HLA基因检测PPT课件

• SanHale Waihona Puke Baiduer 测序原理
3’ A T A G C T G A C T G C A G A T G A T 5’
5’ T A T C G A C T
3’
3’ A T A G C T G A C T G C A G A T G A T 5’
5’ T A T C G A C T G
3’
3’ A T A G C T G A C T G C A G A T G A T 5’
Father’s Mother’s
4 M bp
DP DQDR BC A
HLA: 无血源相关 同胞兄妹 父母亲
10/10 单倍型全相合，半相合 半相合
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脐血干细胞移植 外周血干细胞移植
骨髓干细胞移植
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HLA-A、B、DR抗原配型与移植肾存活率 （加州大学资料）
十年存活 70 率（%） 60
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1950年代Dausset 经产妇血清进行个体之间抗体与白细胞 凝集和细胞毒试验
发现人的MHC，命名为HLA 基因位于第6号染色体短臂
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1960年代，Benacerraf 不同品系的豚鼠对一些抗原的免疫应答 能力比较发现：
控制机体对不同抗原的免疫应答能力的 基因（Ir基因）位于MHC基因复合体内。
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HLA 基因分型
低分辨: SSP
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rSSO Luminex bead for class I & class II
中等分辨HLA分型
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Next generation sequencing
高分辨高通量HLA分型
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Illumina Sequencing by Synthesis (SBS) chemistry
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HLA抗原和等位基因命名:
用血清学及细胞学方法检测抗原特异性:
HLA-B27, HLA-DR4（血清学方法） HLA-DPw2（细胞学方法）
用分子生物学方法检测等位基因：
HLA-DRB1*04 05
位点名 主型
等位基因序号
HLA-B*27 07
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例如HLA-B27
HLA-B*2701
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HLA基因系统的多态性及一些主要基因座位的等位基因数
正式命名显示多态性的HLA基因座位有31个，共2 320个等位基因。 图中所
示为常见基因座位的等位基因数。
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HLA分型的基本检测方法： 细胞学方法测抗原特异性（型） 血清学方法测抗原特异性（型） （微量淋巴细胞毒试验） 分子生物学方法测等位基因 PCR/SSP PCR/Luminex PCR/SBT PCR/二代测序 PCR/流式细胞仪
3.7
系统性红斑狼疮
DR3
5.8
类风关
DR4
4.2
胰岛素依赖型糖尿病 DR3/DR4
25.0
重症肌无力
DR3
2.5
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小结
HLA的三个特性使其成为热点：
决定组织相容性 高度多态性 与疾病关联
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Table of Contents
1. HLA 和HLA分型检测 2. HLA 分型方法比较 3. 强直柱脊椎炎
HLA-B*2708
HLA-B*2702
HLA-B*2709
HLA-B*2703
HLA-B*2710
HLA-B*2704
HLA-B*2711
HLA-B*27051
.
HLA-B*27052
.
HLA-B*2706
.
HLA-B*2707
HLA-B*2723
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Loci Considered to be Matched
HLA 基因检测
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Table of Contents
1. HLA 和HLA分型检测 2. HLA 分型方法比较 3. 强直柱脊椎炎
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Table of Contents
1. HLA 和HLA分型检测 2. HLA 分型方法比较 3. 强直柱脊椎炎
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基本概念
➢ 什么是HLA
50 40 30 6抗原 5抗原 4抗原 3抗原 不匹配
抗原匹配数
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常见HLA与疾病关联
疾病
HLA抗原 相对风险
—————————————————————————
强直性脊椎炎
B27
89.8
Behcet综合征
B51
10-15
多发性硬化症
DR2
4.8
乳糜泻
DR3
10.8
Grave’s病
DR3
MiSeq
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Pacific Biosciences - Single-molecule real-time sequencing
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Sequencing based typing (SBT)
高等分辨HLA分型
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• Sanger 测序原理
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（包括HLA、H-2、ChLA、RhLA、DLA、
SLA、RLA、GpLA、B等）
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1940年代，Snell和Gorer 小鼠间的肿瘤及皮肤移植试验发现：
决定小鼠间移植排斥与否（即组织相容性） 的基因位于17号染色体短臂
命名为组织相容性-2（H-2）
H-2是一个由许多紧密连锁的基因位点构成 的复杂系统
5’ T A T C G A C T G A
3’
3’ A T A G C T G A C T G C A G A T G A T 5’
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8
Benacerraf、Dausset和Snell三位科学家
分别从不同角度对MHC的免疫遗传学进 行的开拓性研究，
荣膺1980年的诺贝尔医学和生理奖。
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HLA分型
HLA共分为4型：I型分子包括HLA-A、HLA-B和HLA-C，广泛存在与 各种组织细胞中； II型分子包括HLA-DP、HLA-DQ和HLA-DR，存在于B细胞、巨噬细胞 和活化T细胞中； III型分子为补体系统，包括C2和C4位点，存在于血清中； IV型分子可能是一些分化抗原，只存在于淋巴细胞、某些细胞毒性T细 胞和白细胞中。
MHC、HLA、亚型、关联
➢ 什么是HLA分型
I型，II型，III型，IV型
➢ HLA分型与疾病检测
骨髓与器官移植，免疫性疾病，代谢性疾病，神经内科 疾病，骨科疾病等
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4
人类白细胞抗原 human leukocyte antigen , HLA
主要组织相容性复合体 Major histocompatibility complex， MHC