二维核磁处理实用手册
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ACD/Labs二维核磁数据处理实用手册
高级化学发展有限公司Advanced Chemistry Development(以下简称ACD/Labs)成立于1994年,总部位于加拿大多伦多市。ACD/Labs是一家将化学结构与分析化学信息进行有效结合、进而产生全面分析化学管理系统(英文简称ChemAnalytics)的化学软件公司。其主要功能包括未知化学物质结构解析、谱图预测和解释、分析数据处理与管理、理化性质和药物代谢毒性预测、色谱分离、医药化学、新药试剂合成、化学系统命名、以及化学专利和论文的发表。ACD/NMR Processor为ACD/Labs众多模块中的一个。
ACD/NMR Processor功能简介:
1.包含1D和2DNMR数据处理以及ACD/ChemSketch画图软件
2.兼容性好,可以处理Bruker、Varian、Thermo Scientific、JEOL、Tecmag、ASCII、
GE、Acorn NMR、Lybrics、JCAMP、MSI Felix等核磁数据。
3.自动获取多重谱峰信息且数据导出专业化(可以按照国外著名期刊要求导出,数
据可直接用于文章的发表或论文的写作)。
4.宏命令自动处理谱图
5.类PPT操作界面。
6.一键处理傅里叶转换、相位校正、基线校正等。
7.支持手动、自动取峰和积分。
8.数据能按照强度或者等值线图表显示。
9.应用Magnitude spectrum, Power spectrum以及Symmetrization命令。
10.谱图叠加处理功能。
11.可将1D谱图添加到2D谱图中
12.通过化学位移和耦合常数建立2D核磁谱图
13.另外还具有差谱处理、化学结构导入、谱图注释标记、自动识别氘代试剂等功能
搭配NMR Predictor还可实现:
1.自动验证化学结构与谱图的匹配度。
2.自动归属1D和2D核磁数据。
ACD/NMR Processor所支持的数据格式
ACD/Labs目前最新版本是ACD/Labs12.5,操作平台:Windows
1、谱图处理界面
双击安装文件夹中ACDLabs 12.0文件夹中的Specmanager图标进入如下界面,或者进入ACD/Labs的任一模块,选择菜单栏ACD/Labs/Specmanager模块(一般图标选择ChemSketch)
注:如最左边出现分隔栏,则在菜单栏View中将ACD/NMR Workbook的勾去掉
2、导入数据
方法一:
点击如下操作界面中最左边红色的文件夹按钮,或者File-Open所要打开的数据。【文件路径ACD12/EXAMPLES/SPECMAN/2DNMR/EXAMPLE_2】
数据导入后
方法二:
将文件夹直接拖入SpecManager窗口查看Spectrum Parameter
选择菜单栏View/Spectrum Parameter
3、Pereference预设置
工具栏选择Option按钮,选择Pereference
Structure标签,Structure Coloration附近,点击,出现Coloration Setting 对话框,输入需要设置的数值
Labels与Scales标签
*如无需更改设置,直接点击OK 4.Full FT
工具栏选择Full FT
点击OK
放大功能。
上一次放大范围
滚动鼠标滚轴调整Threshold
5、Attach 1D Curve
选择工具栏Setup 1D Curve
选择Horz Spectrum将1HNMR附于F2
点击打开
如需调整1HNMR谱峰强度,点击,输入如300,Enter
注:这一部分是具体谱图类型而定,如H-HCosy,纵轴为1HNMR
点击打开
如需调整1HNMR谱峰强度,点击,输入如300,Enter
放大谱峰
选中谱峰中心,像右拖至F2谱峰中心位置
横向定标后谱图
纵向定标
单击Vert,选中谱峰中心,向上拖至F1谱峰中心位置
纵向定标后的谱峰
选择Accept
定标后谱图
7、Peak Picking
选择工具栏Peak Picking按钮
选择Manual
选择Peak Picking位置,单击左键
选择Accept
8、添加或删除网格线
工具栏选择Peak Picking按钮
单击左键
选择Gridlines
放大需要建立网格线的区域
单击左键
工具栏选择Vert,建立纵向网格线
工具栏选择Both,同时建立横向及纵向网格线
删除横向网格线
工具栏选择Horz
将红色线移至需要删除的网格线
当红色变成蓝色
单击左键,出现节点
单击Delete
Vert和Both操作同上
9、添加化合物结构式
方法一:Processor界面选择操作界面左下角的4-Structure
选择Edit in ChemSketch在ChemSketch界面画化合物结构
画好化合物结构后选择Attach Structure to the Current Spectrum
e
方法二:Processor界面切换到ChemSketch界面,画好结构,选择
Attach Structure to the Current Spectrum