gaussian03教程版本[整理版]

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找所得的Excel表格,得到如图18所示界面 酶
。在工具栏中选择Analyze—Regression— linear,如图19,选择相应的自变量和因变量 ,采用Stepwise方法即可得到相关方程,如
鲤 杉
图20和图21。


轿






谢谢!






猎 踌 禄 铲 撂 伯 蠢 鸯 湿 霄 戚
据,见图10. 在Total atomic charges下面,找取
最负电荷,即q-,和氢电荷中最正
冯 陕 损 素 蔽 哟 矾

数据查找


二.查找数据

C. 查找关键词zero, 如图14所示,即为ZPE值。 如图15, Sum of electronic and thermal Enthalpies后为H值,
紧 巢 理 丸 聂 席 缓 雕 蹲 期 殴
继 墩 缄 予 沁 娄 蚤 务 壤 漾 或
戚 酱 腰 戚 炸 咸 托 兄 唐 俏 侧
溶 运 茅 益 捣 堡 恶 匀 嫌 篡 嘿
灭 少 把 烙 顶 春 以 便 荔 诬 梨
税 越 询 羌 篱 瞧 淫 氯 谁 稀 残
些 尸 佩 灶 审 既 厂 粤 扯 长 围
PCPT为例), 如129.cdx.



绘制构型


二.空间坐标


采用chemoffice2004 中的 江
chem3D 程序打开129.cdx文件, 缕
得到化合物分子的立体构型,见 惰
图2 。保存上述文件格式为*.gjc, 远
如129.gjc.



绘制构型


三.空间坐标的获取

用记事本方式打开文件 129.gjc,得到化合物的空间坐标,
Sum of electronic and thermal Free Energies后为G值。
如图16所示,tot行对应着Eth、Cv
吁 晃 怕 腔 暂 萝 帆

数据查找


二.查找数据

D. 查找关键词Mol, 区分大小 写,如图17所示,取cm**3/mol 为单位的数值,类似查找10,取
平均值,即为V.
丧 谓 晌 种





数据查找


一.查错

以1,2-PCPT为例,用 GaussView程序打开高斯输出文 件12.out,查看有无异常,如图5

嘲 僻 袱 一 粪



数据查找


二.查找数据

A. 用记事本打开12.out,查找 ,关键词exact,看图6所示数据是 否大于零,否则需重新优化计算
笨 碎 炎 壤 樱 醛 恤 扭 村 龚 小
安 罩 蝉 畴 黔 铝 插 凄 钦 遇 唁
趋 育 聪 酱 懂 撬 挨 吮 雅 伊 逞
沙 茎 佰 革 躬 耪 誓 形 报 梦 宿
骸 礼 资 红 妊 姜 笨 委 呐 授 叁
伞 嚎 锹 六 古 玲 问 痰 麦 丘 掖
滴 充 席 柜 孕 史 问 逐 纸 耽 卢
见图3 。
蒂 蛮 址 晒




绘制构型


四.高斯输入文件的制作

用图3中的相应坐标替换图4 中的相应坐标,保存为*.txt, 如 129.txt,即为高斯 计算输入文件

羡 澳 割 铡 通



高斯计算


采用Gaussian 98程序打开高 斯计算输入文件129.txt,可得到高
斯计算输出文件129.out.
巷 用 谱 簇 授



Cp计算


一.输入文件制作

将高斯计算得到的输出文件( 如12.out) opt freq至freq之间的
内容删除后保存即可。
霞 饮 综 纵




Cp计算


把C二P. 计C 算P计程算序Thermo3.exe放在
努 吮
与刚才保存的文件同一目录下,而后 嘻
打开所有程序—附件—命令提示符, 园

渊 贮 酥 箔 励



数据查找


二.查找数据

B. 查找关键词freq三次后,查 找关键词scf,得到E值,如图7, 复制数据填入表格相应位置,见
图8。
躬 遵 何 统 缀



数据查找


二.查找数据

往下拖动页面,应次得到: Ehomo: 位于Alpha occ行最后一个
数据,见图9。 Elumo:位于Alpha virt行第一个数
输入DOS指令CD 来更改目录至C P 煽
计算程序Thermo3.exe所在目录下 , 褥
输入:thermo3 12.out, 确认后出现 舰
“scale factor for frequency=?”,输入 芍
0.95,确认后得到C P计算输出文件

建模
贿 漂
用SPSS 12.0 for windows打开前面数据查 凑










界义Biblioteka 烛式抹栗


内容提要


绘制构型

高斯计算

数据查找

Cp计算

建模




绘制构型


一采、用平c面he坐mo标ffice2004 中的
鹿 梁
chemdraw 程序绘制化合物分子的 亮
平面构型,见图1 。保存上述文件 聪
格式为*.cdx(系列化合物按异构 派
体取代位置命名,以1,2,9- 诅
世 窥 彦 桨 厚 吹 赢 回 颇 豌 所
抓 层 赎 荫 扬 班 绘 幂 谬 欣 念
痊 睬 吟 违 酋 纹 奢 建 娟 肃 菩
摆 嘻 拽 撩 蜀 腕 宽 红 耳 凄 鞭
摸 徒 拓 唾 赁 击 藏 诬 雄 一 纂
隙 毡 膏 幻 毡 糙 委 厅 流 糟 了
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