常用的核酸染料有哪些

EB（溴化乙锭）：
溴化乙锭是一种高度灵敏的嵌入性荧光染色剂，为强致癌诱变剂，但价格便宜。

它与DNA
的结合几乎没有碱基序列特异性。

在高离子强度的饱和溶液中，大约每2.5个碱基插入一个
溴化乙锭分子。

EB的这种特性使其成为一种核酸染料，常用于琼脂糖凝胶电泳中的核酸染色。

溴化乙锭在紫外区302nm和366nm处有吸收峰，在紫外光的照射下，溴化乙锭可被激发出橙红色的荧光（590nm）。

结合有DNA的溴化乙锭复合物的荧光强度要比没有结合DNA的染
料高出20-30倍，因此溴化乙锭可检测到少至10ng的DNA条带，非常灵敏。

Gel Green和Gel Red：
GelRed 和 GelGreen 是两种集高灵敏、低毒性和超稳定性于一身的极佳的荧光核酸凝胶染色
试剂。

其特点有：
高灵敏度：GelRed 和 GelGreen 是目前市场中最灵敏的凝胶核酸染料之一；
稳定性极好：可以使用微波炉加热，可以在室温下保存；
更安全：艾姆斯氏试验结果表明，该染料的诱变性远小于溴化乙锭（EB）；
广泛的适应性：适用于预制凝胶和凝胶电泳后染色；
染色过程简单：与EB一样，在预制胶和电泳过程中不必担心染料降解；而电泳后染色过程
也只需30分钟且无需脱色或冲洗；
对 DNA 和 RNA 的迁移影响小：对核酸迁移的影响小于 SYBR Green 。

与标准凝胶成像系统以及可见光激发的凝胶观察装置完美兼容：使用 312nm 激发的 UV 凝胶
成像系统时，GelRed 可以完美的替代EB；使用 254nm 激发的 UV 凝胶成像系统或可见光激
发的凝胶观察装置时，GelGreen 足以替代任意一种 SYB染料。

但该染料会使小片段DNA迁
移慢一些（与EB相比).
Gold View I型/II型：
Goldview对于大片段DNA的染色效果良好，但是在对于500bp以下的片段效果不是很好，
还有一个很致命的弱点是它的荧光基团在紫外灯下非常容易淬灭，一般5-10min条带就会消失。

另外Goldview不适用于胶回收。

Goldview其实就是AO（丫啶橙，一种剧毒产品）且荧
光效果远不如EB，灵敏度差，本底色严重，不利用于回收，不稳定，在紫外灯下其诱导突
变能力极高
SYBR Green 和SYBR Gold：
稳定性差，也有毒性。

它属于花箐素类核酸染料，花箐类染料不是无毒的，而只是低毒的，
电泳级别的是经过修饰的，
修饰有三种：
1.加入卤素或氰基。

2.2.插入环羟基。

3.3.加入稳定剂。

SYBR Green I是高灵敏的DNA荧光染料，适用于各种电泳分析，操作简单：无须脱色或冲洗。

至少可检出20pg DNA，高于EB染色法25-100倍。

SYBR Green I 与dsDNA 结合荧光信号会增强800-1000倍，用SYBR Green I染色的凝胶样品荧光信号强，背
景信号低。

SYBR Green和SYBR Gold相对于EB的稳定性要差很多。

SYBR系列的染料也能进入细胞染色线粒体以及核内的DNA，从而产生危害。

SYBR Green I已被证实在紫外光下
将会产生强诱变能力，使DNA或其他物质发生突变。