第四章 细菌的遗传分析
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混合作用60min 在含链霉素的基本培养基上涂板 只有重组子能够存活:
F-: ade+strr 1000
影印到EMB培养基上
紫红色菌落:lac+ade+ 780(亲本型) 白色或粉红色菌落:lac- ade+ 220(重组型)
1. 重组子的产生
Lac+ ade+ strs Lac- ade- strr
细胞壁(cell wall) 细胞膜(plasma membrane) 鞭毛(Flagella)
性纤毛(pili) 拟核(Nucleoid) 核糖体(Ribosome)
细菌染色体的着膜复制
二、细菌的染色体: 细菌为单倍体,其染色体为环形双链DNA 分子,不形成核小体结构。(P146图) 三、细菌是遗传学研究的好材料: 1. 结构简单; 2. 世代时间短; 3. 后代个体多; 4. 各种突变类型多。
2. 分解代谢功能突变型(catabolic functional mutant): lac- 乳糖突变型, 野生型为lac+
3. 抗性突变型(resistance mutant): Strr ( Str- )抗链霉素突变型, Strs (Str+ )链霉素敏感型 Penr ( Pen-)抗青霉素突变型, Pens (Pen+)青霉素敏感型 T1r 抗T1噬菌体, T1s 对T1噬菌体敏感
F因子的结构
配对区域(pairing region) 原点(origin) 致育基因 (fertility gene)
F因子由3个区域组成: 1)原点(origin):转移的起点; 2)配对区域(pairing region):与整合有关; 3)致育基因(fertility gene):使细菌具有感 染力,其中有编码性纤毛的基因。
苏 氨 酸 合 成 能 力 亮 氨 酸 合 成 能 力 叠 氮 化 钠 抗 性 Tl 噬 菌 体 抗 性 乳 糖 能 否 利 用 半 乳 糖 能 否 利 用 链 霉 素 抗 性
Thr
leu
T1
azi
lac
出现重组子菌落
混合培养,细菌开始杂交每隔一定时间取样,用搅拌器搅拌打 断结合管,使配对的细菌分开,中断杂交,稀释菌液。
F+ × F-
F+
(2) 细菌基因的转移-高频重组 (P149图B)
高频重组(High frequency recombination,Hfr):
如果F因子整合到细菌染色体上,这种染色体上带有 一个整合的F因子的品系,与F-细胞结合后可将供体染色 体的一部分或全部传递给F-受体,当供体和受体的等位基 因带有不同的遗传标记时,可以观察到它们之间发生重组, 重组频率可达到10-2以上,称为高频重组品系(菌株)。 Hfr × F-
二、 突变型筛选:
1. 根据菌落特点筛选:如Lac-突变菌株在伊红-美蓝培 养基(EMB)上形成白色或粉红色菌落,而lac+ 菌落为有金属光泽的紫色菌落。 2. 抗性突变型的筛选:将细菌涂布在含有某种抗生素 或噬菌体的培养基上,能形成菌落的就是抗性突变 菌株。 3. 营养缺陷型的筛选:用印迹法(replica-plated method) 把在完全培养基上生长的菌落影印到基本培养基上, 鉴别出不能生长的克隆。再把它们转移到含有单一 营养物质的培养基上,判定该突变型需要哪一种营 养物质。
=
× 100%=22%=22cM
用重组频率(RF)所测得的基因距离与用中断 杂交技术以时间为单位的基因距离基本上是成正比的, 大致是1分钟相当于20%重组值,即:1min=20cM
第五节 F’因子和性导
一、 F’因子
Hfr 准确切割 Hfr 不准确切割 F因子 F’
F’因子(F-primer factor): 是一种新的F因子,是带 有插入细菌基因的环状F 因子,即带有部分供体 的F因子。 F’因子的产 生缘于一种错误的切割。 • 由于各自携带的基因不 同,从而可以形成不同 的F’因子。
2.低频重组和高频重组:
(1) F因子的转移-低频重组
a. F+细胞与F-细胞接触并结 合,形成细胞质桥 (cytoplasm bridge),即 结合管(conjugation tube)。 b. F因子进行滚环复制,通 过结合管转移到F- 细胞。
F+lac+
F-lac-
F+lac+
F-lac-
Hfr: thr+ leu+ azis tons lac+ gal+ strs × F-: thr- leu- azir tonr lac- gal- strr
混合
完全培养基
中断杂交
一定时间
含str的选择性培养基 ( 基本培养基 + str) 选择到的重组子:thr+ leu+ strr (选择标记)
三、细菌重组的特点
真核生物:完全合子 原核生物:部分二倍体(部分合子),含有一个亲本的 全部基因组和另一亲本的部分基因组。 外基因子:供体Hfr提供的部分基因组; 内基因子:受体F- 提供的完整基因组。 供体的外基因子 F-的内基因子 原核生物的遗传重组实质上是指受体中插入来自供体的 遗传性不同的DNA片段,并把这种DNA片段或它的复 本整合为受体基因组的一部分。
当基因距离较近时,转移时间的间隔在两分钟之内, 用中断杂交作图就不可靠,而必须用传统的重组作图 (recombination mapping)与中断杂交技术相互对照和补 充,提高作图精度。如根据中断杂交,知道lac比ade先 进入受体,距离约为1分钟,则可进行以下杂交: Hfr: lac+ade+strs × F-: lac-ade-strr
三、 三种致育因子的相互关系
三种致育因子F、F’、Hfr的关系是: 1. 有F因子的细菌为F+,没有F因子的为F-,具有致育因子 (F, F’或Hfr)的菌株就是雄性菌株(male strains) 。 2. F因子可以整合到细菌染色体上,形成Hfr染色体。不同的 Hfr菌株是因为F因子的整合位点或方向不同。 3. F因子又可以从Hfr染色体上剪切下来,产生F因子。如果 剪切不准确而带有一段细菌染色体,则称为F’因子。 4. F因子很容易转移到F-细胞中, F+ × F-F+,但是供体 染色体的转移频率则很低,重组频率很低。 5. Hfr能以高频率把细菌染色体基因转移到F-细菌中,却极 少使F-变为F+(因为F因子位于Hfr染色体的最末端); 6. F’因子的性质介于F+和Hfr之间,即可转移自身,又可以 转移细菌基因,但频率较低。
A
B
完全液体培养基
基本固体培养基平皿
出现若干原养型菌落, 频率为10-7
2. U形管实验
)
3. 菌株A: met- thr+ leu+ thi+ (需甲硫氨酸) 菌株B: met+ thr- leu- thi- (需苏氨酸,亮氨酸和硫胺)
A Strs B Strr A Strr B Strs
含有链霉素的 基本培养基
c. F- 细菌转变成F+细菌。
F+lac+
F+lac+
低频重组(low frequency recombination,Lfr):
F+与F- 之间的杂交只有F因子的转移,因此尽管F因子的 转移频率很高,但是供受体细菌染色体的重组频率却很低, 约为10-6,因此F+品系称低频重组品系(菌株)。(P149图A)
Lac+ ade+
strr Lac- ade- strs
Lac+ ade+ strs Lac- ade- strr
Lac- ade+
strr Lac+ ade- strs
2. 重组频率的计算
RFlac-ade =
lac-ade+ lac+ade+ + lac-ade+ 220 1000
× 100%
第四章 细菌的遗传分析
• • • • • •
第一节 细菌的细胞和染色体 第二节 大肠杆菌的突变型及筛选 第三节 细菌的杂交和性别 第四节 中断杂交与重组作图 第五节 F’因子和性导 第六节 转化与转导作图
第一节
细菌的细胞和染色体
一、 细菌的细胞: 真核生物(eukaryotes) 细胞有细胞核,进行减数分裂 和有丝分裂;细菌是原核生物(prokaryotes),没有细 胞核,不进行减数分裂和有丝分裂。而是简单地复制和 一分为二。
二、性导
利用F’因子将供体细胞的基因导入受体形成部分二倍 体的过程,叫做性导(sex-duction or F’-duction)。 F’因子转移细菌基因不同于Hfr菌株: 1. Hfr: thr+ leu+ strs × F- : thr- leu- strr
重组子: F- ( thr+ leu+strr ),不能将thr+ leu+ 再转入其它F2. F’: thr+ leu+ strs × F- : thr- thr- strr 重组子: F’ ( thr+ leu+ strr ),能与其它F- 杂交,并将thr+ leu+ 转入其他F- ,同时使其也具有F因子,成为F+。
出现原养型菌落
不出现原养型菌落
说明菌株A和B在杂交中的作用不同,A为遗传物质的供体 (donor),相当于雄性;而B为受体(recipient),相当于雌性。
二、 F因子与高频重组
1. F因子(F-factor) :又称性因子或致
育因子。它是能独立增殖的环状DNA分子。 供体细菌:细胞质中具有F因子(F+,♂)。 F+细菌表面有性伞毛(sex pili),即F纤毛。 受体细菌:不含F因子(F-, ♀) 。
1.只有偶数次交换才能保证细菌染色体的完整性,产 生平衡的有活性的重组子;
2.重组子只有一种类型, 相反的重组子(reciprocal recombinant)不会出现。
第四节 中断杂交与重组作图
一、中断杂交实验作连锁图:
Hfr F-
Hfr × FHfr: thr+ leu+ azis tons lac+ gal+ strs F-: thr- leu- azir tonr lac- gal- strr
第二节 大肠杆菌的突变型及筛选
一、大肠杆菌的突变类型:
1. 合成代谢功能突变型(anabolic functional mutant):Biblioteka Baidu
基本培养基 完全培养基 营养缺陷型(auxotroph) 缺陷型(deficient) Met- 甲硫氨酸突变型 Thi- 硫胺突变型 Pur- 嘌呤突变型 野生型(wild type) 原养型(prototroph) Met+ Thi+ Pur+
2. 中断杂交技术作图
根据供体基因进入受体细胞的时间顺序可以 绘制连锁图,这就是中断杂交技术(interrupted mating technique)。根据中断杂交绘制的基因连 锁图,基因距离的单位是分钟而不是厘摩。
0
8 8.5 9 thr leu Az
11 T1
18 lac
25 gal
二、 重组作图
第六节 转化与转导作图
细菌的遗传重组:实质上指受体中插入来自供 体的遗传性不同的DNA片断,并使其整合为受 体基因组的一部分。
第三节 细菌的杂交和性别
(大肠杆菌的性别)
一、细菌的杂交 二、F因子和高频重组 三、细菌重组的特点
一、细菌的杂交
(3个经典实验)
1. 菌株A: met- bio- thr+ leu+ thi+ (需甲硫氨酸和生物素) 菌株B: met+ bio+ thr- leu- thi- (需苏氨酸,亮氨酸和硫胺)
1. 中断杂交实验结果
时间(分钟) 〈9 9 11 18 24 转移的基因 azir azir tonr azir tonr lac+ azir tonr lac+ gal+
1) T=0:杂交开始; 2) T=8分钟内,无重组菌落出现; 3) T=9分钟,出现少量叠氮化钠抗性菌落,但对T1噬菌体还是敏感的。 说明azi r 基因已经进入F-细菌,而tonr 基因尚未进入。 4) T=11分钟时,开始出现对T1噬菌体有抗性的菌落(tonr); 5) T=18分钟时,出现能利用乳糖的菌落(lac+); 6) T=25分钟时,出现能利用半乳糖的菌落(gal+)。
F- (重组型)
F因子特点
• F+细菌可以把F因子传给后代; • F+细菌经吖啶橙处理F因子丢失,丢失后不再 出现; • F+可以和F-杂交,给其复制后的F因子,使F- 变为F+ ; • F因子还可以改变细胞表面的构造,以防止F+ 细菌间的接合; • Hfr 和F-杂交时,F-受体很少得到完整的F因 子,因此大多数重组子仍为F-。
F-: ade+strr 1000
影印到EMB培养基上
紫红色菌落:lac+ade+ 780(亲本型) 白色或粉红色菌落:lac- ade+ 220(重组型)
1. 重组子的产生
Lac+ ade+ strs Lac- ade- strr
细胞壁(cell wall) 细胞膜(plasma membrane) 鞭毛(Flagella)
性纤毛(pili) 拟核(Nucleoid) 核糖体(Ribosome)
细菌染色体的着膜复制
二、细菌的染色体: 细菌为单倍体,其染色体为环形双链DNA 分子,不形成核小体结构。(P146图) 三、细菌是遗传学研究的好材料: 1. 结构简单; 2. 世代时间短; 3. 后代个体多; 4. 各种突变类型多。
2. 分解代谢功能突变型(catabolic functional mutant): lac- 乳糖突变型, 野生型为lac+
3. 抗性突变型(resistance mutant): Strr ( Str- )抗链霉素突变型, Strs (Str+ )链霉素敏感型 Penr ( Pen-)抗青霉素突变型, Pens (Pen+)青霉素敏感型 T1r 抗T1噬菌体, T1s 对T1噬菌体敏感
F因子的结构
配对区域(pairing region) 原点(origin) 致育基因 (fertility gene)
F因子由3个区域组成: 1)原点(origin):转移的起点; 2)配对区域(pairing region):与整合有关; 3)致育基因(fertility gene):使细菌具有感 染力,其中有编码性纤毛的基因。
苏 氨 酸 合 成 能 力 亮 氨 酸 合 成 能 力 叠 氮 化 钠 抗 性 Tl 噬 菌 体 抗 性 乳 糖 能 否 利 用 半 乳 糖 能 否 利 用 链 霉 素 抗 性
Thr
leu
T1
azi
lac
出现重组子菌落
混合培养,细菌开始杂交每隔一定时间取样,用搅拌器搅拌打 断结合管,使配对的细菌分开,中断杂交,稀释菌液。
F+ × F-
F+
(2) 细菌基因的转移-高频重组 (P149图B)
高频重组(High frequency recombination,Hfr):
如果F因子整合到细菌染色体上,这种染色体上带有 一个整合的F因子的品系,与F-细胞结合后可将供体染色 体的一部分或全部传递给F-受体,当供体和受体的等位基 因带有不同的遗传标记时,可以观察到它们之间发生重组, 重组频率可达到10-2以上,称为高频重组品系(菌株)。 Hfr × F-
二、 突变型筛选:
1. 根据菌落特点筛选:如Lac-突变菌株在伊红-美蓝培 养基(EMB)上形成白色或粉红色菌落,而lac+ 菌落为有金属光泽的紫色菌落。 2. 抗性突变型的筛选:将细菌涂布在含有某种抗生素 或噬菌体的培养基上,能形成菌落的就是抗性突变 菌株。 3. 营养缺陷型的筛选:用印迹法(replica-plated method) 把在完全培养基上生长的菌落影印到基本培养基上, 鉴别出不能生长的克隆。再把它们转移到含有单一 营养物质的培养基上,判定该突变型需要哪一种营 养物质。
=
× 100%=22%=22cM
用重组频率(RF)所测得的基因距离与用中断 杂交技术以时间为单位的基因距离基本上是成正比的, 大致是1分钟相当于20%重组值,即:1min=20cM
第五节 F’因子和性导
一、 F’因子
Hfr 准确切割 Hfr 不准确切割 F因子 F’
F’因子(F-primer factor): 是一种新的F因子,是带 有插入细菌基因的环状F 因子,即带有部分供体 的F因子。 F’因子的产 生缘于一种错误的切割。 • 由于各自携带的基因不 同,从而可以形成不同 的F’因子。
2.低频重组和高频重组:
(1) F因子的转移-低频重组
a. F+细胞与F-细胞接触并结 合,形成细胞质桥 (cytoplasm bridge),即 结合管(conjugation tube)。 b. F因子进行滚环复制,通 过结合管转移到F- 细胞。
F+lac+
F-lac-
F+lac+
F-lac-
Hfr: thr+ leu+ azis tons lac+ gal+ strs × F-: thr- leu- azir tonr lac- gal- strr
混合
完全培养基
中断杂交
一定时间
含str的选择性培养基 ( 基本培养基 + str) 选择到的重组子:thr+ leu+ strr (选择标记)
三、细菌重组的特点
真核生物:完全合子 原核生物:部分二倍体(部分合子),含有一个亲本的 全部基因组和另一亲本的部分基因组。 外基因子:供体Hfr提供的部分基因组; 内基因子:受体F- 提供的完整基因组。 供体的外基因子 F-的内基因子 原核生物的遗传重组实质上是指受体中插入来自供体的 遗传性不同的DNA片段,并把这种DNA片段或它的复 本整合为受体基因组的一部分。
当基因距离较近时,转移时间的间隔在两分钟之内, 用中断杂交作图就不可靠,而必须用传统的重组作图 (recombination mapping)与中断杂交技术相互对照和补 充,提高作图精度。如根据中断杂交,知道lac比ade先 进入受体,距离约为1分钟,则可进行以下杂交: Hfr: lac+ade+strs × F-: lac-ade-strr
三、 三种致育因子的相互关系
三种致育因子F、F’、Hfr的关系是: 1. 有F因子的细菌为F+,没有F因子的为F-,具有致育因子 (F, F’或Hfr)的菌株就是雄性菌株(male strains) 。 2. F因子可以整合到细菌染色体上,形成Hfr染色体。不同的 Hfr菌株是因为F因子的整合位点或方向不同。 3. F因子又可以从Hfr染色体上剪切下来,产生F因子。如果 剪切不准确而带有一段细菌染色体,则称为F’因子。 4. F因子很容易转移到F-细胞中, F+ × F-F+,但是供体 染色体的转移频率则很低,重组频率很低。 5. Hfr能以高频率把细菌染色体基因转移到F-细菌中,却极 少使F-变为F+(因为F因子位于Hfr染色体的最末端); 6. F’因子的性质介于F+和Hfr之间,即可转移自身,又可以 转移细菌基因,但频率较低。
A
B
完全液体培养基
基本固体培养基平皿
出现若干原养型菌落, 频率为10-7
2. U形管实验
)
3. 菌株A: met- thr+ leu+ thi+ (需甲硫氨酸) 菌株B: met+ thr- leu- thi- (需苏氨酸,亮氨酸和硫胺)
A Strs B Strr A Strr B Strs
含有链霉素的 基本培养基
c. F- 细菌转变成F+细菌。
F+lac+
F+lac+
低频重组(low frequency recombination,Lfr):
F+与F- 之间的杂交只有F因子的转移,因此尽管F因子的 转移频率很高,但是供受体细菌染色体的重组频率却很低, 约为10-6,因此F+品系称低频重组品系(菌株)。(P149图A)
Lac+ ade+
strr Lac- ade- strs
Lac+ ade+ strs Lac- ade- strr
Lac- ade+
strr Lac+ ade- strs
2. 重组频率的计算
RFlac-ade =
lac-ade+ lac+ade+ + lac-ade+ 220 1000
× 100%
第四章 细菌的遗传分析
• • • • • •
第一节 细菌的细胞和染色体 第二节 大肠杆菌的突变型及筛选 第三节 细菌的杂交和性别 第四节 中断杂交与重组作图 第五节 F’因子和性导 第六节 转化与转导作图
第一节
细菌的细胞和染色体
一、 细菌的细胞: 真核生物(eukaryotes) 细胞有细胞核,进行减数分裂 和有丝分裂;细菌是原核生物(prokaryotes),没有细 胞核,不进行减数分裂和有丝分裂。而是简单地复制和 一分为二。
二、性导
利用F’因子将供体细胞的基因导入受体形成部分二倍 体的过程,叫做性导(sex-duction or F’-duction)。 F’因子转移细菌基因不同于Hfr菌株: 1. Hfr: thr+ leu+ strs × F- : thr- leu- strr
重组子: F- ( thr+ leu+strr ),不能将thr+ leu+ 再转入其它F2. F’: thr+ leu+ strs × F- : thr- thr- strr 重组子: F’ ( thr+ leu+ strr ),能与其它F- 杂交,并将thr+ leu+ 转入其他F- ,同时使其也具有F因子,成为F+。
出现原养型菌落
不出现原养型菌落
说明菌株A和B在杂交中的作用不同,A为遗传物质的供体 (donor),相当于雄性;而B为受体(recipient),相当于雌性。
二、 F因子与高频重组
1. F因子(F-factor) :又称性因子或致
育因子。它是能独立增殖的环状DNA分子。 供体细菌:细胞质中具有F因子(F+,♂)。 F+细菌表面有性伞毛(sex pili),即F纤毛。 受体细菌:不含F因子(F-, ♀) 。
1.只有偶数次交换才能保证细菌染色体的完整性,产 生平衡的有活性的重组子;
2.重组子只有一种类型, 相反的重组子(reciprocal recombinant)不会出现。
第四节 中断杂交与重组作图
一、中断杂交实验作连锁图:
Hfr F-
Hfr × FHfr: thr+ leu+ azis tons lac+ gal+ strs F-: thr- leu- azir tonr lac- gal- strr
第二节 大肠杆菌的突变型及筛选
一、大肠杆菌的突变类型:
1. 合成代谢功能突变型(anabolic functional mutant):Biblioteka Baidu
基本培养基 完全培养基 营养缺陷型(auxotroph) 缺陷型(deficient) Met- 甲硫氨酸突变型 Thi- 硫胺突变型 Pur- 嘌呤突变型 野生型(wild type) 原养型(prototroph) Met+ Thi+ Pur+
2. 中断杂交技术作图
根据供体基因进入受体细胞的时间顺序可以 绘制连锁图,这就是中断杂交技术(interrupted mating technique)。根据中断杂交绘制的基因连 锁图,基因距离的单位是分钟而不是厘摩。
0
8 8.5 9 thr leu Az
11 T1
18 lac
25 gal
二、 重组作图
第六节 转化与转导作图
细菌的遗传重组:实质上指受体中插入来自供 体的遗传性不同的DNA片断,并使其整合为受 体基因组的一部分。
第三节 细菌的杂交和性别
(大肠杆菌的性别)
一、细菌的杂交 二、F因子和高频重组 三、细菌重组的特点
一、细菌的杂交
(3个经典实验)
1. 菌株A: met- bio- thr+ leu+ thi+ (需甲硫氨酸和生物素) 菌株B: met+ bio+ thr- leu- thi- (需苏氨酸,亮氨酸和硫胺)
1. 中断杂交实验结果
时间(分钟) 〈9 9 11 18 24 转移的基因 azir azir tonr azir tonr lac+ azir tonr lac+ gal+
1) T=0:杂交开始; 2) T=8分钟内,无重组菌落出现; 3) T=9分钟,出现少量叠氮化钠抗性菌落,但对T1噬菌体还是敏感的。 说明azi r 基因已经进入F-细菌,而tonr 基因尚未进入。 4) T=11分钟时,开始出现对T1噬菌体有抗性的菌落(tonr); 5) T=18分钟时,出现能利用乳糖的菌落(lac+); 6) T=25分钟时,出现能利用半乳糖的菌落(gal+)。
F- (重组型)
F因子特点
• F+细菌可以把F因子传给后代; • F+细菌经吖啶橙处理F因子丢失,丢失后不再 出现; • F+可以和F-杂交,给其复制后的F因子,使F- 变为F+ ; • F因子还可以改变细胞表面的构造,以防止F+ 细菌间的接合; • Hfr 和F-杂交时,F-受体很少得到完整的F因 子,因此大多数重组子仍为F-。