API
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
(iii) 好的鉴定结果
(iv) 可以接受的鉴定结果 (v) 可疑的生化谱
%Id >90.0及T>0.25
%Id >80.0及T>0
API的局限性 - 经过30年以来的更新资料库,能够查明 的菌种越来越多,未知菌种越来越少, API的这种分类缩小范围利用数据库查 明结果的方法会让发现新菌种越来越困 难。 - API鉴定前还是需要做定向实验的 - 试剂条对温度有要求。菌种的适宜温 度不一定一致
API是 Analytic Products INC的简称 API 微生物鉴定系统以微生物生化理论为基础,借 助微生物信息编码技术,为微生物检验提供了简易 、方便、快捷、科学的鉴定程序。 生理生化鉴定:根据微生物对各种生理条件(温 度、pH、氧气、渗透压)、生化指标(唯一碳氮 源、抗生素、酶、盐碱性)代谢反应进行分析, 并将结果转化成软件可以识别的数据,进行聚类 分析,与已知的参比菌株数据库进行比较,最终 对未知菌进行鉴定的一种技术
按操作说明书规定,将附加试剂 加进适当小孔内
api20E 试剂
API 试剂条
24小时出结果
阅读结果
根据说明书上,
或彩图的指示, 记录结果於报告 单上。
利用编码手册
或APILAB PLUS软件进出分析
全Windows操作界面,多种语言。
API 结果
跟据T值及%Id的组合,作出评语: (i) 极好的鉴定结果 (ii) 很好的鉴定结果 %Id >99.9及T>0.75 %Id >99.0及T>0.50
将试条放进培 养盒内
将 5ml 无菌 水放进培养 盒里
利用石腊油覆盖指定的生化孔 (有划线的孔)
ADH ODC H2S URE
把培养盖盖上
操作步骤 3 (API 20E)
把试条放进孵育箱内,利用指
定温度及时间 API20E : 35 - 37oC,18-24 小时
18-24 小时後
ATCC
ATCC成立于1925年,是世界上最大的生物资源中 心,由美国14家生化、医学类行业协会组成的理 事会负责管理,是一家全球性、非盈利生物标准 品资源中心。ATCC向全球发布其获取、鉴定、保 存及开发的生物标准品,推动科学研究的验证、 应用及进步。
不断更新的数据库:
- 分类学的进化 - 新的菌种 - 生化反应的演进 - 鉴定菌种需要的改变
完整的鉴定谱
微生物鉴定
杆菌 球菌
接触酶
革兰氏
革兰氏
氧化酶 杆菌 球菌
革兰氏染色液
- 在细菌学里最普遍的染色方法
步骤
- 染色前,所有细胞是透明的
G()
G()
- 结晶紫着色後用碘增加染料 与菌体结合
- 乙醇从G() 菌体洗脱结晶 紫
- 用番红液复染,革兰氏阴性 菌呈粉红色,革兰氏阳性菌 呈兰紫色
API的优点 标准化,简易化 在制造过程中,进行质控 FDA标准 用户可用ATCC菌种进行质控 系统化 操作简易 快速报告 30多年的经验,拥有菌种资料>25000 ,鉴定系统的发源生化测试>750 - >1500多篇使用文献
FDA
FDA是食品药品监督管理局(Food and Drug Administration)的简称。FDA有时也代表美国FDA,即 美国食品药品监督管理局,美国FDA是国际医疗审核权 威机构,由美国国会即联邦政府授权,专门从事食品与 药品管理的最高执法机关;是一个由医生、律师、微生 物学家、药理学家、化学家和统计学家等专业人士组成 的致力于保护、促进和提高国民健康的政府卫生管制的 监控机构。其它许多国家都通过寻求和接收 FDA 的帮助 来促进并监控其本国产品的安全。
革兰氏染色
原理 : 检查细菌细胞壁的渗透性
单层厚钛聚糖细胞壁 不紧密外壁层(透乙醇) + 薄内壁层钛聚糖
革兰氏阳性
革兰氏阴性
API 套件
API 试剂盒及其配套试剂
石腊油(容量: 125ml) 覆盖在指定小孔上
悬浮液 (容量: 5ml) 用於调菌液
安培架
附加试条 加进指定的生化孔内
培养盒 保持潮湿环境
API的局限性
16SrDNA鉴定
16SrDNA鉴定是指用利用细菌16SrDNA序列测序的方法对细 菌进行种属鉴定。包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异 引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。 是一种快速获得细菌种属信息的方法。英文名称是16S ribosomal DNA identification,应用有细菌种属鉴定。 细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数分为3种,分别为5S、 16S和23S rRNA。16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA相对 应的DNA序列,存在于所有细菌染色体基因中。 16S rDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分 子钟,其种类少,含量大(约占细菌RNA含量的80%),分子 大小适中,存在于所有的生物中,其进化具有良好的时钟性质, 在结构与功能上具有高度的保守性,素有“细菌化石”之称。 在大多数原核生物中rDNA都具有多个拷贝,5S、16S、23S rDNA的拷贝数相同。16S rDNA由于大小适中,约1.5Kb左右, 既能体现不同菌属之间的差异,又能利用测序技术较容易地得 到其序列,故被细菌学家和分类学家接受。
API细菌鉴定系统和16S rDNA鉴定的区 别
API具有便利、快捷、成本低、效率高的特 点,但是总的来说,16S rDNA鉴定更符合科 学的严谨性,能将每一株菌种准确测定出 来。两个测定角度也不一样,API是用生化 反应间接鉴定出菌种的类别,而16S rDNA鉴 定是由分子水平直接准确鉴定出菌种。即 一个属于分类测定,另一个属于精准测定。 应该依据实验所需而决定使用哪一种鉴定 方法。
Байду номын сангаас
PSIpettes 接种管 挑菌落,混匀及接种
API 试条 每个小孔载有风乾的底物
操作步骤 1 (API 20E)
分离单个菌落
挑单个可疑菌落 尽量避免使用高度选择性培养基
调制菌液
悬浮液 (容量: 5ml)
操作步骤 2 (API 20E)
将菌液接种到小 管或小管及小杯 (CIT, VP和 GEL)