7 糖的生物合成

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7 糖的生物合成

7 糖的生物合成

第七章糖的生物合成

7.1 光合作用

7.1.1 光合作用概述

7.1.2 光能的吸收、转变和同化力产生

7.1.3 光合的碳素途径(卡尔文循环)

途径

7.1.4 C

4

7.2 糖异生作用

7.2.1 糖异生途径

7.2.2 糖酵解和糖异生的互补调节

7.3 蔗糖和多糖的生物合成

7.3.1 糖核苷酸的作用

7.3.2 蔗糖的生物合成

7.3.3 淀粉(糖原)的合成

7.3.4 纤维素的生物合成

7.3.5 半纤维素的生物合成

7.3.6 果胶的生物合成

7.4 植物糖代谢的调节

7.4.1 植物光合细胞丙糖、蔗糖、淀粉的相互转化

7.4.2 果糖-2 , 6-二磷酸(F - 2 ,6 - BP)对糖酵解的调节

7.4.3 光合作用形成的能量和还原力的外运

7.4.4 植物光合细胞中糖酵解及蔗糖和淀粉合成的调节

7.1 光合作用

7.1光合作用

光合作用(photosynthensis)是生物界中规模最大的有机合成过程,通过光合作用使太阳能转变为化学能贮存于碳水化合物中,每年约为8.36×1018 kJ。放出的氧气约535×1011 t,同化的碳素约2×1011 t。

7.1.1光合作用概述

光合作用的基本过程可用下式表示。

式中CO2是碳的氧化态,而生成物碳水化合物(CH2O)中的碳是相对还原态,因此,这是一个氧化还原反应。CO2为氧化剂,在反应中被还原,H2O为还原剂,本身被氧化而提供CO2还原所需的电子。CO2/(CH2O)系统的E′为-0.4 V,而O2/H2O的E′是+0.82 V,显然,

在电子从水转移至CO2分子时是逆电势梯度(+1.22 V),因此,不能自发进行。要使这一过程进行,必须供给能量。在光合作用中,这些能量是由叶绿素吸收的光能提供的。

7.1.2光能的吸收、转变和同化力产生

7.1.2.1光合色素和光化学反应

1光合色素高等植物叶绿体中含有两类色素分子:叶绿素和类胡萝卜素。叶绿素包括叶绿素a和b;类胡萝卜素包括胡萝卜素和叶黄素。这些色素分子与叶绿体类囊体膜上的蛋白质形成色素蛋白复合物,完成对光能的吸收、传递和光化学反应。根据色素的作用可将其分为天线色素(辅助色素)和作用中心色素。天线色素(antenna pigment)包括全部叶绿素b、类胡萝卜素和大部分叶绿素a,它们的功能是吸收光能并传递到作用中心色素分子。作用中心色素(reaction centre pigment)是位于类囊体膜上具有特殊状态和光化学活性的少数叶绿素a分子,其作用是利用光能产生光化学反应,将光能转变成电能。

2 光化学反应根据吸收光波长的不同,把作用中心色素分为两类:P700(700 nm)和

P680(680 nm),它们分别是色素蛋白复合物光系统Ⅰ(photosystem Ⅰ,PSⅠ) 和光系统Ⅱ(photosystemⅡ,PSⅡ)的光合作用中心色素。在高等植物中光合作用中心是指叶绿体中进行光合作用原初反应的最基本的色素蛋白结构,至少包括一个作用中心色素分子P(代表

P680或P700)、一个原初电子受体(A)和一个原初电子供体(D)。A和D分别是直接接受或供给作用中心色素电子的物质。

光化学反应发生时,作用中心色素P接受光能被激发成激发态P*,此时P*的一个电子被激发处于高能轨道,极易失去。P*把1个电子传给原初电子受体A,使A变成A-,P*失去电子后回到基态变成P+,P+对电子有极大的吸引力,再从原初电子供体D得到一个电子,本身恢复成P而D变成D+,实现了电荷的分离。

7.1.2.2光合电子传递链(photosynthetic chain)

如上述,在光合作用中水中的电子经过一系列的电子递体的传递,最后到达NADP+。这些递体在类囊体膜上是有序的排列,互相衔接着,被称为电子传递链。如果把这些物质按

其氧化还原电位(E′)排列起来,其形状像英文中Z,所以又称为Z链,如图7-1所示。从图上可以看出:

图7-1高等植物光合作用电子传递链

1 通过光对两个作用中心色素分子P680和P700的激发,提高了P*680和P*700的氧化还原电势,H2O中的电子逆电势传递到NADP+。但在P*680→P700和P*700→NADP+之间是顺电势梯度的自发过程。

2 电子传递过程是电子递体之间的一系列氧化还原反应。

3 电子传递的结果是把光能变成电能,又变成了NADPH+H+中的活跃的化学能。同时在电子传递过程中还偶联ATP的产生,这也是一个把光能转变成活跃化学能的过程。光合作用中通过电子传递形成NADPH+H+和ATP,合称之为同化力,用于后文提到的卡尔文循环中CO2的固定和还原,从而形成有机化合物糖。

4 光合链电子的最终供体为H2O,这就导致水的光解,形成光合放氧。

Z链是按电子传递体的生物氧化还原电势排列的。它并不反映这些物质在类囊体中的排列状况。图7-2显示了电子传递体在类囊体中实际排列的电子传递链。

图7-2质子梯度的形成和ATP产生

7.1.2.3光合磷酸化

叶绿体利用光能使ADP+Pi生成ATP的反应,称之为光合磷酸化(photosynthetic phosphorylation)。利用光能生成ATP的过程有两种。一种是来自于水的电子经过PSⅡ,Cytb6/f和PSⅠ的传递到达NADP+,在传递过程中释放能量用于ADP磷酸化生成ATP,同时将NADP+还原成NADPH+H+。此过程其电子传递是开放的,所以称之为非环式光合磷酸化。另一种是PSⅠ的电子传给Fd后,再传给Cytb6/f,然后经PC又回到PSⅠ,形成一个环式电子流。在电子流动过程中释放的能量使ADP+Pi形成ATP,因其电子传递路程是闭合的,所以称之为环式光合磷酸化。

形成ATP的机理可以用化学渗透学说来解释(参阅62)。如在图7-3非环式电子传递过程中,当来自水的电子还原PQ成PQH2时,要从叶绿体基质中得到两个质子,而当PQH2将电子传给Cytb6/f时,要将两个质子释放到类囊体腔中,类囊体膜对质子是不可随

便通过的。因此使腔内的质子浓度大于基质的质子浓度。即利用电子传递释放的能量建立了一个质子势。当质子通过ATP合酶从腔中进入基质时,就利用这部分能量使ADP+Pi形成ATP。这样,就很好地解释了非环式光合磷酸化中ATP的形成(图7-3)。而对于环式光合磷酸化,因为电子传递过程没有完全搞清楚,因此没有一个满意的答案。环式电子传递过程是PSⅠ→Fd→Cytb6/f→PC→PSⅠ时,就同样可以建立类囊体膜内外的质子势,用于ATP 的形成。这一问题的解决还有待进一步研究。

7.1.3光合的碳素途径(卡尔文循环)

基本的光合碳素途径——还原的戊糖途径是1946年M Calvin等科学家用单细胞绿藻作试验材料,应用14C示踪技术并结合纸上层析法,经过十年努力搞清楚的光合作用碳素同化途径。因此也称作卡尔文循环(Calvin cycle)。由于卡尔文在光合作用碳转化途径上作出了重大贡献,他于1961年获得诺贝尔奖。卡尔文循环的最初产物为3-磷酸甘油酸,因此,此途径也称C3途径。整个循环可分为三个阶段。

1 CO2的固定CO2与核酮糖-1,5-二磷酸(ribulose bisphosphate,RuBP)反应生成两分子三磷酸甘油酸(3-PGA)。在此反应中,酶的作用使RuBP异构成烯醇式二磷酸核酮糖,后者羧化成中间产物2-羧基,3-酮基-1,5-二磷酸核糖,再加水分解生成2分子3-磷酸甘油酸(3-PGA)。

这一反应由核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶(ribulose bisphosphate carboxylase oxygenase, Rubisco)催化,该酶位于叶绿体间质中,含量占叶片可溶性蛋白一半以上。由八个大亚基和八个小亚基组成,大小亚基分别由叶绿体基因和核基因编码。催化部位在大亚基上,而小亚基则具有调节作用。该酶还具有加氧酶活性,加氧产物为3-PGA和磷酸乙醇酸,加氧和羧化作用发生在同一个活性中心,而且两种活性均可为CO2和Mg2+所活化。

2羧化产物的还原包括两步反应:3-PGA在激酶催化下磷酸化生成1,3-二磷酸甘油酸(1,3-diPGA);后者在脱氢酶催化下还原为3-磷酸甘油醛。此反应所消耗的ATP和NADPH 称之为光合同化力,来自光合作用的光反应。反应产物3-磷酸甘油醛是一个三碳糖。

3 RuBP的再生由一系列转酮酶、转醛酶和异构酶催化,经10步反应(表7-1,图7-4)使RuBP再生。反应及酶类似于磷酸戊糖途径中分子重排阶段的逆过程。

表7-1光合作用碳还原循环的反应

卡尔文循环的总反应式中的6-磷酸果糖可进一步转化为葡萄糖: 总反应式可写成:

图7-4卡尔文循环(C3循环)

表明每同化1分子CO2需3分子ATP和2分子NADPH。7.1.4 C4途径

M.D.Hatch和C。R。Slack发现,某些起源于热带的植物例如甘蔗、玉米等在光合作用中还存在一种辅助途径——C4途径。它的作用是固定、转运和集中CO2到C3途径所在的维管束鞘细胞中,使其中CO2浓度升高,从而提高了光合速率。

C4途径开始于叶肉细胞中,在磷酸稀醇式丙酮酸羧化酶(PEP羧化酶)的作用下,CO2与磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)缩合形成草酰乙酸。后者是一种含四个碳原子的二羧酸,故将该反应途径叫C4途径。在某些C4植物中草酰乙酸被转变成苹果酸,在另一些植物中它也可被转变成天冬氨酸,然后转入维管束鞘细胞中,经过脱羧作用分解成CO2和一个C3化合物(如PEP),C3化合物被转运回叶肉细胞中,进行下一次固定CO2的循环;CO2则进入卡尔文循环,形成糖。简要过程见图7-5。

图7-5C4途径的简要过程

在C4植物中,卡尔文循环只存在于维管束鞘细胞中,这些细胞中的O2浓度较低,而又由于C4途径的转运和集中,CO2浓度升高,因而提高了细胞中的CO2/O2之比,这有利于RuBisco的羧化作用而不利于其加氧作用,提高了光合作用的速率。

7.2糖异生作用

糖异生(gluconeogenesis)作用是由非糖前体如丙酮酸、草酰乙酸等合成葡萄糖的过程。可通过糖酵解的逆过程完成,但糖异生途径又非糖酵解的简单逆转。在糖酵解中,由己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶催化的反应是不可逆的,若以另一些酶代替,这三步反应即可逆(图7-6)。

图7-6糖酸解和糖异生的比较7.2.1糖异生途径

1.丙酮酸生成磷酸烯醇式丙酮酸通过两步反应: (1) 丙酮酸羧化酶催化丙酮酸羧化生成草酰乙酸:

丙酮酸羧化酶是一个生物素蛋白,需乙酰CoA和Mg2+激活。该酶定位于线粒体,丙酮酸需经运载系统进入线粒体后才能羧化成草酰乙酸,后者只有在转变为苹果酸后才能再进入细胞质。

苹果酸再经胞质中的苹果酸脱氢酶转变成草酰乙酸,才能进一步转变成PEP。

(2) 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶催化草酰乙酸形成PEP:

PEP沿酵解途径逆向反应转变成1,6-二磷酸果糖。

2.1,6-二磷酸果糖转化成6-磷酸果糖,反应由二磷酸果糖酯酶催化

该酶是变构酶,受AMP、2,6-二磷酸果糖变构抑制,但受ATP、柠檬酸变构激活。

3.6-磷酸葡萄糖转化成葡萄糖由6-磷酸葡萄糖酯酶催化。

哺乳动物的糖异生作用在肝脏中进行;高等植物主要发生在油料种子萌发时脂肪酸氧化产物和甘油向糖的转变。

7.2.2糖酵解和糖异生的互补调节

在细胞中糖异生作用和糖酵解作用相互协调、受到很多代谢物的调控:

1高水平的ATP、NADH变构抑制磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶,而变构地激活二磷酸果糖酯酶。

2 Pi、AMP、ADP变构激活磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶并变构抑制二磷酸果糖酯酶。

3 ATP/ADP比值高时EMP途径关闭、糖异生打开;ATP/ADP比值低时EMP途径打开,糖异生活性降低。柠檬酸起类似的作用。

7.3蔗糖和多糖的生物合成

7.3.1糖核苷酸的作用

葡萄糖只有转变为活化形式,才能合成寡糖和多糖。尿苷二磷酸葡萄糖(UDPG)、腺苷二磷酸葡萄糖(ADPG)和鸟苷二磷酸葡萄糖(GDPG)都是葡萄糖的活化形式,它们分别在寡糖和多糖的生物合成中作为葡萄糖的供体。可通过下式合成:

此反应是可逆的,但由于焦磷酸极易被焦磷酸酶水解成正磷酸使反应向右进行。ADPG 和GDPG也是以类似的反应生成的,催化的酶是ADPG(或GDPG)焦磷酸化酶。

7.3.2蔗糖的生物合成

蔗糖的合成可通过下列二条途径:

1蔗糖合成酶蔗糖合成酶能利用UDPG作为葡萄糖供体与果糖合成蔗糖。反应如下:

UDPG + 果糖→蔗糖 + UDP

该酶还可利用ADPG、GDPG等作为葡萄糖供体,主要存在于植物的非绿色组织(如贮藏器官)。

2磷酸蔗糖合成酶磷酸蔗糖合成酶可使UDPG的葡萄糖转移到6-磷酸果糖上,形成磷酸蔗糖:

UDPG + F-6-P →磷酸蔗糖 + UDP

在光合组织中磷酸蔗糖合成酶活性高。在磷酸蔗糖磷酸酶的催化下,磷酸蔗糖水解生成蔗糖。

磷酸蔗糖 + H2O →蔗糖 + Pi

由于磷酸蔗糖合成酶的活性较大,平衡常数有利蔗糖合成,而且磷酸蔗糖合成酶存在量大,所以一般认为途径2是植物合成蔗糖的主要途径。

图7-7蔗糖合成的可能途径

那么途径1的功能何在?现在认为主要是起蔗糖分解的作用,特别是在贮藏淀粉的组织器官中蔗糖转变成淀粉过程中起着重要作用。

7.3.3淀粉(糖原)的合成

淀粉是植物界普遍存在的贮存多糖。谷类、豆类和薯类等粮食中含有大量淀粉。在高等动物的肌肉和肝脏中,贮存着动物淀粉——糖原。淀粉和糖原虽然在结构上复杂程度不同,但它们的生物合成的基本点是相似的;直链的增长是在原有直链上逐步增加葡萄糖残基,支链的增多是把直链的一部分拆下来装配成侧枝。

7.3.3.1淀粉的合成

光合作用旺盛时,叶绿体可直接合成和累积淀粉;非光合组织也可利用葡萄糖合成或通过蔗糖转化成淀粉。

1直链淀粉的合成通过三种酶进行:

(1) 淀粉磷酸化酶此酶广泛存在于动物、植物、酵母和某些细菌、它催化下面反应:

G-1-P + 引物(nG)→(n+1)G + Pi n33

葡萄糖C1被磷酸化,因此所转移来的葡萄糖是加在引物链的C4非还原末端羟基上。

植物细胞中无机磷浓度较高,因此通常磷酸化酶的主要作用是催化淀粉的水解。

(2) D酶D-酶是一种糖苷转移酶,作用于α-1,4糖苷键上,它能将一个麦芽多糖的残余段转移到葡萄糖、麦芽糖或其它α-1,4键的多糖上,起着加成作用(见图7-8),形成淀粉合成中的“引物”。

图7-8D酶的作用示意图

—:α-1,4键;●转移的葡萄糖单位

(3) 淀粉合成酶是淀粉合成的主要途径。主要以ADPG作为葡萄糖基供体。也可以用UDPG,但用ADPG合成淀粉的反应比用UDPG快10倍。

图7-9蔗糖转化为淀粉的途径

图7-10支链淀粉的合成

支链淀粉除含有α-1,4键外,还有α-1,6糖苷键。因此,支链淀粉是在淀粉合成酶和1,4-α-葡聚糖分支酶(原称Q酶)共同作用下生成的。淀粉合成酶催化葡萄糖以α-1,4键结合,1,4-α-葡聚糖分支酶可从直链淀粉的非还原端拆开一个低聚糖片段,并将其

各类中药化学成分的生物合成途径

各类中药化学成分的主要生物合成途径 乙酸-丙二酸途径:脂肪酸类,酚类,醌类;甲戊二羟酸途径:萜类,甾类;莽草酸途径:即桂皮酸途径,苯丙素类,木脂素类,香豆素类;氨基酸途径 :生物碱类 溶剂提取法(常用溶剂及极性) (1)溶剂按极性分类:三类,即亲脂性有机溶剂、亲水性有机溶剂和水。溶剂按极性由弱到强的顺序如下:石油醚<四氯化碳<苯<二氯甲烷<氯仿<乙醚<乙酸乙酯<正丁醇<丙酮<甲醇(乙醇)<水。 甲醇(乙醇)是最常用的溶剂,能用水任意比例混合. 分子大,C多,极性小,反之,大..按相似相溶原理,极性大的溶剂提取极性大的化合物 提取方法 ①煎煮法:挥发性及加热易破坏,多糖类不宜用。 ②浸渍法:不用加热,适用于遇热易破坏或挥发性成分,含淀粉或黏液质多的成分,但效率不高。 ③渗漉法:效率较高。④回流提取法:受热易破坏的成分不宜用。⑤连续回流提取法:有机溶剂,索氏提取器或连续回流装置。⑥水蒸气蒸馏法: 适于具挥发性,能随水蒸气蒸馏而不被破坏的。挥发油、小分子生物碱、酚类、游离醌类等:⑥超临界萃取法:以CO2为溶剂.用于极性低的化合物,室温下工作,几乎不用有机溶剂,环保 分离方法 ①吸附色谱:利用吸附剂对被分离化合物分子的吸附能力的差异,而实现分离的一类色谱。硅胶用于大多数中药成分;氧化铝用于碱性或中性亲脂性成分如生物碱、萜、甾;活性炭用于水溶性物质如氨基酸、糖类和某些苷类;聚酰胺用于酚醌如黄酮、蒽醌及鞣质。②凝胶色谱:主要是分子筛作用,根据凝胶的孔径和被分离化合物分子的大小而达到分离目的。③离子交换色谱:基于各成分解离度的不同而分离。主要用于生物碱、有机酸及氨基酸、蛋白质、多糖等水溶性成分的分离纯化。④大孔树脂色谱:一类没有可解离基团,具有多孔结构,不溶于水的固体高分子物质。它可以通过物理吸附有选择地吸附有机物质而达到分离的目的。是反相的性质,一般被分离物质极性越大,越先被洗脱下来,极性越小,越后洗脱下来。应用于中药有效部位或有效成分的分离富集。⑤分配色谱:利用物质在固定相和流动相之间分配系数不同而达到分离。正相色谱:固定相极性>流动相极性,用于分离极性和中等极性的成分。常用固定相:氰基或氨基键合相;常用流动相为有机溶剂。反相色谱:固定相极性<流动相极性,用于离非极性和中等极性的成分,常用C18或C8键合相。常用流动相为甲醇-水或乙腈-水。 糖和苷类化合物 糖:多羟基醛或多羟基酮及其衍生物、聚合物的总称 苷:糖或糖额衍生物与另一非糖物质通过糖的端基碳原子连接而成,又称配糖体 构型D,L,α,β : 向上D,向下L; 同侧:β异侧:α 苷键酸水解:苷键原子首先发生质子化,然后苷键断裂生成苷元和糖的阳碳离子中间体,在水中阳碳离子经溶剂化,再脱去氢离子形成糖分子。难易顺序:N-苷>O-苷>S-苷>C-苷。强酸水解:得到糖,苷元易破坏;弱酸水解:得到次级苷,确定糖的连接顺序;两相酸水解:保护苷元 酶水解:对难以水解或不稳定的苷,在酶水解条件温和,不会破坏苷元,可得到真正的苷元 显色反应 Molish反应:加入5%α-萘酚乙醇液,沿管壁缓慢滴入浓硫酸,在两层液面间会出现一个紫色环。又称α-萘酚反应.说明含有糖类或苷类. (但碳苷和糖醛酸例外,呈阴性.) 菲林和多伦反应:阳性,有还原糖.可以利用这两个反应来区别还原糖和非还原糖。 单糖:都是还原糖。双糖:麦芽糖、乳糖为还原糖。蔗糖为非还原糖 苷键构型的判断 糖苷的1H-NMR:成苷的端基质子H的耦合常在较低场。如:β构型J H1-H2=6~9Hz(8左右);α构型J H1-H2=2~3.5Hz (4左右) 醌类 酸性(规律) -COOH > 二个β-OH > 一个β-OH >二个α- OH > 一个α–OH 可用PH 梯度萃取分离。 其结果为①和②被5%碳酸氢钠溶液提出;③被5%碳酸钠提出;④被1%氢氧化钠提出;⑤只能被5%氢氧化钠提出 可用PH梯度萃取分离。 颜色反应 1、Feigl反应:全部醌类均阳性。碱性条件加热,紫色 2、Borntrager’s反应:也叫碱液试验,羟基蒽醌阳性。——颜色变化与OH数目及位置有关,红-紫色. 3、醋酸镁反应:含α-酚羟基或邻二酚羟基的蒽醌类阳性。 4、与活性亚甲基试剂反应kesting-Craven和无色亚甲蓝显色反应: 苯醌和萘醌类的专属反应.在碱性条件下 5、对亚硝基-二甲苯胺反应: 蒽酮类的特异性反 应.(唯一).蒽酮就是9或10位没有被取代的羟基 蒽酮类. 醌类化合物的提取与分离 (大题,看书) pH梯度萃取法P82 例:大黄蒽醌苷类的分离 苯丙素类(一个或几个C6-C3) 香豆素:一般具有苯骈α-吡喃酮母核的天然产物 母核(画) 内酯性质和碱水解反应 碱性开环,酸性闭环。但长时间加热,异构化,不可 恢复闭环. 显色反应有荧光性质 1、Gibb’s反应: 试剂:2,6-二氯(溴)苯醌氯 亚胺 C6位没取代,阳性,蓝色 2、Emerson反应试剂:4-氨基安替比林,铁氰化 钾反应 C6位没取代,阳性,红色 木脂素鉴识 Labat反应:具有亚甲二氧基的木脂素加浓硫酸 后,再加没食子酸,可产生蓝绿色 黄酮(C6-C3-C6) 结构与基本骨架(芦丁,槲皮素,鼠李糖,葡萄糖的 结构都要求会写)138页 经典结构是2-苯基色原酮,现在泛指两个苯环通 过三个碳原子相互连接而成的一类化合物 黄酮类:以2-苯基色原酮为母核,且3位上无含 氧基团取代的一类化合物 黄酮醇:在黄酮基本母核的3位上连有羟基或含 氧基团 二氢黄酮:黄酮基本母核的2、3位双键被氢化而 成 二氢黄酮醇:黄酮醇类的2、3位被氢化的基本母 核 交叉共轭体系:黄酮结构中色原酮部分本身无 色,但在2位上引入苯环后,即形成交叉共轭体 系,通过电子转移、重排,使共轭链延长而显出 颜色。在7位或4’位上引入-OH及-OCH3等助色 团后,产生p-π共轭,使化合物颜色加深。 溶解度:游离黄酮一般难溶于水,易溶于甲醇、 乙醇、乙酸乙酯、氯仿、乙醚等有机溶剂及稀碱 水中。引入羟基增多,水溶性增大,脂溶性降 低;而羟基被甲基化后,脂溶性增加。黄酮苷一 般易溶于水、甲醇、乙醇等强极性溶剂中,但难 溶于苯、氯仿、乙醚等有机溶剂中 平面型如黄酮、黄酮醇、查尔酮等溶解度较小, 非平面型如二氢黄酮及二氢黄酮醇的溶解性较 大,异黄酮的也较大 酸性:7,4’-二OH黄酮>7-或4’-OH黄酮>一 般酚羟基>5-OH黄酮 显色反应:(1)HCl-Mg反应:样品溶于甲醇或乙 醇1ml中,加入少许Mg,再加几滴浓HCl,一两 分钟显红~紫红色。(2)AlCl3反应:样品的乙醇 溶液和1%乙醇溶液AlCl3反应,生成黄色络合 物。(3)锆盐-枸橼酸反应:可鉴别黄酮类化合 物是否纯在3-或5-OH。样品的甲醇溶液加2%二氯 氧锆甲醇溶液。黄色不褪,有3-OH或3,5-OH, 如果减褪,无3-OH而有5-OH pH梯度萃取法:5%NaHCO3可萃取7,4’-二羟基 黄酮,5%NaCO3可萃取7-或4‘-羟基黄酮, 2%NaOH可萃取一般酚羟基的黄酮,4%NaOH可以萃 取5-羟基黄酮。 柱色谱分离 硅胶柱:利用极性差异,几乎适用于任何类型黄 酮(主要分离异黄酮、二氢黄酮,二氢黄酮醇及 高度驾机皇或乙酰化的黄酮及黄酮醇) 聚酰胺柱:通过酰胺羰基与黄酮类化合物分子上 的酚羟基形成氢键缔合而产生。化合物结构与Rf 值:酚羟基少>多;易形成分子内氢键>难;芳 香化程度低>高;异黄酮>二氢黄酮醇>黄酮> 黄酮醇;游离黄铜>单糖苷>双糖苷>叁糖苷 (含水移动相做洗脱剂);有机溶剂做洗脱剂反 之。洗脱能力由弱至强;水<甲醇或乙醇(浓度 由低到高)<丙酮<稀氢氧化钠水溶液或氨水< 甲酰胺<二甲基甲酰胺<尿素水溶液 紫外 黄酮类型带II(弱峰) 带I(强峰) 取代) 黄酮醇(3-OH 游离) 250-280 358-385 异黄酮245-270 310-330肩峰 二氢黄酮/醇370-295 300-330 查耳酮220-270低强度340-390 氢谱: 黄酮或黄酮类H-3是一个尖锐的单峰出现在 6.3 处 邻位耦合:耦合常数为8Hz左右 间位耦合:2-3Hz 对位耦合:很弱,数值很小或没有 5,7-二OH黄酮δppm:H-6小于 H-8 . 7- OH 黄酮: δppm:H-6 > H-8 6’δ比较大,5’较小 同时还要看 单峰S,就没有邻,间位双锋d说明有邻位或间位 其中一个双双锋dd就说明有邻,和间两个 生物合成途径 经验异戊二烯法则:基本碳架均是由异戊二烯以 头-尾顺序或非头-尾顺序相连而成;生源异戊二 烯法则:甲戊二羟酸是各种萜类化合物生物合成 的关键前体 单萜:无环,单环,双环,三环,环烯醚。知道 卓酚酮,环烯醚萜,薄荷醇,青蒿素的二级结构 和性质 性质:萜类多具苦味,单萜及倍半萜可随水蒸气 蒸馏,其沸点随其结构中的C5单位数、双键数、 含氧基团数的升高而规律性升高 提取:挥发性萜可用水蒸气蒸馏法;一般萜可用 甲醇或乙醇提取;萜内酯可先用提取萜的方法提 取出总萜,然后利用内酯的特性,用碱水提取酸 化沉淀的方法纯化;萜苷多用甲醇、乙醇或水提 取 柱色谱:吸附剂多用硅胶。中性氧化铝。含双键 者可用硝酸银络合柱色谱分离(利用硝酸银可与 双键形成π络合物,而双键数目位置及立体构型 不同的萜在络合程度及络合稳定性方面有一定差 异)。洗脱剂多以石油醚、正己烷、环己烷分离 萜烯,或混以不同比例的乙酸乙酯分离含氧萜 鉴识:卓酚酮类的检识 (硫酸铜反应:绿色结 晶);环烯醚萜的检识(Weiggering法:蓝色/紫红 色;Shear反应:黄变棕变深绿);薁类的检识 (Ehrlich反应:蓝紫绿;对-二甲胺基苯甲醛) 挥发油 也称精油,是存在于植物体内的一类具有挥发 性、可随水蒸气蒸馏、与水不相容的油状液体。 分为:芳香族,萜类,脂肪族 检识:化学测定常数:酸值、酯值、皂化值 提取方法:①蒸馏法:提取挥发油最常用的方 法,对热不稳定的挥发油不能用。②溶剂萃取 法:脂溶性杂质较多。③吸收法:油脂吸收法, 用于提取贵重挥发油。④压榨法:该方法可保持 挥发油的原有新鲜香味,但可能溶出原料中的不 挥发性物质。⑤二氧化碳超临界流体萃取法:有 防止氧化热解及提高品质的突出优点,用于提取 芳香挥发油 三萜 醋酐-浓硫酸反应(Liebermann-Burchard) 红-紫-蓝-绿色-褪色(甾体皂苷) 黄-红-紫-蓝-褪色(三萜皂苷) 胆甾醇沉淀法:胆甾醇复合物——乙醚回流提 取,去除胆甾醇,得皂苷。因为甾体皂苷比三萜 皂苷形成的复合物稳定. 甾类 C21甾醇C2H5 昆虫变态激素8-10个碳的脂肪烃 强心苷不饱和内酯环 甾体母核的C-17位上均连一个不饱和内酯环。根 据内酯环的不同:五元不饱和内酯环叫甲型强心 苷元;六元不饱和内酯环叫乙型。 苷和糖连接的顺序分: I型强心苷:苷元-(2,6-二去氧糖)x-(D-葡萄

第十五章:蛋白质的生物合成.doc

第十五章蛋白质的生物合成 一:填空题 1.蛋白质的生物合成是以________________作为模板,________________作为运输氨基酸的工具, ________________作为合成的场所。 2.细胞内多肽链合成的方向是从________________端到________________端,而阅读mRNA的方向是从________________端到________________端。 3.核糖体上能够结合tRNA的部位有________________部位、________________部位和 ________________部位。 4.ORF是指________________,已发现最小的ORF只编码________________个氨基酸。 5.蛋白质的生物合成通常以________________作为起始密码子,有时也以________________作为起始密码子,以________________、________________和________________作为终止密码子。 6.SD序列是指原核细胞mRNA的5′-端富含________________碱基的序列,它可以和16SrRNA的3′-端的________________序列互补配对,而帮助起始密码子的识别。 7.含硒半胱氨酸的密码子是________________。 8.原核生物蛋白质合成的起始因子(IF)有________________种,延伸因子(EF)有________________种,终止释放因子(RF)有________________种;而真核生物细胞质蛋白质合成的延伸因子通常有 ________________种,真菌有________________种,终止释放因子有________________种。 9.密码子的第2个核苷酸如果是嘧啶核苷酸,那么该密码子所决定氨基酸通常是________________。 10.原核生物蛋白质合成中第一个被参入的氨基酸是________________。 11.真核生物细胞质蛋白质合成对起始密码子的识别主要通过________________机制进行。 12.无细胞翻译系统翻译出来的多肽链通常比在完整的细胞中翻译的产物要长,这是因为 ________________。 13.蛋白质的半寿期通常与________________端的氨基酸性质有关。 14.tmRNA是指________________。 15.同工受体tRNA是指________________。 16.疯牛病的致病因子是一种________________。 17.已发现体内大多数蛋白质正确的构象的形成需要________________的帮助,某些蛋白质的折叠还需要________________和________________酶的催化。 18.SRP是指________________,它是一种由________________和________________组成的超分子体系,它的功能是________________。 19.蛋白质定位于溶酶体的信号是________________。 20.分子伴侣通常具有________________酶的活性。 答案:1. 2 3 4

核酸生物合成

第十章核酸的生物合成 已知DNA是生物遗传的主要物质基础,是遗传信息的载体。但它是怎样把信息传递给子代并进行表达的?已证明DNA可进行自我复制,即在细胞分裂时,—个DNA分子可复制成两个与原来完全相同的DNA分子,并分配在两个分裂的子细胞中,这是把遗传信息传给子代的方式。在后代的生长发育过程中,遗传信息自DNA转录——即把其分子中某些片段的信息转抄在RNA分子中,此种RNA称为信使RNA (mRNA),它们再指导合成特异的蛋白质(翻译),并由这些蛋白质表现出生命活动的特征,执行各种生命功能。这种转录和翻译,即为遗传信息的表达过程。 第一节DNA的生物合成 DNA是由其组成单元脱氧核苷三磷酸聚合起来的生物大分子。活体内合成的新的DNA必须维持亲代细胞内原有的DNA分子结构,这样才得以保持遗传性状不变。现已知无论是高等生物或低等生物,体内DNA的合成都是以原有的DNA为模板“浇铸”而成,因此它们的结构和功能都能保持和亲本一模一样,所以DNA的合成也往往称为DNA复制。 —、DNA的复制方式 原核生物每个细胞只含有一个染色体;真核生物每个细胞则含有多个染色体。在细胞增殖周期的一定阶段,整个染色体组都将发生精确的复制,随后以染色体为单位把复制的基因组分配到两个子代细胞中去。染色体DNA的复制与细胞分裂之间存在密切的相互联系,一旦复制完成,即可发动细胞分裂;细胞分裂结束后,又可开始新的一轮DNA复制。 1. 半保留复制 DNA由互补的两条多核苷酸链组成。一条链上的核苷酸排列顺序决定了另一条链的核苷酸排列顺序。由此可见,DNA分子的每一条链都含有合成它互补链所必需的全部信息。1953年,Wotson和Crick在提出DNA双螺旋结构模型时即推测,DNA复制时两条互补链分开,然后在每条链上按碱基配对的方式合成新的互补链,以组成新的DNA分子。这样新形成的两DNA分子与原来的DNA分子的碱基顺序完全一样。每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的,这种复制方式称为半保留复制。 二、复制的起点和方向 DNA的复制开始于染色体上固定的起始点。超始点是含有100~200个碱基对的一段DNA。先是DNA 的两条链在起始点分开形成叉子样的“复制叉”,随着复制叉的移动完成DNA的复制过程。细胞内存在着能识别起始点的特种蛋白质。 DNA复制可以朝一个方向,也可以朝两个方向进行。 三、与DNA复制有关的酶和蛋白质 DNA的复制是一个十分复杂的过程,但能精确高速地进行,极少出现错误(错误机率10-8~10-9),这是许多酶和蛋白质共同作用的结果。 (一)DNA聚合酶 1.大肠杆菌DNA聚合酶 DNA复制过程中最基本的酶促反应是四种脱氧核苷酸的聚合反应。1956年Kornberg等首先从大肠杆菌提取液中分离出催化此反应的酶。他们将大肠杆菌提取液与32p标记α—磷酸根的四种脱氧核苷三磷酸(dA TP,dTTP,dGTP,dCTP)的混合物一同温育,发现32P掺入到延伸的DNA链的核苷酸残基之间的3',5'—磷酸二酯键中去。催化这个反应的酶称为DNA聚合酶,其后从不同的生物中都找到了这种酶。 2. 真核生物DNA聚合酶 在发现大肠杆菌DNA聚合酶后不久,从小牛胸腺中也分离到了DNA聚合酶。其后,曾对各种真核生物,包括动物、植物和微生物,广泛研究了它们细胞中的DNA聚合酶。现已知,在真核生物中存在四种

蛋白质的生物合成习题与参考答案

第十五章蛋白质生物合成 一、填空题: 1.三联体密码子共有 64 个,其中终止密码子共有 3 个,分别为 UAA 、 UAG 、 UGA 。2.密码子的基本特点有四个分别为从5′→3′无间断性、简并性、变偶性、通用性。3.次黄嘌呤具有广泛的配对能力,它可与 U 、 C 、 A 三个碱基配对,因此当它出现在反密码子中时,会使反密码子具有最大限度的阅读能力。 4.原核生物核糖体为 70 S,其中大亚基为 50 S,小亚基为 30 S;而真核生物核糖体为 80 S,大亚基为 60 S,小亚基为 40 S。 5.原核起始tRNA,可表示为 tRNA f甲硫,而起始氨酰tRNA表示为f Met-tRNA f甲硫;真核生物起始tRNA可表示为 tRNA I甲硫,而起始氨酰-tRNA表示为 Met-tRNA f甲硫。 6.肽链延伸过程需要进位、转肽、移位三步循环往复,每循环一次肽链延长 1 个氨基酸残基,原核生物中循环的第一步需要 EF-Tu 和 EF-Ts 延伸因子;第三步需要 EF-G 延伸因子。 7.原核生物mRNA分子中在距起始密码子上游约10个核苷酸的地方往往有一段富含嘌呤碱基的序列称为Shine-Dalgrano序列,它可与16S-rRNA 3′-端核苷酸序列互补。 8.氨酰-tRNA的结构通式可表示为: O tRNA-O-C-R NH2, 与氨基酸键联的核苷酸是 A(腺嘌呤核苷酸)。 9.氨酰-tRNA合成酶对氨基酸和相应tRNA都具有较高专一性,此酶促反应过程中由 ATP 水解提供能量。 10.肽链合成的终止阶段, RF1因子和 RF2因子能识别终止密码子,以终止肽链延伸,而 RF3因子虽不能识别任何终止密码子,但能协助肽链释放。 11.蛋白质合成后加工常见的方式有磷酸化、糖基化、脱甲基化、信号肽切除。12.真核生物细胞合成多肽的起始氨基酸为甲硫氨酸,起始tRNA为 tRNA I甲硫,此tRNA 分子中不含 T C 序列。这是tRNA家庭中十分特殊的。 二、选择题(只有一个最佳答案): 1.下列有关mRAN的论述,正确的一项是( C ) A、mRNA是基因表达的最终产物 B、mRNA遗传密码的阅读方向是3′→5′ C、mRNA遗传密码的阅读方向是5′→3′ D、mRNA密码子与tRNA反密码子通过A-T,G-C配对结合 E、每分子mRNA有3个终止密码子 2.下列反密码子中能与密码子UAC配对的是( D ) A、AUG B、AUI C、ACU D、GUA 3.下列密码子中,终止密码子是( B ) A、UUA B、UGA C、UGU D、UAU

乳酸菌胞外多糖的生物合成及其遗传调控

乳酸菌胞外多糖的生物合成及其遗传调控 * 姚晶1,任婧2,吴正钧2,王荫榆2,郭本恒 1,2 1(上海海洋大学食品学院,上海, 201306)2(乳业生物技术国家重点实验室光明乳业股份有限公司技术中心,上海, 200436)摘 要 作为食品级的乳酸菌分泌的胞外多糖,由于其具有很多优良的功能特性,成为了近年来的研究热点。 胞外多糖产量偏低限制了其工业化应用,因此从基因水平上探索增加乳酸菌胞外多糖产量的途径是大有裨益的。文中详细阐述了胞外多糖的分类、结构,同型多糖和异性多糖生物合成过程及其差异,以及在合成过程中的遗传调控,并介绍了一些增加产量的有效调控手段,为深入的研究提供理论参考。关键词 乳酸菌,胞外多糖,生物合成,遗传调控 第一作者:硕士研究生(郭本恒教授为通讯作者,E-mail :guo-benheng@https://www.360docs.net/doc/8e3877432.html, )。 *“十一五”国家科技支撑计划(2006BAD04A14, 2006BAD04A06)。收稿日期:2010-08-13,改回日期:2010-12-17 胞外多糖(Exopolysaccharide , EPS )是一种微生物在生长过程中分泌到细胞外的长链多糖。以荚膜的形式附着在细胞表面的胞外多糖称为荚膜多糖(capsular polysaccharides ,CPS ),以黏液的形式分散在胞外环境中的胞外多糖称为游离多糖(或黏液多 糖)。很多微生物都能分泌EPS , 尤其是乳酸菌(Lac-tic acid bacteria ,LAB )。LAB 是公认安全(generally recognized as safe , GRAS )的食品级微生物,EPS 作为LAB 重要的次生代谢产物,具有很高的研究和利用价值。20世纪40年代开发出的由肠膜明串珠菌 (L .mesenteroides )产生的右旋糖酐(dextrans )是最早被开发利用的乳酸菌胞外多糖,也是食品和药品管理 局(Food and Drug Administration , FDA )批准的第一种食品级微生物胞外多糖。至今,人们已经筛选出了多 株产EPS 的LAB 。不同LAB 菌株EPS 的合成量是不同的, 而EPS 合成量的高低决定其发酵菌株是否适用于工业化生产。目前,对于培养基、培养条件、生长因子等外部因素影响EPS 合成量的报道已经很多,而从LAB 的遗传和生理角度对其EPS 合成量影响的报道甚是少见。深入理解和研究LAB 基因簇对EPS 的合成调控,可以从基因水平促进EPS 合成量的增加,从而实现EPS 的工业化生产。本文系统阐述了LAB EPS 相关的生物合成途径、遗传调控体系以及一些有效的调控手段。 1 产EPS 的LAB 菌株及其分类 1.1 产EPS 的菌株 产EPS 的LAB 来源广泛,绝大部分来源于乳制 品,如[1] 酸奶、Kefir 制品、奶酪等,还有一些来源于发 酵肉制品和蔬菜等。目前已经报道的产EPS 的LAB 有 [2] :嗜热链球菌(S .thermophilus )、嗜酸乳杆菌(Lb .acidophilus )、干酪乳杆菌(L .casei )、德氏乳杆菌 保加利亚亚种(Lb .delbruec kii ssp.bulgaricus )、瑞士乳杆菌(Lb .helveticus )、乳酸乳球菌乳脂亚种 (Lc .lactis ssp.cremoris )、乳酸乳球菌(Lc .lactis )、植物乳杆菌(L .plantarum )、肠膜明串珠菌(Leuc .mesenteroides )、酒样乳杆菌(L .kefiranofaciens )等等。其中研究较多的是 [3] :嗜热链球菌筛选菌株 S .thermophilus EU20,NCFB2393,IMDO 01,SFi6,SFi39和Sfi12等;保加利亚乳杆菌(Lb .bulganicus )筛 选菌株L .bulganicus CNRZ 397, CNRZ 1187,CNRZ 416, Lb1,LY03等;乳酸乳球菌乳脂亚种筛选菌株L .lactis subsp.cremoris NIZO B35,NIZO B40,AHR 53等。 1.2EPS 的种类及其结构 根据所在位置的不同,可以分为荚膜多糖和黏液多糖。荚膜多糖又可以分为:(1)大荚膜,简称荚膜,可在光学显微镜下看到,最低厚度为0.25μm ,具有 相当大的外部表面积;(2)微荚膜, 厚度在0.2μm 以下,光学显微镜看不到,可用免疫学方法检验;(3)粘液层堆积在细胞表面,其多糖成分常渗入培养基中。粘液多糖可以进入培养基形成黏液 [4] 。 根据合成位点和模式的不同, LAB EPS 又可以分为同型多糖(homopolysaccharides , HoPS )和异型多糖

生物化学习题-蛋白质的生物合成

第十二章蛋白质的生物合成 一、知识要点 (一)蛋白质生物合成体系的重要组分 蛋白质生物合成体系的重要组分主要包括mRNA 、tRNA 、rRNA、有关的酶以及几十种蛋白质因子。其中,mRNA是蛋白质生物合成的直接模板。tRNA的作用体现在三个方面:3ˊCCA接受氨基酸;反密码子识别mRNA链上的密码子;连接多肽链和核糖体。rRNA和几十种蛋白质组成合成蛋白质的场所——核糖体。 遗传密码的特点:无标点性、无重叠性;通用性和例外;简并性;变偶性。 (二)蛋白质白质生物合成的过程 蛋白质生物合成的过程分四个步骤:氨基酸活化、肽链合成的起始、延伸、终止和释放。 其中,氨基酸活化即氨酰tRNA的合成,反应由特异的氨酰tRNA合成酶催化,在胞液中进行。氨酰tRNA合成酶既能识别特异的氨基酸,又能辩认携带该氨酰基的一组同功受体tRNA分子。 肽链合成的起始对于大肠杆菌等原核细胞来说,是70S起始复合物的形成。它需要核糖体30S和50S亚基、带有起始密码子AUG的mRNA、fMet-tRNA f 、起始因子IF1、IF2、IF3(分子量分别为10 000、80 000和21 000的蛋白质)以及GTP和Mg2+的参加。 肽链合成的延伸需要70S起始复合物、氨酰-tRNA、三种延伸因子:一种是热不稳定的EF-Tu,另一种是热稳定的EF-Ts,第三种是依赖GTP的EF-G以及GTP和Mg2+。 肽链合成的终止和释放需要三个终止因子RF1、RF2、RF3蛋白的参与。 比较真核细胞蛋白质生物合成与原核细胞的不同。 (三)蛋白质合成后的修饰 蛋白质合成后的几种修饰方式:氨基末端的甲酰甲硫氨酸的切除、肽链的折叠、氨基酸残基的修饰、切去一段肽链。 二、习题 (一)(一)名词解释 1.密码子(codon) 2.反义密码子(synonymous codon) 3.反密码子(anticodon) 4.变偶假说(wobble hypothesis) 5.移码突变(frameshift mutant) 6.氨基酸同功受体(isoacceptor) 7.反义RNA(antisense RNA) 8.信号肽(signal peptide) 9.简并密码(degenerate code) 10.核糖体(ribosome) 11.多核糖体(poly some) 12.氨酰基部位(aminoacyl site) 13.肽酰基部位(peptidy site) 14.肽基转移酶(peptidyl transferase) 15.氨酰- tRNA合成酶(amino acy-tRNA synthetase) 16.蛋白质折叠(protein folding) 17.核蛋白体循环(polyribosome) 18.锌指(zine finger) 19.亮氨酸拉链(leucine zipper) 20.顺式作用元件(cis-acting element) 21.反式作用因子(trans-acting factor)

鼠李糖脂资料

表面活性剂综述 皂素(saponin) 烷基多苷(Alkyl polyglucosides) 表面活性剂: 表面活性剂是一类集亲水基和憎水基于一体,可显著降低溶剂的表面张力或液一液界面张力的一类化合物。其分子结构一般包括长链疏水基团和亲水性离子基团或极性基团两个部分。通常,表面活性剂分子的两个部分的基团是不对称的。此种结构上的两亲特点,决定了表面活性剂的许多物理化学性质,是产生表面活性的内在原因。 不仅具有很高的活性,即在水中加入很少量就能使水的表面张力大幅度地降低,而且还具有独特的渗透;润湿和反润湿(防水、防油);乳化和破乳:发泡和消泡;洗涤、分散与絮凝,抗静电,润滑和加溶等应用性能。从广义上讲,可将表面活性剂称为这样一类物质即在加入很少量时就能明显改变体系的界面性质和状态的物质。 表面活性剂的化学结构特点: 表面活性剂是由性质不同的两部份组成。一部份是由疏水亲油的碳氢链组成的非极性基团,另一部份为亲水疏油的极性基。这两部份分别处于表面活性剂分子的两端,为不对称结构。因此表面活性剂分子结构的特性是一种既亲油又亲水的两亲分子。它不仅能防止油水相排斥,而且具有把两相连接起来的功能。 表面活性剂的分类:

按表面活性剂有水溶液中能否解离,分为离子型与非离子型表面活性剂。而离子型表面活性剂又按产生电荷的性质分为阴离子、阳离子型和两性离子型; 按表面活性剂在水和油中的溶解性可分为水溶性和油溶性表面活性剂;前者占多数,但后者日益重要,只是其品种不多。 按分子量分类,可将分子量大于104者称为高分子表面活性剂,在103一104称为中分子量表面活性剂及分子量大于102一103者称为低分子量表面活性剂。 还有按表面活性剂的功能来进行分类的。有表面张力降低剂、渗透剂、润湿剂、乳化剂、增溶剂、消泡剂等。 表面活性剂的性质: 表面活性剂的两亲特性使其能定向地吸附于两相界面上,亲水基一端朝向水相,疏水基一端朝向油相,从而降低了水溶液的表面张力或油水界面张力。表面活性剂在界面上吸附越多,界面张力降低得越多。表面活性剂在溶液表面的吸附量随溶液浓度增大而增多,当表面活性剂浓度达到或超过某一数值后,表面吸附量不再增加。此时溶液中的表面活性剂分子会从单体缔合为胶态聚集物,即形成胶束。胶束内部是由表面活性剂憎水基形成的疏水性内核;胶束外部是由亲水基组成的外壳。表面活性剂在溶液中形成胶束时的浓度称为临界胶束浓度(Critical micellar concenrtation,CMC)。CMC可作为表面活性剂的表面活性的一个量度。CMC越小,则表示此种表面活性剂形成胶团所需浓度越低,因而,改变表/界面性质,起到乳化、增溶等作用所需的浓度也就越低。表面活性剂在固一液界面上的吸附作用,如土壤一水或故态有机物一水界面,同样可降低固一液界面张力,促进有机污染物分子脱离固体表面。 当表面活性剂达到一定浓度后,活性剂分子形成球状、层状或棒状的聚集体,它们的亲油基团彼此靠在一起,而亲水基团向外伸向水相,这样的聚集体叫做胶束。能够形成胶束的最低表面活性剂浓度叫做临界胶束浓度,简称cMc。 表面活性剂的水溶液当表面活性剂浓度超过临界胶束浓度(CMC)时,能使不溶或微溶于水的有机化合物的溶解度显著提高的现象称之为表面活性剂的增溶作用。 水溶液中表面活性剂的存在能使不溶或微溶于水的有机化合物的溶解度显著增加,此即表面活性剂的增溶作用。 增溶作用为一胶团现象,与表面活性剂在溶液中形成胶团有密切关系。胶束具有疏水性的微环境,对有机物的增溶作用显著,可大大提高憎水性有机物在水相的表观溶解度。表面活性剂的增溶作用与表面活性剂的结构、被增溶物的结构密切相关。另外,溶液中所存在的有机添加物和无机盐以及温度等环境因素也会对增溶作用具有明显影响。表面活性剂对难溶性有机污染物的增溶作用受表面活性剂的种类和浓度、胶束的结构、有机物的性质、表面活性剂的HLB值、无机电解质、环境温度、共存有机物等因素的影响。 增溶作用的特点: 1)只有在表面活性剂浓度高于CMC时增溶作用才明显表现出来,也就是微溶物溶解度的增加是由于胶团的形成,表面活性剂浓度越大(>CMC),胶团形成的越多,微溶物也就溶解得越多。 2)增溶作用不同于水溶助长作用。水溶助长作用是使用混合溶剂来增大溶解度,以苯为例,大量乙醇(或乙酸)的加入会使苯在水中的溶解度大大增加,这称之为水溶助长作用。其原因在于:相当大量的乙醇(或乙酸)的加入大大改变了溶剂的性质,而在增溶作用中,表面活性剂的用量相当少,溶剂性质也无明显变化。

核酸的生物合成

(二)填空题 1.DNA复制是定点双向进行的,股的合成是,并且合成方向和复制叉移动方向相同;股的合成是的,合成方向与复制叉移动的方向相反。每个冈崎片段是借助于连在它的末端上的一小段而合成的;所有冈崎片段链的增长都是按方向进行。2.DNA连接酶催化的连接反应需要能量,大肠杆菌由供能,动物细胞由供能。 3.大肠杆菌RNA聚合酶全酶由组成;核心酶的组成是。参与识别起始信号的是因子。 4.基因有两条链,作为模板指导转录的那条链称链。 5.以RNA为模板合成DNA称,由酶催化。 6.DNA或UpGpCpA分别经0.3NKOHR、NaseT1和牛胰RNaseI处理所得结果: DNA: 0.3NKOH:;RNaseT1:;RNase I: ; UpGpCpA:0.3NKOH:;RNaseT1:;RNase I :。 7.基因突变形式分为:,,和四类。 8.亚硝酸是一个非常有效的诱变剂,因为它可直接作用于DNA,使碱基中基氧化成基,造成碱基对的。 9.所有冈崎片段的延伸都是按方向进行的。 10.前导链的合成是的,其合成方向与复制叉移动方向;随后链的合成是的,其合成方向与复制叉移动方向。 11.引物酶与转录中的RNA聚合酶之间的差别在于它对不敏感,并可以作为底物。12.DNA聚合酶I的催化功能有、、、和。 13.DNA回旋酶又叫,它的功能是。 14.细菌的环状DNA通常在一个开始复制,而真核生物染色体中的线形DNA可以在起始复制。 15.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ的活性使之具有功能,极大地提高了DNA复制的保真度。16.大肠杆菌中已发现种DNA聚合酶,其中负责DNA复制,负责DNA损伤修复。17.DNA切除修复需要的酶有、、和。 18.在DNA复制中,可防止单链模板重新缔合和核酸酶的攻击。 19.DNA合成时,先由引物酶合成,再由在其3′ 端合成DNA链,然后由切除引物并填补空隙,最后由连接成完整的链。 20.原核细胞中各种RNA是催化生成的,而真核细胞核基因的转录分别由种RNA聚合酶催化,其中rRNA基因由转录,hnRNA基因由转录,各类小分子量RAN则是的产物。 21.一个转录单位一般应包括序列、序列和顺序。 22.真核细胞中编码蛋白质的基因多为。编码的序列还保留在成熟mRNA中的是,编码的序列在前体分子转录后加工中被切除的是。在基因中被

结冷胶生物合成机理研究进展_百替生物

结冷胶生物合成机理研究进展 中国生物工程杂志China Biotechnology,2005,25(11):62~65 王霞袁永黎盛基许平* (山东大学微生物技术国家重点实验室济南250100) 摘要结冷胶是少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis)产生的一种新型微生物多糖,其独特的流变特性使结冷胶具有广泛的工业用途。虽然在结冷胶的理化特性方面的研究比较详尽,但是对结冷胶的发酵生产及其生物合成机制还缺乏深入了解。主要关注最近在结冷胶生物合成途径分子生物学方面的研究,用于编码结冷胶生物合成所需蛋白质的基因主要有三类:与糖核苷酸合成有关的基因、与四碳重复单元合成有关的基因及与长链聚合和多糖分泌有关的基因。基因工程是结冷胶分子改造和产量增加最具前景的方法。 关键词少动鞘氨醇单胞菌结冷胶合成途径基因工程 收稿日期:2005 04 21修回日期:2005 06 20 *通讯作者,电子信箱:pingxu@https://www.360docs.net/doc/8e3877432.html,结冷胶是由好氧的革兰氏阴性杆菌——少动鞘氨醇单胞菌Sphingomonas paucimobilis ATCC31461发酵产生的,葡萄糖转化率为50%[1]。这与黄原胶相比,结冷胶低产率、低转化率是限制其大规模产业化的主要障碍。低产率、低转化率的影响因素除了环境因素(如营养物、温度、溶氧及反应器等)外,更重要的是对结冷胶的合成途径缺乏深入了解。因此,对结冷胶生物合成机理进行分子水平上的研究对提高结冷胶产量和转化率及拓宽结冷胶应用具有重要意义。 1结冷胶的组成和结构特征结冷胶是相对分子量高达100万的阴离子型线性多糖,具有平行的双螺旋结构,其结构如图1所示[2]。 图1天然结冷胶的化学结构重复单元 Fig.1Repeating unit of proposed chemical structure of crude gellan 结冷胶主链结构是葡萄糖、葡萄糖醛酸、鼠李糖以2∶1∶1摩尔比聚合而成的四碳重复单元的长链分子,主链上重复的四碳糖单元均为: 3) β D Glc (1 4) β D GlcA (1 4) β D Glc (1 4) α L Rha(1 。天然结冷胶与低乙酰基结冷胶在结构上的不同点在于:前者在每个以β 1,3键连接的葡萄糖分子C2处被L 甘油酸酯化,C6处被乙酸酯化,据Videira等[3]研究,ces10基因编码的蛋白质负责乙酸和甘油酸的连接。 结冷胶的功能特性是由它非常微妙的结构特征决定的,与流变学研究相联系的结构分析表明,结构不同的结冷胶流变学性质变化很大[4]。显微镜观察结冷胶,发现它是由多股链形成的小圈状结构[5]。这种结构(在其它微生物胞外多糖,如黄原胶、硬葡聚糖,普遍存在)导致形成一张大的分子网截留水分子而产生凝胶现象。此外,在一价或二价阳离子存在的情况下,该区域明显增多,并使它们更具耐热性,从而提高结冷胶潜在的胶化能力及结冷胶溶液的粘度[6]。 2结冷胶生物合成中有关的酶和基因少动鞘氨醇单胞菌S.paucimobilis ATCC31461胞外多糖的生物合成涉及大量基因产物的一致作用,因此十分复杂。构建结冷胶主要结构的糖核苷酸有UDP 葡萄糖、UDP 葡萄糖酸和dTDP 鼠李糖。用于编码结冷胶生物合成所需蛋白质基因包括3类:与糖核苷酸合成有关的基因、与四碳重复单元合成有关的基因及与长链聚合和多糖分泌有关的基因[7,8]。多糖sphingan S-88与结冷胶有相同的主链结构,其合成基因簇(sps基因簇)已经被完全测序[9]。最近,Videira等[10]对结冷胶合成基因簇(gel基因簇)进行了研究,结冷胶基因簇中已经被识别的结构和序列与已经测序的多糖sphingan S 88合成基因簇(sps基因簇)十分相似,且相对应的基因也有很高的同源性(图2),这为gel基因簇的研究提供了方便。

核酸的生物合成习题

一、是非题 1.滚筒式复制是环状DNA,一种特殊的单向复制方式。 2.所有核酸的复制过程中,新链的形成都必须遵循碱基配对的原则。 3.双链DNA经过一次复制形成的子DNA分子中,有些不含亲代核苷酸链。 4.原核细胞的每一个染色体只有一个复制起点,而真核细胞的每一个染色体就有许多个复制起点。 5.在细胞中,DNA链延长的速度随细胞的培养条件而改变。 6.在细胞生长周期的G1期是双倍体,而在G2期是三倍体。 7.所有核酸合成时,新链的延长方向都是从5′→3′。 8.抑制RNA合成酶的抑制剂不影响DNA的合成。 9.在E.coli细胞和真核细胞中都是由DNA聚合酶Ⅰ切除RNA引物。 10.缺失DNA聚合酶Ⅱ的E.coli突变株,可以正常地进行染色体复制和DNA修复合成; 11.在真核细胞中,三种主要RNA的合成都是由一种RNA聚合酶催化。 12.真核细胞中mRNA 5′端都有一个长约200核苷酸组成的PolyA结构。 13.真核细胞中mRNA的前体为hnmRNA。 14.无论是在原核或真核细胞中,大多数mRNA都是多顺反子的转录产物。 15.一段人工合成的多聚尿苷酸可自发形成双螺旋。 二、填空题 1.mRNA前体的加工一般要经过、在5′端和在3′端三个步骤。2.识别同一断裂序列的限制性内切酶称为、识别相似断裂序列并产生能通过碱基互补相互缔合粘性末端的限制性内切酶称为。 3.逆转录酶是催化以为模板,合成的一类酶,产物是。4.欲标记DNA双链5′端,需要酶催化,利用作底物。5.通过与DNA分子中G-C顺序结合,阻止RNA聚合酶催化的RNA链延伸的抗生素是。 6.核糖体的亚基上含有与mRNA结合的位点。 7.RNA聚合酶复合物中的。因子具有作用。 8.DNA双链中编码链的一段核着酸顺序是pCpTpGpGpApC,转录的mRNA顺序应该是。 9.每个冈崎片段是借助连在它端的一小段引物,每个冈崎片段的增长都是由端向端延伸。 10.寡聚核苷酸片段UpGpCpApUpGpCp经0.3摩尔的KOH水解产物是,经RnaseT1作用产物是,经RNase A 产物是。 11.DNA复制时,前导链的合成是的,复制方向与复制叉移动的方向,后随链的合成是的,复制方向与复制叉移动的方向。 12.在真核细胞的DNA切除修复过程中,受损伤的碱基可由和切除,并由和共同作用将缺失的碱基补上。 13.在实验室使用的大多数诱变剂都是属于诱变,而大多数致癌物质都是属于诱变。 14.14.在线粒体中的环状基因组是通过合成方式复制。滚筒式复制的特点是由。 15.DNA复制和RNA的合成都需要酶,在DNA复制中该酶的作用

蛋白质生物合成考题

第十四章蛋白质的生物合成 一、单项选择题 1、原核生物中起始氨基酰-tRNA是 A.fMet-tRNA fMet B.Met-tRNA Met C. Arg-tRNA Arg D.leu- tRNA leu E.Asn--tRNA Asn 2、与mRNA上5′-ACG-3′密码子相应的tRNA反密码子(5′→3′)是 A.CGA B.IGC C.CIG D.CGI E.GGC 3、tRNA分子具有下列结构特征 A.密码环 B.有5'端-C-C-AOH末端 C.有反密码环和5'端-C-C-AOH末端 D.有多聚A尾 E. 3'端有C-C-AOH末端,另一侧有反密码环 4、在蛋白质生物合成中催化氨基酸之间形成肽键的酶是 A.氨基酸合成酶 B.羧基肽酶 C.转肽酶 D.氨基肽酶 E.氨基酸连接酶 5、原核生物翻译起始复合物有下列组分 A. DNA模板+RNA+RNA聚合酶 B. 翻译起始因子+核糖体 C. 核糖体+fMet-tRNA fMet+mRNA D. 核糖体+起始-tRNA E.氨基酰-tRNA合成酶 6、催化氨基酸活化的酶是 A.氨基酸- tRNA 转移酶 B.氨基酰- tRNA 合成酶 C.氨基肽酶 D.氨基酸转移酶 E.羧基肽酶 7、蛋白质生物合成的终止信号由下列哪种因子识别? A. σ B. RF C. EF D. IF E. ρ 8、通过结合细菌的核糖体大亚基而杀灭或抑制细菌的抗生素是 A.四环素 B.氯霉素 C.链霉素 D.嘌呤霉素 E.放线菌酮 9、翻译延长阶段所需的酶是 A. 转肽酶 B. 磷酸化酶 C. 肽链聚合酶 D. 氨基酰-tRNA合成酶 E.氨基肽酶 10、肽链延长时接受氨基酰-tRNA的部位是 A.小亚基 B.大亚基 C.A位 D.P位 E.肽位 11、氨基酸是通过那种化学键与tRNA 结合的 A. 肽键 B.磷酸酯键 C.酐键 D.酯键 E.氢键 12、在mRNA分子的5'端,下列密码子具有起始信号作用 A. UAA B. UAG C. UGA D.GUA E.AUG

两类糖苷类化合物和两类杂环化合物的设计、合成及其生物活性研究

两类糖苷类化合物和两类杂环化合物的设计、合成及其生物活性 研究 当前,为寻找新的活性分子,通常都是采用合成化合物库的方法对一类分子进行生物活性的研究。这样不但可以对分子的各种生物活性进行广泛的研究,更可以依据大量的测试数据确定一定的构效关系,也就为新药物的研究开发奠定了基础。 一、抑制高致病禽流感病毒H5N1进入宿主的皂苷的合成及构效关系研究皂苷是一类具有多种药效活性的三萜及甾体的糖缀合物,不仅显示了广谱的抗肿瘤作用而且对多种病毒都具有显著的抑制作用。本论文以首次发现的作用于H5N1高致病禽流感病毒的血凝素蛋白的小分子活性抑制剂——chlorogenin 3-O-β-chacotrioside YC-72 and chlorogenin 6-α-O-actyl-3-O-β-chacotrioside GC-29。 为研究该系列化合物的构效关系以便于开发活性更高的H5N1小分子活性抑制剂,我们以化合物YC-72为先导化合物设计合成了8个结构类似物来研究其甾体母核和糖链对活性的影响。研究发现马铃薯三糖熊果酸甲酯衍生物5具有同化合物YC-72相似的抗病毒活性。 初步构效关系研究表明:苷元的多稠环结构是活性必需的;马铃薯三糖片段在皂苷抗禽流感病毒中扮演着重要角色,简化为二糖后活性消失。二、抗肿瘤蒽环鼠李糖苷的合成及构效关系研究大黄素对多种肿瘤细胞株显示了一定的抑制作用,由于其与DNA的结合能力不强造成了其抗肿瘤作用较弱,而天然存在的大黄素β糖苷显示了很强的细胞毒活性。 本文设计合成了三个系列的蒽环鼠李糖糖苷化合物包括大黄素鼠李糖糖苷、

蒽酮鼠李糖糖苷和杂原子蒽酮鼠李糖糖苷,并进行了相关的生物活性测试,初步阐明了其构效关系。为有效地降低蒽酮鼠李糖糖苷的心脏毒性,设计合成了系列在其C-10亚甲基引入Ac的衍生物。 活性测试表明C-10亚甲基引入Ac不仅可以提高化合物的细胞毒活性而且可以降低其毒性。此外,本论文应用生物电子等排体原理设计合成了三个不同系列的杂原子蒽酮鼠李糖糖苷化合物,并进行了相关的生物活性测试,初步阐明了其构效关系,发现了一个具有新型的结构骨架的抗肿瘤先导化合物2-[4-O-(2’,3’-Di-O-acetyl-α -L-rhamnopyranosyl)-8-methyl-2H-chromeno[4,3,2-c,d]indazol-2-yl]-1-N, N-diethylethanamine (119)。 采用荧光滴定法测试了所合成的蒽环鼠李糖糖苷类似物与CT-DNA的结合能力。实验结果显示所合成的蒽环鼠李糖糖苷化合物与DNA的作用存在插入结合模式,即化合物插入DNA双链中,与碱基结合,从而可能阻止DNA的进一步复制。 这为从分子水平上研究治疗癌症等疾病的新型药物提供了一定的实验依据。 三、选择性PDE4抑制剂的设计、合成及构效关系研究选择性PDE4抑制剂是一类治疗慢性阻塞性肺病(COPD)的有效药物,但用于临床的现有的选择性PDE4抑制剂大都有致呕吐等副作用。 本文通过计算机辅助设计了解了PDE4结合腔的特征和活性位点的结合方式,明确了了选择性PDE4抑制剂的药效团特征,建立了PDE4抑制剂的药效团模型。分别设计合成了以四氢异喹啉和氨基苯酞为骨架的两类小分子杂环化合物,并对部分四氢异喹啉衍生物测试了其相关的生物活性,初步确定了其构效关系,发现了两个对PDE4有较好抑制活性的先导化合物

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