第15章氨基酸肽和蛋白质2016
氨基酸_多肽
肽键的平面特征
15
15.5 蛋白质的结构 蛋白质也是由氨基酸以酰胺键形成的大分子化合物。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将相对分子量在 10000以上的多肽称为蛋白质。在10000以下的称为多肽。 蛋白质的结构可分为四级: 一级结构:氨基酸的连接顺序。 二级结构:肽链的的构象及通过链内或链间的氢键形 成的α-螺旋、β-折叠等结构。 三级结构:是指在二级结构基础上,肽链相互扭在一 起或卷曲成其他形状。
∆ R CH2NH2 + CO2 R CH COOH 或脱羧酶 NH2
8 脱羧和脱氨基反应
(CH3)2CHCH2CHCOOH + H2O NH2 酶 (CH3)2CHCH2CH2OH + CO2 + NH3
11
二 多肽和蛋白质
一个氨基酸分子的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失 水形成的酰胺键称为肽键。
16
四级结构:是指由多条具有一、二、三级结构的肽链 通过非共价键连接起来的结构形式。
一 級 结 构
二 級 结 构
三 級 结 构
四 級 结 构
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α-螺旋 多肽链中的各个肽平面围绕同一 轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一 周,沿轴上升的距离即螺距为 0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两 个氨基酸之间的距离为0.15nm; 肽链内形成氢键,氢键的取向几 乎与轴平行,第一个氨基酸残基 的酰胺基团的-CO基与第四个氨 基酸残基酰胺基团的-NH基形成 氢键。 蛋白质分子为右手α-螺旋。
6
2 与亚硝酸反应
R CH COOH + HNO2 NH2 R CH COOH + N2 + H2O OH
反应是定量进行的,可以根据放出氮气的量计算分子 中氨基的量。(范斯来克氨基测定法) 3 与醛反应
S-15氨基酸多肽蛋白质ppt课件
R C H = C H C O O H + N H 3
③ γ-氨基酸和δ -氨基酸受热则分子内氨基与羧 基失水形成内酰胺。
CH 2 △ CHCH O 2 +H CH CH COOH R 2 R CH 2 2 HNC H N 2 O γ氨 基 酸 γ内 酰 胺 O C H H 2C 2 R C H C H C H C H C O H 2 2 2 + R C H H O C H 2 2 N HH N HC
H H NCH C N 2
CH 3O
CH 2 COOH
丙 氨 酰 -甘 氨 酸 , 简 写 为 丙 -甘 ( A l a -G l y ) ( Ⅱ )
三肽含由6种异构体;四肽有24种;五肽有120 种;… …
命名原则: 以含 C—端的氨基酸为母体,把肽链中其它氨 基酸名称中的酸字改为酰字,将含N—端的氨基 酸写在最前,然后按它们在链中的顺序依次排列 至最后含C—端的氨基酸。除C-端氨基酸保留原 名,其它都用“酰”来代替“酸”。
+ NH 3 ( Ⅰ )
+ NH 3
H
NH 2 ( Ⅱ ) 负 离 子
正 离 子
两 性 离 子
氨基酸在强 酸性溶液中 以正离子存 在。
在等电点时, 氨基酸主要 以两性离子 存在。
在强碱性 溶液中以 负离子存 在。
说明结晶状态的氨基酸的高熔点、易溶于水、 难溶于非极性有机溶剂等物理性质的原因。
(3)等电点 等电点:当溶液调节至一定的pH值时,氨基酸可以两 性离子的形式存在,将此溶液置于电场中,氨基酸不 向电场的任何一极移动,即处于电中性状态,这时溶 液的pH值称为氨基酸的等电点。 中性氨基酸的等电点略小于7,一般在5~6.3之间。 酸性氨基酸的等电点小于7,一般在2.8~3.2之间。 碱性氨基酸的等电点大于7,一般在7.6~10.8之间。
第十六章 氨基酸、多肽和蛋白质
OH R CH COOH +N2
+ H2O
若定量测定反应中所释放的N2的体积,即可计算出 氨基酸的含量,此方法称为van Slyke氨基氮测定法,常
用于氨基酸和多肽的定量分析。
第二节 肽
一、肽的结构和命名
肽是氨基酸残基之间彼此通过酰胺键相连而成的一 类化合物。 肽分子中的酰胺键又称为肽键(peptide bond)。 二肽可视为一分子氨基酸中的-COO―与另一分子氨基 酸中的NH3+脱水二成的。肽也是以两性离子的形式存在。
OH
H+
等电点 脱水
OH
H+
- - 带负电荷 脱水
OH
H
+
- - - -
(五)蛋白质的颜色反应 蛋白质分子内含有许多肽键和某些带有特殊基团的 氨基酸残基,可以与不同试剂产生特有的颜色反应,利 用此性质可鉴别蛋白质。
反应名称 试剂 颜色 作用基团 缩二脲反应 强碱、稀硫酸铜溶液 紫色或紫红色 肽键 茚三酮反应 稀茚三酮溶液 蓝紫色 氨基 蛋白黄反应 浓硝酸、再加碱 深黄色或橙红色 苯环 亚硝酰铁氢化钠 亚硝酰铁氢化钠溶液 红色 巯基
(五)氧化脱氨反应 氨基酸中的氨基能被 H2O2 或 KMnO4 等强氧化剂所氧 化,脱氨而生成α―酮酸。
[O]
R CH COOH NH2
R CH COOH + H2O NH
R C COOH + NH3 O
(六)氨基酸与亚硝酸的反应 氨基酸与亚硝酸作用,可定量释放氮气
+ NH3 R CH COO
+ H2NO2
使蛋白质发生沉淀的现象称为盐析(saltingout)。常用
的盐析剂有(NH4)2SO4、Na2SO4、NaCl和MgSO4等。
第十五章 蛋白质的合成-答案
一、选择题1.与原核生物核糖体小亚基结合的蛋白质合成抑制剂是(A )A.链霉素B.氯霉素C.利福霉素D.放线菌素E.青霉素3.大肠杆菌合成的所有未修饰的多肽链,其N末端的氨基酸残基应是(C)A.甲硫氨酸B.丝氨酸C.甲酰甲硫氨酸D.甲酰丝氨酸E.谷氨酸4.某5岁儿童突发咽痛,呼吸急促,表现烦躁。
体温测得为38.5T,咽部检查见扁桃体肿大,甚至观察有循环系统衰竭的症状,诊断为咽白喉,白喉病产生的外毒素(白喉毒素)为致病的主要因素。
白喉毒素抑制蛋白质合成的主要机制是(E)A.降解核糖体大亚基的28SrRNA使其失活B.特异性结合40S亚基的A位干扰延长阶段的进位C.抑制肽酰转移酶从而抑制肽链延长D.与40S亚基结合影响翻译准确性E.使eEf-2失活从而阻断肽链延长6.小明因为受伤需要抹点红霉素,红霉素作为一种抗生素其作用原理是(C)A.阻止翻译起始复合物的形成B.抑制氨基酸tRNA与小亚基结合C.抑制肽酰转移酶D.引起读码错误E.抑制EF-G10.多肽链的延长与下列物质无关的是(B)A.肽酰转移酶B.甲酰甲硫氨酰-tRNAC.GTPD.mRNAE.EF-Tu、EF-Ts和EF-G11.肽键形成部位是(B)A.核糖体大亚基P位B.核糖体大亚基A位C.两者都是D.两者都不是E.核糖体大亚基E位13.氨基酰-tRNA合成酶的特点是(E)A.存在于细胞核内B.只对氨基酸的识别有专一性C.只对tRNA的识别有专一性D.催化反应需GTPE.对氨基酸、tRNA的识别都有专一性15.多数氨基酸都有两个以上密码子,下列氨基酸只有一个密码子的是(D)A.苏氨酸、甘氨酸B.脯氨酸、精氨酸C.丝氨酸、亮氨酸D.色氨酸、蛋氨酸E.天冬氨酸、天冬酰胺19.翻译起始复合物的组成(C)A.DNA模板+RNA+RNA聚合酶B.Dna蛋白+开键DNAC.核糖体+甲硫氨酰tRNA+mRNAD.翻译起始因子+核糖体E.核糖体+起始者tRNA20.下列关于核糖体的叙述,正确的是(B)A.是遗传密码的携带者B.由rRNA与蛋白质构成C.由snRNA与hnRNA构成D.由引物、DNA和蛋白质构成E.由tRNA与蛋白质构成21,下列关于密码子的叙述,正确的是(C)A.由DNA链中相邻的三个核苷酸组成B.由tRNA中相邻的三个核苷酸组成C.由mRNA上相邻的三个核苷酸组成D.由rRNA中相邻的三个核苷酸组成E.由多肽链中相邻的三个核苷酸组成22.遗传密码的简并性是指(C)A.密码子的第3位碱基决定编码氨基酸的特异性B.一个密码子可代表多个氨基酸C.多个密码子可代表同一氨基酸D.密码子与反密码子之间不严格配对E.所有生物可使用同一套密码23.下列关于遗传密码的叙述,正确的是(E)A.遗传密码只代表氨基酸B.一种氨基酸只有一个密码子C.一个密码子可代表多种氨基酸D.密码子与反密码子遵守严格的碱基配对原则E.密码子的简并性降低了基因突变的效应24.一个tRNA的反密码子为5,UGC3,,它可识别的密码子是(A )A.5'GCA3'B.5,ACG3'C.5'GCU3'D.5'GGC3'E.5'AUG3,25.氨基酸通过下列哪种化学键与tRNA进行特异结合(B)A.糖苷键B.酯键C.酰胺键D.磷酸酯键E.氢键26.蛋白质生物合成中氨基酸的活化与tRNA的结合需要(B )A.氨基酸tRNA合成酶B.氨基酰tRNA合成酶C.ATP合成酶D.转位酶E.GTP27.参与新生多肽链正确折叠的蛋白质是(A)A.分子伴侣B.G蛋白C.转录因子D.释放因子E.p因子28.原核生物起始tRNA是 (C)A.甲硫氨酰-tRNAB.缬氨酰-tRNAC.甲酰化的甲硫氨酰-tRNAD.氨酰-tRNAE.乙酰化的甲硫氨酰-tRNA29.新生肽链合成的方向是 (A )A.从N端到C端合成B.从C端到N端合成C.没有固定的方向D.先从N端到C端合成小片段,再连接成一条多肽链E.从中间部位向N端和C端两个方向同时进行30.蛋白质磷酸化修饰的潜在修饰位点是(B)A.甘氨酸B.酪氨酸C.苯丙氨酸D.谷氨酸E.赖氨酸34.蛋白质合成终止是 (B)A.核糖体到达mRNA分子的3'末端B.释放因子识别终止密码子进入A位C.释放因子进入P位D.mRNA出现发夹结构,核糖体无法移动E.特异的tRNA进入A位35.氯霉素对细菌蛋白质合成的生物学影响是(E )A.导致未成熟多肽链的释放B.抑制核糖体大小亚基的结合C.抑制tRNA功能D.抑制30S核蛋白体亚基的活化E.抑制50S核蛋白体亚基的肽酰转移酶活性38.若向mRNA的编码区插入一个核苷酸,则会出现(D)A.翻译出的蛋白质的第1个氨基酸残基改变B.翻译出的蛋白质的氨基酸残基序列不变C.插入处上游翻译出来的氨基酸序列完全改变D.插入处下游翻译出来的氨基酸序列完全改变E.仅在插入处一个氨基酸残基改变。
第15章 氨基酸、多肽和蛋白质 ppt课件
2.命名: 多按其来源或性质而命名。国际 上有通用的符号(见P616表20-1)。
3.构型: 用D/ L体系表示——在费歇尔投 影式中氨基位于横键右边的为D型,位于 左边的为L型。例如:
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6
COOH H C NH2
R
COOH NH2 C H
物理性质
大部分的氨基酸在水中有一定的溶解度;
酸性的氨基酸在水中的溶解度较差;
氨基酸在200度以下都是稳定的;
氨基酸的pKa为2左右;
每一个光学纯的氨基酸都有旋光值。
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10
二、氨基酸的性质
1、氨基酸的酸-碱性——两性与等电点 氨基酸分子中的氨基是碱性的,而羧
基是酸性的,因而氨基酸既能与酸反应, 也能与碱反应,是一个两性化合物。
ppt课件
8
8个人体必需氨基酸
(C H 3 )2 C H C H (N H 2 )C O O H( C H 3 ) 2 C H C H 2 C H ( N H 2 ) C O O H
缬氨酸
亮氨酸
C2H5CHCH(NH2)COOH CH3 异亮氨酸
CH3CHCH(NH2)COOH OH 苏氨酸
C 6 H 5 C H 2 C H (N H 2 )C O O HC H 3 S ( C H 2 ) 2 C H (N H 2 )C O O H
酐等都可用作酰化剂。在蛋白质的合成过程
中为了保护氨基则用苄氧甲酰氯作为酰化剂。
O
R
OR
C 2O H C C + N l 2 C H C H OOH C 2O H C NC H C H O
ppt课件
中国海洋大学资料生物化学课件第十五章 蛋白质合成(新)
(一)遗传密码的破译
* 美国科学家 Nirenberg 等, 1968 年获诺贝尔生 理学奖。 * 1961 年, Nirenberg 等人,在大肠杆菌的无细 胞体系中外加 poly(U) 模板、 20 种标记的氨基 酸,经保温后得到了多聚 phe-phe-phe ,于是 推测UUU编码phe。利用同样的方法得到 CCC 编码pro,GGG编码gly,AAA编码lys。 * 如果利用 poly ( UC ),则得到多聚 Ser-LeuSer-Leu,推测UCU编码Ser,CUC编码Leu。 * 到1965年就全部破译了64组密码子。
蛋白质合成时,mRNA结合于核糖体小亚基 上,大亚基结合带氨基酸的tRNA,tRNA的 反密码子与mRNA密码子配对,ATP供能, 合成蛋白质。
三、遗传密码
遗传密码:mRNA中的核苷酸序列与蛋白质 中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码 三个碱基编码一个氨基酸称为三联体密码或 密码子(Coden)。 密码子的发现。
(1)在进入A位点之前,新氨酰tRNA首先必须与延伸因子EF— TU—GTP结合。 (2)延伸因子 EF—Tu是一个GTP结合蛋白,参与氨酰 tRNA的 就位。 (3)氨酰tRNA入位后,EF—TU—GTP水解,EF—TU—GDP从 核糖体上释放下来,在第二个延伸因子 EF—Ts 帮助下 EF— Tu—GDP 释 放 掉 GDP 并 重 新 结 合 一 分 子 GTP 再 生 成 EF— Tu—GTP。
简并性的生物学意义
A、减少有害突变:假如每种氨基酸只有一个密 码子,那么剩下的44个密码子都成了终止子, 如果一旦哪个氨基酸的密码子发生了单碱基的 点突变,那么极有可能造成肽链合成的过早终 止。如GUN 编码 Ala ,由于简并性的存在,不 论第三位的U变成什么,都仍然编码Ala; B、可以使DNA上的碱基组成有较大的变化余地, 而仍然保持多肽上氨基酸序列不变(意思基本 同上)。
第十五章 蛋白质生物合成
methionine, fMet),于是形成N-甲酰甲硫氨酰-tRNA
(fMet-tRNAifMet),可以在mRNA的起始密码子AUG
处就位,参与形成翻译起始复合物。起始密码子只
能辨认fMet-tRNAifMet。
目录
起始氨基酸的甲酰化
fMet-tRNAifMet 的生成是一碳化合物转移和利 用的过程之一,反应由转甲酰基酶催化,甲酰基从 N10-甲酰四氢叶酸转移到甲硫氨酸的α-氨基上。 Met-tRNAifMet+N10-甲酰FH4
甲酰化酶
fMet-tRNAifMet+FH4 Met-tRNAifMet的Met的α-NH2被甲酰化 该酶特异性强,不能催化Met或Met-tRNAMet
目录
(二)参与肽链延长的 甲硫氨酰-tRNA:
真核、原核相同:Met-tRNAMet
tRNAMet 和 甲 硫 氨 酸 结 合 后 生 成 MettRNAMet,必要时进入核蛋白体,为延长中的 肽链添加甲硫氨酸。
的各碱基之间既无间隔也无交叉。通常从一个正确
起点(AUG)开始,3个一组,一个不漏的读下去
至终止密码。
5’…….A U G G C A G U A C A U …… U A A 3’
Met Ala
Val
His
终止密码
目录
目录
基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生
插入或缺失,可能导致框移突变(frameshift
–tRNA(transfer RNA, 转移RNA)
20种氨基酸(AA)作为原料 20多种酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ATP、GTP、无机离子
目录
蛋白质合成的场所(工厂)是核糖体;
运输氨基酸到模板上的是tRNA—适配器;
第十五蛋白质生物合成作业及答案
E.先从5‘-末端阅读,然后再从3’-末端阅读
40.AUG的重要性在于:
A.作为附着于30S核糖体位点B.作为tRNA的识别位点C.作为肽链的释放因子
D.作为肽链合成的终止密码子E.作为肽链的起始密码子
41.摆动配对是指下列哪些碱基之间配对不严格:
37.核蛋白体的结构特点是:
A.单链蛋白质B.由大、小亚基组成C.四个亚基组成D.三个亚基组成E.亚基与NAD构成
38.翻译的含义是指:A.mRNA的合成B.tRNA的合成
C.tRNA运输氨基酸D.核蛋白体大,小亚基的聚合与解聚E.以mRNA为模板合成蛋白质的过程
39.mRNA的信息阅读方式是:
A.从多核苷酸链的5‘末端向3’末端进行B.从多核苷酸链的3‘-末端向5’-末端进行
8.反密码子是指
A.DNA中的遗传信息B.tRNA中的某些部分C.mRNA中除密码子以外的其他部分
D.rRNA中的某些部分E.密码子的相应氨基酸
9.密码GGC的对应反密码子是CD.CGCE.GGC
10.在蛋白质生物合成中转运氨基酸作用的物质是A.mRNAB.rRNAC.hnRNAD.DNAE.tRNA
6.蛋白质生物合成过程特点是
A.蛋白质水解的逆反应B.肽键合成的化学反应C.遗传信息的逆向传递
D.在核蛋白体上以mRNA为模板的多肽链合成过程E.氨基酸的自发反应
7.关于mRNA,错误的叙述是
A.一个mRNA分子只能指导一种多肽链生成B.mRNA通过转录生成
C.mRNA与核蛋白体结合才能起作用D.mRNA极易降解E.一个tRNA分子只能指导一分于多肽链生成
11.凡AUG三联密码都是
16 氨基酸、多肽、蛋白质
氨基酸、多肽、蛋白质
内容
第一节 氨基酸 第二节 多肽 第三节 蛋白质简介
第十六章 氨基酸、多肽、蛋白质
1
蛋白质:
含氮的天然高聚物,生物体内一切组织的基本组成部分。 除水外,细胞内80%都是蛋白质。在生命现象中起重要的作 用。人类的主要营养物质之一。
如:
酶(球蛋白)——机体内起催化作用 激素(蛋白质及其衍生物)——调解代谢 血红蛋白——运输O2和CO2 抗原抗体——免疫作用
CH2 O C Cl + NH2 CH COOH
O
R
CH2 O C NH CH COOH
苄氧甲酰氯的酰基易引入,对以后应用的种种试剂较稳定,同时 还能用多种方法把它脱下来。
(2)氨基的烃基化: (与RX作用)
NO2
NO2
R
F + NH2 CH COOH
NO2
NO2 R NH CH COOH
氟代二硝基苯在多肽结构分析中用作测定N端的试剂。
丝胺酸 Ser
COOH N
H
NH2
HO
CH2CH COOH
脯胺酸 酪胺酸
pro Tyr
NH2 CH2CH COOH
N H
*色胺酸 Trp
第十六章 氨基酸、多肽、蛋白质
等电点 5.47 5.68 6.30 5.66 5.89
7
结构 II 酸性
NH2 HOOC CH2CH COOH
NH2 HOOC (CH2)2CH COOH
COOH
H2N
H
第十六章 氨基酸、多肽、蛋白质
CH2SH 4
下列19种氨基酸可组成无数蛋白质:
结构
名称
缩写
等电点
有机化学第15章氨基酸多肽与蛋白质
H+ 水解 105oC
NHCH 2 CN H C H C NHCHCOH CH 3 CH 2 C 6 H 5 NO 2
DNFB-Gly-Ala-Phe
O O 2N NH CH 2 COH NO 2 O O + H 2 N CHC O H + H 2 NC HCOH CH 3 CH 2 C 6 H 5
甜菜碱
存在于多种蛋白性的动物保护组织(如毛发、角、指甲)中,通过氧化还 NH 2 原而相互转化。
-2 H 2 H SC H 2C H C O O H 2H NH2 SC H 2C H C O O H NH 2 SC H 2C H C H 2O O H
半胱氨酸
胱氨酸
3. 色氨酸
N H
C H 2C H C O O H NH2
R CH NH2 CH2 COOH R CH CH COOH
β-氨基酸受热失氨形成α, β-不饱和酸
R CH NH2 CH 2 C H 2CO O H R HC HN
H2 C CH2 + H O 2 C O
γ -氨基酸受热分子内氨基与羧基失水形成内酰胺(五元环内酰胺)
H2 C R CH NH2 CH2 CH2 C H 2C O O H HN C O CH 2 R HC CH 2
一 氨基的保护
1. 用氯代甲酸苯甲酯(或称苯甲氧基甲酰氯)保护
O
C6H5CH2OH+COCl2(光气)
C 6 H 5 CH 2 OCCl
Benzoxycarbonyl(简写Cbz)
反应过程:
+NH 3CH2CO2 -
O
C 6 H 5 CH 2 OCCl
O C 6 H 5 CH 2 OC-N H C H 2 C O O
第十五章物质代谢的相互联系和调节控制
第十五章物质代谢的相互联系和调节控制第十二章物质代谢的相互联系和调节控制一:填空题1.生物体内的代谢调节在三种不同的水平上进行,即________________、________________和________________。
2.代谢途径的终产物浓度可以控制自身形成的速度,这种现象被称为________________。
3.连锁代谢反应中的一个酶被激活后,连续地发生其它酶被激活,导致原始信使的放大。
这样的连锁代谢反应系统,称为________________系统。
4.酶对细胞代谢的调节是最基本的代谢调节,主要有二种方式:________________和________________。
5.高等生物体内,除了酶对代谢的调节外,还有________________和________________对代谢的调节。
6.生物合成所需的基本要素是________________、________________和小分子前体。
7.不同生物大分子的分解代谢均可大致分为三个阶段:将大分子降解为较小分子的________________;将不同的小分子转化为共同的降解产物________________;经________________完全氧化。
8.构通糖、脂代谢的关键化合物是________________。
9.不同代谢途径可以通过交叉点代谢中间物进行转化,在糖、脂、蛋白质及核酸的相互转化过程中三个最关键的代谢中间物是________________、________________和________________。
10.真核生物DNA的复制受到三个水平的调控:________________、________________和________________的调控。
11.遗传信息的表达受到严格的调控,包括________________即按一定的时间顺序发生变化,和________________即随细胞内外环境的变化而改变。
第十五章氨基酸多肽与蛋白质
二级结构 (Secondary structure)
α-螺旋结构
毛发、角壳等纤维蛋白的二 级结构主要是这种形式
三级结构 (Tertiary structure)
有 原 子指 的组 空成 间蛋 排白 布质 。分
COO-
+H3N
H
CH2 CH2 CONH2 Glutamine (Gln)
谷氨酰胺
COO-
+H3N
H
CH2 COO-
Aspartate (Asp) 门冬氨酸
COO-
+H3N
H
CH2
CH2 COO-
Glutamate(Glu)
谷氨酸
COO-
+H3N
H
CH2 CH2 CH2
CH2 NH3+
COO-
+H3N
8.失羧和失氨作用
(CH3)2CHCH2CHCOOH + H2O
NH2
酶 (CH3)2CHCH2CH2OH+ CO2 + NH3
Ⅱ 多肽(polypeptide )
一分子氨基酸的氨基与另一分子氨基酸的羧基可以 发生分子间的脱水缩合,并通过肽键(peptide bond)结 合成肽 。
R CH COOH + HN CH COOH
+
NH3
C OH
O
O CH
C+
C OH O
NH3 +
O
HO C C
HO C
O
OH
O
C
C
蛋白质、多肽、氨基酸概述及分类重点 PPT
❖ 咪唑环形成质子传递体系
亲核试剂:给出电子
(3)Neutral Amino Acids中性氨基酸
❖ 中性氨基酸侧链不提供也不接受质子
❖ (1) Glysine甘氨酸 最简单、没有光学活性的氨基
酸
❖ (abbreviation:Gly)
❖ 显然与这种氨基酸相关的化学反应比较少,在生物学 上的意义主要是作为结构成份,大量的结构蛋白质如: 胶原和丝素中含有大量的甘氨酸。
CO2H H2N C H
R
R的结构
-H -CH3 -CH(CH3)2 -CH2CH(CH3)2 -CH(CH3)CH2CH3
N H
CO2H
-CH2C6H5
CH2
OH
CH2
N H
-CH2OH -CH(OH)CH3 -CH2CO2H -CH2CH2CO2H -CH2CONH2 -CH2CH2CONH2
-CH2SH -CH2CH2SCH3 -CH2CH2CH2CH2NH2 -CH2CH2CH2NHC(=NH)NH2
❖ 亲水性特别好,但第二个羟基(仲羟基)形成氢键能力弱、
HOOC
NH2
CCHH来自OH CH3❖ (3) Cysteine半胱氨酸 ❖ (abbreviation:Cys)
NH2 HOOC C CH2 SH
H
用 sulfur(硫) 取代丝氨酸的氧,较高pH值下能够给出质子 离 解
硫原子是特别好的亲核试剂
❖ α-,β-,γ-,orδ-氨基酸、
❖ γ-aminobutyric acid γ-氨基丁酸 (GABA):
❖ 神经传递素
❖ 2,5-diiodotyrosine 2, 5-二碘酪氨酸 ❖ 甲状腺激素前体
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1.氨基酸的两性电离和等电点
在水中,氨基酸的 -NH2 与 -COOH 互相反应形成内
盐(两性离子)。
15
应用:分离 提纯
NH 3+ R —C — H COOH
NH 2 R —C — H COOH
+ NH 3
氨基酸所带的正、带负 电荷相等,呈电中性, 此溶液的pH值称为该氨 基酸的等电点
H+
OH
-
6
2. 命名
(1)俗名:按其来源或性质命名。
CH2COOH NH2
CH2-CH-COOH OH NH 2
HOOC-CH2-CH-COOH NH2
甘氨酸
丝氨酸
天冬氨酸 (天门冬植物)
(有甜味) (存在于蚕丝中)
7
( 2 )系统命名法:以羧酸为母体,氨基当作
取代基,称为“氨基某酸”。氨基的位置习惯上
13
四、氨基酸的物理性质(了解)
α- 氨基酸均为无色晶体,熔点都很高,一般在
200~300℃之间,多数氨基酸受热易分解放出CO2。
α-氨基酸大多难溶于有机溶剂,而易溶于强酸、强碱,
在水中的溶解度也各异。
14
五、氨基酸的化学性质(5条 重点掌握)
氨基酸具有-NH2和-COOH的一般性质,由于这些 官能团的相互影响,还具有一些特殊性质。
F O2N DNFB NO2 O O + H2N CH C NH CH C NH CH COOH n R R R 碱性介质 O O HN CH C NH CH C NH CH COOH n R R R NO2 HCl, H2O O HN CH C OH R NO2 DNP-N-端氨基酸(黄色)
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O2N
肽键(酰胺键)
H2N-CH-C-N-CH-COOH+ H2O R1 R2
二肽
二肽还存在NH3+和COO-,它可与另一分子氨基酸
脱水形成三肽,依次形成四肽、五肽…。
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第二节 肽
肽是一类具有生物活性的低分子量的化合物,在神
经传导、代谢调节方面起着重要重要作用。
一.肽的结构和命名
O O O + H3N CH C NH CH C NH CH C OR R R n
H N C C C O
C O 氢键
H N
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(1)α-螺旋:蛋白质中的多肽链围绕中心轴作有 规律的顺时针螺旋式上升,即称为α-螺旋 , 绝大多数蛋白质是形成右螺旋。 毛发中的角蛋白,肌肉中的 肌球蛋白、皮肤的表皮蛋白 等纤维状蛋白,都呈α-螺旋 , 数条螺旋缠绕在一起形成缆 索状,从而增强其机械强度 并使其具有弹性。
① 羧肽酶法 (选择性)
O O 羧肽酶 C NH CH C NH CH COOH + H2O R' R O O C NH CH C OH + H2N CH COOH R' R 余肽 C-端氨基酸
② 部分水解法 肽
水解 酸或酶
碎片
端基分析
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第三节 蛋白质
蛋白质是构成一切细胞的生物高分子化合物。
一、蛋白质的元素组成和分类
R —C — H COO
两性离子
OH
-
NH 2 R —C — H COO
-
H+
正离子(向负极移动)
负离子(向正极移动)
pH<pI
pH = pI 等电点
pH>pI
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电泳法分离氨基酸
电泳:带电离子在电场中向其电荷相反的电极移动。
天冬氨酸 pI=2.98 丙氨酸 pI=6.02 精氨酸 pI=10.76 pH=6.02
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三、氨基酸的结构特点和构型
α R— CH— COOH 或 NH2 α — — CH COO R NH3+
偶极离子结构为主
1)各种α-氨基酸都具有酸性的羧基,羧基的邻位碳上都有碱性 的氨基。
2)各种α-氨基酸的区别在于R基团结构的不同,有些在烃基上
还连有其他官能团如-OH,-COOH,-SCH3或-NH2等。
确定组成这个多肽的氨基酸的种类和数目; 确定出这些氨基酸在肽链中的连接顺序。
1.测定相对分子质量
可以用化学方法、物理方法测定:渗透压法、X射线衍射法、超离心法等。
2.氨基酸种类及含量的测定
多肽
水解
H+/OH-
氨基酸化合物
分离 电泳等
各氨基酸含量
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3.氨基酸排列顺序的确定
(1)N端分析法
①桑格法(Sanger)
S S
O
HO
C OO
H3N+
蛋白质三级结构中的相互作用力
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4. 四级结构
蛋白质分子含有两条或 多条肽链,其中每一个 具有三级结构的多肽链 称为亚基,各个亚基的 空间排布及亚基接触部 位的布局和相互作用, 称为蛋白质的四级结构 。
血红蛋白的四级结构
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三、蛋白质的性质
1.两性电离与等电点
NH3 P COOH OH H NH3 P COO OH H NH2 P COO
B链 H2N-苯丙-缬-天冬酰-谷酰-组-亮-半胱-甘-丝-组-亮-缬-谷-丙-亮-酪-亮-缬-半胱-甘-谷- 精-甘-苯丙-苯丙-酪-苏-脯-赖-丙-COOH
猪胰岛素蛋白质分子的一级结构
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2. 二级结构
多肽链的主链的骨架原子(氨基氮,α-碳原子,羰基 碳 )的相对空间位置,不涉及侧链R基团的构象。 肽键中的羰基氧和亚氨基氢间通过氢键的作用, 使得肽链可以形成α-螺旋型、 -折叠等空间关系, 这些被称为是蛋白质的二级结构。
蛋白质分子的元素组成为: C:50%-55% H:6.0%-7.3% O:19%-24% S:0-4% N:13%-19%
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大多数蛋白质的含氮量近似为16%,即每克氮相 当于6.25克蛋白质。通过测定生物样品中的含氮量即 可以推算出该样品中的蛋白质含量-定氮法。
2008年中国毒奶粉事件——三聚氰胺事件 三聚氰胺——蛋白精、密胺
O2N
+ 其它各种氨基酸
②爱德曼(Edman)降解法
O O C6H5N C S + H2NCHCNHCHC R R' O N CH R + H2NCHC C NH R' S 肽链其余部分 O C S O O C6H5NHCNHCHCNHCHC R R'
HCl 有机溶剂
C6H5
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(2)C端分析法
正离子 pH<pI
两性离子 pH=pI
负离子 pH>pI
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调节溶液的pH值,蛋白质以偶极离子形式存在, 在电场中既不向阴极也不向阳极移动,此时溶液的 pH值称为该蛋白质的等电点(pI)。在等电点时 ,蛋白质的溶解度最小,因此可以通过调节溶液的 pH值,使蛋白质从溶液中析出,从而达到分离或 提纯的目的。
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3)除甘氨酸外, 其他19种氨基酸的α–碳原子都是 手性碳,都具有旋光性:
COO
+ -
COOH R NH 3+
NH 3 R
H
L -型
氨基酸的D、L构型标记法:
D -型
α -NH3+在碳链右边的为D型,在左边的为L型。
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生物体内具有旋光活性的19种α-氨基酸:
若用D、L标记法,均为L构型。
若用R、S标记法,除半胱氨酸为R构型外, 其余皆为S构型。
氨基末端(N-端) 羧基末端 (C-端)
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肽的结构取决于组成肽链的氨基酸种类和数目 及排列顺序。
例如:由2种不同的氨基酸可形成2种二肽
O H3N+ CH2 C NHCHCO2CH3 O H3 N+ CHC NHCH2 CO2CH3
甘氨酰丙氨酸
丙氨酰甘氨酸
许多种氨基酸按照不同的排列顺序,构成了自然 界中种类繁多的多肽和蛋白质。
O =N— O
O + RCHO + CO2 + 3H2O OH
蓝紫色化合物
应用:颜色强度与参与反应的氨基酸的量成正比。可用来定性 或者定量测定各种氨基酸;测定在电泳等试验中各种氨基酸的
位置及大概浓度。
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5.氨基酸的脱水成肽反应
H O H2N-CH-C-OH+ H-N-CH-COOH △ R1 R2 OH
第十五章 氨基酸、肽和蛋白质
第一节 氨基酸(Amino acid)
一、氨基酸是组成蛋白质的基本单位
蛋白质
酸、碱或酶水解
多肽
-氨基酸 最终产物
NH2 R CH COOH
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几个概念
氨基酸:羧酸分子中烃基上的氢原子被氨基取代生成
的化合物
肽:两分子及两分子以上的氨基酸脱水生成的酰胺 寡肽:由10个以内氨基酸残基相连而成的肽 多肽:由较多氨基酸残基相连而成的肽 蛋白质:相对分子质量在一万以上的多肽
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多肽的命名:从左到右,即从N-端开始将酰基名称按顺 序排列,有游离羧基的C-端氨基酸作为母体。
O H O H -O CCHCH CH C N CHC N CH CO 2 2 2 2 2 N+H3 CH2SH
谷氨酰-半胱氨酰-甘氨酸
简称:Glu-Cys-Gly; 谷-半胱-甘
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二、多肽中氨基酸顺序的测定
二级以上的结构:空间结构
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1. 一级结构
一级结构指肽键连接起来的多肽链中氨基酸的排列次
序。 任何特定的蛋白质都有其特定的氨基酸排列次序。有 的由一条肽链组成;有的由二条或多条肽链组成。
S S S S S
A链 H2N-甘-异亮-缬-谷-半胱-半胱-苏-丝-异亮-半胱-丝-亮-酪-谷酰-亮-谷-天冬酰-酪-半胱-天 冬酰-COOH S
+