MALDI-TOF质谱仪在临床常见细菌鉴定中的应用
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a s s t i m i c a t i o n o f m a t r i x i s t e d l a s e r d e s o r t i o n i o n i z a t i o n e o f f l i h t m a s s s e c t r o m e t e r i n A l - - p g p p p
: ( ) t r a c t O b e c t i v e o e v a l u a t e d t h e a l i c a t i o n v a l u e o f t w o k i n d s o f m a s s s e c t r o m e t e r M S a n d V i t e k M S s s t e m i n t h e i A b s T - p p p y j ) ( d e n 1 4g e n e r a a n d 3 0s e c i e s i i s o l a t e d b a c t e r i a i n c l i n i c . M e t h o d s 4 9s t r a i n s o f c o mm o n b a c t e r i a i n c l u d i n t i f i c a t i o n o f r o u t i n e l - 1 p g y , , , s o l 2 0 1 3w e r e a t e d f r o m b l o o d u r i n e c e r e b r a l s i n a l f l u i d s e c r e t i o n a n d s u t u m s a m l e s i n o u r h o s i t a l f r o m M a r c h 2 0 1 2t o J a n u a r p p p p y s s i m i s t e d l a s e r d e s o r t i o n i o n i z a t i o n e o f f l i h t m a s s s e c t r o m e t e r a t 2k i n d s o f m a t r i x i d e n t i f i e d b c o l l e c t e d a n d s i m u l t a n e o u s l - - p g p y y ( ) t h e c o n v e n t i o n a l b i o c h e m i c a l i d e n t i f i c a t i o n MA L D-T h e i d e n t i f i c a t i o n r e s u l t s w e r e c o m a r e d w i t h t h o s e i d e n t i f i e d b O F-M S . T p y ( ) 1 6 Sr D NA e n e s e 3k i n d s o f m e t h o d w e r e c o n f i r m e d b V i t e k 2c o m a c t . T h e s t r a i n s w i t h t h e i n c o n s i s t e n t r e s u l t s i d e n t i f i e d b - g y p y , u e n t h e B r u k e r B i o t e r M S 1 4 9c o mm o n b a c t e r i a t h e c o r r e c t i d e n t i f i c a t i o n r a t e s o f e n u s a n d s e c i e s b c i n . R e s u l t s o n Am q y p g p y g g t h e V i t e k M S s s t e m w e r e 9 7% a n d 9 5% r e s e c t i v e l . T h e r e w e r e n o m i s i d e n t i f i e d a n d w h i c h b w e r e 9 8% a n d 9 6% r e s e c t i v e l y p y y p y t h e s e t w o k i n d s o f M S. C o n c l u s i o n o s t a t i s t i c a l d i f f e r e n c e i n t h e i d e n t i f i c a t i o n r e s u l t s w a s o b s e r v e d b e t w e e n b a c t e r i a l s t r a i n s b N y ) 0 i d e n 5 . B o t h e x h i b i t e x c e l l e n t i d e n t i f i c a t i o n l e v e l a n d a r e s u i t a b l e f o r t h e r o u t i n e l a b o r a t o r P>0. t h e s e t w o k i n d s o f M S s s t e m( - y y i c a t i o n o f c l i n i c a l m i c r o o r a n i s m. t i f g : ; ; K e w o r d sb a c t e r i a m a s s s e c t r o r a h i c a n a l s i s 6 Sr R NA 1 p g p y y 对临床分离细菌进 行 快 速 鉴 定 是 临 床 医 生 和 检 验 科 的 共 同愿 望 , 分 子 生 物 学 鉴 定 方 法 快 速 准 确, 如荧光杂交和
王 冰, 任晓 庆 , 褚美玲, 杨 柳, 盛翔 宇 , 周连庆, 薛文成, 孟冬娅△ ( ) 沈 阳 军 区 总医院检验科 , 辽宁沈 阳 1 0 1 6 1 0
*
Βιβλιοθήκη Baidu
目的 探讨 两 种质 谱 仪 B S 系 统 在临床 常 规 分 离 细 菌 鉴 定 中的 应 用 价 值 。 方 法 收 集 沈 阳 军 i o t e r M S和 V i t e k 摘 要 : -M y p 尿液、 脑脊液、 分泌物和痰液等标本的临床常见菌细菌1 区 总医院 2 包括1 2 年 3 月至 2 0 1 3年1月分离自血液、 4个菌属 0 1 4 9株( 。 同时 采 用 两 种 MA 对3 和3 结果与 V e k 2c o m a c t常 规 生 化 鉴 定 进 行 比 较 , 0个 菌 种) L D I O F-M S 系 统 对 上 述 菌 株 进行 鉴 定 , i t -T p 种 方法 检 测 结 果不 一 致 菌 株 用 1 6 Sr R NA 测 序进行 确 认 。 结果 在 1 4 9株常见细菌中, r u k e r B i o t e属 和 种 的 正确 鉴 定 率 分 别 B y p 两种质 为9 S 属 和 种 的 正确 鉴 定 率 分别 为 9 6% , V i t e k 5% 。 两 者 均 无 错 误 鉴 定 菌 株 。 结 论 对 该 组 常 见 细 菌 , 8% 和 9 7% 和 9 -M ) , 均 呈现 出 优 异 的 鉴 定 水 平 , 适 合用 于 临床 微 生 物 的 常 规 鉴 定 。 谱 仪 鉴 定 结 果 比较 差 异 无 统计 学意义 ( 0 5 P>0. 关键词 : 细菌; 6 Sr R NA 质 谱 分析 ; 1 : / 0. 2 0 1 4. 1 6. 0 4 7 D O I 1 0. 3 9 6 9 . i s s n . 1 6 7 3 4 1 3 - j 文献标识码 : A ( ) 文章编号 : 3 0 2 0 1 4 1 6 8 1 6 7 4 1 3 2 2 2 0 3 - - -
·2 2 2 8·
, , , 国际检验医学杂志2 0 1 N o . 4年8月第3 5卷第1 6期 1 6 I n t J L a b M e d A u u s t 2 0 1 4 V o l . 3 5 g
· 检验仪器与试剂评价 ·
MA L O F 质谱仪在临床常见细菌鉴定中的应用 D I -T
[] 不 适 合 于 常 规 大 量 样 本 的 鉴 定。 但成本昂 贵 且 费 时 , C R1 , P
D NA 小量提取试剂盒 ( M i n i B E S T B a c t e r i a l G e n o m i c D NA E x - 及P t r a c t i o n k i tⅡ ) C R 反应相关试剂 ( T a k a R a 1 6 Sr D NA B a c - ) , 大连宝生物公司, i a l I d e n t i f i c a t i o n P C R K i t R o c h e 4 8 0Ⅱ 实 t e r 。 时荧光定量 P 瑞士 R C R 仪( o c h e公司 ) 1. 3 方法 1. 3. 1 细菌分 离 培 养 所 有 菌 株 标 本 接 种 在 相 应 培 养 基 上 ( , 3 5 ℃ 孵育箱恒温培养 2 5% 羊血琼脂或巧克力培养基 ) 4~4 8 ( 生长条件有特殊要求 的 菌 置 于 5% ~1 0% C O h 2 培养箱或厌 。 氧袋中 ) 1. 3. 2 细菌的 生 化 鉴 定 采 用 V I T E K 2C OMP A C T 自动鉴 定仪及配套鉴定卡 , 严格按照说明书进行操作 。 1. 3. 3 1 6 Sr NA 提 取 试 剂 盒 提 取 模 板 R NA 检 测 及 测 序 D 进行 1 产物送大连宝生物有限 D NA, 6 Sr R NA 基因 P C R 扩增 , 公司测序部完成 ; 结果在 G e n B a n k 数据库中进行比对 。 1. 3. 4 细菌的 MA L D I S 鉴定 用无菌接 种 环 挑 取 适 O F M -T 量( 纯培 养 单 个 落 菌 涂 于 质 谱 仪 样 品 检 测 板 上 , 迅速 3~5 个 ) 随 后 再 点 1μ 加 0. 5μ L 的7 0% 甲 酸 覆 盖 加 样 的 位 置 , Lα -氰
* i d e n t i f i c a t i o n o f c l i n i c a l c o mm o n b a c t e r i a
a n i n e n i a h u e i a n i u, h e i a h o i a u e e n e n o n a△ o i n l i n n n u, u n i n c h e n W B R X C M Y L S X Z L X W M D g g, g g g y q g, g, g g y q g, g, ( t m e n t n i c a l o r a t o r e r a l t a l n a n i t a r n, n a n o n i n 0 1 6, n a) D e a r o C l i L a b G e n H o s i o S h e M i l R e i o S h e L i a 1 0 C h i y, y g y y g, g1 p f p f g