第二章_蛋白质化学0
生物化学考题-名解
第二章蛋白质化学1、蛋白质的变性2、氨基酸的PI3、肽4、模体(超二级结构)5、结构域6、蛋白质一级结构7、蛋白质的四级结构8、亚基9、盐析10、分子伴侣11.标准氨基酸1.在理化因素作用下,蛋白质的空间构象被破坏,其理化性质和生物学活性也丧失的过程。
2.调整溶液的pH,使氨基酸带上等量的正电荷和负电荷,此时溶液的pH值为pI。
3.氨基酸之间脱去一分子水以肽键相连而成的化合物。
4.蛋白质中,由两个或三个具有二级结构的肽段在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体,也叫超二级结构。
5.蛋白质的三级结构中存在着若干个二级结构肽段区域或模体的聚集区,它们通常依据特定的几何位置排列,形成具有特定功能的区域,这种区域称为结构域。
6.蛋白质多肽链从N端到C端的氨基酸的排列顺序及二硫键的位置。
7.由两条以上具有独立三级结构的肽链通过非共价键连接而成的结构。
8.蛋白质四级结构中具有独立三级结构的肽链9.大量的中性盐使蛋白质沉淀下来而使蛋白质不变性的过程。
10.是通过提供一个保护环境,加速蛋白质折叠成天然构象蛋白质的伴侣分子。
由于在细胞中合成蛋白质新生多肽链的速度很快,为此存在许多可以帮助蛋白质新生多肽链折叠的蛋白质,统称为分子伴侣。
11.用于合成蛋白质的20种氨基酸为标准氨基酸,与其他氨基酸的区别是它们都有遗传密码。
第三章核酸化学1、稀有碱基2、增色效应3、减色效应4、变性温度5、核酸分子杂交1.核酸分子中,除了常规碱基之外,还存在含量很少的其他碱基,称为稀有碱基。
2.DNA变性导致其紫外吸收值增加,称为增色效应。
3.变性DNA复性恢复成天然构象时,其紫外吸收降低,称为减色效应。
4.50%DNA变性解链时的温度称为解链温度,又称变性温度、熔解温度或熔点。
5.不同来源的核酸链因存在互补序列而形成互补双链结构的过程称为核酸分子杂交。
第四章酶12.Km值Km是反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度1、酶2、酶的活性中心3、酶的必需基团4、多酶体系5、酶的特异性6、酶原激活7、同工酶8、米氏常数9、酶的最适温度10、酶的激活剂1.活细胞产生的具有催化作用的蛋白质及核酸。
生物化学 第2章 蛋白质化学
第二章蛋白质化学一、填空题:1、不同蛋白质的含量颇为相近,平均含量为____%。
2、蛋白质中存在种氨基酸,除了氨基酸外,其余氨基酸的α-碳原子上都有一个自由的基及一个自由的基。
3、能形成二硫键的氨基酸是,分子量最小的氨基酸是。
4、蛋白质具有两性电离性质,大多数在酸性溶液中带电荷,在碱性溶液中带负电荷。
当蛋白质处在某一pH值溶液中时,它所带的正负电荷数相等,此时的蛋白质成为,该溶液的pH值称为蛋白质的________。
5、蛋白质的一级结构是指在蛋白质多肽链中的。
6、在蛋白质分子中,一个氨基酸的α碳原子上的与另一个氨基酸α碳原子上的_______脱去一分子水形成的键叫,它是蛋白质分子中的基本结构键。
7、一个四肽Lys-Val-His-Arg在pH=7溶液中进行电泳,它将向极方向移动。
8、蛋白质在280nm处有最大吸收峰,这是由于蛋白质分子中存在、和残基的缘故。
9、α—螺旋和β—折叠结构属于蛋白质的级结构,稳定其结构的作用力是。
10、丝氨酸、苏氨酸及酪氨酸的极性是由侧链基团的基提供的;天冬酰胺和谷氨酰胺的极性是由其引起的,而半胱氨酸的极性则是因为含的缘故。
11、蛋白质颗粒表面的和是蛋白质亲水胶体稳定的两个因素。
12、蛋白质变性主要是因为破坏了维持和稳定其空间构象的各种键,使天然蛋白质原有的与性质改变。
13、.蛋白质分子二级结构常见的两种类型是和。
14、天然蛋白质分子中的α—螺旋都属于手螺旋。
15、已知下列肽段:(1)-Ala-Phe-Tyr-Ala-Arg-Ser-Glu—(2)-Lys-Glu-Arg-Gln-His-Ala-Ala—(3)-Gln-Cys-Leu-Ala-Ser-Cys-Ala—(4)-Gly-Leu-Ser-Pro-Ala-Phe-Val—其中在pH=7条件下向负极移动快的多肽是;在280nm有最大光吸收的是;可能形成二硫键桥的是;α—螺旋中断的是。
二、选择题(只有一个最佳答案):1、在寡聚蛋白质中,亚基间的立体排布、相互作用以及接触部位间的空间结构称之谓( )A、三级结构B、缔合现象C、四级结构D、变构现象2、形成稳定的肽链空间结构,非常重要的一点是肽键中的四个原子以及和它相邻的两个α-碳原子处于( )A、不断绕动状态B、可以相对自由旋转C、同一平面D、随不同外界环境而变化的状态3、甘氨酸的解离常数是pK1=2.34, pK2=9.60,它的等电点(pI)是( )A、7.26B、5.97C、7.14D、10.774、肽链中的肽键是:( )A、顺式结构B、顺式和反式共存C、反式结构5、维持蛋白质二级结构稳定的主要因素是:( )A、静电作用力B、氢键C、疏水键D、范德华作用力6、蛋白质变性是由于()A、一级结构改变B、空间构象破坏C、辅基脱落D、蛋白质水解7、必需氨基酸是对()而言的。
动物生物化学 第二章 蛋白质
蛋白质分子为右手-螺旋。
(1)-螺旋
-螺旋
表 几种螺旋结构参数
结构类型 残基/圈 1个氢键环的原子数 每个残基高度(nm) Φ Ψ
310螺旋 3.0
位 置
及顺序分析,
的 然后同其它方法分析的肽段进行比较,
确 确定二硫键的位置。
定
2.4 蛋白质的高级结构
2.4.1 肽单位平面结构和二面角
O
O
O
H
H
H
H2N
C
C
N H
C
C
N H
C
C
R
R
R
N端
肽单位
肽单位
O
H
H
NH C C N C COOH
H
R
R
C端
肽单位: 主肽链中的重复单位
肽键平面—由于肽键的双键性质,使得形成肽键的N、C原子以及它们相 连的四个原子形成一个平面,这个平面就叫肽键平面。
蛋白质构件分子是氨基酸。 氨基酸是蛋白质的基本单位。 自然界存在的氨基酸有300多 种,但合成蛋白质的氨基酸只 有20种,都属于α-氨基酸,其 中除甘氨酸外,其余都是L-α氨基酸。
蛋白质分子中的20种 氨基酸在DNA分子中有它 们特异的遗传密码相对应,
因而也称编码氨基酸 (Coding amino acid)。 新近发现的硒代半胱氨酸 (SeCys)也是一种编码 氨基酸。
由 两 个 氨 基 酸 组 成 的 肽 称 为 二 肽 , 由 多 个 氨 基酸组成的肽则称为多肽。因为多肽呈链状, 所以又称为多肽链。组成多肽的氨基酸单元称 为氨基酸残基。
第二章 蛋白质
第二节 氨基酸
(2)碱法水解 (3)酶法水解 选择合适的蛋白酶,在适当的 pH和温度条件下与蛋白质溶液混匀,保温, 经一定时间得到所需的水解产物。 啤酒工业中用蛋白酶水解大分子蛋白质可 除去蛋白质混浊。增加产品稳定性。 (4)稀酸、稀碱水解
第二节 氨基酸
二、氨基酸的结构和分类 1、常见氨基酸 2、蛋白质分子中的稀有氨基酸
第一节 概述
二、蛋白质的化学组成 1、元素组成: 主要有C、H、O、N和少量S 有些蛋白质还有P、Cu、Fe、Mn、Mo、Co、 Zn、Mg、Ca等矿质元素
蛋白质换算系数
第一节 概述
2、蛋白质大分子的化合物组成 两种类型:单纯蛋白质和结合蛋白质
第一节 概述
单纯蛋白质:完全水解产物只有α-氨基酸。 结合蛋白质:由单纯蛋白质与耐热的非蛋白 质物质结合而成的,其非蛋白质部分称为 辅基。 结合蛋白质分子=单纯蛋白质+辅基
第二章 蛋白质
第一节 概述
一、蛋白质的概念 二、蛋白质的化学组成 三、蛋白质的分类 四、蛋白质的分布和生物学意义
第一节 概述
一、什么是蛋白质 蛋白质是一切生物体中普遍存在的, 由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大 分子;其种类繁多,各具有一定的相对分 子质量、复杂的分子结构和特定的生物功 能;是表达生物遗传性的一类主要物质。
第一节 概述
2、蛋白质的生物学作用 (1)形态学功能:生物体的各种组织结构都有 蛋白质参加构成,如动物的角、毛、肉等 形态结构的干物质主要成分都是蛋白质。 (2)生理活性功能:如酶的催化作用,糖蛋白 的细胞识别作用 (3)外氨基酸
一、蛋白质的水解 二、氨基酸的结构和分类 三、氨基酸的理化性质 四、氨基酸的分离制备和分析鉴定
生物化学 第二章 蛋白质化学 上
一 氨基酸的一般结构特征
氨基酸的基本结构特征:
•酸性:
•碱性:
•手性(旋光性):
•特异性
蛋白质是由20种L-型 的α-氨基酸构成。
非极性氨基酸(6个)
极性不带电荷(6个)
芳香族(3个)
带电荷(5个)
二 氨基酸的分类和结构 1.按照氨基酸侧链的极性分类 非极性氨基酸:Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro共八种 极性不带电荷:Gly, Ser, Thr, Cys, Asn, Gln, Tyr共七种 带正电荷:Arg, Lys, His(碱性氨基酸) 带负电荷:Asp, Glu(酸性氨基酸)
胶联剂、可制作金属涂料和车辆、电器用高档氨基树脂装饰漆。
第二节 蛋白质的组成单位-氨基酸
发现:
法国化学家H Braconnot 纤维素酸热解---葡萄糖(单体) 明胶酸热解----含氮化合物(甘氨酸) 肌肉酸水解---含氮化合物(含氨基和羧基)---氨基酸 蛋白质的基本组成单位是(***)氨基酸(amino acid,AA)
3 根据组成分类 简单蛋白质 分子中只有氨基酸 结合蛋白质 简单蛋白+非蛋白成分,
也称复合蛋白质(conjugated protein)或全蛋白质(holoprotein) 结合蛋白根据结合的非蛋白成分进一步分为:
① 色蛋白(chromoprotein)色素+Pr
血红素蛋白;细胞色素类(蛋白);叶绿素蛋白;血蓝蛋白;黄 素蛋白
Tyr、Phe
Trp
N
红色 胍基 Arg
酚试剂反应 (Folin-Cioculteu 反应)
Ellman反应
碱性 CuSO4 及磷 钨酸-钼酸
二硫硝基苯甲酸 DTNB
第二章生物化学--蛋白质上幻灯片PPT课件
H
CH3-S-CH2CH2-CHCOO+NH3 甲硫(蛋)氨酸 methionine Met M 5.74
2、极性不带电荷的氨基酸
HS-CH2-CHCOO+NH3
半胱氨酸 cysteine Cys,C 5.07
HO-
-CH2-CHCOO+NH3
酪氨酸
tyrosine Tyr,Y
5.66
结构
名称
缩写
Glu ,E 3.22
+NH3
Glutamic acid
几种特殊氨基酸
• 脯氨酸 (亚氨基酸)
CH2 CH2
CH2
CHCOONH2+
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半胱氨酸
-OOC-CH-CH2-SH + HS-CH2-CH-COO-
+NH3
-HH
+NH3
-OOC-CH-CH2-S S-CH2-CH-COO-
+NH3
二、蛋白质的分类
1. 按组成分为:简单蛋白质 结合蛋白质 2. 按分子形状和溶解度分为:
纤维状蛋白质 球状蛋白质
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3.按功能分:酶、转运蛋白、贮存蛋白、运动蛋 白、结构蛋白、防御蛋白、调节蛋白等。
三、蛋白质的元素组成
碳 50% 氢7% 氧23% 氮16% 硫 0-3% 微量的磷、铁、铜、碘、锌、钼
第二章生物化学 蛋 白质上幻灯片
第一节 蛋白质在生命活动中的作用 第二节 氨基酸 第三节 蛋白质的结构 第四节 蛋白质结构与功能的关系 第五节 蛋白质的溶解性质及分离鉴定
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第一节 蛋白质在生命活动中的作用
一、蛋白质的概念
蛋白质(protein):是由氨基酸(amino acids) 通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子 含氮化合物。
基础生物化学-蛋白质化学
第二章蛋白质化学第一节蛋白质导言一、蛋白质是生物体重要的组成部分蛋白质(Protein)是生物体的基本组成成份。
蛋白质英文一词“pro tein”,是荷兰化学家Mulder首先使用的,来自于希腊语“pro tos”意为“第一”和“最重要的”。
在机体内蛋白质的含量很多,约占机体固体成分的45%,它的分布很广,几乎所有的器官组织都含蛋白质,并且它又与所有的生命活动密切联系。
蛋白质在生命活动中的作用:1. 酶的催化作用,已知酶有2000多种;2. 运输和储藏作用;3. 激素的调节作用;4. 运动功能,肌肉收缩;5. 结构成分和机械支持物;6. 免疫功能;7. 构成生物膜,体现膜功能;8. 毒素的强调节作用;9. 与动物生长生殖相关,蛋白质有功能大分子之称。
二、蛋白质的元素组成单纯蛋白质的元素组成为碳50~55%、氢6%~7%、氧19%~24%、氮13%~19%,除此之外还有硫0~4%。
有的蛋白质含有磷、碘。
少数含铁、铜、锌、锰、钴、钼等金属元素。
各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。
由于体内组织的主要含氮物是蛋白质,因此,只要测定生物样品中的氮含量,就可以按下式推算出蛋白质大致含量。
这是凯氏定氮法测蛋白质含量的理论依据:蛋白质含量=蛋白质氮×6.25三、蛋白质基本单位氨基酸蛋白质可以在酸、碱或酶的作用水解成氨基酸。
在自然界中氨基酸有300余种,但构成天然蛋白质的氨基酸只有20种,均为L-α-氨基酸(甘氨酸,脯氨酸除外),其结构通式如下:第二节氨基酸的分类组成蛋白质的氨基酸按其α-碳原子上侧链R基团的结构和极性不同分为20种。
一、根据R的结构不同分类1. R基团是非极性的:Gly、Ala、Val、Leu、Met、Ile。
2.R基团是极性的不带电的:Ser、Thr、Cys、Pro、Asp、Gln。
3.R基团带正电的:Lys、Arg、His。
4.R基团带负电的:Asp、Glu。
5.芳香族的:Phe、Tyr、Trp。
第二章蛋白质化学作业及答案
班级学号姓名第二章《蛋白质化学》作业及参考答案第一部分试题1.氨基酸的侧链对多肽或蛋白质的结构和生物学功能非常重要。
用三字母缩写形式列出其侧链为如下要求的氨基酸:(a)含有一个羟基;b)含有一个氨基;c)含有一个具有芳香族性质的基团;(d)含有分支的脂肪族烃链;(e)含有硫;(f)含有一个在pH 7-10范围内可作为亲核体的基团或原子,指出该亲核基团或原子。
2.某种溶液中含有三种三肽:Tyr - Arg - Ser , Glu - Met - Phe 和Asp - Pro - Lys , α- COOH基团的pKa 为3.8; α-NH3基团的pKa为8.5。
在哪种pH(2.0,6.0或13.0)下,通过电泳分离这三种多肽的效果最好?3.利用阳离子交换层析分离下列每一对氨基酸,哪一种氨基酸首先被pH7缓冲液从离子交换柱上洗脱出来。
(a)Asp和Lys;(b)Arg和Met;c)Glu和Val;(d)Gly和Leu(e)Ser和Ala4.胃液(pH=1.5)的胃蛋白酶的等电点约为1,远比其它蛋白质低。
试问等电点如此低的胃蛋白酶必须存在有大量的什么样的官能团?什么样的氨基酸才能提供这样的基团?5.一个含有13个氨基酸残基的十三肽的氨基酸组成为:Ala, Arg,2 Asp, 2Glu, 3Gly, Leu, 3Val。
部分酸水解后得到以下肽段,其序列由Edman降解确定,试推断原始寡肽的序列。
(a)Asp - Glu - Val - Gly - Gly - Glu - Ala(b)Val - Asp - Val - Asp - Glu(c)Val - Asp - Val(d)Glu - Ala -Leu - Gly -Arg(e)Val - Gly - Gly - Glu - Ala - Leu(f)Leu - Gly - Arg6.由下列信息求八肽的序列。
(a)酸水解得Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val(b)Sanger试剂处理得DNP-Ala。
大学生物化学课件 第2章 蛋白质化学
肽链上的氨基酸不是完整的氨基 酸,因而称为氨基酸残基(Amino acid residues)。 一条肽链有两端。 具有游离氨基的一端称为氨基末端 (Amino terminal,或叫N端)。 具有游离羧基的一端称为羧基末端 (Carboxyl terminal,或叫C端)。
3. 肽的书写方法 Calligraph of peptides 书写肽链时,习惯把N端写在左 边,把C端写在右边。 两个氨基酸之间用·或-分开,也 可以用圆圈将氨基酸符号圈开。
4.
二 . 蛋白质的分类 Classification of proteins
1. 根据蛋白质的分子形状分类 Classification according to the shape of protein molecules 球状蛋白质 Globulins 纤维状蛋白质 Fibrins
2. 根据蛋白质的功能分类 Classification according to the functions of proteins 活性蛋白质 Active proteins 酶,转运蛋白,调节蛋白,信号蛋 白,防御蛋白等。 非活性蛋白质 Passive proteins 结构蛋白等。 3. 根据组成分类 Classification according to the composition of proteins 简单蛋白质 Simple proteins 结合蛋白质 Conjugated proteins
2. 由氨基和羧基参与的几种重要化学反应 Several important reactions of amino acids 1)茚三酮反应 Ninhydrin reaction 茚三酮 + 氨基酸 蓝紫色化合物
*
茚三酮反应
南开大学:生化课件02蛋白质化学
D/L标记法 标记法
甘油醛 D/L 分型为参考标准
球棍式
透视式
投影式
二、氨基酸的分类和结构
基团结构分: 依R基团结构分: 基团结构分 非极性氨基酸( 非极性氨基酸(Nonpolar Amino Acids)9种 ) 种 极性,不带电荷氨基(Polar,Uncharged 极性,不带电荷氨基( Amino Acids)6/7种 ) 种 酸性氨基酸 (-)(Acidic Amino Acids)2种 ( ) 种 碱性氨基酸 (+)(Basic Amino Acids)3种 ( ) 种
含非极性R基团的氨基酸 含非极性 基团的氨基酸
(甲硫氨酸) 甲硫氨酸)
含极性不带电荷R基团的氨基酸 含极性不带电荷 基团的氨基酸
含带负电荷(酸性) 基团的氨基酸 含带负电荷(酸性)R基团的氨基酸
含带正电荷(碱性) 基团的氨基酸 含带正电荷(碱性)R基团的氨基酸
4-羟脯氨酸 羟脯氨酸 3-甲基组氨酸 甲基组氨酸 5-羟赖氨酸 羟赖氨酸
ε—N-N-N-三甲基赖氨酸 三
甲状腺素
三、蛋白质 中修饰性氨 基酸
γ-羧基谷氨酸 羧基谷氨酸 α-氨基己二酸 氨基己二酸 氨基己二 焦谷氨酸
ε-N-甲基赖氨酸 甲基赖氨酸
磷酸丝氨酸 磷酸苏氨酸 磷酸丝氨酸 磷酸苏氨酸 磷酸酪氨酸 磷酸酪氨酸
N-甲基精氨酸 甲基精氨酸
N-乙酰 赖氨酸
四、非蛋白质氨基酸
[质子供体] 质子供体]
pK值 :指某种解离基团有一半被解离时的 值。 值 指某种解离基团有一半被解离时的pH值
pK1
pK2
甘氨酸酸 碱滴定曲线
2.34
9.60
Gly等电点的计算 等电点的计算
《生物化学》第二章
2.β-折叠
形式
4.无规卷曲
多肽链中,两段以上折叠成锯齿状的肽链, 通过氢键相连而成的平行片层状结构称为β折叠或β-片层。
无规卷曲是指肽链中没有确定规律性的构象, 不能被归入明确的二级结构,本身也具有一 定的稳定性。
- 20 -
第二节 蛋白质的分子结构
二、蛋白质的空间结构
α-螺旋
α-螺旋的主链呈螺旋上升,每3.6个氨基酸残基 上升一圈,相当于0.54 nm。
另外,虽然亚基具有独立的三级结构,但单独存在时无生物活性。例如,血红蛋白(上图)由四个 亚基组成,每个亚基在含氧量高的地方均能结合一分子的氧,在含氧量低时,释放所结合的氧。但任何 一个亚基单独存在时,只能结合氧,不能释放氧,不具有血红蛋白的运氧作用。
- 27 -
第二节 蛋白质的分子结构
二、蛋白质的空间结构
蛋白质的一级结构决定了蛋白质的二级、三级等高级结构。 蛋白质一级结构的阐明,对揭示某些疾病的发病机制、指导疾病治疗有十分重要的意义。
?
蛋白质的空间结构是如何形成的??
- 18 -
第二节 蛋白质的分子结构
二、蛋白质的空间结构
蛋白质的二级结构
蛋白质的二级结构(secondary structure)是指多肽链中有规则重复的构象, 这些构象由主链原子形成,不涉及侧链部分的构象。
-7-
第一节
蛋白质的分子组成 二、蛋白质的基本结构单位——氨基酸
除甘氨酸外,其他氨基酸的α-碳原子均为手性碳 原子,有L-型和D-型两个旋光异构体。组成天然氨基 酸的氨基酸均为L-型,因此人体内的氨基酸均为L-α-氨 基酸,其结构式如右图所示。
-8-
第一节
蛋白质的分子组成 二、蛋白质的基本结构单位——氨基酸
蛋白质化学-蛋白质结构和功能关系
• 变性的本质
—— 破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白 质的一级结构。
•造成变性的因素 物理因素:加热、紫外线、X线、超声波 化学因素:乙醇等有机溶剂、强酸、强 碱、重金属离子及生物碱试剂等 。
➢ 变性特征: 生物活性丧失;
理化性质改变:溶解度降低、球状蛋白质的 不对称性增加、粘度增加、扩散系数降低,某 些蛋白质不能够再形成结晶, 变性后分子结构 松散、易被水解,变性蛋白易被酶消化。
2、不可逆沉淀
▪ 定义:蛋白质发生沉淀后,不能用透析等方法除 去沉淀剂而使蛋白质重新溶解的现象
▪ 在强烈沉淀条件下,不仅破坏了蛋白质胶体溶液 的稳定性,而且也破坏了蛋白质的结构和性质, 产生的蛋白质沉淀不可能再重新溶解于水。
▪ 由于沉淀过程发生了蛋白质的结构和性质的变化, 所以又称为变性沉淀。
▪ 如加热沉淀、强酸碱沉淀、重金属盐沉淀和生物 碱沉淀等都属于不可逆沉淀。
肌红蛋白(myoglobin, Mb)
肌红蛋白是一个只有三级结
构的蛋白质,有8段α-螺旋
结构,分别成为A B C D E F G H肽段。整条多肽链折叠 成紧密球状分子,氨基酸残 基上的疏水侧链大都在分子 内部,富极性及电荷的则在 分子表面,因此水溶性较好。 Mb分子内部有个袋形空穴, 血红素居于其中。
(1)抗体的基本结构
Ig分子基本结 构是由四个肽 链组成的。
包括二条较小 的轻链和二条 较大的重链。
轻链与重链之 间是由二硫键 连接形成Ig分 子单体。
(1)抗体的基本结构
(2)可变区和恒定区
➢ 可变区和抗原识别有关,决定抗体识别的特异 性,而恒定区和效应功能相关。
➢ 此外在Y形分子伸出的两臂和主干之间还有个 可弯曲的铰链区(hinge R),能改变两个结合抗 原的Y形臂之间的距离。
《生物化学》思考题第二章 蛋白质化学
第二章蛋白质化学学习要求一、掌握蛋白质分子平均含氮16%的意义,20种氨基酸名称(及三字符号),R结构特点及分类法;蛋白质一、二、三、四级结构基本特点;蛋白质生物学功能。
二、熟悉蛋白质重要的理化性质;其他为应了解的内容。
习题一、名词解释1.等电点(pI) 2.肽键 3.蛋白质的变性作用 4.非编码氨基酸 5.α螺旋 6.结合蛋白 7.盐析作用 8.亚基 9.分子病 10.透析二、思考题1.不同蛋白质的含量颇为相近,平均含量为%。
2.20种基本氨基酸可以分为哪几类?其分类依据是什么?其中,酸性氨基酸和碱性氨基酸各包含哪几种氨基酸?3.蛋白质的一、二、三、四级结构的各自定义及其特点。
4.蛋白质的二级结构有哪些?维持二级结构的化学键是?5.维持蛋白质一级结构的化学键是键,而维持蛋白质高级结构的化学键有哪些?6.如果组成蛋白质的2条多肽链之间存在共价键(如二硫键),就没有四级结构。
7.试说明蛋白质结构与功能的关系。
8.维持蛋白质亲水胶体稳定的两个因素是?9.引起蛋白质变性的理化因素有哪些?蛋白质变性后,其理化性质....和生物学活性.....会发生怎样的改变?10.沉淀蛋白质的方法有哪些?其中法在常温下沉淀出的蛋白质不变性。
11.试举二例说明蛋白质变性在医学、食品工业等实践中的应用。
12.蛋白质和核酸对紫外光均有吸收。
蛋白质的最大吸收波长是 nm;核酸的最大吸收波长是 nm。
13.蛋白质的生理功能有哪些?试从含量及生理功能说明蛋白质在生命过程中的重要性。
14.氨基酸的等电点和中性点(pH 7.0)有何区别?15.如将氨基酸混合液(甘氨酸、精氨酸、谷氨酸)点在滤纸上,在pH6.8的缓冲液中进行电泳,试推测它们从正极至负极的顺序。
第三章酶学学习要求一、掌握酶的概念与作用特点(催化效率高、专一性强、不稳定性及可调控性等).酶蛋白、辅助因子(辅酶或辅基)、参与辅酶或辅基组成的B族维生素及其功能、全酶;必需基团与活性中心;酶原激活及同工酶概念。
蛋白质化学
引导看P16
蛋白质的概念:
生命是蛋白体的存在方 式,这种存在方式本质 上就在于这些蛋白体的 化学组成部分的不断自 我更新。
蛋白质的生物学意义(补充)
(一)是生物体的重要组成部分 (二)具有重要的生物学功能 (三)具有氧化功能
应用:可定性或定量测定各种氨基酸。
a、根据颜色深浅,在570nm处测OD值, 可知样品中氨基酸含量。 b、定量释放的CO2,可用测压法测量,计 算出参加反应的aa量。
氨基酸既是酸又是碱,但不能直接用酸、 碱滴定法定量测定,为什么? 这是因为此滴定的pI过高(12-13),或 PI过低(1-2),没有适当的指示剂。
计算等电点的离子
3、紫外吸收性质:
只有芳香族的氨基酸,才具有紫外吸收能 力(因其含有苯环共轭双键的R侧链)。 酪氨酸 λmax:270nm 苯丙氨酸 λmax :259nm 色氨酸 λmax :279nm 所以,测定样品280nm处的光吸收值, 可知溶液中蛋白质的浓度。此法快速简便。
反应式(P26-27):
氨基酸与茚三酮反应
加热 (弱酸) 还原性茚三酮
+
水合茚三酮(无色)
+
NH3
CO2
RCHO
+ 2NH3 +
3H20
蓝紫色化合物
还原性茚三酮
水合茚三酮
重要结论:
除脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄 色物质外, 其余的氨基酸与此反应均产生蓝紫 色物质。 此反应非常灵敏,只需几微克氨基酸就 能显色。且A570与氨基酸含量在一定范围内成 正比,因此茚三酮反应可用于测定样品中氨基 酸含量。并常用作显色剂,可定性或定量地测 定各种α-氨基酸。 此外,多肽和蛋白质也能发生此反应, 但灵敏度较差。
生物化学第二章 蛋白质
蛋白质
目 录
一、蛋白质的种类、含量与分类 二、氨基酸 三、肽 四、蛋白质的结构 五、蛋白质的性质 六、食物中的蛋白质 七、蛋白质的分离与纯化
一、蛋白质的化学组成与分类
主要组成元素:C、H、O、N、S 及 P、Fe、 Cu、Zn、Mo、I、Se 等微量元素。 百分数约为:碳占50~55%,氢占6~8%, 氧占20~30%,氮占15~18%及硫占0~4%。 大多数蛋白质所含氮素约为16%,因该元素容 易用凯氏(Kjeldahl)定氮法进行测定。 故蛋白质的含量可由氮的含量乘以 6.25(100/16)计算出来: 即:蛋白质含量=6.25×样品含氮量
aa向正极移动 aa向负极移动 aa不移动
pI的测定:
酸碱滴定法; 基于aa所带基团 均可解离; 得到弱酸弱碱曲 线; 根据aa上可解离 基团的pK值计算 等电点: pK:解离常数。 以甘氨酸为例:
由此可知:
在生理pH内,aa 的羧基和氨基全部解离; 具有这种性质的物质称两性电解质; 带有相反基团的分子叫两性离子; 滴定中Gly的阳离子(R+)、阴离子(R-) 和两性离子(R°)的比例随pH而变; 当溶液中只有两性离子时, pH = pI
蛋白质氨基酸
蛋白质中存在的20种氨基酸,除脯氨酸外,在其 α -碳原子上都有一个自由的羧基及一个自由的氨基; 由于脯基酸的α -氨基被取代,它实际上是一种α -亚 氨基酸。此外,每种氨基酸都有一个特殊的R基团。
生物体内常见氨基酸的分类:
蛋白质氨基酸: 蛋白质中常见的20种氨基酸 稀有的蛋白质氨基酸:蛋白质组成中,除上述20 种常见氨基酸外,从少数蛋白质中还分离出一些 稀有氨基酸,它们都是相应常见氨基酸的衍生物。 如4-羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等。 非蛋白质氨基酸:生物体内呈游离或结合态的氨 基酸。
第二章蛋白质化学氨基酸
氨基的羧酸。是羧酸分子中Cα 上 的一个H被氨基取代而成的化合物。
R-COOH
----C-C-C-C-COOH γβα
R-C α H -COOH
H
R-C α H -COOH
NH2
蛋白质氨基酸
• 自然界中存在的氨基酸有300余种,但组成蛋白 质的有22种,称为蛋白质氨基酸,又名标准氨基 酸,其中最早发现的20种较为常见,
• 20种氨基酸中,第一个被发现的是Asn,是1806 年在植物芦笋中发现的;最后一个被发现的是 Thr,是1938年在小麦麸质中发现的。
• 2种不常见的蛋白质氨基酸:含硒半胱氨酸(第 21种)和吡咯赖氨酸(第22种)
一、氨基酸的结构
氨基酸的结构通式
COO+α
H3N C H
COOH
或
H2N
α
CH
R
(1) L-α-氨基酸的衍生物 L-瓜氨酸和L-鸟氨酸是合成精氨酸的中间产物。
(2)D-α-氨基酸 D-Ala存在于肽聚糖中,D-Phe是短杆菌肽S的组分 (3)β、γ、δ-氨基酸 β-Ala是泛酸的前体,γ-氨基丁酸是传递神经冲动的化 学介质。
五、AA的重要理化性质
(一)氨基酸的物理性质
• 状态:无色晶体或粉末 • 溶解性:各种氨基酸在水中的溶解度差别很大,
凯氏定氮法:
100克样品中蛋白质的含量 ( g % ) = 每克样品含氮克数× 6.25×100
1/16%
蛋白质含量的测定: 凯氏定氮法(测定氮的经典方法)
三聚氰胺(Melamine)
• 分子量126.12。
• 牛奶中总蛋白质由大约 94%的纯 蛋白质(约3.1g/100g)和约6% 非蛋白质(约0.2g/100g)组成。 总蛋白质平均含量为3.3%。
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R为含羟基基团的氨基酸 (4) R为含羟基基团的氨基酸
丝氨酸( -氨基羟基丙酸) 苏氨酸( -氨基丝氨酸(α-氨基-β-羟基丙酸)和苏氨酸(α-氨基β-羟基丁酸)都含有β-羟基。丝氨酸的羟甲基(羟基丁酸)都含有β 羟基。丝氨酸的羟甲基( CH2OH)在水溶液中不发生离子化,但可以参与很多酶 )在水溶液中不发生离子化, 的活性部位的反应。苏氨酸也象异亮氨酸一样, 的活性部位的反应。苏氨酸也象异亮氨酸一样,具有两个 手性碳原子, 手性碳原子,即α-碳和β-碳原子。 -碳和β 碳原子。
8. 免疫功能:生物体用于防御致病微生物或 免疫功能: 病毒侵害而产生的抗体(免疫球蛋白) 病毒侵害而产生的抗体(免疫球蛋白)是一 类高度专一性的蛋白质。它能识别病毒、 类高度专一性的蛋白质。它能识别病毒、细 菌以及其它生物体的细胞,并与之相结合, 菌以及其它生物体的细胞,并与之相结合, 消除它们的病理作用, 消除它们的病理作用,从而起作保护机体的 作用; 作用; 9. 干扰素的抗病毒作用:干扰素以蛋白质的 干扰素的抗病毒作用: 形式存在于细胞内, 形式存在于细胞内,消灭抗体不能抵御的入 侵病毒; 侵病毒;
赖氨酸( , 二氨基己酸 是一个双氨基酸,含有α-和 二氨基己酸) ② 赖氨酸(α,ε-二氨基己酸)是一个双氨基酸,含有 和 ε-氨基 。 在中性 , ε-氨基以碱性氨离子 ( -CH2-NH3 + ) 的 氨基。 氨基以碱性氨离子( 氨基 在中性pH, 氨基以碱性氨离子 形 式 存 在 , 在 蛋 白 质 中 通 常 带 正 电 荷 。 精氨酸( 氨基 胍基戊酸) 氨基-δ-胍基戊酸 ③ 精氨酸(α-氨基 胍基戊酸)是20种氨基酸中碱性最强 种氨基酸中碱性最强 的氨基酸。它的侧链胍基离子的pKa值最高(pKa=12.5)。 值最高( 的氨基酸。它的侧链胍基离子的 值最高 = )
3. 生长、分化的调控蛋白:组蛋白、阻遏蛋 生长、分化的调控蛋白:组蛋白、 转录因子等参与基因的表达调控; 白 、 转录因子等参与基因的表达调控 ; 细 胞周期蛋白等具有调控细胞分裂、 增殖、 胞周期蛋白等具有调控细胞分裂 、 增殖 、 生长、分化的功能; 生长、分化的功能; 4. 运输蛋白:脊椎动物红细胞的血红蛋白和 运输蛋白: 无脊椎动物中的血蓝蛋白在生命呼吸过程 中起作输送氧气的作用。 中起作输送氧气的作用 。 血液中的脂蛋白 随着血流输送脂质。 随着血流输送脂质 。 生物氧化过程中某些 色素蛋白如细胞色素c等起电子传递体的作 色素蛋白如细胞色素 等起电子传递体的作 用 。 生命活动需要的许多小分子物质和离 子的输送也需要蛋白质的协助; 子的输送也需要蛋白质的协助;
10. 接受和传递信息 : 接收外界信息 接受和传递信息: 并进行传递作用的一类蛋白质, 并进行传递作用的一类蛋白质 , 如 酵母细胞的信号传导系统、 酵母细胞的信号传导系统 、 视网膜 上的视色素、 味蕾上的味觉蛋白等。 上的视色素 、 味蕾上的味觉蛋白等 。
第一节 蛋白质分子的组成
一、蛋白质的元素组成 二、蛋白质的基本组成单位—氨基酸 蛋白质的基本组成单位—
R为酸性基团的氨基酸 (6) R为酸性基团的氨基酸
天冬氨酸( 氨基戊二酸) 天冬氨酸(α-氨基丁二酸)和谷氨酸(α-氨基戊二酸)是 氨基丁二酸) 谷氨酸( 二羧基氨基酸。除了含有α 羧基外,天冬氨酸还含有b 羧基; 二羧基氨基酸。除了含有α-羧基外,天冬氨酸还含有b-羧基; 而谷氨酸则含有g-羧基。两个氨基酸的侧链在pH7时都离子化, 而谷氨酸则含有g 羧基。 两个氨基酸的侧链在pH7时都离子化, pH 所以在蛋白质中是带负电荷的。 所以在蛋白质中是带负电荷的 。 这两个氨基酸经常出现在蛋 白质分子表面上,谷氨酸的单钠盐是调味品味精。 白质分子表面上,谷氨酸的单钠盐是调味品味精。
5. 储藏蛋白:有一类蛋白质具有储藏氨基酸, 储藏蛋白:有一类蛋白质具有储藏氨基酸, 在需要的时候将其用作生物体及其胚胎或幼 体生长发育的原料的功能。如卵清蛋白, 体生长发育的原料的功能。如卵清蛋白, 小 麦种子中的麦醇溶蛋白; 麦种子中的麦醇溶蛋白; 6. 激素的调节作用:含氮激素本质上是蛋白质、 激素的调节作用:含氮激素本质上是蛋白质、 多肽或氨基酸衍生物,如胰岛素。激素对生 多肽或氨基酸衍生物, 如胰岛素。 物体的新陈代谢具有调节作用; 物体的新陈代谢具有调节作用; 7. 运动功能:高等动物肌肉的主要成分是蛋白 运动功能: 质 ,肌肉收缩是由肌球蛋白和机动蛋白的相 对滑动来实现的; 对滑动来实现的;
课堂讲授
13~14
5
课堂讲授
第九章 脂类及其代谢
15
3 3
课堂讲授
第十章 氨基酸的代谢 第十一章 核苷酸代谢 第十二章
2
课堂讲授
第二章 蛋白质化学
序言 第一节 第二节 第三节 第四节 第五节 第六节
蛋白质分子的组成 肽键和肽 蛋白质的结构 蛋白质分子结构与功能的关系 蛋白质的性质 蛋白质的分类
各种蛋白质的含氮量很接近, 各种蛋白质的含氮量很接近, 平均为16%,即一克氮相当于 ,即一克氮相当于6.25 平均为 克蛋白质。 克蛋白质。由于体内组织的主要含 氮物是蛋白质,因此,只要测定生 氮物是蛋白质,因此, 物样品中的氮含量, 物样品中的氮含量,就可以此换算 出蛋白质大致含量。 出蛋白质大致含量。
序言
蛋白质( 蛋白质 ( Protein) 是由 ) 是由L-α-氨基酸按一 氨基酸按一 定的次序通过肽键( 酰胺键) 定的次序通过肽键 ( 酰胺键 ) 连接而成的生 物大分子。 蛋白质英文一词 “ protein”, 来 物大分子 。 蛋白质英文一词“ , 源于希腊语“ 第一” 源于希腊语“protos”,是“第一”或“最重 , 要的”意思。 要的”意思。
一、蛋白质的元素组成
单纯蛋白质的元素组成为: 单纯蛋白质的元素组成为 碳:50~55%; ~ ; 氢:6%~7%; ~ ; 氧:19%~24%; ~ ; 氮:13%~19%; ~ ; 硫:0~4%; ~ ; 有的蛋白质含有磷、 有的蛋白质含有磷、碘。少数含铁、铜、 少数含铁、 钼等金属元素。 锌、锰、钴、钼等金属元素。
脯氨酸( 吡 ④ 脯氨酸(β-吡 咯烷基- 羧酸 羧酸) 咯烷基 -羧酸 ) 有 一个环形的饱和烃侧 所以严格地讲, 链 , 所以严格地讲 , 脯氨酸是一个亚氨基 酸。
R为芳香族基团的氨基酸 (2) R为芳香族基团的氨基酸
•
苯丙氨酸( 氨基-β-苯丙酸 苯丙氨酸( α -氨基 苯丙酸)侧链含有苯基。酪氨 氨基 苯丙酸)侧链含有苯基。 氨基-β-对羟基苯丙酸 酸( α -氨基 对羟基苯丙酸)与苯丙氨酸相似,只是在 氨基 对羟基苯丙酸)与苯丙氨酸相似, 苯基的对位多了一个羟基,所以又称为对羟基苯丙氨酸。 苯基的对位多了一个羟基,所以又称为对羟基苯丙氨酸。 色氨酸( 吲哚 吲哚- 氨基丙酸 氨基丙酸) 色氨酸(β-吲哚 α -氨基丙酸)的侧链带有一个双环的吲 哚基,所以色氨酸又称之吲哚丙氨酸。 哚基,所以色氨酸又称之吲哚丙氨酸。
R为脂肪族基团的氨基酸 为脂肪族基团的氨基酸: (1) R为脂肪族基团的氨基酸:
甘氨酸( 氨基乙酸) ① 甘氨酸 (- 氨基乙酸 ) 的侧链 是个氢原子, 20种氨基酸中最 是个氢原子,是20种氨基酸中最 简单的, 简单的,所以甘氨酸的碳原子不 是手性碳。 是手性碳。
丙氨酸( 氨基丙酸 氨基丙酸) ② 丙氨酸 ( a-氨基丙酸 ) 的侧链是一个简单的甲基; 的侧链是一个简单的甲基 ; 缬氨酸(a-氨基异戊酸 的 氨基异戊酸)的 缬氨酸 氨基异戊酸 的3 侧链 是 一个 含 有支 链 的 碳侧链。 碳侧链。
二、蛋白质的基本组成单位-氨基酸 蛋白质的基本组成单位(一)氨基酸的构型 (二)蛋白质氨基酸的分类 (三)氨基酸的理化性质 (四)氨基酸的分离与分析
氨基酸是指含氨基的羧酸
(一)氨基酸的构型
旋光性: 是手性分子的一种性质, 旋光性 : 是手性分子的一种性质 , 即旋转 偏振光平面的能力; 偏振光平面的能力; 分子的旋光度符号和构型(D,L)之间没有简 之间没有简 分子的旋光度符号和构型 单的关系.不是都象甘油醛那样 是右旋 单的关系 不是都象甘油醛那样D-是右旋 不是都象甘油醛那样 是右旋,L是左旋。 各种L-氨基酸中有的为左旋有的 是左旋 。 各种 氨基酸中有的为左旋有的 为右旋, 即使同一种L-氨基酸 氨基酸, 为右旋 , 即使同一种 氨基酸 , 在不同溶 剂中测定时, 剂中测定时 , 其比旋光值和旋光方向也会 不同。 不同。
1
1 10 9 12 6
课堂讲授
第一章 绪论 第二章 蛋白质化学 第三章 酶化学 第四章 核酸的化学及其生物合成 第五章 蛋白质的生物合成 第六章 维生素与辅酶 第七章 生物氧化 第八章 糖与糖代谢
1~3
课堂讲授
3~5
课堂讲授
6~8
课堂讲授
9~10
课堂讲授
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课堂讲授
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蛋白质在生命活动中的作用
1. 酶蛋白:蛋白质最重要的生物学功能之一是作为 酶蛋白: 生物体新陈代谢的催化剂-酶 生物体新陈代谢的催化剂 酶。目前已发现的酶有 2000多种,绝大多数是蛋白质; 多种, 多种 绝大多数是蛋白质; 2. 作为结构成份的蛋白质:蛋白质的另一重要生 作为结构成份的蛋白质: 物学功能是作为生物体的结构成份。 物学功能是作为生物体的结构成份。在高等动物 里,胶原蛋白和弹性蛋白都是结缔组织的蛋白质 组分。胶原蛋白是主要的细胞外结构蛋白, 组分。胶原蛋白是主要的细胞外结构蛋白,参与 结缔组织和骨骼作为身体的支架, 结缔组织和骨骼作为身体的支架,而弹性蛋白在 血管和韧带中特别丰富; 血管和韧带中特别丰富;
(二)蛋白质氨基酸的分类
①脂肪族氨基酸: 甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、 脂肪族氨基酸 甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、 亮氨酸、异亮氨酸、 亮氨酸、异亮氨酸、脯酸 ②芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸 芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸、 1、 按照 侧链 R的 不同 ③含硫氨基酸: 含硫氨基酸: ⑤碱性氨基酸: 碱性氨基酸: ⑥酸性氨基酸: 酸性氨基酸: ⑦酰胺氨基酸: 酰胺氨基酸: 蛋氨酸、 蛋氨酸、半胱氨酸 组氨酸、赖氨酸、精酸 组氨酸、赖氨酸、 天冬氨酸、 天冬氨酸、谷氨酸 天冬酰胺、 天冬酰胺、谷氨酰胺 ④含羟基氨基酸:丝氨酸、苏氨酸 含羟基氨基酸:丝氨酸、