核酸提取的一些常规方法

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核酸纯化方大全

核酸纯化方大全

核酸纯化方大全一:酚氯仿抽提—经典的纯化技术酚氯仿抽提可算得上是核酸分离纯化技术中最经典的方法之一,该方法是由冷泉港实验室中的研究人员首先提取的,并被大量的科研究工作者进行改良使用。

其原理是:在酚氯仿的共同作用下,蛋白质会被变性,形成不溶解的物质。

由于蛋白质的密度小于酚而大于水,所以离心后,会在酚相和水相于之间,形成蛋白质中间层,从而有效地将蛋白质和核酸分离开来。

由于DNA的抽提方式有很多,这个技术并没有被试剂公司接受。

但是另一方面,使用酸性酚氯仿抽提RNA的纯化方式却被广泛接受(因为有效的RNA纯化方式并不多),其纯化原理为:在酸性酚的条件下,DNA溶解于有机相,RNA溶解于水相,而蛋白质则在中间相;从而有效地将DNA,RNA和蛋白质一起分开。

该技术的创始人是Chomczynski。

RNA-Solv Reagent (Omega Bio Tek)就是这一技术的改良产品。

这一技术的最大优点就是经济,灵活。

二:盐析法—经济型核酸抽提技术该技术原理是在组织或细胞裂解液中,加入高浓度盐(NaCl或NH4Cl,KI,KAC)来沉淀去除蛋白质,从而得到高纯度的基因组DNA。

Omega公司在这一方面有着非常卓越的产品。

基于这一技术的产品,其名称都有’SQ’。

该系列的产品最大的优点就是:经济和灵活,是目前提取基因组DNA最经济的试剂盒。

此外,Omega在首次研发了基于这一技术的DNA,RNA和蛋白质共提取的试剂盒,这一个目前最方面最快速的DNA,RNA和蛋白质共提取的试剂盒。

三:玻璃珠—第一个固液相核酸纯化技术在高离液盐(盐酸胍,异硫氰酸胍,NaI)条件下,玻璃珠会同核酸发生吸附反应,而在低盐条件下,核酸又可以被洗脱下来。

但是玻璃珠的残留以及干燥问题影响了这一技术的运用。

至目前为止,大部分的公司已经去除这个纯化技术。

早期的Omega也有许多基于这个技术的试剂盒,但是今天Omega公司只在凝胶回收中保留了这个试剂盒(Ultra-Sep Gel Extraction Kit)。

核酸的提取原理

核酸的提取原理

核酸的提取原理
核酸的提取原理主要包括以下几个步骤:细胞破碎、核酸分离、蛋白质去除和纯化。

首先,细胞破碎是将待提取的细胞样品通过物理或化学方法破坏细胞膜,使细胞内的核酸暴露出来,常见的方法有机械破碎、温度变化、酶解等。

细胞破碎后,核酸与其他细胞成分如蛋白质、碳水化合物等混合在一起,因此需要进行核酸的分离。

分离方法主要有酚-氯
仿萃取法、硅胶柱层析法和离心沉淀法等。

酚-氯仿萃取法通
过酚的亲脂性和氯仿的亲水性选择性地萃取核酸。

硅胶柱层析法则是利用硅胶封填在滤柱中,利用核酸与硅胶的亲附作用来纯化核酸。

离心沉淀法是通过高速离心将核酸从样品中沉淀下来。

在核酸分离的过程中,常常伴随着蛋白质的存在。

蛋白质的存在会干扰核酸的定量和纯度检测,因此需要进行蛋白质去除的步骤。

常用的去除蛋白质的方法有蛋白酶处理、酸性酒精沉淀和有机溶剂提取等。

最后,为了提高核酸的纯度和浓度,还需要进行纯化步骤。

纯化方法有乙醇沉淀法、酚-氯仿萃取法、离心过滤法等。

综上所述,核酸提取原理是通过细胞破碎、核酸分离、蛋白质去除和纯化等步骤将待提取样品中的核酸分离出来,以获得高质量的核酸样品。

核酸提取的原理及方法

核酸提取的原理及方法

核酸提取的常见方法及原理核酸提取作为分子实验中最基础的实验之一,几乎是所有实验的基本,无论后续的克隆、PCR、qPCR、建库测序等等都需要核酸才能顺利进行。

今天我们就来简单了解核酸提取的基本原理和方法。

1、什么是核酸核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,为生命的最基本物质之一,分为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),其中RNA又可以根据功能的不同分为核糖体RNA(r RNA),信使RNA(m RNA)和转移RNA(t RNA)。

核酸广泛存在于所有动植物细胞、微生物内、生物体内的核酸常与蛋白质结合形成核蛋白。

不同的核酸,其化学组成、核苷酸排列顺序等不同。

DNA主要集中在细胞核内,线粒体和叶绿体中,而RNA主要分布在细胞质当中。

2、核酸提取类型1、总RNA提取总RNA中,75-85%为rRNA(主要是28S-26S/23S和18S/16S rRNA),其余的由分子量大小和核苷酸序列各不相同的mRNA和小分子RNA如tRNA、5S rRNA、5.8S rRNA、miRNA、siRNA、小核RNA(small nuclear RNA,snRNA)及核仁小分子RNA(small nuceolar RNA,snoRNA)等组成。

2、miRNA提取MicroRNAs (miRNAs)是小型的、高度保守的RNA分子,如小干扰RNAs (siRNAs),通过与他们的碱基配对调节其同源mRNA的分子表达,以预防通过各种机制的表达。

他们已成为进行发育、细胞增殖、分化和细胞周期的重点监管机构。

3、基因组DNA提取进行基因结构和功能研究以及基因诊断,通常要求得到的片段长度不小于100~200kb。

在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。

4、质粒抽提质粒抽提方法即去除RNA,将质粒与细菌基因组DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。

核酸提取经典方法

核酸提取经典方法

核酸提取经典方法
核酸提取是分离和纯化生物样本中的核酸分子的过程。

经典的核酸提取方法通常包括以下步骤:
1. 细胞破碎和裂解:将细胞或组织样本破碎和溶解,以释放核酸。

常用的方法包括机械破碎、化学裂解和酶裂解等。

2. 蛋白质去除:将裂解后的样品进行蛋白酶处理,以去除蛋白质等杂质。

可使用蛋白酶K处理、苯酚/氯仿法或硅胶膜法等。

3. 酒精沉淀:通过加入适量的醇类,如乙醇或异丙醇,使核酸沉淀下来。

通常会加入盐类,如氯化钠或乙酸钠,以调节溶液的离子浓度。

4. 洗涤:将核酸沉淀物进行洗涤,以去除沉淀物中的杂质。

常用的洗涤方法包括乙醇洗涤法、酚/氯仿洗涤法或硅胶膜洗涤法。

5. 溶解:将洗涤后的核酸沉淀溶解于适当的缓冲液中,以得到高纯度的核酸。

常用的溶解缓冲液包括Tris-HCl缓冲液或无酶水。

上述方法是常见的经典核酸提取方法,但随着科学技术的发展,现代的核酸提取方法也在不断改进和更新,以提高提取效率和纯度。

如今,还有各种基于磁珠、
膜片、筛膜、电泳和自动化设备等的高通量、高效、自动化的核酸提取方法被广泛应用于科学研究和临床诊断。

核酸提取破碎细胞的方法

核酸提取破碎细胞的方法

核酸提取破碎细胞的方法
核酸提取破碎细胞的方法有多种,以下提供两种:
1. 机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法。

关于超声波处理法,要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间。

2. 化学试剂法:用含SDS或CTAB的溶液处理细胞,在一定的pH环境和
变性条件下,细胞破裂,蛋白质变性沉淀,核酸被释放到水相。

pH环境则
由加入的强碱(NaOH)或缓冲液(TE、STE等)提供。

表面活性剂或强离子剂可使细胞裂解、蛋白质和多糖沉淀。

缓冲液中的一些金属离子螯合剂(EDTA等)可螯合对核酸酶活性所必须的金属离子Mg2+ 、Ca2+ ,从而抑制核酸酶的活性,保护核酸不被降解。

此外,反复冻融法也是一种常用的细胞破碎方法:将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。

请注意,具体使用哪种方法需要依据实验需求和条件来选择。

在操作过程中,也需要注意安全问题。

核酸提取经验及原理总结

核酸提取经验及原理总结

核酸提取经验及原理总结核酸提取是分子生物学研究中的一项重要技术,它可以从生物样品中分离和纯化出目标的核酸分子,为后续的实验操作提供基础。

本文将对核酸提取的经验和原理进行总结,以帮助读者更好地理解和应用该技术。

核酸提取的经验总结:2.样品的预处理:在核酸提取前,需要对样品进行一些预处理,如细胞裂解、组织破碎等。

这些步骤有助于释放和保护核酸分子,促进提取效果。

3.溶解和裂解:核酸提取的第一步是将样品溶解和裂解,以释放核酸分子。

溶解缓冲液常用于裂解样品,并加入蛋白酶进行蛋白质降解。

此时需要考虑样品的特性和实验要求,选择合适的裂解缓冲液和裂解方法。

4.核酸分离:核酸分离是核酸提取的关键步骤,常用的分离方法有酚-氯仿法、硅胶柱法和磁珠法等。

在选择分离方法时需考虑样品的类型和实验要求,以及各种方法的特点和优势。

5.纯化和浓缩:提取的核酸分子中常含有杂质,需要进行纯化和浓缩。

常用的纯化方法有酚-氯仿法、琼脂糖凝胶电泳法和商用纯化试剂盒等。

纯化后的核酸可以进行浓缩,以提高其浓度和纯度。

6.质量检测:核酸提取后,需要对提取的核酸分子进行质量检测。

常用的检测方法有琼脂糖凝胶电泳、比色法和荧光分析等。

通过检测可以了解核酸的浓度、纯度和完整性,为后续实验提供准确的数据。

核酸提取的原理总结:1.细胞裂解和溶解:细胞裂解是将细胞壁和细胞膜破坏,使细胞内容物暴露在溶液中。

细胞溶解液中常含有裂解缓冲液和蛋白酶等物质,以促进细胞的裂解和蛋白质的降解。

2.核酸分离和纯化:核酸在细胞溶解液中可以与其他细胞成分分离,常用的方法有酚-氯仿法。

酚可溶于水,而氯仿可溶于有机溶剂,通过两相溶剂的分层,可以将核酸沉淀到有机相中,从而实现核酸的分离。

3.杂质去除和浓缩:通过纯化方法,可以将核酸与其他杂质分离。

如硅胶柱和磁珠法通过静电吸附和洗脱来除去杂质,商用纯化试剂盒则通过离心柱等固相材料来实现。

纯化后的核酸可以进行浓缩,以提高其浓度和纯度。

4.质量检测:核酸提取后,需要对提取的核酸进行质量检测。

核酸提取的一些常规方法

核酸提取的一些常规方法

1. 乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀DNA原理是什么原理是什么原理是什么原理是什么????乙醇能够消除核酸的水化层,使带负电荷的磷酸基团暴露出来。

Na+之类的平衡离子能够与这些带电基团结合,在沉淀形成部位降低多核苷酸链之间的排斥作用。

因此只有在阳离子的量足以中和暴露的磷酸残基的电荷时才会发生乙醇沉淀。

最常用的阳离子:1)醋酸铵:贮存液10.0mol/L 终浓度 2.0~2.5mol/L 常用于减少多余的杂质(如DNTP及多糖)与核酸的共沉淀。

例如在2mol/L醋酸铵存在的情况下连续两次DNA沉淀可从DNA制品中除去>99%的dNTP。

在通过琼脂糖酶消化琼脂糖之后沉淀核酸时,使用醋酸铵也是最佳选择,这种阳离子可以减少寡糖消化产物共沉淀的可能性。

然而若用沉淀的核酸进行磷酸化时,就不要用醋酸铵沉淀核酸,因为铵离子能够抑制T4噬菌体多核苷酸激酶。

2)氯化锂:贮存液8.0mol/L 终浓度0.8mol/L 常用于需高浓度乙醇进行的沉淀(如沉淀RNA)。

LiCl在乙醇溶液中的溶解度很高而且不随核酸共沉淀。

小分子RNA(如tRNA及5S RNA)在高离子强度下(没有乙醇时)是可溶的,而大分子RNA则不溶。

可以利用这个差异在高浓度LiCl(0.8mol/L)中纯化大分子RNA。

3)氯化钠:贮存液 5.0mol/L 终浓度0.2 mol/L (0.2 mol/L)用于DNA样品中存在SDS时。

这种去污剂在70%乙醇中仍为可溶。

4)醋酸钠:贮存液 3.0mol/L(ph5.2)终浓度0.3 mol/L (0.3mol/L,ph5.2)在DNA和RNA的常规沉淀中最为常用。

2. 乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀DNA和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀DNA的区别是什么的区别是什么的区别是什么的区别是什么????异丙醇和酒精都是有机溶剂,一般来讲,提取质粒的时候一开始都要用异丙醇沉淀,因为异丙醇沉淀的效果要好一些,如二楼所讲,但最后大多用酒精沉淀,因为酒精容易挥发,对下游的实验影响小。

植物和动物的核酸dna和rna提取方法

植物和动物的核酸dna和rna提取方法

提取植物和动物的核酸DNA和RNA是生物学研究中的重要步骤,它们可以帮助科学家们更深入地了解生物的遗传信息和基因表达。

本文将介绍植物和动物核酸DNA和RNA的提取方法,让读者对这一过程有一个清晰的认识。

一、植物核酸DNA提取方法1. 细胞破碎:需要将植物组织破碎,以释放细胞内的DNA。

这可以通过磨粉或切碎的方法来实现。

2. 细胞裂解:接下来,使用裂解缓冲液来裂解细胞膜和细胞壁,释放DNA分子。

裂解缓冲液的配方可以根据不同植物的特性进行调整。

3. 蛋白质沉淀:通过向裂解液中加入溴化苯酚等物质,可以沉淀掉大部分蛋白质,使得DNA分子得以分离。

4. 乙醇沉淀:将裂解液中的DNA用乙醇沉淀,这样可以将DNA分子从溶液中提取出来。

5. 溶解和纯化:将沉淀的DNA分子溶解在适当的缓冲液中,并进行进一步的纯化和浓缩处理,得到纯净的DNA溶液。

二、植物核酸RNA提取方法1. 细胞破碎:与DNA提取类似,首先需要将植物组织破碎,以释放细胞内的RNA。

2. 细胞裂解:使用特制的裂解缓冲液来裂解细胞膜和细胞壁,释放RNA分子。

不同植物组织的RNA特性可能有所不同,需要根据具体情况进行优化。

3. 蛋白酶处理:加入蛋白酶来降解蛋白质,使RNA得以更好地纯化。

4. 酚-氯仿提取:利用酚-氯仿混合液可以有效地将RNA从裂解液中提取出来,与DNA提取类似。

5. 洗涤和纯化:对得到的RNA进行洗涤和纯化处理,得到纯净的RNA溶液。

三、动物核酸DNA提取方法1. 组织裂解:将动物组织进行细胞破碎,释放细胞内的DNA。

2. 细胞裂解:使用特制的裂解缓冲液来裂解细胞膜,释放DNA分子。

对于硬质组织,可能需要较强的裂解条件。

3. 蛋白酶处理:加入蛋白酶来降解蛋白质,使DNA得以更好地纯化。

4. 酚-氯仿提取:利用酚-氯仿混合液可以有效地将DNA从裂解液中提取出来,与植物DNA提取类似。

5. 溶解和纯化:对得到的DNA进行溶解和纯化处理,得到纯净的DNA溶液。

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1. 乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀DNA原理是什么原理是什么原理是什么原理是什么????乙醇能够消除核酸的水化层,使带负电荷的磷酸基团暴露出来。

Na+之类的平衡离子能够与这些带电基团结合,在沉淀形成部位降低多核苷酸链之间的排斥作用。

因此只有在阳离子的量足以中和暴露的磷酸残基的电荷时才会发生乙醇沉淀。

最常用的阳离子:1)醋酸铵:贮存液10.0mol/L 终浓度 2.0~2.5mol/L 常用于减少多余的杂质(如DNTP及多糖)与核酸的共沉淀。

例如在2mol/L醋酸铵存在的情况下连续两次DNA沉淀可从DNA制品中除去>99%的dNTP。

在通过琼脂糖酶消化琼脂糖之后沉淀核酸时,使用醋酸铵也是最佳选择,这种阳离子可以减少寡糖消化产物共沉淀的可能性。

然而若用沉淀的核酸进行磷酸化时,就不要用醋酸铵沉淀核酸,因为铵离子能够抑制T4噬菌体多核苷酸激酶。

2)氯化锂:贮存液8.0mol/L 终浓度0.8mol/L 常用于需高浓度乙醇进行的沉淀(如沉淀RNA)。

LiCl在乙醇溶液中的溶解度很高而且不随核酸共沉淀。

小分子RNA(如tRNA及5S RNA)在高离子强度下(没有乙醇时)是可溶的,而大分子RNA则不溶。

可以利用这个差异在高浓度LiCl(0.8mol/L)中纯化大分子RNA。

3)氯化钠:贮存液 5.0mol/L 终浓度0.2 mol/L (0.2 mol/L)用于DNA样品中存在SDS时。

这种去污剂在70%乙醇中仍为可溶。

4)醋酸钠:贮存液 3.0mol/L(ph5.2)终浓度0.3 mol/L (0.3mol/L,ph5.2)在DNA和RNA的常规沉淀中最为常用。

2. 乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀乙醇沉淀DNA和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀和异丙醇沉淀DNA的区别是什么的区别是什么的区别是什么的区别是什么????
异丙醇和酒精都是有机溶剂,一般来讲,提取质粒的时候一开始都要用异丙醇沉淀,因为异丙醇沉淀的效果要好一些,如二楼所讲,但最后大多用酒精沉淀,因为酒精容易挥发,对下游的实验影响小。

异丙醇比较疏水,能很更好地沉淀核酸,用乙醇的目的是去盐,它比异丙醇更亲水,所以能去掉一些盐离子。

有时还用70%的乙醇洗样品也是为了增加盐的溶解度。

在沉淀核酸时可用乙醇与异丙醇,乙醇的极性要强于异丙醇,所以一般用2倍体积乙醇沉淀,但在多糖、蛋白含量高时,用异丙醇沉淀可部分克服这种污染,尤其用异丙醇在室温下沉淀对摆脱多糖、杂蛋白污染更为有效。

异丙醇沉淀核酸时,高浓度盐存在将使大量多糖存在在溶液中,从而可达到去多糖的作用。

但高浓度的盐存在会影响核酸的进一步操作,因此必须用乙醇多次洗涤脱盐。

异丙醇沉淀核酸:优点:为所需容积小且速度快,适用于浓度低,而体积大DNA样品的沉淀。

0.54~1.0倍体积的异丙醇可选择性沉淀DNA和大分子rRNA和mRNA;但对5sRNA、tRNA和多糖产物不产生沉淀,一般不需要在低温条件下长时间放置。

缺点:易使盐类(如NaCl、蔗糖)与DNA共沉淀;在DNA沉淀中异丙醇难以挥发除去,所以常规需要用70%的乙醇漂洗DNA沉淀数次。

乙醇沉淀核酸:沉淀DNA乙醇是首选的有机溶剂,对盐类沉淀少,DNA沉淀中所含的衡量乙醇易蒸发去处,不影响以后的实验。

在适当的盐浓度下,2倍样品容积的95%乙醇可有效沉淀DNA,对于RNA则需要将乙醇量增加至2.5倍. 缺点是总体积较大。

需在-20度放置很长时间,30分钟-1小时。

同样需要70%乙醇洗涤
“蛋白质的变性”是指蛋白质分子中的次级键被破坏。

主要是氢键和离子键。

甲醇、乙醇、丙酮等有机溶剂可以提供自己的羟基或羰基上的氢或氧去形成氢键,从而破坏了蛋白质中原有的氢键,使蛋白质变性。

而引起蛋白质沉淀的原因一方面是由于甲醇、乙醇、丙酮等有机溶剂加入水中使溶剂介电常数降低,增加了相反电荷的吸引力,另一方面是因为这些有机溶剂是强亲水试剂,争夺蛋白质分子表面的水化水,破坏蛋白质胶体分子表面的水化层而使分子聚集沉淀。

多糖分级沉淀
主要原理是通过降低水溶液的介电常数使多糖脱水从而产生沉淀来分离多糖,几乎适用于所有水溶性多糖,虽然不同多糖可在不同浓度乙醇的条件下分步沉淀,但特异性不高,导致对所需多糖的分离选择性较差,要提高多糖的纯度需经反复
的极性而改变混合组分溶液中某些成分的溶解度,使其从溶液中析出。

如在含有糖类或蛋白质的水溶液中,分次加入乙醇,使含醇量逐步增高,逐级沉淀出分子量段由大到小的蛋白质、多糖、多肽在含皂苷的乙醇溶液中分次加入乙醚或丙酮可使极性有差异的皂苷逐段沉淀出来等。

沉淀物的结构不仅与乙醇浓度等有关,还与加乙醇的顺序有关。

如先加乙醇后加料分子较大,先加料后加乙醇则分子较
极性也就增大根据相似相溶就是极性的有机物易容于极性的溶剂,极性小的易溶于极性小或非极性溶剂多糖极性较大在水中的溶解性很好不过在醇的溶解性很低所以将醇加到含有多糖的水溶液中可以改变的水溶液的极性极性大的多糖最先溶出来极性下的最后溶出来做到了分级纯化其实这也是浓缩
糖进行提取。

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