蛋白质的化学.

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一、氨基酸—蛋白质的构件分子
(一)蛋白质的水解
蛋白质—→蛋白胨—→多肽—→二肽—→氨基酸
蛋白质和多肽的肽键与一般的酰胺键一样 可以被酸碱或蛋白酶催化水解,酸或碱能够将 多肽完全水解,酶水解一般是部分水解.
1、酸水解
常用6 mol/L的盐酸或4 mol/L的硫酸在 105-110℃条件下进行水解,反应时间约 20小时。
二、氨基酸的分类
(一)根据来源分:内源氨基酸和外源 氨基酸 (二)从营养学角度分:必需氨基酸和 非必需氨基酸
(三)根据是否组成蛋白质来分:蛋白质中常 见氨基酸、蛋白质中稀有氨基酸和非蛋白氨基 酸
1、蛋白质中常见氨基酸的结构
主要区别在侧链R基的不同
甘氨酸 Glycine
脂肪族氨基酸(中性)
O
H2N CH C OH H
2
-氨基--甲基戊酸
氨基酸的结构
甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline
亚氨基酸(杂环)
H N
CO OH
-吡咯烷基--羧酸
氨基酸的结构
甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine
脂肪族氨基酸(含硫) -氨基--巯基丙酸
氨基酸的结构
精氨酸 Arginine
脂肪族氨基酸(碱性)
O H2N CH C OH
CH2 CH2 CH2 NH C NH NH2
-氨基--胍基戊酸
氨基酸的结构
精氨酸 Arginine 赖氨酸 Lysine
脂肪族氨基酸(碱性)
O H2N CH C OH
CH2 CH2 CH2 CH2 NH2
氨基乙酸
氨基酸的结构
甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine
脂肪族氨基酸(中性)
O H2N CH C OH
CH3
-氨基丙酸
氨基酸的结构
甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸
Glycine Alanine Valine
脂肪族氨基酸(中性)
O
H2N CH C OH
CH CH3
CH3
-氨基异戊酸
氨基酸的结构
甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸
Glycine Alanine Valine Leucine
脂肪族氨基酸(中性)
O
H2N CH C OH CH2 CH CH3 CH3
-氨基异己酸
氨基酸的结构
甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine
脂肪族氨基酸(中性)
从氨基酸的结构通式可以看出: 1、构成蛋白质的氨基酸均为L—α—氨基酸。 2、 除R为H(甘氨酸)外,其余氨基酸均具有旋光性。 3、 各种氨基酸的区别在于侧基R基上。
氨基酸的构型: 构成蛋白质的氨基酸除甘氨酸外,均含有α—碳原子,在 空间各原子有两种排列方式:L—构型与D—构型,它们 的关系就像左右手的关系,互为镜像关系,下图以丙氨 酸为例:
CH2 CH2 CO NH2
氨基酸的结构
苯丙氨酸 Phenylalanine
脂肪族氨基酸(含硫)
O H2N CH C OH
CH2 CH2 S CH3
-氨基--甲硫基丁酸
氨基酸的结构
甘氨酸 Glycine 丙氨酸 Alanine 缬氨酸 Valine 亮氨酸 Leucine 异亮氨酸 Ileucine 脯氨酸 Proline 甲硫氨酸 Methionine 半胱氨酸 Cysteine
(二)α-氨基酸的一般结构
蛋白质都由20种常见氨基酸(基本氨基酸) 组成。 氨基酸的结构通式:19种氨基酸具有一级 氨基(-NH3+)和羧基(-COOH)结合到 α碳原子(Cα),同时结合到(Cα)上 的是H原子和各种侧链(R);Pro具有二 级氨基(α-亚氨基酸)。
L-α-氨基酸的结构通式
COOH │ H2N — C — H │ R
3、酶水解
应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生 消旋化。但水解往往不彻底,产物为较小的肽 段。 目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶 (proteolytic enzyme)或称蛋白酶 (proteinase)已有十多种。 最常见的蛋白水解酶有以下几种:胰蛋白酶、 糜蛋白酶、胃蛋白酶、嗜热菌蛋白酶。
,-二氨基己酸
氨基酸的结构
精氨酸 Arginine 赖氨酸 Lysine 组氨酸 Histidine
碱性氨基酸(杂环)
O H2N CH C OH
CH2
N NH
-氨基--咪唑基丙酸
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate 脂肪族氨基酸(酸性)
O H2N CH C OH
CH2 CO OH
-氨基丁二酸
第一章 蛋白质的化学
第一节氨基酸 第二节蛋白质的共价结构 第三节蛋白质的三维结构 第四节蛋白质的结构与功能 第五节蛋白质的分离纯化和鉴定
第一节 氨基酸(amino acid)
一、氨基酸—蛋白质的构件分子 二、氨基酸的分类 三、氨基酸的酸碱化学 四、氨基酸的化学反应 五、氨基酸的物理性质 六、氨基酸的分析分离
脂肪族氨基酸(含羟基)
O
H2N CH C OH CH OH
CH3
-氨基--羟基丁酸
氨基酸的结构
天冬酰胺 Asparagine
脂肪族氨基酸(含酰胺)
O H2N CH C OH
CH2 CO NH2
氨基酸的结构
天冬酰胺 Asparagine
谷酰胺 Glutamine
来自百度文库
脂肪族氨基酸(含酰胺)
O H2N CH C OH
氨基酸的结构
天冬氨酸 Aspartate 脂肪族氨基酸(酸性)
谷氨酸 Glutamate
O
H2N CH C OH CH2 CH2 CO
OH
-氨基戊二酸
氨基酸的结构
丝氨酸 Serine
脂肪族氨基酸(含羟基)
O H2N CH C OH
CH2 OH
-氨基--羟基丙酸
氨基酸的结构
丝氨酸 Serine 苏氨酸 Threonine
此法的优点是不引起消旋,得到的是L氨基酸。
缺点是色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟 基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部 分被分解;天门冬酰胺和谷氨酰胺侧链 的酰胺基被水解成了羧基。
2、碱水解
一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。 由于水解过程中许多氨基酸都受到不同 程度的破坏;产生消旋现象,其产物是 D-型和L-型氨基酸的混合物。 该法的优点是色氨酸在水解中不受破坏
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