Tan第五章 目的基因的导入和重组子的筛选

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噬菌体转化
电 穿 孔 法 结 合 转 化
5/11/2015 8:30 AM 欢迎同学们听课!
107-8
106-9(<100Kb) 104-5
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5.3.1.2 化学转化法(CaCl2诱导大肠杆菌转 化法)
• 原理:0º C、低浓度(50~100 mM)CaCl2,Ca2+改
变细胞膜的磷脂层结构,提高膜的通透性,而且增强
进入细胞的DNA分子抗DNase的能力。
特点:操作简便,不需特殊仪器,一般实验室均可进
行。转化率在5106~2 107个转化子/g质粒DNA范围
内,完全可满足常规克隆的需要。
ห้องสมุดไป่ตู้
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5.3.1.2 化学转化法(CaCl2诱导大肠杆菌转化法)
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5.3 基因转移(gene transfer)
5.3.1 重组质粒DNA分子转化大肠杆菌 5.3.2 重组噬菌体DNA分子转导大肠杆菌 5.3.3 重组DNA分子转入真核细胞
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5.3.1 重组质粒DNA分子转化大肠杆菌
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λ 噬菌体体外装配的两种系统
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噬菌斑
• λ 和M13噬菌体都能形成噬菌斑,λ 形成的 是真正的噬菌斑(透明),是由于细胞的裂解引 起的;而M13的噬菌斑是浑浊的,因为细胞并未 裂解,它引起的是细菌生长的减慢,而使细菌 的浓度低于周围细胞。
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影响转化效率的因素
受体细胞的感受态,它决定转化因子能否被吸 收进入受体细胞; 受体细胞的限制酶系统和其 他核酸酶,它们决定转化因子在整合前是否被 分解;
受体和供体染色体的同源性,它决定转化因子 的整合; 重组DNA 分子大小
重组DNA纯度、浓度
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• 感受态细胞制备: 感受态细胞:指处于能吸收周围环境 中DNA分子的生理状态的细胞。 菌种活化、培养、收菌和进行CaCl2 处理。 • DNA分子转化感受态细胞: 冰浴、42º C热激、37 º C恢复、涂板培 养。
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5.3.1.3 电激法(电穿孔转化法)
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5.2 受体细胞及其选择的基本原则
5.2.1 受体细胞 5.2.2 受体细胞选择的基本原则
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5.2.1 受体细胞 • 受体细胞(receptor cell):又称为宿 主细胞或寄主细胞(host cell) • 从实验技术上讲:是能摄取外源DNA 并使其稳定维持的细胞。 • 从实验目的上讲:是有应用价值和理论 研究价值的细胞。
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重组噬菌体的鉴定
• (一)利用插入失活鉴定 M13噬菌体,多种λ噬菌体载体都含有lacZ’基因, 可以通过插入失活鉴定重组噬菌体。 (二)λ噬菌体的cI基因的插入失活 λ噬菌体载体在cI基因位点上含有单一的酶切位点, 该位点上插入外源基因可以导致该基因的失活,引起 表现型的变化。正常的噬菌斑是浑浊的,但重组的噬 菌斑是清亮的。 (三)利用Spi(sensitive to P2 inhibition)表型选择 一般来讲,λ噬菌体不能侵染已被P2噬菌体侵染的 大肠杆菌细胞,因此λ噬菌体被称为Spi+(对P2前噬菌 体抑制敏感),插入新的DNA后,能变成spi-,可以侵 染含有P2噬菌体的细菌,只有重组子是Spi-可以形成噬 菌斑,因此可以很方便的选择出来。
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c. d. e. f.
高压电穿孔法转化 显微注射法转化 接合转化 噬菌体转染
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表4—1 大肠杆菌常用转化方法的比较
转 化 方 法 Ca 诱 导 原生质体转化
转 化 效 率 107-8 105-6
本课程内容
• 第一章 绪论 • 第二章 基因克隆的工具酶
• 第三章 基因工程的载体
• 第四章 目的基因的制备 • 第五章 目的基因导入和重组子的筛选 • 第六章 外源基因的表达 • 第七章 基因操作的基本技术
• 第八章 植物基因工程及应用
• 第九章 动物基因工程及应用 • 第十章 医学基因工程及应用
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• (四)根据λ基因组的大小筛选 λ装配系统,只有37kb-52kb的DNA分子可 以进入头部结构,小于37kb的不能装配。许多 构建的λ载体切除了部分DNA,因而小于37kb, 只有插入外源DNA分子后才能被装配到头部结 构中,使载体的长度等于或大于37kb。对于这 样的λ噬菌体载体,只有重组的噬菌体才能进行 正常的复制。
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5.3.2 重组噬菌体DNA分子转导大肠杆菌
• 转染(transfection): 采用与质粒 DNA 转化受体细胞相似的方法, 将重组 噬菌体 DNA 分子直接导入受体细胞中的过 程,称为转染。 效率较低,103~104个噬菌斑/ g DNA ,较难 满足一般实验要求,实践中少用。 • 转导(transduction): 是指通过 噬菌体(病毒)颗粒感染宿主细胞 的途径把外源DNA分子转移到受体细胞内的过程。 效率高,可达103~104个噬菌斑/ g DNA,需 进行体外包装。
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• 宿主细胞进行正常的复制。因此,需要将 重组克隆鉴定出来。 • 把重组DNA导入受体细胞进行扩增
• 根据所用载体的特性选择适宜的受体细胞
及选择适宜的重组DNA导入的方式:转化、 转染和转导。
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噬菌体转化大肠杆菌的方法
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λ 噬菌体的体外装配

有两种不同的系统可以应用: 一种是cos位点突变的噬菌体的单品系系统。 另一种系统需要两种不同的缺陷品系一个 是基因D的突变体,另一个品系是基因E的突变 体,由于蛋白质合成的缺陷。体外的装配过程 可以利用两种不同培养物的混合物,含有完整 的外壳蛋白,完成装配过程。将装配的噬菌体 接入细菌就可以完成正常的侵染过程。
5.3.1.1 细菌转化的机制 5.3.1.2 化学转化法(CaCl2诱导大肠杆菌转化法) 5.3.1.3 电激法(电穿孔转化法) 5.3.1.4 转化率的计算及其影响因素
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5.3.1.1 细菌转化的机制
• 转化(transformation): 重组质粒 DNA 分子通过与膜蛋白结合进入受体 细胞,并在受体细胞内稳定维持和表达的过程称为 转 化 。 自然界中,转化并不是细菌或的遗传信息的主 要方式,实验室中只有小部分的细菌可以很容易的 转化,进一步的研究发现,这类细菌含有DNA结合和 吸收的代谢机制。正常条件下,大部分细菌包括大 肠杆菌,只能吸收有限的DNA,为了提高转化效率, 建立了一系列的转化方法: a. 热激法转化感受态细胞 b. PEG介导的原生质体转化
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5.3.1.4 转化率的计算及其影响因素 • 转化率:
是指 DNA 分子转化受体菌获得转化子的效率。
• 转化率计算:
=转化子总数/DNA分子总数或质量
或 =转化子总数/受体细胞数
• 实际中按转化子总数/DNA分子质量(g)计算
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5.4 重组子筛选的方法
5.4.1 遗传表型直接检测法
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DNA分子连接
不同的DNA片段(目的基因和载体)经适 当酶切后,在连接酶的作用下,连接在一起构 建成重组DNA分子 。
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5.1.1 DNA重组(连接)的类型
• 插入重组: 载体上只有唯一的酶识别位点 随机(非定向)插入 • 置换重组 (1) 载体上有两个同样的酶识别位点 随机(非定向)置换
• 原理:利用高压电脉冲作用,在细菌细胞膜上进行电穿孔
( electroporation ),形成可逆的瞬间通道,促进外源 DNA 的有效吸收。 • 特点:
1. 感受态细胞制备简单; 2. 转化率高达109~1010个转化子/g质粒DNA;
3. 用途广泛,但需特殊仪器电激仪。
• 除感受态细胞制备及转化与化学法不同之外,其余步骤包 括所设转化对照与化学法相均相同。
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利用lacZ'基因的插入失活筛选重组噬菌斑
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5.3.3 重组DNA分子转入真核细胞 • 重组DNA分子导入植物细胞-植物基因工程 (见后面第八章) • 重组DNA分子导入哺乳动物细胞-动物基因 工程(见后面第九章)
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5.1.3 DNA重组中需注意的问题
• 两端具相同粘性末端的 DNA 分子会发生自 身环化。 • 对于置换重组,需将切割的 DNA 分子经过 凝胶电泳分离,回收目的片段。
• 无论单酶切还是双酶切,目的 DNA 分子均 可能发生串联,必需检测重组 DNA 插入片 段的分子大小。
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5.2.2 受体细胞选择的原则
• • • • • • • • • • 外源DNA分子能稳定存在,限制酶缺陷型; 重组基因缺陷型; 易于转化/ 转导; 易筛选 遗传稳定性高,易于扩大培养; 安全性高; 内源蛋白酶基因缺失或缺陷; 遗传密码无明显偏好性; 具有较好的转译加工机制; 较高的理论和实践应用价值。
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第五章 目的基因导入和重组子的筛选
5.1 DNA片段的连接重组
5.2 受体细胞选择的基本原则
5.3 基因转移
5.4 重组子的筛选
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5.1 DNA片段的连接重组
5.1.1 DNA连接类型 5.1.2 DNA片段之间连接的方式 5.1.3 DNA重组中需注意的问题
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• 体外装配(in vitro packaging):λ DNA的转染 效率不高,如果将重组的λ分子装配成头-尾结 构的病毒粒子,将极大的提高效率。
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噬菌体转化大肠杆菌的方法
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5.3 基因转移(gene transfer)
• 载体与目的基因连接后,体系中可能存在下列分 子: a. 未连接的载体分子 b. 未连接的DNA片段 c. 载体的自连 d. 含有错误插入片段的重组DNA分子 e. 重组DNA分子 转化过程中,这些分子同时被转移到宿主细 胞内。未连接的分子即使被细菌摄取,只有在特 殊的条件下才能复制,寄主的酶可降解这些DNA片 段。自连的载体和错误插入的重组质粒可以进入
(2) 载体上有两个不同的酶识别位点
定向置换
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5.1.2 DNA片段之间连接的方式 • 具互补黏性末端片段之间的连接
• 具平末端DNA片段之间的连接
• DNA片段末端修饰后进行的连接
• DNA片段加linker or adaptor后的连接
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