比较齐全的生物信息学常用网站

一些好用的网站

这是生物酶检索系统的网页。该检索系统是一个整合了3500多种不同酶的大量信息的数据库，
它收集了《Springer酶学手册》（第二版）中几乎所有的内容，
同时还包括一些有关酶的动力学、热力学及参考文献等信息。
非赢利和用于学术研究的用户通过国际互联网可免费使用
3 酶抑制和医药化学杂志 /journals/titles/14756366.html
《酶抑制和医药化学杂志》网由泰勒斯和弗朗西斯集团创建。
该杂志主要发表有关酶抑制剂和抑制处理的新知识和相关发现，
其研究领域涵盖酶学、细胞生物学、微生物学、生理学、药理学、药物设计和生物合成等。
用户可以在网上免费浏览目录和摘要，但全文服务需要付费。
4 无机生物化学杂志 /inca/publications/store/5/0/5/7/7/2/
这是《无机生物化学杂志》的网页。该月刊由Elsevier编辑出版。
用户可以在网上免费浏览目录和摘要，但全文服务需要付费。其内容包括：金属酶的化学、结构和功能
；无机离子和分子与蛋白质、核酸的相互作用；包含金属系统在基因表达调控中的作用；
光谱学方法在金属生物分子结构研究中的应用；微量元素在生命系统中的功能等。
作为GenLink多媒体端粒资源库的一个组成部分，由华盛顿大学药学院遗传学系承担。
其目的在于供一个网上端粒信息中心，从中可免费获得与端粒相关的基因、文献引用、端粒酶论坛、
蛋白质产物和丰富全面的端粒文献资料。
8 极端条件研究中心 /cer/
极端条件研究中心网站由英国Bath大学的Michael Danson教授创建。
一些好用的网站
1 代谢途径数据库，网址： /pathdb/

常用生物信息学数据库和分析工具网址

PDB release notes
http://www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pdb
KEGG release notes
http://www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pathway
核苷酸数据库
GenBank
/
ftp:///genbank/gbrel.txt
dbEST summary report
/dbEST/dbESTsummarv.html
EMBL release notes
http://www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?embl
PDBSTR
http://www.genome.ad.jp
Prosite
/prosite
结构数据库
PDB
/pdb

NDB
/NDB/ndb.html
生物信息学常问的问题
/faq/
生物信息学机构
NCBI
/
International Nucleotide Sequence Database Collaboration.
/collab/
Mouse Genome Informatics
/bin/query_accession?id=MGI:97555
Saccharomyces Genome Database
/cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+%22PGK1%22
http://www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?prf
PDBSTR release notes

生物信息学网站网址(全)

生物信息学网站分子生物学数据库综合目录1. SRS序列查询系统(分子生物学数据库网络浏览器) http://www.embl-heidelberg.ed/srs5/2. 分子生物学数据库及服务器概览/people/pkarp/mimbd/rsmith.html3. BioMedNet图书馆4. DBGET数据库链接http://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html5. 哈佛基因组研究数据库与精选服务器6. 约翰. 霍普金斯大学(Johns Hopkins University) OWL网络服器/Dan/proteins/owl.html7. 生物网络服务器索引，USCS /network/science/biology/index.html8. 分子生物学数据库列表(LiMB) gopher:///11/molbio/other9. 病毒学的WWW服务器，UW-Madison /Welcome.html10. UK MRC 人类基组图谱计划研究中心/11. 生物学家和生物化学家的WWW资源http://www.yk.rim.pr.jp/~aisoai/index.html12. 其他生物网络服务器的链接/biolinks.html13. 分子模型服务器与数据库/lap/rsccom/dab/ind006links.html14. EMBO实际结构数据库http://xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html15. 蛋白质科学家的网络资源/protein/ProSciDocs/WWWResources.html16. ExPASy分子生物学服务器http://expasy.hcuge.ch/cgi-bin/listdoc17. 抗体研究网页18. 生物信息网址http://biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html19. 乔治.梅森大学(George Mason University)的生物信息学与计算分子生物学专业/~michaels/Bioinformatics/20. INFOBIOGEN数据库目录biogen.fr/services/dbcat/21. 国家生物技术信息研究室/data/data.html22. 人类基因组计划情报/TechResources/Human_Genome23. 生物学软件及数据库档案/Dan/software/biol-links.html24. 蛋白质组研究：功能基因组学的新前沿(著作目录) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html序列与结构数据库一．主要的公共序列数据库1. EMBL WWW服务器http://www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) /genbank/query_form.html3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构) 4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) /5. EBI产业支持/6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html7. 大分子结构数据库/cgi-bin/membersl/shwtoc.pl?J:mms8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) /modeling/net_services.html9. PIR国际蛋白质序列数据库/Dan/proteins/pir.html10. SCOP(蛋白质的结构分类)，MRC /scop/data/scop.l.html11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库/immuno/index.html12. TIGR数据库/tdb/tdb.html13. NCBI WWW Entrez浏览器/Entrez/index.html14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构) 15. 基因本体论坛/GO/二. 专业数据库1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) .au/2. O-GL YCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http://www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关系数据序) 4. EBI蛋白质拓扑图/tops/Serverintermed.html5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) /6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) /ecocyc/ecocyc.html8. Eddy实验室的snoRNA数据库/snoRNAdb/9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) /html/ecoli.html10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http://pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html11. YPD(酿酒酵母蛋白质) /YPDhome.html12. 酵母基因组数据库/Saccharomyces/13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) /14. MPDB(分子探针数据库) http://www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html15. tRNA序列及tRNA基因序列汇编http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库/dbs/SRPDB/SRPDB.html17. SRPDB(信号识别粒子数据库) /dbs/SRPDB/SRPDB.html18. RDP(核糖体数据库计划) /19. 小核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/ssu/index.html20. 大核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/lsu/index.html21. RNA修饰数据库/RNAmods/22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库)/Departments/Biology/Databases/RNA.html23. SWISS-2DPAGE(二维凝胶电泳数据库) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html24. PRINTS /bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html25. KabatMan(抗体结构及序列信息数据库) /abs26. ALIGN(蛋白质序列比对一览) /bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html27. CATH(蛋白质结构分类系统) /bsm/cath28. ProDom(蛋白质域数据库) http://protein.toulouse.inra.fr/29. Blocks数据库(蛋白质分类系统) /30. HSSP(按同源性导出的蛋白质二级结构数据库) http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/31. FSSP(基于结构比对的蛋白质折叠分类) /dali/fssp/fssp.html32. SBASE蛋白质域(已注释的蛋白质序列片断) http://www.icgeb.trieste.it/~sbasessrv/33. TransTerm(翻译控制信号数据库) /Transterm.html34. GRBase(参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库) /~regulate/trevgrb.html35. REBASE(限制性内切酶和甲基化酶数据库) /rebase/36. RNaseP数据库/RNaseP/home.html37. REGULONDB(大肠杆菌转录调控数据库) http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/38. TRANSFAC(转录因子及其DNA结合位点数据库) http://transfac.gbf.de/39. MHCPEP(MHC结合肽数据库) .au/mhcpep/40. ATCC(美国菌种保藏中心) /41. 高度保守的核蛋白序列的组蛋白序列数据库/Baxevani/HISTONES42. 3Dee(蛋白质结构域定义数据库) /servers/3Dee.html43. InterPro(蛋白质域以及功能位点的完整资源) /interpro/序列相似性搜索1. EBI序列相似性研究网页/searches/searches.html2. NCBI: BLAST注释/BLAST3. EMBL的BLITZ ULTRA快速搜索/searches/blitz_input.html4. EMBL WWW服务器http://www.embl-heidelberg.de/Services/index.html#55. 蛋白质或核苷酸的模式浏览/compbio/PatScan/HTML/patscan.html6. MEME(蛋白质超二级结构模体发现与研究) /meme/website7. CoreSearch(DNA序列保守元件的识别) http://www.gsf.de/biodv/coresearch.html8. PRINTS/PROSIT浏览(搜索motif数据库) /cgi-bin/attwood/SearchprintsForm.pl9. 苏黎世ETH服务器的DARWIN系统http://cbrg.inf.ethz.ch/10. 利用动态规划找出序列相似性的Pima IIhttp://bmerc-www.bu.ede/protein-seq/pimaII-new.html11. 利用与模式库进行哈希码(hashcode)比较找到序列相似性的DashPat /protein-seq/dashPat-new.html12. PROPSEARCH(基于氨基酸组成的搜索) http://www.embl-heidelberg.de/aaa.html13. 序列搜索协议(集成模式搜索) /bsm/dbbrowser/protocol.html14. ProtoMap(SEISS-PROT中所有蛋白质的自动层次分类) http://www.protomap.cs.huji.ac.il/15. GenQuest(利用Fasta、Blast、Smith-Waterman方法在任意数据库中搜索) http://www.gdb.rog/Dan/gq/gq.form.html16. SSearch(对特定数据库的搜索) http://watson.genes.nig.ac.jp/homology/ssearch-e_help.html17. Peer Bork搜索列表(motif/模式序列谱搜索) http://www.embl-heidelberg.de/~bork/pattern.html18. PROSITE数据库搜索(搜索序列的功能位点) /searches/prosite.html19. PROWL(Skirball研究中心的蛋白质信息检索) /index.html序列和结构的两两比对1. 蛋白质两两比对(SIM) http://expasy.hcuge.ch/sprot/sim-prot.html2. LALNVIEW比对可视化观察程序ftp://expasy.hcuge.ch/pub/lalnview3. BCM搜索装置(两两序列比对) /seq-search/alignment.html4. DALI蛋白质三维结构比较/dali/5. DIALIGN(无间隙罚分的比对程序) http://www.gsf.de/biodv/dialign/html多重序列比对及系统进行树1. ClustalW(BCM的多重序列比对) /multi-align/multi-align.html2. PHYLIP(推测系统进行树的程序) /phylip.html3. 其它系统进行树程序，PHYLIP文档的汇编http://expasy.hcuge.ch/info/phylogeny.html4. 系统进行树分析程序(生命树列表) /tree/programs/programs.html5. 遗传分类学软件(Willi hennig协会提供的列表) /education.html6. 用于多重序列比对的BCM搜索装置/multi-align/multi-align.html7. AMAS(分析多重序列比对中的序列) /servers/amas_server.html8. 维也纳RNA二级结构软件包http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/四. 有代表性的预测服务器1. PHD蛋白质预测服务器，用于二级结构、水溶性以及跨膜片断的预测http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/predictprotein.html2. PhdThreader(利用逆折叠方法预测、识别折叠类) http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/phd_help.html3. PSIpred(蛋白质结构预测服务器) /psipred4. THREADER(戴维. 琼斯) /~jones/threader.html5. TMHMM(跨膜螺旋蛋白的预测) http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/6. 蛋白质结构分析，BMERC /protein-seq/protein-struct.html7. 蛋白质域和折叠预测的提交表http://genome.dkfz-heidelberg.de/nnga/def-query.html8. NNSSP(利用最近相邻法预测蛋白质的二级结构) /pss/pss.html9. Swiss-Model(基于知识的蛋白质自动同源建模服务器) http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html10. SSPRED(用多重序列比对进行二级结构预测) /jong/predict/sspred.html11. 法国IBCP的SOPM(自寻优化预测方法、二级结构) http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopm.html12. TMAP(蛋白质跨膜片断的预测服务) http://www.embl-heidelberg.de/tmap/tmap_info.html13. TMpred(跨膜区域和方向的预测) /software/TMPRED_form.html14. MultPredict(多重序列比对的序列的二级结构) /zpred.html15. BCM搜索装置(蛋白质二级结构预测) /seq-search/struc-predict.html16. COILS(蛋白质的卷曲螺旋区域预测) /software/coils/COILS_doc.html17. Coiled Coils(卷曲螺旋) /depts/biol/units/coils/coilcoil.html18. Paircoil(氨基酸序列中的卷曲螺旋定位) /bab/webcoil.html19. PREDATOR(由单序列预测蛋白质二级结构) http://www.embl-heidelberg.de/argos/predator/predator_info.html20. EV A(蛋白质结构预测服务器的自动评估) /eva/五. 其他预测服务器1. SignalP (革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真核生物蛋白质的信号肽及剪切位点) http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/2. PEDANT(蛋白质提取、描述及分析工具) http://pedant.mips.biochem.mpg.de/六. 分子生物学软件链接1. 生物信息学可视化工具/alan/VisSupp/2. EBI分子生物学软件档案/software/software.html3. BioCatalog /biocat/e-mail_Server_ANAL YSIS.html4. 生物学软件和数据库档案/Dan/softsearch/biol-links.html5. UC Santa Cruz的序列保守性HMM的SAM软件/research/compbio/sam.html七. 网上博士课程1. 生物计算课程资源列表：课程大纲http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/syllabi.html2. 生物序列分析和蛋白质建模的Ph.D课程http://www.cbs.dtu.dk/phdcourse/programme.html3. 分子科学虚拟学校/vsms/sbdd/4. EMBnet 生物计算指南http://biobase.dk/Embnetut/Universl/embnettu.html5. 蛋白质结构的合作课程/PPS/index.html6. 自然科学GNA虚拟学校http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Vsns/index.html7. 分子生物学算法/education/courses/590bi。

国外生物学网站

根据某资源网资源贴整理，大家共享国外生物学网站1/.pk/////美国国家科学院院刊/美国植物病理学会/国际植物病理学会/英国植物病理学会/http://www.botany.utoronto.ca/ResearchLabs/MallochLab/index.stm /mycolink.html/ Genes & Development/////美国冷泉港实验室/美国冷泉港实验室出版社/美国国家科学院/美国微生物学会杂志/美国微生物学会/美国医学研究院/bto/microbes/index.htm#T op/里诺内华大学生物资源研究中心(生物信息学组织)生物信息学组织官方网站。

美国国立生物信息中心-NCBI<English>/相关新闻资源AgWebAmerican ScientistBBC - Sci/T echBINASBio-IT WorldBioWorldBloombergBoston GlobeBtech Investor BusinessWeekCBS MarketWatch CNBCChemScopeCNN-T echnology EconomistForbesFortuneGenomeWebILF NewsMercury News Moreover - Biotech MSNBC - T echNatureNature: BiotechNY Times - Science Red HerringSan Fran. ChronicleThe ScientistScience Magazine Scientific American Signals MagazineThe T SectorUpsideWall StreetJournal Wash. Post - Biotech 相关信息资源About: Biotech/med AgBioForumAg Biotech InfoNet AgBiotechNetAmer. Journ. of Bioethics BioExchangeBioFindBioInformerBioresearch OnlineBioSpaceBiotech ChroniclesBiotech DictionaryBiotech JournalsBiotech Knowl. Cen.Biotech ProgressBiotech Resource - OECDBioView - JobsBioVistaBio-WebBioWorldBtech InvestorCouncil for BiotechDoubleTwistElec Journal of Biotech - BiotechGenetic Engin. NewsIonianNational Agri. LibraryNature Mag - BiotechNBIFPharmaPortalSciWebSignals MagazineTECSOC - BiotechTIGR DatabaseWWW Virtual Library国外生物学网站2国外医学网址大全(转贴)国外卫生管理/f?kz=97848670国外卫生管理团体/f?kz=97852143国外卫生管理论坛及NEWS /f?kz=97852561国外健康网(含论坛及组织) /f?kz=97858752国外医学会. 红十字会/f?kz=97868849国外医疗管理/f?kz=97877812国外主要医院网站/f?kz=97927864国外预防医学网(含食品安全)/f?kz=97933600国外血液病网站/f?kz=97938492国外妇幼(含健康儿科) /f?kz=97944322国外生物医学网/f?kz=97954968国外科学研究基金/f?kz=97962581国外医学院校(含论坛及机构) /f?kz=98005217国外医学图书馆(不含数据) /f?kz=98016192国外基础医学网站(病理) /f?kz=98026552国外基础医学网站(解剖) /f?kz=98028846国外基础医学网站(生理) /f?kz=98032258国外基础医学网站(遗传) /f?kz=98035061国外药理学机构/f?kz=98077303国外药学信息/f?kz=98081281国外药物滥用及毒物.中毒学/f?kz=98085451国外药典查询/f?kz=98088180护理机构与网站/f?kz=98090246国外护理论坛/f?kz=98094130国外外科学(普外) /f?kz=98096481国外外科学(心脏、主动脉外科)/f?kz=98097538国外外科学(血管外科) /f?kz=98099089国外外科学( 腹外科) /f?kz=98099521国外外科学( 腹腔镜) /f?kz=98100759国外外科学( 创伤外科) /f?kz=98101162国外外科学( 颅脑、普外科) /f?kz=98102459国外外科学( 整形外科) /f?kz=98102868国外外科学( 移植) /f?kz=98103559国外外科学( 泌外) /f?kz=98103821国外外科学( 麻醉及其它)/f?kz=98104325国外内科学(循环系统) /f?kz=98157899国外内科学心脏病信息/f?kz=98160843国外循环系统学心衰方面/f?kz=98162002国外循环系统学(心脏外科)/f?kz=98162463国外循环系统学(介入方面)/f?kz=98162675国外循环系统学(血脂研究)/f?kz=98163440国外循环系统学(抗凝与病理的研究)/f?kz=98180299国外循环系统学(高血压) /f?kz=98181504国外循环系统学(心律失常) /f?kz=98183119国外呼吸系统网（机构）/f?kz=98186238国外呼吸系统网（哮喘）/f?kz=98188114国外呼吸系统网（慢性阻塞性肺病）/f?kz=98189129国外呼吸系统网（肺肿瘤）/f?kz=98203256国外呼吸系统网（结核病)/f?kz=98207003国外医学网址大全国外呼吸系统网（成人呼吸窘迫与睡眠呼吸暂停）/f?kz=98210540国外消化系统网（机构)/f?kz=98212998国外消化系统网（肝病)/f?kz=98217185国外消化系统网（内镜)/f?kz=98216098国外消化系统网（消化信息)/f?kz=98214811国外消化系统网（肠道病)/f?kz=98237934国外泌尿系统网（机构)/f?kz=98239922国外泌尿系统网（泌尿疾病信息)/f?kz=98296091国外泌尿系统网（狼疮性)/f?kz=98299579国外泌尿系统网（透淅及其它)/f?kz=98311052国外神经系统网（机构)/f?kz=98313016国外神经系统网（神经疾病信息)/f?kz=98316840国外神经系统网（脑梗塞及出血)/f?kz=98319323国外神经系统网（头痛研究)/f?kz=98321789国外神经系统网（癫痫) /f?kz=98322908国外神经系统网（帕金森氏病)/f?kz=98331143国外神经系统网（老年性痴呆)/f?kz=98334633国外神经系统网（神经外科及其它)/f?kz=98336228国外内分泌系统网（机构)/f?kz=98337903国外内分泌系统网（糖尿病)/f?kz=98386600国外内分泌系统网（肥胖)/f?kz=98388056国外内分泌系统网（骨质疏松)/f?kz=98388669国外肿瘤系统网（机构)/f?kz=98389335国外肿瘤系统网（癌症信息)/f?kz=98390652国外肿瘤系统网（肿瘤护理)/f?kz=98392487国外肿瘤系统网（研究基金)/f?kz=98392764国外五官科系统网（口腔信息)/f?kz=98398976国外五官科系统网（综合信息)/f?kz=98400100国外五官科系统网（耳鼻喉科)/f?kz=98404661国外传染科系统网（感染性疾病)/f?kz=98408664国外传染科系统网（耐药研究)/f?kz=98411236国外传染科系统网（结核病) /f?kz=98411649国外传染科系统网（艾滋病) /f?kz=98412597国外生物学网站3艾滋病专利数据库/pto/access.html早老性痴呆(Alzheimer)网.au/~dhs/ad.html阿基米德计划/arch/arch.htmlAvon乳腺癌预防知识/Avon/avon.html牙科教育资源/uni/projects/der/derweb.html残疾学入门/CommonRoom/DisabilitiesAccess/杜克大学医疗中心/联机急救/~afoster/safety/健康网/health/index.html保健信息资源www-hsl.mcmaster.ca/tomflem/top.html心脏支持工作组/~rwall/HIVNet 家用测试工具/KitsHP.htmlHyperDoc：国家医药图书馆/工作和健康学院www.iwh.on.ca/home.htmMayo卫生所/MS基金会/cyber.serv/hwp/support/ms/menu.html 然药品和代用疗法/~amrta养学习中心/~rlc/远地区的医疗(Remote Area Medical) /ram/联机Rogaine /rogaine/虚拟医院/界卫生网/国外生物学网站4生物工程常用数据库核苷酸顺序数据库(GENBANK)人体基因库氨基酸顺序数据库(SWISS-PRO)酵母基因组数据库(YEASTS)美国种质保藏中心(ATCC)美国专利局数据库(USPO)国外生物学网站5生物统计和医学信息/bioinfo.html活细胞/kcj/quill/遗传学教育中心/instruction/medicine/genetic心脏预览/tfi/preview/heartpreview.html视觉化科学教育/people/art035/Bin/science.html生命树/tree/phylogeny.html虚拟青蛙解剖页/vfrog/国外生物学网站 62.极其不错的专业试题库!3.链接地址:小妹偶然发现一个分子生物学试题库,有1221道分子生物学试题!!有些难度不小!可惜未分章节,有答案!!但要填上e-mial和名字,并且每页选十题,可在每页不断选取!!.网址:,然后进入"考试指南".索要答案的方法是Y ounger先发现的!!THANK YOU!!!(9月15日9时修订!!)去“生物谷”到“生物谷站内资源”，然后去“分子生物学”栏，再打开其中的“生物化学与分子生物学经典电子书（14本）”栏找到其中的“Genes 2000”（就是GENES 7），点击其后的"打包下载"（有下划线）即可！神经科学站点midas 整理一、神经科学团体组织神经科学学会神经科学学会（The Society for Neuroscience）简称SfN，成立于1970年，会员30,000人，是目前世界上最大的一个有关脑和神经系统研究的组织。

生物方面的网站

好的生物学方面的网站41个1．http://cellbio.u / 得克萨斯大学细胞生物学研究生培养方面的网站。

2．http://cimewww.epfl.ch 一个电镜方面的网址。

3．/ Geoge Madson 大学的教学网站4．/bio/bio181/BIOBK/BioB ookCELL2.html 一个细胞学教学网。

5．/bio/B IO181/BIOB K/BioB ookTOC.html 老外的细胞生物学在线图书。

6．/home0/ecoli/molecula/home.htm 一本分子生物学简明读本。

7．/photobase/cgris图库.html 种质资源图库。

8．/courses/ 加州大学伯克利分校细胞与分子教学网站，精彩！9．/Science/Cell_Biology/ 细胞生物学网址，精彩。

10．/ 37度网，有许多不要钱的医学书籍和图片，精彩。

11．/ 动物图片12．/micromenu.htm 各种古董显微镜，图片非常精彩，全面。

13．/ 生物软件网，有大量材料和网址。

14．/subject/biology/ 中基网生物，有动植物图片。

15．/Cell-biology/ 关于细胞膜、细胞骨架方面的讲述的确不错。

16．/ 精彩的电镜照片，让你垂涎三尺。

17．/~lthompso/bgy53/ 普通生物学教学课件18．http://www.grt.kyushu-u.ac.jp信号转导部分很好。

19．http://www.grt.kyushu-u.ac.jp/spad/menu.html 细胞因子信号转导。

20．/faculty/Eng manj/bio2114/power/cell/ 细胞生物学教学网站，有很多幻灯片。

21．/~newmanl/GraphicsCatalog.html 细胞生物学图片。

22．/exhibits/gallery/fluorescencegallery.htm 荧光显微镜照片。

pubmed数据库入口ncbi

PubMed数据库入口：NCBI简介PubMed 是一种由美国国家图书馆（National Library of Medicine，NLM）所提供的生物医学文献数据库，是全球最大的生物医学文献存储库之一。

作为生物医学研究领域的重要工具，PubMed 提供了大量的生物医学文献信息，覆盖了基础医学、临床医学、生物技术等多个研究领域。

PubMed 的数据库入口是由美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）负责维护的。

NCBI 是一个提供了一系列生物技术信息资源和工具的综合性生物技术数据库，帮助研究人员获取和分析生物技术相关的数据。

在本文中，我们将重点介绍 PubMed 数据库的入口，即 NCBI 网站的功能和特点。

NCBI 网站NCBI 网站（https:/// ）是一个免费提供生物医学信息服务的网站，具有丰富全面的生物医学数据库资源。

在 NCBI 网站上，用户可以访问PubMed 数据库以及其他诸如 GenBank、BLAST、PubChem 等数据库。

NCBI 网站提供了直观友好的用户界面，让用户可以轻松访问并获取所需的生物医学文献信息。

下面我们将介绍 PubMed 数据库的一些主要功能和特点。

PubMed 数据库功能文献搜索作为一个重要的生物医学文献数据库，PubMed 提供了强大的搜索功能，帮助用户快速准确地检索感兴趣的文献。

用户可以根据关键词、作者、期刊等信息进行搜索，也可以通过高级搜索来进一步精确检索。

文献浏览用户搜索到感兴趣的文献后，可以通过 PubMed 的文献浏览功能查看摘要和全文。

摘要提供了文章的主要内容和结论，方便用户了解文献的核心内容。

全文则提供了更详细的信息，包括方法、结果和讨论等。

文献收藏用户在浏览文献时，可以将感兴趣的文献添加到自己的收藏夹中。

这样，用户可以方便地管理和访问自己收藏的文献，随时查阅。

生物多样性保护网站内容简介

生物多样性保护网站内容简介生物多样性保护是当今世界面临的重大挑战之一。

随着人类活动的扩大和自然环境的破坏，地球上的生物多样性正面临巨大的威胁。

为了宣传和推动生物多样性的保护意识，许多网站涌现出来，致力于向公众传达关于生物多样性保护的知识、实践和政策。

本文将为您介绍一些优秀的生物多样性保护网站，让您更好地了解和参与到这一全球性的保护事业中。

1. 全球生物多样性信息网络 (Global Biodiversity Information Facility, GBIF)全球生物多样性信息网络是一个全球性的在线平台，致力于收集、整合和共享全球生物多样性数据。

该网站提供了丰富的数据资源，包括物种分类、分布、出版物和研究成果等。

通过浏览GBIF网站，您可以深入了解各个地区的生物多样性，掌握最新的研究进展，并参与到数据采集和贡献中去。

2. 自然保护联盟 (International Union for Conservation of Nature, IUCN)自然保护联盟是全球最大的自然保护组织，致力于促进生物多样性的保护和可持续利用。

IUCN网站提供了广泛的资源和信息，包括领导力、政策和实践等方面。

您可以在该网站上了解到全球各地的生物多样性状况、重点保护区域、威胁和挑战等内容，还可以了解到IUCN的最新动态和倡议。

3. 生物多样性保护中心 (Center for Biological Diversity, CBD)生物多样性保护中心是美国著名的非营利环保组织，致力于保护和恢复全球的生物多样性。

该网站提供了关于物种保护、生境保护和环境法律方面的信息。

您可以在CBD网站上了解到各类濒危物种的保护情况、关注的生物多样性热点、野生动物保护政策等内容，并参与到相关的行动和宣传活动中去。

4. 世界自然基金会 (World Wildlife Fund, WWF)世界自然基金会是一个全球性的保护性环境组织，致力于保护地球上的生物多样性和自然资源。

生物信息学常用数据资源介绍

生物信息学常用数据资源介绍生物信息学是一门将大量数据和信息与生命科学相结合的学科，随着技术的不断发展，越来越多的生物信息学数据资源得到了广泛应用，使得生物信息学研究呈现出爆发式增长的态势。

在接下来的文章中，我将介绍一些常用的生物信息学数据资源。

1. 基因组浏览器基因组浏览器是生物信息学研究中非常常见的一种工具，在基因组浏览器中，用户可以利用多种查询方式快速定位以及查找基因序列、变异位点、基因表达等数据，具体的使用方法可以参考NCBI、UCSC和ENSEMBL等公共数据库。

2. 数据库公共数据库是生物信息学在数据共享和协作方面发挥重要作用的平台之一，NCBI、ENSEMBL、UniProt和GenBank等是生物信息学具有代表性的公共数据库，这些数据库为用户提供了一系列的基因组、转录组、蛋白质、代谢物等多种数据资源，这些数据可以帮助研究者进行基因预测及分析，杂交研究、协同研究等多种生物信息学研究。

3. 软件工具与数据库不同的是，软件工具主要起到数据分析与处理的作用。

对于不同的数据分析任务，不同的软件工具适应程度也不同，因此在生物信息学研究过程中需要不断尝试和探索，比如在转录组分析中，DESeq2和edgeR是非常常用的工具。

4. 人类基因组计划人类基因组计划是一项耗时多年，费用庞大的生命科学研究计划，目的是把人类的基因组解码，并制定新的医学治疗方案等。

在该项目结束后，因为庞大的数据量，成千上万名的研究者可以在其基础上继续开展基因组学研究，这进一步推动了生命科学领域的发展。

5. 元分析数据集随着生物信息学领域的快速发展，元分析数据集作为新工具出现了。

它是由几个相对独立的研究组合而成，旨在研究特定生物过程的数据，比如癌症发病的前因后果，它们包括多个数据来源和测序仪，提供了更全面、多元化的基因数据，为进一步研究确定新的生物标志物和治疗方法提供了更加可靠的基础。

综上，以上我们介绍了一些生物信息学研究中使用频率较高的数据资源，它们共同构成了生物信息学领域的基础设施，在加速科研发展、优化研究流程、减少人力物力成本等方面发挥重要作用，一方面可以帮助科研工作者得到更准确的结果，另一方面又能为更广泛的生命科学研究打开更广的视野。

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在进行科学研究中，会经常需要查阅和参考文献著作，对研究生来说掌握搜索文献的能力尤其重要。

目前可以使用Google学术、百度学术等一些学术搜索网站进行文献查阅。

但这些网站又有很多问题，例如Google学术需要一定技巧才能使用，而其镜像网站又存在界面不美观含有广告等问题。

有一个专注于生物医学领域的文献搜索网站pubmed。

浏览器地址栏输入搜索我们就进入到网站主页。

打开后就可以看到清新简洁的搜索界面啦。

我们在在输入框输入'cancer'进行搜索。

进入到'cancer'搜索页面，可以看到相关文献按照综合排序进行排列，并且同时清晰展现文献所在期刊影响因子。

搜索详情页面右侧为自定义搜索范围框，可以设置文献类型，文献日期，影响因子等。

我们注意到在最开始的到在最开始的搜索框中提示可以使用中英文关键词搜索。

那么我们用中文关键词“癌症”试试。

可以看到通过中文关键词也能成功找到英文文献。

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常用生物信息学网址NCBI 生物信息学研究工具：/Tools/NCBI 生物信息学研究工具网站由美国国家生物技术信息中心支持。

该网站提供了许多程序的链接，内容包括数据挖掘、核酸和蛋白质组分析等。

同时，网站还提供了许多相关链接和资源。

欧洲生物信息学研究所：/欧洲生物信息学研究所是一个非盈利学术机构，是欧洲分子生物学实验室的一部分。

它是生物信息学研究和服务的中心。

它所管理生物数据的数据库包括核酸，蛋白质序列和大分子结构。

它的使命是保证从分子生物学和基因组研究的日益增长的信息向公众公开，并且对科学研究团体提供任何方面的免费使用，以促进科学发展。

欧洲生物信息学研究所Ensembl 基因组浏览器：ttp:///ensembl/index.html欧洲生物信息学研究所Thornton 研究组：/Thornton/index.html欧洲生物信息学研究所多序列联配数据库:/embl/Submission/alignment.html欧洲生物信息学研究所工具箱:/Tools/欧洲生物信息学研究所核酸数据库:/Databases/nucleotide.html欧洲生物信息学研究所计算基因组研究组:/research/CGG/index.html欧洲生物信息学研究所完整基因组数据库:/genomes/欧洲生物信息学研究所序列数据库研究组:/seqdb/index.htmlBrutlag 生物信息学研究组：/Brutlag 生物信息学研究组是斯坦福大学的一个研究团体，主要研究从蛋白质一级结构预测蛋白质结构和功能，其开发了EMOTIF 、EMATRIX 和3MOTIF 软件应用于非鉴定的基因组序列的功能确定，另外还开发了LOCK 和3DSEARCH 软件用于比较蛋白质结构和蛋白质结构数据库的搜索。

生物GBF 信息学小组主页：http://transfac.gbf.de/生物信息学小组主页是德国生物技术研究中心的生物信息组的主页。

生物学的权威生物网址

生物教师应该知道的权威生物网权威生物网址导航:/生物网站大全：/jiaoyan/swwz2.htm中学生物网址大全/mid-school/mid-school.html[生物网址通] 中国科普博览：/gb/lives/index.html动物星球:/newssh/animal_dwsingqu_newsmore.shtml 天星教育网：/中国基础教育网：/subject/biology/生物报：/高中生物教与学/生物教与学/Sites/shengwu/default.asp生物资源网：/基因时代：/sciencefilm/jysd.htmK12 生物论坛：http://sq.*/bbs/index.php?t=thread&frm_id=13&rid=0 中国生命科学论坛：/中学生物资源网：/Index.htm中国昆虫网：/昆虫世界：/kcsj/中山大学生物博物馆：/museum/creature/人与自然：/GB/huanbao/259/3546/普克资源中心：/zt/zt2.asp华南植物园：/main.htm生物教学与高考：/abc.htm 洪恩在线动感课堂：/edu/dgkt/index.htm#sw高中生物教学资源网：/ loadBBS: /leadbbs/Boards.asp生物世纪-教师之家：/rwdata/index.htm越秀生物教研：/index.asp奥林匹克竞赛指导:/jszd/index.htm生物笋园：/zhonghuawang/index.htm中国生物教学网：/课件园：/sort.asp?classid=6生物教学之窗：/main/index.html阿风生物教学网：/广东生物教学网：/Article/Index.asp中国生物多样性信息交换所：/中国野生动植物保护：/old/nlhzh.asp 中国动物园：/hyonline/rcsh/asia/china/dwy.asp k12 频道：http://www.*/www/ 高中试卷网：/新课程教育网：/闪亮生物网:http://202.121.7.7/person/shine/科普园地:/kpyd/index.htm野生动物网:/Index.htm /sheying/index.asp 动物星球:/_home/老莫生物教学:/中青网大百科:/encyclopedia/propagation/index.htm生物导航网:/ 中学生物:/zxsw/index.asp中国环境生态网:/index.shtml华中师大:植物学精品课程:/jpkc/cw/zhiwuxue/main.htm中国生物论坛:/bbs/Default.asp盐生植被类型:/psi/research/WYE2/types%20of%20halophyte %20 vegetation.htm思奇生物网:/生命青葱网:/南京大学植物资源网:/cps/site/NJU/njuc/plantsweb/index.htm生物教学之窗:/main/index.html中学综合教育资源网:http://220.189.228.106:8282/index.asp生命经纬:/ 中国公众科普网:/ 我爱奥赛网高中生奥:/bbs2/list.asp?boardid=5 江西省赣县中学生物组网站:生物秀:/Index.html植物生物化学教学站:/kech/zwsl/zhlbiochem/园林植物论坛:/bbs/Board/Board.asp?BoardID=2生物百花园:/ 高中生物资源索引:/明虎生物驿站：/中国生物课程网:http://bio.*.com/index.html中学生物教学资源网：/北京大学医学部精品课程:/jpkc-sb/bingli/jpkc/jpkc.htm生物教师之家：/index.asp动物生理学网络课程精编:http://202.113.96.26/wlkc/dongwushenglixue/index.htm教育星空:/teacher/new.asp?cid=9&classid=14& Nclassid=216植物学教学网站http://202.116.65.193/jinpinkc/zhiwuxue/course.htm中国植物科普网:/中国蝴蝶网: /articl/read.asp?id=1591天利生物论坛:/index.asp?boardid=42生物多样性:.hk/~bio/6e/Biodiversity/第二教育网:/search/02016/rs1.html园丁工作站:/sw/Index.html中国生物课程网:http://bio.*.com/四川省基础教育资源中心:/search.php?skey=%C9%FA%C E%EF&stype=&subject=&grade=&type=&format=&x=19&y=2中小学教育资源交流中心:/list/shengwu/张家口市第三中学:http://*194.241.146/SW/index.asp生物教育网:/Index.html全品高考网:http://www.*.com/Subject.aspx?subcataid=6精品试卷网:/shijuan/38/课件交流中心:http://www.*.net/Soft_Class.asp?softChannelID=3&ClassID=190免费教育资源网:/Soft/118/一线高考网:生物庄园:/sw丹中教育资源网：/edu/shiti/ShowClass.asp?ClassID=43高中生物学习辅导:生物虎冀:/index6.htm野生生物守望者:/高校招生网:/gktk/search.asp?classid=123110生物学科网:/中学精品资源网:/Soft/ShowClass.asp?ClassID=30 中国名师教育网：/teacher/jiaoliu/test_brow.asp?subject=生物生物资源网:/英才苑:/pe/teacher/ShowClass.asp?ClassID=450 海口市灵山中学:/Class/wqj03/生物教育资源库:/index.asp高中生物:/gzsw/index.htm海豚在线：/Soft/ShowClass.asp?ClassID=61中国教育考试资源库::/Sorting.asp?sortid=6第一生物:/Index.shtml新课标在线:/St/sw/150_Index.shtml生物学家园:/blog.php?uid-165.html课件吧:/kj/ShowClass.asp?ClassID=209江苏省兴化中学资源平台:/Soft/ShowClass.asp?Clas sID=77中国生物新课程网:http://bio.*.com/Channel06/swalpkjs/、浙江青少年科技教网:/html/jykj/sw/index.html 细胞生物学在线:/book/index.htm生物虎翼:/index.htm中学生物网站:/res/seniorbio/index.htm高中生物资源索引:/生化资源空间:/Index.asp中学生物:/xkweb/zxsw/中国课件网:/sort.asp?CateID=6 莲山生物课件:。

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包括核酸的酶切位点、motif、开读框等搜索，PCR引物设计，二级结构预测，多序列比较及分子进化树构建，等等；蛋白分析则包括酶切图谱，功能区搜索，分子进化分析，蛋白二级结构预测，等等；此外还提供序列管理等功能。

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没有课题？几个生物信息网站来帮你

没有课题？几个生物信息网站来帮你不少人有这样的困惑：来实验室一两年了，还没找到一个可行的课题，面对毫无作为的现实，我们常常怀疑自己，我是不是不适合做科研，不然怎么荒废了两年还找不到课题，其实不然，只是因为你还没找到合适的方法，随着大数据时代的到来，充分的运用生物信息学知识会让你做到事半功倍，下面我就介绍几个常用的网站来给你解说，该如何找课题。

众所周知，磷酸化广泛存在于各种蛋白中，对蛋白功能的调控具有非常的意义，我今天着重介绍蛋白磷酸化课题的寻找。

首先找到一个你感兴趣的蛋白，我以GRB2为例，找到GRB2可能会发生磷酸化的位点，进入网站搜索后，选的GRB2我们发现，GRB2有很多可能发生磷酸化的位点，选择一个被预测次数最多(最有可能)的位点，Y209位最有可能，被预测208次因此我们就以GRB2 Y209位磷酸化作为一个起点，去寻找可能使之发生磷酸化的激酶。

进入网站搜索后，找到Y209，点击其后的Kinase Pred这样我们就可以找到使之发生磷酸化的激酶，最有可能的是SYK为了进一步验证其可能性，我们需要探究SYK和GRB2之间是否有相互作用，可以进入网站，搜索后，继续选定GRB2点击继续点击继续获得搜索结果后，我们可以看到SYK和GRB2之间被预测有相互作用，这就表明SYK可能与GRB2相互作用，随后使之Y209位磷酸化。

通过文献查找，我们发现，竟然真有文章报道了这就表明，用这种方法是可以找到一些非常好的课题。

有了这些大数据网站的帮忙，你还再也不用自己找不到课题了。

华丽丽的分割线李莫愁博士：看了这么久的万事屋，还不会设计课题真的是不应该了。

其实还是那样，找到线索，往下深入挖掘，总能有你需要的课题浮出水面的。

还要感谢郁金香同学的倾情投稿，要知道磷酸化那两个网站的话，就回复“BA”就告诉你，不要在评论区回复哦！好了，今天就策到这里吧。

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Microbiology: Principles and Explorations 056 MIRAGE057 NCBI-反转录病毒中心058 Nucleic Acids Research059 PKCLab060 PlantsP061 PlasmoDB062 ProSite063 Prostate Action064 Protein Peospector065 Protein Structure Database http://www./~geigel/PSdb/PSdb.html066 Proteome Biokownlege067 ProtoMap068 Provo海洋生物教育中心069 Ptotemoe Systems070 RECODE071 Science中文/杂志072 The CluSTr database073 The Galton Laboratory074 The Insect Company075 The Microbiology Network 076 TIGR基因索引077 Trends杂志078 UCMP生物词典079 World Species List080 World Wildlife Fund081 阿风生物教学网082 阿奇生物教育教学网083 爱科普网084 爱生物BBS085 爱生物考研论坛086 澳大利亚生态学会087 保护生态学088 保护中国的生物多样性089 北大蛋白质数据库090 北大理论生物学中心 /091 北大生命科学学院 /links.jsp092 北大生物信息学数据库093 北大植物发育实验室 /094 北京大学生物信息学中心 /095 北京动物园096 北京昆虫网097 北京生命科学研究院098 北京野生动物保护中心099 比利时生物安全网100 病毒学词汇101 波兰生物化学学报102 虫害综合治理应用生态学家协会103 初中生物-人教网/chzsw/index.htm104 代谢途径数据库105 带菌体生态学杂志106 带菌体生态学杂志107 淡水生态和内陆渔业研究108 淡水生态系统生态学109 淡水生态学合作研究中心110 蛋白质晶体论坛 /nttalk 111 蛋白质晶体论坛 /nttalk 112 蛋白质之间相互作用目录113 蛋白质组学114 德国Cologne大学藻种库115 丁香园 /bbs/116 动物物种信息共享117 动物学报118 动物学分部http://monkey./119 端粒文献库120 俄罗斯菌种保藏中心121 二十一世纪生物论坛122 发育生物学123 分子基因软件124 分子基因资源网125 分子生物学个人交流网126 分子细胞生理学127 风湿免疫资讯网128 复旦发育生物学研究所 /idm/129 干细胞信息网130 肝素研究131 高中生物-人教网/gzsw/index.htm132 哥德堡大学海洋生态学系133 哥伦比亚大学生物信息中心134 哥伦比亚植物系135 革兰氏阴性杆菌编码鉴定数据库136 功能基因组学http://ihome./~b400559 137 功能糖生物学138 狗的基因组图谱139 广东蝴蝶140 广东微生物菌种保藏中心141 广州微生物研究所142 国际动物学大会143 国际古植物学组织144 国际生命科学研究所145 国际生物化学和分子生物学联盟146 国际微生物生态学会147 国际细胞生物学联盟148 国家人类基因组北方研究中心149 国家人类基因组南方研究中心150 国家生物医学分析中心蛋白质组学网151 国家新药筛选中心152 果蝇的发育和遗传数据库153 哈尔滨医大生物信息研究室154 哈佛大学基因组研究中心155 哈佛大学结构细胞实验室156 哈佛大学生殖生态学实验室http://www.people.fas./~pellison/157 哈佛蛋白质组学158 哈佛化学和生物化学系159 哈佛生物化学和生物物理学和医学中心160 海洋科技信息网161 海洋生态学与海洋植物162 海洋生物图书馆163 海洋生物学164 海洋生物学词典165 核酸的热力学数据166 核酸数据库NDB167 荷兰生态学研究所168 湖泊检索生态部分169 华大基因170 华盛顿大学基因组中心171 华盛顿大学生化系172 基因潮173 基因岛174 基因组175 基因组每日新闻176 基因组生物信息学数据库177 基因组学词汇表178 吉林大学实验动物中心179 极端条件研究中心180 脊椎动物红细胞基因表达181 计算和观察蛋白三维结构182 加拿大生物化学和分子细胞生物学学会183 加州大学伯克利分校细胞&分子生物学网站184 加州大学基因组与生物信息学185 加州大学生态与进化系186 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这四个网站了解一下，让你轻松预测相互作用蛋白！

这四个网站了解一下，让你轻松预测相互作用蛋白！蛋白质互作网络是由不同蛋白通过彼此之间的相互作用构成，参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。

在进行基因机制研究中，寻找互作蛋白是一个深入探究基因功能的过程，寻找未知蛋白充满艰辛，而通过数据库预测互作蛋白能够为我们的研究拓展思路，提供方向，让我们在科研道路上更加轻松。

下面就为大家推荐四个可以用来预测相互作用蛋白的网站！一：STRING网站1.STRING数据库是比较经典的蛋白互作数据库。

数据库使用简单。

2. 输入基因名称后，可以获得蛋白互作网络图，其中圆圈节点之间的直线代表该直线连接的两个蛋白之间的相互作用关系，点击直线可查看蛋白的详细信息。

3.网站下方提示不同颜色的直线代表不同的相互作用关系证据来源。

包括蛋白质之间的直接物理相互作用，也包括蛋白质之间的间接功能相关性。

它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外，还有利用生物信息学的方法预测的结果。

二：Genemania网站。

1. Genemania也是比较常用的蛋白互作网站，网站结果类似cytoscape app，但是无需下载安装软件，直接在线使用，非常方便。

2.在网站左上方可以选择查询物种以及基因名称，同时点击下方不同的图标能够设置网络图展示形式：列表式、环状等。

3 .网站右侧可以设置网络边的来源，所应用的生物信息学方法有：物理互作、基因共表达、基因共定位、基因富集分析以及网站预测等等，通过这种方法能够设定检索范围。

三：unihi 网站1. unihi是一个用于检索，分析和可视化人类分子相互作用网络的数据库。

其主要目的是为广泛的生物学和医学研究人员提供一个全面且易于使用的网络调查平台。

UniHI目前包括基因，蛋白质和药物之间近350,000个分子相互作用，以及许多其他类型的数据，如基因表达和功能注释。

2.网站支持输入单基因或者多基因名称，寻找与之互作蛋白。

ncbi使用指导

NCBI（National Center for Biotechnology Information）是美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information）的简称，是美国国立卫生研究院（NIH）资助的专门网站，为全世界科研人员提供大量的生物信息学数据库和信息服务。

在使用NCBI时，有几个常用的服务和工具需要注意：一、PubMedPubMed是NCBI的一个主要数据库，是一个免费的搜索工具，专门为检索生物医学文献而设计。

它包含了超过1300万篇生物医学论文，覆盖从1950年代开始至现在的所有生物医学研究。

使用步骤如下：1. 输入你想要查询的关键词或者题目，可以输入英文关键词或者作者名字，并使用逻辑词组合查询。

2. 可以使用"AND"组合多个关键词进行查询，比如在搜索框中输入“lung cancer AND chemotherapy”。

3. 在搜索结果页面，你可以查看每个文献的摘要和链接到原始的研究文章。

如果想要查看更详细的信息，可以直接点击论文标题进入PubMed数据库查看。

二、NCBI BLASTBLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于比较序列的工具，可以帮助你查找和比较基因、DNA、RNA和蛋白质序列。

它可以帮助你找到与你的序列最匹配的已知序列。

使用步骤如下：1. 打开NCBI的BLAST主页，选择合适的BLAST工具，如BLASTP（蛋白质序列比对）、BLASTN （DNA序列比对）等。

2. 输入你的序列，可以选择从数据库下载的序列或者自己输入的序列。

3. 选择合适的数据库，如NCBI GenBank、SwissProt等，然后点击“BLAST”按钮开始搜索。

4. BLAST会返回与你输入序列最匹配的序列及其相关信息，如相似度、E值等。

三、GEO基因表达数据库GEO（Gene Expression Omnibus）是一个公开可用的基因表达数据库，包含了许多组织和疾病类型的数据。

盘点：三大你不可不知的开放性生物信息分析平台

盘点：三大你不可不知的开放性生物信息分析平台随着高通量测序技术的快速发展，产生了海量的生物学数据，这也对生物信息学分析技术提出了很高的要求。

为此，各种生物信息分析平台孕育而生。

生物信息学分析平台是将各种生物信息学分析软件集成起来，通过网页或者命令行的方式进行生物信息分析的平台，下面将一一介绍三个常用的生物信息分析平台。

1、GalaxyGalaxy是一个开放的基于网页的生物信息分析平台，目前已经部署投入使用的公共Galaxy分析平台约有30个。

通过该平台，能够在不下载和安装任何软件或工具的前提下做各种生物信息分析，并能够记录每一步分析过程，同时可以与其他科研人员分享分析的历史记录和构建的工作流。

比如，由国家基因库搭建、配置和维护的公共开放的Galaxy平台（/galaxy/root），可以为国内外用户提供运算存储资源和流程化分析服务，它整合了各种生物信息学分析工具，可以友好方便的构建生物数据分析工作流，是集数据上传检索及处理、序列比对组装、序列分析、SNP/WGA分析、数据可视化等众多生物信息分析功能于一体的公共开放性平台。

2、GenePatternGenePattern生物分析平台提供了用于基因组、转录组、蛋白质组、SNP分析和常见数据处理分析的150多个分析工具，并且该平台具有word插件，可以将分析流程添加到doc文档中。

具体见链接/cancer/software/genepattern/3、DNAnexus分析平台DNAnexus生物分析平台主要侧重下一代测序技术的信息分析，部分功能可免费使用。

DNAnexus（/）生物分析平台是致力于打造云端数据分析平台，2011年获Google Ventures和TPG Biotech投资，DNAnexus将和Google共建开放式DNA数据库，以取代美国政府的国家生物技术信息中心（NCBI）。

该平台最大的特点是使用google的云服务，将数据存在云端，科研人员可通过软件即可访问这些数据。

生物信息学网站网址(全)

生物信息学网站分子生物学数据库综合目录1. SRS序列查询系统(分子生物学数据库网络浏览器) http://www.embl-heidelberg.ed/srs5/2. 分子生物学数据库及服务器概览/people/pkarp/mimbd/rsmith.html3. BioMedNet图书馆4. DBGET数据库链接http://www.genome.ad.jp/dbget/dbget.links.html5. 哈佛基因组研究数据库与精选服务器6. 约翰. 霍普金斯大学(Johns Hopkins University) OWL网络服器/Dan/proteins/owl.html7. 生物网络服务器索引，USCS /network/science/biology/index.html8. 分子生物学数据库列表(LiMB) gopher:///11/molbio/other9. 病毒学的WWW服务器，UW-Madison /Welcome.html10. UK MRC 人类基组图谱计划研究中心/11. 生物学家和生物化学家的WWW资源http://www.yk.rim.pr.jp/~aisoai/index.html12. 其他生物网络服务器的链接/biolinks.html13. 分子模型服务器与数据库/lap/rsccom/dab/ind006links.html14. EMBO实际结构数据库http://xray.bmc.uu.se/embo/structdb/links.html15. 蛋白质科学家的网络资源/protein/ProSciDocs/WWWResources.html16. ExPASy分子生物学服务器http://expasy.hcuge.ch/cgi-bin/listdoc17. 抗体研究网页18. 生物信息网址http://biochem.kaist.ac.kr/bioinformatics.html19. 乔治.梅森大学(George Mason University)的生物信息学与计算分子生物学专业/~michaels/Bioinformatics/20. INFOBIOGEN数据库目录biogen.fr/services/dbcat/21. 国家生物技术信息研究室/data/data.html22. 人类基因组计划情报/TechResources/Human_Genome23. 生物学软件及数据库档案/Dan/software/biol-links.html24. 蛋白质组研究：功能基因组学的新前沿(著作目录) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/LivreTOC.html序列与结构数据库一．主要的公共序列数据库1. EMBL WWW服务器http://www.EMBL-heidelberg.ed/Services/index.html2. Genbank 数据库查询形式(得到Genbank的一个记录) /genbank/query_form.html3. 蛋白质结构数据库WWW服务器(得到一PDB结构) 4. 欧洲生物信息学研究中心(EBI) /5. EBI产业支持/6. SWISS-PROT(蛋白质序列库) http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html7. 大分子结构数据库/cgi-bin/membersl/shwtoc.pl?J:mms8. Molecules R Us(搜索及观察一蛋白质分子) /modeling/net_services.html9. PIR国际蛋白质序列数据库/Dan/proteins/pir.html10. SCOP(蛋白质的结构分类)，MRC /scop/data/scop.l.html11. 洛斯阿拉莫斯的HIV分子免疫数据库/immuno/index.html12. TIGR数据库/tdb/tdb.html13. NCBI WWW Entrez浏览器/Entrez/index.html14. 剑桥结构数据库(小分子有机的及有机金属的结晶结构) 15. 基因本体论坛/GO/二. 专业数据库1. ANU生物信息学超媒体服务(病毒数据库、分类及病毒的命名法) .au/2. O-GL YCBASE(O联糖基化蛋白质的修订数据库) http://www.cbs.dtu.dk/OGLYCBASE/cbsoglycbase.html3. 基因组序列数据序(GSDB)(已注释的DNA序列的关系数据序) 4. EBI蛋白质拓扑图/tops/Serverintermed.html5. 酶及新陈代谢途径数据库(EMP) /6. 大肠杆菌数据库收集(ECDC)(大肠杆菌K12的DNA序列汇编) http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc.html7. EcoCyc(大肠杆菌基因及其新陈代谢的百科全书) /ecocyc/ecocyc.html8. Eddy实验室的snoRNA数据库/snoRNAdb/9. GenproEc(大肠杆菌基因及蛋白质) /html/ecoli.html10. NRSub(枯草芽胞杆菌的非冗余数据库) http://pbil.univ-lyonl.fr/nrsub/nrsub.html11. YPD(酿酒酵母蛋白质) /YPDhome.html12. 酵母基因组数据库/Saccharomyces/13. LISTA、LISTA-HOP及LISTA-HON(酵母同源数据库汇编) /14. MPDB(分子探针数据库) http://www.biotech.est.unige.it/interlab/mpdb.html15. tRNA序列及tRNA基因序列汇编http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/index/html16. 贝勒医学院(Baylor College of Medicine)的小RNA数据库/dbs/SRPDB/SRPDB.html17. SRPDB(信号识别粒子数据库) /dbs/SRPDB/SRPDB.html18. RDP(核糖体数据库计划) /19. 小核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/ssu/index.html20. 大核糖体亚蛋白RNA结构http://rrna.uia.ac.be/lsu/index.html21. RNA修饰数据库/RNAmods/22. 16SMDB及23SMDB(16S和23S核糖体RNA突变数据库)/Departments/Biology/Databases/RNA.html23. SWISS-2DPAGE(二维凝胶电泳数据库) http://expasy.hcuge.ch/ch2d/ch2d-top.html24. PRINTS /bsm/dbbrowser/PRINTS/PRINTS.html25. KabatMan(抗体结构及序列信息数据库) /abs26. ALIGN(蛋白质序列比对一览) /bsm/dbbrowser/ALIGN/ALIGN.html27. CATH(蛋白质结构分类系统) /bsm/cath28. ProDom(蛋白质域数据库) http://protein.toulouse.inra.fr/29. Blocks数据库(蛋白质分类系统) /30. HSSP(按同源性导出的蛋白质二级结构数据库) http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/31. FSSP(基于结构比对的蛋白质折叠分类) /dali/fssp/fssp.html32. SBASE蛋白质域(已注释的蛋白质序列片断) http://www.icgeb.trieste.it/~sbasessrv/33. TransTerm(翻译控制信号数据库) /Transterm.html34. GRBase(参与基因调控的蛋白质的相关信息数据库) /~regulate/trevgrb.html35. REBASE(限制性内切酶和甲基化酶数据库) /rebase/36. RNaseP数据库/RNaseP/home.html37. REGULONDB(大肠杆菌转录调控数据库) http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/38. TRANSFAC(转录因子及其DNA结合位点数据库) http://transfac.gbf.de/39. MHCPEP(MHC结合肽数据库) .au/mhcpep/40. ATCC(美国菌种保藏中心) /41. 高度保守的核蛋白序列的组蛋白序列数据库/Baxevani/HISTONES42. 3Dee(蛋白质结构域定义数据库) /servers/3Dee.html43. InterPro(蛋白质域以及功能位点的完整资源) /interpro/序列相似性搜索1. EBI序列相似性研究网页/searches/searches.html2. NCBI: BLAST注释/BLAST3. EMBL的BLITZ ULTRA快速搜索/searches/blitz_input.html4. EMBL WWW服务器http://www.embl-heidelberg.de/Services/index.html#55. 蛋白质或核苷酸的模式浏览/compbio/PatScan/HTML/patscan.html6. MEME(蛋白质超二级结构模体发现与研究) /meme/website7. CoreSearch(DNA序列保守元件的识别) http://www.gsf.de/biodv/coresearch.html8. PRINTS/PROSIT浏览(搜索motif数据库) /cgi-bin/attwood/SearchprintsForm.pl9. 苏黎世ETH服务器的DARWIN系统http://cbrg.inf.ethz.ch/10. 利用动态规划找出序列相似性的Pima IIhttp://bmerc-www.bu.ede/protein-seq/pimaII-new.html11. 利用与模式库进行哈希码(hashcode)比较找到序列相似性的DashPat /protein-seq/dashPat-new.html12. PROPSEARCH(基于氨基酸组成的搜索) http://www.embl-heidelberg.de/aaa.html13. 序列搜索协议(集成模式搜索) /bsm/dbbrowser/protocol.html14. ProtoMap(SEISS-PROT中所有蛋白质的自动层次分类) http://www.protomap.cs.huji.ac.il/15. GenQuest(利用Fasta、Blast、Smith-Waterman方法在任意数据库中搜索) http://www.gdb.rog/Dan/gq/gq.form.html16. SSearch(对特定数据库的搜索) http://watson.genes.nig.ac.jp/homology/ssearch-e_help.html17. Peer Bork搜索列表(motif/模式序列谱搜索) http://www.embl-heidelberg.de/~bork/pattern.html18. PROSITE数据库搜索(搜索序列的功能位点) /searches/prosite.html19. PROWL(Skirball研究中心的蛋白质信息检索) /index.html序列和结构的两两比对1. 蛋白质两两比对(SIM) http://expasy.hcuge.ch/sprot/sim-prot.html2. LALNVIEW比对可视化观察程序ftp://expasy.hcuge.ch/pub/lalnview3. BCM搜索装置(两两序列比对) /seq-search/alignment.html4. DALI蛋白质三维结构比较/dali/5. DIALIGN(无间隙罚分的比对程序) http://www.gsf.de/biodv/dialign/html多重序列比对及系统进行树1. ClustalW(BCM的多重序列比对) /multi-align/multi-align.html2. PHYLIP(推测系统进行树的程序) /phylip.html3. 其它系统进行树程序，PHYLIP文档的汇编http://expasy.hcuge.ch/info/phylogeny.html4. 系统进行树分析程序(生命树列表) /tree/programs/programs.html5. 遗传分类学软件(Willi hennig协会提供的列表) /education.html6. 用于多重序列比对的BCM搜索装置/multi-align/multi-align.html7. AMAS(分析多重序列比对中的序列) /servers/amas_server.html8. 维也纳RNA二级结构软件包http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/四. 有代表性的预测服务器1. PHD蛋白质预测服务器，用于二级结构、水溶性以及跨膜片断的预测http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/predictprotein.html2. PhdThreader(利用逆折叠方法预测、识别折叠类) http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/phd_help.html3. PSIpred(蛋白质结构预测服务器) /psipred4. THREADER(戴维. 琼斯) /~jones/threader.html5. TMHMM(跨膜螺旋蛋白的预测) http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/6. 蛋白质结构分析，BMERC /protein-seq/protein-struct.html7. 蛋白质域和折叠预测的提交表http://genome.dkfz-heidelberg.de/nnga/def-query.html8. NNSSP(利用最近相邻法预测蛋白质的二级结构) /pss/pss.html9. Swiss-Model(基于知识的蛋白质自动同源建模服务器) http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html10. SSPRED(用多重序列比对进行二级结构预测) /jong/predict/sspred.html11. 法国IBCP的SOPM(自寻优化预测方法、二级结构) http://pbil.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/NPSA/npsa_sopm.html12. TMAP(蛋白质跨膜片断的预测服务) http://www.embl-heidelberg.de/tmap/tmap_info.html13. TMpred(跨膜区域和方向的预测) /software/TMPRED_form.html14. MultPredict(多重序列比对的序列的二级结构) /zpred.html15. BCM搜索装置(蛋白质二级结构预测) /seq-search/struc-predict.html16. COILS(蛋白质的卷曲螺旋区域预测) /software/coils/COILS_doc.html17. Coiled Coils(卷曲螺旋) /depts/biol/units/coils/coilcoil.html18. Paircoil(氨基酸序列中的卷曲螺旋定位) /bab/webcoil.html19. PREDATOR(由单序列预测蛋白质二级结构) http://www.embl-heidelberg.de/argos/predator/predator_info.html20. EV A(蛋白质结构预测服务器的自动评估) /eva/五. 其他预测服务器1. SignalP (革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真核生物蛋白质的信号肽及剪切位点) http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/2. PEDANT(蛋白质提取、描述及分析工具) http://pedant.mips.biochem.mpg.de/六. 分子生物学软件链接1. 生物信息学可视化工具/alan/VisSupp/2. EBI分子生物学软件档案/software/software.html3. BioCatalog /biocat/e-mail_Server_ANAL YSIS.html4. 生物学软件和数据库档案/Dan/softsearch/biol-links.html5. UC Santa Cruz的序列保守性HMM的SAM软件/research/compbio/sam.html七. 网上博士课程1. 生物计算课程资源列表：课程大纲http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/syllabi.html2. 生物序列分析和蛋白质建模的Ph.D课程http://www.cbs.dtu.dk/phdcourse/programme.html3. 分子科学虚拟学校/vsms/sbdd/4. EMBnet 生物计算指南http://biobase.dk/Embnetut/Universl/embnettu.html5. 蛋白质结构的合作课程/PPS/index.html6. 自然科学GNA虚拟学校http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Vsns/index.html7. 分子生物学算法/education/courses/590bi。