DNA重组技术ppt课件
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三、试剂与器材
(一)试剂 限制性内切酶;10×内切酶缓冲液 T4DNA连接酶;10×连接酶缓冲液 电泳缓冲液 1×TAE 琼脂糖;溴酚兰; 溴化乙锭(工作浓度0.5µg/ml) 酚;氯仿;无水乙醇;70%乙醇;灭菌双蒸
水
(二)实验器材
1.电泳仪、电泳槽、紫外检测仪、摄 影设备
酶-AMP复合物再结合到具有5’-磷酸基和3’羟 基切口的DNA分子上,使DNA腺苷化。
产生一个新的磷酸二酯键,把缺口封起来。
当我们已经获得目的基因片段,选择好适当 的克隆(或表达,转化)质粒载体, 并确定 重组方案后,下面要进行的就是DNA片段 之间的体外连接,从而获得重组子。
此重组子可转入相应的宿主菌中用于对目的 基因的扩增以及目的基因表达(如现代基因 工程药物的生产),还可用于序列分析和转 基因等重要生物技术的研究中。
根据点样量制备合适厚度的琼脂糖凝胶板; 切胶时尽可能切掉不含DNA片段的凝胶; 要尽量减少DNA在紫外下的照射时间以
减少对DNA的损伤; 熔胶要完全 。
DNA的连接
在T4DNA连接酶的作用下,平端或带有相 同粘末端的DNA分子可以连接上。DNA 连接酶的作分三步:
T4DNA 连接酶与辅助因子ATP形成酶-AMP 复合物。
1、DNA分子的体外连接
DNA分子的体外连接就是在一定条件下, 由DNA连接酶催化两个双链DNA片段 组邻的5’端磷酸与3’端羟基之间形成 磷酸酸脂键的生物化学过程,DNA分子 的连接是在酶切反应获得同种酶互补序列 基础上进行的。
连接反应中值得注意的几个问题:
1.DNA连接酶 常用的DNA连接酶有两种: (1)来自大肠杆菌的DNA连接酶 (2)来自噬菌体的T4DNA连接酶。 二者的作用机理类似。
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二、实验原理
1. 核酸限制性内切酶是在原核生物中发现的 一类专一识别双链DNA中特定碱基序列的 核酸水解酶,它们的功能类似于高等动物的 免疫系统,用于抗击外来DNA的侵袭。现 已发现几百种限制性内切酶,它们以内切方 式水解核酸链中的磷酸二酯键,产生的DN A片段5’端为P,3’端为OH。由于限制性内切 酶能识别DNA特异序列并进行切割,因而 在基因重组、DNA序列分析、基因组甲基 化分析、基因物理图谱绘制及分子克隆等技 术中收到广泛应用。
实验方法
DNA分子的体外连接
1.在无菌Eppendorf管中加入以下溶液:
a. 0.1μg质粒载体,2倍分子的外源DNA。
b. 加无菌水至7.5μl,于45℃加温5分钟使重新
退火的粘端解链, 将混合物冷却到0℃。
c. 加入:
10×T4DNA连接酶buffer T4DNA连接酶
1μl 0. 1μl
胶回收后用30-50 μl无菌双蒸水洗脱DNA片段,取 1-5 μl进行电泳检测,取2-5 μl测定OD260下的光吸收 值,计算DNA的浓度。
注:1 OD 260相当于双链DNA浓度为50 μg /ml
胶回收注意事项
将电泳槽用ddH2O反复清洗干净, 倒入新鲜 配制的灭菌电极缓冲液;
5.连接反应的检测
连接反应成功与否,最后的检测要通过下一 步实验,转化宿主菌, 阳性克隆的筛选来确 定。
我们下面的实验从粘性末端为例操作。
实验试剂
1.纯化后的酶切质粒载体和目的基因。 2.10×T4DNA连接酶buffer
200mM Tris-HCl(pH7.6) 50mM MgCl2 50mM 二硫苄糖醇 500μg/ml BSA 3.T4DNA连接酶 4.5mM ATP
定,折衷方法是12℃过夜。
3. DNA的平末端和粘性末端
由于内切酶产生的DNA末端有平末端和粘 性末端,因而连接反应中就有平未端连接和 粘性末端连接。 二者连接效率不同。
粘性末端效率高,因而在底物浓度,酶浓度 选择上是有差异的,
4.碱性磷酸酶处理质粒载体
为了提高连接效率,一般采取提高DNA的浓度, 增加重组子比例。这样就会出现DNA自生连接 问题, 为此通常选择对质粒载体用碱性磷酸酶 处理,除去其5’末端的磷酸基,防止环化, 通过接反应后形成的缺口可在转化细胞后得以修 复。
加DNAse-free的BSA 可以起到稳定酶活性 的作用;
用硅化处理的器皿进行酶切可以提高酶活 性;
酶切所用器皿和ddH2O要经过高温灭菌方可 使用;
DNA样品应不含重金属离子
DNA片段的胶回收
电泳洗脱法 低熔点琼脂糖凝胶电泳挖块法 冻融回收法 玻璃奶回收法 柱回收法(按说明书进行)
5mM ATP
1μl
2.盖上管盖,充分混匀,台式离心扣上离心5秒。
3.12℃下过夜连接反应。
4.反应结束后于-20℃保存。
结果与分析
电泳检查连接结果: 如何判断连接效果的成功性?
T4DNA连接酶作用机制
T4连接酶作用分三步: 1.T4DNA连接酶与辅助因子ATP形成
酶-AMP复合物。 2.酶-AMP复合物结合到具有5’-磷酸
基和3’-羟基切口的DNA上,使DNA 腺苷化。 3.产生一个新的磷酸二酯键,把缺口封起来.
2.连接反应的温度
DNA连接酶的最适反应温度为37℃, 但在此温度下, 粘性末端的氢键结合很不稳
2.恒温水浴槽
五.注意事项
影响限制性内切酶活性的生物因子: 酶切割位点周围核苷酸两侧的碱基的性
质; 识别序列在DNA中的分布频率; 与DNA的构象有关(SC,L,OC); DNA的纯度(蛋白、氯仿、SDS、
EDTA、甘油等);
内切酶用量不超过总反应体积的10%;
消化时间适当延长有利于提高酶活性;
第四部分 DNA重组技术
--DNA的酶切、回收和连接转化
DNA的酶切反应
分子生物学中经常使用的是II型限制性内切酶。 它能识别双链DNA分子中特定的靶序列 (4~8bp),并在该序列内切断DNA,形成特 有的粘末端或平端。
一、实验目的
掌握DNA酶切的基本原理。 学习和了解限制性内切酶的使用方法。 学习和掌握DNA片段胶回收的方法