酵母表达外源蛋白(foreign protein)(1)
毕赤酵母中高效引导外源蛋白分泌的信号肽的研究
毕赤酵母中高效引导外源蛋白分泌的信号肽的探究毕赤酵母被广泛应用于外源蛋白的表达和分泌,但其分泌机制依旧存在瓶颈。
信号肽作为外源蛋白分泌的关键信号,可以增进蛋白的正确折叠和定位。
本探究合成了多个信号肽并测试了其诱导外源蛋白分泌的效果。
结果显示,其中一个信号肽在毕赤酵母中具有高效的引导外源蛋白分泌的作用,并可提高外源蛋白的表达量。
这一探究为毕赤酵母外源蛋白分泌的机制探究和工业应用提供了新思路。
关键词:毕赤酵母、信号肽、外源蛋白分泌、表达、折叠定位正文:引言毕赤酵母是一种广泛应用于外源蛋白表达和分泌的真菌,其工业用途广泛,包括生产酶、生物肥料、食品添加剂等。
外源蛋白的表达和分泌是毕赤酵母应用的基础,因此其分泌机制的探究具有重要的理论和应用价值。
信号肽被认为是蛋白在细胞内穿过细胞膜从而被分泌到细胞外所必需的关键信号。
近年来,通过信号肽的调控已经在多种真菌中实现了外源蛋白的高效表达和分泌。
因此,寻找高效的信号肽,探究其引导外源蛋白分泌的机制,具有重要的应用前景。
材料和方法合成了11种可能具有对毕赤酵母分泌效果的信号肽,并转化到毕赤酵母中。
以GFP作为模型蛋白,不同信号肽在GFP表达和分泌过程中的诱导效果进行比较。
同时,测定了其中一个信号肽对外源蛋白表达量和分泌量的影响,并通过Western blot分析外源蛋白的分泌效果和分泌途径分析来探究信号肽的作用机制。
结果在11种信号肽中,有一个信号肽(称为SgPEP1)能够显著增加GFP的分泌效率,同时提高了外源蛋白的表达量。
Western blot和分泌途径分析显示,SgPEP1作用于胞内和胞外蛋白的定位和折叠,增进蛋白正确地进入胞外。
谈论本探究中发现的SgPEP1信号肽在毕赤酵母外源蛋白表达和分泌中具有高效的引导作用,这为改善毕赤酵母的表达和分泌效率提供了新思路。
在信号肽的机理探究中,需要进一步探究其在外源蛋白折叠中的作用方向和机制,以便更好地控制蛋白的定向和拓扑。
外源基因在酵母体系中表达
C.albicans hyphal n.r cell wall Ag
Spinach
2
phosphoribulokinase
S/Mut+ Halaas, et al (1995)
Shiba, et al (1995)
S/Mut+
S/Mut+, S/MutS( 30,000 copies/c ell) S/MutS
fragment C
Pertusis
3
antigen P69
Mouse EGF 0.45
Aprotinin 0.8
Kunitz
1
protease
inhibitor (A-
beta-PP)
Human
4
serum
albumin(HS
A)
HIV-1
1.25
gp120
and
0.02
I/Mut+ and Muts I/Muts S/Muts S/Mut+/Muts S/Mut+
第一代酵母基因工程表达系统是以酿酒酵 母表达系统为典型代表。
第二代酵母基因工程表达系统的典型代表 就是近年来倍受关注的毕赤酵母表达系统 等为代表的甲醇酵母表达系统:
1987年Cregg等首次报道甲醇营养型毕 赤酵母(Methy1otrophic Pichia pastoris)表达 外源蛋白以来,由于它具有表达效率高, 遗传稳定,产物可分泌表达等优点,己成 为近年来极受青睐的真核基因表达系统。
S:284
ds Fv (di-sulfide-bonded n.r S/n.r Luo, et al (1995), J.
single chain antibodies) n.r
酵母表达(1)
酵母表达引言酵母是一类单细胞真核生物,被广泛应用于生物学研究中。
酵母表达系统是指利用酵母细胞表达外源基因的技术,被广泛应用于蛋白质的高效表达和产量大规模生产。
本文将介绍酵母表达系统的原理、优势和应用。
原理酵母表达系统的核心原理是将外源基因导入酵母细胞,并通过酵母细胞的转录、翻译和修饰机制,使外源基因在酵母细胞中得到表达和功能发挥。
通常情况下,酵母表达系统主要采用酵母菌属的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)或毕赤酵母(Pichia pastoris)作为宿主细胞。
1.酵母转录机制:酵母细胞的基因表达主要通过RNA聚合酶Ⅱ进行转录,产生mRNA分子。
2.酵母翻译机制:酵母细胞通过核糖体进行翻译,将mRNA翻译成蛋白质。
3.酵母修饰机制:酵母细胞具有多种修饰酶,可以对蛋白质进行翻译后修饰,如糖基化、磷酸化等。
优势相比其他常用的表达系统,酵母表达系统具有一系列的优势:1.高效表达能力:酵母表达系统能够实现高水平的外源基因表达,产量可达到克级。
2.翻译后修饰:酵母细胞具有多种修饰酶,可以对蛋白质进行翻译后修饰,使蛋白质得到正确的糖基化等修饰。
3.生长条件简单:酵母菌生长条件相对简单,可以在常规培养基中进行培养,对培养条件的要求相对较低。
4.可溶性蛋白质表达:酵母细胞具有较强的蛋白质折叠和修饰能力,能够高效地表达可溶性蛋白质。
应用酵母表达系统广泛应用于以下领域:1.蛋白质研究:酵母表达系统可用于大规模蛋白质表达和纯化,为蛋白质的结构、功能和相互作用研究提供了高效的工具。
2.药物筛选:酵母表达系统可用于药物靶点鉴定和药物分子筛选,加速药物研发过程。
3.疫苗研究:酵母表达系统可用于疫苗候选抗原的高效表达和产量大规模生产。
4.代谢工程:酵母表达系统可用于代谢工程领域,利用酵母细胞对外源代谢产物的高效合成能力,实现产生复杂化合物的目标。
5.生物制药:酵母表达系统已经被广泛应用于生物制药领域,用于生产重组蛋白和抗体等生物药物。
乳酸克鲁维酵母表达外源蛋白研究进展
生物技术通讯 LETTERS IN BIOTECHNOLOGY Vol.18 No.6 Nov., 2007
影响乳酸克鲁维酵母表达的前提下, 几乎抑制了在细菌体内的 表达。这样, 此突变体就可以表达通常在野生 LAC4 启动子下不 能表达的一些蛋白, 如牛肠激酶、鼠甲状腺激素结合蛋白等。
在酵母和动物细胞中, 为达到最优基因表达, 发现转录起始 码 ATG 周 围 的 核 苷 酸 序 列 是 重 要 的 , 如 Kozak[13]广 泛 研 究 了 在 COS 细胞中这些区域对表达胰岛素的影响。同样, 酵母在高表达 外源蛋白时, 常被发现 ATG 周围存在一些特定核苷酸, 这表明了 这些核苷酸对表达这些基因的重要作用。 2.4 附加型和整合型载体
G418、零 霉 素 ( Zeocin)、卡 那 霉 素 等 抗 生 素 也 已 成 为 应 用 于 乳酸克鲁维酵母的筛选标记。另外还有氮源选择方法, 如基于构 巢 曲 霉 ( Aspergillus nidulans) 乙 酰 胺 酶 ( 由 amdS 基 因 编 码 ) 的 选 择标记, 能够将乙酰胺降解成氨。因为乳酸克鲁维酵母没有能力 利用乙酰胺, 只有从载体上获得乙酰胺基因而过表达乙酰胺酶 的转化细胞才能在以乙酰胺为惟一氮源的琼脂培养基上生长。 这种方法已被成功运用于乳酸克鲁维酵母 GG799 菌株, 用来表 达牛肠激酶、麦芽糖结合蛋白、卵清蛋白、纤 维 素 酶 、鼠 甲 状 腺 激 素结合蛋白, 而且都是应用所提供的商业化整合型表达载体 pKLAC1[10]来 完 成 的 。 2.3 启动子
通常应用于酿酒酵母的营养缺陷型标记, 如 ura3、leu2、trp1, 也被逐渐用于乳酸克鲁维酵母的分子遗传操作中。但营养缺陷 型标记应用于工业生产还存在一定的不足, 因为许多工业性生 产菌株已经通过遗传突变提高了分泌蛋白的能力, 这些菌往往 已是二倍体或者非整倍体, 或者在染色体某区段进行了修改。已 有报道认为, 用营养缺陷型菌株生产异源蛋白是不利的, Gorgens 等[8]在酿酒酵母中发现, 异源的木聚糖酶在 营 养 缺 陷 型 菌 株 中 的 分泌严重降低, 虽然这种不足可以通过在培养基中添加相应氨 基酸等养分来克服, 但采取补救措施后的菌株生长速度依旧缓 慢。在 URA3 营养缺陷型乳酸克鲁维酵母菌中, 即使添加外源尿 嘧 啶 , 其 表 达 的 牛 肠 激 酶 的 量 还 是 降 低 至 1 /10[9], 原 因 可 能 是 细 胞已经因为分泌外源蛋白增加了压力, 又进一步因为合成或运 输外源氨基酸而负重。
外源蛋白表达失败或不表达的原因和解决方法
外源蛋白表达失败或不表达的原因和解决方法外源蛋白表达的定义和意义外源蛋白表达是指在一个生物体(如细菌、酵母、昆虫、哺乳动物等)中表达另一个生物体(如植物、动物、病毒等)的蛋白质的技术,它是生物技术的重要手段和工具。
外源蛋白表达可以用于研究蛋白质的结构和功能,开发新型的药物和疫苗,生产工业用途的酶和激素等。
外源蛋白表达失败或不表达的原因外源蛋白表达失败或不表达的原因很多,可以分为上游和下游两类。
上游原因上游原因是指与外源基因本身特性或重组蛋白细胞毒性等相关的原因,它们只能通过上游的合理设计来解决。
上游原因包括以下几种:•外源基因与宿主细胞的密码子用法不匹配,导致翻译效率低或错误。
•外源基因含有宿主细胞不能识别或不能正确加工的信号序列,导致转运或定位异常。
•外源基因含有宿主细胞不能识别或不能正确剪切的内含子,导致转录或翻译中断。
•外源基因含有宿主细胞不能识别或不能正确修饰的位点,导致糖基化、磷酸化等后期修饰缺失或异常。
•外源基因含有宿主细胞不能兼容或不能稳定保存的序列,导致重组质粒不稳定或降解。
•重组蛋白对宿主细胞产生毒性或抑制作用,导致细胞生长受阻或死亡。
下游原因下游原因是指与下游的操作不当或失误等相关的原因,它们可以通过下游的规范操作和优化条件来避免。
下游原因包括以下几种:•重组菌甘油管保存时间过长,导致质粒丢失或突变。
•诱导剂加错或用量不当,导致重组蛋白表达水平低或无法诱导。
•表达条件选择不合适,导致重组蛋白表达效率低或形成包涵体。
•蛋白纯化步骤操作不规范,导致重组蛋白损失或污染。
•SDS-PAGE或WB检测操作不当或试剂失效,导致重组蛋白检测失败或假阴性。
外源蛋白表达失败或不表达的解决方法外源蛋白表达失败或不表达的解决方法需要根据具体的原因和情况进行选择和调整。
一般来说,可以从以下几个方面进行优化:•优化外源基因的设计,使其与宿主细胞的密码子用法、信号序列、内含子、修饰位点等相匹配或适应,或者使用人工合成的优化基因。
酵母表达系统在植物功能基因组学研究中应用的局限性
植物生理学通讯 第42卷 第6期,2006年12月1168酵母表达系统在植物功能基因组学研究中应用的局限性潘维锋 李师鹏*山东师范大学生命科学学院,济南250014Yeast, a Model System to Elucidate Plant Gene Function: Application and Limi-tationPAN Wei-Feng, LI Shi-Peng *College of Life Sciences, Shandong Normal University, Jinan 250014, China提要 介绍了酵母表达体系在植物的功能基因组学研究中的应用,并对这一实验手段应用的局限性进行了分析,以期提醒研究者应全面理解采用这一体系所获得的实验数据,确保据此而作出的结论全面、可靠。
关键词 酵母;拟南芥;基因组学;酵母功能互补;功能基因组学随着DNA测序技术的不断完善,基因测序变得越来越经济、有效、可靠。
到2006年6月为止已经完成包括酵母、人类、拟南芥在内的21个真核生物基因组测序,另外还有126个真核生物基因组计划正在进行中(数据来源于NCBI数据库)。
这些前沿性工作导致了大量新基因的发现,为人们在基因组水平上研究生物的生长和发育等生命现象打下了基础。
单倍体啤酒酵母(Saccharomycescerevisiae)是1997年完成全基因组测序的,这是第一个完成的全基因组测序的真核生物。
整个酵母基因组包括约6 200个不含内含子的基因。
其中很多基因的功能已得到较为深入的研究,有关信息可以通过互联网在酵母基因组数据库中查到,如斯坦福大学的SGD (Saccharomyces GenomeDatabase)数据库。
迄今,整个酵母的95%以上的基因序列被系统敲除,不同的单基因敲除突变体可以从Invitrogen公司ATCC (American TypeCulture Collection)或EUROSCARF (European Sac-charomyces cerevisiae Archives for Functional Analysis)获得。
基因工程-外源基因在酵母菌中的表达
基因工程刘夫锋2019.11.27基因工程5 2 3 4 1 6789重组DNA 技术与基因工程的基本概念重组DNA技术与基因工程的基本原理重组DNA技术所需的基本条件重组DNA技术的操作过程目的基因的克隆与基因文库的构建外源基因在大肠杆菌中的表达外源基因在酵母菌中的表达外源基因在哺乳动物细胞中的表达外源基因表达产物的分离纯化7.1酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征7 外源基因在酵母菌中的表达酵母菌的分类学特征酵母菌(Yeast )是一群以芽殖或裂殖方式进行无性繁殖的单细胞真核生物,分属于子囊菌纲(子囊酵母菌)、担子菌纲(担子酵母菌)、半知菌类(半知酵母菌),共由56个属和500多个种组成。
如果说大肠杆菌是外源基因最成熟的原核生物表达系统,则酵母菌是最成熟的真核生物表达系统。
7.1 酵母菌作为表达外源基因受体菌的特征7 外源基因在酵母菌中的表达酵母菌表达外源基因的优势全基因组测序,基因表达调控机理比较清楚,遗传操作相对简单能将外源基因表达产物分泌至培养基中具有原核细菌无法比拟的真核蛋白翻译后加工系统大规模发酵历史悠久、技术成熟、工艺简单、成本低廉不含有特异性的病毒、不产内毒素,美国FDA 认定为安全的基因工程受体系统,食品工业有数百年历史酵母菌是最简单的真核模式生物7.2 酵母菌的宿主系统7 外源基因在酵母菌中的表达7.2.2提高重组蛋白表达产率的突变宿主菌7.2.3 抑制超糖基化作用的突变宿主菌7.2.4 减少泛素依赖型蛋白降解作用的突变宿主菌7.2.1 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌7.2.1 广泛用于外源基因表达的酵母宿主菌目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:酵母属如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )克鲁维酵母属如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis )毕赤酵母属如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris )裂殖酵母属如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )汉逊酵母属如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha )裂殖酵母属如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )如解脂耶氏酵母(耶氏酵母属Yarrowia lipolytica )如腺嘌呤阿氏酵母(阿氏酵母属Arxula adeninivorans )其中芽殖型酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽。
酵母表达系统
•巴斯德毕赤酵母 它是一种甲醇营养菌,甲醇可诱导与甲醇代谢相关酶基 因的高效表达,如乙醇氧化酶基因(AOX1)的表达产物可 在细胞中高水平积累。 AOX1的启动子是一种可诱导的强启
动子。以AOX1为启动子,选择AOX1基因缺失的突变株作为
受体细胞,可高效表达外源基因。 在毕赤酵母中得到表达的重组异源蛋白有乙型肝炎表面 抗原、人肿瘤坏死因子、人表皮生长因子、链激酶等几十种。 毕赤酵母的分泌表达能力比酿酒酵母强,但对其遗传背景了 解还比较少,且发酵周期也比较长。
Selecting a Pichia Expression Vector
pPIC9载体的信号肽序列和多克隆位点
Selecting a Pichia Expression Vector
Pichia Cloning
表达载体与毕赤酵母基因 组发生重组的方式:
1. 载体的3‘ AOX1区与基因组的
expression and can even lead to cell death. Other important facts: • Doubling time of log phase Mut+ or MutS Pichia in YPD is ~2 hours • Mut+and MutS strains do not differ in growth rates unless grown on methanol • Doubling time of log phase Mut+Pichia in methanol medium (MM) is 4-6 hours
AOX1基因的末端发生同源重组
2. 载体的HIS4区与基因组的HIS4 基因的末端发生同源重组
Gene Replacement at AOX1 in GS115
酵母表达系统
比较基因组学
通过比较不同物种之间的基因组 和转录组,分析生物进化的特征 和规律。
05 酵母表达系统的未来发展
提高表达产物的产量与质量
基因编辑技术
利用基因编辑技术,如CRISPR-Cas9,对酵母基因进行精确修饰, 以提高目标蛋白的表达量和纯度。
沉默子
沉默子是能够抑制基因表达的DNA序列,通过与转录因子结合来抑制基因的表达,在基因表达调控中具有重要作 用。
转录因子与基因表达调控
转录因子
转录因子是能够识别并结合DNA序列的蛋白质,通过与特定DNA序列的结合来调控基因的表达。
转录因子与基因表达调控
转录因子在基因表达调控中发挥关键作用,通过与启动子、增强子或沉默子等DNA序列的相互作用来 调节基因的表达。
蛋白质相互作用
通过酵母双杂交等技术研究蛋白质之间的相互作用,揭示基因调控 的分子机制。
基因突变分析
通过构建突变体分析基因突变对酵母生长、代谢等的影响,研究基因 的功能。
生物进化研究
物种进化
利用酵母表达系统研究物种之间 的进化关系,通过比较不同物种 之间基因表达的差异,揭示物种 进化的规律。
适应性进化
利用酵母表达系统生产食品添 加剂、酶制剂等,提高食品质 量和安全性。
农业领域
通过酵母表达系统改良农作物 ,提高抗逆性、产量和品质等
。
酵母表达系统的优缺点
优点
操作简便、周期短、成本低、可大规 模生产、安全性高。
缺点
表达水平相对较低、分泌蛋白的加工 和修饰能力有限、易受宿主菌遗传背 景的影响。
02 酵母表达系统的基本组成
对启动子、终止子等表达元件进行优化,提高其转 录和翻译效率,促进目标蛋白的表达。
酵母表达系统研究概述
酵母表达系统研究概述田晓娟【摘要】目前常用的外源基因表达系统主要分为两类:原核表达系统和真核表达系统.前者主要包括大肠杆菌表达系统和枯草杆菌表达系统,后者一般包括酵母表达系统、昆虫/杆状病毒表达系统、哺乳动物细胞表达系统以及新兴的转基因植物表达系统等.在这众多的表达系统中酵母表达系统因其培养比较方便、简单、价格低廉、外源蛋白表达量高、表达的蛋白活性好、能进行翻译后修饰等诸多优点脱颖而出,成为目前最主要的外源基因表达系统.概述了常见的几种酵母表达系统的特点,并对发酵过程中影响外源蛋白表达量的因素做了探讨,以期为人们表达重组蛋白时选择合适的表达系统和获得高效的表达产物提供帮助.【期刊名称】《陇东学院学报》【年(卷),期】2018(029)001【总页数】5页(P72-76)【关键词】酵母表达系统;外源基因;蛋白表达【作者】田晓娟【作者单位】陇东学院岐伯医学院,甘肃庆阳 745000【正文语种】中文【中图分类】R379.9;Q93-33酵母常被广泛地用于生产医用或有工业前景的重组蛋白。
为了高效获得某种单一的蛋白产物,首先必须考虑目的蛋白本身的特点、宿主菌的特性等问题,以确定和优化它的最适表达系统。
酵母表达系统有众多品质优良的宿主菌株,包括酿酒酵母、毕赤酵母、多形汉逊酵母、乳酸克鲁维酵母、粟酒裂殖酵母、解脂耶氏酵母和Arxula adeninivorans等。
与多数复杂的真核生物不同,酵母表达系统比较经济节约,能快速地达到较高的细胞密度,产生高浓度的蛋白,并且不含有致热源、病原体和病毒夹杂物;具有良好的耐热性;能利用一些罕见的不易被其他生物利用的碳源;有些菌株还进行了一些更具优势的加工,例如人源化的糖基化、缺失一些蛋白酶等。
此外,它们使用各种各样的载体、启动子和选择性标记以供选择。
酵母因其单细胞生物的这种优势和独特的翻译后修饰的能力,使得它们已经广泛地用于生产工业化的重组蛋白(如核糖体蛋白)。
随着工业化发酵工艺知识的积累和目前基因工程技术的发展,有望设计出更符合成本效益的表达系统,以满足日益增长的对重组蛋白和糖蛋白的需求。
酵母表达简介
酵母表达外源蛋白1、菌株用GS115表达不出蛋白,换KM71H后,大部分克隆能表达。
2、温度:在28度和室温下诱导表达,表达水平可能都不低。
3、pH手册上用6.0,pH提高到6.8,不表达的蛋白可能就表达出来。
BMMY 的pH7.0-7.5比较合适。
国内外做的最好的rHSA,最适pH大概5-6左右。
pH3的时候yeast和peptone好像会沉淀的,可以用磷酸和磷酸二氢钾调,具体比例自己去试试。
4、偏爱密码子codon bias一般不是主要的问题,你要表达的蛋白特性才是主要问题,酵母对分子量大(30KD以上),结构复杂(如一些蛋白酶),二硫键含量多的蛋白往往不能有效表达,尤其是分泌表达。
密码子改造对一些较小的而且结构简单的蛋白表达量的提高可能有一些作用。
比如一位战友用Pichia酵母表达一个单链抗体,29KD,含有2对二硫键,表达量约几毫克每升,选用酵母偏好密码子全基因合成后,表达量没有什么提高。
5、表达时间与空质粒转化对照诱导时间长了以后,是会有很多蛋白分泌出来的,时间越长杂蛋白就越多,且分子量都比较大。
最好做一个空质粒转化的对照,这样就会比较肯定到底是不是自身的蛋白分泌的结果。
6、污染每个样品从G418板上挑10个左右单克隆于2ml BMGY摇菌(30ml 玻璃管,比LB管大一点),纱布一般用8层,一天左右看着比较浑离心,留样1ml,余1ml换2ml BMMY诱导表达,3,4层纱布足够了。
污染一般都是跟瓶口覆盖有关的原因造成的,只盖纱布肯定会污染。
加盖报纸后,就再没遇到过污染。
如果只用6层纱布,污染的可能当然很大,100ml三角瓶,装量10ml培养液,用橡筋把8层纱布和2层报纸拴紧封口,空气浴摇床。
7、不表达蛋白有没有表达就要看你的运气了,一般重复2-3次实验都没有表达菌株,这个蛋白就放弃表达了。
8、表达量30KD,10mg/L表达量已经很高,最直接的方法是发酵,一般提高5-10倍。
大肠杆菌一样出现大团的超表达蛋白。
毕氏酵母蛋白表达系统原理
毕氏酵母蛋白表达系统原理1.引言1.1 概述概述在生物科学研究中,表达外源蛋白是一个常见的实验手段,用以研究蛋白的结构和功能。
而毕氏酵母蛋白表达系统作为一种重要的表达系统之一,已经被广泛应用于各个领域,包括基因工程、药物研发和生物制药等。
本文将对毕氏酵母蛋白表达系统的基本原理和优势进行详细介绍。
毕氏酵母(Pichia pastoris)是一种单细胞真菌,具有高效的蛋白表达能力和较高的细胞密度。
毕氏酵母蛋白表达系统是基于毕氏酵母的遗传工程技术,通过将外源基因嵌入到毕氏酵母的基因组中,使其能够产生大量特定蛋白。
其主要原理是利用毕氏酵母的内源启动子和信号序列来调控外源基因的表达,并通过细胞代谢途径来实现对外源蛋白的正确折叠和修饰。
毕氏酵母蛋白表达系统相比其他表达系统具有许多优势。
首先,由于毕氏酵母的生长速度较快,表达时间相对较短,可以迅速得到目标蛋白。
其次,毕氏酵母能够产生大量的外源蛋白,产量可以达到克级甚至克拉级。
此外,毕氏酵母蛋白表达系统具有高选择性,外源基因在毕氏酵母中的稳定性较高,避免了外源基因的丢失或突变。
总之,毕氏酵母蛋白表达系统是一种广泛应用的表达系统,其基本原理和优势使其成为生物科学研究中重要的工具。
本文将进一步深入介绍毕氏酵母蛋白表达系统的基本原理和其在科学研究和应用中的潜力。
1.2 文章结构文章结构部分的内容如下:文章结构部分旨在介绍本文的整体框架和各个章节的内容安排,以便读者更好地理解和阅读本文。
本文包含引言、正文和结论三个主要部分。
1. 引言部分(Introduction)是文章的开篇,旨在引起读者的兴趣并提供对毕氏酵母蛋白表达系统原理的总体概述。
其中,1.1概述部分将简要介绍毕氏酵母蛋白表达系统的基本概念和背景信息;1.2文中结构部分(Article Structure)将详细介绍本文的整体结构安排,以便读者明确每个章节的内容;1.3目的部分(Objective)将说明本文的研究目的和意义,为后续内容提供背景和动机。
巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白的降解机理及其控制策略
巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白的降解机理及其控制策略1.巴斯德毕赤酵母表达外源蛋白的降解机理在外源蛋白的表达过程中,宿主菌毕赤酵母的胞内和胞外均有一定量的蛋白酶的表达,因此,不论是胞内表达亦或是分泌表达,大多数外源蛋白均面临着被降解的问题,这也是影响表达量的一个重要因素,同时,还增加了纯化目的蛋白的难度。
近年来,蛋白酶的研究是P.pastoris表达系统一个重点和热点。
越来越多的蛋白酶的遗传背景和生理生化性质得到深入的研究。
P.pastoris能根据细胞生长环境(碳源的改变以及细胞或细胞器的胁迫)来调整自身酶系,以合成与降解不同的蛋白和细胞器,液泡是蛋白质降解最主要的场所,另一降解场所是细胞基质蛋白酶体中。
但是,对于外源蛋白来说,其降解常在表达和分离纯化的第一步,主要是由培养基中胞外蛋白酶,细胞外膜结合蛋白酶(cell-bound proteases)和细胞自噬或裂解释放的胞内蛋白酶降解的。
胞内蛋白酶主要涉及降解蛋白质前体产生活性蛋白;切除转运出膜后的蛋白质信号肽;使调控蛋白失活;降解变异或不需要的蛋白质;提供营养,前体和能量。
胞外蛋白酶分泌较少,主要降解部分蛋白质提供氨基酸和多肽等营养。
根据蛋白酶的分泌和作用地点,P.pastoris的胞内蛋白酶可以分为三种类别,即液泡蛋白酶(vacuolar proteases),细胞基质蛋白酶体(the cytosolic proteosome)以及分泌途径的蛋白酶(proteases located along the secretory pathway)。
表1.2毕赤酵母液泡蛋白酶和分泌途径蛋白酶Table 1.2 Proteases of Pichia pastoris vacuole and secretory pathwayEnzyme Type Gene Zymogen formVacuole PrA Aspartic PEP4 YesPrB Serine PRB1 YesCpY Serine PRC1 YesCpS Metallo-( Zn2+) CPS1 UnknownApI Metallo-( Zn2+) LAP4 YesApCo Metallo-(Co2+) DAP2 NoDPAP-B Serine SEC11 UnknownSecretory pathway signal peptidase Kex2 protease Serine KEX2 Yes Kex1 carboxypeptidase Serine KEX1 NoDPAP-A Serine STE13 Unknown,predict noYeast as partyl protease ш Aspartic Y AP3 Unknown,predict yes酵母液泡位于基质中,一方面是维持胞内pH和盐离子平衡,储藏盐离子的功能;另一方面,由于液泡中含有大量的非特异性的水解酶,较宽底物范围的内生和异源蛋白酶,液泡是降解蛋白甚至细胞器的一个重要场所,大约80%的蛋白在液泡中降解。
酵母表达系统概述及相关研究进展
酵母表达系统的研究进展和前景( XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX学院)摘要:酵母表达系统在表达真核生物蛋白方面已经得到广泛而成功的应用,表达出的重组蛋白表现出较高甚至比原物种体内的蛋白质更高的生物活性。
近年来,利用酿酒酵母和毕赤巴斯德氏酵母表达人源蛋白或肽类活性物以及其它中间体取得了新的进展。
本文主要从上游设计,重组表达,分离纯化和活性验证等方面进行了总结,并且对未来更好的利用酵母生产药物等活性物质作出展望。
关键词:酵母表达系统;蛋白分泌:异源基因;糖基化修饰;人源活性药物引言酵母作为一种表达外源基因的宿主菌, 既具有操作简单, 生长快等特点, 又具有真核细胞的翻译后修饰加工系统。
在表达某些基因工程产品时, 可以大规模生产, 从而有效地降低成本。
常用的酵母表达系统有酿酒酵母表达系统, 甲基营养型酵母表达系统和裂殖酵母表达系统。
酿酒酵母(Saccharomyces. cerevisiae)在分子遗传学方面被人们的认识最早,也是最先作为外源基因表达的酵母宿主。
但由于酿酒酵母的局限,1983 年美国Wegner 等人最先发展了以甲基营养型酵母(methylotrophic yeast)为代表的第二代酵母表达系统。
其中毕赤酵母(P. pastoris)是继S. cerevisiae之后被迅速推广的一种外源基因表达的宿主菌。
酿酒酵母难于高密度培养,分泌效率低,几乎不分泌分子量大于30 kD的外源蛋白质,也不能使所表达的外源蛋白质正确糖基化,而且表达蛋白质的C端往往被截短。
因此,一般不用酿酒酵母做重组蛋白质表达的宿主菌。
但是,可以通过基因敲除或改造用酿酒酵母表达亚单位疫苗(如HBV疫苗、口蹄疫疫苗等)或非蛋白活性物质及其中间体(如青蒿素,色素)。
与原核和其它真核表达系统相比,巴斯德毕赤酵母作为重组蛋白表达系统有以下优点[1]:(1)生长速率快,易于高密度培养(2)在几乎不含蛋白质的培养基中具有高水平产率(3)消除了内源毒性和噬菌体感染(4)易于对具有明确特征的酵母表达载体进行操作(5)对毕赤酵母的噬菌体对人没有病原性(6)具有多种翻译后修饰包括多肽折叠,糖基化,乙酰化,甲基化,蛋白质降解调控以及定位至亚细胞结构(7)能够构建分泌的蛋白,这样只需从生长培养基中提纯而不必收集酵母本身细胞。
酵母菌中表达外源蛋白的优势
2019/2/2
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Two-step gene replacement. This procedure allows the experimenter to introduce any type of mutation anywhere in the yeast genome, without leaving behind vector sequences or a selectable marker. The desired mutation with flanking sequences is cloned into a conventional plasmid that also contains a marker that can be selected both for and against. URA3 and ura4+ are usually employed for this purpose in S. cerevisiae and S. pombe, respectively. Then the plasmid is digested with a restriction enzyme that cuts once within the yeast sequences flanking the mutation and is introduced into yeast by transformation. The DNA break stimulates recombination within the flanking sequences, leading to integration of all the vector sequences and the mutated yeast sequences into the chromosome of the recipient yeast cell. Note that there is a duplication of the target sequences, with one copy containing the mutation and the other copy retaining the wild type sequence.
酵母表达系统与方法
一种常用的巴氏毕赤酵母表达载体结构图
甲醇营养型的两种酵母表达系统比较
甲醇营养型酵母表达系统的主要优点:
1. 应用AOX启动子,转录效率高,易于诱发调控; 2. 表达质粒易于整合到基因组,不易丢失,适于高密度发
1981年Hizeman等人首次报道了人重组干扰素基 因在酿酒酵母中表达并获成功。
酵母表达系统的组成
◆宿主:酿酒酵母、裂殖酵母、乳酸克鲁维亚酵母、
巴氏毕赤酵母等。
◆质粒载体
1. 质粒类型: 自主复制型质粒(Yeast replicating plasmid, YRp) 着丝粒质粒(Yeast centromeric plasmid, YCp ) 附加体质粒(Yeast episomal plasmid,YEp) (自主复制,拷贝数高,不稳定, 易丢失) 整合型载体(Yeast integrating plasmid,YIp) (稳定性好,拷贝数低) YAC载体(Yeast artificial chromosome, )
1. 以分裂的方式繁殖 2. 裂殖酵母与哺乳动物有许多相似之处 3. 表达的产物具有天然的构象和活性 4. 高效表达载体: pTL2M (含有高效的hCMV启动子)
裂殖酵母表达系统的优点
尽管裂殖酵母作为外源基因表达系统的发展远远 落后于酿酒酵母和巴氏毕赤酵母,但随着载体的发展, 裂殖酵母不仅可以表达胞内蛋白,也能高效表达膜蛋 白和分泌蛋;特别是裂殖酵母表达系统可以使外源基 因的产物保持天然的特性。因此,裂殖酵母作为外源 基因表达系被认为是最有前途的。
◆裂殖酵母表达系统
Schizo saccharomyces pombe (粟酒裂殖糖酵母)
酵母中的蛋白质表达
酵母中的蛋白质表达酵母是一类单细胞真菌,广泛存在于自然环境中。
酵母在科学研究中有着重要的地位,尤其是在蛋白质表达领域。
酵母中的蛋白质表达已经成为了生物医学研究中不可或缺的工具,可以用于研究基因功能、药物筛选以及生物制药等领域。
1. 酵母在蛋白质表达中的优势酵母的蛋白质表达系统相对较为简单和稳定,是许多科学家首选的研究工具。
首先,酵母细胞具有丰富的胞质内基因组,可以快速高效地改造和表达外源蛋白质。
其次,酵母具备较高的蛋白质折叠和翻译机制,能够更好地保持外源蛋白质的稳定性和结构完整性。
此外,酵母细胞的培养条件相对简单,成本较低,因此在大规模蛋白质表达方面具备优势。
2. 酵母中的蛋白质表达系统酵母中常用的蛋白质表达系统主要有酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)表达系统和甲酵母(Pichia pastoris)表达系统。
酿酒酵母是一种常见的真核表达系统,其广泛应用于基因功能研究和蛋白质产量较低的情况下。
甲酵母是一种高效的分泌表达系统,能够产生大量外源蛋白质,并具备良好的蛋白质折叠能力。
根据实验需求和目标蛋白质的特点,选择合适的酵母表达系统可以提高表达效率和蛋白质纯化的质量。
3. 酵母蛋白质表达的应用酵母蛋白质表达系统在科学研究和工业应用中具有广泛的应用价值。
首先,在基因功能研究中,酵母蛋白质表达可以用于高通量筛选基因功能、蛋白质相互作用以及调控网络的研究。
其次,在药物开发领域,酵母蛋白质表达系统可以用于药物靶点的鉴定和药效评价。
此外,酵母蛋白质表达系统还被广泛地应用于生物制药中,用于表达和生产重组蛋白质药物。
4. 酵母蛋白质表达的挑战和改进尽管酵母蛋白质表达系统具有众多优势,但也面临一些挑战。
首先,酵母细胞往往不能正确地折叠某些复杂蛋白质,导致表达产物不具备功能性。
其次,在大规模表达中,蛋白质的折叠和翻译机制容易因酵母细胞的酵母细胞酵母细胞酵母细胞酵母细胞酵母细胞酵母细胞肥料缺乏或其他环境变化而受到影响。
生物合成酵母蛋白的方法
生物合成酵母蛋白的方法生物合成酵母蛋白主要指的是通过基因工程技术改造酵母细胞,使其能够表达外源蛋白质的过程。
下面是一种典型的大规模生产酵母表达重组蛋白的基本流程:1. 构建重组载体:设计并合成包含目标基因的DNA序列,通常会带有酵母特异的启动子以驱动目标蛋白的表达。
将目标基因克隆到适合酵母使用的表达载体中,该载体通常包括选择标记基因,用于筛选成功转化的酵母细胞。
2. 酵母转化:使用物理(如电穿孔)、化学(如PEG介导)或生物(如原生质体制备后的转化)方法将重组载体导入到酵母细胞内,使得目标基因整合到酵母染色体或作为质粒存在于细胞内。
3. 筛选和鉴定:转化后的酵母细胞在特定的选择培养基上生长,只有成功整合了重组载体并表达了目标基因的细胞才能存活或显示特殊表型。
可通过PCR、Southern blot 或Western blot 等分子生物学技术验证目标基因是否已正确整合和表达。
4. 表达优化:对表达条件进行优化,比如调整培养温度、pH值、诱导剂的添加时机和浓度,以及培养基成分,以提高目标蛋白的表达水平和质量。
5. 发酵和收获:采用YPD或其他适宜的培养基进行大规模发酵,监控细胞生长和目标蛋白的表达情况。
当酵母细胞达到最佳生长状态或目标蛋白达到最大表达时,通过离心收集酵母细胞。
6. 细胞裂解和蛋白纯化:通过化学或机械手段裂解酵母细胞释放胞内蛋白质。
利用亲和标签(如GST、His标签等)结合亲和层析进行初步纯化,或者采用其他蛋白纯化技术进一步纯化目标蛋白。
7. 质量检测与鉴定:对纯化得到的蛋白质进行纯度和活性测定,可能还需要进行N端测序、氨基酸序列分析、酶活性检测等来确认其正确性和功能性。
以上即为利用生物技术手段合成酵母蛋白的主要步骤,实际操作中可能需要根据目标蛋白的具体性质和实验需求进行相应的调整和优化。
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酵母表达外源蛋白(foreign protein)(1)
1、菌株
用GS115表达不出蛋白,换KM71H后,大部分克隆能表达。
2、温度:
在28度和室温下诱导表达,表达水平可能都不低。
3、pH
手册上用6.0,pH提高到6.8,不表达的蛋白可能就表达出来。
BMMY的p
H7.0-7.5比较合适。
国内外做的最好的rHSA,最适pH大概 5-6左右。
p
H3的时候yeast和peptone好像会沉淀的,可以用磷酸和磷酸二氢钾调,具体比例自己去试试。
4、偏爱密码子
codon bias一般不是主要的问题,你要表达的蛋白特性才是主要问题,酵母对分子量大(30KD以上),结构复杂(如一些蛋白酶),二硫键
含量多的蛋白往往不能有效表达,尤其是分泌表达。
密码子改造对一
些较小的而且结构简单的蛋白表达量的提高可能有一些作用。
比如一
位战友用Pichia酵母表达一个单链抗体,29KD,含有2对二硫键,表达
量约几毫克每升,选用酵母偏好密码子全基因合成后,表达量没有什
么提高。
5、表达时间与空质粒转化对照
诱导时间长了以后,是会有很多蛋白分泌出来的,时间越长杂蛋白就
越多,且分子量都比较大。
最好做一个空质粒转化的对照,这样就会
比较肯定到底是不是自身的蛋白分泌的结果。
6、污染
每个样品从G418板上挑10个左右单克隆于2ml BMGY摇菌(30ml玻璃管,比LB管大一点),纱布一般用8层,一天左右看着比较浑离心,留样1m l,余1ml换2ml BMMY诱导表达,3,4层纱布足够了。
污染一般都是跟瓶口覆盖有关的原因造成的,只盖纱布肯定会污染。
加盖报纸后,就再没遇到过污染。
如果只用6层纱布,污染的可能当然
很大,100ml 三角瓶,装量10ml培养液,用橡筋把8层纱布和2层报纸
拴紧封口,空气浴摇床。
7、不表达
蛋白有没有表达就要看你的运气了,一般重复2-3次实验都没有表达
菌株,这个蛋白就放弃表达了。
8、表达量
30KD,10mg/L表达量已经很高,最直接的方法是发酵,一般提高5-10倍。
大肠杆菌一样出现大团的超表达蛋白。
9、糖基化
酵母分泌表达的N糖基化是可以预测的,有如下序列:N X S/T就是潜
在的糖基化位点,X为任意氨基酸,1个糖基化位点会加上1-3KD左右
的糖基。
另外可能还有O糖基化话,但是无法预测其位点,不过很少听
说表达蛋白有O糖基化的。
如果胞内表达,不存在糖基化的问题。
10、表型与表达
重组SalI和BglII酶切产生单交换和双交换,结果就是产生Mut+和Muts
表型的菌株;前者在甲醇诱导表达时生长快,消耗的甲醇多,后者生
长慢,消耗的甲醇少,所以诱导表达时Muts表型要求更高的菌体浓度。
一般用Mut+表型的较多,但是对某些蛋白Muts菌株可能表达的更好,
只有试试才知道你的蛋白用那种菌株表达较好。
11、培养基
YPD:最基本的培养用;BMGY:诱导表达前培养用;BMMY:诱导表达用;MD:电转化后筛选his+用。
YEPD是不能代替BMGY的,因为有葡萄糖,这样残留的葡萄糖会影响下
一步的诱导表达。
不过有一种方法是可行的,就是用YPG培养基代替,
只是把 YEPD中的葡萄糖用3%的甘油代替,也可以降低成本。
摇瓶毕竟
不能和发酵罐比,甘油残余会抑制甲醇利用。
BMGY、BMMY灭菌后才能加甲醇、磷酸钾、生物素。
配制BMMY时也没必
要用5%过滤除菌的甲醇,在灭菌后使用前加100%甲醇至你要的浓度。
YNB可以高压灭菌,没问题的,也可以0.22um过滤处理,天冬氨酸和苏
氨酸要待培养基高压灭菌后加入;配YPD时可以加入YPD一起灭菌,但
时间不能太长,温度不能太高,一般121-125度12-15分钟足够了。
若
时间过长,温度过高,可能导致YPD焦化。
glucose和含氮化合物在一
起容易产生美拉德反应,这是配制培养基中的禁忌。
颜色很深的话,
基本不能使用了。
或者含有葡萄糖和/或YNB的培养基108度35min高压
灭菌。
小量发酵其实可以把培养基成分中的YNB和生物素去除,培养基价格便宜,操作又方便,可以直接灭菌,效果也很好(效果不比含YNB的差)。
如果是用自己配置的培养基,如玉米浸提液、麦芽浸提液、麦麸浸提
液等等,可以不用换液,采取添料来维持酵母对培养基的营养需要。
用无机盐进行大规模发酵,更省钱。
大规模发酵时,甲醇的流加速度增加不要太快。
另外使用纯氧并不昂贵,在武汉买个钢瓶600元左右,一瓶纯氧20元。
一个批次100h左右估
计3-4 瓶氧气。
关于Tryptone和Peptone的选择:
1)用培养E.coli的Tryptone替代Peptone对有些酵母菌可以,例如一般
的表达酵母.但是对有酵母菌些绝对不行.例如做双杂交的 AH109,Y187
之类表达酵母,根本就长不好.
2)Tryptone和Peptone虽然都是营养胨,但营养成分不一样.即使是
一般的表达酵母可以在Tryptone生长,生长状态也没有在 Peptone中好.但tryptone和peptone就是含量上有点不同外,其他没什么区别,
用peptone的目的不是为了提供氮源,提供氮源的是培养基里面的YNB。
3)如果要求不高,一般使用也还凑合.尽可能的用Peptone,difco公司的,晶美公司代理的,甚至是其它国产的蛋白胨都可以很正常的培养绝大多数酵母菌.
4)用含Peptone的培养基颜色很深,纯化表达蛋白时颜色要去掉,所以还要进行麻烦的后续处理。
而改用Tryptone后,培养基颜色变得很浅,和LB(液体)颜色差不多,后续处理要简单些。
invitrogen说明书说 peptone的作用是防止目的蛋白被一些酶类水解,加入peptone的目的就是竞争性抑制目的蛋白的水解,因为peptone是一些小的短肽,是一些酶作用的底物。
培养毕赤酵母,书上说BIOTIN储液是水溶液,但事实上BIOTIN很难溶于水, 可以稍稍水浴加热一下。
配制500×BIOTIN stock solution(0.0 2%)有这么3种方案:
1)、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2)、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;
3)、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
MD、MM属于基础培养基,没有哪种成分会含有微量生长因子(如生物素)。
所以肯定要加的。
附:无机培养基配方
BSM无机培养基:
85% H3PO4 26.7ml/L
CaSO4 ·2H2O 0.93g/L
K2SO4 18.2g/L
MgSO4·2H2O 14.9g/L
KOH 4.13g/L
甘油 40g/L
PMT1 4.0ml/L
100%氨水调pH5.0(1瓶50ml加800ul氨水)或10g/L硫酸铵调pH5.0,氨水用于上罐调pH(便宜,方便)。
诱导表达前调 pH6.0。
pH5.0是为了防止BSM形成磷酸钙沉淀,pH6.0是表达HSA融合蛋白的最适pH。
BSM高压灭菌后再加4.0ml/L 过滤除菌的PTM1(微量元素)4.0ml/L 。
10 0%的500ml甲醇加6ml PMT1,用于补加甲醇诱导表达目的融合蛋白。
PMT1(1L)配方:
CuSO4·5H2O 6.0g/L
KI 0.088g/L
MnSO4·H2O 3.0g/L Na2MoO4·2H2O 0.2g/L H3BO3 0.02g/L
CoCl2·6H2O 0.5g/L ZnCl2 20.0g/L FeSO4·7H2O 65.0g/L Biotin 0.2g/L
浓H2SO4 5.0ml。