基因工程名词解释
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名词解释一
RNase:RNA水解酶
Restriction endonucleasr:限制性核酸内切酶
RBS:核糖体结合位点
SD sequence:SD序列。可结合原核生物的核糖体。
Ori:复制起始原点
Promptor:启动子
Klenow fragment:大肠杆菌pol1的大片段
Reverse tranecriptase:反转录酶
Transferred DNA:转移DNA
MCS(multiple cloning site):多克隆位点
IPTG: 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷
X-gal:5-溴4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷
GUS:β-葡萄糖苷酸酶
X-gluc:5-溴4-氯-3-吲哚-β-D葡萄糖苷酸酯
Ampr(ampicillin resistance gene):氨苄青霉素抗性基因
Cmr:氯霉素抗性基因
Tetr:四环素抗性基因
Kanr:卡那霉素抗性基因
Ermr:红霉素抗性基因
Neor:新霉素抗性基因
supF:琥珀突变抑制基因
phagemid:噬菌粒
plasmid:质粒
YAC ( yeast artificial chromosome):酵母人工染色体
BAC(Bacterial Artificial Chromosome):细菌人工染色体
PAC(P1 artificialchromosome):P1人工染色体
TEL: 端粒重复序列
CEN:着丝粒
ARS: 自主复制序列
Cosmid:黏粒
PCR(Polymerase Chain Reaction):聚合酶链式反应
dNTP:脱氧三磷酸核苷
RT-PCR:反转录(reverse transcriptase)PCR或实时定量(real-time)PCR DD(RT)-PCR:差异(反转录)显示PCR
TAIL PCR:热不对称相错PCR
RACE: cDNA末端的快速扩增
RAPD:随机扩增多态性DNA
AFLP:扩增片段长度多态性
SSH:抑制性扣除杂交
FISH:荧光原位杂交
Vector:载体
Blunt end:平末端
Match end/cohesive end:匹配黏端/黏性末端
Deoxyribonuclease:脱氧核糖核酸酶
TAP:烟草算焦磷酸酶
SDS:十二烷基磺酸钠
PAGE:聚丙烯酰胺凝胶电泳
PFGE:脉冲电场凝胶电泳
PEG:聚乙二醇
DEPC:焦碳酸二乙酯
GFP:绿色荧光蛋白
Competent cell:感受态细胞
PNA:肽核酸
Ptac:乳糖操纵子和色氨酸操纵子的杂合启动子
GST(Glutathione S-transferase):谷胱甘肽-S-转移酶
DDT:二硫苏糖醇
Tag:标记蛋白
Polyhis-6:六聚组氨酸肽
名词解释二
1 同裂酶(isoschizomer)识别相同序列的限制酶称同裂酶
同尾酶(isocaudarner)许多不同的限制酶切割DNA产生的末端是相同的,且
是对称的,即它们可产生相同的黏性突出末端。
2 质粒质粒是细菌染色体外能自主复制的双链闭合环状DNA分子。可用作基因工程载体。噬菌粒将单链噬菌体的基因间隔区与质粒载体重组后的载体。主体为载体,在噬菌体辅助下可得到单链DNA。
黏粒是由人工构建的含有λ噬菌体DNA的cos序列和质粒复制子的载体。黏粒具有λ噬菌体的特性,具有质粒的特性。克隆外源DNA的容量大。
3 克隆载体通过目的基因整合于载体上导入宿主细胞,使目的基因随质粒的繁殖而得到大量复制载体。
表达载体除具有复制载体的特点和元件外,还包括使外源基因整合并在宿主细胞中表达的表达元件(启动子,RBS,终止子等)。
穿梭载体具两套不同复制元件和选择标记。使外源基因在两个不同的宿主中复制或表达。
4 反向PCR(inverse PCR)是一种简单的扩增已知序列周边未知序列的方法。根据已知片段两端的序列设计引物,可将邻近的DNA片段扩增出来。
反转录PCR以mRNA为模板反转录出cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增得到目的基因片段。
差异显示PCR(differential display PCR,DD-PCR)是用于检测相似生物材料的基因表达谱差异的一种方法,是PCR和反转录有机结合并深化应用的产物。
5 基因敲除利用特定基因敲除载体的基因序列与靶基因序列的同源性实现重组,达到使靶基因敲除和失活的目的。
基因敲入利用与基因敲除相同的原理,将外源基因放在载体上,通过同源重组将外源基因整合到宿主染色体的特定位点上。
基因下调RNA干扰技术。通过干扰RNA分子的作用达到转录后基因沉默的效应。
6 .T4连接酶和大肠杆菌的DNA连接酶
相同:二者活性相似相似,均能催化5’磷酸集团和3’羟基之间形成磷酸二酯键。
不同:T4连接酶反应过程无需NAD+的参与,大肠杆菌的DNA连接酶需NAD+的参与。
T4连接酶可连接RNA,大肠杆菌的DNA连接酶不连接RNA,平末端链接效率低。
7 基因文库 DNA文库是指某一生物体全部或部分基因的集合,可分为基因文库和cDNA文库。基因组文库将某生物体全部的基因组切割,与合适的载体组建后转化宿主细胞,所获得的所有阳性菌落构成的。
cDNA文库 cDNA是由某一生物的某一特定器官的特定发育时期细胞内所表达的mRNA反转录后形成的。不包括全部基因。
8 宿主的限制和修饰作用
限制作用就是限制酶降解外源DNA,维护宿主遗传稳定性的机制。
修饰作用是通过甲基化酶来的甲基化作用,是宿主细胞能识别自身遗传物质和外来遗传物质的机制。
9 比较pRB322和pUC
pBR322质粒载体的相对分子质量较小,带有一个复制起始位点,该质粒只在大肠杆菌细胞中行使复制。具有两种抗生素抗性基因—氨苄青霉素抗性基因和四环素抗性基因。pUC载体是在pBR322质粒载体的基础上,组入了一个在其5′-端带有一段多克隆位点的lacZ′基因,而发展成为具有双功能检测特性的新型质粒载体系列。
10 核酸水解酶和限制性核酸内切酶
都可将长链DNA切割为短片段DNA或核苷酸,前者切割无特异性,将核苷酸逐一水解下来。后者只识别特异位点,是核酸内切酶的一种。
11 Southern biotting 将两条DNA链杂交,其中一条被标记的链叫做探针。
Northern biotting 将DNA与mRNA或者总RNA杂交
Western biotting抗原抗体杂交,用于检测外源基因蛋白质水平的表达。
12 选择基因与外界存在的筛选压力如抗生素等相互作用,以筛选出被转化的细胞;
报告基因报告基因是指其编码产物能够被快速测定、常用于判断外源基因是否成功地导入受体细胞,是否启动表达的一类特殊用途的基因。应用不依赖于外界选择压力的存在。13基因打靶是指通过DNA定点同源重组,改变基因组中的某一特定基因,从而在生物活体内研究此基因的功能。
同源重组(Homologous Recombination) 是指发生在姐妹染色单体(sister chromatin) 之间或同一染色体上含有同源序列的DNA分子之间或分子之内的重新组合。
14 一元载体是中间表达载体与改造后的卸甲载体Ti通过同源重组所产生的一种复合型载
体,通常亦称为共整合载体(co-integrated vector) 。
双元载体(binary vector) 是指由两个分别含T-DNA和Vir区的相容性突变质粒构成的双质粒系统,也因为其T-DNA与Vir基因在两个独立的质粒上,通过反式激活T-DNA转移故称之为反式载体(trans vector)。
卸甲载体将Ti质粒上T-DNA中的致瘤基因全部去掉,仅保留其两侧边界与T-DNA准确转移所必需的25个碱基序列,故称之为卸甲载体。
15 基因操作:对基因进行分离、分析、改造、检测、表达、重组和转移等操作的总称。
基因工程:主要是利用DNA 重组技术,将生物的某个基因或一个DNA片段通过基因载体(DNA载体)运送到另一生物的活性细胞中,然后经过克隆和行使正常功能(表达),从而创造生物新品种或新物种的遗传学分子技术(从细菌到高等生物)。
DNA 重组:用酶学方法将不同来源的DNA进行切割连接,组成一个新的DNA分子。
16 克隆:将一个亲本细胞经过无性繁殖产生无数个相同细胞的子代群体的过程。
基因克隆:将重组DNA分子导入受体细胞,使其扩增和繁殖以获得大量DNA分子。17 转化:以质粒为载体,将重组DNA分子导入感受态细胞中,并使其获得新表型。
转导:以噬菌粒或病毒为载体,将重组DNA分子导入受体细胞中,并使其获得新表型。
转染:将重组DNA分子导入真核细胞核真核细胞主动摄入外源基因,从而获得新表型。