流式细胞仪荧光补偿——1
多色流式细胞术-荧光素和脱机补偿(ppt课件)
PE-Cy5.5标记抗体
开创荧光标记的新纪元
发射波长范围广:由近紫外-可见-近红外 适于多色分析和制成Tandem荧光染料 毫无例外地得到最好, 最亮的标记物
Alexa Fluor标记抗体特性
多色流式细胞术的必要性
CD4/CD8绝对计数 白血病/淋巴瘤免疫分型 微小残留白血病 祖细胞分析 树突状细胞分析 Naive/Memory T细胞亚群 细胞凋亡分析 增殖/活化分析 细胞周期分析
其它临床/科研应用
多色流式细胞术的必要性
BLOOD, 2000; 96(8): 2691-6
亮度(Brightness)
Alexa Fluor标记物的荧光强度远高于其它标记物
光稳定性(Photostability)
Alexa Fluor标记物的光稳定性强于大多数其它荧光标记物
pH不敏感(pH insensitivity)
Alexa Fluor标记物在很宽的pH范围内均保持高荧光强度
水溶性(Water solubility)
由近紫外可见近红外毫无例外地得到最好最亮的标记物适于多色分析和制成tandem荧光染料wwwgotofcmcomalexafluor标记抗体特性亮度brghtnessalexafluor标记物的荧光强度远高于其它标记物光稳定性photostabialexafluor标记物的光稳定性强于大多数其它荧光标记物ph不敏感phalexafluor标记物在很宽的ph范围内均保持高荧光强度水溶性watersolubialexafluor染料水溶性好因此标记时无需有机溶剂wwwgotofcmcomalexafluor488fitc亮度光稳定性carboxyfluoresceinoregongreenalexafluor488ph敏感性wwwgotofcmcom标记抗体wwwcaltagcomwwwgotofcmcom标记抗体wwwcaltagcomwwwgotofcmcom标记抗体wwwcaltagcomwwwgotofcmcom亮度antb220alexaflur光稳定性极好wwwgotofcmcom标记抗体wwwcaltagcomwwwgotofcmcom脱机补偿necompensatwwwgotofcmcomwwwgotofcmcom多色分析的利器脱机补偿necompensat减少操作时间和样品用量纠正误操作wwwgotofcmcom多色分析的利器脱机补偿necompensatwwwgotofcmcom所有产品与软件信息请登陆wwwgotcmcom免费电话
流式细胞仪的参数
这一过程,成为流体动力学聚焦
FLOW CELL
Injector Tip
Sheath fluid
Hale Waihona Puke Fluorescence signals
Focused laser beam
excited electron ENERGY EMITS ENERGY AS LIGHT
ATOM
光路-荧光信号
每种荧光染料均有特定的激发波长,
2. FCM在免疫学中的应用:
(1) 各种免疫细胞的表面标志, 细胞分选等; (2) 细胞内各种细胞因子的检测;
(3) HLA群体分型; (4) 细胞增殖 CFSE法:活体染料羧基荧光素酰乙酸 (Carboxyfluorescein diacetate,succinimidyl ester, CFDA-SE)是一种非极性分子,可自由穿透细胞膜并 在细胞内被酯酶转化成具有绿色荧光的氨基反应性羧 基荧光素琥珀酰亚胺酯(CFSE)。CFSE只有当细胞 发生分裂时,才会平均地分配到子代细胞中。因此 CFSE含量减少的细胞代表增殖的子代细胞。
Schematic representation of the Annexin V assay
FCM分析细胞周期和凋亡: 根据细胞DNA含量的改变 凋亡细胞DNA的降解,凋亡的细胞因核酸内切酶 的活性增强,使DNA分裂成一些小片段,这些小 片段因细胞膜的通透性的增加而漏出胞外,使凋 亡细胞的DNA含量相对减少,与荧光染料的结合 减少,故细胞DNA荧光强度降低;DNA直方图上显示 在G0/G1峰前出现一个DNA含量减少的亚二倍体或 称亚G0/G1峰, 又称凋亡峰.通过DNA含量可同时 研究凋亡细胞的周期特异性。
流式细胞仪分析技术及应用
流式细胞仪分析技术及应用流式细胞术(FCM)是以流式细胞仪为检测手段的一项能快速、精确的对单个细胞理化特性进行多参数定量分析和分选的新技术。
流式细胞仪的发展综合了激光技术、计算机技术、显微荧光光度测定技术、流体喷射技术、分子生物学和免疫学等多门学科的知识。
概述流式细胞仪由液流系统、光学与信号转换测试系统和信号处理及放大的计算机系统三大基本结构组成,可对细胞悬液中的单个细胞或特定细胞或其超微结构进行多参数快速分析。
一、工作原理(了解)基本组成结构1.液流系统由样本和鞘液组成。
待测细胞被制备成单个细胞的悬液,经荧光染料标记的单克隆抗体染色后置入样品管中,在清洁气体压力下进入流动室形成样本流;鞘液是辅助样本流被正常检测的基质液,其主要的作用是包裹在样本流的周围,使其保持处于喷嘴中心位置以保证检测的精确性,同时又防止样本流中细胞靠近喷孔壁而堵塞喷孔。
2.光学系统由激光光源、分光镜、光束成形器、透镜组和光电倍增管组成。
(1)激光光源:现代流式细胞仪采用的多为气冷式氢离子激光器,常用激光束波长为488nm,15mW。
(2)分光镜:作用是反射较长波长的光,通过较短波长的光。
(3)光束成形器:由两个十字交叉放置的圆柱形透镜组成。
(4)透镜组:有3个透镜,作用是将激光和荧光变成平行光,同时除去离散的室内光。
(5)滤片:长通滤片,允许长于设定波长的光通过;短通滤片,允许短于设定波长的光通过;带通滤片,允许一定带宽的波长通过,其他波长的光不能通过。
(6)光电倍增管(PMT):主要作用是检测散射光和荧光,同时将光学信号转换成电脉冲(数字数据)信号。
3.数据处理系统主要由计算机及其软件组成,进行实验数据的分析、存储、显示,是流式细胞仪组成部件中的重要环节。
二、散射光的测定散射光信号的产生是细胞在液柱中与激光束相交时向周围360°立体角方向散射的光线信号,散射光的强弱与细胞的大小、形状、光学同性、胞内颗粒折射有关,与接收散射光的方向也有关。
科学仪器学流式细胞仪
流式细胞仪生命科学是一门以实验为基础的学科,要做实验必然少不了仪器设备。
仪器设备的好坏也是衡量一个实验室水平的重要标志之一。
同学们已经进入大学二年级下的学习,会越来越多地接触到一些科研仪器,今天我们要讲的是其中之一----流式细胞仪。
图1 流式细胞仪及流式细胞图1.1 流式细胞仪基本结构与功能1.1.1 流式细胞仪基本结构流式细胞仪(flow cytometer,FCM)是集现代物理电子技术、激光技术、计算机技术于一体的先进科学技术设备,是生命科学研究领域中先进的仪器之一。
概括来说,流式细胞术就是利用流式细胞仪对处于快速直线流动状态中的单列细胞或生物颗粒进行逐个、多参数、快速的定性、定量分析或分选的技术。
它具有如下几个特点:①实现对单列细胞或生物颗粒进行逐个检测。
只要标本是单个细胞或生物颗粒,即可用于分析,如血液、骨髓、体液中的细胞、培养细胞等,实体组织经处理后制成的单细胞悬液也能分析。
②实现高通量检测。
只要标本中的细胞或生物颗粒数量足够,短时间内可分析大量细胞或生物颗粒。
流式细胞仪可以每秒钟数十、数百、数千个细胞的速率进行检测,被检测的细胞总数可达数千、数万乃至数百万个。
③多参数、多色荧光分析对细胞特性的识别、计数更为准确。
用不同荧光素标记的单克隆抗体进行多色荧光染色,可同时分析单个细胞或生物颗粒的多种特征,使细胞特性的识别、计数更为准确。
④定性或定量分析细胞。
通过荧光染色对单个细胞或生物颗粒的某些成分,如DNA含量、抗原或受体表达量、Ca2+浓度、酶活性、细胞的功能等均可进行单细胞水平的定性与定量分析。
⑤分选特定性状或功能的细胞。
有些流式细胞仪还具有细胞分选功能,可将具有特定性状或功能的细胞从混合细胞群中分离出来。
总之,它具有检测速度快、测量指标多、采集数据量大、分析全面、分选纯度高、方法灵活等特点。
流式细胞仪的基本结构包括四大模块:流动室与液流系统、光源与光学系统、信号收集与信号转换系统、计算机与分析系统。
流式细胞仪结果分析
CD4+Th细胞、CD4+/CD8+比例
六、自身免疫病相关HLA抗原分析
HLA-B27可出现在58%~97%的强直 性脊椎炎 As 患者
七、移植免疫中的应用
FCM作为一个强大的技术平台,已应用于多个领 域,其在移植免疫分析中的应用也越来越广泛, 目前移植免疫中的FCM应用主要包括流式细胞 术的交叉配型 Flow cytometry cross-matching, FCXM 和群体反应性抗体 Panel reactive antibody, PRA 检测,
样本来源:各种细胞 如外(ZHOU)血,骨 髓,实体组织、悬浮或贴壁培养的细胞 ,微生 物,人工合成微球等, 检测大小:一般是0.5um~40um
流式细胞仪的组成
液流系统 光学系统 数据处理系统
分选系统
分析型流式细胞仪
分选型流式细胞仪
液1 液流流系统
流动室
流动室 Flow cell 是液流系统的核心部件,流动室是由石英 玻璃制成,单细胞悬液在流动室里被鞘液流包绕通过流动 室内一定孔径的孔,检测区在该孔的中心,细胞在此与激光 垂直相交,
荧光染料的特性
•激发波长 EXCITING •发射波长 EMISSION
荧光补偿
四、细胞分选原理
通过流式细胞仪进行细胞分选主 要是在对具有某种特征的细胞需进 一步培养和研究时进行的,
一 分选基本原理
细胞悬液形成液流柱 压电晶体 产生机械振动
流动室振动
液流断裂成液滴
空白液滴 不充电
弃去
含细胞的液滴 充电
微小的乳胶微球分别染成上百 种不同的荧光色 固相芯片是用 探针在芯片上的坐标位置给基 因的特异性编码;而液相芯片 则是用颜色来编码
有关流式荧光补偿
荧光补偿一、为什么要调节荧光之间的补偿每一种荧光素分子都发射某一特定波长范围内的光然而这些荧光的发射光谱会发生重叠有时这种重叠现象非常显著。
比如说FITC、PE 、Cy5-PE这三种荧光素都能够被488nm的氩离子激光器激发激发后的发射波谱分别是FITC的发射峰在520nm左右。
PE在575nm左右而Cy5-PE在670nm 左右。
如图为了能够同时检测这三种发射光信号我们只能通过合适的带通滤光镜来选择性地通过某一特定波长范围内的光。
滤光镜的选择依赖于荧光素发射峰的位置通常来说滤光镜要能够收集靠近荧光素发射峰波长范围内的光波。
比如说FITC我们选用530/30滤光镜既这种滤光镜能够收集515-545nm范围内的光波。
然而我们选用的任何一种滤光镜都不可能仅仅收集一种荧光染料的发射光比如FITC有一部分发射光进入到我们用来收集PE575nm的区域因此只要FITC存在我们不仅在FL1通道收集到530/30的光信号还能在FL2通道上接受到一部分FITC的发射光信号如果同时还加入了PE那么我们怎样判断FL2收集到的光信号有多少来自于PE 多少来自于FITC 呢这就是我们要提的补偿问题。
所谓“补偿”就是除去某一荧光素误入到其它荧光通道中的发射光信号。
具体来说我们必须将FL2荧光通道收集的光信号中属于FITC的那一部分减去才能确切地知道PE的发射光到底是多少。
二、怎样实现补偿荧光素有这样一个特性它被任何一个荧光通道检测到的光信号的比值例如FITC在FL1FL2通道的值是恒定不变的不会随着PMT电压仪器灵敏度的改变而变化。
因此在理想状态下我们能够通过检测FL1通道的值来确定FL2通道的值从而确切地知道怎样正确调节FL2的补偿。
这样我们才能确定实现补偿后FL2通道检测的光信号只是PE发出的不再有FITC的干扰了。
从数学上说实现从FITC到PE的补偿只需从FL2检测到的信号中减去FITC的部分理论上FL1的值越高它进入到FL2中的部分也越多因为两者的比值是不变的。
流式细胞术实验技巧及数据分析
64um
激发光源与光束成形系统
20um
强度
32um 0 32um
这种椭圆形 光斑的检测 区保证每个 细胞分别受 到光照且受 检时受到一 致的光照
FCM的单细 胞照明技术
荧光光谱重
FITC和PE荧光光谱重叠
荧光补偿
FL2
Uncompensated vs Compensated
FL1
利用电子技术或计算机软件等方法将串入相邻
调节性T细胞检测
G3=R1*R3 G4=R1*R4
凋亡细胞测定
凋亡细胞测定
细胞凋亡检测
阴性的设置
血小板检测
血小板检测
血小板检测
血小板检测
谢谢
做事情尽量要主动,主动就是没人告诉你,而你在做着恰当的事情。 好习惯的养成,在于不受坏习惯的诱惑。 世界上只有想不通的人,没有走不通的路。 既然我已经踏上这条道路,那么,任何东西都不应妨碍我沿着这条路走下去。——康德 人而无信,不知其可也。——《论语·为政》 世间的许多事情都如此。当你刻意追求时,它就像一只蝴蝶一样振翅飞远;当你摒去表面的凡尘杂念,为了社会,为了他人,专心致于一项事情时 候,那意外的收获已在悄悄地问候你。 不抱有一丝幻想,不放弃一点机会,不停止一日努力。 不过,一切纪律都当小心地施用,除了诱导学生去把他们的工作完全作好以外,没有别种目的。——夸美纽斯 敢于质疑自己认为不相信的事情,并追究其中的道理。 天下之事常成于困约,而败于奢靡。——陆游 友情,是人生一笔受益匪浅的储蓄。这储蓄,是患难中的倾囊相助,是错误道路上的逆耳忠言,是跌倒时的一把真诚搀扶,是痛苦时抹去泪水的一 缕春风。 你永远要宽恕众生,不论他有多坏,甚至他伤害过你,你一定要放下,才能得到真正的快乐。
双克隆细胞周期分析
关于流式荧光标记补偿设置和荧光三标的疑问
1、准备用FITC,PE和APC进行三标,检测三标细胞占待检测细胞的百分比。
预实验摸抗体浓度时,用单标管与相应的同型对照管比较,在二维散点图上,发现部分指标除在检测通道上偏移,在无关通道上散点也有偏移,我想这就应该是补偿需要做的事情了吧。
根据预实验的结果,发现荧光的部分干扰现象,如PE检测影响APC和FITC,FI TC影响APC,而APC不影响PE和FITC等。
问题:(1)很奇怪的是FITC和APC的发射光谱距离很远,应该没有干扰才对。
为什么也发现了APC受到FITC的影响?是哪里出了问题?(2)三种荧光之间是否两两之间都必须进行补偿?是否APC对PE和FITC不需要补偿?(3)流式可以根据二维散点图检测双阳细胞所占的百分比,那么流式能否测出三标细胞占待检测细胞的百分比?如果可以,应该如何操作?(4)检测三标各管如何设置才最节省且结果最可信?APC和前二者间不做补偿。
它们不是由同一根激光激发,走不同的光通道,互相之间没有影响,因此不用。
PI&FITC均由488nm激光激发,走相同的光学通道,两者的发射波长有重叠部分,因此要求补偿。
这样说有误导,APC和FITC/PE间确实“通常”不需要compensate(也不绝对),但不是因为激发波长不同,而是由于发射波长相差较远,overlap很少。
同是488nm激发的P E-Cy5.5就和APC有overlap,通常需要compensate。
其实compensation很简单,一个一个地run单色control,一个一个地compensate就好了。
2、还有一个问题阳性细胞和阴性细胞在散点图上应该有明显的分群,但是为什么我检测的图形只是整体有微弱偏移,而并没有明显的分群?难道是抗体浓度太低了?我也试着提高抗体浓度,提高了一倍,还是没有明显的改观。
请帮忙分析一下原因。
(1)关于这三种荧光之间的干扰问题,大家看附件里面的图就明白了,因为FITC的发射光是一个宽范围,会漏到PE里面,所以PE的检测器里会检测到FITC的光,因此需要调解补偿,去除这部分假阳性。
流式细胞仪的荧光补偿问题课件
荧光补偿不当还可能 影响流式细胞仪的定 量和定性分析结果。
荧光补偿问题可能导 致实验结果的不稳定 性和不可重复性。
荧光补偿问题的解决方法
01
02
03
04
在实验设计时,应尽量选择光 谱不重叠的荧光染料,避免干
扰。
通过软件算法和校准技术,对 荧光补偿问题进行修正和优化
。
可以使用标准样本进行荧光补 偿校准,以提高实验数据的准
流式细胞仪的荧光补偿问题课件
目录
• 引言 • 流式细胞仪的工作原理 • 荧光补偿的问题分析 • 荧光补偿问题的实验研究 • 总结与展望 • 参考文献
01
引言
背景介绍
流式细胞仪是一种在生物学、医学和 生物工程领域广泛使用的技术,可用 于对细胞进行快速、多参数的分析。
荧光补偿是流式细胞仪分析中的重要 环节,通过对荧光的补偿可以纠正仪 器对不同荧光信号的偏差和不一致性 ,提高实验结果的准确性和可靠性。
实现实时荧光补偿
开发能够实时进行荧光补偿的 流式细胞仪,提高实验效率, 减少误差。
提高荧光补偿的自动化程 度
研究能够自动进行荧光补偿的 算法和技术,减少人工操作的 误差和繁琐程度。
多维数据分析
利用多维数据分析方法,对流 式细胞仪产生的多维荧光数据 进行深入分析和挖掘,发现更 多生物标记物和疾病标记物。
L.L. Wheeless et al., Flow Cytometry
A Practical Approach, 3rd ed., Academic Press, 2016.
THANKS
感谢观看
实验步骤
详细描述实验操作流程, 包括样本准备、上机实验 、数据收集及处理等。
实验结果及分析
1流式细胞仪基础知识介绍
流式样本的前处理
流式数据的获取和分析
流式细胞仪上机流程
开机
仪器质控
建立模板
仪器设置
采集数据
仪器设置
用户可通过PC端软件进行以下条件的设置,并可直观观察到变化,从而获得满意的结果。
电压
• PD或PMT控制
• 可由用户调节
• 各通道互不干扰
• 图像上目标细胞位 置随电压变化实时 更改
✓荧光素 常见荧光素及其激发激光器
信号产生要素之三
荧光 染色
荧 光
荧光 素
素
角
色
荧光 标记
荧光素 抗体
携带抗原的细 胞
信号产生原理
信号收集原理-滤光片
滤光片
长通滤片 波长大于特定功能的光可以通过,波长小于该波长的光被反射 短通滤片 波长小于特定功能的光可以通过,波长大于该波长的光被反射 带通滤片 波长在某特定范围内的光可以通过,波长在该范围以外的光被反射
• 调整原则:通常使 目标细胞位于中央 或靠近中央位置
阈值 • 各通道均可设置 • 单通道阈值设置 • 多通道or\and组合 • 去除噪声及碎片
流速
• 低、中、高速
• 低速样本流最稳 定
• 高速收集速度最 快
停止条件
• 时间 • 体积 • 粒子数
• 特定目标细胞 团
• 在选定条件点 自动停止测试
数据分析要素
多种生物物理性质的方法,同时也是一项可以把具有某相同荧光信号特性的某些细胞亚群从多 细胞群体中分离和富集出来的细胞分析技术。
流式细胞仪(flow cytometer): 是一种集激光技术、电子物理技术、光电测量技术、电子计算机技术、细胞荧光化学技术
补偿难于上青天?!——如何使用flowjo调节补偿
补偿难于上青天?!——如何使用flowjo调节补偿上一期我们讲了流式荧光补偿这个概念,以及我们怎么使用flowjo完成流式的荧光补偿调节,这一期我们深入给大家分享纯经验内容,即:我们如何判断自己的实验结果中荧光补偿的调整是否合适。
要做到补偿调节合适,我们需要做到2点即可,第一就是该调的补偿调好了,第二就是没有补偿被调过了。
我们如何发现该调的补偿没调好呢?关键词就是“形状”,不知道大家注意了这个问题没有,一张流式双参数散点图,在实验结果良好的情况下,形状一定是横纵走向的,即如下:所有的双参数散点图都是呈现横/纵的走向,总的来说大部分细胞群都是圆形/椭圆形。
所以当我们发现细胞群形状明显为对角线走向时,往往提示可能出现2种问题:1.死细胞过多,2.补偿调节不到位。
而后者往往在一个通道的高阳性区和另一个通道低阳性区出现对角线方向的细胞群:例如此数据中APC-CY7/PE-CY7的双参数散点图下出现了APC-CY7 high/pecy7low的细胞群呈现了一个对角线的偏移,即提示存在补偿调节不足的情况出现。
此时我们进行反向补偿调节,即在flowjo上打开补偿矩阵,点击edit进入手动调节模式,增加pe-cy7-apc-cy7的值,即可让实验结果修复正常:注意,A-B即在补偿矩阵的纵列选择A通道,横列选择B通道,大家不要弄反了哦!复后的实验结果,所有分群呈现横纵分布针对补偿不足总结来说,我们在reviews数据时一定要去观察结果的所有双参数散点图,一旦出现流式分群的形状异常时,就应该进一步判断是否补偿不足或是死细胞干扰了。
那么,如果补偿调节过度了,我们如何发现并调节呢?发现补偿调节过度,关键词就是“双阴性群”。
如果我们在review流式结果时发现有的双参数散点图出现了比较诡异的2团阴性细胞群,就需要警惕是否是某个通道的补偿调节过度了。
比如我们在review结果时,发现BV421/fitc双参数散点图中,有2个阴性细胞群,主要是在FITC上出现了双阴性,这是就要高度怀疑fitc和某个通道的补偿调过了。
BeamCyte流式细胞仪快速操作指南
BeamCyte 流式细胞仪快速操作指南流程开机首先打开电脑,电脑正常开机后打开仪器后面板电源键启动仪器,在配套电脑上打开Cytosys 软件,待仪器初始化完成,软件状态栏将显示“就绪”,即可进行下一步操作。
QC 测试1 制备BeamCyte QC微球悬液。
2 点击主菜单“系统维护”→“QC测试”,根据软件提示完成QC测试。
3 QC测试所有项目结果均为 Pass 时,可进行下一步操作。
新建实验1 点击主菜单“文件”→“新建”→“新建实验”,建立新的实验文件。
2 用以下多种方式新建实验样本或标本:在“实验管理”面板,右键点击“实验文件名”,在本实验文件下新建标本。
右键点击“标本”,在选中的标本下新建样本。
如果已有模板文件,点击主菜单“文件”→“新建”→“从模板新建”,将新建有相同模板的标本或样本。
3 点击主菜单“文件”→“保存”,保存选中的实验文件或其他文件。
注:如果已导出fcs文件,文件名会变色。
荧光补偿1.自动荧光补偿准备各个荧光参数的单染样本和未染色对照样本。
点击菜单“开始”→“自动补偿”,弹出“新建自动补偿”对话框,进行自动补偿条件设置。
选择需要使用的样本,并点击“确定”。
软件将自动新建“补偿标本”。
逐管采集单染样本,软件自动计算荧光补偿。
将自动计算的荧光补偿右键导出保存。
2.手动荧光补偿两种方式手动调节荧光补偿:需要补偿的参数两两做密度图,点击快速补偿按钮,拖动快速补偿滚动条,使某一荧光单阳性细胞与阴性细胞在另一荧光通道的荧光强度相等。
逐个调节直到所有参数之间的补偿完成。
补偿前补偿后补偿调节的过程也可以通过点击菜单“开始”→“当前补偿”调出当前样本的补偿矩阵,不断调整溢出矩阵中相应单元格的补偿系数来实现。
采集样本1 在“实验管理”面板,双击试管,使之成为当前试管(蓝色箭头指示)。
2 设置采集条件:设置采集使用的“参数”,,包括选择采集通道并定义别名和电压,初次实验的电压需用调试模式调整。
流式细胞仪操作
Fluorophore BV421 BV570
Pacific Blue Pacific Orange
V500 FITC/AF488 PerCP-Cy5.5
PE
PE-TR
PE-Cy5
PE-Cy7 APC/ AF647
AF700
APC-Cy7
Compensated
FL2-15%FL1
Over Compensated
FL2-30%FL1
Intensit y No. of Cells/Channel
Time (msec)
Signal Intensity (channel)
如何看流式图—散点图
这张图你能看出什么?
如何看流式图—直方图
单峰
流动室(分选)
软件分析系统
分析软件
1. 机器自带分析软件:SUMMIT 2.第三方分析软件:Kaluza, Flowjo, Facs express, CFCS 3.特殊分析软件 :周期分析软件Modifit , Wincyle
What does compensation mean?
PE-Cy7 PE-Cy5
Time Sample Left in Light
0 hours
PE (FL2)
2 hours
22.5 hours
Tandem Conjugates functionality can be sensitive to the environment
如何选择荧光染料
1、根据现有的仪器所有的激光器与通道进行选择,不能只有 488nm、633nm 的激光却选择405nm激光激发的荧光素 ,calibur 是 双激光4色的流式细胞仪,所包含通道FITC\PE\PERCP5-5\APC 2、表达比较弱的选择比较强的荧光素,表达比较强的选择较弱的荧光素
onecompebeads荧光补偿微球
OneComp eBeads荧光补偿微球为什么要调节补偿?流式细胞仪的荧光补偿隔一段时间之后需要调整到适合的位置。
如果荧光补偿没有调节好,会导致细胞分群不明显或者流式检测得到的结果图非常不漂亮,而且会影响到检测结果的不真实。
荧光补偿的调节对初学者来说非常不容易掌握,同时,补偿调节是流式细胞术中比较难掌握的操作。
尤其是一些不常见的标志检测时,需要经验非常丰富的流式操作者根据多年的经验判断调节补偿,才可以得到比较好的数据和图片。
荧光染料发射光谱的重叠FITC和PE间的重叠就是一个光谱重叠的示例。
在单染FITC过程中必须减去或者补偿PE通道出来的荧光。
如何调节补偿?•调节光电倍增管的电压•检测每种荧光素的自发荧光•设置每种荧光素的单染对照(阳性表达)。
什么是单染对照?•阴性细胞•补偿微球细胞似乎是一个不错的选择,但微球却非常好的替代细胞,因为细胞来源可能有限或感兴趣的抗原表示在低水平。
调节补偿要注意:•通常要准备一管没有染色的细胞以调节PMT电压。
•不能用阴性(不染色的)微球来设置电压。
OneComp eBeads补偿微球原理:OneComp eBeads 微球大约是淋巴细胞的大小,可连接各种荧光标记的抗体作为调节补偿使用。
每滴微球中都含有两群:一群是可以结合抗体的阳性群,一群是不会与抗体反应的阴性群。
产品目录号: cat# 01-1111 规格:100 tests •使用方便,一滴即可。
•与所有小鼠、大鼠和仓鼠来源的抗体反应,无论它们的轻链是kappa还是lambda。
•适用于各种激发光:*适用于488 nm 蓝光,532 nm 绿光,561 nm 黄光,633-635 nm 红光,应用于405nm 紫光的荧光素中只需对eFluor® 450 进行过优化。
OneComp eBeads 的优点:•确保正确的补偿,以保证正确的阳性率和阴性率。
•微球可增强信号,优化补偿。
•样本细胞中抗原可能会表达比较弱,而致补偿不准确。
flowjo荧光补偿
注册 |登录构建全球华人科学博客圈返回首页 RSS 订阅 帮助 FlowJo 软件荧光补偿已有 888 次阅读 2012-6-27 11:15 |个人分类:FlowJo 使用|系统分类:科研笔记|关键词:FlowJo ,荧光补偿,软件补偿,博文FlowJo 软件荧光补偿在做多色流式实验的时候,荧光补偿是必需必须进行的步骤。
FlowJo 可以根据荧光补偿单染对照管的数据生成补偿矩阵,并可以对补偿矩阵进行调整。
一、用FlowJo 做荧光补偿并进行数据分析的步骤 1.在补偿编辑器中导入单染管的数据并生成荧光补偿矩阵 2.将补偿矩阵应用到组,对组里面的所有数据进行荧光补偿 3.对补偿过的参数轴启用双指数转换功能二、FlowJo 荧光补偿的具体步骤如果荧光补偿单染对照的数据很好,阴性细胞群和阳性细胞群的分群很明显,只需要将单染管的数据导入FlowJo 的补偿编辑器里,FlowJo 能自动设门,界定出阴性细胞群和阳性细胞群,并计算出荧光补偿矩阵。
操作非常简单,下面的4个步骤便可完成荧光补偿: 1.将数据拖入FlowJo 工作台。
演示数据为:3 color comp 数据,为三色实验的数据。
Cy5PE comp.fcs, FITC comp.fcs, PE comp.fcs 为单染对照管数据;3-COLOR.FCS 为样本数据,同时染了Cy5PE, FITC, PE2.到工作台菜单栏的“窗口”栏选择“打开补偿编辑器”,打开后如下图所示。
点击单染管对应的Sample 列,在弹出的下拉列表中选择对应的单染管数据。
比如在下图的例子中,在Flour 单染管中导入FITC comp.fcs张千君加为好友 给我留言 打个招呼发送消息FlowJo 中文技术博客分享/u/FlowJo流式细胞技术相关资源分享,流式细胞数据分析,流式技术支持及培训博客首页动态记录博文相册主题分享好友留言板个人资料3.按照步骤2中的方法,在3个单染管中都导入对应的数据之后,FlowJo能自动进行设门,界定出阳性细胞群和阴性细胞群,并计算出荧光补偿矩阵。
流式细胞仪荧光补偿调节方法
流式细胞仪荧光补偿调节方法
流式细胞仪荧光补偿调节方法是一种在流式细胞仪中调节荧光信号的方法。
该方法通过对荧光信号的补偿,可以减少荧光信号间的交叉干扰,提高细胞分析的准确性和可靠性。
该方法的具体步骤包括:
1. 在流式细胞仪中采集样品,并使用不同波长的激光激发荧光信号。
2. 对每一个荧光信号进行背景噪声检测,并计算出荧光信号的补偿系数。
3. 根据每个荧光信号的补偿系数,对所有荧光信号进行补偿调节,使得每个荧光信号都能够达到最佳检测效果。
4. 对调节后的荧光信号进行分析,得出准确的细胞分析结果。
该方法的优点是能够减少荧光信号的交叉干扰,提高细胞分析的准确性和可靠性。
同时,该方法也比较简单易行,适用于不同类型的细胞分析研究。
- 1 -。
流式细胞仪荧光补偿
流式细胞仪荧光补偿(一)在流式细胞仪分析中用到的“荧光补偿”这个术语是指修正荧光渗漏的过程,如从探测器除去除匹配荧光以外的任何荧光信号。
荧光补偿过程从原理上来说相对简单,但实际上涉及许多精细、敏感的方面从而使在实践操作相当复杂。
非常不幸,荧光补偿操作可能是在流式操作中的数据采集和分析等步骤中最少被了解和掌握的内容,可能是因为在介绍它时经常要用到线性代数来计算,并且还要求了解它的产生原理。
然而,正确的荧光补偿对于许多流式分析来说绝对是至关重要的,特别是对现常见的多抗原荧光表达强度分析。
因为荧光补偿常被误解、误用并被许多不正确的观念所包围,许多实验室的荧光补偿设置都不正确。
本章的一个部分将剖析有关补偿的一些疑惑问题。
图1显示在设置荧光补偿中常犯错误。
本章将致力于从以下方面阐述流式细胞仪荧光补偿问题:为什么它是必须的,它是如何通过硬件或软件来完成的,荧光补偿是如何时影响数据视觉效果的,最后是如何设计一个最佳的实验来获得一个正确的荧光补偿。
通过完整地阅读本章节,读者将学会为实验正确地设置荧光补偿并在出版物中识别出补偿设置不当的数据,并能够明白这些错误是如何影响分析结果的。
尽管全面的阐述荧光补偿不可避免地要涉及到一些线性代数的问题,但正确掌握荧光补偿并不一定要求要掌握它;在这两部分内容中的问题可根据你的意愿撇去或跳过。
大部分的流式用户不能正确回答图1中的三个问题。
对于问题1的正确答案是“样本2”。
对于问题2,答案中十字门虚线的位置就不正确。
最后,第三个问题的正确答案是:“不可能决定哪个图形中的荧光补偿是正确的”,因此其中没有哪个可以说中正确的。
如果一个正确的荧光补偿对于流式数据分析这么重要,并且又这么少的人知道如何正确地去设置它,而为什么到目前为止流式细胞仪的分析结果还都不错。
对于此问题的简单答案是绝大多数类型的数据分析并不绝对需要正确的荧光补偿。
此问题的另一个答案是不正确的荧光补偿在双色或三色分析中显得并不十分重要。
流式细胞仪基本原理
γ2a-PE
γ2a-PE
双色分析
3
4
Compensation2
Sample1,2……
γ1-FITC
A-FITC
B-PE
B-PE
※几色分析需要制备ห้องสมุดไป่ตู้个补偿对照管
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BD Products
• 是指某一波长激发光引起荧光素发射的一定波长范围内的荧光 • 发射波峰(最大发射波长):Em-Max
• 荧光素的使用:
• 选择正确的激光器 • 确定所需探测器(PMT)
488nm
520nm
异硫氰酸荧光素(FITC)
光学系统:滤光片
• 如何将一束混合的荧光区分开来,分别进行收集呢? • 滤光片置于荧光探测器前,限定其接收的荧光的波长范围 Longpass(LP)
荧光信号
双色直接染色
荧光素的激发和发射光谱
区别
• 任何发荧光的物质分子都具有这两个特征光谱(nm) • 激发光谱(Excitation,Ex):
• 是指能特异性地激发某种荧光素的一定波长范围内的光线,也称 为吸收光谱。 • 吸收波峰(最大吸收波长):Ex-Max
• 发射光谱(Emission,Em):
流式细胞仪的检测范围细胞结构?细胞大小?细胞粒度?细胞表面面积?核浆比例?dna含量与细胞周期?rna含量?蛋白质含量细胞功能?细胞表面胞浆核的特异性抗原?细胞活性?细胞内细胞因子?酶活性?激素结合位点?细胞受体?细胞内钙离子流式细胞仪的组成和工作原理电子处理系统数据分析形式光学系统检测信号液流系统流动室流式细胞仪分析过程液流系统液流系统flowcell流动室injectortip荧光信号聚焦的激光光束鞘液电子处理系统数据分析形式光学系统检测信号液流系统流动室散射光信号falssensorlaser散射光信号rightanglelightdetector??cellcomplexityssc复杂forwardlightdetector??cellsurfaceareafsc大小incidentlightsource前向角散射光fscforwardscatter细胞相对大小及其表面积侧向角散射光sscsidescatter细胞颗粒度及细胞内细胞器的相对复杂性前向角散射光信号侧向角散射光信号外周全血细胞散射光双参数点图红细胞溶解后荧光信号?使用不同荧光标记的单克隆抗体染色做多色分析?荧光信号的强弱反映了细胞抗原的表达含量荧光信号双色直接染色荧光素的激发和发射光谱?任何发荧光的物质分子都具有这两个特征光谱nm?激发光谱excitationex
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流式细胞仪荧光补偿(一)
“荧光补偿”指修正荧光渗漏的过程,如从探测器除去除匹配荧光以外的任何荧光信号。
要用到线性代数来计算,要求了解它的产生原理。
图1显示在设置荧光补偿中常犯错误。
大部分的流式用户不能正确回答图1中的三个问题。
对于问题1的正确答案是“样本2”。
对于问题2,答案中十字门虚线的位置就不正确。
最后,第三个问题的正确答案是:“不可能决定哪个图形中的荧光补偿是正确的”,因此其中没有哪个可以说中正确的。
绝大多数类型的数据分析并不绝对需要正确的荧光补偿。
此问题的另一个答案是不正确的荧光补偿在双色或三色分析中显得并不十分重要。
然而随着五色分在大多数实验室中开展,如果这些个问题持续下去将会导致实验失败。
图1中还显示了荧光补偿在正确检测抗原荧光表达强度中重要影响。
荧光补偿不足会导致弱阳性群体是假阳性颗粒增多,而过度补偿则会丢失弱阳性群体而导致假阴性。
自单激光双色分析出现后此过程变得十分重要。
每种荧光素分子都具有自身的光谱发射范围。
这些发射光谱之间存在相互叠加,如何才能计数多少信号是来自PE而又有多少信号是由FITC引起的呢?这个计算过程我们称为“荧光补偿”。
一步法荧光补偿
如果一种荧光染料的发射光可以被两个含有不同波段的滤光片的探测器检测到(如,在发射光谱的不同区域检测),那么就能根据其中一个探测器的信号计算出另一个探测中有多少信号。
这是因为这两个信号是成比例变化的(如图3)。
这个恒定特性是指我们能够根据绿色荧光探测器中的曲线面积(绿色荧光信号)来精确推算出橙色荧光探测器的曲线面积(如:橙色荧光信号)。
这两个值的比值可在没有FITC以外荧光的情况下计算得知。
用于此目的的样本被称为“荧光补偿调节样本”或是荧光补偿质控物,用于精确测定补偿值。
对于典型的流式细胞仪来说,FITC 发射光在橙色探测器中的信号大概是绿色探测器的15%。
因此,如果我们从橙色探测器中减少绿色探测器信号的15%,那无论有多少FITC信号存在,经校准后的橙色荧光探测器信号将总为零。
这时可在系统中加入PE荧光,橙色荧光探测器经扣除了15%的绿色信号后将显示真正的PE 荧光信号,而不用再考虑是否存在FTIC荧光了。
这就是“一步法”荧光补偿:在第二探测器中修正来自另一荧光的信号。
二步法(双)荧光补偿
从图3的荧光谱中可见PE荧光也有部分渗漏至FITC探测器中。
通过检测只染有PE荧光的细胞来获知此比例,一般它的数值是2%左右。
这称之为PE荧光补偿校正物。
但如果PE荧光出现在FITC探测器中,而同时我们又使用FITC荧光来修正PE探测器中的荧光信号,那这还能有可能来正确修正荧光渗漏来得真正的荧光信号吗?一个不完整的答案来解释此问题:在现有n色荧光分析实验,n是指在仪器上同时检测不确定的荧光数量;这个系统的荧光补偿功能可以完全解决此问题。
实际上,根据一些数学运算是有可能使用这种方法来精确调节补偿的(读者可以跳过下一章节,而不必研究其中原理)。
x F n定义为在n探测器中检测到的来自x荧光的信号。
这样fF1就是指FITC探测器中绿色荧光的信号;pF2是指橙色荧光探测器是PE荧光的信号。
D n是指探测n所检测到的荧光信号。
在此情况下,假设没有任可背景荧光信号;背景荧光信号将稍后讨论。
于是:
公式1
图2
图2 ( 左侧) 一个补偿调节不正确的数据仍能被分析。
这些图谱数据是外周血经CD3FITC和CD4PE或PE同型对照染色检测的结果。
顶端的图显示的是未经补偿调节的数据;列图中显示了FITC到PE中的补偿依次增加后的结果。
十字虚线是依据未染色样本(或是经两种荧光的同型对照染色)设定的来定义阳性细胞群体。
实线门是依据单荧光-同型对照染色设定的。
注意在任何一张图中,不用考虑补偿是否正确,都可正确计算CD3阳性细胞中表达CD4(CD3+CD4+)细胞的数据,但必须是基于单荧光-同型对照染色对照上的(左侧)。
完全以同型对照来设定的虚线十字门来统计将会导致错误的结果。
仅在补偿调节正确的情况下(中间图)才能够在CD3+CD4+细胞中准确计算CD4荧光;补偿不足时CD4荧光过强而当补偿过度时出现了阴性群体。
所以抗原浓度的检测对不恰当的补偿设定将会特别敏感。
图3 FITC和PE荧光发射光光谱。
发射光(由荧光分受激发后发出的光线)是在488nm光源下激发产生的(氩离子激光器发射光)。
FITC发射光的峰值大约在515nm,典型的用于收集它的发射光的滤片是在530nm(深灰色区域)。
PE的发射光是远红光线,峰值在575nm左右,检测它的滤片位此峰值中央。
注意FITC的发射光有部分延伸至PE信号收集范围(B);通常落在575nm波段的荧光信号约为530nm波段荧光信号的15%。
PE的发射光只有极少部分落在530nm波段中(C),通常它只占575nm波段信号的2%(D)。
公式2
x荧光在其他探测中的信号将与xFn计算例(n指代专门收集此荧光的探测器);这样,如要知道有多少真正的FITC或PE信号,就需要计算fF1和pF2。
现已知(自图3)fF1与fF2的比值是衡定的,就如同pF2与pF1一样,这个衡定比值定义如下:
公式3
公式4
因此,xSn是荧光素x在其探测器荧光信号与探测器n的渗漏系数。
这个值由检测补偿质控物来获得,此时样本所有荧光只来自于一个荧光素。
举例来说,FITC荧光补偿质控物:
公式5
公式6
公式7
这样,FITC荧光渗漏系数就是FITC染色样本在各个探测器中的荧光信号与FITC探测器荧光信号的比值。
类似的,PE荧光补偿质控物计算如下:
公式8
注意在公式8中D1和D2与在公式7的值是不同的,因为公式8中是指PE荧光的检测值。
一旦渗漏系统已知,它们便可用于染色样本来计算真正的荧光信号xFn。
回想上述公式5、6:
公式9
公式10
在这两个公式中还有两个未知数(fF1和pF2),它们可被解析如下:
公式11
公式12
fF1和pF2分别是指FITC在绿色荧光探测中的信号,PE在橙色荧光探测中的信号,这正是我们所期望的真正信号,从它的计算公式来看所有数值都是不变量,所以就不存在逻辑无限循环的情况。
PMT 200KHz
2000/s,一个微滴采集50个点。