转录过程模板和酶

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第一节模板和酶

概述

1、转录的概念——生物体以DNA为模板,以NTP为原料,在RNA聚合酶的催化下,合成RNA的过程,称为转录。即把DNA的碱基序列抄录成RNA的碱基序列。转录是基因表达的核心步骤。

2、转录的产物

转录的产物包括:mRNA; tRNA; rRNA等。mRNA把遗传信息从染色体内贮存的状态转送至胞质,作为蛋白质合成的直接模板, tRNA;rRNA不用作翻译的模板,但参与蛋白质的生物合成。

,比较如下:

3、转录与复制的异同

转录与复制都是酶促的核苷酸聚合过程,有许多相似之处,也有许多不同的地方。

相同:①模板:DNA;②原料:三磷酸核苷酸;③遵守碱基配对规律;④模板阅读方向:3′→5′;新链合成方向:5′→3′;⑤酶:依赖DNA的聚合酶;⑥产物:

多核苷酸链

不同:复制转录

模板 DNA双链 DNA模板链

原料 dNTP NTP

配对A→T,G→C A→U,T→A,G→C

酶 DDDP 、解螺旋酶、引物酶 DDRP

拓扑酶、连接酶

产物子代DNA(半保留) RNA(mRNA、tRNA、rRNA等)

引物 + —

第一节模板和酶

转录需要的原料是转录模板和聚合酶。转录时,DNA双链中一股单链用作模板链(template strand ),按碱基配对规律指引核苷酸的聚合,催化聚合的酶是依赖DNA的RNA 聚合酶(DNA dependent RNA polymerase, RNA-pol。)转录是有选择性的,能转录出RNA 的DNA区段,称为结构基因。

一、转录模板

即为DNA的一股链。

1、模板链

定义:转录时,DNA双链中能作为模板转录生成RNA的那一股链,称为模板链,也称有意义链或Waston链。

2、编码链

定义:与模板链相对的另一股单链称编码链,也称反义链或Crick链。

模板链既与编码链互补,又与mRNA互补,可见mRNA的碱基序列除用U代替T外,与编码链是一致的。如下图:

3、不对称转录——在转录过程中DNA双链中仅有一股链的某个区段可作为模板指导RNA 合成;不同的基因其转录时的模板链可能不同,转录的这种选择性,称为不对称转录。这是转录的特点。

不对称转录的含义:

1、DNA分子上一股可转录,另一股不转录。

2、模板链并非永远在同一单链上。

[图示]

4、结构基因

定义:DNA分子中能转录出 mRNA,然后指导蛋白质合成的部分称之。有的基因可能转录出rRNA、tRNA,也属结构基因。换句话说,凡是能转录出RNA的DNA区段,均称为结构基因。其余部分则不是。

二、RNA聚合酶(转录酶 transcriptase, RNA-pol)

(一)原核生物的RNA聚合酶

RNA聚合酶也称转录酶(transcriptase) ,全称依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP)。目前研究

比较透彻的是E.coli的RNA聚合酶。其它原核生物的RNA聚合酶在结构、组成、功能上都与E.coli的RNA聚合酶相似。

组成:全酶由5个亚基组成:即α2ββ′б,其中б亚基易脱落。既辩认转录起始点,又有催化聚合功能,参与转录起始。

核心酶由α2ββ′亚基组成,具有催化聚合功能,不能辩认起始点,但参与转录的延长。

各亚基的功能:

α亚基——决定哪些基因被转录

β亚基——与转录全过程有关 (催化)

β′亚基——结合DNA模板(开链)

б亚基——辩认起始点。

原核生物的σ、β亚基

1、原核生物的σ亚基已发现多种,典型者为σ70

2、参与热休克(应激 heat shock)应答反应必需的σ32因子:辨认与典型的-35和-10序列完全不同的启动子序列,以控制一套热休克基因的表达。

3、原核生物的RNA聚合酶,都受利福平或利福霉素的抑制,它专一性地结合RNA聚合酶的β亚基,在转录开始后才加入利福平,仍能发挥其抑制转录的作用,这就说明β亚基是在转录全过程都起作用的。

(二)真核生物的RNA聚合酶

已发现三种RNA聚合酶分别称为RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,专一性地转录不同的基因,生成不同的产物。鹅膏蕈碱是真核生物RNA聚合酶的特异性抑制剂,但敏感性不同。由于hnRNA为mRNA前体,而mRNA在各种RNA中寿命最短,最不稳定,需经常合成,故酶II被认为是最重要的酶。

三、模板与酶的辩认结合

转录开始时需要模板与酶的辨认,有特别的辨认“信号”。

操纵子(operon):原核生物的转录单位定义。

启动子:

为DNA链上一段能被RNA聚合酶识别、结合并启动转录的区域,又称转录起始区。

特点:启动区长约40~ 60bp;富含A,T;位于结构基因上游(3′端)。

结构:启动区多为40~60bp的片段,包括三个部分

1、识别区(辨别区):与起始点的辨认有关,由全酶б因子辨认,位于-35bp左右,多具有5′-TTGACA-的序列。又称—35区。

2、结合区:为RNA聚合酶紧密结合区,结合后使DNA解链,位于-10bp左右,具有5′-TA TAA TPu的序列,称为Pribnow-box。或称—10区。

3、转录起始位点:由全酶催化两个核苷酸生成第一个磷酸二酯键。

[真核细胞的启动区在—30区,又称TA TAbox或Hogness box。]

[图示]

第二节转录过程

转录也跟复制一样,分起始、延长、终止三个阶段。首先看原核生物的转录。

一、原核生物的转录过程

(一)原核生物的转录起始

1、转录的起始就是生成一个转录起始复合物

由RNA-pol(α2、β、β’σ)-DNA-pppGpN-OH 3 组成。

RNA聚合酶全酶辨认、结合到模板的启动区,靠σ因子辨认转录起点,使DNA解开成单链,形成复制叉,需诸多因子和酶的辅助。转录复合物即为RNA聚合酶的核心酶、DNA模板和转录产物RNA三者结合在一起的复合体。

2、解开DNA双链,形成“转录空泡”。

解链的范围不大(10—20bp)——形成转录空泡。

[图示]

3、起动复合物形成,转录开始:

不需引物,RNA聚合酶在起始部位催化两个核苷酸形成磷酸二酯键。第一个核苷酸常为GTP,GTP与随后的NTP生成PPPGPN′-OH,仍保留三磷酸鸟苷状态。因此常把[RNA聚合酶全酶-DNA-pppGpN′-OH]称为转录的起始复合物。

4、б因子从全酶脱落,可重复利用。

(二)、转录的延长

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