菌物分类学研究中常见的物种概念
菌物的名词解释
菌物的名词解释菌物是生物界的一个大类，包括了真菌（Fungi）和细菌（Bacteria），它们的生物特征和生态功能使得它们在自然界和人类社会中扮演着重要的角色。
本文将分别对真菌和细菌进行解释。
真菌是一类生物，属于真核生物。
与植物和动物不同，真菌没有叶绿素，无法进行光合作用，因此无法自己合成有机物。
真菌的主要营养方式是通过分解有机物质来获取营养，这使得它们在生态系统中扮演着重要的分解者和循环者的角色。
真菌的细胞由真核细胞构成，细胞壁由纤维素和几丁质组成，这使得它们与植物和动物有所区别。
真菌能够以不同的形态存在，包括单细胞菌种和多细胞菌丝体，其中最为常见的是菌丝体。
真菌的菌丝体通常由单细胞菌核通过分裂产生，通过不断延伸和分枝形成复杂的菌丝网络。
菌丝的延伸速度可以达到每小时几个毫米，这使得真菌能够迅速占领营养资源。
菌丝体通常埋藏在地下、树木内部、腐烂物质中等，这些地方是真菌获取营养的重要场所。
真菌可以分泌一些特殊的酶，这些酶能够分解复杂的有机物质，使其变为可吸收的形式。
真菌的分解作用在自然界中是不可或缺的，它们能够帮助分解树叶、死木、动物尸体等有机物质，促进营养的循环。
同时，真菌也与植物共生，形成菌根，帮助植物吸收土壤中的养分。
真菌还能够与一些昆虫形成共生关系，如蚂蚁与菌圃真菌，它们互利共生，为彼此提供营养和保护。
细菌是一类无细胞核的微生物，属于原核生物。
细菌广泛存在于地球上的各种环境中，包括水体、土壤、人体等。
细菌的细胞结构相对较简单，通常由细胞壁、细胞膜和胞质构成。
细菌的细胞壁通常由肽聚糖和脂肪酸构成，不含有几丁质和纤维素。
细菌可通过分裂繁殖，繁殖速度非常快，如大肠杆菌每个细菌可以在20分钟内分裂成两个细菌。
细菌有着多样的代谢方式，可以根据不同的环境条件选择合适的代谢方式。
有些细菌是光合细菌，它们通过光合作用合成有机物质；而一些细菌是化学合成细菌，它们通过分解有机物质来获取能量。
此外，还有一些细菌是厌氧生活的，它们不需要氧气就能够存活。
菌物分类学
16s rRNA核苷酸序列分析步骤
提取 DNA ↓ PCR扩增16S rRNA基 因 ↓ PCR产物纯化 ↓ 16SrRNA基因序列测 定 ↓
相似性结果的一般判断： SAB≥97% 同种 SAB为85-97% 同属 SAB≤85 % 不同属
一、生物的界级分类学说
（一）两界系统 （二）三界系统 （三）四界系统 （四）五界系统 （五）六界系统 （六）三总界五界系统
生物界级学说发展的示意图
两界系统
1753年，瑞典博物学家林奈（Carl vov Linne）在其名著《植物种志》首先提出。
动物界 植物界
三界系统
1939年，Conard提出菌物界； 1860年，Hogg提出设立原始生物界； 1971年，Dodson提出菌界； 1866年，德国动物学家E.H.Haeckel建议三界系统。
系统发育树（phylogenetic tree）
概括各种生物间亲缘关系的树状分枝图， 分无根树和有根树
微生物的系统树 细菌（Bacteria） 古生菌（Archaea） 真核生物（Eukarya）
4. 微生物全基因组序列的测定
1996年，在633位科学家通力合作下，第一个 真核生物酿酒酵母基因组测序完成。 2002年粟酒裂殖酵母基因组测序完成。 2003年，第一个丝状真菌粗糙脉胞菌基因组测 序完成。 到2008年，在NCBI和其他网站已公布了80种真 菌的基因组序列。
DNA-DNA杂交（固相杂交法）
结论：
单链DNA（待测菌株） ↓
转硝酸纤维素膜 ↓
加入放射性标志参照菌DNA（单链） ↓
真菌分类学讲义第一章菌物的基本概念
主讲教师：林英任博士教授林英任，1951年11月生，男，汉族，安徽金寨人，中共党员，博士。
1974年毕业于安徽农学院林学系，并留校任教。
1998年于东北林业大学研究生部毕业，获博士学位。
历任安徽农学院助教、讲师、副教授。
现任安徽农业大学教授，森林保护学、微生物学专业博士生导师。
兼任中国菌物学会理事，《菌物研究》期刊编委，安徽省植物病理学会常务理事。
获省首届青年科技奖，被遴选为省高校中青年学科带头人培养对象，省首批跨世纪学术和技术带头人，享受省政府特殊津贴。
林英任教授主要从事林木病理学、菌物学的教学与科研工作。
主讲“森林（经济林、园林植物）病理学”、“林病流行与治理”、“高级菌物学”、“拉丁文”等课程。
指导硕士、博士研究生多名。
先后主持“中国真菌志·斑痣盘菌目卷研编”、”斑痣盘菌科及相关类群分子系统学研究”等国家自然科学基金项目4项和“安徽盘菌资源及其经济重要性研究”等省级科研项目10余项。
在国内外学术刊物上发表论文60余篇，主要有“中国斑痣盘菌目分类研究”、“盘菌纲一新属——新齿裂菌属”、“国内新见的木本药用植物病害”、“中华猕猴桃病害及其防治”等。
合著《牯牛降科学考察集》、《果树常见病虫害防治》等。
曾获国家农业科技推广奖、省自然科学二等奖、省科技进步三等奖（2项）、省高校科技进步一等奖和校“九五”科技先进个人一等奖。
课程内容《高级菌物分类学》以Ainsworth et al.（1973）的分类体系为基本框架，同时参考Hawksworth et al.（1995）和Kirk et al.（2001）的有关分类主张，系统讲授鞭毛菌、接合菌、子囊菌、担子菌和半知菌亚门及其下属各分类阶元的分类地位和鉴别特征。
此外对菌物的一般性状、植物病原菌的治理和病菌、害虫天敌及食药用菌的开发利用等情况作简要介绍。
旨在学生为识别、发掘、利用和改造菌物打下良好基础。
适用学科专业森林保护学、微生物学专业研究生。
章十 微生物的分类和鉴定
亚种以下的分类单元
亚种（subspeciers）：种的进一步细分，一般指其某 一民而稳定的特征与模式中不同的种常在种名、署名 的加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词； 变种（ variety）：容易引起混乱； 型 form：使用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已 作废； 类群（group）：没有分类地位非正式地指定一组具有 某些共同性状的生物； 菌株（strain）：表示任何由一个独立分离的单细胞繁 殖而成的纯种群体极其一切后代；实际上是一个微生 物达到遗传性纯的标志。 小种（race）：涵义较乱，在不同分支学科中由不同 涵义； 相（phase）：自然界存在的微生物交互变异的一定阶 段； 态（state）：通常指微生物的菌落变异状态。
《伯杰氏系统细菌学手册》
1st ed, 1984-1989, 分为4卷；是在《伯杰氏鉴定细菌 手册》 8th ed 的基础之上增加了大量的分子生物学资料。 但由于当时细菌系统发育的资料仍较零碎，所以有相当一 部分类群未能科目级别分类，从实际需要出发，主要根据 表型特征将整个原核生物分为33组，33个组的划分见表。 国际上最为流行的版本。微生物分类技术和学术理论的发 展促进了生物科学的进步。 2ed ed, 2000开始出版，分为5卷，提出完整的系统分类， 将原核生物分为：古细菌界（2门、5组、8纲、11目、17科、 63属、208种）；细菌界：（16门、26组、27纲、62目、 163科、814属、4727种）；反映了人们对生物系统发育的 深刻认识。
微 生 物 类 群 介 绍
微生物类群介绍微生物（Microorganism/Microbe）是指一群个体微小、结构简单、低等生物的统称。
它不是一个分类学上的专门名词，而是指所有肉眼看不见或看不清楚的微小生物的总称。
虽然对于微生物的认识晚于植物和动物，但是人们和微生物打交道已有8000多年的历史了，当时人们是不自觉地利用微生物，如大家熟知的发面和酿酒。
在生活中，人们与微生物的关系非常密切，如用谷物、大豆可以做出面包、酒精和酱油；通过发酵可以大量生产抗生素、味精和酶制剂；农业上利用豆科植物轮作可以提高肥力；衣服发霉、食品腐败；人类和其他动植物传染病的流行等，所有这些都是微生物作用的结果。
说到微生物的类群，首先要知道生物的界级划分研究简史。
生物的分界是随着科学发展的水平在不断地改变及深化的。
在林奈的时代，对生物的观察仅限于肉眼所能看到的特征及区别，那时生物仅分为植物界（Plantae）与动物界（Animalia）两大界。
到19世纪中叶，霍洛（Hogg，1860）等提出了生物的三界系统，即原生生物界（Protista）、植物界与动物界，其中原生生物界包括单细胞动物、藻类及真菌，他们的三界系统反映了单细胞生物与多细胞生物的区别。
1959年魏塔克（Whittaker）提出了四界系统，即原生生物界、真菌界（Fungi）、植物界与动物界。
其中将原生生物界的真菌独立成为了一界。
1974年李代尔（Leedale）又提出了原核界（Monera），其中包含细菌及蓝细菌，仍为四界系统，即原核界、植物界、真菌界及动物界。
直到1969年，魏塔克将分类系统进行了完善，提出了五界系统：真菌界、原核生物界、原生生物界、植物界、动物界。
按照从高到低的顺序，依次有界、门、纲、目、科、属、种7个单元。
二十世纪70年代，伍斯（Woese）根据超微结构和生物化学，尤其是分子生物学证据，将自然界的整个生物被重新划归三大超界，即原核的古菌、原核的细菌和全部真核生物。
真核生物超界被划分为五界，即动物界、管毛生物界（Chromista）、真菌界、植物界及原生动物界。
界门纲目科属种
生物分类学是研究生物分类的方法和原理的生物学分支。
分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分。
瑞典生物学家林奈将生物命名后，而后的生物学家才用域、界( Kingdom）、门( Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科( Family)、属( Genus)、种(Species)加以分类。
最上层的界，由怀塔克所提出的五界，比较多人接受，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。
从最上层的“界”开始到“种”，愈往下层则被归属的生物之间特征愈相近。
人类属于：界：动物界门：脊索动物门亚门：脊椎动物亚门纲：哺乳纲亚纲：真兽亚纲目：灵长目科：人科属：人属种：智人种在八年级生物-下人教版中出现中文名界（域）、门、纲、目、科、属、种外文名Kingdom、Phylum、Class、Order、Family、Genus、Species隶属生物分类学界有两界、三界、四界、五界之分门门隶于界纲纲隶于门目目隶于纲科科隶于目，近缘的属归合为科属属隶于科，近缘的种归合为属种种（物种）是基本单元目录1基本介绍2分类系统▪两界▪三界▪四界▪五界▪两总界五界▪六界3生命历史4具体分类▪藻类植物（Algae）▪地衣植物门（Lichenes）▪3苔藓植物门（Bryophyta）▪蕨类植物门(Pteridophyta)▪种子植物门（Spemaiophyla）1基本介绍编辑当前最流行的分类是一种五界系统，分别为原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及动物界。
五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。
它没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位不明之故。
它的原生生物界内容庞杂，包括全部原生动物和红藻、褐藻、绿藻以外的其他真核藻类，包括了不同的动物和植物。
例举：斑马鱼的界门纲目科属种：动物界，脊椎动物门，硬骨鱼纲，鲤形目，鲤科，短担尼鱼属。
2分类系统编辑两界瑞典生物学家林奈(1707～1778），注意到周围的生物有固着不动和自养型的植物，也有自由瑞典植物学家林奈瑞典植物学家林奈行动和异养型的动物。
2-2菌物的分类及主要类群
• 命名起点：《国际植物命名法规》（1981） 菌物和植物的命名起点都是 1753年5月1日。
• 合格发表：有拉丁文描述；清晰的照片或 绘图；发表在正式的刊物上；必需保存模 式标本（type）。
• 优先权：第一个发表的具有优先权，其它 以后发表的名称都是该名称的异名 （synonym）。
真菌界分类检索表
1．原生质团或假原生质团存在 粘菌门 1．原生质团或假原生质团缺乏2（真菌门） 2. 有能动细胞（游动孢子），有性孢子为卵孢子
鞭毛菌亚门 2．无能动细胞 3 3．具有性阶段 4 3. 缺有性阶段 半知菌亚门 4．有性孢子为子囊孢子 子囊菌亚门 4．有性孢子为接合孢子接合菌亚门 4．有性孢子为担孢子担子菌亚门
• 学名需改动，建立新组合时，将原定名人 用括号括起来。
• 一种菌物只能有一个学名，对于半知菌 的允许有性阶段和无性阶段采用不同的 学名。
• 学名用拉丁文书写，采用双名法命名： 属名+种加词（+命名人）
如：Puccinia graminis Pers.
Puccinia recondida Rob. et. Desm.
型：Puccinia graminis f.sp.tritici。
变种(variety，var. ):不同群体有形态差异和对寄主科\属的选择性
禾柄锈菌(Puccinia graminis)
小麦禾柄锈菌(P.graminis var. tritici) 燕麦禾柄锈菌(P.graminis var. avenae)
专化型(forma specialis, f.sp.)不同群体无形态差异,对寄主科\属具选择性
尖镰孢菌(Fusarium oxysporum)
菌类的名词解释
菌类的名词解释菌类是生物学中一个重要的分类群，它们广泛存在于我们周围的自然环境中。
本文将对菌类的定义、分类、生态功能和与人类生活的关系进行解释。
一、菌类的定义菌类是指真菌界中的一类生物，包括了真菌界除霜菌门外的所有有孢子且无色素的真菌。
它们与植物和动物一样，属于生物界中的一个独立门派。
二、菌类的分类菌类根据其生活方式和结构特征，可以分为以下几类：1. 子囊菌：它们形成子囊，孢子在子囊内形成和存放，如黑曲菌和苦味柱菌。
2. 担子菌：它们结构特点是在菌盖的裸露表面形成担子，孢子自担子上排成排列，如蘑菇和香菇。
3. 杯菌：它们形态呈杯状，孢子在杯内或杯外形成和存放，如杯状地衣菌和茶杯菌。
4. 地衣菌：它们与藻类共生，形成特殊结构的地衣体，如灰袋地衣菌和硅袋地衣菌。
5. 球菌：它们呈球状或卵圆状，如猴头菌和球孢菌。
三、菌类的生态功能菌类在生态系统中扮演着重要的角色，具有以下几点生态功能：1. 分解和循环有机物质：菌类能够分解和降解植物、动物以及其他真菌的残骸，使有机物质转化为一些可被其他生物利用的形式。
2. 与植物的共生关系：菌根真菌能与植物形成菌根，帮助植物吸收土壤中的养分，同时植物提供菌根真菌所需的碳。
3. 生物防治和消解污染：某些菌类具有抑制或消灭病原微生物的能力，因此被广泛应用于农业生物防治和环境治理中。
4. 生物多样性维护：菌类是生物多样性的重要组成部分，保护和研究菌类有助于维护生态平衡和保护物种多样性。
四、菌类与人类生活的关系菌类对人类生活有着广泛的影响和应用：1. 食品和调味品：许多食用菌如蘑菇、松露和木耳被广泛应用于烹饪中，不仅丰富了菜品的口感，还富含营养成分。
2. 药物和药物研发：许多药物的原料来自菌类，如青霉素和利巴韦林等抗生素。
此外，菌类还被用于药物研发和生物技术领域。
3. 环境修复和生态工程：某些菌类具有吸附和降解有毒物质的能力，可以应用于工业废水和土壤污染的修复。
4. 核电站安全：菌类可以吸附和减少放射性物质的浓度，因此在核电站的环境监测和处理中具有重要作用。
第二章菌物分类学
动物界 植物界原生生物界 原核来自物界真菌界六界系统
1949年，Jahn提出后生动物界、后生植物界、真 菌界、原生生物界、原核生物界和病毒界； 1977年，我国王大耜也提出病毒界； 1996年，美国的P.H.Raven等提出六界系统。
动物界 植物界
原生生物界 真菌界
真细菌界 古细菌界
八界系统
Cavaliver-Smith （ 1981 ， 1988 ） 提 出 八 界 系统，1995年《真菌字典》（第八版）接受 了八个界的系统： 原核生物界、原生动物界、胆藻界、真菌界、 眼虫动物界、藻物界、动物界、绿色植物界。
特点： 亲缘关系相近的种，其GC比接近； GC比差距很大的微生物，其亲缘关系必然较远； GC比是建立新分类单元的可靠指标。
2. 核酸分子杂交法
此法是测定核酸分子同源程度和不同物种 间亲缘关系的有效手段。
适用范围：DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA
具体方法：固相杂交法
DNA-DNA分子杂交测定核酸同源性的原理
系统发育树（phylogenetic tree）
概括各种生物间亲缘关系的树状分枝图， 分无根树和有根树
微生物的系统树 细菌（Bacteria） 古生菌（Archaea） 真核生物（Eukarya）
4. 微生物全基因组序列的测定
1996年，在633位科学家通力合作下，第一个 真核生物酿酒酵母基因组测序完成。 2002年粟酒裂殖酵母基因组测序完成。 2003年，第一个丝状真菌粗糙脉胞菌基因组测 序完成。 到2008年，在NCBI和其他网站已公布了80种真 菌的基因组序列。
一、表型特征
• 1.形态 • 2.超微结构 • 3.生物化学 • 5.核酸序列 • 6.其他
菌物分类学
菌物分类学菌物分类学是生物分类学的一个分支，研究和描述真菌的分类、系统演化和多样性。
真菌是由真菌界中的不同种类组成的一类生物。
它们在生物界中一直被认为是一个独立的界别，与动植物不同。
历史背景菌物分类学的起源可以追溯到18世纪，当时科学家开始注意到真菌与其他生物的差异。
在过去的几个世纪里，许多科学家通过对真菌形态学、解剖学和遗传学特征的研究，不断完善了菌物分类系统。
分类原则菌物分类学的主要原则是基于真菌的形态学特征、生理学性质和生态习性来划分不同的分类单位。
真菌的分类主要基于以下几个层级：界、门、纲、目、科、属和种。
每个层级都有一组特定的特征和描述，以帮助科学家准确地确定和描述不同的真菌。
分类单元界真菌界是菌物分类学中最高的分类单位，包括所有真菌的物种。
真菌界的特点是它们是真核生物，并且没有细胞壁。
门在真菌界中，真菌按照其特定特征被划分为不同的门。
不同的门在形态学特征、生态习性和生物学特性上都有所不同。
纲门下的真菌根据其共同的特征进一步划分为纲。
不同的纲通常具有不同的形态、生长方式和生成孢子的方式。
目纲下的真菌根据更具体的特征被进一步划分为目。
目通常表示一类真菌的共同特征集合。
科目下的真菌根据更具体的特征被划分为科。
科主要用于描述不同菌株之间的相似性和差异性。
属科下的真菌根据其更具体的特征被划分为属。
属是描述真菌相对较小的分类单位，通常用于区分不同种属之间的特征差异。
种属下的真菌根据其特定的特征被划分为种。
种是描述真菌最小分类单位，表示一组具有相似形态和遗传特征的真菌个体。
分类方法菌物分类学使用了许多不同的方法来确定真菌的分类单位。
这些方法包括形态学研究、解剖学特征观察、遗传学分析、生态学特征比较以及分子系统演化研究。
形态学研究是最早也是最常用的分类方法之一。
通过观察菌丝的形态、菌盖、菌褶、菌蓋以及孢子等特征，科学家能够精确地描述不同真菌。
解剖学特征观察是通过对菌丝的内部结构进行观察和研究，以确定真菌的分类单位。
药用菌物学名词解释
药用菌物学名词解释初生菌丝/一级菌丝体/单核菌丝体：指由有性孢子萌发形成的菌丝。
次生菌丝/二级菌丝体/双核菌丝体：单核菌丝发育到一定阶段，由可亲和的单核菌丝之间进行质配，（核不结合）使细胞双核化，形成双核菌丝。
双核菌丝是担子菌类药用菌营养菌丝存在的主要形式。
药用菌：能治疗疾病，具有药用价值，并对人体有保健作用的一类菌物。
包括能形成个体较大的子实体或菌核结构的大型真菌如银耳、香菇；可以产生抗生素的抗生菌如青霉。
含药效成分，具有药用功能，但不共食用。
菌种分离：药用菌母种的分离，可分为孢子分离法、组织分离法以及基内菌丝分离法等。
孢子分离法：单孢分离法：是每次或每支试管只取一个担孢子，让它萌发成菌丝体来获得纯菌种的方法；多孢分离法：就是把许多孢子接种在同一培养基上，让它们萌发、自由交配来获得药用菌纯菌种的一种方法。
组织分离培养法：利用子实体内部组织，进行无性繁殖而获得母种的简便方法，即组织分离。
该法操作简便，菌丝生长发育快，品种特性易保存下来，特别是杂交育种后，优良菌株用组织分离法能使遗传特性稳定下来。
一级种：指最初分离选育出的菌种或经过转管培养的菌种。
二级种：指将一级菌种扩接到谷粒、木屑、棉籽壳等固体基质上或液体培养基上培养的菌种，习惯上称为原种。
三级种：直接用于生产栽培的菌种，也叫栽培种。
同宗接合：由同一孢子萌发成的两条初生菌丝进行交配，完成有性生殖过程。
即：一个担孢子萌发出来的单核的初生菌丝（无性区别）之间可以互相结合（同宗结合）而形成具有双核的二级菌丝。
异宗接合：同一孢子萌发的初生菌丝，不能自行交配（不亲和），只有两个不同交配型的担孢子萌发的初生菌丝才能互相交配，完成有性生殖过程的结合方式。
子座：子座是由拟薄壁组织和疏松组织构成的容纳子实体的褥座状结构。
如冬虫夏草，从菌核中长出有头部和柄部的子座，在头部周围着生有许多子囊壳。
子座的形状多样。
子囊：子囊菌类继其有性生殖而产生的囊状器官，通常在其中藏有8个子囊孢子。
菌种的等级
菌种的等级菌种是指在分类学上，基于形态特征、生长习性、生化反应及遗传基因等多方面因素进行鉴定而命名的具有系统学意义的一组菌株。
根据国际上的分类标准，菌种被分为五种等级：界、门、纲、目、科。
1. 界（Regnum）：是生物分类学上最高的等级，也是分类学的大分类范畴之一。
在生物界中，目前确定了六大界：动物界、植物界、真菌界、原生生物界、细菌界和古菌界。
其中，真菌界和细菌界包含了菌物的全部种类。
2. 门（Phylum）：在一个界内，根据生物的主要相似特征把生物分成若干门。
菌物中的门有两个，即真菌门和细菌门。
3. 纲（Classis）：在一个门内，根据生物的形态、生理生化特征，以及遗传亲缘关系等方面把生物分成若干纲。
真菌门中的纲有五个：接合菌纲、担子菌纲、壳菌纲、放线菌纲和黏菌纲，细菌门中的纲则有二十多个。
4. 目（Ordo）：在一个纲内，根据生物形态、生理生化特征，以及遗传亲缘关系等方面把生物分成若干目。
一些常见的真菌目包括：酵母菌目、产霉菌目、伞菌目和树霉菌目等。
常见的细菌目包括：芽孢杆菌目、厌氧菌目、嗜酸杆菌目和放线菌目等。
5. 科（Familia）：在一个目内，根据生物形态、生理生化特征，以及遗传亲缘关系等方面把生物分成若干科。
菌物中的科有很多，比如真菌门中的伞菌科、白腐菌科、炭角菌科等，细菌门中的芽孢杆菌科、大肠杆菌科、链霉菌科等。
总之，菌种的等级呈递减趋势，界最大，科最小。
不同等级的分类学意义和特点也不同。
每个等级内的分类单元，基于形态、生理生化和遗传关系等方面来分类。
这些分类的目的就是帮助人们更好地认识和研究各种生物，探索生命的奥秘。
菌物学名词解释
1、菌落：菌丝几乎沿着它的长度的任何一点都能发生分枝，由于分枝的不断产生而形成一个特征的圆形轮廓的菌落。
2、蘑菇圈：菌丝体通常是由一个中心向四周呈放射状延伸，外围的菌丝体生活力最强，而中心区的菌丝体相继老化死去，于是形成了天然的菌丝环，当产生担子果时，在地面上呈现了环形排列的蘑菇圈，3、内生菌丝：内生菌丝－菌丝体穿透寄主细胞，通过吸器来获取营养。
并不穿破寄主的质膜，而是一种简单的凹入。
4、侧泡复合体：单核的游动孢子内细胞核被一个大的核帽完全包住。
在孢子内含有一个线粒体，线粒体内侧紧靠细胞核，线粒体的外侧连有类脂体和微体。
线粒体—微体—类脂体外围由被称为背膜的双膜系统包围而构成侧泡复合体，侧泡复合体可分解类脂从而释放能量供鞭毛运动。
5、同宗配合：单一的核型含有完成表达所需的全部遗传信息，即同宗配合的交配因子存在于同一染色体上，不需要经过两个菌丝的交配就能完成性的生活史，这是雌雄同体并且自身可孕的结合。
6、孢子印：将伞菌的菌盖悬挂在白纸的上方，外罩钟罩，过几天后，在白纸就有由菌褶上落下的孢子形成的印迹，与菌褶同形，可作分类依据。
7、侧囊体：囊状体生在担子间，来源与担子相同，因着生位置不同而有多种名称，如生在菌褶边缘两侧的叫侧囊体8、协调的最适温度：在实际生产实践中，为了培育健壮的菌丝体，常常要求比菌丝体生长的最适温度略低2-3℃，这就是“协调的最适温度”。
10、外生菌根：外生菌根的菌丝体紧密地包裹在植物根系的表面，形成外拟薄壁膜层称为菌鞘(哈氏网)，不侵入根细胞内，仅在根细胞的间隙间蔓延，对植物体的营养索取量甚微，故与植物平安相处。
11、厚垣孢子：有些老的菌丝细胞能积累大量的脂肪类物质和与壁结合形成一层极厚的次生壁，这些细胞称为厚垣孢子。
12、网结现象：在菌落发育的后期，菌丝之间互相接触，在菌丝接触点相近的壁局部降解而发生菌丝的网结现象。
13、异宗配合：由单核孢子萌发形成的菌丝体不含有调节有性生殖所需的全部基因，两个同核菌丝(互补细胞)结合产生合子，它具有互补的全部的遗传因子。
界、门、纲、目、科、属、种的分类
被子植物门的特征
种子植物门的一类，具有花、果实和种子等生殖器官，以种子繁殖后代。 植物体一般由根、茎、叶、花、果实和种子等器官组成，形态多样。 被子植物门的植物通常有发达的纤维细胞，能够形成支持组织，使植物体直立。 被子植物门的植物在生长过程中，通常会形成木质部和韧皮部，以运输水分和养分。
黏菌门的特征
黏菌门是真菌界 的一门，与其他 真菌不同的是， 黏菌门的生物没 有细胞壁，因此 具有柔软的质地。
黏菌门的生物通 常在湿润的环境 中生长，例如在 腐烂的植物或动 物尸体上，它们 通过吸收营养来 生存。
黏菌门的生物在 繁殖时，会通过 产生孢子的方式 进行无性繁殖， 孢子可以随风飘 散，从而传播到 其他地方。
生态学研究：生物分类学可以帮助生态学家了解不同物种之间的相互关系，以及它们 在生态系统中的作用。
生物资源利用：通过生物分类学，可以更好地了解和利用生物资源，包括药用植物、 农作物和微生物等。
生物进化研究：生物分类学可以帮助我们更好地了解生物进化的历程和机制，从而更 好地理解生命的本质和起源。
生物多样性的保护和利用
哺乳纲动物具有高 度发达的繁殖和育 幼行为，能够提供 良好的生存环境和 营养物质，保证后 代的健康成长。
哺乳纲动物具有复 杂的社群行为和社 会结构，能够通过 各种方式进行交流 和协作，以适应不 同的生存环境。
双子叶植物纲的特征
种子植物门的一纲，又称木兰纲。
花部通常为5或4基数，偶有3基数 或6基数。
种的分类特点：种是最基本的分类单位，同一物种下的生物能够进行自然 繁殖并产生可育后代，具有相同的遗传特征和形态特征。
目、科、属、种的命名规则
目的命名通常以该类生物的某一显著特征或习性来命名，例如“蜻蜓目” 中的“蜻蜓”就是以该类生物的飞行方式来命名的。
菌类植物知识点总结
菌类植物知识点总结一、菌类植物的种类菌类植物主要分为真菌、原生生物和细菌。
其中真菌包括有线菌门、担子菌门、杯状菌门和卵菌门等。
原生生物包括高级原生生物和原生生物，细菌则包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌等种类。
1、真菌分类真菌是指一类可以进行异养或者自养生物，它们不属于动物也不属于植物，因而被单独划分为一类生物。
真菌主要分为子囊菌、担子菌、或子囊菌和担子菌等多种门，它们以不同的方式进行生殖，形成不同的孢子或者孢子囊。
例如酵母菌属于子囊菌门，大多数的蘑菇则属于担子菌门。
2、原生生物分类原生生物是一类主要包括古菌和原核生物的生物类群。
它们不同于真核生物，原生生物没有真正的细胞核和细胞器，其细胞结构简单，种类繁多。
原生生物中的高级原生生物和原生生物可以在不同的环境中生存，并且通过无性生殖进行繁殖传播。
3、细菌分类细菌是一类单细胞的微生物生物，大多数细菌都是革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌。
它们的细胞结构简单，通常只有一个细胞核和一条DNA链，没有真正的细胞核和细胞器。
细菌主要通过二分裂进行繁殖，而且可以在各种环境中生存，并且发挥着重要的生态作用。
二、菌类植物的结构菌类植物的结构与植物和动物都有所不同。
真菌的细胞壁多为壳多糖和蛋白质组成，细胞质内的细胞器如核糖体、线粒体和内质网等都不同于植物和动物的细胞器。
原生生物的细胞结构更加简单，不能进行细胞分化，而细菌则更加简单，没有真核细胞核和细胞器。
1、真菌的结构真菌的结构主要由菌丝、孢子和子实体组成。
菌丝是真菌主要的体细胞，其长度可以延伸、分枝，不断地在寄主体内或者在土壤中延伸生长。
菌丝体表面常常附着一些类似于根发状的吸器，用于从寄主或者土壤中获取营养。
孢子是真菌的主要繁殖体，分生在孢子囊或者孢子器中，孢子通过风或者昆虫等传播到新的环境中发芽生长。
子实体则是真菌形成的果体结构，其形态多种多样，有些是盘状、有些是杯状、有些则是伞状。
2、原生生物的结构原生生物的细胞结构非常简单，基本上就是一个裸核细胞或者真核细胞，内部没有真正的细胞器。
菌物的概念
菌物的概念菌物，亦称真菌，是一类生物，与植物和动物形成三大生物界。
它们是多细胞或单细胞的生物体，具有多种形态和功能，包括蘑菇、酵母、霉菌、细菌和子囊菌等多种类型。
菌物最初被认为是植物，但在19世纪后期，科学家们发现它们在形态和生理方面与动物更为相似。
菌物有一个细胞壁，其主要成分是几丁质和纤维素。
它们的细胞核具有真核膜，内含线粒体，但没有叶绿体。
菌物无法进行光合作用，因此必须通过吸取有机物和无机物来生存。
菌物有多种形态和功能。
其中一些是多细胞生命体，例如蘑菇和子囊菌，其体内有许多细胞，可以与周围的环境作用，获得养分并将其转化为生长所需的能量。
另一些是单细胞生物体，例如酵母，它们能够通过自我分裂进行繁殖和生长。
菌物的生态角色十分重要。
它们是自然界中的分解器和生物降解剂，能够将死亡的有机物分解为简单的物质，为土地肥沃和新生物体生长提供养分。
菌物还可以与其他生物形成共生关系。
一些菌物可以与树木形成菌根，为树木提供水分和营养，同时从树木中获得能量和有机物。
菌物还有着丰富的生物活性物质和药用价值。
青霉素是著名的抗生素药物，广泛用于治疗人类感染病。
一些蘑菇和真菌也被证明对肿瘤有治疗作用，它们的生物活性物质已经被开发成为一些抗肿瘤药物。
菌物是自然界中非常重要的生物体，它们在生态和医药领域具有广泛的应用前景。
随着科学技术的不断发展，菌物的分子和生理学研究也越来越深入，将有望为我们更好地理解菌物的生态和生物学角色奠定更加坚实的基础。
除了生态和医药领域，菌物还在食品工业中扮演着重要的角色。
在食品加工过程中，菌物可以作为发酵剂和营养补充剂使用，例如酸奶、酸菜、日式米饭和奶酪等。
菌物和其产生的酵素也可以用于食品添加剂和防腐剂的生产，如木聚糖醛和木质素酶等。
在生态方面，菌物也扮演着非常重要的角色。
菌物可以将土壤等有机物分解成能够被吸收利用的小分子，使之成为回收利用的富含养分的物质。
菌物还可以防止某些植物、动物和微生物染上疾病，使其生态环境更加稳定。
我国主栽食用菌茶薪菇的物种概念
Research paper研究论文22 May 2021, 40(5): 981-991 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Q DOI: 10.13346/j.mycosystema.200275我国主栽食用菌茶薪菇的物种概念刘祈猛1<2宋海燕3陈润秀〃陈明辉1<2翟志军〃周健平〃高扬胡殿明〇江西农业大学食药用菌工程技术研究中心江西南昌330045©江西农业大学生物科学与工程学院江西南昌330045©江西农业大学教育部作物生理生态与遗传育种重点实验室江西南昌330045摘要：茶薪菇是我国广泛栽培的一种食药用菌，由于其形态特征与柱状环伞十分相似，分类地位至今尚不明确。
本研究采用形态学和多基因分子系统发育分析相结合的方法，研究茶薪菇和柱状环伞的分类问题，结果表明：茶薪菇和柱状环伞是两个不同但亲缘关系密切的物种；在形态上，茶薪菇菌盖颜色浅褐色至深褐色，油茶味浓，菌环较薄易脱落，褶缘囊状体柱状、烧瓶状或纺锤状，易与柱状环伞相区别。
因此，提出了该种新组合-------茶薪薛Cyc/ocybe chox/'ngu，并指定了茶薪薛的新模式（凭证标本为HFJAU1332，保存于江西农业大学真菌标本馆）。
关键词：环伞属，田头菇属，柱状环伞复合群，分类，新模式[引用本文1刘祈猛，宋海燕，陈润秀，陈明辉，翟志军，周健平，高扬，胡殿明，2021.我国主栽食用菌茶薪菇的物种概 念.菌物学报，40(5): 981-991Liu QM, Song HY, Chen RX, Chen MH; Zhai ZJ, Zhou JP, Gao Y, Hu DM, 2021. Species concept of Cyclocybe chaxingu,an edible mushroom cultivated in China. Mycosystema, 40(5): 981-991基金项目：江西省科技厅青年基金重点项目（20192A C B L21017);江西省重点研发计划项目（20161BBF60078):江西省教育厅自然科学基金（Gj_ll90168)Supported by the Key Project of Jiangxi Provincial Department of Science and Technology Youth Fund (20192ACBL21017), the Key Research and Development Plan of Jiangxi Province (20161BBF60078), and Natural Science Foundation of Education Department of Jiangxi Province (GJJ190168).o Corresponding authors. E-mail: gaoyang@, hudianm ingl@ORCID: GAO Yang (0000-0002-7431-274X)Received: 2020-08-16, accepted: 2020-09-09Copyright ©2021 Institute of Microbiology, CAS. All rights reserved. |**********.cn Tel: +86-10-64807521 菌物学报981刘祈猛等/我国主栽食用菌茶薪菇的物种概念Research paperSpecies concept of Cyclocybe chaxingu,an edible mushroom cultivated in ChinaLIU Qi-Meng1,2SONG Hai-Yan3CHEN Run-Xiu1'2CHEN Ming-Hui1,2ZHAI Zhi-Jun1,2 ZHOU Jian-Ping1'2GAO Yang1,20 HU Dian-Ming1,20〇Bioengineering and Technological Research Centre for Edible and Medicinal Fungi, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, Jiangxi 330045, China©College of Bioscience and Bioengineering, Jiangxi Agricultural University, Nanchang, Jiangxi 330045, China©Key Laboratory of Crop Physiology, Ecology and Genetic Breeding (Jiangxi Agricultural University), Ministry of Education of the P.R. China, Nanchang, Jiangxi 330045, ChinaA b stra c t: Chaxingu,formerly named ss A grocybe choxingu,is an edible and medicinal mushroom widely cultivated in China.Its taxonomic identity is still ambiguous due to morphological similarity to Cyclocybe cylindracea.In this study,morphological characteristics and multiple genes'phylogenetic evidence were employed to delimit the species.Our data indicated that A. choxingu and C.cylindracea are two different but closely related species.Morphologically,A. chaxingu differs from C.cylindracea by its light brown to dark brown pileus with strongly oiltea camellia flavor,thin and easily broken annulus,and cylindrical to lageniform or cambiform cheilocystidia.A new combination,Cyclocybe choxingu was proposed,and a neotype was designated (HFJAU1332, deposited at Herbarium of Jiangxi Agricultural University).K e y w o rd s: Cyc/ocybe,厂ocybe,Cyc/ocybe cj///nd厂acea complex,taxonomy,neotypeA grocybe chaxingu N.L.Huang ^我国普遍栽培的一种食药用菌，与柱状环伞 Cyclocybe cylindroceo(DC.)Vizzini&Angelini^杨树燕 C.aeger/ta (V.Brig.)Vizzini和杨柳环 ^C.salicaceicola(Zhu L.Yang,M.Zang&X.X. Liu)Vizzini构成柱状环伞复合群C.cy//nc/racea complex，商品名为茶树菇（上海农业科学院 食用菌研究所1991;杨祝良等1993; Uhart et al.2008；Chen et ol.2012；Vizzini et ol. 2014)。
篮状菌属分类概述及三个中国新记录种
22 May 2021, 40(5): 1200-1215 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/QShort communication简报DOI: 10.13346/j.mycosystema.200288篮状菌属分类概述及三个中国新记录种陈晗1丁刚1 孙炳达2 张争1Q 王龙2° 陈娟1QO中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193©中国科学院微生物研究所北京100101摘要：篮状菌属真菌在空气、土壤中分布广泛，有些种类是重要的工业酶及色素生产菌，有些则可以引起食品的污染变质，还有些种是引起浅层或散播性感染的条件致病菌，如马尔尼菲篮状菌。
篮状菌属 在传统分类学上是一个有性型属，随着多相分类以及“一种真菌一个名称”概念的广泛普及，该属的概 念已经发生了较大的变化，目前全世界己报道177个种。
本文基于国内外最新研宄结果，对篮状菌属的 分类现状、种的范围和形态学区分等进行了概述，同时基于多基因系统发育树以及形态学观察描述了3个 中国新记录种 y a /a r o m y c e s a m a z o n e n s /s N. Yilmaz, L6pez-Quint., Va sco-Pal.、T. c h /o r o /o m a Visagie & K. J a co b s 和7". m/'nnesotens/s G u e v a r a -S u a r e z , C a n o & D a n i a G a r d a ,并详细比较了它们与模式菌株的形态学差别。
关键词：篮状菌属，新记录种，多基因系统发育【引用本文]陈晗，丁刚，孙炳达，张争，王龙，陈娟，2021.篮状菌属分类概述及三个中国新记录种.菌物学报,40(5): 1200-1215Chen H, Ding G, Sun BD, Zhang Z, Wang L, Chen AJ, 2021. Current taxonomy and three new Chinese records of Tolaromyces. Mycosystema, 40(5): 1200-1215Current taxonomy and three new Chinese records of TalaromycesCH EN H an 1DING G a n g 1SUN B in g-D a2ZHANG Z h e n g10W ANG Long20CH EN A m a n d a -Ju a n 10©Institute of Medicinal Plant D e v e l o p m e n t , Chine se A c a d e m y of Medical Sciences a n d Peking U n i o n Medical College, Beijing 100193, C hina©Insti t u t e of Microbiology, C h i n e s e A c a d e m y of Sciences, Beijing 100101, ChinaAbstract: Species in the gen us 7"a /a 厂om yces are w idely distributed in air and soil, som e speciesare im portant producers of industrial enzym es and pigm ent, and certain species, e.g.丁a la ro m y c e s m a rn e ffe i, w ere reported to cause superficial or dissem inated infections tohum anity. T o la ro m yce s trad itio n a lly is a teleom orphic genus, but according to polyphasic taxo n o m y and "one fu n gus, one nam e" rules, nowaday concept of this genus has changed greatly. Th is genus now co n tains abo ut 177 species. In this paper, the taxonom ic status, species concepts〇C orresponding authors. E-mail: z h a n g z h e n g 321@126.c o m , wl_dgk@ , a m a n d a j _c h e n @l 63.c o mReceived: 2020-09-07, a c c e p te d : 2020-10-091200菌物学报Copyright © 2021 Institute of Microbiology, CAS. All rights reserved. | **********.cn Tel: +86-10-64807521简报22 May2021, 40(5): 1200-1215 Mycosystema ISSN1672-6472 CN11-5180/Qand morphological differences of Tolarom yces species are reviewed.In addition,three n e w Chinese records,Ta/a厂o m y c e s a m a z o/ieDS/.s, 7".ch/o厂o/o m a and 7".are described based on multigene phylogenetic analysis and morphological observations,a n d their differences with ex-type cultures w e r e c o m p a r e d i n detail.K e y w o r d s:Tolarom yces,n e w records,polygenic phylogeny篮状菌属Ta/aromyces C.R.Benj.由B e n j a m i n于1955年建立，属于发菌科，模式 种为7".^/7?/〇；/加1；5(?人〇311§.)(1凡6611】'.[=7". //ofvi/s(Kldcker)Stolk&S a m s o n】。
第二章 菌物的分类
生物分八界系统中与菌物有关内容分别被归在 哪一界当中。
性生殖
三、菌物的分类方法
1. 分类单元
英文 界 Kingdom 门 Phylum 亚门 Sub-纲 Class 亚纲 Subclass 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species
拉丁固定词尾 无
(-mycota) (-mycotina) (-mycetes) (-mycetidea) (-ales) (-aceae)
亚门
鞭毛菌 接合菌 子囊菌 担子菌
半知菌
营 养 体 无性繁殖 有性生殖
原质团或没有隔 膜的菌丝体
游动孢子
菌丝体，典型的 没有隔膜
孢囊孢子
有隔膜的菌丝体， 少数是单细胞
分生孢子等
休眠孢子囊或 卵孢子 接合孢子
子囊孢子
有隔膜的菌丝体 不发达
担孢子
有隔膜的菌丝体 或单细胞
没有有性生殖， 分生孢子等 但可能进行准
以禾柄锈菌小麦变种为例说明其分类地位：
Puccinia graminis Pers.var.tritici Erikss.et.Henn.
界（Kingdon） 门（Phylum） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 变种（Variety）
真核总界（Empire Eukaryota） （3）原始动物界（Archezoa）
•原生生物界
（4）原生动物界（Protozoa）黏菌、根肿菌
（5）植物界（Plantae）
（6）动物界（Animalia）
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菌物分类学研究中常见的物种概念
菌物分类学，又称为系统发育学，是一门研究菌物分类的学科，它的主要研究内容是菌物的系统发育和分类。
菌物分类学涉及多个学科，包括形态学、生物化学、生物物理学和遗传学等，还有细菌学、真菌学和放线菌学等。
菌物分类学的研究对象也很多，主要包括植物、动物、微生物、真菌、放线菌等。
在菌物分类学研究中，最常见的物种概念是种、属、科和目。
种是最小的菌物类别，它是由具有共同形态特征的个体组成，它们可以交配产生后代；属是数个相似的种的集合，它们具有一些共同的形态特征；科是数个相似的属的集合，它们具有共同的生物特性；目是数个相似的科的集合，它们具有共同的结构特征。
菌物分类学的研究不仅是为了认识菌物，也是为了更好地利用菌物。
菌物分类学可以帮助我们了解菌物的形态结构、生态习性、生物学特性和繁殖习性等，从而更好地利用菌物。
此外，菌物分类学还可以帮助我们更好地理解菌物之间的关系，以及菌物在生物进化过程中的角色。
菌物分类学的研究内容极为丰富，其中常见的物种概念是种、属、科和目。
它们的划分标准是菌物的形态特征、生物学特性和繁殖习性。
菌物分类学的研究不仅有助于我们认识菌物，还有助于我们更好地利用菌物，更好地理解菌物之间的关系，以及菌物在生物进化过程中的角色。