细胞筛选个人整理
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细胞筛选
一嘌呤霉素
(一)确定最优筛选浓度
当用于筛选特定细胞的嘌呤霉素合适浓度未知时,需进行滴定,或制定针对那种细胞的嘌呤霉素杀菌曲线。一般而言,嘌呤霉素浓度范围在2-10微克/毫升时是足以杀灭大多数未转染的哺乳动物细胞系。
1.培养待转染(而不是转染后)的细胞。(筛选的目的是杀灭未转染的细胞)
2.取对数生长期的细胞(一般在铺满培养器皿底部的70%~80%时),用新鲜无抗无血
清的培养基制成1.5×105个/ml的细胞悬液。
3.向96孔培养板中加细胞悬液,每孔100微升(使每孔细胞数在1.5×104个),然后
向每孔加新鲜无抗无血清的培养基适量,培养箱中静置培养过夜。(这样做是为了保证在固定细胞密度下确定最佳G418药物筛选浓度。)
4.第二天用嘌呤霉素浓度分别为0,2,4,6,8,10微克/毫升的新鲜无抗无血清培养基
溶液替换各孔中的旧的培养基。(每个浓度可用两个复孔,相当于每个浓度测定三次)。(注意:对于多数细胞种类而言,过量的嘌呤霉素能引起许多非必需的表型的反应。)
5.每日检查细胞活力,根据细胞活力,每三天(即每隔两天)更换含嘌呤霉素的新鲜无
抗无血清培养基溶液一次。如细胞生长过快,可以缩短换液时间(每隔一天)。
6.在正常的实验操作规程时,一种细胞最优筛选浓度的确立时间随细胞的生长率和一
般生存时间而定,大概需3到14天。在所需时间之后,嘌呤霉素的导致所有细胞
死亡的最小浓度就是应该用于该细胞和该实验的浓度。最优浓度为在3-5天内杀死
所有细胞的浓度。
(二)转染细胞
1.第一天:在60mm培养皿内种植细胞,细胞密度为能使第二天细胞融合能达到
70%-80%的密度,CO2孵箱过夜培养。
2.第二天:准备3ml无抗生素无血清培养基,加入Polybrene使其终浓度为8μg/ml。
将已经制备的病毒颗粒0.5ml加至上述培养基,轻吹混匀。去除60mm培养皿内的
旧的培养基,加入含病毒培养基。(Polybrene能够增加病毒感染的效率,然而,
有时候Polybrene对细胞有毒性。这时,可以用ProtamineSulfate代替Polybrene)
(三)筛选细胞
1.病毒感染后24小时,可以换用含最优浓度puromycin的培养基。
2.如果病毒对细胞有毒性,可以减少感染时间至4-6小时,然后换用新鲜培养基,
24-48小时后换加含最优浓度puromycin的培养基。最好设立一个对照皿,不加病
毒液,加入Ploybrene,观察Polybrene是否对细胞有毒性;如果Polybrene没有
毒性,还可以加入puromycin,作为puromycin是否有效的对照。
3.以后每隔一天换用新鲜含puromycin的无抗生素无血清培养基,以替换含大量死细
胞的培养基。直到抗性群落能被识别出(一般是在筛选后10到12天)。
4.待抗性细胞长满以后,细胞转入10cm培养皿,同时,留一部分细胞在原来的60mm
平皿内。
5.60mm平皿内细胞长满后,收获细胞,在蛋白或mRNA水平鉴定基因敲低效率。
6.10cm培养皿内的细胞待长满后传代,首先每种稳定细胞系冻存4-5支细胞,待基
因敲低鉴定清楚后,解冻冻存细胞,进行表型观察分析。通常情况下,由于慢病毒
为复制缺陷型病毒,受感染的细胞不能产生新的病毒,因此从加入病毒颗粒开始,经过5-6次换液后,培养基内已不存在病毒颗粒,可以移至普通细胞培养室内培养
研究。
二G418
(一)确定最优筛选浓度
由于每种细胞对G418的敏感性不同,而且不同的厂家生产的相同浓度的G418的活性不尽相同,所以在筛选之前,一定要确定G418的最佳筛选浓度。
1.G418的配制:取1gG418溶于1ml1mol/L的HEPES液,加蒸馏水定容至10ml(使
G418终浓度为0.1g/ml,HEPES终浓度为100mmol/L),过滤消毒,4度保存。
HEPES的化学全称为羟乙基呱嗪乙硫磺酸(N’-a-hydroxythylpiperazine-N’-ethanesulfanicacid),分子量238.31,是一
种氢离子缓冲剂,能较长时间的控制溶液的pH处于恒定的范围,而对细胞无毒
性作用。
1mol/LHEPES的简单配置:HEPES23.83g,溶解于80ml的双蒸水中,用10mol/L的NaOH调节pH至7.2-7.4,定容至100ml,0.22um小滤器过滤。HEPES
使用终浓度为10-50mmol/L。
2.制备筛选培养基:在100ug/ml~1000ug/ml范围内按0ug/ml、100ug/ml、200ug/ml、
300ug/ml、400ug/ml,500ug/ml、600ug/ml、700ug/ml、800ug/ml,900ug/ml、1000ug/ml浓度用无抗无血清培养基稀释G418制成筛选培养基。心得:由于特性明确的细胞系G418的最佳用量还是比较稳定的,所以有时候不需要在这么大范围内进行筛选。比如说你要转染NIH3T3细胞,现在我告诉你我测试过NIH3T3细胞对G418的敏感性,我用的筛选浓度是200ug/ml。这时你就可以做150ug/ml、200ug/ml、300ug/ml三个浓度进行筛选。
3.培养待转染(而不是转染后)的细胞。(筛选的目的是杀灭未转染的细胞)
4.取对数生长期的细胞(一般在铺满培养器皿底部的70%~80%时),用新鲜无抗无血
清的培养基制成1×104个/ml的细胞悬液。
5.向96孔培养板中加细胞悬液,每孔100微升(使每孔细胞数在1×103个),然后向
每孔加新鲜无抗无血清的培养基适量,培养箱中静置培养。(这样做是为了保证在固定细胞密度下确定最佳G418药物筛选浓度。)
汇合度:实际上就是指细胞占培养表面的比例,如果细胞铺满了整个容器,我们就认为它们100%汇合,也就是汇合度100%。汇合度对G418筛选结果的影响很大,一般筛选时汇合度不宜超过50%!
6.培养6小时左右开始加药。加筛选培养基筛选:吸除培养孔中培养基,PBS洗涤一
次,每孔中加入不同浓度的筛选培养基适量。
7.换液:每日检查细胞活力,根据细胞活力和培养基的颜色,每三天(即每隔两天)
更换筛选培养基一次。如细胞生长过快,可以缩短换液时间(每隔一天)。有死细胞勤换液,可以减少对存活细胞的影响。