关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理ppt课件
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共聚焦激光扫描PPT课件
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4
共聚焦显微镜的优点
减少由于光散射产生的图像模糊 增加有效分辨率 提高信噪比 厚标本的清楚细查 Z轴扫描 可以实现数字放大倍率的调节
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5
Wide-field microscopy
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6
Fluorescent Microscope
Objective
Arc Lamp
Excitation Diaphragm Excitation Filter
12
基于共聚焦原理的皮肤在体三维成像技术
探测器 激光束
小孔
聚焦透镜 分光器
光学扫描 物镜
组织样品
Quarter Wave Plate 窗口
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13
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14
色素痣
A
明亮的黑素细胞巢围绕真 皮乳头呈圆形或椭圆形分布， 细胞形态规则，大小及明亮度 均一。细胞间有间隔。
B
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15
对皮肤疾病的治疗与疗效评估需 要先进的皮肤诊断技术
Emission Filter
Emission Filter Emission Pinhole
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10
原理示意图
光源（激光） 二色镜。 物镜 样品 针孔 检测仪 共焦显微镜的最大优点是可以只 从一个平面收集光。 针孔同焦平面成对（即共焦）， 使得来自焦平面以外的光远离检 测仪。 激光扫描显微镜按顺序一点一点 地、一行一行地扫描样品，将象 素资料合成一个图象。通过移动 焦平面，单个图象（光限幅）可 以放在一起，形成可以以后进行 数字处理的三维栈。
Ocular
Emission Filter
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7
Confocal microscopy
.
8
Confocal Principle
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理 ppt课件
默认使用black edition打开.lsm 格式文件
点击左上角 as 图片格式选择第一个czi保存 保存后的图片即可用blue edition 打开
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
关于激光 共聚焦显 微镜拍照 后图像的 处理
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格式。
注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
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关于激光 共聚焦显 微镜拍照 后图像的 处理
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理
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注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
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值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理 ppt课件
的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
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通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
默认使用black edition打开.lsm 格式文件
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2.格式转换(2)
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
二、1.文件格式
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注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
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2.格式转换(2)
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二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格式。
注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
激光共聚焦技术优秀课件
荧光样品的制备要求
荧光标记反应的特异性强、荧光定位准确 保持样品应有的结构形态完整性 荧光信号的响应准确、灵敏、具有可重复性 荧光强度适宜 荧光稳定性好 样品的荧光分布均匀 两种及两种以上的荧光信号之间荧光光谱交叉
可以消除 图象背景干净、干扰杂质少
荧光探针的种类及应用
原位鉴定细胞或组织内生物大分子、观察细胞及亚 细胞形态结构
图3-9 pA7-TTG1重组质粒酶切鉴定及PCR鉴定 酶切：重组质粒酶切产物；M：Marker DL 2000；PCR：重组质粒PCR产物
目的蛋白细胞器定位观察
含TTG1的瞬时表达载体转入洋葱表皮细胞
(1)将提取好的的含有目的基因的瞬时表达载体以及pA7-GFP载体约20 μL分别 加入1.5 mL离心管中，分别加入500 μL的蒸馏水，两管分别标号P1，P2。 (2) 分别取4片约1.5 cm*1.5 cm大小的洋葱表皮放入P1，P2。 (3)将P1，P2管管盖打开，用封口膜将其封上，扎两到三个小孔。 (4)将P1，P2管进行抽真空，抽到刚刚沸腾为止，一共抽三次。 (5)取MS培养基并在其上铺上一层滤纸。 (6)取出P1，P2管中的洋葱表皮，将其铺在MS培养基的滤纸上，加少量的水 培养16小时。
激光共聚焦显微镜基本操作
获取共焦图像的步骤
在 VIS 模式中观察样品 装入 LSM 配置 扫描图像 保存图像
不同厚度光切图像
Z轴扫描
Z轴扫描、时间系列扫描
时间系列扫描
Z轴扫描＋时间系列扫描
组织和细胞样品中荧光的来源
自发荧光 荧光染色 免疫荧光－荧光抗体法产生荧光 外源性荧光物质进入组织细胞内产生荧光 酶致荧光
成为形态学、分子细胞生物学、神经 科学、药理学和遗传学等领域中新的 有力研究工具。
《激光共聚焦简化》课件
显微镜设置与校准
激光器选择
根据所使用的荧光染料选 择适当的激光器波长。
滤色片配置
选择合适的滤色片以减少 背景噪声并提高信噪比。
校准与调整
确保显微镜的焦距、放大 倍数和视野等参数设置正 确，以便获得清晰的图像 。
图像采集与处理
采集模式选择
图像处理
根据观察需求选择单帧采集、多帧平 均或实时扫描模式。
技术培训
参加相关技术培训，提高操作和维护显微镜的能 力。
05 案例展示与解析
细胞生物学研究案例
细胞骨架结构观察
利用激光共聚焦显微镜技术观察细胞 骨架的动态变化，解析细胞生长、分 裂和迁移过程中的骨架重构过程。
细胞器定位与功能研究
通过共聚焦显微镜对细胞内特定细胞 器进行高分辨率成像，分析其在细胞 代谢、信号转导等方面的功能。
《激光共聚焦显微镜技术简 化操作与解析》
contents
目录
• 激光共聚焦显微镜简介 • 激光共聚焦显微镜操作流程 • 激光共聚焦显微镜解析技术 • 激光共聚焦显微镜的维护与保养 • 案例展示与解析
01 激光共聚焦显微 镜简介
定义与工作原理
定义
激光共聚焦显微镜是一种光学显微镜技术，利用激光作为光 源，通过共聚焦方式获取样品的高分辨率、高对比度图像。
优点
色彩复原技术能够提供高对比度和高 分辨率的图像，同时能够选择性地标 记和染色细胞或组织的特定结构，有 助于研究者更深入地了解细胞或组织 的生理和病理变化。
缺点
由于荧光染料可能会对细胞或组织产 生一定的毒性作用，因此需要严格控 制染料的浓度和作用时间。
定量分析技术
01 02
定量分析技术
利用激光共聚焦显微镜的定量分析软件，对获取的图像进行定量分析和 数据提取。这种技术能够提供更准确和可靠的实验数据，有助于研究者 更深入地了解细胞或组织的生理和病理变化。
激光扫描共聚焦显微镜教学课件
扫描速度与分辨率设置
根据实验需求，调整扫描速度和分辨率以确 保图像质量。
图像采集
校准
确保显微镜处于校准状态，避 免图像出现畸变或失真。
采集参数设置
设置合适的曝光时间、增益和 数字位数等参数，以确保图像 质量。
多区域采集
如需观察大范围样品，可设置 多个采集区域，并确保各区域 间无缝拼接。
实时预览
在采集过程中实时预览图像， 确保图像质量满足要求。
特点
高分辨率、高对比度、高灵敏度 、无损检测、能够观察活细胞等 。
工作原理
01
激光束通过显微物镜照 射到样品上，形成光斑 ；
02
光斑通过扫描器在样品 表面进行扫描，同时收 集反射光或荧光；
03
反射光或荧光通过共聚 焦系统汇聚到光电倍增 管上，转换成电信号；
04
电信号经过处理后形成 图像，显示在计算机屏 幕上。
根据实验需求设置采集参数，如曝光 时间、增益等，以获取高质量的图像 。
CHAPTER 04
激光扫描共聚焦显微镜实验 案例
细胞膜流动性研究
总结词
通过观察细胞膜荧光标记物的扩散和 分布，了解细胞膜的流动性。
详细描述
利用荧光染料标记细胞膜，在激光扫 描共聚焦显微镜下观察标记物的动态 变化，通过分析荧光强度和分布的变 化，可以了解细胞膜的流动性。
高速成像
研发更快的扫描速度和数据处理能力，实现实时动态观察 ，缩短实验时间，提高实验效率。
多维成像
拓展激光扫描共聚焦显微镜的成像维度，从二维平面扩展 到三维立体成像，甚至包括时间序列的四维成像，以更全 面地揭示细胞活动和分子交互过程。
应用领域的拓展
临床诊断
将激光扫描共聚焦显微镜应用于 临床诊断，通过观察活体组织样 本，为疾病诊断和治疗提供更准
根据实验需求，调整扫描速度和分辨率以确 保图像质量。
图像采集
校准
确保显微镜处于校准状态，避 免图像出现畸变或失真。
采集参数设置
设置合适的曝光时间、增益和 数字位数等参数，以确保图像 质量。
多区域采集
如需观察大范围样品，可设置 多个采集区域，并确保各区域 间无缝拼接。
实时预览
在采集过程中实时预览图像， 确保图像质量满足要求。
特点
高分辨率、高对比度、高灵敏度 、无损检测、能够观察活细胞等 。
工作原理
01
激光束通过显微物镜照 射到样品上，形成光斑 ；
02
光斑通过扫描器在样品 表面进行扫描，同时收 集反射光或荧光；
03
反射光或荧光通过共聚 焦系统汇聚到光电倍增 管上，转换成电信号；
04
电信号经过处理后形成 图像，显示在计算机屏 幕上。
根据实验需求设置采集参数，如曝光 时间、增益等，以获取高质量的图像 。
CHAPTER 04
激光扫描共聚焦显微镜实验 案例
细胞膜流动性研究
总结词
通过观察细胞膜荧光标记物的扩散和 分布，了解细胞膜的流动性。
详细描述
利用荧光染料标记细胞膜，在激光扫 描共聚焦显微镜下观察标记物的动态 变化，通过分析荧光强度和分布的变 化，可以了解细胞膜的流动性。
高速成像
研发更快的扫描速度和数据处理能力，实现实时动态观察 ，缩短实验时间，提高实验效率。
多维成像
拓展激光扫描共聚焦显微镜的成像维度，从二维平面扩展 到三维立体成像，甚至包括时间序列的四维成像，以更全 面地揭示细胞活动和分子交互过程。
应用领域的拓展
临床诊断
将激光扫描共聚焦显微镜应用于 临床诊断，通过观察活体组织样 本，为疾病诊断和治疗提供更准
激光扫描共聚焦显微镜教学课件
缺点
昂贵
激光扫描共聚焦显微镜的价格相对 较高，不是所有的实验室都能够负
担得起。
需要专业操作
使用该显微镜需要一定的专业知识 和技能，对操作者的要求较高。
样本制备要求高
由于该显微镜对样本的厚度和折射 率等参数敏感，因此需要精心制备 样本。
维护成本高
激光扫描共聚焦显微镜的维护成本 也相对较高，需要定期检查和保养 。
04
激光扫描共聚焦显微镜的 优缺点
优点
高分辨率
激光扫描共聚焦显微镜利用激光束进行 扫描，可以实现比传统显微镜更高的分 辨率。
灵敏度高
由于激光束的强度高，该显微镜对样本 的灵敏度也相应提高，可以检测到较弱 的荧光信号。
减少光损伤
共聚焦技术只对焦点处的样本进行照明 ，有效减少了光损伤。
三维成像
激光扫描共聚焦显微镜可以采集样本的 三维图像。
仪器清洁
清洁显微镜的透镜和其他部件，以确保观察的清晰度和准确 性。
图像获取
参数设置
在获取图像前，需要设置激光扫描共聚焦显微镜的参数，如扫描速度、扫描分辨 率、激光波长等。
图像获取
通过激光扫描共聚焦显微镜获取细胞样本的图像。
数据分析
对获取的图像进行处理，以提 高其清晰度和对比度。
02
数据测量
01
图像处理
显微镜控制和分析软件。
02
基于图形用户界面，方便用户进行样本观察、图像获
取和数据分析。
03
支持多种组织样本类型，包括免疫荧光、荧光原位杂
交等。
Definiens Developer
一种基于规则和智能图像分析软 件，用于构建细胞和组织图像分
析流程。
提供强大的图像处理和分析工具 ，包括图像预处理、特征提取、
激光共聚焦显微镜基本原理和实际操作49页PPT
41、学问是异常珍贵的东西，从任何源泉吸 收都不可耻。——阿卜·日·法拉兹
42、只有在人群中间，才能认识自 己。——德国
43、重复别人所说的话，只需要教育； 而要挑战别人所说的话，则需要头脑。—— 玛丽·佩蒂博恩·普尔
激光共聚焦显微镜基ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ原理和实际操
作
21、没有人陪你走一辈子，所以你要 适应孤 独，没 有人会 帮你一 辈子， 所以你 要奋斗 一生。 22、当眼泪流尽的时候，留下的应该 是坚强 。 23、要改变命运，首先改变自己。
24、勇气很有理由被当作人类德性之 首，因 为这种 德性保 证了所 有其余 的德性 。--温 斯顿． 丘吉尔 。 25、梯子的梯阶从来不是用来搁脚的 ，它只 是让人 们的脚 放上一 段时间 ，以便 让别一 只脚能 够再往 上登。
44、卓越的人一大优点是：在不利与艰 难的遭遇里百折不饶。——贝多芬
45、自己的饭量自己知道。——苏联
《激光共聚焦技术》课件
多模态成像技术结合
将激光共聚焦技术与其它成像技术（如超声、MRI等）相 结合，可以实现多模态、多尺度的成像，为科学研究提供 更多信息。
人工智能与大数据分析
结合人工智能和大数据分析技术，对激光共聚焦图像进行 深度挖掘和定量分析，提高实验结果的可靠性和可重复性 。
05
实验操作与注意事项
实验前的准备
实验材料
将激光束转换为扫描线，并控 制显微镜的X和Y轴移动。
检测器
用于检测荧光信号，并将信号 转换为电信号。
激光器
用于产生激发光，常用波长为 405nm、488nm、561nm和 640nm。
物镜
用于将激光束聚焦到样品上， 并收集荧光信号。
计算机
用于控制扫描头、物镜和检测 器，并收集和处理荧光信号。
性能指标
光漂白与光毒性
强激光束可能会引起荧光分子的光漂 白和光毒性，影响实验结果和细胞活 性。
未来发展与展望
提高成像速度
未来可以通过改进扫描技术和提高探测器性能来提高激光 共聚焦技术的成像速度，以适应更多动态观察的需求。
拓展应用领域
随着技术的进步和应用需求的增加，激光共聚焦技术有望 在更多领域得到应用，如医学诊断、药物研发等。
细胞生物学研究
细胞形态与结构研究
利用激光共聚焦技术观察细胞形态、细胞器结构以及细胞骨架等，有助于深入 了解细胞生物学特性。
细胞分子定位与相互作用
通过荧光标记技术，对特定分子进行定位和追踪，研究分子在细胞内的分布、 动态变化以及与其他分子的相互作用。
医学诊断与治疗
疾病诊断
利用激光共聚焦技术对活体组织进行无创检测，有助于早期发现和诊断肿瘤、炎 症等疾病。
显微镜设置
根据实验需求，设置 激光波长、扫描速度 、分辨率等参数。
激光扫描共聚焦显微课件
文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。
采用激光作为光源，在传统光学显微镜 基础上，使用紫外或可见光激发荧光探针，采 用共轭聚焦原理和装置，从而得到细胞或组织 内部微细结构的荧光图像，在亚细胞水平上观 察生理信号及细胞形态的变化，并利用计算机 对所观察的对象进行数字图象处理的一套集观 察、分析和输出为一体系统。它把光学成像的 分辨率提高了30%~40%，成为形态学，分子生 物学，神经科学，药理学，遗传学等领域中新 一代的研究工具。
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激光器 显微镜：物镜 载物台 计算机系统：图像分析与控制系统
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激光扫描共聚焦显微镜 vs 荧光显微镜
激光扫描共聚焦显微镜
荧光显微镜
激光器 文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。
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LSCM的重要组件
主要系统包括激光光源、自动显 微镜、扫描模块（包括共聚焦光路通 道和针孔、扫描镜、检测器）、数字 信号处理器、计算机以及图象输出设 备（显示器、彩色打印机）等。
文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系网站或本人删除。
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LSCM与普通荧光显微镜的图像质量比较
采用激光作为光源，在传统光学显微镜 基础上，使用紫外或可见光激发荧光探针，采 用共轭聚焦原理和装置，从而得到细胞或组织 内部微细结构的荧光图像，在亚细胞水平上观 察生理信号及细胞形态的变化，并利用计算机 对所观察的对象进行数字图象处理的一套集观 察、分析和输出为一体系统。它把光学成像的 分辨率提高了30%~40%，成为形态学，分子生 物学，神经科学，药理学，遗传学等领域中新 一代的研究工具。
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激光器 显微镜：物镜 载物台 计算机系统：图像分析与控制系统
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激光扫描共聚焦显微镜 vs 荧光显微镜
激光扫描共聚焦显微镜
荧光显微镜
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LSCM的重要组件
主要系统包括激光光源、自动显 微镜、扫描模块（包括共聚焦光路通 道和针孔、扫描镜、检测器）、数字 信号处理器、计算机以及图象输出设 备（显示器、彩色打印机）等。
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LSCM与普通荧光显微镜的图像质量比较
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理[优质ppt]
![关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理[优质ppt]](https://img.taocdn.com/s3/m/0487b1adba0d4a7302763ac6.png)
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面上 均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜一同 食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1 关于blue edition和black edition的区别 blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。 理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格
式。注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
在black edition中：file—export
输出选项中选择full resolution
自动输出为tif格式
导出后的文件
此时的图象依然不是最终图象，还要通过ps调整分辨率等
七、结语
本教程仅对部分功能进行了说明，提供了简单的修图思路，还有很多内容需要使 用者自己探索。
关于导出格式的总结请参考另一份教程。 祝看过这个教程的各位早日发大文章！
Huang’slabZEN图象处理教程
——————选取与微调整
关于激光共聚焦显微镜拍照后图像的处理ppt课件
2
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面上 均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜一同 食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1 关于blue edition和black edition的区别 blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。 理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
注意：必须同时打开两个版本此选项才能被选中
7
3.用ZEN blue edition 打开图片
打开后可 以看到处 理功能更 加丰富 （若安装 的是实验 通用的版 本则为中 文版）
8
三、图象旋转
点击左侧任务栏中的： 处理-几何 Nhomakorabea 可通过两种方式旋转图象
OR
点击Rotate 2D，在参数中 点击旋转，在参数中调整夹
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
Z-位置可以提取某个 时间点的图象
若要导出为多通道拼合的图片，则需要 使用black edition
同时打开blue edition和black edition 在blue edition中：文件--图象转移至
ZEN-black版本 在black edition中：file—export 输出选项中选择full resolution 自动输出为tif格式
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition 版本更迭： Zen 2009 Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2 zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面上 均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜一同 食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1 关于blue edition和black edition的区别 blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。 理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
注意：必须同时打开两个版本此选项才能被选中
7
3.用ZEN blue edition 打开图片
打开后可 以看到处 理功能更 加丰富 （若安装 的是实验 通用的版 本则为中 文版）
8
三、图象旋转
点击左侧任务栏中的： 处理-几何 Nhomakorabea 可通过两种方式旋转图象
OR
点击Rotate 2D，在参数中 点击旋转，在参数中调整夹
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
Z-位置可以提取某个 时间点的图象
若要导出为多通道拼合的图片，则需要 使用black edition
同时打开blue edition和black edition 在blue edition中：文件--图象转移至
ZEN-black版本 在black edition中：file—export 输出选项中选择full resolution 自动输出为tif格式
激光扫描共聚焦显微镜教学课件
细胞膜流动性研究
总结词
详细描述
利用荧光染料标记细胞膜，在激光扫 描共聚焦显微镜下观察标记物的动态 变化，通过分析荧光强度和分布的变 化，可以了解细胞膜的流动性。
神经元突起研究
总结词 详细描述
细胞骨架结构研究
总结词
详细描述
CHAPTER
激光扫描共聚焦显微镜的未 来发展与挑战
技术创新与改进
分辨率提升 高速成像 多维成像
应用领域的拓展
临床诊断
将激光扫描共聚焦显微镜应用于 临床诊断，通过观察活体组织样 本，为疾病诊断和治疗提供更准
确的依据。
药物研发
利用激光扫描共聚焦显微镜观察 药物对细胞的作用和影响，为新
药研发提供实验支持。
生物科学研究
将激光扫描共聚焦显微镜应用于 生物科学研究，探索细胞和分子
层面的生命活动规律。
实验伦理与法规
动物实验伦理 数据处理与隐私保护 法规遵循
WATCHING
激光扫描共聚焦显微 镜教学课件
• 激光扫描共聚焦显微镜简介 • 激光扫描共聚焦显微镜操作流程 • 激光扫描共聚焦显微镜实验技术 • 激光扫描共聚焦显微镜实验案例 • 激光扫描共聚焦显微镜的未来发展与挑战
CHAPTER
激光扫描共聚焦显微镜简介
定义与特点
定义 特点
工作原理
01
激光束通过显微物镜照 射到样品上，形成光斑；
01
样品选择
02 样品预处理
03 载玻片准备
显微镜设置
光源选择
物镜选择
滤色片配置 扫描速度与分辨率设置
图像采集
校准
。
采集参数设置
多区域采集 实时预览
数据分析
图像处理
相关主题
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本操作在2D模式下进 行即是对所有通道同 时进行操作，若需要 单独对某一通道进行 操作，请在拆分模式 下进行。
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
在blue edition中：文件--图象转移至 ZEN-black版本
在black edition中：file—export
输出选项中选择full resolution
自动输出为tif格式
导出后的文件
此时的图象依然不是最终图象，还要通过ps调整分辨率等
七、结语
本教程仅对部分功能进行了说明，提供了简单的修图思路，还有很多内容需要使 用者自己探索。
式。注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
默认使用black edition打 开.lsm格式文件
点击左上角file--save as 图片格式选择第一个czi保 存 保存后的图片即可用blue edition 打开
Huang’s lab ZEN图象处理教程
——————Βιβλιοθήκη 取与微调整2016.5.1 唐浚博
前言
本教程以一张共聚焦显微镜照片（20160120_crb-HA_HA-aPKC_st11-1Az_40X）为例， 讲解如何选取感兴趣区域并加以处理。
本教程仅对最基础最简单的功能进行说明。欢迎大家批评指正和完善。
三、图象旋转
点击左侧任务栏中的： 处理-几何
可通过两种方式旋转图象
OR
点击Rotate 2D，在参数中 点击旋转，在参数中调整夹
调整夹角度数（正值为顺时 角Z度数（正值为顺时针旋
针旋转角度），点击应用
转角度），点击应用
THANK YOU
SUCCESS
2019/5/9
用两种方式旋转45° 后的效果相同
关于导出格式的总结请参考另一份教程。 祝看过这个教程的各位早日发大文章！
THANK YOU
SUCCESS
2019/5/9
2.格式转换(2)
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
注意：必须同时打开两个版本此选项才能被选中
3.用ZEN blue edition 打开图
片
打开后可 以看到处 理功能更 加丰富 （若安装 的是实验 通用的版 本则为中 文版）
关于blue edition和black edition的区别
blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。
理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition
版本更迭：
Zen 2009
Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2
zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面 上均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜 一同食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1
应用后可以发现并非 在原图基础上修改而 是新建了一张处理过 的图象
每一次应用一种新的 效果都会在当前图象 上进行处理，并新建 一张新的图象
四、选取感兴趣区域（ROI）
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
Z-位置可以提取某个 时间点的图象
若要导出为多通道拼合的图片，则需要 使用black edition
同时打开blue edition和black edition
右键单击框选的区域设置一个感兴趣的图集
设置 后选 中区 域在 3个 通道 中都 被裁 切。
五、图象色彩调整
单击自动或最佳可有效改善图象色调，单击重设可还原。其他调整效果请自行尝试。 注：若gamma值不为1可能导致不同显示器显示效果差异
在blue edition中：文件--图象转移至 ZEN-black版本
在black edition中：file—export
输出选项中选择full resolution
自动输出为tif格式
导出后的文件
此时的图象依然不是最终图象，还要通过ps调整分辨率等
七、结语
本教程仅对部分功能进行了说明，提供了简单的修图思路，还有很多内容需要使 用者自己探索。
式。注：建议在拍摄时就直接保存为“.czi”格式以简化后续操作。
2.格式转换(1)
需要说明的是，格式转换不是必须的，但转换后可方便之后随时对文件修改。
默认使用black edition打 开.lsm格式文件
点击左上角file--save as 图片格式选择第一个czi保 存 保存后的图片即可用blue edition 打开
Huang’s lab ZEN图象处理教程
——————Βιβλιοθήκη 取与微调整2016.5.1 唐浚博
前言
本教程以一张共聚焦显微镜照片（20160120_crb-HA_HA-aPKC_st11-1Az_40X）为例， 讲解如何选取感兴趣区域并加以处理。
本教程仅对最基础最简单的功能进行说明。欢迎大家批评指正和完善。
三、图象旋转
点击左侧任务栏中的： 处理-几何
可通过两种方式旋转图象
OR
点击Rotate 2D，在参数中 点击旋转，在参数中调整夹
调整夹角度数（正值为顺时 角Z度数（正值为顺时针旋
针旋转角度），点击应用
转角度），点击应用
THANK YOU
SUCCESS
2019/5/9
用两种方式旋转45° 后的效果相同
关于导出格式的总结请参考另一份教程。 祝看过这个教程的各位早日发大文章！
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SUCCESS
2019/5/9
2.格式转换(2)
此方法无需转换格式。 同时打开blue edition和black edition Flie—send to ZEN2-blue edition
注意：必须同时打开两个版本此选项才能被选中
3.用ZEN blue edition 打开图
片
打开后可 以看到处 理功能更 加丰富 （若安装 的是实验 通用的版 本则为中 文版）
关于blue edition和black edition的区别
blue edition处理功能更丰富；black edition的导出选项更丰富。二者互补。
理论上两个版本都应安装，安装时请注意系统位数
二、1.文件格式
Zen Lite Blue Edition默认打开“.czi”格式文件。 在拍摄好图像后，保存的图象格式可选很多种，其中本实验室大部分为“.lsm”格
一、版本
ZEN lite软件分为blue edition和black edition
版本更迭：
Zen 2009
Zen2010 Zen2011 Zen2012 zen2
zen2.1
此后仍有更新，但版本号无变化。2012与2此两个版本适用的显微镜不同，所以市面 上均有存在，但图片处理相互兼容。Zen lite为免费软件，与zessi激光共聚焦扫描显微镜 一同食用效果更佳。 /microscopy/zh_cn/downloads/zen.html#inpagetabs-1
应用后可以发现并非 在原图基础上修改而 是新建了一张处理过 的图象
每一次应用一种新的 效果都会在当前图象 上进行处理，并新建 一张新的图象
四、选取感兴趣区域（ROI）
当旋转到 合适的角 度后，即 可圈选出 所需区域
在下方工 具栏中点 击标注-选 择感兴趣 区域ROI
通过调整下方工具栏 中的尺寸，可精确调 整所选区域大小及位 移，保证多张图片所 选区域一致。
六、导出
若要直接从blue edition版本导出，则 文件—导出/导入—导 出
值得一提的是若图象 具有时间条则可以导 出为video
Z-位置可以提取某个 时间点的图象
若要导出为多通道拼合的图片，则需要 使用black edition
同时打开blue edition和black edition