琼脂糖凝胶电泳原理 PPT

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实验六PCR产物的琼脂糖凝胶电泳检测PPT课件

实验六PCR产物的琼脂糖凝胶电泳检测PPT课件
实验目的
• 1.掌握琼脂糖凝胶电泳的原理 • 2.学会琼脂糖凝胶的制作和进行电泳的方法
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实验原理
琼脂糖是一种线性多糖聚合物,天然聚合长链状分子, 在沸水中溶解,45℃开始形成多孔性刚性滤孔,凝胶孔径 的大小取决于琼脂糖的浓度,浓度越高,孔隙越小,其分 辨能力就越强。DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效 应和分子筛效应。
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2. DNA分子进行染色的原理(以溴化乙锭为例)
观察琼脂糖凝胶中DNA最常用的方法是利用荧光染料溴化乙锭进行染色。 溴化乙锭是一种高度灵敏的荧光染色剂,用于观察琼脂糖凝胶中的DNA分 子。溴化乙锭在紫外光照射下能发射荧光,当DNA样品在琼脂糖凝胶中从 负极向正极泳动时,溴化乙锭从正极向负极移动,这样溴化乙锭分子就会嵌 入到DNA分子中的碱基对之间形成络合物,这种络合物在紫外光下发射的 荧光要比单纯的DNA分子要强的多,便于DNA的检测。
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实验原理
(1)电荷效应 DNA分子在PH值高于其等电点的溶液中带负电荷,在
电泳时向阳极移动。
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(2)分子筛效益 在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度主要取决
于分子筛效益,即DNA分子本身的大小和构象(共价闭环 DNA>线状DNA>开环DNA),而且其迁移速度与其相对分子 质量的对数值成反比,所以不用相对分子质量的DNA分子可 以在琼脂糖凝胶电泳中分离。
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实验步骤
琼脂糖凝胶的配制
1g琼脂糖
100mlTBE缓冲液
5µl GoldView
Hale Waihona Puke 冷却到60℃第7页/共12页

实验三琼脂糖凝胶电泳ppt课件

实验三琼脂糖凝胶电泳ppt课件
2、将溶解的琼脂糖(约50℃)倒入制胶模具中,直至厚度为4-6 mm,插 入适当的梳子,在室温下冷却凝固。
3、充分凝固后小心垂直向上拔出梳子,以保证点样孔完好。将凝胶置入电 泳槽中,加0.5TBE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶1-2 mm。
(二)点样
用微量取液器(P20)吸取质粒DNA样品2 l于点样板小孔中,再加入8 l TE及1 l的载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔,蓝色样品混合物将沉 入点样孔下部。同时点5 l MarkerⅢ作为分子量标准。
5、必须保证琼脂糖充分完全熔解,否则,会造成电泳图像模糊不清。 6、电泳槽中缓冲液使用次数过多,缓冲能力下降。特别是TAE缓冲液,
一般用2-3次就要更换,TBE缓冲液则可使用10次左右。 7、为了节约成本,没有跑过DNA的凝胶部分可切下来重复利用,但反复
熔化会降低分辨效率,建议时向哪一极移动? 2、什么是迁移率?影响迁移率的因素有哪些?什么是分辨率?
分辨率与凝胶浓度的关系? 3、DNA荧光染料的发光原理? 4、质粒DNA存在哪些构型?其迁移率有何差异? 5、loading buffer成分是什么?各成分有何作用?
注意:如何判断单酶切是否完全? 如何判断双酶切是否完全?
质粒DNA三种构型:环状超螺旋、开环和线性。 质粒电泳三条带:超螺旋、开环和复制中间体(即2个没有复制完全的质粒 连在了一起)。 同一种酶切后电泳谱带的规律:从高分子量到低分子量条带亮度逐渐减弱 由于DNA Marker与酶切产物所含成分不同,因此迁移率不一定相同!
不同波长的紫外光
短波紫外光:254nm 中波紫外光:302nm 长波紫外光:365nm
1、为什么分光光度计测定的浓度很高,但电泳检测浓度却很低?
GoldViewI GoldViewII

质粒的酶切—琼脂糖凝胶电泳分离DNAppt课件

质粒的酶切—琼脂糖凝胶电泳分离DNAppt课件
实验二 质粒的酶切、琼脂糖凝 胶电泳分离DNA
1. 实验目的 2. 实验原理 3. 实验仪器、材料与试剂 4. 实验步骤 5. 实验结果及讨论
实验目的
限制性内切酶切割出目的DNA
了解琼脂糖凝胶电泳的原理
掌握琼脂糖凝胶的制作及进行电泳的方 法
实验原理
利用限制性内切酶具有特定的识别及切割位 点,定点切割环状质粒DNA。
Tris 242g 冰醋酸 57.1ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0) 100ml 3. 溴化乙锭溶液 10mg/ml水溶液,室温,棕色瓶或铝 铂纸包装保存。 4. 10×DN切体系
调制酶切体系如下: (共 20μL)
无菌水 6μL,
质粒
10 μL
Buffer K 2μL,
EcoR I 1μL,
BamH I 1 μL
37℃酶切1.5小时。
琼脂糖凝胶制备
1. 洗净电泳槽、制胶槽、梳子、挡板,晾干。 2. 插好挡板、梳子。 3. 根据实验所需称取0.4克琼脂糖,放入制胶
的容器中(一般用三角瓶),然后加入40ml电 泳缓冲液(1×TAE)。 4. 加热煮沸,使琼脂糖完全溶解。 5. 溶液冷至约60℃时,加入溴化乙锭4 μL (终浓 度为0.1 g/l),轻轻摇匀,倒入制胶槽上,检查 有无气泡。
纯度;DNA的甲基化程度;温度;缓冲液成分 (DDT,BSA)等。
使用3 mg的DNA Marker DL 2,000(500 ng/条带)进行1% 的琼脂糖凝胶电泳后,各DNA条带自上至下分别为2kb,1Kb, 750bp,500bp,250bp,100bp。
9.用移液器吸起离心管中溶液,移入凝胶的梳孔中。
10.插上导线,打开电泳仪电源,按照需要调节 电压至120V,电泳开始,观察电流情况或电泳 槽中负极的铂金丝是否有气泡出现。

琼脂糖凝胶电泳 ppt课件

琼脂糖凝胶电泳  ppt课件
• 有热可逆性
• 机械强度差,易破碎,浓度 不能太低。
• 易被细菌污染,不易保存, 临用前配制。
• 琼脂糖支持层上的区带易于 扩散,电泳后必须立即固定 染色。
• 与PAGE相比,分子筛作用小, 区带少。
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琼脂糖凝胶的配置
1. 根据电泳需要,配置合适浓度的电泳及制胶 缓冲液。一般为 1× TAE或0.5×TBE。
注意:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须是相 同的。
2. 根据制胶量及凝胶浓度,在加有一定量的电 泳缓冲液的三角锥瓶中,加入准确称量的琼脂 糖粉。
注意:总液体量不宜超过三角锥瓶的50%容量。
3. 在微波炉中加热溶解琼脂糖
注意:必须保证琼脂糖充分完全溶解,否则,会造成电 泳图像模糊不清。加热时如胶液剧烈沸腾发泡,停止加 热。微波炉中加热时间不宜过长。
2) 分子大小相近的DNA带不 增加电泳时间,核准正确的凝胶
易分辨
浓度
DNA带缺失 3) DNA 变性
电泳前请勿高温加热DNA链,以 20mM NaCl Buffer稀释DNA
4) DNA链巨大,常规凝胶电泳 在脉冲凝胶电泳上分析 不合适
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注意:不要产生气泡,溶液温度太高(>60℃),会使得水 分过分蒸发,改变凝胶离子浓度,影响电泳效果。
6. 在室温下使胶凝固(大约30 分钟),然后放置 于电泳槽中进行电泳。
注意: 凝胶不立即使用时,用保鲜膜将凝胶包好在4℃ 下保存,或者放在制胶的缓冲液中,一般可保存2~5 天。
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琼脂糖凝胶缓冲液
电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后 在冰上冷却5分钟
不规则DNA带迁移 2) 电泳条件不合适
电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃; 经常更换电泳缓冲液

DNA的琼脂糖凝胶电泳分析ppt课件

DNA的琼脂糖凝胶电泳分析ppt课件
❖ 上样量不宜过多,会造成条带的相互挤压;
❖ 如果点样孔多余,将样点到中间,尽量避免边缘 效应 ,中间电场比较均匀 ;
❖ 做胶的缓冲液和跑胶的缓冲液浓度应该一致;
❖ 加样时不要太快,让其自然沉底,均匀分布在电 ห้องสมุดไป่ตู้孔内 ;
❖ 电泳开始时可以采用低电压使其跑出孔后,再调 高电压。
采用PP管及配件:根据给水设计图配 置好PP管及配 件,用 管件在 管材垂 直角切 断管材 ,边剪 边旋转 ,以保 证切口 面的圆 度,保 持熔接 部位干 净无污 物
琼脂糖凝胶 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0 浓度(%)
可分辨的线
10~ 7~ 6~ 4~ 3~
性DNA大小 60~5 20~1 0.8 0.7 0.4 0.2 0.1 范围(kb)
采用PP管及配件:根据给水设计图配 置好PP管及配 件,用 管件在 管材垂 直角切 断管材 ,边剪 边旋转 ,以保 证切口 面的圆 度,保 持熔接 部位干 净无污 物
采用PP管及配件:根据给水设计图配 置好PP管及配 件,用 管件在 管材垂 直角切 断管材 ,边剪 边旋转 ,以保 证切口 面的圆 度,保 持熔接 部位干 净无污 物
❖ 2、 50×TAE电泳缓冲液:称取242gTris碱 (即三羟甲基氨基甲烷, Tris为弱碱,在室 温(25℃)下,它的pKa为8.1;根据缓冲理 论,Tris缓冲液的有效缓冲范围在pH7.0到 9.2之间。Tris碱的水溶液pH在10.5左右,一 般加入盐酸以调节pH值至所需值,即可获得 该pH值的缓冲液。但同时应注意温度对于 Tris的pKa的影响 ), ,加H2O800ml,待 完全溶解后,加57.1ml冰乙酸, 100ml0.5mol/LEDAT(pH8.0),用H2O定 容至1000ml。临用前用H2O稀释成1×TAE 电泳缓冲液。

实验琼脂糖凝胶电泳的原理与方法 PPT

实验琼脂糖凝胶电泳的原理与方法 PPT

六、血浆脂蛋白琼脂糖凝胶电泳
按电泳法分:
按超速离心法分:
乳糜微粒(CM)
乳糜微粒CM ( < 0、96 )
-脂蛋白 (-位) 极低密度脂蛋白VLDL(0、961、006)
前-脂蛋白(2-位) 低密度脂蛋白LDL (1、0191、063) -脂蛋白 (1-位) 高密度脂蛋白HDL(1、0631、21)
进行印迹转移电泳时,要注意缓冲液得离子强度要低,pH要远 离pI,使蛋白质带有较多电荷,一般用稳定性较好得Tris-缓冲体 系。还要注意凝胶与支持膜之间不能有气泡。适当提高电压或 电流可以提高转移速度,但亦会增加热效应,故电压或电流不可过 高。
五、交变脉冲电场凝胶电泳
一般琼脂糖凝胶电泳只能分离小于20kb得DNA。 这就是因为在琼脂糖凝胶中,DNA分子得有效直径超 过凝胶孔径时,在电场作用下,迫使DNA变形挤过筛孔, 而沿着泳动方向伸直,因而分子大小对迁移率影响不 大。如此时改变电场方向,则DNA分子必须改变其构 象,沿新得泳动方向伸直,而转向时间与DNA分子大小 关系极为密切。
D-半乳糖
3,6-脱水-L-半乳糖
琼脂糖链依分子内与分子间氢键及其它力得作 用使其互相盘绕形成绳状琼脂糖束,构成大网孔型凝 胶。
冷却
松散,随机地,盘绕地琼脂糖链
双螺旋结构区域与线性链相链接
淬火
溶胶状态
初级胶
最终得凝胶结构
琼脂糖为电泳支持物进行平板电泳,其优点如下: (1)琼脂糖凝胶电泳操作简单,电泳速度快,样品不需事
按支持物得装置形式不同,区带电泳可为: ➢平板式电泳,支持物水平放置,就是最常用得 电泳方式; ➢垂直板式电泳,聚丙烯酰胺凝胶常做成垂直 板式电泳; ➢垂直柱式电泳,聚丙烯酰胺凝胶盘状电泳即 属于此类; ➢连续液动电泳,首先应用于纸电泳,将滤纸垂 直竖立,两边各放一电极,溶液自顶端向下流, 与电泳方向垂直。

琼脂糖凝胶电泳试验课件

琼脂糖凝胶电泳试验课件
0.3 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0 5~60 ( kb) 0.8~10 0.5~7 0.4~6 0.2~4 0.1~3 100~2000 ( bp) 80~500 60~400 40~200 25~150 6~100
PAG
3.5 5.0 8.0 12.0 15.0 20.0
不同(空间) 不同(空间)类型核酸的凝胶电泳:
缓冲液的组成和离子强度直接影响迁移率。 传统最常用的是TAE,但其缓冲能力很低,长时间电泳需要正、负电极贮液槽之间 进行缓冲液循环,并经常更新TAE。
缓冲液的离子强度 离子强度与样品泳动速度成反比,电泳的最适离子强度一般 离子强度 在0.02~0.2之间。在高速离子强度下(如误加10×电泳缓冲液),溶液导 电性极高并明显产热,可能引起凝胶熔解及DNA变性。 缓冲液的pH值影响DNA迁移率,溶液的pH值远离样品等电点时,样 值 品荷电量越多,泳动越快,核酸电泳液常用偏碱性或中性条件,使核酸带 负电荷,向正极泳动。 在进行电泳时,荧光染料EB可插入到碱基中,从而增加线状和开环 DNA的长度,使其刚性更强,并会使线状DNA的迁移率降15%,另外温 度和碱基堆积也会影响DNA的迁移率。
2)凝胶孔径大小 )
琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶(polyacrylamide gel, PAG)是核酸凝胶电 泳常使用的支持材料,通过两种支持介质的浓度变化调整所形成凝胶的 分子筛网孔大小,能分离不同分子量的核酸片段。
凝胶
琼脂糖
胶浓度( ) 线状DNA分子的有效分 胶浓度(%) 线状 分子的有效分 离范围
三、实验原理
概言之:DNA分子带负电荷,在电场中受到电荷效应、分子筛效应向
正极移动过程中,因DNA分子的大小及构象差别而呈现迁移位置上的差异, 对于线形DNA分子,其电场中的迁移率与其分子量的对数值成反比,电泳 时加溴化乙锭,其与DNA结合形成一种荧光络合物,在254~365nm紫外照射 下可产生桔红色的荧光,可用于检测DNA。(此法可观察到凝胶中2ng左右 的DNA)。琼脂糖可制成不同孔径的凝胶,分离DNA的范围广,约 200bp~50kb。

细胞凋亡的DNA琼脂糖凝胶电泳PPT课件

细胞凋亡的DNA琼脂糖凝胶电泳PPT课件
与细胞坏死区别
细胞坏死是被动的过程,通常由外界因素如物理、化学损伤引起 ,而细胞凋亡是主动过程,由基因调控。
细胞凋亡的过程
起始阶段
细胞受到凋亡信号刺激,开始进入凋亡过程。
执行阶段
细胞内部发生一系列生化反应,如DNA断裂、蛋白 质降解等。
降解阶段
细胞被分解成小碎片,即所谓的“死亡小体”,随后 被周围的巨噬细胞或邻近细胞吞噬。
物种鉴定
通过DNA琼脂糖凝胶电泳对物种进行鉴定,如 PCR-RFLP、DNA指纹分析等。
细胞凋亡研究
通过DNA琼脂糖凝胶电泳检测细胞凋亡相关的 DNA片段,如梯状带等。
03
细胞凋亡的DNA琼脂糖凝胶电泳检测
细胞凋亡DNA的提取
细胞凋亡过程中,DNA会经历一系列的降解过程, 形成凋亡小体。
提取凋亡细胞中的DNA,是进行琼脂糖凝胶电泳检测 的重要步骤。
凋亡机制探讨
02
结合实验结果,可以探讨细胞凋亡的机制,如内源性途径和外
源性途径等。
影响因素分析
03
分析实验过程中可能影响结果的因素,如温度、pH值、DNA提
取方法等。
实验结论与讨论
01
02
03
实验结论
根据实验结果,可以得出 关于细胞凋亡的结论,如 凋亡诱导剂或抗凋亡剂的 作用效果、凋亡机制等。
实验意义
细胞凋亡的意义
80%
维持内环境稳定
细胞凋亡有助于清除不再需要的 或异常的细胞,维持内环境的稳 定。
100%
发育和组织成熟
在胚胎发育和组织成熟过程中, 细胞凋亡有助于塑造和修剪多余 或异常的细胞。
80%
防御和免疫
细胞凋亡有助于清除被感染或发 生癌变的细胞,从而维持机体的 健康。
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琼脂糖凝胶电泳结果分析及其应用
凝胶准备
胶床准备
铺胶
静置
胶床置于电泳槽中 加电泳缓冲液 拔梳子 上样
电泳 取出凝胶 拍照
琼脂糖凝胶电泳结果分析及其应用
琼脂糖凝胶电泳结果分析
结果初步分析 数量分析:条带的宽度,
荧光的亮度。 质量分析:纯度
分子量
影响因素: DNA分子的大小:实验证明,DNA片段迁移距离与其 分子量的对数成反比; 琼脂糖的浓度:一定大小的DNA片段在不同浓度的琼 脂凝胶中,电泳迁移率不相同; DNA分子的构型:不同构型的DNA在琼脂糖凝胶中的 电泳速度差别较大
⑵可提取大分子DNA 利用琼脂糖凝胶制成凝胶块提取基因组DNA能够获得足够大 胶上进行的电泳检测。
3、琼脂糖在其他方面的应用 ⑴ 、琼脂糖在免疫扩散法中的应用。 ⑵ 琼脂糖在双链DNA探针的合成方法中的作用琼脂糖凝胶电泳ຫໍສະໝຸດ 果分析及其应用口腔1402
琼脂糖凝胶电泳结果分析及其应用
琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、 RNA分子混合物的方法,主要是应用琼脂糖凝胶 作为支持物的电泳法,借助琼脂糖凝胶的分子筛 作用,核酸片段因其分子量或者分子形状的不同, 电泳速度有差异而分离,利用DNA、RNA分子在 泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合 物的目的。 与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子 筛”和“电泳”的双重作用。
大家有疑问的,可以询问和交流
可以互相讨论下,但要小声点
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琼脂糖凝胶电泳结果分析及其应用
1、DNA的制备. ⑴ 适合分离大片段DNA. 琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚 丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广,尤其适于分离大 片段DNA.普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用 脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段.
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