第三章转录及转录调控文稿演示
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转录起始复合物(三元复合物): RNA聚合酶-DNA 模板-四磷酸二核苷酸
RNApol (2) - DNA - 5'pppGpN- OH 3
● 原核生物转录起始复合物
σ因子与核心酶形成全酶,σ因子发现起始 位点,全酶与-35序列结合,酶分子向-10序 列转移并牢固结合。形成闭合转录复合物
-10序列及起始位点处发生局部解链,形成 开放转录复合物
其解旋酶促使新生 RNA链从三元转录复 合物中解离出来, 从而终止转录。
13
(三)启动子结构
启动子是基因表达不可缺少的重要调控序列。没 有启动子,基因就不能转录。原核生物启动子是由两 段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,对 mRNA的合成极为重要。
RNA聚合酶保护区 结构基因
5
3
3
5
5
3
-50 -40 -30 -20 -10 1 10
3
5
-35 区
-10 区
开始转录
TTGACA AA C T G T
T A T A A T Pu A T A T T A Py
RNA-pol辨认位点 (Pribnow box) (recognition site)
原核生物启动子保守序列
转录起始点
1、 转录开始的位置
超过90%的转录起始点为嘌呤核苷酸,在转录 起始点有一保守序列:MCATMM,A是转录 始点。 M:A或C或G
稳定性存在差异
DNA/DNA双链比DNA/RNA杂化双链稳定 稳定性: G≡C>A=T>A=U
DNA
RNA
RNA聚合酶 核糖体
原核生物转录过程中的现象
三、转录终止
RNA聚合酶在DNA模板上停止前进, 转录产物RNA链从转录复合物上脱落。
机制 依赖Rho (ρ)因子的转录终止
非依赖Rho因子的转录终止
2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链 不断延长。
(NMP) n + NTP (NMP) n+1 + PPi 3. 转录空泡的形成:
转录空泡(transcription bubble):
DNA解开的两条单链与RNA聚合酶及其转录产物RNA构成的转 录复合物。
RNA-pol:40-60 bp; 解链:小于20 bp; RNA/DNA:8-9 bp。
大多数启动子为16~18bp
一、原核生物转录的起始
转录起始需解决两个问题: 1. RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起
始区域。
2. DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的 模板。
转录起始过程:
1. 辨认起始位点: 亚基辨认启动子的-35区,RNA聚合酶全
酶(2)与模板疏松结合。 酶滑行到-10区,通过亚基与模板牢固
36512 150618 155613 11000 70263
功能
决定哪些基因被转录 催化功能
结合DNA模板 功能尚不清楚 辨认起始点
σ亚基结合位点:-35序列 β‘亚基结合位点:-10序列
(二) ρ因子
1969年Roberts研究发现的控制转录终止的蛋白质。
因子:又称释放因 子,六聚体蛋白, 可以水解NTP,
第三章转录及转录调控文稿演示
转录单位
转录单位:一个转录区段可视为一个转录单位,包括 若干个结构基因及其上游的调控序列。
启动子
转录单位
终止子
+1
转录起点
编码区(开放阅读框)
转录终点
不对称转录(asymmewk.baidu.comric transcription)
* 在DNA分子双链上某一区段,一股 链可转录,另一股链不转录;
编码链 模板链
转录方向
模板链 编码链
高度的忠实性(high fidelity)
转录的忠实性是指一个特定基因的转录具有 固定的起点和固定的终点,而且被转录产生的剪 基序列,严格遵守碱基互补原则。
然而,转录出错率高于复制出错率 原因:RNA聚合酶没有校读功能
高度的进行性(highly progressive)
—10序列
2、 —10序列,位于转录起始位点上游— 10bp左右,有一个6个碱基组成的保守 序列TATAAT,是RNA聚合酶结合的部 位,又称为TATA盒或Pribnow盒。
特点:不同的启动子,其位置略有不同 不同的启动子,每个碱基出现的频率不 同。
—35序列
3、—35序列:位于转录起始位点上游35bp处, 故称—35序列,有一个6个碱基组成的保守序 列TTGACA.
在β亚基的催化下,形成RNA的第一个磷酸 二酯键,由DNA模板、RNA聚合酶、新生RNA 链组成转录起始复合物(三元复合物)。
σ因子从全酶上解离,核心酶与DNA的亲和 力下降,三元复合物在DNA链上移动,继续 合成RNA.
二、转录延长
1. 亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构, 与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;
➢ 不同启动子的—35序列的每个碱基出现的频率 不同。
➢ —35序列是RNA聚合酶初始结合的部位 ➢ —35序列的核苷酸结构决定了启动子的强度
4、作用部位间隔区
-35序列和-10序列之间的间隔区碱基序列对转录起始并 不重要。
➢ -35序列和-10序列之间的间隔区长度对转录很重要。
➢ 实验结果表明: -35序列和-10序列之间的间隔区长度 为17bp时转录效率最高。
结合。 形成闭合转录复合物(二元复合物)
转录起始过程:
2. DNA局部解链 RNA聚合酶挤入DNA双链中,解链长度约
12~17个核苷酸, 拓扑异构酶参与。 形成开放转录复合物(二元复合物)
转录起始过程:
3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应, 形成转录起始复合物。
5-pppG -OH + NTP 5-pppGpN - OH 3 + ppi
正常的转录一旦发生,就不会中途停止,转录终止 前RNA聚合酶不从模板链解离下来
一旦RNA聚合酶从模板链解离,则解离下来的 酶不可能与解离点重新结合
第二节 原核生物转录
一、原核生物转录相关结构和酶
(一)原核生物的RNA聚合酶
核心酶 core
enzyme
全酶 holoenzyme
亚基
ω
分子量
* 模板链并非永远在同一单链上。
相关概念
模板链(template strand)有意义链或Watson链: DNA双链中,能按碱基配对规律指引转录,生成RNA的 一股单链。
编码链(coding strand)反义链或Crick链: DNA双链 中碱基序列与RNA一致的一股链。
结构基因
转录方向
RNApol (2) - DNA - 5'pppGpN- OH 3
● 原核生物转录起始复合物
σ因子与核心酶形成全酶,σ因子发现起始 位点,全酶与-35序列结合,酶分子向-10序 列转移并牢固结合。形成闭合转录复合物
-10序列及起始位点处发生局部解链,形成 开放转录复合物
其解旋酶促使新生 RNA链从三元转录复 合物中解离出来, 从而终止转录。
13
(三)启动子结构
启动子是基因表达不可缺少的重要调控序列。没 有启动子,基因就不能转录。原核生物启动子是由两 段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,对 mRNA的合成极为重要。
RNA聚合酶保护区 结构基因
5
3
3
5
5
3
-50 -40 -30 -20 -10 1 10
3
5
-35 区
-10 区
开始转录
TTGACA AA C T G T
T A T A A T Pu A T A T T A Py
RNA-pol辨认位点 (Pribnow box) (recognition site)
原核生物启动子保守序列
转录起始点
1、 转录开始的位置
超过90%的转录起始点为嘌呤核苷酸,在转录 起始点有一保守序列:MCATMM,A是转录 始点。 M:A或C或G
稳定性存在差异
DNA/DNA双链比DNA/RNA杂化双链稳定 稳定性: G≡C>A=T>A=U
DNA
RNA
RNA聚合酶 核糖体
原核生物转录过程中的现象
三、转录终止
RNA聚合酶在DNA模板上停止前进, 转录产物RNA链从转录复合物上脱落。
机制 依赖Rho (ρ)因子的转录终止
非依赖Rho因子的转录终止
2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链 不断延长。
(NMP) n + NTP (NMP) n+1 + PPi 3. 转录空泡的形成:
转录空泡(transcription bubble):
DNA解开的两条单链与RNA聚合酶及其转录产物RNA构成的转 录复合物。
RNA-pol:40-60 bp; 解链:小于20 bp; RNA/DNA:8-9 bp。
大多数启动子为16~18bp
一、原核生物转录的起始
转录起始需解决两个问题: 1. RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起
始区域。
2. DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的 模板。
转录起始过程:
1. 辨认起始位点: 亚基辨认启动子的-35区,RNA聚合酶全
酶(2)与模板疏松结合。 酶滑行到-10区,通过亚基与模板牢固
36512 150618 155613 11000 70263
功能
决定哪些基因被转录 催化功能
结合DNA模板 功能尚不清楚 辨认起始点
σ亚基结合位点:-35序列 β‘亚基结合位点:-10序列
(二) ρ因子
1969年Roberts研究发现的控制转录终止的蛋白质。
因子:又称释放因 子,六聚体蛋白, 可以水解NTP,
第三章转录及转录调控文稿演示
转录单位
转录单位:一个转录区段可视为一个转录单位,包括 若干个结构基因及其上游的调控序列。
启动子
转录单位
终止子
+1
转录起点
编码区(开放阅读框)
转录终点
不对称转录(asymmewk.baidu.comric transcription)
* 在DNA分子双链上某一区段,一股 链可转录,另一股链不转录;
编码链 模板链
转录方向
模板链 编码链
高度的忠实性(high fidelity)
转录的忠实性是指一个特定基因的转录具有 固定的起点和固定的终点,而且被转录产生的剪 基序列,严格遵守碱基互补原则。
然而,转录出错率高于复制出错率 原因:RNA聚合酶没有校读功能
高度的进行性(highly progressive)
—10序列
2、 —10序列,位于转录起始位点上游— 10bp左右,有一个6个碱基组成的保守 序列TATAAT,是RNA聚合酶结合的部 位,又称为TATA盒或Pribnow盒。
特点:不同的启动子,其位置略有不同 不同的启动子,每个碱基出现的频率不 同。
—35序列
3、—35序列:位于转录起始位点上游35bp处, 故称—35序列,有一个6个碱基组成的保守序 列TTGACA.
在β亚基的催化下,形成RNA的第一个磷酸 二酯键,由DNA模板、RNA聚合酶、新生RNA 链组成转录起始复合物(三元复合物)。
σ因子从全酶上解离,核心酶与DNA的亲和 力下降,三元复合物在DNA链上移动,继续 合成RNA.
二、转录延长
1. 亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构, 与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;
➢ 不同启动子的—35序列的每个碱基出现的频率 不同。
➢ —35序列是RNA聚合酶初始结合的部位 ➢ —35序列的核苷酸结构决定了启动子的强度
4、作用部位间隔区
-35序列和-10序列之间的间隔区碱基序列对转录起始并 不重要。
➢ -35序列和-10序列之间的间隔区长度对转录很重要。
➢ 实验结果表明: -35序列和-10序列之间的间隔区长度 为17bp时转录效率最高。
结合。 形成闭合转录复合物(二元复合物)
转录起始过程:
2. DNA局部解链 RNA聚合酶挤入DNA双链中,解链长度约
12~17个核苷酸, 拓扑异构酶参与。 形成开放转录复合物(二元复合物)
转录起始过程:
3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应, 形成转录起始复合物。
5-pppG -OH + NTP 5-pppGpN - OH 3 + ppi
正常的转录一旦发生,就不会中途停止,转录终止 前RNA聚合酶不从模板链解离下来
一旦RNA聚合酶从模板链解离,则解离下来的 酶不可能与解离点重新结合
第二节 原核生物转录
一、原核生物转录相关结构和酶
(一)原核生物的RNA聚合酶
核心酶 core
enzyme
全酶 holoenzyme
亚基
ω
分子量
* 模板链并非永远在同一单链上。
相关概念
模板链(template strand)有意义链或Watson链: DNA双链中,能按碱基配对规律指引转录,生成RNA的 一股单链。
编码链(coding strand)反义链或Crick链: DNA双链 中碱基序列与RNA一致的一股链。
结构基因
转录方向