有机化学 第十五章 氨基酸、多肽与蛋白质
第十五章 蛋白质的生物合成-翻译
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二、tRNA
tRNA是氨基酸的搬运工具。 tRNA是多肽链和mRNA之间的 重要转换器。 每一种氨基酸可以有一种以上 tRNA作为运载工具。 能够携带相同氨基酸而反密码子 不同的一组tRNA分子称为氨基 酸的同工受体tRNA (isoaccepting tRNA) 。
tRNA须具备的功能 • 与氨基酸结合(3’末端) • 识别特异的氨酰-tRNA合成酶(D环) • 识别mRNA链上密码子 • 与核糖体结合,使延长中的肽链附着于核糖体上(TψC环)
蛋白质生物合成过程包括: 1. 氨基酸的活化; 2. 合成起始; 3. 肽链延伸:进入、转肽、移位; 4. 终止合成。
一、氨基酸的活化
二、合成的起始阶段
核糖体大小亚基分离; mRNA在小亚基定位结合; 起始氨酰tRNA的结合; 核糖体大亚基结合。
1. 核糖体大、小亚基分离 IF1和IF3与30S小亚基结合,促进核糖体大、小
翻译过程实际上就是由tRNA携带着氨基酸,逐一识别 mRNA上的密码子,并将氨基酸依密码子的排序相互 连接的过程。核糖体是翻译的场所。
一、mRNA模板和遗传密码
• mRNA是翻译的直接模板。 (一)遗传密码的破译
mRNA上四种核苷酸→组成蛋白质的20种aa
核苷酸与氨基酸对应关系?
3个相邻的核苷酸→1个aa, 有43种排列→64种密码子
• 核糖体可以看作是一个大分子的机构,它具有许多精密的 配合部分,来挑选并管理参与蛋白质合成的各个组分。它 参与多肽链的启动、延伸和终止的各种因子的识别。
原核生物核糖体
5S rRNA, 23S rRNA 50S
34种蛋白质 70S
16S rRNA 30S
21种蛋白质
真核生物核糖体
5SrRNA,5.8SrRNA,28SrRNA 60S
有机化学基础知识点氨基酸与蛋白质的结构与性质
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有机化学基础知识点氨基酸与蛋白质的结构与性质有机化学基础知识点:氨基酸与蛋白质的结构与性质在有机化学中,氨基酸是构成蛋白质的基本组成单位。
了解氨基酸的结构和性质对于深入理解蛋白质的功能和作用至关重要。
本文将介绍氨基酸的基本结构、分类以及蛋白质的结构和性质。
一、氨基酸的基本结构氨基酸是由一个氨基基团(-NH2)、一个羧酸基团(-COOH)和一个侧链基团(R)组成的。
氨基酸的碳原子上还有一个氢原子和一个与侧链基团连接的碳原子,即α碳原子。
氨基酸的侧链基团可以是不同的有机基团,决定了氨基酸的性质和功能。
根据侧链基团的性质,氨基酸可分为以下几类:1. 构成氨基酸主链的非极性氨基酸,如甘氨酸、丙氨酸等。
它们的侧链基团都是非极性的烷基或芳香烃基,不带电荷。
2. 构成氨基酸主链的极性氨基酸,如天冬酰胺酸、谷氨酸等。
它们的侧链基团含有极性官能团,具有某种电荷。
3. 构成氨基酸主链的带电氨基酸,如赖氨酸、精氨酸等。
它们的侧链基团带正电荷,在生物体内具有重要的生理功能。
此外,还有一些特殊的氨基酸,如脯氨酸、半胱氨酸等,它们在氨基酸的结构中具有特殊的官能团或化学键,参与了许多重要的生物反应。
二、蛋白质的结构蛋白质是由一条或多条多肽链组成,每个多肽链由多个氨基酸残基以肽键相连而成。
多肽链的折叠和空间排布决定了蛋白质的功能和性质。
1. 一级结构:指多肽链上氨基酸残基的线性排列顺序。
氨基酸之间通过肽键连接,多肽链的N端和C端分别指代氨基末端和羧基末端。
2. 二级结构:指蛋白质中多肽链的局部结构。
常见的二级结构有α-螺旋和β-折叠,它们是由氢键相互作用所稳定的。
3. 三级结构:指整个多肽链的三维空间结构。
蛋白质的三级结构由多个二级结构单元通过各种非共价键相互作用而形成。
4. 四级结构:指多肽链与多肽链之间的空间排布和相互作用。
多个多肽链通过非共价键和共价键相互连接而形成更复杂的蛋白质结构。
蛋白质的结构多种多样,不同的结构决定了不同的功能。
高中有机化学教案 氨基酸和蛋白质
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氨基酸和蛋白质第一节 氨基酸一、 概述分子中含氨基的羧酸称为氨基酸。
芳香氨基酸:COOHN H 2C H 3C H 2C HCOOHN H 2α-氨基酸:β-氨基酸:γ-氨基酸:C H 3C H COOHN H 2CH 2C H 2COOH N H 2CH 2C H 2C H 2COOH N H 2中性氨基酸:-NH 2与-COOH 数目相等酸性氨基酸:-NH 2比-COOH 数目少碱性氨基酸:-NH 2比-COOH 数目多命名多用俗名。
二、 构型:除甘氨酸,均有手性。
分子的构型可与L-乳酸联系。
H OH COOHC H 3H N H 2COOH C H 3L-乳酸 L-氨基酸三、 物理性质:无色结晶,易溶于水,难溶于非极性有机溶剂。
加热到熔点(>200℃)分解。
四、化学性质1. 两性:⑴ 结构与平衡:分子中有氨基和羧基,可形成分子内盐。
存在:主要以两性分子存在。
中性氨基酸中-COO -与-NH 2+解离的能力不同,因此中性氨基酸的pH 不等于7,一般略小于7,即负离子多一些。
⑵ 平衡改变:加入酸,平衡左移,正离子增加。
加入碱,平衡右移,负离子增加。
⑶等电点:当正离子数目等于负离子数目时的pH值。
用pI表示。
酸性氨基酸:pI<7,即pH<7,碱性氨基酸:pI>7 ,即pH>7中性氨基酸:pI<7,即pH<7⑷电场下的离子的迁移:①强酸性溶液中,主要以正离子存在,向阴极移动。
②强碱性溶液中,主要以负离子存在,向阳极移动,③等电点时,负离子向阳极移动,正离子向阴极移动。
2.与亚硝酸反应用于定量分析中测定分子中的氨基的含量。
称为范斯莱克(V an Slyke)氨基测定法3.与甲醛作用用于封闭氨基,滴定羧基。
4.络合作用N、O可与金属离子配位5.受热分解:同羟基酸类似①α-氨基酸②β-氨基酸③γ、δ-氨基酸④δ以上氨基酸6.与茚三酮反应:α-氨基酸的性质,现象:加热后,可生成蓝紫色物质。
7.失羧作用:小心加热,可以失去CO2得到胺第二节多肽一、肽:分子间氨基与羧基失水,以酰胺键相连,形成的化合物。
汪版 有机 第15 章氨基酸
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(5) 羧基的反应 氨基酸的羧基,也具有羧基的一般性质,能发生酯化、 成酐、成酰胺等反应。 α-氨基酸可以用一般的方法酯化。
C6H5CH2OH HCl,Δ
C6H5CH2CHCOO NH3+
-
C6H5CH2CHCOOCH2C6H5 NH3Cl-
+
在合成蛋白质时,常用引入苄酯基来保护羧基。
脱羧反应 将氨基酸缓缓加热或在高沸点溶剂中回流, 可以发生脱羧反应生成胺。
(1) α-氨基酸的物理性质 熔点:α-氨基酸都是高熔点固体,多数在熔化时分解。 因此,α-氨基酸的熔点不能作为鉴定的可靠物理常数。 甘氨酸:262℃(分解);酪氨酸:310℃(分解) 。
(2) 酸碱性 氨基酸既能和酸反应生成铵盐,也能和碱反应生成羧酸 盐,是两性化合物。
氨基酸分子中的羧基和氨基不是以游离状态存在的,而
与卤代烃及醛、酮的反应
•氨基具有亲核性,可与卤代烃(RX)及醛、酮作用。
NO 2 NO 2 R NO 2 NO 2 R
F + NH2 CH COOH
NH CH COOH
2,4-二硝基氟苯 (DNFB)
N-(2,4-二硝基苯基)氨基酸 显黄色,可用于氨 基酸的比色测定
此反应可用于识别多肽或蛋白质的N-端氨基酸
可以通过测定氨基酸的等电点来鉴别氨基酸。
课堂练习:
•下列氨基酸溶于水使之达到等电点应加酸还是加碱?
(1)赖氨酸
H2NCH2CH2CH2CH2CHCOOH NH2
等电点时pH>7,溶于水中使之达到等电点应当加碱 (2)甘氨酸 H2NCH2COOH 等电点时pH<7,溶于水中使之达到等电点应当加酸
(3)谷氨酸
Ser O
分子生物学第十五章 蛋白质的生物合成
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1.遗传密码种类:
• mRNA 分子有4种碱基:A、G、C、U,可组合成64个密 码子,其中61个分别代表20种不同氨基酸
• 遗传密码共有43=64种, 64: UAA、UAG、UGA 终止密码 61: AUG 起始密码 代表Met 60: 代表19种氨基酸
9
遗传密码表 第一碱基
(5/-端)
第二碱基
43
一、起始阶段
(一)原核生物翻译起始复合物的形成
参与的物质: 核糖体50S和30S大小两类亚基 mRNA 起始作用的fMet-tRNAfMet GTP供能 起始因子(IF1、IF2、IF3)
44
起始过程:
• 核糖体大小亚基解离 • 小亚基与mRNA结合:
16sRNA识别mRNA的SD序列
• fMet-tRNAfMet与mRNA起始密码子AUG结合 • 核糖体大小亚基形成起始复合物
tRNAphe Phe-tRNAphe
• 肽链起始和延长的甲硫氨酰-tRNA:
真核生物:起始: Met-tRNAiMet 延长: Met-tRNAMet
原核生物: 起始:fMet-tRNAfMet 延长:Met-tRNAMet
39
40
第三节 肽链的合成过程
41
整个翻译过程可分为 :
• 翻译的起始 • 翻译的延长 • 翻译的终止
tRNA反密码子 第1位碱基
mRNA密码子 第3位碱基
I
U
G AC
U, C, A A, G U, C U G
17
摆 动 配 对
32 1
U
123
18
• ⑤遗传密码的通用性
从原核生物到人类都共用同一套遗传密码,被称为遗传密码的通用性。 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。
氨基酸_多肽
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肽键的平面特征
15
15.5 蛋白质的结构 蛋白质也是由氨基酸以酰胺键形成的大分子化合物。 蛋白质与多肽并无严格的界线,通常是将相对分子量在 10000以上的多肽称为蛋白质。在10000以下的称为多肽。 蛋白质的结构可分为四级: 一级结构:氨基酸的连接顺序。 二级结构:肽链的的构象及通过链内或链间的氢键形 成的α-螺旋、β-折叠等结构。 三级结构:是指在二级结构基础上,肽链相互扭在一 起或卷曲成其他形状。
∆ R CH2NH2 + CO2 R CH COOH 或脱羧酶 NH2
8 脱羧和脱氨基反应
(CH3)2CHCH2CHCOOH + H2O NH2 酶 (CH3)2CHCH2CH2OH + CO2 + NH3
11
二 多肽和蛋白质
一个氨基酸分子的氨基与另一个氨基酸的羧基之间失 水形成的酰胺键称为肽键。
16
四级结构:是指由多条具有一、二、三级结构的肽链 通过非共价键连接起来的结构形式。
一 級 结 构
二 級 结 构
三 級 结 构
四 級 结 构
17
α-螺旋 多肽链中的各个肽平面围绕同一 轴旋转,形成螺旋结构,螺旋一 周,沿轴上升的距离即螺距为 0.54nm,含3.6个氨基酸残基;两 个氨基酸之间的距离为0.15nm; 肽链内形成氢键,氢键的取向几 乎与轴平行,第一个氨基酸残基 的酰胺基团的-CO基与第四个氨 基酸残基酰胺基团的-NH基形成 氢键。 蛋白质分子为右手α-螺旋。
6
2 与亚硝酸反应
R CH COOH + HNO2 NH2 R CH COOH + N2 + H2O OH
反应是定量进行的,可以根据放出氮气的量计算分子 中氨基的量。(范斯来克氨基测定法) 3 与醛反应
有机化学氨基酸、多肽、蛋白质
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6 种异构体 24种异构体
许多种氨基酸按照不同的排列顺序, 构成了自 然界中种类繁多的多肽和蛋白质。
命名多肽时以C-末端的氨基酸残基为母体, 由 N-端叫起, 依次称为某氨酰(基)某氨酸。
O
O
O
H2N CHC NH CH2C NH CHC OH
N-端
CH3
CH2
C-端
丙氨酸残基 甘氨酸残基 苯丙氨酸残基
利用蛋白质分子胶体颗粒大不能透过半透膜 的性质可将蛋白质分离提纯,这种方法称为透析 法(dialysis)。
(三)蛋白质的沉淀和变性
调节蛋白质溶液的pH值至等电点, 再加入适当的脱水剂除去蛋白质分子表 面的水化膜, 可使蛋白质分子聚集而从溶液中沉淀析出。
根据生成紫色化合物颜色的深浅程度,或根据放出
CO2气体的体积,可对 α-氨基酸 进行定量分析。 也常用于层析实验中氨基酸的显色。
第二节 肽肽ຫໍສະໝຸດ 氨基酸残基之间彼此通过酰胺键 (肽键)连 接而成的一类化合物。其通式为:
RO
R’ O
H2N C-C-OH + H N C-C-OH
H
HH
A氨m基ino酸acid
第十四章 氨基酸、蛋白质
第一节 氨基酸
一、氨基酸的分类、命名和构型
氨基酸的结构特点
①都是α-氨基酸(脯氨酸是
α–亚氨基酸); H N
COOH H
R CH COO- 内盐
NH3+
偶极离子
②除甘氨酸外,都是L-氨基酸(左旋);
③各氨基酸侧链R基团不同,氨基酸结构和性质有差异
1、分类
据化学结构:
任何一种蛋白质分子在天然状态下均具有独特 而稳定的构象,这是蛋白质分子在结构上最显著的 特点。为了表示蛋白质分子不同层次的结构,常将 蛋白质分子结构分为一级、二级、三级和四级。一 级结构又称为初级结构或基本结构,二级结构以上 属于构象范畴,称为高级结构。
有机化学第四版完整课后答案
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目录第一章绪论 (1)第二章饱和烃 (2)第三章不饱和烃 (6)第四章环烃 (14)第五章旋光异构 (23)第六章卤代烃 (28)第七章波谱法在有机化学中的应用 (33)第八章醇酚醚 (43)第九章醛、酮、醌 (52)第十章羧酸及其衍生物 (63)第十一章取代酸 (71)第十二章含氮化合物 (77)第十三章含硫和含磷有机化合物 (85)第十四章碳水化合物 (88)第十五章氨基酸、多肽与蛋白质 (99)第十六章类脂化合物 (104)第十七章杂环化合物 (113)Fulin 湛师第一章 绪论1.1扼要归纳典型的以离子键形成的化合物与以共价键形成的化合物的物理性质。
答案:1.2 NaCl 与KBr 各1mol 溶于水中所得的溶液与NaBr 及KCl 各1mol 溶于水中所得溶液是否相同?如将CH 4及CCl 4各1mol 混在一起,与CHCl 3及CH 3Cl 各1mol 的混合物是否相同?为什么? 答案:NaCl 与KBr 各1mol 与NaBr 及KCl 各1mol 溶于水中所得溶液相同。
因为两者溶液中均为Na +,K +,Br -, Cl -离子各1mol 。
由于CH 4与CCl 4及CHCl 3与CH 3Cl 在水中是以分子状态存在,所以是两组不同的混合物。
1.3碳原子核外及氢原子核外各有几个电子?它们是怎样分布的?画出它们的轨道形状。
当四个氢原子与一个碳原子结合成甲烷(CH 4)时,碳原子核外有几个电子是用来与氢成键的?画出它们的轨道形状及甲烷分子的形状。
答案:C+624H CCH 4中C 中有4个电子与氢成键为SP 3杂化轨道,正四面体结构CH 4SP 3杂化2p y2p z2p x2sH1.4写出下列化合物的Lewis 电子式。
a.C 2H 4b.CH 3Clc.NH 3d.H 2Se.HNO 3f.HCHOg.H 3PO 4h.C 2H 6i.C 2H 2j.H 2SO 4 答案:a.C C H H HHCC HH HH或 b.H C H H c.H N HHd.H S He.H O NO f.O C H Hg.O POO H H Hh.H C C HHH H HO P O O H HH或i.H C C Hj.O S O HH OH H或1.5下列各化合物哪个有偶极矩?画出其方向。
第十六章 氨基酸、多肽和蛋白质
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OH R CH COOH +N2
+ H2O
若定量测定反应中所释放的N2的体积,即可计算出 氨基酸的含量,此方法称为van Slyke氨基氮测定法,常
用于氨基酸和多肽的定量分析。
第二节 肽
一、肽的结构和命名
肽是氨基酸残基之间彼此通过酰胺键相连而成的一 类化合物。 肽分子中的酰胺键又称为肽键(peptide bond)。 二肽可视为一分子氨基酸中的-COO―与另一分子氨基 酸中的NH3+脱水二成的。肽也是以两性离子的形式存在。
OH
H+
等电点 脱水
OH
H+
- - 带负电荷 脱水
OH
H
+
- - - -
(五)蛋白质的颜色反应 蛋白质分子内含有许多肽键和某些带有特殊基团的 氨基酸残基,可以与不同试剂产生特有的颜色反应,利 用此性质可鉴别蛋白质。
反应名称 试剂 颜色 作用基团 缩二脲反应 强碱、稀硫酸铜溶液 紫色或紫红色 肽键 茚三酮反应 稀茚三酮溶液 蓝紫色 氨基 蛋白黄反应 浓硝酸、再加碱 深黄色或橙红色 苯环 亚硝酰铁氢化钠 亚硝酰铁氢化钠溶液 红色 巯基
(五)氧化脱氨反应 氨基酸中的氨基能被 H2O2 或 KMnO4 等强氧化剂所氧 化,脱氨而生成α―酮酸。
[O]
R CH COOH NH2
R CH COOH + H2O NH
R C COOH + NH3 O
(六)氨基酸与亚硝酸的反应 氨基酸与亚硝酸作用,可定量释放氮气
+ NH3 R CH COO
+ H2NO2
使蛋白质发生沉淀的现象称为盐析(saltingout)。常用
的盐析剂有(NH4)2SO4、Na2SO4、NaCl和MgSO4等。
有机化学氨基酸
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氨基酸、多肽与蛋白质
Ⅰ、氨基酸
一、结构、分类和命名
1、结构:分子中含有氨基和羧基
R
H C NH2 COOH
2、分类:
(1)根据氨基与羧基的位置分类
H R C NH2 COOH
R
CH NH2
CH2 COOH
CH2 NH2
CH2
CH2 COOH
α-氨基酸
β-氨基酸
γ-氨基酸
中性氨基酸
(2) 碱性氨基酸
水蛭素多肽——抗血栓分子药理 1884年Haycraft首先发现新鲜医用水蛭Hirud medicinalis提取物含抗凝血物质,但直至1955年Mark wardt等从医用水蛭中才分离出水蛭素(hirudin,HV),共有 7种异构体。1984年Dodt首先测出其一级结构,确认HV是 一条含65个左右氨基酸的多肽。HV酶是血液凝固、止血过程 和血栓形成的中心酶之一。它专一性地水解纤维蛋白原上的 Agr-Gly键,使之转变成纤维蛋白;纤维蛋白相互作用会进一 步形成血栓。HV的2个结构域通过不同的机制分别和凝血酶 相互作用,抑制其活性。其C端长链通过和凝血酶的纤维蛋白 原识别部位结合,拮抗凝血酶对纤维蛋白原的识别。而HV的N 末端核心结构域通过和凝血酶的活性部位结合而抑制它的催 化活性。临床实验结果也表明,HV的抗栓作用不需要其它因 子的作用;又不会引起出血等副作用。其效果超过小分子肝 素。因此被认为是2010年前最强的可逆性凝血酶直接抑制剂。 全球约有20亿美元市场销售量。
+
O
C O
内盐(偶极离子或两性离子)
-
+
HC l
RCH
+
COOH
+
Cl
NH3
蛋白质的生物合成
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16
(二)氨基酰-tRNA合成酶 (aminoacyl-tRNA synthetase)
氨基酰-tRNA合成酶
氨基酸 + tRNA
氨基酰- tRNA
ATP
AMP+PPi
17
1. 氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA 都有高度特异性:每种氨基酸都只有1种氨基酰tRNA合成酶,生成特定的氨基酰-tRNA(aa-tRNA)
参与蛋白质生物合成的主要物质 蛋白质生物合成过程 翻译后的加工与靶向输送 蛋白质生物合成的抑制剂
3
第一节 参与蛋白质生物合成的 主要物质
蛋白质合成体系:20种氨基酸,mRNA、 tRNA、核蛋白体、酶和蛋白因子、无机离 子、ATP 、GTP 等。
4
一、mRNA:合成蛋白质பைடு நூலகம்模板
(一) mRNA是遗传信息的携带者 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为
14
密码子与反密码子除通过碱基互补结合外, 还具有摆动性,即密码子的第3位碱基与反 密码子的第1位碱基配对不严格,称为摆动 配对。
15
密码子、反密码子配对的摆动现象
tRNA反密码子 第1位碱基
I
U G AC
mRNA密码子 第3位碱基
U, C, A A, G U, C U G
密码子的第3位碱基发生突变时,并不影响tRNA带入 正确的氨基酸。
2.氨基酰-tRNA的表示方法:
Ser-tRNASer
Met-tRNAMet
真核生物起始因子辨认的Met-tRNAiMet 延长因子辨认Met-tRNAeMet
右上角字母可略
18
三、核糖体:合成蛋白质的场所
蛋白质和氨基酸
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那我们必须先熟悉 禽流感病毒电子图片 流感病毒的性质! 流感病毒的性质!
蛋白质的性质
1.溶解性 溶解性 有的蛋白质溶于水,如鸡蛋清; 有的蛋白质溶于水,如鸡蛋清;有的蛋白质难溶 与水,如丝、毛等。 与水,如丝、毛等。蛋白质溶于水或其他溶剂形 成的溶液是高分子溶液,它的分子较大, 成的溶液是高分子溶液,它的分子较大,已经接 近或等于胶粒的大小,故有丁达尔现象 丁达尔现象。 近或等于胶粒的大小,故有丁达尔现象。 2.具有两性 具有两性 蛋白质分子中存在着氨基和羧基,因此它与氨 蛋白质分子中存在着氨基和羧基, 基酸一样,具有两性。 基酸一样,具有两性。
实验1-2 实验
鸡 蛋 清 溶 液
加入
降低了蛋白质的溶解度 现象: 现象:
饱和Na 饱和 2SO4溶液
沉淀析出 沉淀溶
: 向蛋白质溶液中加入某些浓的无机盐溶液 向蛋白质溶液中加入某些浓 ( Na2SO4 (NH4)2SO4 后,可以使蛋 白质凝聚而从溶液中析出的作用叫盐析 盐析。 白质凝聚而从溶液中析出的作用叫盐析。
以鸡蛋为例探讨蛋白质性质: 以鸡蛋为例探讨蛋白质性质: 列举其它例子探讨蛋白质性质: 列举其它例子探讨蛋白质性质:
(1)科学分析表明,蛋黄是富含脂肪的,但 科学分析表明,蛋黄是富含脂肪的, 科学分析表明 是我们吃鸡蛋时,一般感觉不到油腻感, 是我们吃鸡蛋时,一般感觉不到油腻感 但腌制成咸蛋后,煮熟蛋黄里却有油 煮熟蛋黄里却有油. 但腌制成咸蛋后 煮熟蛋黄里却有油 (2)煎蛋时 生鸡蛋受热会凝结。 煎蛋时,生鸡蛋受热会凝结 煎蛋时 生鸡蛋受热会凝结。 (3)家用消毒碗柜用紫外线来杀死细菌。 家用消毒碗柜用紫外线来杀死细菌。 家用消毒碗柜用紫外线来杀死细菌 (4)做实验时不小心手沾到弄 做实验时不小心手沾到弄HNO3,皮肤会 做实验时不小心手沾到弄 皮肤会 变黄. 变黄 (5)误食 误食CuSO4溶液会使人中毒。 溶液会使人中毒。 误食
高中化学竞赛【氨基酸 肽 蛋白质】生物分子

17
3 热脱水 α-氨基酸生成交酰胺
2 CH3CHCO2H
- H2O
NH2
O
H3C
*
NH
HN
*
CH3
O
2, 5-二嗪哌酮
18
HO2CCH2CH2CHCO2- -H2O +NH2
谷氨酸
O
+NH2
CO2-
焦谷氨酸
19
氨基酸的特殊性质
1 等电点 (Isoelectric Point, IP)
氨基酸以两性离子状态 (等电状态) 存在 时溶液的 pH值为该氨基酸的等电点 (IP)。
5
构型:D / L
CO2H H2N H
R
L-
CHO HO H
CH3
L-甘油醛
6
NH2CH2CO2H
甘氨酸 Glycine
Gly
CH3-CH-CO2+ NH3
丙氨酸 Alanine
Ala
7
酪氨酸 Tyr Tyrosine
HO2C(CH2)2-CH-CO2+NH3
谷氨酸 Glu Glutamic Acid
O
O
(CH3)3COCCl (CH3)3COCN3
O (CH3)3COC-
t-Butoxycarbonyl
BOC
催化氢化和稀碱都不能除去 BOC, 但可用温和的酸性水解法除去。
49
2 羧基的保护 成酯
甲酯 苯甲酯 叔丁酯
去保护:碱性水解
去保护:H2/Pd 去保护:CF3CO2H, HBr, AcOH 水解
3
§15.1 氨基酸 Amino Acids
组成蛋白质的氨基酸有二十种,其中八种 是必须氨基酸。
有机化学第15章氨基酸多肽与蛋白质

H+ 水解 105oC
NHCH 2 CN H C H C NHCHCOH CH 3 CH 2 C 6 H 5 NO 2
DNFB-Gly-Ala-Phe
O O 2N NH CH 2 COH NO 2 O O + H 2 N CHC O H + H 2 NC HCOH CH 3 CH 2 C 6 H 5
甜菜碱
存在于多种蛋白性的动物保护组织(如毛发、角、指甲)中,通过氧化还 NH 2 原而相互转化。
-2 H 2 H SC H 2C H C O O H 2H NH2 SC H 2C H C O O H NH 2 SC H 2C H C H 2O O H
半胱氨酸
胱氨酸
3. 色氨酸
N H
C H 2C H C O O H NH2
R CH NH2 CH2 COOH R CH CH COOH
β-氨基酸受热失氨形成α, β-不饱和酸
R CH NH2 CH 2 C H 2CO O H R HC HN
H2 C CH2 + H O 2 C O
γ -氨基酸受热分子内氨基与羧基失水形成内酰胺(五元环内酰胺)
H2 C R CH NH2 CH2 CH2 C H 2C O O H HN C O CH 2 R HC CH 2
一 氨基的保护
1. 用氯代甲酸苯甲酯(或称苯甲氧基甲酰氯)保护
O
C6H5CH2OH+COCl2(光气)
C 6 H 5 CH 2 OCCl
Benzoxycarbonyl(简写Cbz)
反应过程:
+NH 3CH2CO2 -
O
C 6 H 5 CH 2 OCCl
O C 6 H 5 CH 2 OC-N H C H 2 C O O
蛋白质和多肽的氨基酸序列分析
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虽然多肽的氨基酸组成分析已向更灵 更精确、 敏、更精确、更快速以及自动化方向发展 和改进,但还没有一种单独适用于所有残 和改进,但还没有一种单独适用于所有残 基的,并且能在水解液中定量回收的水解 方法出现,很多因素如温度、时间、水解 方法出现,很多因素如温度、时间、 试剂、添加剂、 试剂、添加剂、水解方法等对水解的完全 程度均有影响。 程度均有影响。 • 下面主要对一些常用的水解方法作简要介 绍。
引言
测定蛋白质的一级结构前的准备工作
样品纯度必须>97%以上; 纯度必须>97%以上 1. 样品纯度必须>97%以上; 聚丙烯酰胺凝胶电泳要求一条带 测定蛋白质的相对分子质量 相对分子质量; 2. 测定蛋白质的相对分子质量; SDS-PAGE,凝胶过滤法, SDS-PAGE,凝胶过滤法,沉降系数法 测定蛋白质多肽链种类和数目 多肽链种类和数目; 3. 测定蛋白质多肽链种类和数目; 种类: SDS种类: SDS-PAGE 数目: 末端氨基酸残基摩尔数/ 数目:N末端氨基酸残基摩尔数/蛋白质摩尔数 测定蛋白质的氨基酸组成 氨基酸组成; 4. 测定蛋白质的氨基酸组成;并根据分子量计算每 种氨基酸的个数; 种氨基酸的个数;
• 1、酸性水解
• 酸性水解是采用较多的一种水解方法,其中HCl是最 酸性水解是采用较多的一种水解方法,其中 是最 通用的水解剂。 通用的水解剂。 • 条件:6 mol/L HCI、真空、110℃,水解时间为 ~ 条件: 、真空、 ℃ 水解时间为20~ 24h。即可用于液相水解模式也可用于气相水解模式。 。即可用于液相水解模式也可用于气相水解模式。 • 损失:在该条件下,得到的氨基酸不消旋,但天冬酰 损失:在该条件下,得到的氨基酸不消旋, 胺和谷氨酰胺分别被完全水解为天冬氨酸和谷氨酸, 胺和谷氨酰胺分别被完全水解为天冬氨酸和谷氨酸, 色氨酸则被完全破坏, 色氨酸则被完全破坏,半胱氨酸不能从样品中直中痕量杂质所破坏,丝氨酸 和苏氨酸被部分水解,损失分别为10%和5%。 和苏氨酸被部分水解,损失分别为 和 。
有机化学课后习题参考答案完整版(汪小兰第四版)
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目次之袁州冬雪创作第一章绪论0第二章饱和烃1第三章不饱和烃5第四章环烃13第五章旋光异构21第六章卤代烃26第七章波谱法在有机化学中的应用31第八章醇酚醚41第九章醛、酮、醌50第十章羧酸及其衍生物61第十一章取代酸68第十二章含氮化合物74第十三章含硫和含磷有机化合物82第十四章碳水化合物85第十五章氨基酸、多肽与蛋白质96第十六章类脂化合物101第十七章杂环化合物109Fulin 湛师第一章 绪论1.1扼要归纳典型的以离子键形成的化合物与以共价键形成的化合物的物感性质. 答案:1.2 NaCl 相同?如将CH4及CCl4各1mol 混在一起,与CHCl3及CH3Cl 各1mol 的混合物是否相同?为什么? 答案:NaCl 与KBr 各1mol 与NaBr 及KCl 各1mol 溶于水中所得溶液相同.因为二者溶液中均为Na+,K+,Br -, Cl -离子各1mol.由于CH4与CCl4及CHCl3与CH3Cl 在水中是以分子状态存在,所以是两组分歧的混合物.1.3碳原子核外及氢原子核外各有几个电子?它们是怎样分布的?画出它们的轨道形状.当四个氢原子与一个碳原子连系成甲烷(CH4)时,碳原子核外有几个电子是用来与氢成键的?画出它们的轨道形状及甲烷分子的形状. 答案:C+624HCCH 4中C 中有4个电子与氢成键为SP 3杂化轨道,正四面体结构CH 4SP 3杂化2py2p z2p x2sH1.4写出下列化合物的Lewis 电子式.答案:a.C C H H H HCC HH HH 或 b.H C H H c.H N H Hd.H S H e.H O NOf.OC H Hg.O P OO O H H Hh.H C C HHH H HO P O O H HH或i.H C C Hj.O S O HH OOH H或1.5下列各化合物哪个有偶极矩?画出其方向.答案:b.ClClc.HBrd.HCe.H 3COHH 3COCH 3f.1.6 根据S 与O 的电负性不同,H2O 与H2S 相比,哪个有较强的偶极-偶极作用力或氢键? 答案:电负性O>S,H2O 与H2S 相比,H2O 有较强的偶极作用及氢键. 1.7 下列分子中那些可以形成氢键?a.H2b. CH3CH3c. SiH4d. CH3NH2e. CH3CH2OHf. CH3OCH3 答案:1.8 醋酸分子式为CH3COOH ,它是否能溶于水?为什么?答案:能溶于水,因为含有C=O 和OH 两种极性基团,根据相似相容原理,可以溶于极性水.第二章饱和烃2.1 卷心菜叶概况的蜡质中含有29个碳的直链烷烃,写出其分子式.答案:C29H602.2 用系统定名法(如果可以的话,同时用普通定名法)定名下列化合物,并指出(c)和(d)中各碳原子的级数.a.CH 3(CH 2)3CH(CH 2)3CH 3C(CH 3)2CH 2CH(CH 3)2 b.C H H C HH CH HH C H HC H H CHHH c.CH 322CH 3)2CH 23d.CH 3CH 2CH CH 2CH 3CHCH CH 2CH 2CH 3CH 3CH 3e.C CH 3H 3C CH 3Hf.(CH 3)4Cg.CH 3CHCH 2CH 3C 2H 5h.(CH 3)2CHCH 2CH 2CH(C 2H 5)21。
15氨基酸.

氨基酸、
多肽和蛋白质
第十五章 氨基酸、多肽和蛋白质 学习指导 目的
1、掌握氨基酸的结构和主要化学性质; 2、熟悉重要的组成蛋白质的氨基酸。
重点
氨基酸的结构、两性电离、等电点及主要化学性质
氨基酸是蛋白质的基本组成单位,是人体 不可缺少的物质。
氨基酸的化学合成1850年就已实现,但氨基 酸的发酵法生产在一百年后的1957年才得以 实现用糖类(淀粉)发酵生产谷氨酸。
R CH COOH NH 3
注: 1°等电点为电中性而不是酸碱性的中性(即 pH=7),在溶液中加入电极时其电荷迁移为零。 中性氨基酸 酸性氨基酸 碱性氨基酸 pI = 4.8~6.3 pI = 2.7~3.2 pI = 7.6~10.8
2°等电点时,偶极离子在水中的溶解度最小, 易结晶析出。
氨基酸的存在形式、电离方向和程度,均取决于 溶液的酸碱性即pH值: 1、当加入 H 时,平衡向左移动,有利于碱 式电离,酸式电离受到抑制,氨基酸主要以阳离子形 ﹢ 式存在,电泳向负极移动; 2、当加入OH 时,平衡向右移动,有利于酸 ﹣ 式电离,碱式电离受到抑制,氨基酸主要以阴离子形 式存在,电泳向正极移动; 3、当调节pH在某一特定值时,使其酸式电离 与碱式电离达到平衡,使得羧基与氨基的离子化程度 相等,氨基酸主要以两性离子的形式存在——等电状 态。
二、α-氨基酸的物理性质
1、α-氨基酸一般为无色晶体。 2、熔点比相应的羧酸或胺类要高,一般在 230~300℃。 3、除甘氨酸外,其它的α-氨基酸都有旋光性。 4、L-α-氨基酸一般有甜味,也有无味、苦味的。
三、α-氨基酸的化学性质
氨基酸分子中既含有氨基(-NH2)又含 有羧基(-COOH),因此它具有羧酸和胺类 化合物的性质;同时,由于氨基与羧基之间 相互影响及分子中烃基(-R)的某些特殊结 构,又显示出一些特殊的性质。
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脂肪族氨基 酸 据R基结 构不同分类 芳香族氨 基酸 基 杂环族 氨基酸
中 氨 酸( 一 基 羧 ) 性 基 含 氨 一 基 氨 和 基 数 据 基 羧 的 目 性 基 ( 一 基 羧 ) 酸 氨 酸 含 氨 二 基 性 基 ( 二 基 羧 ) 碱 氨 酸 含 氨 一 基
养 角 分 从营 的 度 类 需 基 --动 体 要 但 必 氨 酸 动物 需 , 体内不 合成 合 不足 能 和 成 必 氨 酸 体 非 需 基 --体 能 成 不必由 物供 内 合 , 食 给
H3N
H CH2OH
H3N
H
H3N
H CH2SH
Serine (Ser) 氨 丝 酸 COO+
CHOH CH3 Threonine (Thr) 氨 苏 酸* COO+
Cysteine (Cys) 胱 酸 半 氨 COO+
H3N
H CH2 CH2SCH3
H3N
H CH2 CONH2
H3N
H
Methionine (M et) 硫 酸 蛋 酸 * 甲 氨 ( 氨 )
是生命体中含量最丰富、 蛋白质是生命体中含量最丰富、功能最重 要的一类生物大分子, 要的一类生物大分子,是生物体的基本组成 物质。它存在于所有生物细胞中, 物质。它存在于所有生物细胞中,约占细胞 干重的50%以上。 50%以上 干重的50%以上。 蛋白质的主要功能: 蛋白质的主要功能:
催化功能——绝大多数酶是由蛋白质组成的。 绝大多数酶是由蛋白质组成的。 ◎ 催化功能 绝大多数酶是由蛋白质组成的 免疫防御作用——生物体能产生蛋白质抗体。 生物体能产生蛋白质抗体。 ◎ 免疫防御作用 生物体能产生蛋白质抗体 转运功能(物质交换) ◎ 转运功能(物质交换) 调控功能(如许多激素) ◎ 调控功能(如许多激素) ◎ 形成生物体的基本形体结构 ◎ 拉伸和收缩功能 ◎ 神经剌激的产生和传导
多肽结构的测定 多肽的合成
Ⅲ
蛋白质 (Proteins )
☆ 蛋白质的含氮星平均为16%,即每g氮相当于6.25g蛋 蛋白质的含氮星平均为16%,即每g氮相当于6.25g蛋 16% 6.25g 白质,若测出样品中N含量则可求出蛋白质含量。 白质,若测出样品中N含量则可求出蛋白质含量。 注意:不同样品换算系数不同。 注意:不同样品换算系数不同。 蛋白质有两个主要的生物功能 生物功能: ☆ 蛋白质有两个主要的生物功能: · 作为动物组织的结构材料(纤维状蛋白)如皮肤、头发 作为动物组织的结构材料 纤维状蛋白)如皮肤、 结构材料( 指甲、羊毛、 羽毛等。 、指甲、羊毛、角、羽毛等。 球状蛋白质( · 维持和调节生命过程,这类蛋白属于球状蛋白质(溶于 维持和调节生命过程,这类蛋白属于球状蛋白质 )。如各种酶 激素、抗体、血红蛋白。 如各种酶、 水)。如各种酶、激素、抗体、血红蛋白。 一、蛋白质的分类 (classification of Proteins )
Asparagine (Asn) 酰 门冬 胺
CH2 CH2 CONH2 Glutamine (Gln) 氨 胺 谷 酰
COO+H N 3
COO+
H CH2 COO-
H3N
H CH2 CH2 COO-
Aspartate (Asp) 酸 门冬氨 COO+
Glutamate(Glu) 谷氨酸
COO+
H3N
+
H2N
Isoleucine (Ile) 异 氨 * 亮 酸
COO+
COO+
COO+
H3N
H CH2
H3N
H CH2
H3N
H CH2
Phenylalanine (Phe) 丙 酸* 苯 氨 COO+
OH Tyrosine (Tyr) 氨 酪 酸 COO+
N H Tryptophan (Try) 氨 色 酸 COO+
丙氨酸(pI=6.02)、精氨酸(pI=10.76)、 丙氨酸( ) 精氨酸( ) 天冬氨酸( 天冬氨酸(pI=2.98)的混合液中 为6.00,将 )的混合液中pH为 , 天冬氨酸 此混合液置于电场中,其中____移向正极, ____移向正极 此混合液置于电场中,其中____移向正极, 精氨酸 丙氨酸 ____移向负极,___在两极之间 移向负极,___在两极之间。 ____移向负极,___在两极之间。
H CH2 CH2 CH2 CH2 NH3+
H3N
H CH2 CH2 CH2 NH COO+
H3N H2C
H
guanidino C NH2+ NH2 Arginine (Arg) 精氨酸
imidazole N
NH2+
Lysine (Lys) 赖氨酸 *
Histidine 组氨酸
氨基酸的构型( 氨基酸的构型( configuration of nucleic acids )
O O NH
H H
H3C CH
OH
HN C O
O O CH CH3 H3C CH HN
NH CH CH3 C O
HO
β-氨基酸的脱水(分子内) 氨基酸的脱水(分子内) 氨基酸的脱水
NH2 R CH CH2COOH R CH CHCOOH + NH3
γ-氨基酸和 氨基酸的脱水 氨基酸和δ-氨基酸的脱水 氨基酸和
大多数氨基酸相同 COOH
H2N C R H
α-C
侧链(每个氨基酸不同)
1.具有酸性的-COOH及碱性的 1.具有酸性的-COOH及碱性的-NH2,为两性电解质。 及碱性的-NH 为两性电解质。 2.如R≠H,则具有不对称碳原子,具有旋光性。 . ,则具有不对称碳原子,具有旋光性。
CHO HO C H H2N COOH C R H H COOH C R NH2
NH2 N CH2
此反应可测定氨基酸的含量,也称为氨基酸的甲醛滴定法。 此反应可测定氨基酸的含量,也称为氨基酸的甲醛滴定法。 甲醛滴定法
4.络合性能 .
R HC C O O N H2 H2 N Cu CH R O O C
5.氨基酸的受热反应 . α-氨基酸的脱水(分子间) 氨基酸的脱水(分子间) 氨基酸的脱水
氨基酸、 第十五章 氨基酸、多肽与蛋白质
(amino acids and polypeptide and proteins)
本章学习要求 1.熟练掌握氨基酸的化学性质 熟练掌握氨基酸的化学性质、 1.熟练掌握氨基酸的化学性质、肽的 结构、蛋白质的理化性质、DNA和 结构、蛋白质的理化性质、DNA和RNA 的组成; 的组成; 2.熟记几种常见氨基酸的结构和特 2.熟记几种常见氨基酸的结构和特 性。
RCHCOOH
NH2
OH H
RCHCOO
NH2
阴离 子
RCHCOO
NH3
两性 离子
pH < pI
pH = pI (等电点) 等电点)
pH > pI
等电点——调节其溶液至一定的 值时,使其成为在电 调节其溶液至一定的pH值时 等电点 调节其溶液至一定的 值时, 场中既不向阳极移动,也不向阴极移动的两性离子, 场中既不向阳极移动,也不向阴极移动的两性离子,此 时溶液的pH值 称为该氨基酸的等电点 等电点(isoelectric point, 时溶液的 值,称为该氨基酸的等电点 , 简写pI)。 简写 。 中性氨基酸的pI 之间) 中性氨基酸的 < 7(在5.0~6.3之间) ( 之间 酸性氨基酸的pI 之间) 酸性氨基酸的 < 7(在2.8~3.2之间) ( 之间 碱性氨基酸的pI 之间) 碱性氨基酸的 > 7(在7.6~10.8之间) ( 之间
自然界存在多种肽类物质,如胰岛素、脑啡肽、 自然界存在多种肽类物质,如胰岛素、脑啡肽、青 霉素等。 霉素等。
多肽链中含有游离氨基的一端以“ 端 表示; 多肽链中含有游离氨基的一端以“N-端”表示;含 有游离羧基的一端, 一般将N-端 端 表示,而且一般将 有游离羧基的一端,以“C-端”表示,而且一般将 端 放在左边, 端放在右边 例如: 端放在右边。 放在左边,C-端放在右边。例如:
R CH CH2 CH2 COOH NH2 R O N H γ 内 酰胺 CH2 H2C CH2 CH δ 内酰胺 C O NH + H2O R + H2O
H R C CH2 CH2 CH2 COOH NH2
6.与茚三酮反应 与茚三酮反应
O C C C O O C C C O H OH O OH OH O C
O HOOCCH NH2 CH2CH2 C NH CH CH2 S S CH2 HOOCCH NH2 CH2CH2 C O NH CH
O C NH CH2 COOH
C O
NH
CH2 COOH
氧化型谷胱甘肽Glutathione(GS—SG) ( 氧化型谷胱甘肽 )
[H] GS SG 2GSH [O]
一分子氨基酸的氨基与另一分子氨基酸的羧基可以 发生分子间的脱水缩合,并通过肽键 肽键( 发生分子间的脱水缩合,并通过肽键(peptide bond)结 ) 合成肽 合成肽 。
R CH COOH +
NH2 HN CH COOH H R' O R CH C NH CH COOH NH2 R' 肽键
+ H2O
H2N CH2(CH2)3CHCOOH NH2 氨 赖 酸 二 ( 胺 戊 胺 尸 ) Ba(OH)2 - CO2 H2N (CH2)5 NH2
8.失羧和失氨作用 .
(CH3)2CHCH2CHCOOH + H2O
NH2
酶
(CH3)2CHCH2CH2OH CO2 + NH3 +
多肽ห้องสมุดไป่ตู้polypeptide ) Ⅱ 多肽