临床诊断学 细菌的分类单位、系统及命名
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20_细菌的分类和命名
phyta。
如：根据
抗原性
抗原型（血清型）
噬菌体裂解 噬菌体型
生化反应
生化型
生物学特征 生物型
• 同型细菌按其微细差别进一步划分，则划分为 不同旳亚型，亚型不属于细菌正式旳分类单元。
4、菌株（strain）
•又称品系，为同种细菌不同起源旳纯培 养物。同种细菌可有多种菌株，菌株旳 主要性状应相同，次要性状可稍有差别。
16SrRNA寡核苷酸编目
• 五、细菌旳分类体系 • 《伯吉氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual
of Systematic Bacterology），由美国细菌学家 Holt主编，共四卷：
• 第1卷 一般医学和工业方面主要旳G-细菌（ 1984年）
• 第2卷 放线菌以外旳G＋细菌（1986年） • 第3卷 古细菌、蓝细菌及其他G－细菌（1989
• 有关分类位置发生变化和分离鉴定新细菌旳 论文，都应在“国际系统与进行微生物学杂志 ” （IJSEM）原名“国际系统细菌学杂志”（IJSB） 刊登，如在其他杂志刊登，必须提交论文副 本给该杂志公布，两年后无异议，所提出旳 新细菌名称才干生效。
第二节 细菌旳命名
• 细菌旳命名根据国际细菌命名法规采用“双 名法”命名。即用“属名”加“种名”来表达一种 生物旳学名。
四、细菌分类鉴定旳原则
•长久以来，细菌分类鉴定旳主要根据是 其表型特征，即形态、染色、培养、 细胞壁构造、生理生化及抗原性旳特 征。这些表型特征对细菌旳鉴定和分 类具有很主要旳作用，尤其在临床微 生物学实践中，至今仍有应用价值。
目前分类主要旳根据
•主要是根据种系发生关系，即分析其基 因旳同源性，从而拟定分类地位。 措施主要采用三种： 测定DNA分子中碱基(G+C)mol% 核酸分子杂交
细菌的分类与命名
P酸序列 2）蛋白质分析 3）转化不转导试验 4）DNA中G+C克分子%测定 5）DNA-DNA杂合试验
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（二）细菌的分类法
1. 条目分类法 2. 数值分类法 3. DNA碱基组成相似性分类法
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（三）细菌种类及种以下的分类单位
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5. 株（Strain)：又称品系，是丌同来源的某一细 菌的纯培养物。同一种细菌可有许多菌株，其主 要性状应完全相同，其次要性状可稍有差异。菌 株的名称没有一定的规定，通常用地名或动物名 的缩写加编号作菌株名。
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四、细菌命名的原则
属名用拉丁文的名词放在前，第一字母大写； 种名用拉丁文的形容词或名词所有格，放在属名之后，丌 大写。中文译名不此相反，即种名在前，属名在后。例如 结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis)，前者为属 名，后者为种名。
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1. 种（Species)：是生物分类的基本单位。它是生物在演 化阶段，具有相对稳定的一定性状特征的实体。凡属同种 的生物，均具有共同的基本性状特征。 2. 亚种（Subspecies)：种内可能存在的某些性状上相互 差异的类别。 3. 变种（Variety)：在个别主要基本性状上不种的典型特 征丌符的类别。 4. 型（Type)不亚型（Subtype)：其地位低于亚种。型别 划分的指征仅仅是某一方面的性状，如血清型（实质是表 面蛋白结构的差异）。
细菌的分类不命名
本章要点：细菌的分类原则、分类单位、命名原则
主要名词解释：种、亚种、变种、型、株
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一、细菌的分类体系及依据
细菌的分类及命名
细菌分类学包括分类，命名和鉴定
一．细菌分类：根据细菌各自的特征，并按照亲缘关系分类，以 不同等级编排系统。分类有两种：
1. 细菌的生理生化分类法，包括有传统分类法和数值分类法。 细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法，称种系分类或自然分类。
细菌命名：在分类基础上，给每种细菌一个科学名
01
称，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名
○ 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 ○ 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分组成如：产气荚膜梭菌
（Clostridium perfringens） ○ 属名在前，字首字母要大写，其余小写 ○ 整个属名及种名在出版物中应排成斜体 ○ 中文译名，种名在前，属名在后
二．分类学文献中的细菌拉丁文学名， 属名和种名之后，往往还要加上首次 定名人（加括号）、现名定名人和现 名定名年份，这些均用正体排字。
○ 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， ○ Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
如果是新种，在新种的 拉丁文学名之后还要加 上“sp.nov。”，nov 是novel的缩写。
例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.， 译为：胞内劳森菌，新 属新种。
○ 一般兽医学及医学微生物学文献中，属名和 种名之后的部分均予省略。
○ 如：Escherichia coli
例如
大肠埃希菌的学名全名是：Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为Bacillu coli， Castellani及Chalmers于1919年改为现名。
细菌的分类与命名
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的某一株细菌
Salmonella sp.
只确定属名， 只确定属名，未确定种名的若干菌株
Salmonella spp.
亚种用subsp.表示 表示 亚种用
Pasteurella multocida subsp. septica
第三节 细菌的分类体系
目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 目前公认的细菌分类体系是“伯吉氏系统细菌学手册” 描述了各个属的性状及属内各种的简明比较 。 “国际系统与进化微生物学杂志”（International 国际系统与进化微生物学杂志” Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IJSEM）是细菌分类命名的世界公认 ） 的权威期刊。 的权威期刊。
第四节 细菌的鉴定
一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。 一般只有纯培养的细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的 分子水平的 鉴定主要限于专业实验室或作研究之用 。 1.形态学检查：标本涂片镜检 形态学检查： 形态学检查 2.病原菌分离鉴定 病原菌分离鉴定 分离培养：一般 ℃ 分离培养：一般37℃ 16-24h 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 细菌鉴定：菌落特征、形态、染色特征、生化试验、 血清学试验
复习重点
细菌命名与书写的基本原则。 细菌命名与书写的基本原则。
Escherichia coli 属名 种名 属名+种名 Salmonella pullorum (S. pullorum)
几种不同的书写情况： 几种不同的书写情况：
属名重复出现，可缩写 属名重复出现，
大肠杆菌）； 如：E.coli （大肠杆菌）；
S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 鸡白痢沙门氏菌）
细菌的分类及命名
二、细菌的分类地位
1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物
古菌 细菌
在兽医微生物中，古细菌不占重要 地位
2、细菌还包括
衣原体、立克次氏体、霉形体、 螺旋体、放线菌等→对动物和人 具有致病作用
蓝细菌、紫色光合细菌等
3、细菌的分类单元
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
界 Kingdom (拉：Regnum)
四、细菌分类鉴定的标准
1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是 其表型(phenotype)特征
形态 染色 培养 细胞壁结构 生理生化 抗原特性
这些表型特征对细菌的鉴定和分类具有很重要的 作用，尤其是在临床微生物学的实中，至今仍有 应用价值。
2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据 是 细 菌 的 种 系 发 生 关 系 (phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而 确定分类地位。
1、分类方法 数值分类法：根据细菌的各种性状的数值
分析，借助计算机，将拟分类的细菌按其 性状的相似程度归类定位。
在进行数值分类时
需要选择分类单位（菌株、种或属）→将 性状编码→按公式计算出相似度（S矩阵） →进行系统聚类→画出相似矩阵图→最后 转绘树状普（dendrogam）
计算相似度的公式为：
属名葡萄球菌 种名金黄色 命名人的姓
恶臭消化链球菌的学名
改名者
Peptostreptococcus foetidus （ Veillon ）Smith
属名消化链球菌 种名恶臭 原命名者
恶臭消化链球菌是由 Veillon 首先发现和定名的 ，后 Smith 重新定为现名。
3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规 则读念
Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为 Bacillu coli，Castellani及Chalmers 于1919年改为现名。
dl第7章 细菌的分类与命名
第七章 细菌的分类与命名
主讲：微生物学检验教研室
第七章 细菌的分类与命名
第一节 细菌的分类单位与命名
种、标准株 双命名法
第二节 细菌的分类方法
数值分类法
第一节 细菌的分类单位与命名
一、细菌的分类单位
❖ 分类等级：界、门、纲、目、科、属、种 1）种：细菌分类的基本单位。生物学性状相同的细
菌群体构成一个种；同一菌种的细菌在某些方面有 一些差异可分为亚种、亚种以下分型、亚型 2）株：不同来源的相同菌种称为菌株。其性状可以 完全相同，也可有某些差异。具有某种细菌典型的 生物学特征的菌株为该菌的标准株。标准株作为细 菌分类、鉴定、命名、质量控制的依据和标准
B.stearothermophilus Bacillus.subtilis(Ehreberg) Cohn 1872（在细菌分类
单元的后面附上命名人的姓氏、命名年代，括号 内为原命名人的姓氏。）
第二节 细菌的分类方法
❖ 传统分类方法
以细胞壁的结构特点作为最高一级分类依据，按 细胞形态、革兰氏染色性、鞭毛及生化特性作为 较高一级分类依据
二、细菌的命名
❖ 举例：
芽孢杆菌属（Bacillus原意为小杆菌）中的几个种： 枯草芽孢杆菌： Bacillus. subtilis 或 B.subtilis 蜡样芽孢杆菌： Bacillus.cereus 或 B.cereus 嗜热脂肪芽孢杆菌：Bacillus.stearothermophilus 或
第一节 细菌的分类单位与命名
二、细菌的命名
❖ 双命名法：即种的学名。包括属名、种名加词。它们 都是由拉丁文、希腊文或拉丁化的其他词组成，要求 印刷成斜体或书写时在名称下划线。
1）第一个词是属名，单数主格名词或作为名词的形容 词表示； 第一个字母大写或缩写为大写的单个或几个 字母表示
主讲：微生物学检验教研室
第七章 细菌的分类与命名
第一节 细菌的分类单位与命名
种、标准株 双命名法
第二节 细菌的分类方法
数值分类法
第一节 细菌的分类单位与命名
一、细菌的分类单位
❖ 分类等级：界、门、纲、目、科、属、种 1）种：细菌分类的基本单位。生物学性状相同的细
菌群体构成一个种；同一菌种的细菌在某些方面有 一些差异可分为亚种、亚种以下分型、亚型 2）株：不同来源的相同菌种称为菌株。其性状可以 完全相同，也可有某些差异。具有某种细菌典型的 生物学特征的菌株为该菌的标准株。标准株作为细 菌分类、鉴定、命名、质量控制的依据和标准
B.stearothermophilus Bacillus.subtilis(Ehreberg) Cohn 1872（在细菌分类
单元的后面附上命名人的姓氏、命名年代，括号 内为原命名人的姓氏。）
第二节 细菌的分类方法
❖ 传统分类方法
以细胞壁的结构特点作为最高一级分类依据，按 细胞形态、革兰氏染色性、鞭毛及生化特性作为 较高一级分类依据
二、细菌的命名
❖ 举例：
芽孢杆菌属（Bacillus原意为小杆菌）中的几个种： 枯草芽孢杆菌： Bacillus. subtilis 或 B.subtilis 蜡样芽孢杆菌： Bacillus.cereus 或 B.cereus 嗜热脂肪芽孢杆菌：Bacillus.stearothermophilus 或
第一节 细菌的分类单位与命名
二、细菌的命名
❖ 双命名法：即种的学名。包括属名、种名加词。它们 都是由拉丁文、希腊文或拉丁化的其他词组成，要求 印刷成斜体或书写时在名称下划线。
1）第一个词是属名，单数主格名词或作为名词的形容 词表示； 第一个字母大写或缩写为大写的单个或几个 字母表示
细菌的分类与命名
5、 细菌的分类体系
1. “伯吉氏系统细菌学手册” （ Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology）：自1923年出 版第一版以来，不断充实修改再版，1994年面世第 九版。
2. Balows等编著的“原核生物” ( The Prokaryyotes ) : 第二版，1992，可弥补伯吉氏手册 的不足。
☆分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。 ☆鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的哪个分类类群的过程。
☆命名是根据国际命名法规给每一微生物类群及种类以科学的名称。
模式种： 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型
菌株（type strain）当其具体代表，此即该种 的模式种（type spe
第三节 细菌分类鉴定的标准
一、表型特征鉴定
长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型特征，即形 态、染色、培养、细胞壁结构、生理生化及抗原性的特征。
二、种系发生关系鉴定
测定DNA中G+Cmol% 核酸杂交法 16sRNA寡聚核苷酸序列
第七章 细菌的分类与命名
第四节 细菌分类的方法
生物分类的二种基本原则：
a）根据表型特征(phenotype)的相似程度分群归 类，这种表型分类重在应用，不涉及生物进化或 不以反映生物亲缘关系为目标；
b）按照生物系统发育相关性水平来分群归类，其目标 是探寻各种生物之间的进化关系，建立反映生物系统 发育的分类系统。
微生物分类的难题：
绝大部分微生物个体小、形态简单、易受环境影 响而变异、缺少有性繁殖过程、缺乏化石资料。
第四节 细菌分类的方法
二、数值分类法
原理是根据数值分析，借助电子计算 机，将拟分类的细菌按其性状相似程度归类定 位。
细菌的分类与命名
细菌的分类方法
传统分类法是临床细菌学检验的基础和依据。这种分
类法的参考书是：
Bergey’s manual of systemic bacteriology
Manual of clinical microbiology
世界畅销书
Diagnostic microbiology
全国临床检验操作规程
中文教科书
标准菌株的用处
(1)标准菌株的典型特征是实验室菌株分 类和鉴定的依据，其种名也是实验室菌 株命名的依据。 (2)标准菌株是临床细菌学检验质量控制 的标准。 (3)在科研中，如涉及细菌，必须使用标 准菌株作为参考菌株或直接使用标准菌 株作为实验材料，否则论文不能公开发 表或不能参加科研成果评定。
2．细菌的命名
(2)数值分类法：分类标记不分主次，而是同等重要看
待（等重要原则）。一般要选用50项以上的生物学特
征作为分类的依据，此分类法是细菌鉴定仪器化、自
动化、电算化的基础和原则，此法称数值分类法。
2．遗传学分类法：CDC分类系统
(1)DNAG+Cmol%测定：用加热变性法测定 两株菌G+Cmol%鉴别 1)不同属:两株菌DNAG+Cmol%相差1015%及以上 2)同属:两株菌DNAG+Cmol%之差<10-15% 3)同种不同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 ≤4-5% 4)同种同亚种:两株菌DNAG+Cmol%之差 <2%
因为细菌的分类常使用科、属、种、型等分类单位，
细菌的科、属、种、型的数量大，为满足细菌分类需
要，常要求对细菌的科、属、种等进行命名，如
沙门
福氏志贺菌
志贺菌属 鲍特志贺菌
细菌分类与命名
发表新名称时，应在新名称之后加上所属 新分类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、 新属“gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。
三、细菌分类鉴 定的标准
20世纪60年代以前，国际上不少细菌分类学 家都曾对细菌进行过全面的分类，提出过一些 在当代有影响的细菌分类系统。但70年代以后 ，对细菌进行全面分类的、影响最大的是《伯 杰氏手册》。所以该书目前已成为对细菌进行 分类鉴定的主要参考书。
❖ １.病料的采集
无菌采集新鲜病料。
❖ ２.直接涂片染色镜检（形态学检查）-单染色法或
复染色法 对于一些具有特征形态的病原体如炭疽 杆菌、猪丹毒杆菌、巴氏杆菌等可迅速做出诊断。
❖ ３.分离纯培养及观察培养特性
❖ 纯培养细菌，再经染色镜检、生化试验、动物试验、 免疫学诊断等进行鉴定。
❖鉴定的前提是：只有分离后的纯培养细菌才
能进行鉴定。
4.生化试验：检测细菌代谢产物 5.动物试验
另外还可再采取病料涂片检查和分离鉴定。 6.血清学反应：用于细菌分型 7.分子生物学技术 核酸探针技术、ＰＣＲ技术等。 8.自动化技术
采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感 试验卡或条板，可快速准确地对临床数百种常见分离 菌进行自动分析鉴定和药敏试验。
❖ 蛋白质是基因的产物,蛋白质的氨基酸顺序直接 反映mRNA顺序而与编码基因密切相关。
❖可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的比较 来分析不同生物系统发育关系,序列相似性越高 ,其亲缘关系愈近。
❖可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系统发 育树和进行分类。
（四）核酸的碱基组成和 分子杂交
比较DNA和碱基组成和进行核酸分子杂交,是 目前通过直接比较基因组进行生物分类最常用的 两种方法。 1.DNA的碱基组成[(G+C)%] 2.核酸的分子杂交 DNA—DNA杂交、DNA—rDNA杂交、核酸探针 3.16SrRNA寡核苷酸编目 4.微生物全基因组序列测定
三、细菌分类鉴 定的标准
20世纪60年代以前，国际上不少细菌分类学 家都曾对细菌进行过全面的分类，提出过一些 在当代有影响的细菌分类系统。但70年代以后 ，对细菌进行全面分类的、影响最大的是《伯 杰氏手册》。所以该书目前已成为对细菌进行 分类鉴定的主要参考书。
❖ １.病料的采集
无菌采集新鲜病料。
❖ ２.直接涂片染色镜检（形态学检查）-单染色法或
复染色法 对于一些具有特征形态的病原体如炭疽 杆菌、猪丹毒杆菌、巴氏杆菌等可迅速做出诊断。
❖ ３.分离纯培养及观察培养特性
❖ 纯培养细菌，再经染色镜检、生化试验、动物试验、 免疫学诊断等进行鉴定。
❖鉴定的前提是：只有分离后的纯培养细菌才
能进行鉴定。
4.生化试验：检测细菌代谢产物 5.动物试验
另外还可再采取病料涂片检查和分离鉴定。 6.血清学反应：用于细菌分型 7.分子生物学技术 核酸探针技术、ＰＣＲ技术等。 8.自动化技术
采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感 试验卡或条板，可快速准确地对临床数百种常见分离 菌进行自动分析鉴定和药敏试验。
❖ 蛋白质是基因的产物,蛋白质的氨基酸顺序直接 反映mRNA顺序而与编码基因密切相关。
❖可以通过对某些同源蛋白质氨基酸顺序的比较 来分析不同生物系统发育关系,序列相似性越高 ,其亲缘关系愈近。
❖可以根据蛋白质的氨基酸序列资料构建系统发 育树和进行分类。
（四）核酸的碱基组成和 分子杂交
比较DNA和碱基组成和进行核酸分子杂交,是 目前通过直接比较基因组进行生物分类最常用的 两种方法。 1.DNA的碱基组成[(G+C)%] 2.核酸的分子杂交 DNA—DNA杂交、DNA—rDNA杂交、核酸探针 3.16SrRNA寡核苷酸编目 4.微生物全基因组序列测定
细菌的分类及命名
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（二）数值分类法
是通过广泛比较分类单位的性状特征，然 后计算它们的相似性，再根据相似性的数 值划分类群的一种分类方法。
至少50－60个性状以上 同等重要 只能划分到类群
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35
方法步骤
根据较多特征分类，每一特征地位相同。 1、每一菌株为一操作单位，确定很多特征 （50—60 个）
鞭毛菌亚门 接合菌亚门 子囊菌亚门 担子菌亚门 半知菌亚门
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43
第八版 1995年
原生生物界
真核 生物域
假菌界 卵菌类
子囊菌门、担子菌门 真菌界 壶菌门、接合菌门
有丝孢真菌类
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44
酵母：lodder分类系统
菌种鉴定工作三部曲 1、获得该微生物的纯培养 2、测定一系列必要的鉴定指标 3、查找权威性鉴定手册
的细菌大于550 种。目前中国
各级疾病预防控制机构在细菌
学检验中比较多地应用了此项
技术
菌种
基本培养基 （液体）
检测、编码、查表、鉴定
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适用于API鉴定细 菌有700多种 30
API—细菌鉴定系统
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2、Enterotube 系统
不同培养基分装不同小槽中，同 步接种，培养后检测、查表、鉴定。
重要的G-细菌 1－11组
G+细菌 12－17组 光合菌、蓝细菌、古细菌等 18－25组
放线菌 26－33 组
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40
《伯杰氏系统细菌学手册》第2版，
分为5卷
古生菌域 泉古生菌门
广古生菌门
2门8纲－－－208个种
细菌的分类单位、系统及命名
（一）细菌的分类单位细菌的分类等级（分类单位）和其他生物相同，为界、门、纲、目、科、属、种。
临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。
种是细菌分类的基本单位。
形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成属；相近的属归为科，依次类推。
在两个相邻等级之间可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属、亚种等。
同一菌种不同来源的细菌称该菌的不同菌株。
它们的性状可以完全相同，也可以有某些差异。
具有该种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准菌株，在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据，标准菌株也可作为质量控制的标准。
（二）细菌的命名国际上一个细菌种的科学命名采用拉丁文双命名法，由两个拉丁字组成，前一字为属名，用名词，首字母大写；后一字为种名，用形容词，首字母小写，印刷时用斜体字。
中文译名则是以种名放在前面，属名放在后面。
例如：Mycobacteriumtuberculosis（结核分枝杆菌），Salmonellatyphi（伤寒沙门菌）等。
有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名，如Tuberclebacillus（结核杆菌）、Typhoidbacillus（伤寒杆菌）等。
（三）细菌的分类系统细菌分类系统有多种，为了便于文献资料的相互比较、分析和交流，目前国际上普遍采用伯杰分类系统。
也有采用CDC（美国疾病预防和控制中心）分类系统。
包括有细菌的鉴定以及细菌分类资料。
目前以细菌细胞壁的结构特点作最高一级分类依据，将原核生物界分为4个菌门；薄壁菌门、坚壁菌门、软壁菌门和疵壁菌门。
细菌的分类与命名(最全版)PTT文档
上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差 异，在种内分成2个或2个以上的分类单位，即为 亚种
微生物亚种以下的变型分类
亚种以下
生物变型——表示特殊的生化或生理特征
血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征
微生物的菌株
菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来 源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以 数字、字母、人命或地名等表示
分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的 后代即为分离物
群(Group)
为工作方便而将近似的种或介于
种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征
归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归
生理生化、G + C mol%、系统发育地位等 5．抗原构造：O、K、H
门（Phylum or Division）
为主——体现了现代分子生物学的研究成 属（Genus）
《伯杰氏系统细菌学手册》 3．生活方式：自主生活，共生，寄生
果 尚未出齐 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中
细菌的分类与命名
微生物分类鉴Байду номын сангаас目的
分类是人类认识微生物，进而利用和 改造微生物的一种手段，微生物工作者只 有在掌握了分类学知识的基础上，才能对 纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解 其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用 微生物资源提供依据
第一节 微 生 物 分 类 学
微生物分类学(Taxonomy)是一门按微生物类群的 亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元 或分类群（Taxon）的科学
细二胞、形 微态生水物平的的 命色名 素、形状、来源、病名、地名、某科学家的
微生物亚种以下的变型分类
亚种以下
生物变型——表示特殊的生化或生理特征
血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征
微生物的菌株
菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来 源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以 数字、字母、人命或地名等表示
分离物是指已分离得到但为经鉴定的纯培养物的 后代即为分离物
群(Group)
为工作方便而将近似的种或介于
种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征
归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归
生理生化、G + C mol%、系统发育地位等 5．抗原构造：O、K、H
门（Phylum or Division）
为主——体现了现代分子生物学的研究成 属（Genus）
《伯杰氏系统细菌学手册》 3．生活方式：自主生活，共生，寄生
果 尚未出齐 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中
细菌的分类与命名
微生物分类鉴Байду номын сангаас目的
分类是人类认识微生物，进而利用和 改造微生物的一种手段，微生物工作者只 有在掌握了分类学知识的基础上，才能对 纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解 其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用 微生物资源提供依据
第一节 微 生 物 分 类 学
微生物分类学(Taxonomy)是一门按微生物类群的 亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元 或分类群（Taxon）的科学
细二胞、形 微态生水物平的的 命色名 素、形状、来源、病名、地名、某科学家的
细菌的分类及命名ppt课件
细菌的分类及命名
6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之 后还要加上“sp.nov。”，nov是novel 的缩写。 • 例如Lawsonia intracellularis
gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
细菌的分类及命名
7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， • 例如Pasteurella multocida
• 属名在前，字首字母要大写，其余小写
• 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
• 中文译名，种名在前，属名在后
细菌的分类及命名
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定名 人（加括号）、现名定名人和现名定名 年份，这些均用正体排字。 • 一般兽医学及医学微生物学文献中，
属名和种名之后的部分均予省略。 • 如：Escherichia coli
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
• 界 Kingdom (拉：Regnum)
• 门 Phylum (拉：Phylum)) • 纲 Class (拉：Classis) • 目 Order (拉：Ordo)
•
科 Family (拉：Familia)
•
属 Genus（拉：Genus）
•
种 Species（拉：Species）
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁 文学名可在属名之后加sp．(正体字)；如果同属未 定种名的若干菌株，则用spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ，
• 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， • Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之 后还要加上“sp.nov。”，nov是novel 的缩写。 • 例如Lawsonia intracellularis
gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳 森菌，新属新种。
细菌的分类及命名
7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是 subspecies的缩写， • 例如Pasteurella multocida
• 属名在前，字首字母要大写，其余小写
• 整个属名及种名在出版物中应排成斜体
• 中文译名，种名在前，属名在后
细菌的分类及命名
2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属 名和种名之后，往往还要加上首次定名 人（加括号）、现名定名人和现名定名 年份，这些均用正体排字。 • 一般兽医学及医学微生物学文献中，
属名和种名之后的部分均予省略。 • 如：Escherichia coli
细菌的分类单元与动植物一样，依次为
• 界 Kingdom (拉：Regnum)
• 门 Phylum (拉：Phylum)) • 纲 Class (拉：Classis) • 目 Order (拉：Ordo)
•
科 Family (拉：Familia)
•
属 Genus（拉：Genus）
•
种 Species（拉：Species）
5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁 文学名可在属名之后加sp．(正体字)；如果同属未 定种名的若干菌株，则用spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ，
• 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， • Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。
细菌的分类与命名
细菌分类系统
《伯杰系统细 菌学手册》
根据细菌细胞 壁的结构特点 将原核生物界 分为四个菌门：
薄壁菌门-有 细胞壁的革兰 阴性菌
厚壁菌门-有 细胞壁的革兰 阳性真细菌
软壁菌门-缺 细胞壁的真细 菌（支原体）
疵壁菌门-古 细菌
细菌分类系统
01
《伯杰系统细菌学手册》
02
第1卷：医学、工业和普通微生物中
革兰阴性杆菌
葡萄糖发酵 +
+ 弧菌科
氧化酶 肠杆菌科
非发酵菌 双歧索引法
（一）传统分类法
01
优点：使用方便、分类 较明确。
02
缺点：对分类性状的选 择有一定主观性。
（二）数值分类法
借助计算机将细菌按其性状的相似程度进行分类，一般选用2050项以上的生理、生化指标逐一进行比较，通过计算机分析各 菌的相似度来划分种和属。
螺旋体 革兰阴性、需氧、微需氧、有动力
第1卷 1~11组
3 4 5 6
、螺形菌 革兰阴性、无动力、弯曲菌 革兰阴性、需氧、杆菌或球菌 革兰阴性、兼性厌氧、杆菌 革兰阴性、厌氧、杆菌或螺形菌
包括医学、工业、农 业重要的革兰阴性细菌
7 8 9 10 11
异化还原硫酸盐的细菌 革兰阴性、厌氧球菌 立克次体和衣原体 支原体 内共生菌
概念
型：按某种细微特征在种内进一步区分。血清型、噬菌 体型、生物型、细菌素型。用于流行病学的分析研究。
群：不是固定分类单位，按某种生物学特征，把相应的 菌株归在一起，组成群。例如：沙门菌血清分群。
命名法
细菌科学名称（学名）的命名法采用生物双名法（binominal nomenclature）。具备拉丁化文字的形式和明确的分类等级两个特点，即由 一个属名和一个种名构成。属名在前，种名在后。
微生物的分类单元和命名
4.闵航（2005）：微生物学.浙江大学出版社
参考期刊：
微生物学报中国科学院微生物研究所；中国微生物学会主办
微生物学通报中国微生物学会；中国科学院微生物研究所主办
参考网址：
中国微生物信息网络hppt://159.226.80.1/chinese.html
中国微生物资源信息共享/sdinfo
中国微生物信息网络n/
2.
一、填空题
1.种以上的系统分类单元自上而下可依次分成7级：_____，______，______，_______，________，___________，_____________。
答案：界，门，纲，目，科，属，种
3.
一、简答
1.微生物分类学担负着那三项具体任务？
4.
5.
课程讲义资源（Word文档）、教学课件资源（PPT）、视频录像资源（视频录像）。
属名在前规定用拉丁字名词表示词首字母要大写由微生物的构造形状或由著名的科学家名字而来用以描述微生物的主要特征
微生物的分类单元和命名
1.
1.分类单位：界、门、纲、目、科、属、种。其中种是最基本的分类单位。亚种以下的分类名词有变种、型、菌株
2.命名：每一种微生物的学名都依属与种而命名，由两个拉丁字或希腊字或拉丁化的其他文字组成。属名在前，规定用拉丁字名词表示词首字母要大写，由微生物的构造、形状、或由著名的科学家名字而来，用以描述微生物的主要特征。种名在后，用拉丁形容词表示，词首字母小写，为微生物的色素、形状、来源、病名或著名的科学家姓名等，用以描述微生物的次要特征。
6
使用教材：
微生物学教程第3版周德庆主编高等教育出版社2011
参考书目：
1.沈萍主编，《微生物学》，高等教育出版社，2000；
参考期刊：
微生物学报中国科学院微生物研究所；中国微生物学会主办
微生物学通报中国微生物学会；中国科学院微生物研究所主办
参考网址：
中国微生物信息网络hppt://159.226.80.1/chinese.html
中国微生物资源信息共享/sdinfo
中国微生物信息网络n/
2.
一、填空题
1.种以上的系统分类单元自上而下可依次分成7级：_____，______，______，_______，________，___________，_____________。
答案：界，门，纲，目，科，属，种
3.
一、简答
1.微生物分类学担负着那三项具体任务？
4.
5.
课程讲义资源（Word文档）、教学课件资源（PPT）、视频录像资源（视频录像）。
属名在前规定用拉丁字名词表示词首字母要大写由微生物的构造形状或由著名的科学家名字而来用以描述微生物的主要特征
微生物的分类单元和命名
1.
1.分类单位：界、门、纲、目、科、属、种。其中种是最基本的分类单位。亚种以下的分类名词有变种、型、菌株
2.命名：每一种微生物的学名都依属与种而命名，由两个拉丁字或希腊字或拉丁化的其他文字组成。属名在前，规定用拉丁字名词表示词首字母要大写，由微生物的构造、形状、或由著名的科学家名字而来，用以描述微生物的主要特征。种名在后，用拉丁形容词表示，词首字母小写，为微生物的色素、形状、来源、病名或著名的科学家姓名等，用以描述微生物的次要特征。
6
使用教材：
微生物学教程第3版周德庆主编高等教育出版社2011
参考书目：
1.沈萍主编，《微生物学》，高等教育出版社，2000；
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临床诊断学细菌的分类单位、系统及命名
（一）细菌的分类单位
细菌的分类等级（分类单位）和其他生物相同，为界、门、纲、目、科、属、种。
临床细菌检验常用的分类单位是科、属、种。
种是细菌分类的基本单位。
形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成属；相近的属归为科，依次类推。
在两个相邻等级之间可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属、亚种等。
同一菌种不同来源的细菌称该菌的不同菌株。
它们的性状可以完全相同，也可以有某些差异。
具有该种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准菌株，在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据，标准菌株也可作为质量控制的标准。
（二）细菌的命名
国际上一个细菌种的科学命名采用拉丁文双命名法，由两个拉丁字组成，前一字为属名，用名词，首字母大写；后一字为种名，用形容词，首字母小写，印刷时用斜体字。
中文译名则是以种名放在前面，属名放在后面。
例如：Mycobacteriumtuberculosis（结核分枝杆菌），Salmonellatyphi（伤寒沙门菌）等。
有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名，如Tuberclebacillus（结核杆菌）、Typhoidbacillus（伤寒杆菌）等。
（三）细菌的分类系统
细菌分类系统有多种，为了便于文献资料的相互比较、分析和交流，目前国际上普遍采用伯杰分类系统。
也有采用CDC（美国疾病预防和控制中心）分类系统。
包括有细菌的鉴定以及细菌分类资料。
目前以细菌细胞壁的结构特点作一级分类依据，将原核生物界分为4个菌门；薄壁菌门、坚壁菌门、软壁菌门和疵壁菌门。