lamp产物检测方法(一)
lamp技术在家禽腹泻性疾病检测中的应用
LAMP技术在家禽腹泻性疾病检测中的应用董雯雯①张世栋①王春玲①艾洪新①李新华①潘力①朱伟②*李峰①*(①山东省家禽疫病诊断与免疫重点实验室山东省农业科学院家禽研究所山东济南250023②山东省家禽疫病诊断与免疫重点实验室山东畜牧兽医职业学院山东潍坊)中图分类号:S858.3 文献标识码:B 文章编号:1007-1733(2019)12-0092-05快速检测致病微生物是控制疾病暴发的有效方法之一。
目前,测病原体的传统方法耗时且劳动强度大,并且通常很容易失去最佳控制疾病的机会。
因此,迫切需要一种快速检测疾病的方法。
环介导等温扩增(LAMP)是近年来新建立的核酸恒温快速扩增技术。
它具有高灵敏度,特异性,视觉检测和对仪器的低需求。
它具有节省时间和精力等诸多优点,在分子诊断领域具有很大的潜力。
目前,LAMP已被广泛用于检测各种动物病原微生物。
本文主要综述了LAMP技术在家禽腹泻病原微生物检测中的应用以及LAMP技术的改进和优化,为快速检测家禽肠道疾病提供了参考。
目前,荧光定量、间接免疫荧光等分子生物学技术在家禽病原检测中起着关键作用,但都需要昂贵的仪器设备及一定操作技能。
一旦出现疫情,基层养殖场及实验室很难实现对病原的快速检测[1]。
针对这一现象,Notomi等[2]于2000年研发出一种新的DNA扩增技术-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LA MP)。
该方法在各项指标上优于传统的分子生物学检测技术,且不需要昂贵的仪器设备、简便、快速、灵敏,仅需在引物及BstDNA聚合酶的催化下,等温水浴30~ 60min,即可实现靶基因109倍扩增[3],检测成本较低,适合基层地区开展病原微生物的早期诊断和筛查。
目前LAMP的检测对象已经覆盖了核酸、蛋白质、细胞等,展现出非常广阔的应用前景。
1 LAMP技术原理(1)LAMP技术是在等温(60~65℃)条件下利用BstDNA聚合酶和靶基因4条特异性引物进行反应,最后实现基因的指数型扩增,具有高度灵敏性和特异性。
《2024年肺孢子菌基因LAMP检测方法的研究》范文
《肺孢子菌基因LAMP检测方法的研究》篇一一、引言肺孢子菌(Pneumocystis)是一种常见的呼吸道病原体,感染后可引发肺炎、支气管炎等严重疾病,对人类健康构成严重威胁。
因此,快速、准确地检测肺孢子菌成为了临床诊断和治疗的关键。
传统的检测方法如培养法、PCR等虽然有一定的效果,但存在耗时长、操作复杂等问题。
因此,本研究旨在探讨一种新的肺孢子菌基因检测方法——LAMP(环介导等温扩增)技术,以提高检测的效率和准确性。
二、LAMP技术简介LAMP技术是一种基于核酸序列的等温扩增技术,能够在恒温条件下实现靶标序列的高效扩增。
其基本原理是通过四个引物识别DNA的多个序列位点,在DNA聚合酶的作用下进行链式扩增反应。
LAMP技术具有快速、灵敏度高、特异性好等优点,被广泛应用于病原体的快速检测。
三、肺孢子菌基因LAMP检测方法的建立1. 引物设计:根据肺孢子菌的基因序列信息,设计出四条特异性引物,用于LAMP反应的启动和扩增。
2. 反应体系建立:建立包含DNA聚合酶、dNTPs、引物等成分的LAMP反应体系。
3. 反应条件优化:通过调整反应温度、时间等参数,优化LAMP反应条件,以提高扩增效率和特异性。
四、实验方法与结果分析1. 实验方法:采集临床患者呼吸道样本,提取DNA后进行LAMP扩增反应。
同时,采用传统的PCR方法作为对照。
2. 结果分析:对LAMP扩增产物进行电泳分析、荧光定量等检测,观察扩增曲线和溶解曲线等指标,评估LAMP技术的性能。
五、结果与讨论1. 结果:通过实验发现,肺孢子菌基因LAMP检测方法具有快速、灵敏度高、特异性好等优点。
与传统的PCR方法相比,LAMP技术能够在更短的时间内完成扩增反应,且具有更高的灵敏度和特异性。
此外,LAMP技术还具有操作简便、成本低等优势。
2. 讨论:本研究表明,肺孢子菌基因LAMP检测方法是一种有效的病原体检测技术。
其优点在于能够在恒温条件下实现快速、高效的扩增反应,提高检测的准确性和效率。
lamp实验流程
lamp实验流程lamp实验流程是一种常用的生物学实验方法,用于研究基因转录的调控机制。
LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)是一种在等温条件下进行核酸扩增的方法。
下面将详细介绍LAMP实验的流程。
一、实验前的准备工作:1. 准备实验所需的试剂和材料,包括引物、引物探针、模板DNA、核酸扩增酶等。
2. 根据实验需要,设计引物和引物探针,并进行合成或购买。
3. 清洁实验台面、仪器设备和试剂瓶,消毒操作区域,确保实验环境的洁净。
4. 使用无菌工艺准备试剂和培养基。
二、核酸提取:1. 根据实验样品的特性,选择适宜的核酸提取方法,并按照该方法进行提取操作。
2. 根据实验需要,将提取的核酸溶解在合适的溶解液中,得到模板DNA。
三、LAMP引物设计与合成:1. 根据需要扩增的目标序列,使用生物信息学软件进行引物序列的设计。
2. 根据引物设计结果,对引物进行合成或购买。
四、LAMP反应体系的准备:1. 准备一份LAMP反应体系通用配方:主反应液(包括模板DNA、引物和引物探针)、聚合酶酶液、酶活化缓冲液等。
2. 根据实验需要,调整反应体系中各组分的浓度和比例。
五、LAMP反应条件的优化:1. 通过对不同反应条件(如温度、时间等)的优化,确定最佳的LAMP反应条件。
2. 进行LAMP反应条件优化的方法包括逐步检测法、一次性试管法、电泳法等。
六、LAMP反应的操作步骤:1. 在无菌条件下,将LAMP反应组份依次加入反应管中,轻轻混匀。
2. 将反应管放入恒温培养箱中,在合适的温度下进行反应。
3. 根据实验需要,可以选择观察反应体系中荧光信号、浓度变化、反应时间等指标。
七、LAMP产物的分析:1. 从LAMP反应体系中取出反应产物,可以进行多种分析方法,如电泳分析、比色法、荧光实时PCR等。
2. 根据分析结果,判断LAMP反应是否成功,检测目标序列的扩增情况。
八、实验结果的分析与验证:1. 根据LAMP反应的结果,分析目标序列的扩增情况,判断目标基因的表达水平。
LAMP技术及应用 PPT
LAMP法在结核菌检测中的应用
技术特点:
适宜的检测对象 以临床上引起结核感染的结核分枝杆菌复合群为检测 对象,可避免假阳性过高。
反应管预装反应体系 扩增及检测在全封闭反应管中进行,有效降低气溶胶 污染;用户操作简便、减少操作误差。
结果易读 产物和显色液直接显色即可肉眼判断结果。
LAMP法在结核菌检测中的应用
LAMP法和其他PCR法的比较
LAMP法和其他PCR法的比较
技术特点
特异性高 4条引物靶向目标基因6个区段,特异性高于PCR和qPCR
灵敏度高 扩增模板可低至每测试10拷贝或更少。
检测时间短 恒温扩增,省却温度循环,扩增时间60min。
设备简易,可同时检测多批样本 不需特定或高端检测仪器,恒温设备即可,例如水浴锅, 可以随时放入后续批次样本。
琼脂糖凝胶电泳法 由LAMP原理可知,LAMP反应的最终扩增产物是茎环DNA组
成的混合物,即有若干倍茎长度的茎环结构和类似花椰菜的结构。 因此,LAMP扩增产物在2%的琼脂糖凝胶糖上呈现的是典型的梯 状条带。(图A)
肉眼观察法 在LAMP反应过程中,可以通过产生的副产物焦磷酸镁白色
沉淀的产生来肉眼直接判断扩增反应是否进行。(图B)
LAMP法在结核菌检测中的应用 靶标限定: 结核分枝杆菌复合群
临床上感染人类的是结核分枝杆菌复合群,包括结核分枝 杆菌、牛分枝杆菌、田鼠分枝杆菌、非洲分枝杆菌、卡氏 分枝杆菌。
对检测对象的准确限定能避免假阳性过高而增加治疗成本, 长远来说,更有利于避免耐药性的产生。
gyrB基因作为结核分枝杆菌重要的功能基因,在复合群进 化过程中非常保守,LAMP法检测即以gyrB基因作为靶标。
通过荧光染料检测 有时,通过肉眼观察白色沉淀来检测会存在一定的误差,所
lamp琼脂糖凝胶浓度的选择
lamp琼脂糖凝胶浓度的选择引言:在分子生物学研究中,琼脂糖凝胶是一种常用的分离和纯化核酸的方法。
而在LAMP(Loop-mediated isothermal amplification)技术中,琼脂糖凝胶也扮演着重要的角色。
本文将探讨LAMP琼脂糖凝胶浓度的选择,以及其对实验结果的影响。
一、琼脂糖凝胶的作用琼脂糖凝胶是一种聚合物凝胶,通过其孔隙大小的调节,可以实现核酸分子的分离和纯化。
在LAMP技术中,琼脂糖凝胶用于检测LAMP反应产物,通过电泳分析,可以判断反应是否成功,以及目标序列的扩增程度。
二、琼脂糖凝胶浓度的选择在选择琼脂糖凝胶浓度时,需要考虑到目标序列的大小和所需分辨率。
一般来说,较小的目标序列需要较高浓度的琼脂糖凝胶,以获得更好的分辨率。
而较大的目标序列则需要较低浓度的琼脂糖凝胶,以便更好地扩散。
三、琼脂糖凝胶浓度对实验结果的影响琼脂糖凝胶浓度的选择直接影响到实验结果的准确性和可靠性。
如果选择的琼脂糖凝胶浓度过高,孔隙大小会变小,导致目标序列无法扩散到凝胶深层,从而影响扩增效果的检测。
而如果选择的琼脂糖凝胶浓度过低,孔隙大小会变大,导致目标序列扩散过快,无法得到清晰的分离结果。
四、实验中的琼脂糖凝胶浓度选择策略在实验中,可以通过尝试不同浓度的琼脂糖凝胶来确定最适合的浓度。
首先,可以选择一个较低的浓度进行试验,观察扩增产物的分离情况。
如果分离效果不佳,可以逐渐增加琼脂糖凝胶的浓度,直到获得最佳的分辨率和扩增效果。
五、其他影响因素的考虑除了琼脂糖凝胶浓度外,还有其他因素也会影响LAMP实验的结果。
例如,电泳时间、电压和电泳缓冲液的配制等。
因此,在选择琼脂糖凝胶浓度时,还需要综合考虑这些因素,以获得最佳的实验结果。
结论:LAMP琼脂糖凝胶浓度的选择对实验结果具有重要影响。
根据目标序列的大小和所需分辨率,可以选择合适的琼脂糖凝胶浓度。
在实验中,可以通过尝试不同浓度的琼脂糖凝胶来确定最适合的浓度。
lamp实验需要的注意点
lamp实验需要的注意点LAMP实验是一种常见的实验方法,用于研究生物体的生理和生化特性。
在进行LAMP实验时,需要注意以下几点:一、实验室安全进行LAMP实验时,必须严格遵守实验室的安全规定,佩戴好实验室必要的个人防护用品,如实验手套、实验眼镜等。
同时,要保持实验室的整洁和干净,避免实验中的交叉污染。
二、试剂准备在进行LAMP实验前,要确保所有所需试剂的准备工作已经完成。
这包括准备好LAMP反应体系中的引物、酶、缓冲液以及待测样品等。
在准备试剂的过程中,要严格按照试剂说明书的要求操作,避免试剂的污染和浪费。
三、引物设计在进行LAMP实验时,需要设计合适的引物,以确保实验结果的准确性和可靠性。
引物的设计要考虑到目标序列的特性,如长度、GC含量、互补性等。
同时,还需要进行引物的特异性检验,以避免引物与非目标序列的非特异性扩增。
四、PCR仪设置LAMP实验通常需要使用PCR仪进行温度控制。
在进行实验前,要根据实验要求设置好PCR仪的温度程序,并进行预热。
同时,要确保PCR仪的温度控制精度和稳定性,以保证实验结果的可靠性。
五、实验条件控制在进行LAMP实验时,需要严格控制实验条件,如温度、时间等。
温度是影响LAMP反应的重要因素,要根据目标序列的特性和引物设计的要求,选择合适的温度。
同时,还需要控制反应体系的pH值、离子浓度等,以保证反应的进行。
六、实验结果分析在进行LAMP实验后,要对实验结果进行准确的分析和解读。
可以通过观察扩增产物的大小、颜色等特征来初步判断实验结果。
然后可以进行进一步的验证,如聚合酶链式反应(PCR)、酶切等实验,以确认扩增产物的特异性。
七、实验记录和数据保存在进行LAMP实验时,要做好实验记录和数据保存工作。
记录实验过程中的关键步骤、操作细节和实验结果等信息,以备后续分析和复现实验。
同时,要将实验数据保存在可靠的介质中,以防止数据的丢失和损坏。
总结:LAMP实验是一种常见的实验方法,可以用于检测目标序列的存在和特异性扩增。
LAMP法介绍
(6)
F1
F2 5’
F1c
B1c B2c B3c
3’
B2
5’
BIP B1c
B3 Primer
7. (6)的单链通过链置换DNA聚合酶的作用则形成下图的双链(7)。
(7)
5’ F1c F2 F1
B1c B2c B3c
3’
3’ F1
F2c F1c
5’
B1
B2 B3
8. 另外由 (6)中被剥离的单链因为在3‘末端含有互补的F1c与F1区段,5’末端含有 互补互的B1与B1c区段,所以整条链会形成如同哑铃状的结构。而这个结构,就是我们 LAMP法的扩增循环的起始结构(8)。以上为LAMP法扩增循环起始结构的形成过程。
Loop-mediated Isothermal Amplification (LAMP)
LAMP法为已知基因的检测提供 “简便、快速、准确、廉价” 的基因检测方法。
★利用该方法「简便」、「廉价」的特性、可将基因检测推广至尚未普及的领域与地区。 ★为满足基因检测或基因扩增的现场(例如病房临床现场检测)「快速」(30分钟以内)获 得结果的需求,我们提供了一种「简便」、「准确」的基因检测扩增技术。
templatpsa0110121416182022242628时间分钟以上结果为使用快速法的实验数据后述templatpsa用实时浑浊仪检测灵敏度试验结果环引物的原理应用环引物loopprmer缩短扩增时间快速法环引物的原理在lamp法的基础上在哑铃状结构的5末端的环状单链部分b1区段与b2区段之间或者f1区段与f2区段之间导入具有互补序列的环引物分别为环引b1b2b1cf1f2cf1cf2f1cloopprimer入具有互补序列的环引物分别为环引物b和环引物f就能够增加dna合成的起点
LAMP
LAMP(环介导等温扩增)技术2011-07-28 11:46 来源:北京蓝谱点击次数:1341 关键词:LAMP PCR技术环介导等温扩增分享到:收藏夹腾讯微博新浪微博开心网PCR方法在人类及动植物疾病基因诊断、食品分析和环境监测等领域发挥着举足轻重的作用,其灵敏度高、特异性好,是目前最精准的基因诊断方法。
然而PCR方法操作起来较复杂,对仪器和人员要求比较高,不适合基层或现场快速诊断,因此在国内的推广速度并不是很快。
2000年日本学者Notomi在Nucleic Acids Res杂志上公开了一种新的基因诊断技术,即LAMP (L oop-mediated isothermal amplification),中文名为“环介导等温扩增反应”,受到了世卫组织WHO、各国学者和相关政府部门的关注,短短几年,该技术已成功地应用于SARS、禽流感、HIV等疾病的检测中,在这次甲型H1N1流感事件中,日本荣研化学公司接受WHO的邀请进行H1N1 LAMP试剂盒的研制。
通过荣研公司近十年的推广,LAMP技术已广泛应用于日本国内各种病毒、细菌、寄生虫等引起的疾病检测、食品化妆品安全检查及进出口快速诊断中,并得到了欧美国家的认同。
LAMP方法的优势除了高特异性、高灵敏度外,操作十分简单,对仪器设备要求低,一台水浴锅或恒温箱就能实现反应,结果的检测也很简单,不需要像PCR那样进行凝胶电泳,LAMP反应的结果通过肉眼观察白色浑浊或绿色荧光的生成来判断,简便快捷,适合基层快速诊断。
可以预见,在未来的基因诊断领域,LAMP方法将占据大壁江山。
目前,在万方数据库搜索LAMP文章500多篇。
详见:/paper.asp x?q=loop-mediated+isothermal+amplification&o=sortby+CitedCount+CoreRank+date+relevanc e%2fweight%3d5&f=top&n=10&p=11. 优缺点介绍:LAMP方法优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高2~5个数量级);反应时间短(30~60min就能完成反应);临床使用不需要特殊的仪器(试剂盒研发阶段推荐用实时浑浊仪);操作简单(不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、酶和模板混合于PCR管中,置于水浴锅或恒温箱中63℃左右保温30~60min,肉眼观察结果)。
LAMP
A loop-mediated isothernal amplification 环介导等温扩增PCR
原理
LAMP优点
灵敏度高 (比传统的PCR方法高2~5个数量级) 反应时间短 (30~60分钟就能完成反应) 操作简单( 不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、 酶和模板混合于反应管中,置于水浴锅或恒温箱中 63℃左右保温30~60分钟司 研究开发的不开盖LAMP扩增产物纳米指示剂, 能完全避免交叉污染引起的假阳性以及引物二聚体 引起的假阳性。 性价比低,实用性不高
SYBR Green I 该核酸染料可集合与dsDNA双螺旋小沟中,集合后 荧光效果明显(黄色变为绿色)
鲤鱼疱疹病毒
锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus),简称KHV。 因其主要是由DNA类疱疹滤过性病毒感染所引起, 又名鲤鱼肾炎及鳃坏疽病毒。 感染后行动迟钝,食欲不振,身体糜烂可致死。
引物设计
引物间距离 Tm值 引物末端稳定性(自由能低于-4kcal/mol)
扩增条件
Mg2+浓度 甜菜碱 反应温度 BST DNA酶 65℃左右该酶活性最好,具有5’ 3’dna聚合酶活 性 80℃ 10min 失活
气溶胶现象
0.001~100微米
避免假阳性采取措施 操作环境 最后加入Bst taq酶,可在反应体系中滴加矿物 油 体系配置区域与检测区域要严格分开 反应过程中使用过的耗材需要密封处理后丢弃 若已经出现假阳性 每天给实验室开窗通风、给超净台紫外照射并 通风,一段时间后更换所有试剂再重新做LAMP 更换引物
实验设计流程 将疱疹病毒打入鲤鱼,使其感染病毒,提取DNA (以 野 生型鲤鱼做对照)。 LAMP引物设计(由网站设计) 利用设计引物克隆目的基因片段 LAMP检测病毒条件优化 温度(60-65) Mg2+ (6\8\10mM ) 甜菜碱(0.8、1.2、1.4M)——Mg2+ 8mM LAMP 特异性 提取不同病毒的DNA进行 LAMP灵敏度 反应底物稀释-1—-7 作为模版进行反应,以传统 pcr作为对照 对鲤鱼的KHV检测 提取不同部位的DNA,用传统pcr及LAMP方法进 行检测
LAMP技术在微生物检测中的应用
3随着经济的迅速发展,人们对各类食品的需求也日益增大,食品安全问题越来越受到人们的重视,微生物对食品的污染问题也相应地备受关注。
然而,使用传统的检测方法即非选择性和选择性增菌、生长法及血清学鉴定虽然比较准确,但繁琐费时。
此外,低水平的病原菌污染,食品加工后导致菌体的“致伤”及食品其它成分的干扰等因素,使得传统的检测方法受到了一定的限制,因此,急需一些灵敏度更高、特异性更强、简便快捷的食品安全检测技术和方法,以及时发现致病菌,控制污染及其可能对人体健康产生的危害。
科技的进步使得新的检测方法层出不穷,如ATP 荧光检测法,酶联免疫吸附法(ELISA),生物传感器技术,基因芯片技术,以及目前被广泛应用的基于PCR 的检测技术。
ELISA 由于免疫反应特异性强,对试剂的选择性高,致使很难同时分析多种成分;对结构类似的化合物有一定程度的交叉反应;分析分子量很小的化合物和很不稳定的化合物有一定的困难[1]。
生物传感器技术以生物分子特异识别为基础,而非特异性信号干扰常使其检测底限和可信度受到影响。
目前多数生物传感器制作的相对不够均一,使设置对照检测的作用降低,且多数传感器检测对象只限于一种目标物[2]。
基因芯片技术检测的灵敏度较低需要昂贵的尖端仪器,技术上也存在一些问题[3]。
PCR 方法敏感、准确、快速,可替代病原学检测,但由于需要昂贵的仪器设备、较高检测费用以及对检测人员较高的技术要求而使其不适用于现场快速检测及基层普及应用。
2000年,日本学者Notom i 等[4]发明了一种全新的核酸扩增方法—环介导等温扩增技术(LAMP ,loop-mediated isothermal amplification)。
该法在等温条件下(6~65℃)就能完成扩增反应,它可以在以内在恒LAMP 技术在微生物检测中的应用李志强(西华大学生物工程学院,四川成都,610039)摘要LAMP (1oop-m ediated isothermal amplifica tion)技术是一种新的恒温核酸扩增技术,具有特异性强、等温灵敏、操作简单、产物易检测等优点。
核酸检测的技巧
核酸检测的技巧
核酸检测是一种应用广泛的生物技术方法,用于检测特定的核酸序列。
以下是一些常用的核酸检测技巧:
1. PCR(聚合酶链式反应):PCR是一种常用的核酸扩增技术,通过逐渐增加核酸的数量,使其达到可以检测的水平。
PCR通常包括DNA模板、引物(用于指导扩增的DNA序列)、聚合酶和核苷酸。
PCR具有高灵敏度和特异性。
2. RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应):RT-PCR结合了逆转录和PCR技术,可以通过将RNA转录成cDNA,再进行扩增来检测RNA的存在。
逆转录酶将RNA 模板逆转录成cDNA,并使用PCR扩增cDNA。
3. LAMP(环介导等温扩增):LAMP是一种等温扩增技术,其特点是无需特殊的温度环境和设备。
LAMP通过多个引物与目标序列特异性结合并产生DNA扩增产物,其产物可以通过肉眼观察变色来进行检测。
4. 点杂交:点杂交是一种通过寡核苷酸探针与待测样品中的特定目标序列进行杂交,再使用荧光探测剂进行检测的技术。
这种技术可以用于检测单一核酸序列,并具有高度特异性。
5. ISH(原位杂交):原位杂交是通过将标记有探针的核酸杂交到细胞或组织样本上,通过显微镜观察探针与待测样本的结合情况来检测目标序列的存在。
这些技术都具有各自的优势和适用领域,在核酸检测中起到关键作用。
lamp扩增显色法
lamp扩增显色法
LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) 是一种新兴的DNA扩增技术,它在一定温
度和时间下,通过酶反应直接在体外扩增特定DNA序列。
LAMP技术的突出特点是可以在简
单的实验条件下进行快速和高效的DNA扩增。
该技术的主要步骤包括:首先选取目标DNA
片段,设计核酸引物;然后在一个含有核酸引物、DNA模板、反应缓冲液等的反应体系中进
行酶反应;最后通过眼睛观察扩增产物的显色效果来判断扩增是否成功。
显色法是LAMP技术中用于检测扩增产物的一种方法。
扩增过程中产生的大量DNA产物可以
与特定的染料结合,在给定的条件下形成可见的显色反应。
这种显色法可以直接通过肉眼观察
颜色变化来判断LAMP反应是否成功,无需复杂的仪器设备。
在LAMP显色法中,使用一种称为增色剂的化学物质,它可以在扩增过程中与产生的大量
DNA产物结合形成颜色反应。
通常,增色剂会在扩增产物释放时产生颜色变化,这种颜色变
化的出现可以通过目视判断扩增是否成功。
常用的增色剂有SYBR Green,这种染料能够与DNA结合并发出荧光,使扩增产物呈现荧光阳性。
此外,还有一些其他的染料也可以用于LAMP显色法,具体选择染料应根据实验需要和目标DNA片段的特性来确定。
LAMP扩增显色法具有操作简便、快速、高效、低成本等优点,因此在病原体检测、环境监测、食品安全等领域被广泛应用。
lamp检测技术原理
lamp检测技术原理LAMP(loop-mediated isothermal amplification)技术是一种新开发的核酸扩增技术,采用了一种较为简单的反应体系,它利用单一的酶就能在恒温下迅速扩增寡核苷酸序列。
相对于PCR技术,LAMP技术具有操作简便、响应时间短、在复杂的基因组背景下具有更高的特异性和灵敏度等诸多优点。
本文主要介绍LAMP技术的原理和优缺点以及应用前景。
一、LAMP技术原理LAMP技术的核心是利用反转录酶将RNA模板转录成具有这种序列的cDNA,然后利用核酸聚合酶扩增cDNA。
其反应原理基于无需热循环多重扩增(muliple displacement amplification)的核酸扩增技术,主要分为两个阶段:第一阶段:反应的产物是DNA扩增物。
在此过程中,LAMP引物包括两个外部引物F3和B3,以及两个内部引物FIP和BIP。
FIP包含与F3序列完全匹配的5'端及与目标序列互补的3'端,BIP则包含与B3序列完全匹配的5'端及与目标序列互补的3'端。
引物F3和B3均相似于PCR反应中的起始引物,用于启动扩增反应。
内部引物FIP和BIP通常由两个互补的寡核苷酸序列构成,这个引物可以形成一个干扰环(intra-loop),这个结构能够保护引物与目标序列的杂交效率,并促进反向归一分支(reverse transcription displacement loop,RTDL)的形成。
…1. 优点(1)不需要高昂的设备和专业技术(2)无需基因分离,避免污染和误差(3)反应耗时短,使其更易于操作(4)对反应体系的优化可以大大提高扩增效率(5)对于丰富的背景DNA和RNA不敏感,具有更高的特异性(6)精确和准确度高,可以探测到低浓度的目标核酸2.缺点(1)由于插入引物扩增导致的较多的非特异性扩增,使得LAMP扩增产品更难直接测序,容易产生误导性解释。
食品中过敏原成分环介导等温扩增LAMP检测方法第1部分:开心果编制说明
食品中过敏原成分环介导等温扩增(LAMP)检测方法第1部分:开心果编制说明1 基本信息图1 LAMP引物在开心果2S球蛋白基因上所对应的区域根据上述序列设计引物如下:包括外引物1(F3),外引物2(B3),环引物1(FL),环引物2(BL),内引物1(FIP),内引物2(BIP)。
表 1 LAMP引物序列名称编号序列LAMP引物序列F3 5’- GTGCCGGTGCCAGAACCTAG -3’B3 5’- CTACTGCAACACATATCACGCATGTAC -3’FIP 5’- GCACATGCGAGGCAATTCACTGGCAGCAACAGGGGCAGTTCAGAGG -3’BIP 5’- CATTTCACCCAGTCAGGGGTGTCAGTCTCCATATGCTGGCGATGATG -3’FL 5’- GCTGTCTCATAAAGTTCCTGAAGC -3’BL 5’- CAGTTCAGTTCACCATACTGGTCTTA -3’反应体系的建立根据相关文献建立的反应体系如表2所示。
表2 LAMP反应体系组分工作液浓度加样量(µL)反应体系终浓度ThermoPol缓冲液10 × 1 ×外侧上游引物(F3) 5 µmol/L µmol/L外侧下游引物(B3) 5 µmol/L µmol/L内侧上游引物(FIP)40 µmol/L µmol/L内侧下游引物(BIP)40 µmol/L µmol/L上游环引物(FL)10 µmol/L µmol/L下游环引物(BL)10 µmol/L µmol/LdNTPs 10 mmol/L 5 mmol/L甜菜碱 5 mol/L 4 mmol/L硫酸镁100 mmol/L 6 mmol/L(包括缓冲液中所含硫酸镁) Bst DNA聚合酶8 U/µL 1 U/µLDNA模板10 ng/µL 2 ng/µL水― 4 ―将混合物反应管置于LAMP 实时浊度仪中,反应60 min后,80°C酶灭活5 min终止反应,通过实时浊度仪器监测扩增反应。
LAMP(环介导等温扩增)的原理及在寄生虫检测上的应用
T ta a s li e r oa mo a er c p uod s y s l n e b
Pne m o ysi arni u c tsc i i
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可 以 检 测 人 体 的 4种 疟 原 虫 , 测 三 日疟 原 虫 、 形 检 卵 疟原 虫 的极 限为 1 0拷 贝 , 对 于 恶 性 疟 原 虫 和 间 日 而
2 1 7 孢 子 虫 杨秋 林 等 .. 。 据 卡 氏肺 孢 子 虫 线 根
粒 体 核 糖 体 大 亚 基 ( r NA) 因设 计 引 物 利 用 mtR 基
L AMP方 法检 测 该 虫 。 以结 核 杆 菌 、 弓形 虫 、 鼠 大 白细胞 等 为对 照 , 卡 氏肺 孢 子 虫 DNA 1 将 0倍 稀 释 后 同时 进 行 L AMP和 P R, C 比较 两 者 的 敏 感 性 。
lamp技术介绍以及在微生物检测中的应用
研究生课程论文课程: 微生物检测技术题目LAMP技术及其在微生物检测中的应用姓名: 王飞学院: 生命科学学院专业: 微生物学号: 201121601620 11 年12 月30 日LAMP技术及其在微生物检测中的应用摘要:环介导等温扩增(1oop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术是近年来发展出的一种敏感、特异、方便快捷的核酸扩增技术。
与传统PCR方法相比,LAMP不需要热循环,为等温扩增,且由于LAMP反应中产生大量的副产物一白色焦磷酸镁沉淀,扩增产物可不经过电泳,通过肉眼观察或浊度计即可判定结果。
因此LAMP是一种不需要热循环仪、肉眼即可判定结果的高度特异和敏感的DNA 扩增方法。
近年LAMP技术在病原微生物检测及食品微生物检测上已有广泛应用,本文就LAMP极其在这两方面的研究进展作一综述。
关键词:LAMP;环介导等温扩增;核酸扩增Application of LAMP in detection of microorganism Abstract:LAMP (loop-mediated isothermal amplification) method, which develops in recent years, is a sensitivity, special and convenience nucleic acid amplification technique. To compare with the traditional PCR, LAMP, which needn’t hot circle, is constant temperature amplification. Because LAMP can produce a mount of coproduce, magnesium pyrophosphate,which is a white precipitation,the result can be estimated by eyes or nephelometer without electrophoresis. In recent years, the application of LAMP in detection of disease pathogen and microorganism in food had been wide studied. These articles summarize the studies in these two aspects.Key words:LAMP; loop-mediated isothermal amplification; nucleic acid amplification 1.引言核酸体外扩增技术是分子生物学领域最重要的研究手段之一,以检测核酸为基础的分子诊断技术已广泛应用于临床医学和微生物检测等领域。
lamp产物检测方法
lamp产物检测方法
检测lamp产物的方法一般包括以下几种:
1. PCR检测:PCR是一种常用的检测lamp产物的方法。
通过
特定的引物和酶,可以从样品中扩增出lamp产物的目标序列,并通过凝胶电泳等方法检测扩增产物。
2. 实时荧光PCR检测:实时荧光PCR是一种基于PCR的方法,可以实时监测lamp产物的扩增过程。
通过特定的引物、
探针和荧光染料,可以定量检测lamp产物的数量。
3. 电泳检测:电泳是一种常用的分离和检测生物分子的方法。
可以通过电泳将lamp产物分离开,并通过特定的染料或探针
检测。
4. DNA测序:DNA测序是一种直接测定lamp产物序列的方法。
通过测序仪对lamp产物进行测序,可以确定其具体序列。
5. 杂交检测:可以使用特定的探针对lamp产物进行杂交,通
过检测探针与lamp产物的结合状态来判断是否有lamp产物存在。
这些方法可以单独或结合使用,根据需要进行选择。
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lamp产物检测方法(一)
LAMP产物检测
概述
LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)是一种高效、快速、特异性强的核酸检测技术,已广泛应用于医学、生物学、环境
科学等领域的产物检测中。
本文将介绍LAMP产物检测的几种常用方法。
方法一:实时荧光检测
实时荧光检测是LAMP检测中最常用的方法之一。
通过添加与LAMP引物配对的荧光探针,荧光信号与目标基因的扩增有关。
实时荧
光检测可以提供实时的扩增曲线,并且可以基于荧光信号强度计算出
目标物的浓度。
该方法结果灵敏度高,操作简便。
方法二:封闭管内检测
封闭管内检测适用于大规模样本分析。
在封闭管中进行LAMP反应,通过观察管内的颜色变化来判断是否存在目标产物。
通常,反应阳性
样品呈黄色或绿色,而阴性样品为紫色。
方法三:便携式检测设备
随着便携式检测设备的发展,LAMP产物检测也可以在户外或实验
室之外进行。
便携式检测设备结合了实时荧光检测和封闭管内检测的
优势,能够有效地检测目标产物,并且具有高灵敏度和快速反应的特点。
方法四:电化学检测
电化学检测是一种基于电化学信号变化来判断目标产物的方法。
通过引入与目标基因相关的电化学标记物,可以在反应过程中测量电流或电压的变化。
该方法具有高灵敏度、快速反应和较低的成本。
方法五:便携式PCR检测仪器结合LAMP
传统的PCR(Polymerase Chain Reaction)方法在LAMP产物检测中也得到广泛应用。
便携式PCR检测仪器结合LAMP技术,可以提供更高的扩增效率和较低的虚警率。
结论
LAMP产物检测是一种快速、高效、特异性强的核酸检测技术。
实时荧光检测、封闭管内检测、便携式检测设备、电化学检测和便携式PCR检测仪器结合LAMP是几种常用的方法。
根据实际需要,可以选择适合的检测方法进行LAMP产物检测。
(以上内容仅供参考,请根据实际情况进行操作)
LAMP产物检测
概述
LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)是一种高效、快速、特异性强的核酸检测技术,已广泛应用于医学、生物学、环境
科学等领域的产物检测中。
本文将介绍LAMP产物检测的几种常用方法。
方法一:实时荧光检测
•使用引物和荧光探针进行LAMP反应。
•实时监测荧光信号和扩增曲线。
•可以计算出目标物的浓度。
•结果灵敏度高,操作简便。
方法二:封闭管内检测
•在封闭管中进行LAMP反应。
•观察管内的颜色变化来判断是否存在目标产物。
•反应阳性样品呈黄色或绿色,阴性样品为紫色。
•适用于大规模样本分析。
方法三:便携式检测设备
•结合实时荧光检测和封闭管内检测的优势。
•能够在户外或实验室之外进行。
•检测目标产物,具有高灵敏度和快速反应的特点。
方法四:电化学检测
•通过引入与目标基因相关的电化学标记物。
•在反应过程中测量电流或电压的变化。
•具有高灵敏度、快速反应和较低的成本。
方法五:便携式PCR检测仪器结合LAMP
•在LAMP产物检测中结合传统的PCR方法。
•使用便携式PCR检测仪器,提高扩增效率和减少虚警率。
结论
LAMP产物检测是一种快速、高效、特异性强的核酸检测技术。
实时荧光检测、封闭管内检测、便携式检测设备、电化学检测和便携式PCR检测仪器结合LAMP是几种常用的方法。
根据实际需要,可以选择适合的检测方法进行LAMP产物检测。
(以上内容仅供参考,请根据实际情况进行操作)。