小鼠microRNA-125b过表达载体构建 毕业论文

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microRNA-125b对人视网膜母细胞瘤增殖和凋亡作用实验研究

microRNA-125b对人视网膜母细胞瘤增殖和凋亡作用实验研究

microRNA-125b对人视网膜母细胞瘤增殖和凋亡作用实验研究田冰玉;白淑玮;康前雁【期刊名称】《陕西医学杂志》【年(卷),期】2017(046)011【摘要】Objective:To evaluate the expression level of microRNA-125b(miR-125b)in retinoblastoma and study its roles in cell proliferation and apoptosis.Methods:The expression of miR-125b was detected by real-time PCR in retinoblastoma Y79 cell lines.The synthesized miR-125b mimic and miR-125b inhibitor was transfected into retinoblastoma Y79 cell lines.The cell proliferation and apoptosis were measured by CCK-8 and flow cytometry re-spectively.Results:MiR-125b was significantly up-regulated in retinoblastoma Y79 cell lines.Expression of miR-125b in miR-125bmimic group(Y79 cells+ miR-125bmimic)was significantly up-regulated compared with miR-NC group(untreated Y79 cells)(P<0.05).It apparently promotes RB cell proliferation and suppresses cell apoptosis in miR-125bmimic group compared with miR-NC group(P<0.05),while it apparently suppresses RB cell proliferation and promotes cell apoptosis in miR-125bmimic group compared with miR-NC group(P<0.05).the suppressor gene DRAM2 may be identified as direct target of miR-125b.Conclusions:MiR-125b may act as an oncogene in reti-noblastoma through regulation of cell proliferation and apoptosis.%目的:探讨microRNA-125b(miR-125b)在人视网膜母细胞瘤细胞中的表达,及其对肿瘤细胞增殖抑制和诱导凋亡的作用.方法:采用RT-PCR方法检测miR-125b在视网膜母细胞瘤细胞系Y79中的表达;构建miR-125b过表达(miR-125bmimic)和抑制载体(miR-125inhibitor)转染Y79细胞,检测miR-125b表达情况;通过细胞凋亡实验和细胞增殖实验(CCK-8)观察 miR-125b过表达和抑制表达后,对肿瘤细胞增殖力和凋亡的影响.结果:miR-125b在人视网膜母细胞瘤细胞系中Y79细胞系中呈高表达;miR-125bmimic组(Y79+ miR-125bmimic)中miR-125b的表达较miR-NC 组(未处理的 Y79细胞)表达显著增多,差异具有统计学意义(P< 0.05);miR-125binhibitor组(Y79+miR-125binhibitor)中miR-125b的表达较miR-NC组表达显著减少,差异具有统计学意义(P<0.05);miR-125bmimic组较miR-NC组相比,Y79细胞增殖力显著增高,细胞凋亡显著下降,差异具有统计学意义(P<0.05);而miR-125inhibitor组较miR-NC组相比肿瘤细胞增殖力显著下降,细胞凋亡率显著提高,差异具有统计学意义(P<0.05).miR-125b可能是通过DRAM2基因来发挥其致癌作用;结论:miR-125b 可能作为癌基因在视网膜母细胞瘤中发挥作用,并对肿瘤细胞增殖和凋亡具有显著影响.【总页数】4页(P1491-1493,1544)【作者】田冰玉;白淑玮;康前雁【作者单位】西安交通大学第一附属医院眼科西安710061;西安市第四医院眼科西安710004;西安市第四医院眼科西安710004;西安交通大学第一附属医院眼科西安710061【正文语种】中文【中图分类】R392.3【相关文献】1.脂多糖调控Notch信号通路作用于人牙髓干细胞增殖、分化、凋亡的实验研究[J], 项海东;李浩渤;陈惠珍2.L-左旋肌肽对人肝癌细胞HepG2增殖及凋亡作用的实验研究 [J], 刘强;彭玉萍;戴社教;马小斌3.洛铂对人肝癌细胞HepG2增殖及凋亡作用的实验研究 [J], 次旦旺久;赵相轩;林坤;张强;卢再鸣;王晓明4.长链非编码RNA MALAT1靶向miR-570-3p对人视网膜母细胞瘤细胞系SO-Rb50增殖、凋亡和侵袭的调控作用 [J], 闫义涛;王晓丽;谷圆圆;任艳凡;胡俊喜5.秦巴硒菇提取物对人肝癌细胞株SMMC-7721增殖与凋亡的调节作用的实验研究 [J], 李娟; 袁作辉; 杨帆; 王倩凤因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

MicroRNA—125 的生理功能及其在疾病中的作用

MicroRNA—125 的生理功能及其在疾病中的作用

MicroRNA—125 的生理功能及其在疾病中的作用MicroRNAs(miRNAs)是一类小的非编码RNA分子,其可以在转录后水平调节基因表达。

miR-125是在不同种属生物中高度保守的miRNA。

miR-125家族的成员已经被证实能够在多种不同类型的疾病中表达改变,并调控疾病的发生。

此外,miR-125在免疫宿主防御,尤其是在对细菌或病毒的感染中起到至关重要的作用。

本文着重总结了miR-125家族的生理功能以及其在肿瘤以及免疫系统疾病、造血系统恶性疾病、心血管疾病中的作用,也讨论了miRNA家族在未来作为生物标志物和治疗靶点的发展前景。

[Abstract] MicroRNAs (miRNAs)are emerging as small non-coding RNA molecules that regulate gene expression at a post-transcriptional level. miR-125 is a highly conserved miRNA throughout diverse species. Members of miR-125 family have been validated to be changed,exhibiting its different roles in many different types of diseases. Furthermore,miR-125 plays a crucial role in immunological host defense,especially in response to bacterial or viral infections. In this review,summarizes the pathophysiological functions of miR-125 family in various diseases,focusing on carcinoma and host immune responses,malignant diseases in hematopoietic system,cardiovascular diseases and so on,also discuss the potential of miRNA family as promising biomarkers and therapeutic targets for different diseases in future.[Key words] miR-125;Carcinoma;Autoimmune disease;Malignant diseases in hematopoietic system;Cardiovascular diseaseMicroRNAs(miRNAs)是一类18~25 nt长度的小分子非编码单链RNA,miRNAs通过不完全或完全结合到靶基因mRNA的3′非翻译区(3′UTR),从而降解靶基因mRNA或抑制其翻译,实现对靶基因表达水平的转录后调控,从而参与调控个体发育、细胞代谢、增殖、分化和凋亡等多种生物学过程[1-3]。

microRNA过表达载体构建技术的实验研究

microRNA过表达载体构建技术的实验研究

microRNA过表达载体构建技术的实验研究姜彬【摘要】目的:构建microRNA的表达载体,再转染生物体细胞观察该microRNA的转录或表达情况,以获知它的作用机理及对生物体的影响。

方法:以microRNA-21(简化为miR-21)为例说明构建表达载体的方法。

根据microRNA的成熟序列以及附近约200多碱基共约470个碱基序列,设计PCR 引物,PCR扩增,PCR产物和pcDNA3.1(+)质粒双酶切后,用T4连接酶进行连接反应,并转化入感受态细胞,筛选后对重组质粒进行双酶切、琼脂糖凝胶电泳鉴定及测序分析,并将其转染 Hela细胞,经 RT-PCR实验检测其表达情况。

结果:pcDNA3.1(+)/miR-21过表达载体转染细胞后使得miR-21在细胞中过表达。

结论:成功构建了miR-21的真核表达载体,为进一步研究miR-21功能及作用机制奠定实验基础。

%This article introduces how to construct miRNA-21 overexpression vector and transfect it into cell ( Hela). Then the level of expression of miR-21 was observed. The miR-21 precursor is amplified by PCR method ,then the recombinant vector pcDNA3.1 (+ ) and miR-21 are constructed. After screening and identifying the recombinant ,it is transfected into cancer cells (Hela).The miR-21 expressing level is detected by RT-PCR.The result shows that the level of the miR-21 expression increases significantly in the cells that are transfected the recombinant. The miR-21 overexpression vector is successfully constructed ,and a foundation for studying the function of miR-21 is established .【期刊名称】《实验技术与管理》【年(卷),期】2014(000)001【总页数】5页(P41-44,48)【关键词】微小RNA;miR-21;pcDNA3.1(+)【作者】姜彬【作者单位】北京大学医学部生化系,北京 100191【正文语种】中文【中图分类】Q5221 microRNA概述1993年,Lee等[1]在线虫中发现了小分子单链非编码RNA,其长度只有22nt,当时命名为1in-4。

微小RNA-125b及其靶基因信号素分子4C在乳腺癌中的表达及意义

微小RNA-125b及其靶基因信号素分子4C在乳腺癌中的表达及意义

微小RNA-125b及其靶基因信号素分子4C在乳腺癌中的表达及意义赵遵兰;卢晓辉;王洋洋;吴海华;夏春磊;陈素莲;杨清玲;陈昌杰【期刊名称】《蚌埠医学院学报》【年(卷),期】2015(40)10【摘要】目的:探讨微小RNA(microRNA,miR)-125b及其靶基因信号素分子(SEMA)4C在乳腺癌组织(BRCR)及其癌旁正常组织(NCT)中的表达情况,并分析其与临床病理学特征的关联性及意义.方法:采用荧光定量PCR检测24 例BRCR及其NCT中miR-125b的表达,采用免疫组织化学方法检测40例BRCR及其NCT中SEMA4C的表达.统计分析两者表达水平与患者的年龄、组织学分级、临床分期、淋巴结转移,雌、孕激素受体和人表皮生长因子受体-2(cerbB-2)等临床病理学特征间的关联性.结果:SEMA4C表达在BRCR中高于NCT,SEMA4C表达在淋巴结转移和cerbB-2表达间差异均有统计学意义(P<0.01和P<0.05),而在患者年龄,组织学分级,肿瘤临床分期及雌、孕激素受体表达间差异均无统计学意义(P>0.05).miR-125b表达在BRCR中低于NCT(P<0.05),其表达在SEMA4C、淋巴结转移以及cerbB-2差异均有统计学意义(P=0.034 ~P=0.022).结论:在乳腺浸润性导管癌中SEMA4C表达升高,miR-125b表达降低,两者均与cerbB-2过表达以及淋巴结转移均有一定关系,提示SEMA4C为miR-125b靶基因之一,miR-125b可能是一个新的乳腺癌标志物.%Objective:To explore the expressions of microRNA(miR)-125b and its target gene semaphorin4C(SEMA4C) in breast cancertissue(BRCR) and adjacent normal tissue(NCT),and analyze its correlation with clinicopathologic features and significance. Methods:The expressionsof miR-125b in 24 BRCR and NCT were detected using real-time quantitative PCR,and the expressions of SEMA4C in 40 BRCR and NCT were detected by immunohistochemistry. The relationships between the expressions of miR-125b and SEMA4C and clinico-pathological parameters including age,clinical staging,lymph node metastasis,estrogen receptor,progesterone and human epidermal growth factor receptor-2(cerbB-2) were analyzed. Results:The expression of SEMA4C in BRCR was higher than that in NCT,the difference between the expression of SEMA4C and cerbB-2 in lymph node metastasis tissue was statisticallysignificant(P<0. 01 and P<0. 05). The differences of the age,histological grading,clinical staging,and estrogen and progesterone receptors were not statistically significant(P>0. 05). The expression of miR-125b in BRCR was lower than that in NCT(P <0. 05),the differences between the expression of SEMA4C and cerbB-2 in lymph node metastasis tissue were statistically significant ( P =0. 034 to P =0. 022). Conclusions:The expressions of miR-125b and SEMA4C in breast invasive ductal carcinoma increase and decrease, respectively,which is associated with lymph node metastasis and cerbB-2 level. The SEMA4C is one target gene of miR-125b,and miR-125b may serve as a potential breast cancer marker.【总页数】4页(P1301-1304)【作者】赵遵兰;卢晓辉;王洋洋;吴海华;夏春磊;陈素莲;杨清玲;陈昌杰【作者单位】蚌埠医学院临床检验诊断学实验中心,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院临床检验诊断学实验中心,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院临床检验诊断学实验中心,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院临床检验诊断学实验中心,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院生物科学系,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院生物化学与分子生物学教研室,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院生物化学与分子生物学教研室,安徽蚌埠233030;蚌埠医学院生物化学与分子生物学教研室,安徽蚌埠233030【正文语种】中文【中图分类】R737.9【相关文献】1.存活素、微小染色体维持蛋白2在乳腺癌中的表达及其临床意义 [J], 栗东海;刘明2.雷帕霉素靶分子信号转导通路在增生性玻璃体视网膜病变中的表达及意义 [J], 才娜;刘宁宁;柳力敏;万超;王昕华;陈蕾3.微小RNA-144-3p及其靶基因NFE2L2在宫颈癌中的表达及临床意义 [J], 王志景;王慧;何全中;孙力4.miRNA及其靶基因EZH2在乳腺癌中的表达及临床意义 [J], 李朝夕; 黄建军; 黄健; 张姝; 何芸; 陆景润; 刘敏; 莫非; 罗扬勇; 刘晋廷5.p-STAT3/p-AKT信号通路及其靶基因CyclinD1在基底细胞癌皮损中的表达及其临床意义 [J], 任双双;邓玉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

MicroRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化过程中的作用和机制探讨的开题报告

MicroRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化过程中的作用和机制探讨的开题报告

MicroRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化过程中的作
用和机制探讨的开题报告
题目:MicroRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化过程中的作用和机制探讨
研究背景和意义:
胚胎干细胞是具有自我复制和多向分化能力的细胞,具有重要的生物学和医学应用潜力。

胚胎干细胞分化为不同类型的细胞是通过复杂的信号调控网络来实现的,其中包括miRNA对基因表达的调控。

与其它的miRNA相比,miRNA-125b在胚胎干细胞中的表达水平特别高,与胚胎发育和干细胞分化相关。

研究内容和方法:
本研究将使用小鼠胚胎干细胞作为模型,通过给小鼠胚胎干细胞表达过度或抑制miRNA-125b的表达,观察其对胚胎干细胞自我更新能力和多向分化能力的影响。

同时,使用Western blot和qPCR等方法,检测miRNA-125b对相关基因的表达水平的影响。

最后,通过miRNA-125b的靶基因预测和验证等方法,探讨miRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化中的作用和机制。

研究意义:
通过研究miRNA-125b在小鼠胚胎干细胞分化中的作用和机制,可以更好地理解胚胎干细胞分化的调控机制。

同时,该研究也有助于探讨miRNA在细胞分化调控中的作用,为干细胞治疗提供新的思路和方法。

microRNA过表达载体具体步骤及说明

microRNA过表达载体具体步骤及说明

microRNA过表达载体具体步骤及说明microRNA 过表达载体具体使用说明及步骤MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,通常长为18~25nt,能够通过与靶mRNA 特异性的碱基配对结合,引起靶序列降解或抑制其翻译,从而对基因进行转录后的表达调控(如右图所示)。

GenePharma MicroRNA 载体利用CMV 启动子可以在众多哺乳动物细胞中快速、高效、持续表达pre-miRNA,经过Drosha(RNase Ⅲ)作用形成small hairpin pre-miRNAs。

在使用载体法针对某一MicroRNA 进行过表达研究过程中,通常会遇到如下几个问题:实验对照组的确立、细胞转染条件的确定、基因表达效率的检测。

1、实验对照组的确立在一个完善的MicroRNA 表达实验设计中,必须考虑设立正确合理的实验对照组。

通常,这些对照组包括载体阴性对照组、转染试剂对照组。

载体阴性对照可以有两种,一种是采用通用的阴性对照组,在本试剂盒中包括了该对照所需的载体(microRNA),可以表达与目的基因序列无同源性的microRNA 片段;另一种是将目的microRNA 的序列打乱后重新组合所得的阴性对照(scrambled)。

对照组的设立对于MicroRNA 表达研究是很有必要的,您可以利用载体对照来确认microRNA 实验中转染、RNA提取和基因表达检测方法的可靠性。

2、细胞转染条件的确定使用MicroRNA 载体转染细胞时,为了选择合适的转染方法和确定转染效率,通常采用报告基因来检测DNA 的导入情况。

最常用的报告基因是绿色荧光蛋白。

3、MicroRNA 表达的检测通常用两大类方法来检测MicroRNA 表达效率,一类方法是直接检测MicroRNA 的变化水平,常用的方法如northern 杂交、芯片(microarrays)以及核糖核酸酶保护分析,但这些传统的方法都需要用到标记探针与纯化的RNA 进行杂交,由于成熟的miRNAs 及其前体共享一段共同的靶序列,而且目前的这些方法有无法通过大小将其分开,因此很难专一识别成熟的MicroRNA,导致较高的背景信号。

miRNA过表达或干扰

miRNA过表达或干扰

miRNA过表达或干扰尽管第一个microRNA是在1993年发现的,但直到最近几年,人们才开始了解这种小RNA分子的大作用。

miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。

最近的研究表明它们影响了约三成的基因。

miRNA在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。

同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。

然而,miRNA很小,这就增添了研究的难度。

如何从细胞中提取和纯化miRNA?如何上调或下调特定的miRNA?如何验证结果?全靠自己摸索,体会是很深,但时间也花不少。

收集了来自顶尖研究院的专家的实际操作经验,这将让你少走弯路。

Q1:您使用什么方法来上调或下调特定的miRNA?为什么?Galina Gabriely(哈佛大学)对于miRNA的下调,我们使用修饰的反义寡核苷酸,因为它们能产生最特异的抑制。

此外,我们也使用LNA修饰的oligo。

这些oligo与miRNA的高亲和力结合,提供了强的抑制,不过它们偶尔会有脱靶效应。

对于上调,我们使用Ambion 的合成miRNA模拟物。

Peng Jin(埃默里大学)我们使用RNA oligo和载体的方法。

对于RNA oligo方法,我们采用类似siRNA 双链的miRNA,及anti-miRNA来增加或阻断特定miRNA的活性。

这种方法便于操控细胞培养中特定miRNA的活性。

载体方法有着长期改变的优势,能够追踪个别细胞。

我们利用人工的shRNA质粒或Pol II表达载体,来过表达特定的miRNA。

对于miRNA的下调,我们要么表达一个shRNA,它能产生与miRNA前体的茎环结构互补的siRNA,要么使用miRNA海绵(miRNA sponge),它能在特定miRNA的多个目标位点表达报告基因。

Winston Kuo(哈佛大学)目前有两种通用策略:1) 基于载体或病毒的miRNA或miRNA反义链序列的过表达;2) 外源miRNA双链或反义抑制剂的转染。

microRNA-125b在孕期酒精暴露所致新生小鼠脑神经元凋亡中的作用

microRNA-125b在孕期酒精暴露所致新生小鼠脑神经元凋亡中的作用

* 基 金 项 目 :四川省卫生和计生委科研课题(I8PJ043) A 通f丨i •作者:李 思 秀 ,E - m ail: 4 9 丨5 2 6 丨2 丨@ qq. com
广东医学 202丨年 5 月 第 42 卷第 5 期 Guangdong Medical Journa丨 May 2021 , Vol. 4 2 ,No. 5
Bax表达明显下降( P <0.05) 结 论 miR125b 通过影响丨>53通路进而参与影响孕期酒精暴露致小鼠脑神经
元凋亡.,
【关键词】 胎儿酒精综合征;mim25l>; p5 3 ; 细胞凋亡
【中图分类号】 R741.02;K363.2
【文献标志码】 A
1)01 ;10. 13820/ki.gtlyx.20193278
【A b stra ct】 O bjective To investigate the role of m iK125h in alcohol utero exposure induced neuron apoptosis. M ethods Pregnant mice were exposed to alcohol (5 0 % 5 jjL l/g /d ) during the whole gestation and assigned as exposed group ;while mice of control group were exposed to normal saline. H rain/birth weights ratio were detec ted, runnel method was applied for assessm ent of neuron apoptosis;and mRNA levels o( niiK125l), p53 and apoptosis related gene Bax were measured by Q - PCR methods. W estern blot was used to detect protein levels of |)53 and Bax. In vitro, PC - 12 cells were exposed to ethanol, and m iK125b mimic- was transfected to PC - 12 cells to up - regulate m iR 125l);and m iR 125h, p53 aritl Bax expression levels were detecled. R esults B rain/hirth weight ratio of nevvljorn m ice in alcohol exposed group were significantly lower than those in conlrnl group ( P < 0 . 0 5 ) . Neuron apoptosis level was increased in exposed group. miK125l) expression was .signiliraiilly reduce^l in exposed gro u p ;p53 and IJax were significantly incieased holh in mRNA and protein levels in exposed groups, compared to control group ( < 0 . 0 5 ). m iR125b mimic transfection induced o v e rexpression of m iK 125b ( P < 0. 05 ) ; thus p53 and Bax significantly decreased both in mRNA and protein levels after m iK I25h up - regulation after ethanol exposure ( P < 0. 05 ) . C onclusion Alc ohol exposure during gestation may cause neuron apoptosis through decrease of inil{125l), which might negative regulate |>53.

microRNA-125b在多种慢性肝病发生发展中的作用

microRNA-125b在多种慢性肝病发生发展中的作用
: ; ; . Avalriolus Rchirognihc tlivser dRiseeasseesranvdethde.establishment of non - invasive differential methods. Key words MicroRNAs Liver Diseases Gene Expression Regulation
卢能源,等. microRNA -125b 在多种慢性肝病发生发展中的作用
725
0
microRNA - 125b 在多种慢性肝病发生发展中的作用
卢能源1,王佳慧1,钟芳菲1,汪 磊1,彭 岳2,赵铁建2,郑 洋1
1 广西中医药大学赛恩斯新医药学院,南宁530021;2 广西中医药大学基础医学院生理教研室,南宁530021
)和 (转录成 )两个基因座转 miR - 125b - 1 21q21
miR - 125b - 2
标准为以肝细胞脂肪变性的肝活检、血液生物标志物及影像学
录而来[6]。新兴证据表明,miR -125b 参与调控多种慢性肝病, 方面证据为基础,同时合并2 型糖尿病或超重和肥胖或代谢功
能障碍的肝脏疾病[7 - 8]。规定的代谢功能障碍主要指自身存
: ( ) Abstract MicroRNA miRNA is a type of small non - coding RNA and acts as a post - transcriptional regulator of gene expression. This
, , article briefly describes the etiology of various chronic liver diseases including metabolic dysfunction - associated fatty liver disease chronic , , , , , hepatitis B chronic hepatitis C chronic drug - induced liver injury liver cirrhosi and summarizes related

microRNA 过表达载体具体步骤及说明

microRNA 过表达载体具体步骤及说明

microRNA 过表达载体具体使用说明及步骤MicroRNA(miRNA)是一类真核生物内源性的小分子单链RNA,通常长为18~25nt,能够通过与靶mRNA 特异性的碱基配对结合,引起靶序列降解或抑制其翻译,从而对基因进行转录后的表达调控(如右图所示)。

GenePharma MicroRNA 载体利用CMV 启动子可以在众多哺乳动物细胞中快速、高效、持续表达pre-miRNA,经过Drosha(RNase Ⅲ)作用形成small hairpin pre-miRNAs。

在使用载体法针对某一MicroRNA 进行过表达研究过程中,通常会遇到如下几个问题:实验对照组的确立、细胞转染条件的确定、基因表达效率的检测。

1、实验对照组的确立在一个完善的MicroRNA 表达实验设计中,必须考虑设立正确合理的实验对照组。

通常,这些对照组包括载体阴性对照组、转染试剂对照组。

载体阴性对照可以有两种,一种是采用通用的阴性对照组,在本试剂盒中包括了该对照所需的载体(microRNA),可以表达与目的基因序列无同源性的microRNA 片段;另一种是将目的microRNA 的序列打乱后重新组合所得的阴性对照(scrambled)。

对照组的设立对于MicroRNA 表达研究是很有必要的,您可以利用载体对照来确认microRNA 实验中转染、RNA提取和基因表达检测方法的可靠性。

2、细胞转染条件的确定使用MicroRNA 载体转染细胞时,为了选择合适的转染方法和确定转染效率,通常采用报告基因来检测DNA 的导入情况。

最常用的报告基因是绿色荧光蛋白。

3、MicroRNA 表达的检测通常用两大类方法来检测MicroRNA 表达效率,一类方法是直接检测MicroRNA 的变化水平,常用的方法如northern 杂交、芯片(microarrays)以及核糖核酸酶保护分析,但这些传统的方法都需要用到标记探针与纯化的RNA 进行杂交,由于成熟的miRNAs 及其前体共享一段共同的靶序列,而且目前的这些方法有无法通过大小将其分开,因此很难专一识别成熟的MicroRNA,导致较高的背景信号。

过表达微小RNA miR-125b对人胚胎干细胞增殖的影响

过表达微小RNA miR-125b对人胚胎干细胞增殖的影响
YUE We 2 PEI n. Xu —T 2 e ao%
1 S h o o rc nclMe i n ,G a giMe i lU i ri ,N n ig 5 0 2 ;2 e ig Is tt o rnfs n . co l fPel ia i dc e un x i dc nv sy a n 3 0 1 .B in ntue fT as i a e t n j i uo Meiie e ig 10 5 ;3 e ig Z ogig H si l e ig 1 0 3 ;C ia dc ,B in 0 8 0 .B in h nx opt ,B in 0 0 9 hn n j j n a j
i g mirRNA 1 5 ( R一1 5 ) tru h rn feig h ma mb o i s m c l t u a oi x r sin v co n co 2 b mi 2 b h o g t se t u n e r nc t a n y e el wi e k r t e p eso etr s h y e
计 数 和 克 隆计 数 , mi 一 2 b 达 上 调 的 h S 对 R 15 表 E C的 增 殖 情 况 进 行 分 析 。结 果 : 时定 量 P R检 测 结 果 表 明 , 实 C 细胞 转 染
后 7 , R 15 2 h mi一 2 b的表 达 上调 1 5 , 明 h S . 倍 说 4 E C转 染 成 功 ; 隆 计 数 及 细 胞 计 数 结 果 显 示 过 表 达 mi一 2 b的 h S 克 R 15 EC 增 殖 受 到 明 显 抑 制 ( < 0 ) 结 论 : 染 m R 15 P O 1。 转 i 一 2 b真 核 表 达 载 体 的 h S E C能 够 上 调 成 熟 mi一 2 b的表 达 ,E C中 R 15 hS

转基因动物在microRNA研究中的应用

转基因动物在microRNA研究中的应用
* 通讯联系人. Tel: 0451-86671684, E-mail: gaoxu_671227@ 收稿日期:2009-02-19,接受日期:2009-04-08
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生物化学与生物物理进展
Prog. Biochem. Biophys.
2009; 36 (9)
Stefan 等应用转基因技术建立了 miR-155 过表达的 小鼠模型 . [24] 2007 年 Zhao 等[25]应用基因打靶技术 建 立 了 miR-1-2 的 基 因 敲 除 模 型 . 近 三 年 , 与
“miRNA 和转基因动物”相关的研究数量更是不断 增长,建立策略不断丰富. miRNA 转基因动物模 型正成为 miRNA 功能研究的有力工具(表 1).
Table 1 The functions of microRNAs revealed by using transgenic mouse 表 1 应用转基因小鼠证实的 microRNA 功能
从“转基因”表达水平的结果上看,转基因动 物模型可分为:过表达(overexpression)、基因敲除 (knockout, KO) 及 基 因 敲 减 (knockdown). 通 常 , “转基因动物”也可单指外源基因“过表达”的动 物. 基因不同水平的表达导致其产物生成量的差 异,最终动物出现不同表型(phenotype),从而为不 同研究提供材料.
MicroRNA 的表达具有阶段和组织特异性,有 些 microRNA 在胚胎发育过程中起着关键作用,有 些 microRNA 只在特定组织表达. 这完全适合运用 条件基因打靶(conditional gene targeting)技术对其进 行功能研究. 在传统基因打靶过程中,microRNA 从发育的开始就在其全部脏器内被“敲除”,这会 影响胚胎发育,甚至造成胎死(embryonic lethality) 现象. 而条件基因敲除的应用很好地解决了这一问 题. 目前,重组酶 Cre-LoxP 系统已在 microRNA 基因敲除动物中有所应用. 2007 年,van Rooij 等[41] 报道了心肌细胞条件敲除 miR-208(图 1c)对 琢MHC 基因表达的影响,进一步揭示了其对心脏发育的作 用. 该技术需要一种含组织特异性表达 Cre 重组酶 的转基因动物,同时经同源重组建立另一种含 LoxP 重组酶位点的基因打靶动物,二者杂交产 生的后代,就可产生组织特异性的 miRNA 敲除的 动物.

MicroRNA125a质粒表达载体的构建及其表达活性

MicroRNA125a质粒表达载体的构建及其表达活性
e 2000 Eppendorf 5334 PCR 仪 Chromo4 定量 PCR 仪
日本 Takara 公司
美国 OligoEngine 公司 美国 Invitrogen 公司 德国 Eppendorf 公司 美国 Bio-rad 公司
方法:
miR-125a前体序列的扩增: miR-125a 前 体 扩 增 引 物 的 设 计 : 检 索 Sanger miRNA 数 据 库 (http://microrna.sanger.ac. uk/ sequences) , 获 得 miR-125a-5p 前 体 (precursor miR-125a)序列,并于 NCBI数据库检索miR-125a 前体 序列基因组定位及序列。利用primer3在线引物设计软件 (/primer3/) , 根 据 拟 插 入pSuper
Center of Tumor Diagnosis and Treatment, Chengdu Millitary General Hospital of Chinese PLA, Chengdu 610083, Sichuan Province, China
Zhang Tao★, Master, Chief physician, Center of Tumor Diagnosis and Treatment, Chengdu Millitary General Hospital of Chinese PLA, Chengdu 610083, Sichuan Province, China zhangato269@
设计:分子生物学实验。 时间及地点:实验于 2010-06/2011-03在成都医学 院免疫学教研室完成。 材料: 主要试剂和仪器:
试剂及仪器
来源

构建反转录病毒小向导RNA表达载体用于小鼠T细胞基因功能研究

构建反转录病毒小向导RNA表达载体用于小鼠T细胞基因功能研究

1585 V ol.40 No.12 Dec. 2020上海交通大学学报(医学版)JOURNAL OF SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY (MEDICAL SCIENCE)论著·基础研究CRISPR/Cas9系统作为一个强大的基因组编辑工具,最早发现于细菌和古细菌中。

它是细菌和古细菌在长期不断进化的过程中产生的适应性免疫防御机制,用以保护自身的基因组免受外源核酸(如噬菌体、病毒等)的干扰和破坏[1]。

CRISPR-Cas9 系统主要由2个部分组成:一是CRISPR 相关核酸酶,目前基因编辑系统中用到的主要是Cas9核酸酶;二是小向导RNA(small guide RNA,sgRNA),含有20 nt能够与靶基因组互补的序列[2-3]。

构建反转录病毒小向导RNA表达载体用于小鼠T细胞基因 功能研究赵艳娜1,邱 荣2,沈 南1,唐元家11.上海交通大学医学院附属仁济医院风湿病科,上海市风湿病学研究所,上海 200125;2.中国科学院大学上海营养与健康研究所,上海200031[摘要]目的·构建反转录病毒小向导RNA(small guide RNA,sgRNA)表达载体,用于小鼠T细胞分化调控及其基因功能的研究。

方法·表达短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)的反转录病毒载体(MSCV-LTR-miR30-PIG,LMP)经过Xho1和Sal1双酶切后,回收得到反转录病毒载体骨架。

以慢病毒sgRNA表达载体为模版,通过PCR扩增获得U6-sgRNA-PGK-Puro-BFP片段。

利用同源重组将U6-sgRNA-PGK-Puro-BFP片段组装进反转录病毒载体骨架。

为了验证系统的有效性,设计靶向Il17a、Rorc和Irf4的sgRNA序列并进行克隆。

分离Cas9转基因小鼠CD4 T细胞分别进行sgRNA反转录病毒感染,诱导其向Th17细胞分化。

《小鼠体细胞重编程过程关键转录因子在lncRNA区域的结合模式研究》范文

《小鼠体细胞重编程过程关键转录因子在lncRNA区域的结合模式研究》范文

《小鼠体细胞重编程过程关键转录因子在lncRNA区域的结合模式研究》篇一一、引言随着生命科学技术的飞速发展,体细胞重编程技术已成为研究热点之一。

该技术主要涉及将已分化的体细胞重新编程为多潜能性干细胞的过程,而此过程中关键转录因子的作用机制及其与lncRNA(长链非编码RNA)的相互作用尤为关键。

本研究旨在探究小鼠体细胞重编程过程中关键转录因子在lncRNA区域的结合模式,为深入理解重编程机制提供理论依据。

二、材料与方法1. 材料本实验选用小鼠胚胎成纤维细胞作为研究对象,通过CRISPR/Cas9技术构建关键转录因子过表达及敲低的细胞模型。

同时,收集相应时间点的重编程细胞样本。

2. 方法(1)RNA提取与测序:提取各时间点重编程细胞的总RNA,包括mRNA和lncRNA,进行高通量测序。

(2)生物信息学分析:利用生物信息学方法,分析关键转录因子与lncRNA的结合模式。

(3)荧光素酶报告基因实验:构建关键转录因子与lncRNA 结合的荧光素酶报告基因载体,验证结合模式的真实性。

三、结果1. 测序结果分析通过对各时间点重编程细胞的RNA测序结果进行分析,我们发现关键转录因子在lncRNA区域存在明显的结合模式。

这些结合模式在不同时间点有所差异,表明重编程过程中转录因子的作用是动态变化的。

2. 结合模式分析利用生物信息学方法,我们分析了关键转录因子与lncRNA 的结合模式。

结果显示,转录因子主要通过特定的序列motif与lncRNA结合,这种结合具有高度的特异性。

此外,我们还发现转录因子与lncRNA的结合受到重编程过程中其他调控因子的影响。

3. 荧光素酶报告基因实验验证为了验证生物信息学分析结果的准确性,我们进行了荧光素酶报告基因实验。

结果显示,关键转录因子与lncRNA的结合能够激活荧光素酶的表达,进一步证实了转录因子与lncRNA的结合模式。

四、讨论本研究通过高通量测序、生物信息学分析和荧光素酶报告基因实验等方法,研究了小鼠体细胞重编程过程中关键转录因子在lncRNA区域的结合模式。

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小鼠microRNA-125b过表达载体构建目录摘要 (1)Abstract (3)1 前言 (4)2 材料与方法 (5)2.1 材料 (5)2.2主要试剂与仪器 (5)2.2.1主要试剂 (5)2.2.2主要仪器 (5)2.3 方法 (6)2.3.1质粒提取 (6)2.3.2鼠尾基因组DNA提取 (6)2.3.3 PCR引物设计与合成 (7)2.3.4 PCR扩增 (7)2.3.5琼脂糖凝胶电泳检测 (7)2.3.6 DNA产物纯化及回收 (8)2.3.7酶切及鉴定 (8)2.3.8载体构建 (9)3 结果与分析 (9)4 讨论 (11)5 结论 (11)6 参考文献 (12)致谢 (14)摘要NPC1是一种以溶酶体内脂质异常沉积为特征的中枢神经系统退行性疾病,迄今为止对NPC1的发病机制仍得不到合理的解释。

研究发现miRNA对tau蛋白的调控和神经元存活至关重要,通过调节蛋白激酶和蛋白磷酸酯酶来调节tau蛋白磷酸化水平。

Tau 蛋白过度磷酸化损伤神经细胞功能和结构,如过度磷酸化使Tau 蛋白结合微管能力降低[1],Tau 蛋白在神经元内聚积导致神经元轴突转运障碍[2]、乙酰胆碱释放减少[3]、蛋白酶体活性抑制[4-7],这些功能和结构的改变可能导致神经元呈慢性进行性变性构建miR-125b表达载体,从tau蛋白磷酸化调控的研究入手,系统地研究参与tau蛋白磷酸化调控的miR-125b 的靶基因,阐释其中的分子作用机制,为tau蛋白异常病变引起的神经退行性疾病的研究与防治提供新的思路。

本实验目的:构建小鼠microRNA-125b(miR-125b)过表达载体。

方法:参考小鼠miR-125b前体序列的PCR扩增引物,重新设计限制性内切酶位点为Nhe I和EcoR I,PCR扩增,然后将目的片段和pcDNA3.1-EGFP质粒进行双酶切鉴定,使用T4 DNA连接酶进行连接,转化DH5α感受态细胞,挑取重组阳性克隆,对重组质粒进行双酶切、琼脂糖凝胶电泳鉴定及测序分析。

结果:菌液PCR筛选鉴定出正确的miR-125b过表达载体,测序分析证实克隆的基因序列正确。

结论:成功构建小鼠miR-125b的真核表达载体,为进一步研究miR-125b在C1型尼曼-匹克病中调控tau蛋白磷酸化的作用机制奠定实验基础。

关键词:microRNA-125b;pcDNA3.1-EGFP;过表达载体Construction of microRNA-125b overexpressionvector in mouseAbstractObjective To construct the microRNA-125b(miR-125b) overexpression vector in mouse. Methods PCR amplification primers of miR-125b precursor sequence referred to article, we redesigned restriction enzymes for Nhe I and EcoR I. After being confirmed by PCR amplification, the target fragment and pcDNA3.1-EGFP plasmid were identified by double digestion., and connected using T4 DNA ligase. Then, it was transforme d in DH5α competent cells. Finally, the recombinant plasmid were picked, and identified by double digestion, agarose gel electrophoresis and DNA sequencing. Results miR-125b precursor sequence was successfully inserted into pcDNA3.1-EGFP plasmid by identification of DNA sequencing. Conclusion The eukaryotic expression vector of mouse miR-125b has been successfully constructed, which provides a foundation for further studying the mechanism of tau phosphorylation regulated by miR-125b in Niemann-Pick type C1 disease.Key words:microRNA-125b, pcDNA3.1-EGFP, Overexpression vector一、前言microRNA(miRNA,微小RNA)是一类长约20-24个核苷酸的内源性非编码单链小分子RNA,进化上具有高度保守性,广泛存在于真核生物中。

成熟miRNA能够与靶基因3′UTR以完全互补或不完全互补的形式结合,诱导靶mRNA降解或抑制蛋白翻译,导致相应蛋白质合成缺失或减少,从而在转录水平、转录后水平、表观遗传水平等调控基因表达,参与生命过程中一系列的重要进程[1]。

到目前为止,在人类和小鼠中分别发现超过1000和750种miRNA,其中一些主要在大脑中表达[2-4],人类有接近1/3的基因受到miRNA的调控[5]。

近年来的大量研究表明,miRNA的异常表达广泛参与了肿瘤、心血管疾病和糖尿病等重大疾病的发生与发展。

同时,miRNA也参与了神经系统生长发育和生理功能的调控,其表达异常与神经退行性疾病的发生发展相关[6]。

C1型尼曼-匹克病(Niemann-Pick disease type C1, NPC1)是一种以溶酶体内脂质异常沉积为特征的中枢神经系统退行性疾病,迄今为止对NPC1的发病机制仍得不到合理的解释[7,8]。

研究表明,tau蛋白和Aβ(Amyloid beta,β-淀粉样蛋白)在神经退行性病变中紧密联系,存在协同作用。

tau蛋白在调节轴突运输功能的同时,亦参与Aβ的致病机制,加剧Aβ导致的神经元毒性、微管丢失、神经炎症变化等,进而导致神经变性和学习记忆障碍,揭示tau蛋白在神经元细胞变性的发生发展中起重要作用[9,10]。

目前,虽然对tau蛋白参与神经退行性疾病的具体机理尚不明确,但已证实,抑制神经元tau蛋白过度磷酸化可以有效缓解神经退行性病变的发生和发展[11]。

miRNA对tau蛋白磷酸化的调控和神经元存活至关重要,通过调节蛋白激酶和蛋白磷酸酯酶的表达来调控tau蛋白磷酸化水平。

miR-125b在阿尔茨海默病(Alzheimer's disease, AD)中的发病机理是促进tau蛋白过度磷酸化。

miR-125b超表达会引起tau 蛋白过度磷酸化,分别上调蛋白激酶p35、cdk5和p44/42-MAPK和下调蛋白磷酸酯酶DUSP6、PPP1CA及抗凋亡因子Bcl-W的表达。

抑制蛋白磷酸酯酶的表达会导致tau 蛋白过度磷酸化,超表达PPP1CA和Bcl-W会阻止miR-125b引起的过度磷酸化,证实蛋白磷酸酯酶可以调节miR-125b对tau蛋白的影响。

然而,抑制神经元中miR-125b 的表达会降低tau蛋白过度磷酸化和蛋白激酶活性。

另外,在小鼠海马内注射miR-125b 会损害联想学习以及下调DUSP6、PPP1CA和Bcl-W表达,并增强tau蛋白过度磷酸化[12]。

本研究构建了小鼠miR-125b的真核过表达载体,为进一步研究miR-125b在C1型尼曼-匹克病中调控tau蛋白磷酸化的作用机制奠定实验基础。

二、材料与方法2.1 材料BALB/c小鼠、大肠杆菌DH5α感受态细胞、pcDNA3.1-EGFP质粒均由实验室保存。

2.2主要试剂与仪器2.2.1主要试剂PurePlasmid Mini Kit、2×Es Taq MsterMix(康为世纪)、DNA Fragment Purification kit(TaKaRa)、10×quick cut Buffer、10×quick cut Green Buffer、QuickCutTM Nhe I、QuickCutTM EcoR I、ddH2O、10×T4 DNA Ligase、10×T4 DNA Ligase Buffer、LB液体培养基、LB固体培养基、DNA Marker 2000bp、水合氯醛、琼脂糖、EB。

2.2.2主要仪器本研究所用主要仪器的名称和生产厂家见表1。

表1 主要实验仪器仪器生产厂家96孔梯度PCR仪ABI公司水浴锅北京光明医疗仪器有限公司高压灭菌锅上海申安医疗器械场恒温摇菌摇床江苏海门其林医用仪器厂台式高速冷冻离心机SIGMANanodrop 2000分光光度计Thermo单人双面净化作台苏州净化设备有限公司电子天平上海精天电子电泳仪北京市六一仪器厂凝胶成像系统Uvitec公司10µl微量移液枪Eppendorf100µl微量移液枪Eppendorf1000µl微量移液枪Eppendorf电热恒温培养箱北京中兴伟业仪器有限公司气浴恒温振荡器上海比朗仪器有限公司低温恒温槽上海平轩科学仪器有限公司2.3 方法2.3.1质粒提取1、将3ml的pcDNA3.1-EGFP菌液加入到1.5ml离心管中,6000rpm离心5min,弃上清。

2、向沉淀中加入250µl Buffer P1(已加入RNase A),悬浮沉淀。

3、向离心管中加入250µl Buffer P2,缓慢的上下颠倒混匀,直到溶液变得清亮粘稠。

4、其后加入350µl Buffer N3,温和的上下颠倒,直至出现白色絮状沉淀后,12000rpm 离心15min。

5、离心后的产物弃上清,移入已装收集管的吸附柱中12000rpm离心1min,弃废液。

随后加入500µl Buffer PB 12000rpm离心1min,再加入750µl Buffer PW12000rpm离心1min,弃废液,室温晾干,吸附柱至于新的离心管中,向膜上加入100µl Buffer EB,放置3min 12000rpm离心1min。

6、1%的胶进行电泳。

2.3.2鼠尾基因组DNA提取1、取5mm鼠尾切成小块置于1.5ml离心管中,加入180µl Buffer GTL。

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