质粒大规模提取方法
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E.Z.N.A. Plasmid Maxi Kit (D6922-01)质粒大规模提取试剂盒
注意:
1.使用之前,把试剂盒中的一小管RNA酶加入溶液Ⅰ. 4℃保存
2.加84ml 100%乙醇到DNA Wash Buffer Concentrate中.室温保存
除试剂盒外还需准备:配有浮桶式转头(吊桶式转头)的离心机
可达到12000×g的高速离心机
50ml无菌离心管
高速离心管
无菌去离子水或TE缓冲液
纯乙醇
操作规程:(提取过程在室温下进行)
1.将带有目的质粒的大肠杆菌接种到200-500ml LB(含氨苄青霉素50μg/ml),1-4升培养瓶中37℃震荡培养过夜(12-16h)
需特别指出的是:endA阴性的E.coli菌株用于常规质粒提取,如DH5α和JM109.
2.取500ml菌液装入适当管子(推荐用250ml离心瓶)中,室温下3500-5000×g离心10min
3.小心去上清,用洁净纸巾吸干管壁残留液体。加7.0ml溶液Ⅰ,吹打数次,用旋涡振荡仪充分悬浮沉淀
4.移入50ml至少可承受12000×g的离心管,加7.0ml溶液Ⅱ,轻轻来回翻转混合7-10次,至澄清裂解液
注意:必须室温下孵育5-10min
避免大力混合,以减少对染色体DNA的机械力切割,提高质粒纯度
5.加10ml溶液Ⅲ,温和倒转数次,至有絮状沉淀形成
室温孵育5min并不时混合
室温离心10min得到致密的基因组DNA和碎屑团块
6.特别小心地吸取上清,加到装配好容积50ml离心管的大型吸收柱,上盖,装入吊桶式转头,室温3000-4000×g离心5min
注意:确保没有搅动沉淀以保证质粒回收率
有必要牺牲2-4ml溶菌产物
单次最多加25ml溶菌产物,如果较多,分2次加入
可用此管直接重复步骤6
注意:接下来的步骤都会用到浮桶式转头(吊桶式转头)离心机(用固定角转头会使提供的50ml离心管变形或破裂)
7.加50ml HB缓冲液到吸收柱,上盖,室温3000-4000×g离心5min(此步为确保除尽剩余蛋白,同时使后面的操作得到的是高纯度DNA)
8.加10ml用乙醇稀释的DNA Wash Buffer,上盖,室温3000-4000×g离心5min,弃掉滤过液
注意:Wash Buffer浓缩液用前必须用纯乙醇稀释,方法见标签
如果经过冷冻,用前必须恢复室温
9.此步可选:重复步骤8
10. 加10ml纯乙醇,室温3000-4000×g离心5min,弃掉滤过液
11. 将空管上盖3000-4000×g离心10min甩干(用移液器去掉甩到离心管中的乙醇)
注意:此步必做!残留的乙醇会影响接下来的步骤
12. 洗脱DNA之前可用以下方法进行干燥,以得到更干燥的吸收柱(如果没有真空箱/室,可直接执行步骤13)
方法A:取出吸收柱,将吸收柱在真室箱/室中15min,执行步骤13
方法B:取出吸收柱,在65℃真空干燥箱或恒温箱中干燥10-15min,执行步骤13
13. 将吸收柱放入干净50ml离心管,加1-2ml(取决于需要的终浓度)无菌去离子水或TE缓冲液在滤膜上,3500×g离心5min,一次可洗脱70%附着DNA(可进行再洗脱,但会降低DNA浓度)
建议:洗脱前,如果将吸收柱放入70℃热水中浸泡2min,会明显提高回收率同时得到高浓度DNA
注意:清除在吸收柱内部O形圈边缘的DNA Wash Buffer残留非常重要
如果在洗脱前没有真空干燥吸收柱,最后需对质粒DNA进行净化,方法如下:
加氯化钠到洗脱液至终浓度200mM,再加0.8体积的异丙醇,旋涡振荡混合,10000×g离心10min,用70%乙醇清洗沉淀,10000×g离心10min,轻轻倒出上清,短暂风干,用200-500μl无菌去离子水或TE 缓冲液再悬浮DNA
14. 检测:
方法A:分别在260nm和280nm波长下测定20-50倍稀释液的吸光度
DNA浓度=260nm吸光度×50×稀释因子μg/ml
高质粒拷贝数能达到500ml培养液得到1mg DNA,如果260nm吸光度/280nm吸光度大于1.8,说明核酸大于90%。
方法B:和预知浓度DNA样品(Marker)一起做琼脂糖凝胶/嗅乙啶电泳,对比结果
(通常情况得到的DNA是单体超螺旋,也有少量多联体)