 43.63%.T h em e a na g ea n d M Pi n f e c t i o nr a t eo f f e m a l e p a t i e n t sw e r eh i g h e r t h a n t h o s e o fm a l e s (P <0 05).M P i n Gf e c t i o nw a sf o u n di nh o s p i t a l i z e dc h i l d r e no fa l l a g e g r o u p s ,t h eM Pi n f e c t i o nr a t e so fn e o n a t ea n di n f a n t g r o u p ,t o d d l e r g r o u p ,p r e s c h o o l Ga g e g r o u p a n d s c h o o l Ga g e g r o u p we r e 9 76%,26.28%,48.08%a n d63.51%,r e s p e c t i v e l y .M Pi n G322f e c t i o nw a s f o u n d t h r o ugh o u t t h e y e a ri nh o s p i t a l i z e d c h i l d r e nw i t h r e s p i r a t o r y t r a c t i n f e c t i o n,t h e i n f e c t i o nr a t ew a s23.15%,31.65%,59.50%a n d44.73%i n t h e s p r i n g,s u mm e r,a u t u m na n dw i n t e r,r e s p e c t i v e l y,t h e M P i n f e c t i o nr a t e i na u t u m na n d w i n t e rw a sh i g h e r t h a n t h a t i n s p r i n g a n d s u mm e r(P<0 05).T h e p o s i t i v e r a t e s o fM PGR N Ai nb r o n c h o a l v e o l a r l a v a g e f l u i d, s p u t u m,t h r o a t s w a b,a n d p l e u r a l e f f u s i o nw e r e77.89%,20.38%,32.15%,a n d27.27%,r e s p e c t i v e l y.T h e r ew a s a d i f f e r e n c e b e t w e e nM PGR N Aa n dM PGD N At e s t r e s u l t s(P<0 05).I nC o n c l u s i o n,a m o n g t h e h o s p i t a l i z e d c h i l d r e nw i t h r e s p i r a t o r y i n f e cGt i o n s i nT i a nj i n,t h e i n f e c t i o n r a t e o fM Pw a s h i g h e r i n f e m a l e s t h a n t h a t i nm a l e s,t h e r a t e i n c r e a s e dw i t h t h e i n c r e a s e o f a g e, t h eh i g h e s tM P i n f e c t i o n r a t ew a s i n s c h o o lGa g e c h i l d r e n,t h eM P i n f e c t i o n r a t e i n a u t u m nw a s s i g n i f i c a n t l y h i g h e r t h a n t h a t i n o t h e r s e a s o n s,a n d t h e p o s i t i v e r a t e o fM PGR N Ai nb r o n c h o a l v e o l a r l a v a g e f l u i dw a s s i g n i f i c a n t l y h i g h e r t h a n i n o t h e r s p e c i m e n t y p e s,R N Ac o n s t a n tGt e m p e r a t u r e a m p l i f i c a t i o n t e c h n o l o g y w a s s u i t a b l e f o r e a r l y d e t e c t i o no fM P i n f e c t i o n.K e y w o r d s:M y c o p l a s m a p n e u m o n i a e d e t e c t i o n;R N A c o n s t a n tGt e m p e r a t u r e a m p l i f i c a t i o n t e c h n o l o g y;e p i d e m i o l o g i c a l a n a l y s i s;c h i l d r e nS u p p o r t e db y N a t i o n a lN a t u r a l S c i e n c eF o u n d a t i o n o f C h i n a(N o.81772259),S c i e n c e a n dT e c h n o l o g y F u n d o fT i a n j i nM u n i c i p a l B u r e a uo f h e a l t h(N o.2011K Z33),S c i e n c e a n dT e c h n o l o g y F u n do fT i a n j i n M u n i c i p a l B u r e a uo f h e a l t h(N o.2015K Z038)㊀㊀支原体是介于细菌和病毒之间,无细胞壁并能够独立生存的最小微生物.肺炎支原体(M y c oGp l a s m a p n e u m o n i a e,M P)是引起呼吸道感染的常见病原体,通过飞沫传播,儿童感染最为多见,可发生于各个年龄段,全年可见,其发病率与性别㊁年龄㊁季节㊁地区有一定相关性[1].M P可引起急性上呼吸道感染㊁支气管炎和支气管肺炎(M y c o p l a s m a p n e u m o n i a e p n e u m o n i a,M P P)以及溶血性贫血㊁脑膜炎㊁心肌炎㊁肾炎等肺外并发症.婴幼儿M P P起病急,病程长,病情重,表现为发热㊁剧咳㊁呼吸困难和喘憋等,但其临床表现不是十分典型,容易误诊,从而延误治疗.M P P占儿童肺炎的10%~20%,流行年份可达30%[2G3].在大于5岁的儿童中,M P 引起超过40%的社区获得性肺炎.在每4~7年一次的M P流行中,由M P导致的社区获得性肺炎会成倍增加.轻型M P感染性疾病尤其是支气管炎比社区获得性肺炎多至少20倍,但近20%的M P感染无临床症状[4].因此掌握儿童M P感染的流行病学特点,使用快速㊁准确㊁低成本的检测方法很有必要[5].基于实时荧光核酸恒温扩增检测技术(S i m u lGt a n e o u sA m p l i f i c a t i o na n d T e s t i n g,S A T)的M PGR N A检测直接以病原体特异性R N A为扩增靶标,使用MGM L V反转录酶㊁T7R N A多聚酶和优化探针进行恒温扩增,具有无创㊁快速㊁操作简单及高诊断准确性等优点.目前S A T技术已应用于肺结核㊁泌尿生殖道沙眼衣原体和淋球菌等病原体的检测,亦见于少数对支原体检测的报道[6G7],但上述报道均为方法学研究,目前尚无基于S A T技术的关于M P 的流行病学报道.为了解天津地区M P流行病学特点,为临床诊断和治疗提供参考,本研究选取2016年5月-2018年5月在天津市儿童医院拟诊断为呼吸道感染的住院患儿1782例,对其M PGR N A检测结果及其他临床资料进行比较分析,现将结果报告如下.1㊀材料与方法1.1㊀研究对象㊀选择2016年5月-2018年5月在天津市儿童医院拟诊断为呼吸道感染的住院患儿1782例作为研究对象,其中男性患儿975例,女性患儿807例,男女比例1.21ʒ1.00,年龄在1月-16岁之间.全部病例标本均进行M PGR N A检测,其中560例同时进行M PGD N A检测.统计标本入选:以患儿首次入院首次检测的标本为准,如同时检测多种标本,以阳性标本为准.临床诊断标准依据«诸福棠实用儿科学»第八版[2].1.2㊀试剂和仪器㊀试剂使用上海仁度生物科技有限公司的M P核酸检测试剂盒(R N A恒温扩增)和中山大学达安基因股份有限公司的M P核酸检测试剂盒(P C R荧光探针法),仪器使用A B IP r i s m7500荧光定量P C R仪.1.3㊀标本处理与检测1.3.1㊀M PGR N A检测㊀R N A提取及反应体系配置:取新鲜肺泡灌洗液㊁咽拭子㊁痰液或胸腹水标本,肺泡灌洗液使用原标本,咽拭子中加入1m L生理盐水浸泡混匀,痰液用4倍生理盐水稀释混匀,胸腹水使用原标本;取200μL标本,先后加入200μL裂解液和100μL核酸提取液并依次混匀;阴阳性对照按使用说明书配置;60ħ保温5m i n,室温平衡10m i n;使用磁珠分离装置分离磁珠并清洗两次;用40μL扩增检测液与磁珠混匀,最后取30μL混合液置于微量反映管中,60ħ保温10m i n,42ħ保温5422中国人兽共患病学报2019,35(3)m i n,完成提取.30μL上述提取液中加入10μL酶液组成40μL最终反应体系.反应程序设置:42ħ1m i n,40个循环;荧光素通道设定为F1(F AM)和F2(H E X或者V I C),荧光信号每分钟收集一次.阳性结果判定:F1通道C tɤ35且溶解曲线在64ʃ5ħ区间有吸收峰,F2通道有或者无数值的样本为阳性;F1通道35<C t<40,F2通道有或者无数值的样本重新检测,检测结果C t<40且溶解曲线在64ʃ5ħ区间有吸收峰的样本为阳性.1.3.2㊀M PGD N A检测㊀D N A提取及反应体系配置:痰液用4倍生理盐水稀释混匀,4ħ冰箱过夜,咽拭子中加入1.5m L生理盐水浸泡混匀,4ħ冰箱过夜,肺泡灌洗液和胸腹水使用原标本;取上述标本1m L至1.5m L离心管中,12000r/m i n离心5m i n;去上清,沉淀中加入50μL D N A提取液充分混匀,100ħ恒温处理10m i n,12000r/m i n离心5m i n备用.阴阳性对照按使用说明书配置.40μL M PP C R反应液㊁3μLT a q酶及2μL样品处理上清液组成最终反应体系.反应程序设置:93ħ2m i n;93ħ45s,55ħ60s,10个循环;93ħ30s,55ħ45s,30个循环.阳性结果判定:扩增曲线呈S型且C t值<30,则结果为阳性.1.4㊀统计学分析㊀采用S P S S22.0软件进行数据处理和统计分析,计量资料以xʃs表示,组间比较采用t检验;计数资料以例数或百分率表示,各组阳性率比较采用卡方检验,P<0 05为差异有统计学意义.2㊀结㊀果2.1㊀M P感染总体情况㊀本研究共检测拟诊断为呼吸道感染的住院患儿1782例,M PGR N A结果为阳性者709例,总阳性率39.79%.同时进行M PGR N A和M PGD N A检测的患儿共560例,其中M PGR N A阳性者430例,阳性率为76.79%,M PGD N A 阳性者450例,阳性率为80.36%.2.2㊀M P感染的性别差异㊀本研究中男性患儿M P 检出率(指M PGR N A,下文未注明者均同)为36.62%(357/975),女性患儿M P检出率为43.63%(352/807).女性患儿M P检出率高于男性患儿(表1),两者差异有统计学意义(χ2=9.04,P<0 05),可推测天津地区呼吸道感染住院患儿的M P整体检出率女性高于男性.表1㊀M P感染的性别分布T a b.1㊀G e n d e r d i s t r i b u t i o no fM P i n f e c t i o n 性别观察病例数(n)阳性病例数(n)阳性率/%构成比/%男97535736.6250.35女80735243.6249.65合计178270939.79100 002.3㊀不同年龄患儿M P检出率比较㊀本研究中男性患儿的平均年龄为(4.45ʃ3.37)岁;女性患儿的平均年龄为(5.01ʃ3.34)岁,两者平均年龄比较差异有统计学意义(t=3.54,P<0 05),女性患儿年龄略高于男性.在不同年龄组分布方面,新生儿与婴儿组㊁幼儿组㊁学龄前期组和学龄期组患儿M P检出率分别为9.79%(32/328)㊁26.28%(123/468)㊁48.08%(225/468)和63.51%(329/518).不同年龄组M P检出率比较差异有统计学意义(χ2=294.25, P<0 05),其中新生儿与婴儿组最低,学龄期组最高,M P检出率随着年龄的增大而增高(表2).表2㊀M P感染的年龄分布T a b.2㊀A g e d i s t r i b u t i o no fM P i n f e c t i o n年龄观察病例数(n)阳性病例数(n)阳性率/%构成比/%新生儿与婴儿组(0-1岁)328329.764.51幼儿组(>1-3岁)46812326.2817.35学龄前期组(>3-6岁)46822548.0831.73学龄期组(>6岁)51832963.5146.40合计178270939.79100.002.4㊀不同月份(季节/年份)M P检出率比较㊀天津地区M P感染全年可见,图1列出了2016年5月-2018年5月这一时期内不同月份(1-12月)呼吸道感染患儿的M P检出率,可以看出不同月份间M P 检出率有很大不同,其中9月份最高,达64 52%,4月份最低,为18.47%.若依照季节对表中数据进行整理,我们可以得出,天津地区春(3-5月)㊁夏(6-8月)㊁秋(9-11月)㊁冬(1-2,12月)四季呼吸道感染患儿的M P检出率分别为23.15%(141/609)㊁31 65%(25/79)㊁59.50%(216/363)和44.73%(327/731).秋季呼吸道感染患儿M P检出率明显5223期王㊀朝等:基于R N A恒温扩增技术分析天津地区呼吸道感染住院儿童肺炎支原体感染的流行病学特点高于其他季节,秋冬季M P 检出率高于春夏季(χ2=114.70,P <0 05).若按自然年划分,2016㊁2017和2018年度天津地区呼吸道感染患儿M P 检出率分别为:55.27%(173/313)㊁50.58%(395/781)和20 49%(141/688).图1㊀天津地区不同月份呼吸道感染住院患儿M P 感染率F i g .1㊀M P i n f e c t i o n r a t e o fh o s pi t a l i z e dc h i l d r e nw i t hr e Gs p i r a t o r y t r a c ti n f e c t i o n i n T i a n j i n i n d i f f e r e n t m o n t h s2.5㊀标本类型对M P GR N A 阳性率的影响㊀此研究中M P 检测共有4种标本类型:肺泡灌洗液㊁痰液㊁咽拭子和胸腹水,其M P GR N A 阳性率分别为77 89%(391/502)㊁20.38%(161/790)㊁32 15%(154/479)和27.27%(3/11).不同标本类型间M P GR N A 阳性率比较差异有统计学意义(χ2=440 78,P <0 05),肺泡灌洗液M P GR N A 阳性率明显高于其他标本类型(表3).表3㊀不同标本类型中M P GR N A 阳性率T a b .3㊀P o s i t i v e r a t e o fM P GR N A i nd i f f e r e n t s p e c i m e n t y p e s 标本类型观察病例数(n )阳性病例数(n )阳性率(%)构成比(%)肺泡灌洗液50239177.8955.15痰液79016120.3822.71咽拭子47915432.1521.72胸腹水11327.270.42合计178270939.791002.6㊀M P GR N A 检测结果与M P GD N A 检测结果的比较㊀为探究R N A 检测与D N A 检测在M P 检测中不同,遂对本研究中同时进行M P GR N A 检测和M P GD N A 检测的560份标本的检测结果进行比较(表4),两者具有较好的一致性(K a p pa =0 704,P <0 001),一致率为73.57%(412/560);M P GR N A检测阳性率为76.79%(430/560),低于M P GD N A检测阳性率(80.36%)(450/560),且两者差异具有统计学意义(M c N e m a r 检验:P <0 05).表4㊀M P GR N A 和M P GD N A 检测结果比较T a b .4㊀T e x t r e s u l t s c o m p a r i s o no fM P GR N Aa n dM P GD N A M P GD N A 检测M P GR N A 检测合计阴性病例数(n )阳性病例数(n )阴性病例数(n )9218110阳性病例数(n )38412450合计1304305603㊀讨㊀论M P 感染是一种全球感染性疾病,以呼吸道感染最常见,患者为主要的传染源,通过飞沫经呼吸道传播,尤其多见于儿童.M P 感染与性别㊁年龄以及季节有一定关系,不同性别和年龄患儿的M P 发病率情况在不同地区具有一定的一致性,而不同地区患儿的M P 检出率则不尽相同[8].M P 感染诊断中,血清特异性抗体检测是目前最常见的方法,以往儿童M P 感染流行病学分析多使用此方法,但其缺陷在于较难鉴别急性感染或既往感染.近年来分子诊断技术广泛应用于M P 诊断领域,包括常规P C R ㊁巢式P C R ㊁实时荧光定量P C R 等.与血清学方法相比,P C R 方法敏感度㊁特异性和可靠性更高,而且不受患儿免疫状态的影响,有利于M P 感染的早期诊断[9].M P GD N A (P C R )检测技术的不足之处在于其不依赖于M P 的存活状态,阳性结果无法区分急性感染㊁无症状感染和感染后的持续携带状态,有研究显示,动态检测M P 感染后其D N A 持续携带的中位数时间为7周,个别可长达7个月之久[10G11].作为R N A 检测技术之一的S A T 技术以特异性R N A 为靶标,由于R N A 在菌体中含量较高且只存在于活体菌株中,S A T 技术可提高病原体检出的敏感度和特异性,能够即时反映病原体感染情况,使诊断具有更高的准确率,可作为检测病原体感染的可靠方法[12G13].本次检测中有560份标本在进行M P GR N A 检测的同时进行了M P GD N A 检测,其中有56份标本的检测结果不同,当中18份标本的M P GD N A 结果为阴性,而M P GR N A 的结果为阳性;38份标本的M P GD N A 结果为阳性,而M P GR N A 结果为阴性.查阅这些病例的临床及血清学检测结果,发现前者标本多在疾病早期留存,而后者患儿多在住院前已进行过有针对性622中国人兽共患病学报2019,35(3)的抗生素治疗,前者血清学检测结果阳性率及抗体滴度亦明显低于后者,提示M PGD N A阴性而M PGR N A阳性者多见于早期M P感染患儿,而M PGD N A阳性且M PGR N A阴性者多见于疾病治疗后的恢复期.这些结果表明S A T技术比M PGD N A 检测具有更高的灵敏度,更适合于早期诊断,亦更适用于M P感染后治疗和恢复情况的监测.本研究基于S A T技术共检测住院呼吸道感染患儿1782例,M PGR N A结果阳性者709例,总阳性率39.79%.最近几年国内呼吸道感染患儿M P检出率中,东北地区有报道30.19%[14],西北地区有报道30.79[15],长江三角洲地区有报道20.97%[16],西南地区有报道27.01%[17],华北地区此前有报道27 23%[18].比较上述各地区M P检出率,变化较大,但以此次天津地区M P检出率为最高,分析其原因,一方面检测方法不同,上述文献报道均使用血清学检测方法,而此次报道采用S A T技术;另一方面可能与标本类型有关,此次检测中肺泡灌洗液所占比例较大且其阳性率远高于其他类型标本,高达77 89%(391/502)(表3);此外不能排除天津地区住院患儿M P感染(携带)率原本高于其他地区的可能性.目前国内外针对肺泡灌洗液的M P核酸检测尚少见,国外曾有研究者收集319例患有慢性呼吸系统疾病的患儿的肺泡灌洗液,并利用P C R方法检测其M PGD N A,结果显示10%的患儿M PGD N A阳性[19],这与此次检测结果有一定差别,其中原因有待进一步研究.以往报道中,不同性别间M P检出率差异不尽一致,到目前为止尚无明确证据表明M P感染存在性别差异.本次检测结果显示,男性患儿M P感率为36.63%,女性患儿M P感率为43.62%,女性高于男性,两者差异有统计学意义.M P感染可发生于儿童各年龄段,国内外报道均显示M P感染发病的高峰期为学龄前期和学龄期儿童[8,20],本次检测结果显示,天津地区各年龄段呼吸道感染住院儿童M P检出率有显著差异,结果具有统计学意义,M P 检出率随着年龄的增大而增大,学龄前期尤其是学龄期患儿M P检出率明显高于其他年龄组患儿,这与上述以往研究相一致.分析其原因,学龄期儿童走出家庭进入人员密集环境,一方面在适应的过程中免疫力下降,另一方面被传染的概率大大增加.M P感染见于全年各个季节和月份,不同地区的高发季节并不相同.在国内M P检出率的问题上,以往观点多以南北方论,认为北方多发于冬春季,南方多发于夏秋季,但部分研究并不支持这一观点.地处我国北方的北京地区秋冬季M P检出率明显高于春夏季[21],地处长江三角洲地区的南京以夏半年较多,其春夏季的M P检出率高于秋冬季[22].而同属南方,位于珠江三角洲地区的广州的冬季的M P检出率高于其他季节[23].研究显示M P感染与环境温度和湿度呈正相关,温度和湿度可能才是M P感染和致病的更直接因素,而非直接取决于地域或气候[24].本次检测显示,天津地区呼吸道感染住院患儿M P检出率秋季最高,且秋冬季明显高于春夏季.这与上述北京地区研究结果基本一致.此外,M P感染每隔几年就会在大范围的区域内出现一次周期性流行,从2010年起,欧洲地区尤其是欧洲北部国家M P检出呈现上升趋势,同时期的其他地区如巴西㊁以色列㊁韩国和日本也出现流行[25].从2011年至2013年,中国北方地区出现一次明显的M P感染流行,2014年至2016年M P感染又进入低潮期[26].此次报道天津地区M P检出率呈整体下降趋势,周期性流行趋势有待更长时间的监测.综上所述,R N A恒温扩增技术是检测M P感染的有效方法,具有较高的敏感度和准确率.天津地区呼吸道感染住院儿童M P总检出率为39.79%,女性患儿检出率高于男性;M P感染可发生在各年龄段儿童且会随着年龄的增大而增高,其中学龄期儿童M P检出率最高;M P感染见于全年,秋冬季M P 检出率高于春夏季,秋季检出率明显高于其他季节.利益冲突:无引用本文格式:王朝,王维,郭伟,等.基于R N A 恒温扩增技术分析天津地区呼吸道感染住院儿童肺炎支原体感染的流行病学特点[J].中国人兽共患病学报,2019,35(3):223G228.D O I:10.3969/j.i s s n.1002G2694.2019.00.005参考文献:[1]I z u m i k a w aK.C l i 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支气管肺泡灌洗液RNA恒温扩增检测涂阴肺结核的诊断价值
临床 肺科 杂 志
2 0 1 5年 1 1月 第2 0卷第 1 1 期
支气 管肺 泡 灌洗 液 R N A 恒 温扩 增 检 测涂 阴肺 结核 的诊 断价 值
任斐 周永 严 文 苗 风 济 岳 英
【 摘要 】 目的 评价支气 管肺 泡灌 洗液结核分枝杆菌 R N A恒温扩增检测 ( s i m u l t a nபைடு நூலகம்e o u s a mp l i f i c a t i o n a n d
t e s t i n g f o r M y c o b a c t e r i u m t u b e r c u l o s i s ,S A T — T B ) 对涂 阴肺 结核 的诊 断价值 。方 法 选 取涂 阴肺 结 核组 ( 观察 组) 9 5例和非结核病组 ( 对照组 ) 6 7例共计 1 6 2例 , 两组患者均行纤维支气 管镜检查 , 留取 支气 管肺泡灌 洗液
( 0 2 ) : 8 O一 8 5 .
可 以增 强该 类病 人 的 术后 免 疫 力 , 并 可 明显 降 低 手
术 后肠 瘘 的发生 几率 , 促进 病 变 的恢 复 、 减少 病人 的
病痛 及 经 济负 担。通过 该研 究 , 本人认为 C D 3 + 、
行荧光定 量 P C R( F Q — P C R) , R N A恒 温 扩 增 检 测 ( S A T — T B ) , 结 核 菌快 速 培 养 , 计算 B A L F的 S A T — T B对 涂 阴 肺
结核诊 断的敏感 度 , 特异度 , 阳性预测值 , 阴性预测 值。结果
S A T — T B检测 B A L F对诊 断涂 阴肺结 核 的敏感
运用核酸恒温扩增技术检测肺炎克雷伯菌的试剂及其扩增方法[发明专利]
专利名称:运用核酸恒温扩增技术检测肺炎克雷伯菌的试剂及其扩增方法
专利类型:发明专利
发明人:张霞,郑文杰,刘伟,张宏伟,曲鹏,吴冬雪,赵良娟,刘培,高旗利
申请号:CN201210448968.1
申请日:20121112
公开号:CN102899419A
公开日:
20130130
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种运用核酸恒温扩增技术检测肺炎克雷伯菌的试剂及其扩增方法,设计了六个引物组序列,5’-TACGCCCCGGTCTGAC;5’-GCGCTTTCACCCCCAAC;5’-GTCCCTTTTGCCCGAGGTCGACGGCACGGCCATT;5’-CGACGGCACGGCCATTTGTCCCTTTTGCCCGAGG;5’-TGGCAACGACTGGTCTCGCC;5’-TCGCGTAGGGGGAGGCTGTT。
针对肺炎克雷伯菌,本发明克服了现有技术中的缺点,提供一种运用核酸恒温扩增技术快速低成本的检测方法。
申请人:天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心
地址:300461 天津市塘沽区天津港保税区京门大道158号
国籍:CN
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评价RNA恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断价值
评价RNA恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断价值作者:白莉高煜张井兰来源:《医学食疗与健康》2020年第15期【摘要】目的:讨论价RNA恒温扩增检测技术在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断价值。
方法:现随机选取2018年7月-2019年8月期间我院儿科收治的568例儿童肺炎支原体肺炎患儿作为本次研究对象,入院期间均采取了相同的治疗方案,治疗过程中采用RNA实时荧光恒温扩增技术(SAT)进行了肺炎支原体抗体(MP-IgG)的检测,观察治疗前后患儿白细胞水平和发热时间的差异。
结果:(1)儿童肺炎支原体肺炎患儿的SAT阳性率呈明显上升趋势(P<0.01),组间差异存在统计学意义;(2)随着治疗时间的推进,MP-IgG的阳性率呈逐渐上升趋势(P<0.01),组间差异存在统计学意义;(3)SAT转阴时间越长,患儿中性粒细胞水平越高,发热时间越长,同时淋巴细胞水平越低(P<0.01),统计学意义明显。
结论:在儿童肺炎支原体肺炎的治疗中,SAT技术是评价疾病发展的可参指标,临床应用效果较高,值得应用和推广。
【关键词】SAT;儿童肺炎支原体肺炎;淋巴细胞;中性粒细胞[中图分类号]R725.6 [文献标识码]A [文章编号]2096-5249(2020)15-0-02兒童肺炎支原体肺炎是常见的呼吸系统疾病,由于早期影像学和临床征象不具有特征性,因此存在诊断上的困难。
SAT是近些年新兴的一种分子生物学的检测法,相关研究显示其具有较好的特异性和敏感性[1]。
在既往研究中,SAT曾用于肠道轮状病毒、结核分枝杆菌等病原体的检测[2],但是在肺炎支原体的检测上则鲜有报道,为此,本文将我院收治的儿童肺炎支原体肺炎患儿作为研究对象,对其应用SAT技术进行检测,观察其具体应用效果,详细报道如下。
1 资料与方法1.1一般资料现随机选取2018年7月-2019年8月期间我院儿科收治的568例儿童肺炎支原体肺炎患儿作为本次研究对象,患儿年龄为5-12岁,平均(8.2±1.6)岁,其中男性患儿265例,女性患儿303例,所有患儿经临床观察后均符合《儿童社区获得性肺炎管理指南》中关于儿童肺炎支原体肺炎的诊断标准。
211176203_结核分枝杆菌RNA恒温扩增实时荧光检测技术检测肺泡灌洗液诊断肺结核的价值
规程4)B*和试剂盒说明书进行-将标本分为5份#(份进行 涂片抗酸杆菌染色#(份进行分枝杆菌分离培养及菌种鉴
的检出率较高&+3*)5M#(+5"-)-'#在涂阴培阳标本中检出 率为3+*+NM &-)4"-+B'#在涂阴培阴标本中检出率较低
定 份进行 检测 份进行 检测分枝 #(
T>1>aJ>D? #(
中图分类号A4-(
N)*7"-1'&#("$B-,%*&/#"+%,(-'*&%#-+=,"/"$-("&'-'7(*#("'1/&.!"#$%&#'()*+,'+%()#+-$.*.(*$)'"K%*&'-,B*&,-. ,-B-1*/,%"7/&.7"-1'&#"'1=%,+&'-.5(%0*.$%,&#"# 0$+ _+&6`+H#O*X*67H#4&67F*&$H#4&6701+$H#[+ Q1&$"*H#_+&6 01*,*6J#4+ [*&61$67H; H3(M&)',(6'$<E>*6*#&>O&%$)&'$)"#Q1&&65*A)$-*6#*&>R$/M*'&>$< =+%()#+>$/*/A)(-(6'*$6 &6@ =)(&',(6'#:*,&6 ]HIHII#E1*6&%J3(M&)',(6'$< E>*6*#&>O&%$)&'$)"#Q1&&65* A)$-*6#*&>E&6#()R$/M*'&>#:*,&6]HIIKH#E1*6& E$))(/M$6@*67&+'1$)!4+[*&61$67#N,&*>!HTLIJLKLT\HHJK;#$,
RNA恒温扩增技术快速检测痰标本中结核分枝杆菌的研究
LI Ju n l i a n
( De p a r t me n t o f Me di c a l L a b o r a t o r y; t h e Xi n j i a n g Uy gu r Au t o n o mo u s Re g i o n
Ch e s t Ho s pi t a l , Ur u mq i , Xi n j i a n g 8 3 0 0 4 9, Ch i n a )
r i um t ub e r c ul o s i s ( SA T— T B a s s a y) w a s de s i g ne d t o di a gn os e r a p i d l y pu l m ona r y t u be r c u l o s i s(PTB ) .U nf or t u na t e l y, t he di a g nos t i c
a d v a n t a g e i s u n c l e a r f r o m p r e v i o u s s ma l l s a mp l e s t u d i e s . Ob j e c t i v e I n t h e c u r r e n t i n q u i r y , a l a r g e s a mp l e s i z e wa s u s e d t o r e e v a l u a t e
应用RNA恒温扩增实时荧光检测技术观察抗结核药物的疗效
( J ] . 中国误诊学杂志 , 2 0 1 1 , 1 1 ( 3 ) : 5 7 3 6 7 4 .
应用 R N A恒 温扩 增 实 时荧 光 检 测技 术 观察 抗 结 核 药物 的疗效
胡永领 , 刘 成永 , 成 松( 江 苏 省徐 州市 传染 病 医院 徐州 2 2 1 0 0 4 )
娠期子宫垂体后叶素 比缩宫 素对 子宫收缩 的作 用更显著 。术
中注射垂体后 叶素后 子宫平 滑肌 收缩 明显 , 瘤 体突 出于子 宫 [ 5 ] 秦成路 , 廖莳 , 许可可 , 等. 垂体后 叶素在腹腔镜肌瘤切 除术中的 表面 , 易于剥离 ; 肌瘤剥 离过 程 中子 宫血 管强 烈 收缩 , 达到 显 价值 [ J ] .当代医学 , 2 0 1 4, 2 0 ( 2) : 5 3 - 5 4 . 著 的止血效果 。所 以垂 体后 叶素组 手术 操作 更 方便 , 手术 时 [ 6 ] 柯小 宁, 李艳 , 张建红 , 等. 腹腔镜下 子宫肌瘤切 除术中联合应用 间也相应缩短 , 同时元明显血流动力学变化 。J 。 垂体后 叶素 与呋塞米 的临床研 究 [ J ] .中国微 创外科杂 。 2 0 1 0 , 1 0 3 . 3 临床观察 到应用 垂体后 叶素 1 5 mi n时 平均 动脉 压和 心
参 考 文献
[ 1 ] 风芝 , 冷金花 , 郎景和 . 腹 腔镜 子宫肌瘤 剔除术 的临床进展 【 J ] .
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叶 素 组平 均 动 脉 压 和 心 率 上 升 相 对 明 显 , 与 缩 宫 素 组 相 比 差 和其 他 不 良反 应 。 主要 由于 垂 体 后 叶 素 在 剧 烈 收 缩 平 滑 肌 的
RNA恒温扩增技术诊断新生儿解脲脲原体感染的价值
RNA恒温扩增技术诊断新生儿解脲脲原体感染的价值童郁;邵展;戴显宁;许锴;李阳阳;林建萍【期刊名称】《中华新生儿科杂志》【年(卷),期】2017(032)005【摘要】目的探讨RNA恒温扩增技术(RNA-simuhaneous amplification and testing,RNA-SAT)诊断新生儿解脲脲原体(Ureaplasma urealyticum,Uu)的价值.方法选取2014年3月至2016年3月本院新生儿科收治的疑似Uu感染患儿,取咽拭子或气管内分泌物标本,分别采用分离培养法、RNA-SAT法、荧光定量聚合酶链反应(fluorescence quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)法及胶体金法检测Uu,以分离培养法阳性作为参考,计算另外3种检测方法的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,以及治疗后的阴转率.结果共纳入210例临床疑似Uu感染新生儿,治疗前分离培养法Uu阳性56例,以此为参考,RNA-SAT 法、FQ-PCR法和胶体金法检测Uu的敏感度和特异度分别为91.1%和95.5%、89.3%和90.9%、75.0%和94.2%,RNA-SAT法敏感度和特异度均最高.治疗7、14、21 d RNA-SAT法检测Uu的阴转率分别为48.9%(23/47)、72.3%(34/47)、93.6%(44/47),治疗21 d时RNA-SAT法阴转率高于FQ-PCR法和胶体金法,差异有统计学意义(P<0.05).结论 RNA-SAT法检测新生儿Uu感染的敏感度和特异度均较高,对新生儿Uu感染疗效的评价有应用价值.【总页数】3页(P371-373)【作者】童郁;邵展;戴显宁;许锴;李阳阳;林建萍【作者单位】温州市人民医院检验科,325000【正文语种】中文【中图分类】R698.2【相关文献】1.实时荧光核酸恒温扩增技术在解脲脲原体检测中的应用2.实时荧光核酸恒温扩增技术和液体培养法在不孕不育人群解脲脲原体检测中的应用比较3.实时荧光核酸恒温扩增技术在解脲脲原体检测中的临床应用价值4.实时荧光核酸恒温扩增技术和实时荧光定量聚合酶链反应检测解脲脲原体的效果比较5.比较实时荧光核酸恒温扩增技术(SAT)和液体培养法在解脲脲原体(UU)检测中的诊断价值因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
RNA恒温扩增实时检测技术联合荧光定量PCR技术对痰涂片阴性肺结核患者的诊断价值分析
RNA恒温扩增实时检测技术联合荧光定量PCR技术对痰涂片阴性肺结核患者的诊断价值分析任成新【期刊名称】《中国现代药物应用》【年(卷),期】2022(16)17【摘要】目的研究核糖核酸(RNA)恒温扩增实时检测技术和荧光定量聚合酶链式反应(PCR)技术联合应用于痰涂片阴性肺结核患者诊断中的临床价值。
方法80例痰涂片阴性肺结核患者,在治疗前分别采用RNA恒温扩增实时检测技术、荧光定量PCR技术、两项技术联合方式对肺泡灌洗液标本进行检测。
比较三种检测方法的阳性率、操作时间、确诊时间、住院时间、满意度。
结果联合检测阳性率96.25%高于RNA恒温扩增实时检测技术的75.00%、荧光定量PCR技术的78.75%,差异有统计学意义(P<0.05)。
RNA恒温扩增实时检测技术与荧光定量PCR技术检测的阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。
联合检测操作时间(42.19±8.10)min长于RNA恒温扩增实时检测技术的(28.16±5.08)min、荧光定量PCR技术的(26.73±6.95)min,确诊时间(1.68±0.35)h、住院时间(10.27±2.55)d短于RNA恒温扩增实时检测技术的(4.24±0.46)h、(19.76±2.51)d及荧光定量PCR技术的(4.69±0.72)h、(18.20±2.68)d,差异有统计学意义(P<0.05)。
RNA恒温扩增实时检测技术与荧光定量PCR技术的操作时间、确诊时间、住院时间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。
联合检测的总满意度为96.25%,高于RNA恒温扩增实时检测技术的78.75%与荧光定量PCR技术的82.50%,差异有统计学意义(P<0.05)。
RNA 恒温扩增实时检测技术与荧光定量PCR技术的总满意度比较,差异无统计学意义(P>0.05)。