kj9-核糖体

蛋白质合成中很多重要步骤与50S 蛋白质合成中很多重要步骤与50S 核糖体大亚单位相关
涉及的多数因子为G 蛋白( 具有GTPase 活性) 涉及的多数因子为 G 蛋白 ( 具有 GTPase活性 ) , 核糖 体上与之相关位点称为GTPase相关位点 体上与之相关位点称为GTPase相关位点 成功地制备L11-rRNA复合物的晶体, 成功地制备L11-rRNA复合物的晶体,获得了其空间 结构高分辨率的三维图象 证实了前人用各种实验技术所获得的结论 提出直观, 提出直观,可靠且比人们的预料更为精巧复杂和可 能的作用机制, 为揭开核糖体这一具有30 多亿年 能的作用机制 , 为揭开核糖体这一具有 30多亿年 历史的古老的高度复杂的分子机器的运转奥秘迈 出了极重要的一步
同一生物中不同种类的r 同一生物中不同种类的r蛋白的一级结构 均不相同,在免疫学上几乎没有同源性. 均不相同,在免疫学上几乎没有同源性.
不同生物同一种类r 不同生物同一种类r蛋白之间具有很高 的同源性, 并在进化上非常保守.
蛋白质结合到rRNA上具有先后层次性 蛋白质结合到rRNA上具有先后层次性
生命是自我复制的体系
三种生物大分子,只有RNA既具有信息载体 三种生物大分子,只有RNA既具有信息载体 功能又具有酶的催化功能.因此,推测RNA 功能又具有酶的催化功能.因此,推测RNA 可能是生命起源中最早的生物大分子. 可能是生命起源中最早的生物大分子. 核酶(ribosome):具有催化作用的RNA. 核酶(ribosome):具有催化作用的RNA. 由RNA催化产生了蛋白质 RNA催化产生了蛋白质
三,核糖体蛋白质与rRNA的功能分析 三,核糖体蛋白质与rRNA的功能分析
核糖体上具有一系列 与蛋白质合成有关结合位点与催化位点
在蛋白质合成中肽酰转移酶的活性研究
(a)核糖体小亚单位中的部分r蛋白与rRNA的结合位点) (b)及其在小亚单位上的部位
核糖体上具有一系列与蛋白质合成有关的 结合位点与催化位点
三,RNA在生命起源中的地位及其演化过程 三,RNA在生命起源中的地位及其演化过程
生命是自我复制的体系 DNA代替了RNA的遗传信息功能 DNA代替了RNA的遗传信息功能 蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能 蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能
RNA在生命起源中的地位 RNA在生命起源中的地位
二,核糖体的结构
结构与功能的分析方法
蛋白质合成过程中很多重要步骤与 50S核糖体大亚基单位相关 50S核糖体大亚基单位相关
原核生物与真核生物核糖体成分的比较
核 糖 体
核 糖 体
结构与功能的分析方法
离子交换树脂分离纯化各r 离子交换树脂分离纯化各r蛋白 纯化的r 蛋白与纯化的rRNA 进行核糖体重组装, 纯化的 r 蛋白与纯化的 rRNA进行核糖体重组装 , 示 r 蛋白与rRNA的结构关系 蛋白与rRNA的结构关系 双向电泳技术示E coli核糖体在装配各阶段与 rRNA 双向电泳技术示 E.coli 核糖体在装配各阶段与rRNA 结合蛋白质的类型 双功能交联剂和双向电泳研究r 双功能交联剂和双向电泳研究r蛋白在结构上的相 互关系 电镜负染色与免疫标记技术结合,对r蛋白定位 电镜负染色与免疫标记技术结合,对r 对rRNA,特别16S rRNA 结构的研究 rRNA,特别16S 70S核糖体小亚单位rRNA与r蛋白空间关系 70S核糖体小亚单位rRNA与
在蛋白质合成中肽酰转移酶的活性研究
核糖体蛋白 在核糖体中rRNA是起主要作用的结构成分 rRNA是起主要作用的结构成分 r蛋白质的主要功能
核糖体蛋白
很难确定哪一种蛋白具有催化功能: 在E.coli中核糖体蛋白突变甚至缺失对蛋白 coli中核糖体蛋白突变甚至缺失对蛋白 质合成并没有表现出" 质合成并没有表现出"全"或"无"的影响. 的影响. 多数抗蛋白质合成抑制剂的突变株, 多数抗蛋白质合成抑制剂的突变株,并非由 于r蛋白的基因突变而往往是 rRNA基因突变. rRNA基因突变. 在整个进化过程中rRNA的结构比核糖体蛋白 在整个进化过程中rRNA的结构比核糖体蛋白 的结构具有更高的保守性.
核糖体的重组装是自我装配过程
16SrRNA的一级结构是非常保守的 16SrRNA的一级结构是非常保守的 16SrRNA的二级结构具有更高的保守性: 16SrRNA的二级结构具有更高的保守性: 臂环结构(stem臂环结构(stem-loop structure) rRNA臂环结构的三级结构模型 rRNA臂环结构的三级结构模型
第二节 聚核糖体与蛋白质的合成
多聚核糖体(polyribosome或 多聚核糖体(polyribosome或polysome) 蛋白质的合成 RNA在生命起源中的地位及其演化过程 RNA在生命起源中的地位及其演化过程
一,多聚核糖体 (polyribosome or polysome)
概念:核糖体在细胞内并不是单个独立地执行功 能 , 而是由多个甚至几十个核糖体串连在一条 mRNA分子上高效地进行肽链的合成 , mRNA 分子上高效地进行肽链的合成, 这种具有 特殊功能与形态结构的核糖体与mRNA 的聚合体 特殊功能与形态结构的核糖体与 mRNA的聚合体 称为多聚核糖体 多聚核糖体的生物学意义 细胞内各种多肽的合成, 细胞内各种多肽的合成 , 不论其分子量的 大小或是mRNA 的长短如何, 大小或是 mRNA的长短如何 , 单位时间内所合成 的多肽分子数目都大体相等 以多聚核糖体的形式进行多肽合成,对 mRNA的利用及对其浓度的调控更为经济和有效 mRNA的利用及对其浓度的调控更为经济和有效
核糖体的基本类型与成分 核糖体的结构 核糖体蛋白质与rRNA的功能分析 核糖体蛋白质与rRNA的功能分析
一,核糖体的基本类型与成分
核糖核蛋白体,简称核糖体(ribosome) 核糖核蛋白体,简称核糖体(ribosome) 基本类型 附着核糖体 游离核糖体 70S的核糖体 70S 80S的核糖体 80S 主要成分 r蛋白质:40%,核糖体表面 蛋白质:40% rRNA:60% rRNA:60%,,核糖体内部
在核糖体中rRNA是起主要作用的结构成分 在核糖体中rRNA是起主要作用的结构成分
具有肽酰转移酶的活性; 为tRNA提供结合位点(A位点,P位点和E位点); tRNA提供结合位点(A位点, 位点和E位点) 为多种蛋白质合成因子提供结合位点; 为多种蛋白质合成因子提供结合位点; 在蛋白质合成起始时参与同mRNA选择性地结 在蛋白质合成起始时参与同mRNA选择性地结 合以及在肽链的延伸中与mRNA结合; 合以及在肽链的延伸中与mRNA结合; 核糖体大小亚单位的结合,校正阅读 (proofreading), 无意义链或框架漂移的校正 , (proofreading) , 无意义链或框架漂移的校正, 以及抗菌素的作用等都与rRNA有关. 以及抗菌素的作用等都与rRNA有关.
第九章
核糖体(ribosome) 核糖体(ribosome)
核糖体的类型与结构
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多聚核糖体与蛋白质的合成
第一节
核糖体的类型与结构
核糖体是合成蛋白质的细胞器, 核糖体是合成蛋白质的细胞器,其唯一的 功能是按照mRNA的指令由氨基酸高效且精确 功能是按照mRNA的指令由氨基酸高效且精确 地合成多肽链. 地合成多肽链.
与mRNA的结合位点: mRNA的结合位点: 新掺入的氨酰-tRNA的结合位点——氨酰基位点, 新掺入的氨酰-tRNA的结合位点——氨酰基位点, 又称A 又称A位点 延伸中的肽酰-tRNA的结合位点——肽酰基位点, 延伸中的肽酰-tRNA的结合位点——肽酰基位点, 又称P 又称P位点 肽酰转移后与即将释放的tRNA的结合位点E 肽酰转移后与即将释放的tRNA的结合位点E位 点(exit site) 肽酰tRNA 从 位点转移到P 位点( 延伸因子EF肽酰 tRNA从 A 位点转移到 P 位点 ( 延伸因子 EF-G 结 合位点) 合位点)有关的转移酶: 肽酰转移酶的催化位点 与蛋白质合成有关的其它起始因子,延伸因子 和终止因子的结合位点
r蛋白质的主要功能
对rRNA 折叠成有功能的三维结构是十分重要的; 在蛋白质合成中, 某些r 在蛋白质合成中, 某些r蛋白可能对核糖体的构象 起"微调"作用; 微调" 在核糖体的结合位点上甚至可能在催化作用中, 在核糖体的结合位点上甚至可能在催化作用中, 核 糖体蛋白与rRNA共同行使功能. 糖体蛋白与rRNA共同行使功能.
早期简单生命生物大分子:遗传信息载体, 又 早期简单生命生物大分子:遗传信息载体, 具酶的催化功能RNA 具酶的催化功能RNA 核酶:具催化作用的RNA(核酸水解,连接, 核酶:具催化作用的RNA(核酸水解,连接, mRNA剪接,聚合,磷酸化,氨酰基化,烷基 mRNA剪接,聚合,磷酸化,氨酰基化,烷基 化),核糖体rRNA具肽酰转移酶活性 ,核糖体rRNA具肽酰转移酶活性 核糖:甲烷合成 RNA催化效率低→催化产生蛋白质→ RNA催化效率低→催化产生蛋白质→DNA DNA较RNA稳定,易修复,贮存大量信息, DNA较RNA稳定,易修复,贮存大量信息, 但mRNA拼接和蛋白质合成仍需RNA催化 mRNA拼接和蛋白质合成仍需RNA催化
蛋白质化学结构的多样性与构象的多变性;
与RNA相比,蛋白质能更为有效地催化多种生化 RNA相比, 反应,并提供更为复杂的细胞结构成分, 反应,并提供更为复杂的细胞结构成分,逐渐演 化成今天的细胞. 化成今天的细胞.
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DNA代替了 DNA代替了RNA的遗传信息功能 代替了RNA的遗传信息功能
DNA双链比RNA单链稳定; DNA双链比RNA单链稳定;
DNA链中胸腺嘧啶代替了RNA链中的尿嘧啶, DNA链中胸腺嘧啶代替了RNA链中的尿嘧啶, 使之易于修复.
蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能 蛋白质取代了绝大部分RNA酶的功能