IEF-SDS PAGE双向电泳技术
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双向电泳
一、材料
样品:人神经母细胞瘤细胞SK-N-SH
二、试剂
SDS-PAGE所需试剂
1、30%Acry-Bis (w/v)
29.2%Acry 29.2g
0.8%Bis 0.8g
加水至100ml溶解,棕色试剂瓶4℃贮存,PH<7,数月后重配
2、10%的SDS贮液(w/v)
RT保存,因SDS在4℃会析出
3、Tris-HCl buffer
①1.5M的PH8.8的Tris-HCl buffer——分离胶buffer
100ml含Tris 18.171g,加DDW至80ml,用浓HCl调PH8.8,再定容至100ml,4℃保存
②1.0M的PH6.8的Tris buffer——浓缩胶buffer:
50ml 含Tris 6.057g,加DDW至40ml,用浓HCl调PH6.8,再定容至50ml,4℃保存
4、TEMED
以游离碱形式发挥作用,催化AP形成自由基,故PH较低时,聚合反应受抑制,易吸湿,被氧化,从无色变为黄色,故因密闭4℃保存
5、10%AP
1g的AP溶于10ml水中,4℃保存,隔周新鲜配置
6、PH8.3 电泳缓冲液1L,RT保存
终浓度
Tris碱3g 250mM
Gly(25.05)14.4g 250mM
SDS 1g 0.1% (192mM)
加水至1L,可不调PH
7、甘油液4℃31ml
丙三醇 5.5ml
DDW 25.5ml
8、考马斯亮蓝染液CBB (RT,50%甲醇+冰醋酸+R250)
总体积100ml 终浓度
甲醇Methanal 45ml 45%
水45ml
冰醋酸10ml 10%
R250 0.25g 0.1%
改进:(0.12% G250, 10% (NH4)2SO4, 10% H3PO4, 20% 甲醇)
100ml H2O+100ml H3PO4(先混匀,产热的)+100g粉末状(NH4)2SO4(边搅拌边加)先溶解,然后加入1.2g G250再溶解(不能真正溶解),定容至800ml,边搅拌边加200ml甲醇,终体积1000ml(可至少保存半年)。
9、脱色液
7.5ml的冰醋酸
5ml的甲醇
加水至100ml
或者用含有少量NaCl的清水进行脱色
IEF 试剂
10、一向裂解液Lysis buffer ,-80℃贮存
总体积MW 10ml 终浓度
urea 60.06 4.2042g 7M 硫脲(thiourea) 76.12 1.5224g 2M CHAPS 614.89 0.4g 4%
DTT 154.25 0.108 70mM Amphylyte PH3~9.5 200μl
Tris-base 121.14 0.048456g 40mM
临用前加EGTA (100mM) 400μl 4mM PMSF(100mM) 200μl 2mM
11、一向管胶覆盖液Overlay buffer ,-80℃贮存
Lysis buffer 稀释一倍即可
12、上下槽电泳液(现配)
上槽阴极液(20mM的NaOH):10ml 1M的贮液加水至500ml 下槽阳极液(10mM的H3PO4):5ml 1M的贮液加水至500ml 注:若分离碱性蛋白,上下槽电极液互换
13、平衡缓冲液:一向管胶之后的balance buffer
2% SDS
10%甘油
5%β-巯基乙醇/DTT
62.5mM的Tris-HCl (PH6.8)
微量溴酚蓝
100ml 200ml 终浓度SDS 2g 4g 2%
甘油10ml 20ml 10% β-巯基乙醇/DTT 5ml/1.54g 10ml/3.08g 5% Tris-base 0.757125 1.51425 62.5mM
14、固定液
50%的甲醇+10%的乙酸
15、一向管胶配方
14~15cm*4 14~15cm*8 尿素 1.152g 2.304g
DDW 160μl 320μl 10% NP-40 160μl 320μl
30%Acry-Bis 400μl 800μl 甘油液744μl 1488μl
Amphylyte
PH4~6 18μl 36μl PH6~8 18μl 36μl PH3~9.5 36μl 72μl
10%APS 3.2μl 6.4μl
TEMED 0.8μl 1.6μl
16、分离胶40ml 18*16*0.1cm (1块)
胶浓度12.5% 12.8% 13%
DDW 12.4ml 12.13ml 11.87ml 30% Acry-Bis 16.8ml 17.07ml 17.33ml
1.5M PH8.8 Tris 10ml 10ml 10ml
10% SDS 400μl 400μl 400μl 10% AP 400μl 400μl 400μl TEMED 16μl 16μl 16μl
17、5% 浓缩胶 3.2ml 18*1.5*0.1cm (一块)
H2O 1.84ml
30% Acry-Bis 0.536ml
1M PH6.8 Tris 0.8ml
10% SDS 0.032ml
10% AP 24μl
TEMED 4μl