结核杆菌耐利福平分子机制的研究和rpoB基因突变快速检测方法的探讨
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结果
一、菌种生化鉴定结果
所有58株细菌经生化初步鉴定为结核分支杆菌,未见牛分支杆菌等其他非结核分支杆菌。
二、药敏测定结果
58株结核分支杆菌中,利福平耐药株36株,敏感株22株。耐药株中对利福平高度耐药的有20株,低度耐药的有16株。36株利福平耐药株均至少对另一种其他的一线药物也耐药,其中有32株对利福平耐药的结核分支杆菌同时对异烟肼耐药,其比例高达88.9%。结核分支杆菌的耐药类型以及耐多药株的耐药谱见表1—4,利福平耐药与耐多药之间的关系见图1.1。
表1-4结核分支杆菌的耐药类型
注:X:INH、SM或EMB中的任何~种:Y为SM或EMB。
H1.I利丰f11’r耐药’o时多鲋之川的天系
R:RFI’:I:[NII:S:SM:E:EMB:X:I!此s戏E:Y:S!止E.,
rpoB基因片段的扩增与序列分析
目』j1『可以通过Intemet在GeneBank(L27989)罩查到rpoB基因的全序列(1065。4598),共3534bp。下面列出了包含核心突变区的部分基因序列。
SequenceofrpoB[AntimicrobAgentsChemother.38(4),805—811(1994)】065
08114120l
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rpoB全基因序列共3534bp(1065—4598),其中2370~2438共69bp的片段为核心突变区(有底纹部分),本部分研究的引物分别为其上游的2316—2335区和下游的2528.2509区的序列(带边框部分)。
2.1引物的设计与合成
根据上述rpoB基因序列设计引物,由上海博亚生物技术有限公司合成
ddH20溶解,终浓度为25pmol/uL。
I二游引物F(20bp):5'-ATCAACATCCGGCCGGTGGT一3
F游引物R(20bp):5'-GGTTTCGATCGGGCACATCC一3
J,k)lJ卜述0『物埘rpoB地l大I进iJ:扩增的JlI段K/一F为213bp。.
结果
一、DNA的抽提与鉴定
逊过IS6110片段的扩增,对58橡煞垓分支#F菠的挞因组DNA避;j:PCR攥定,扩增产甥缀2%琼脂糖凝胶电泳(4V/cm),结果均可见单一渍蜒∞目的条她(123bp,见图2-4)。
篷2-4。结援分支辑蘧基蓬缀DNA鉴定
M.DNAMarker(LanderlOObp);1、2为扩增的IS6110片段(123bp),
1和2的丰萸扳分别为H37Rv和临床分离橼提取的基因缎DNA:3为阴性对照
二、PCR扩增与序列分析
i、PCR扩增:5B株结核分支杆菌DNA的rpoB扩增产物经2%琼脂糖凝胶电泳(4V/cm)均可见单一清晰的目的条带(213bp。见圉2-5)。
燃2-5.rpoB壤吣扩璎,}段l毡溶
M·DNA
Marker·I~4均儿女“增的rpoBlf∞"投f2I3的j,
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I)NA,4/sf,'/t雌对照,